Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9667
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9667, 1226 aa
1>>>pF1KE9667 1226 - 1226 aa - 1226 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3962+/-0.000999; mu= 12.5310+/- 0.060
mean_var=114.7181+/-22.441, 0's: 0 Z-trim(107.8): 28 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.119745
statistics sampled from 9945 (9964) to 9945 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16
Scan time: 2.610
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS1071.1 ADAR gene_id:103|Hs109|chr1 (1226) 8209 1430.0 0
CCDS30879.1 ADAR gene_id:103|Hs109|chr1 ( 931) 6203 1083.4 0
CCDS33590.1 ADARB1 gene_id:104|Hs109|chr21 ( 701) 894 166.2 2.7e-40
CCDS7058.1 ADARB2 gene_id:105|Hs109|chr10 ( 739) 853 159.1 3.8e-38
CCDS33589.1 ADARB1 gene_id:104|Hs109|chr21 ( 741) 550 106.8 2.2e-22
CCDS42970.1 ADARB1 gene_id:104|Hs109|chr21 ( 714) 486 95.7 4.5e-19
>>CCDS1071.1 ADAR gene_id:103|Hs109|chr1 (1226 aa)
initn: 8209 init1: 8209 opt: 8209 Z-score: 7663.0 bits: 1430.0 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 8209; 99.8% identity (99.9% similar) in 1226 aa overlap (1-1226:1-1226)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNPRQGYSLSGYYTHPFQGYEHRQLRYQQPGPGSSPSSFLLKQIEFLKGQLPEAPVIGKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MNPRQGYSLSGYYTHPFQGYEHRQLRYQQPGPGSSPSSFLLKQIEFLKGQLPEAPVIGKQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 TPSLPPSLPGLRPRFPVLLASSTRGRQVDIRGVPRGVHLGSQGLQRGFQHPSPRGRSLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS10 TPSLPPSLPGLRPRFPVLLASSTRGRQVDIRGVPRGVHLRSQGLQRGFQHPSPRGRSLPQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 RGVDCLSSHFQELSIYQDQEQRILKFLEELGEGKATTAHDLSGKLGTPKKEINRVLYSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RGVDCLSSHFQELSIYQDQEQRILKFLEELGEGKATTAHDLSGKLGTPKKEINRVLYSLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 KKGKLQKEAGTPPLWKIAVSTQAWNQHSGVVRPDGHSQGAPNSDPSLEPEDRNSTSVSED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KKGKLQKEAGTPPLWKIAVSTQAWNQHSGVVRPDGHSQGAPNSDPSLEPEDRNSTSVSED
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LLEPFIAVSAQAWNQHSGVVRPDSHSQGSPNSDPGLEPEDSNSTSALEDPLEFLDMAEIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLEPFIAVSAQAWNQHSGVVRPDSHSQGSPNSDPGLEPEDSNSTSALEDPLEFLDMAEIK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 EKICDYLFNVSDSSALNLAKNIGLTKARDINAVLIDMERQGDVYRQGTTPPIWHLTDKKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EKICDYLFNVSDSSALNLAKNIGLTKARDINAVLIDMERQGDVYRQGTTPPIWHLTDKKR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 ERMQIKRNTNSVPETAPAAIPETRRNAEFLTCNIPTSNASNNMVTTEKVENGQEPVIKLE
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ERMQIKRNTNSVPETAPAAIPETKRNAEFLTCNIPTSNASNNMVTTEKVENGQEPVIKLE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 NRQEARPEPARLKPPVHYNGPSKAGYVDFENGQWATDDIPDDLNSIRAAPGEFRAIMEMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NRQEARPEPARLKPPVHYNGPSKAGYVDFENGQWATDDIPDDLNSIRAAPGEFRAIMEMP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 SFYSHGLPRCSPYKKLTECQLKNPISGLLEYAQFASQTCEFNMIEQSGPPHEPRFKFQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SFYSHGLPRCSPYKKLTECQLKNPISGLLEYAQFASQTCEFNMIEQSGPPHEPRFKFQVV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 INGREFPPAEAGSKKVAKQDAAMKAMTILLEEAKAKDSGKSEESSHYSTEKESEKTAESQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 INGREFPPAEAGSKKVAKQDAAMKAMTILLEEAKAKDSGKSEESSHYSTEKESEKTAESQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 TPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHEPKFQYCVAVGAQTFPSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHEPKFQYCVAVGAQTFPSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 SAPSKKVAKQMAAEEAMKALHGEATNSMASDNQPEGMISESLDNLESMMPNKVRKIGELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SAPSKKVAKQMAAEEAMKALHGEATNSMASDNQPEGMISESLDNLESMMPNKVRKIGELV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 RYLNTNPVGGLLEYARSHGFAAEFKLVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RYLNTNPVGGLLEYARSHGFAAEFKLVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 KQEAADAALRVLIGENEKAERMGFTEVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGSTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KQEAADAALRVLIGENEKAERMGFTEVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGSTF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 HDQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLGRKILAAIIMKKDSEDMGVVVSLGTGNRCVKGDSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HDQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLGRKILAAIIMKKDSEDMGVVVSLGTGNRCVKGDSLS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 LKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKYNSQTAKDSIFEPAKGGEKLQIKKTVSFHLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKYNSQTAKDSIFEPAKGGEKLQIKKTVSFHLY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 ISTAPCGDGALFDKSCSDRAMESTESRHYPVFENPKQGKLRTKVENGEGTIPVESSDIVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ISTAPCGDGALFDKSCSDRAMESTESRHYPVFENPKQGKLRTKVENGEGTIPVESSDIVP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 TWDGIRLGERLRTMSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TWDGIRLGERLRTMSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 CCRVTRDGSAFEDGLRHPFIVNHPKVGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CCRVTRDGSAFEDGLRHPFIVNHPKVGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 GTRGTVDGPRNELSRVSKKNIFLLFKKLCSFRYRRDLLRLSYGEAKKAARDYETAKNYFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GTRGTVDGPRNELSRVSKKNIFLLFKKLCSFRYRRDLLRLSYGEAKKAARDYETAKNYFK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220
pF1KE9 KGLKDMGYGNWISKPQEEKNFYLCPV
::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KGLKDMGYGNWISKPQEEKNFYLCPV
1210 1220
>>CCDS30879.1 ADAR gene_id:103|Hs109|chr1 (931 aa)
initn: 6203 init1: 6203 opt: 6203 Z-score: 5792.0 bits: 1083.4 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 6203; 99.9% identity (100.0% similar) in 931 aa overlap (296-1226:1-931)
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 SQGSPNSDPGLEPEDSNSTSALEDPLEFLDMAEIKEKICDYLFNVSDSSALNLAKNIGLT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MAEIKEKICDYLFNVSDSSALNLAKNIGLT
10 20 30
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 KARDINAVLIDMERQGDVYRQGTTPPIWHLTDKKRERMQIKRNTNSVPETAPAAIPETRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS30 KARDINAVLIDMERQGDVYRQGTTPPIWHLTDKKRERMQIKRNTNSVPETAPAAIPETKR
40 50 60 70 80 90
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 NAEFLTCNIPTSNASNNMVTTEKVENGQEPVIKLENRQEARPEPARLKPPVHYNGPSKAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NAEFLTCNIPTSNASNNMVTTEKVENGQEPVIKLENRQEARPEPARLKPPVHYNGPSKAG
100 110 120 130 140 150
450 460 470 480 490 500
pF1KE9 YVDFENGQWATDDIPDDLNSIRAAPGEFRAIMEMPSFYSHGLPRCSPYKKLTECQLKNPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YVDFENGQWATDDIPDDLNSIRAAPGEFRAIMEMPSFYSHGLPRCSPYKKLTECQLKNPI
160 170 180 190 200 210
510 520 530 540 550 560
pF1KE9 SGLLEYAQFASQTCEFNMIEQSGPPHEPRFKFQVVINGREFPPAEAGSKKVAKQDAAMKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SGLLEYAQFASQTCEFNMIEQSGPPHEPRFKFQVVINGREFPPAEAGSKKVAKQDAAMKA
220 230 240 250 260 270
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 MTILLEEAKAKDSGKSEESSHYSTEKESEKTAESQTPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MTILLEEAKAKDSGKSEESSHYSTEKESEKTAESQTPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHK
280 290 300 310 320 330
630 640 650 660 670 680
pF1KE9 LGNSCEFRLLSKEGPAHEPKFQYCVAVGAQTFPSVSAPSKKVAKQMAAEEAMKALHGEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LGNSCEFRLLSKEGPAHEPKFQYCVAVGAQTFPSVSAPSKKVAKQMAAEEAMKALHGEAT
340 350 360 370 380 390
690 700 710 720 730 740
pF1KE9 NSMASDNQPEGMISESLDNLESMMPNKVRKIGELVRYLNTNPVGGLLEYARSHGFAAEFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NSMASDNQPEGMISESLDNLESMMPNKVRKIGELVRYLNTNPVGGLLEYARSHGFAAEFK
400 410 420 430 440 450
750 760 770 780 790 800
pF1KE9 LVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQGKQEAADAALRVLIGENEKAERMGFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQGKQEAADAALRVLIGENEKAERMGFT
460 470 480 490 500 510
810 820 830 840 850 860
pF1KE9 EVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGSTFHDQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGSTFHDQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLG
520 530 540 550 560 570
870 880 890 900 910 920
pF1KE9 RKILAAIIMKKDSEDMGVVVSLGTGNRCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RKILAAIIMKKDSEDMGVVVSLGTGNRCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYS
580 590 600 610 620 630
930 940 950 960 970 980
pF1KE9 ELMKYNSQTAKDSIFEPAKGGEKLQIKKTVSFHLYISTAPCGDGALFDKSCSDRAMESTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ELMKYNSQTAKDSIFEPAKGGEKLQIKKTVSFHLYISTAPCGDGALFDKSCSDRAMESTE
640 650 660 670 680 690
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE9 SRHYPVFENPKQGKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERLRTMSCSDKILRWNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SRHYPVFENPKQGKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERLRTMSCSDKILRWNV
700 710 720 730 740 750
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE9 LGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGSAFEDGLRHPFIVNHPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGSAFEDGLRHPFIVNHPK
760 770 780 790 800 810
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE9 VGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILDGTRGTVDGPRNELSRVSKKNIFLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILDGTRGTVDGPRNELSRVSKKNIFLLF
820 830 840 850 860 870
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE9 KKLCSFRYRRDLLRLSYGEAKKAARDYETAKNYFKKGLKDMGYGNWISKPQEEKNFYLCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KKLCSFRYRRDLLRLSYGEAKKAARDYETAKNYFKKGLKDMGYGNWISKPQEEKNFYLCP
880 890 900 910 920 930
pF1KE9 V
:
CCDS30 V
>>CCDS33590.1 ADARB1 gene_id:104|Hs109|chr21 (701 aa)
initn: 711 init1: 372 opt: 894 Z-score: 837.2 bits: 166.2 E(33420): 2.7e-40
Smith-Waterman score: 978; 33.5% identity (60.0% similar) in 672 aa overlap (615-1225:79-701)
590 600 610 620 630 640
pF1KE9 SHYSTEKESEKTAESQTPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHEP
: ..:.. .... . .. :::. ::.: :
CCDS33 PGRKRPLEEGSNGHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQ-LNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAP
50 60 70 80 90 100
650 660 670 680 690
pF1KE9 KFQYCVAVGAQTFPSVSAPSKKVAKQMAAEEAMKAL-----HGEA------TNSMASD--
: . : :..:.: . :.:.:: :: :::.:.... .:: : :. .:
CCDS33 LFVMSVEVNGQVFEG-SGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFT
110 120 130 140 150 160
700 710 720 730
pF1KE9 -NQ---PEGMIS--ESLDNLE------SMMPNKVRKIGELVRYLNTNPVGGLLE------
.: :. ... :. :. : : .. . :.: :...:: . :
CCDS33 SDQADFPDTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLS--LSASPVPASLAQPPLPV
170 180 190 200 210 220
740 750 760 770
pF1KE9 ---YARSHGFAA-----------EFKLVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQ
. : .. ....:: : .::... : :..: . ...::
CCDS33 LPPFPPPSGKNPVMILNELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEG-SGRNKKL
230 240 250 260 270 280
780 790 800 810 820 830
pF1KE9 GKQEAADAALRVLIGENEKAERMGFTEVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGST
.: .::..:: .... : :...: :: .: :
CCDS33 AKARAAQSALAAIFN-------------------------LHLDQTPSRQP--IPSEGLQ
290 300 310
840 850 860 870 880 890
pF1KE9 FH------DQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLGRKILAAIIMKK--DSEDMGVVVSLGTGN
.: : .. : :. ::..:. ::.::...: : .: :. :..::.
CCDS33 LHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTGTDVKDAKVI-SVSTGT
320 330 340 350 360 370
900 910 920 930 940
pF1KE9 RCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKY--NSQTAKDSIFEPA-KGGEK
.:..:. .: .: ..:::::::::::...::::..: : :.. : :::. . .:: .
CCDS33 KCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDDQKRSIFQKSERGGFR
380 390 400 410 420 430
950 960 970 980 990 1000
pF1KE9 LQIKKTVSFHLYISTAPCGDGALFDKSCSDRAMESTESRHYPVFENPKQGKLRTKVENGE
: :..:.:::::::.::::. .: : . .: .:: : . .:.::::.:.::
CCDS33 L--KENVQFHLYISTSPCGDARIF--SPHEPILEEPADRH-P--NRKARGQLRTKIESGE
440 450 460 470 480
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE9 GTIPVESSDIVPTWDGIRLGERLRTMSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLG
:::::.:. . ::::. :::: :::::::: ::::.:.::.::. :..:::..:. ::
CCDS33 GTIPVRSNASIQTWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILG
490 500 510 520 530 540
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE9 YLFSQGHLTRAICCRVTRDGSAFEDGLRHPFIVNHPKVGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNW
:. ::.::. :. : .:: : . .:.: .. .: .. :: ::. . ::::
CCDS33 SLYHGDHLSRAMYQRI----SNIED-LPPLYTLNKPLLSGISNAEA-RQPGKAPNFSVNW
550 560 570 580 590 600
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE9 CLADGYDLEILDGTRGTVDGPRNELSRVSKKNIFL----LFKKLCSFRYRRDLLRLS-YG
..:. .:....: : . : ::. :. .. . :. : : . . . :
CCDS33 TVGDSA-IEVINATTGKDELGRA--SRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYH
610 620 630 640 650
1190 1200 1210 1220
pF1KE9 EAKKAARDYETAKNYFKKGLKDMGYGNWISKPQEEKNFYLCPV
:.: ::..:..:: . .. : : :. :: :. .: : :
CCDS33 ESKLAAKEYQAAKARLFTAFIKAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP
660 670 680 690 700
>>CCDS7058.1 ADARB2 gene_id:105|Hs109|chr10 (739 aa)
initn: 792 init1: 386 opt: 853 Z-score: 798.5 bits: 159.1 E(33420): 3.8e-38
Smith-Waterman score: 921; 31.4% identity (60.2% similar) in 633 aa overlap (614-1223:125-737)
590 600 610 620 630 640
pF1KE9 SSHYSTEKESEKTAESQTPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHE
.: ..:.. .:.: . ..: .:. ::.:
CCDS70 GAKRKRPLEEGNGGHLCKLQLVWKKLSWSVAPKNALVQ-LHELRPGLQYRTVSQTGPVHA
100 110 120 130 140 150
650 660 670 680 690
pF1KE9 PKFQYCVAVGAQTFPSVSAPSKKVAKQMAAEEAMKAL-----HGEATNSMASDNQPEGMI
: : : :.. :: . ..:.:: ::. ::: :.... .: .:.. : .
CCDS70 PVFAVAVEVNGLTFEG-TGPTKKKAKMRAAELALRSFVQFPNACQAHLAMGGGPGPGTDF
160 170 180 190 200 210
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CCDS70 QAAQAALQELFDIQMPGHAPGRARRTPMP-QEFADSISQLVTQKFREVTTDLTPMHARHK
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CCDS70 LELHLSKRREDSERSIFVRLKEGGYRL--RENILFHLYVSTSPCGDARLHSPYEITTDLH
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CCDS70 RPLLSGVSDAEA-RQPGKSPPFSMNWVVGSA-DLEIINATTGRRSCGGPSRLCKHVLSAR
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CCDS70 WARLYGRLSTRTPSPGDTPSMYCEAKLGAHTYQSVKQQLFKAFQKAGLGTWVRKPPEQQQ
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: :
CCDS70 FLLTL
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CCDS33 GAWVEKPTEQDQFSLTP
730 740
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CCDS42 SDQADFPDTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLS--LSASPVPASLAQPPLPV
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CCDS42 AKARAAQSALAAIFN-------------------------LHLDQTPSRQP--IPSEGLQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]