Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9628
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9628, 882 aa
1>>>pF1KE9628 882 - 882 aa - 882 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8519+/-0.00105; mu= 16.1490+/- 0.063
mean_var=140.4763+/-27.654, 0's: 0 Z-trim(108.6): 16 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.108211
statistics sampled from 10288 (10301) to 10288 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16
Scan time: 4.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33623.1 PIWIL3 gene_id:440822|Hs108|chr22 ( 882) 5913 935.4 0
CCDS9268.1 PIWIL1 gene_id:9271|Hs108|chr12 ( 861) 2902 465.3 2.1e-130
CCDS6029.1 PIWIL2 gene_id:55124|Hs108|chr8 ( 973) 1791 291.9 3.7e-78
CCDS31656.1 PIWIL4 gene_id:143689|Hs108|chr11 ( 852) 1454 239.3 2.3e-62
CCDS83261.1 PIWIL2 gene_id:55124|Hs108|chr8 ( 937) 1454 239.3 2.5e-62
CCDS6380.1 AGO2 gene_id:27161|Hs108|chr8 ( 859) 432 79.7 2.5e-14
CCDS400.1 AGO3 gene_id:192669|Hs108|chr1 ( 626) 412 76.5 1.7e-13
CCDS399.1 AGO3 gene_id:192669|Hs108|chr1 ( 860) 412 76.6 2.2e-13
CCDS81300.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1 ( 782) 397 74.2 1e-12
CCDS398.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1 ( 857) 397 74.3 1.1e-12
>>CCDS33623.1 PIWIL3 gene_id:440822|Hs108|chr22 (882 aa)
initn: 5913 init1: 5913 opt: 5913 Z-score: 4995.1 bits: 935.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5913; 100.0% identity (100.0% similar) in 882 aa overlap (1-882:1-882)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MPGRARTRARGRARRRESYQQEAPGGPRAPGSATTQEPPQLQSTPRPLQEEVPVVRPLQP
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CCDS33 MPGRARTRARGRARRRESYQQEAPGGPRAPGSATTQEPPQLQSTPRPLQEEVPVVRPLQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RAARGGAGGGAQSQGVKEPGPEAGLHTAPLQERRIGGVFQDLVVNTRQDMKHVKDSKTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RAARGGAGGGAQSQGVKEPGPEAGLHTAPLQERRIGGVFQDLVVNTRQDMKHVKDSKTGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 EGTVVQLLANHFRVISRPQWVAYKYNVDYKPDIEDGNLRTILLDQHRRKFGERHIFDGNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EGTVVQLLANHFRVISRPQWVAYKYNVDYKPDIEDGNLRTILLDQHRRKFGERHIFDGNS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LLLSRPLKERRVEWLSTTKDKNIVKITVEFSKELTPTSPDCLRYYNILFRRTFKLLDFEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLLSRPLKERRVEWLSTTKDKNIVKITVEFSKELTPTSPDCLRYYNILFRRTFKLLDFEQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 VGRNYYTKKKAIQLYRHGTSLEIWLGYVTSVLQYENSITLCADVSHKLLRIETAYDFIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VGRNYYTKKKAIQLYRHGTSLEIWLGYVTSVLQYENSITLCADVSHKLLRIETAYDFIKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 TSAQAQTGNIREEVTNKLIGSIVLTKYNNKTYRVDDIDWKQNPEDTFNKSDGSKITYIDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TSAQAQTGNIREEVTNKLIGSIVLTKYNNKTYRVDDIDWKQNPEDTFNKSDGSKITYIDY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 YRQQHKEIVTVKKQPLLVSQGRWKKGLTGTQREPILLIPQLCHMTGLTDEICKDYSIVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YRQQHKEIVTVKKQPLLVSQGRWKKGLTGTQREPILLIPQLCHMTGLTDEICKDYSIVKE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 LAKHTRLSPRRRHHTLKEFINTLQDNKKVRELLQLWDLKFDTNFLSVPGRVLKNANIVQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LAKHTRLSPRRRHHTLKEFINTLQDNKKVRELLQLWDLKFDTNFLSVPGRVLKNANIVQG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 RRMVKANSQGDWSREIRELPLLNAMPLHSWLILYSRSSHREAMSLKGHLQSVTAPMGITM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RRMVKANSQGDWSREIRELPLLNAMPLHSWLILYSRSSHREAMSLKGHLQSVTAPMGITM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 KPAEMIEVDGDANSYIDTLRKYTRPTLQMGMSCLLVFKVICILPNDDKRRYDSIKRYLCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KPAEMIEVDGDANSYIDTLRKYTRPTLQMGMSCLLVFKVICILPNDDKRRYDSIKRYLCT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 KCPIPSQCVVKKTLEKVQARTIVTKIAQQMNCKMGGALWKVETDVQRTMFVGIDCFHDIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KCPIPSQCVVKKTLEKVQARTIVTKIAQQMNCKMGGALWKVETDVQRTMFVGIDCFHDIV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 NRQKSIAGFVASTNAELTKWYSQCVIQKTGEELVKELEICLKAALDVWCKNESSMPHSVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NRQKSIAGFVASTNAELTKWYSQCVIQKTGEELVKELEICLKAALDVWCKNESSMPHSVI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 VYRDGVGDGQLQALLDHEAKKMSTYLKTISPNNFTLAFIVVKKRINTRFFLKHGSNFQNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VYRDGVGDGQLQALLDHEAKKMSTYLKTISPNNFTLAFIVVKKRINTRFFLKHGSNFQNP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 PPGTVIDVELTRNEWYDFFIVSQSVQDGTVTPTHYNVIYDTIGLSPDTVQRLTYCLCHMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PPGTVIDVELTRNEWYDFFIVSQSVQDGTVTPTHYNVIYDTIGLSPDTVQRLTYCLCHMY
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KE9 YNLPGIIRVPAPCHYAHKLAYLVGQSIHQEPNRSLSTRLFYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YNLPGIIRVPAPCHYAHKLAYLVGQSIHQEPNRSLSTRLFYL
850 860 870 880
>>CCDS9268.1 PIWIL1 gene_id:9271|Hs108|chr12 (861 aa)
initn: 2904 init1: 783 opt: 2902 Z-score: 2454.8 bits: 465.3 E(32554): 2.1e-130
Smith-Waterman score: 2945; 50.5% identity (76.2% similar) in 889 aa overlap (1-882:1-861)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MPGRARTRARGRARRRESYQQEAPGGPRAPGSATTQEPPQLQSTPRPLQEEVPVVRPLQP
: ::::.::::::: .:. : ::...:.: .: :.: :. :
CCDS92 MTGRARARARGRARGQETAQLV--------GSTASQQPGYIQPRPQP----PPAEGELFG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE9 RA-ARGGAGGGAQSQGVKEPGPEAGLHTAPLQERRIGGV---FQDLVVNTRQDMKHVKDS
:. :: ::: :.:::.. ::.. : :: :: :.:: :::::.. :::.:
CCDS92 RGRQRGTAGGTAKSQGLQ---ISAGFQELSLAER--GGRRRDFHDLGVNTRQNLDHVKES
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 KTGSEGTVVQLLANHFRVISRPQWVAYKYNVDYKPDIEDGNLRTILLDQHRRKFGERHIF
:::: : .:.: .::::. :::::. :.:..::.: .: ::. :: ::. .:. : :
CCDS92 KTGSSGIIVRLSTNHFRLTSRPQWALYQYHIDYNPLMEARRLRSALLFQHEDLIGKCHAF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 DGNSLLLSRPLKERRVEWLSTTKDKNIVKITVEFSKELTPTSPDCLRYYNILFRRTFKLL
::. :.: . :... .: .: :.. . :.::. ...:: :::: ::..:::.::: .:..
CCDS92 DGTILFLPKRLQQKVTEVFSKTRNGEDVRITITLTNELPPTSPTCLQFYNIIFRRLLKIM
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 DFEQVGRNYYTKKKAIQLYRHGTSLEIWLGYVTSVLQYENSITLCADVSHKLLRIETAYD
...:.:::::. . :.. : : :: :..::.::::::: ::.:::::.:: ::. :
CCDS92 NLQQIGRNYYNPNDPIDIPSH--RLVIWPGFTTSILQYENSIMLCTDVSHKVLRSETVLD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 FIKRTSAQAQTGNIREEVTNKLIGSIVLTKYNNKTYRVDDIDWKQNPEDTFNKSDGSKIT
:. :.. ...:.:...::: .::::::::::::::::: :::..::.:.:::...
CCDS92 FMFNFYHQTEEHKFQEQVSKELIGLVVLTKYNNKTYRVDDIDWDQNPKSTFKKADGSEVS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 YIDYYRQQHKEIVTVKKQPLLVSQGRWKKGLTGTQREPILLIPQLCHMTGLTDEICKDYS
...:::.:... .: :::.:::: . ..: :: : .:::.::..:::::.. .:..
CCDS92 FLEYYRKQYNQEITDLKQPVLVSQPKRRRGPGGTLPGPAMLIPELCYLTGLTDKMRNDFN
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 IVKELAKHTRLSPRRRHHTLKEFINTLQDNKKVRELLQLWDLKFDTNFLSVPGRVLKNAN
..:.:: ::::.:..:.. . ..:. .. : .:.. :. : :.::.:.:: ::.:.. .
CCDS92 VMKDLAVHTRLTPEQRQREVGRLIDYIHKNDNVQRELRDWGLSFDSNLLSFSGRILQTEK
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE9 IVQGRRMVKANSQ-GDWSREIRELPLLNAMPLHSWLILYSRSSHREAMSLKGHLQSVTAP
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CCDS92 IHQGGKTFDYNPQFADWSKETRGAPLISVKPLDNWLLIYTRRNYEAANSLIQNLFKVTPA
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE9 MGITMKPAEMIEVDGDANSYIDTLRKYTRPTLQMGMSCLLVFKVICILPNDDKRRYDSIK
::. :. : ::::: ...:. .:.. . :. :.:.: .. : .::.::
CCDS92 MGMQMRKAIMIEVDDRTEAYLRVLQQKVTADTQI---------VVCLLSSNRKDKYDAIK
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE9 RYLCTKCPIPSQCVVKKTLEKVQA-RTIVTKIAQQMNCKMGGALWKVETDVQRTMFVGID
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CCDS92 KYLCTDCPTPSQCVVARTLGKQQTVMAIATKIALQMNCKMGGELWRVDIPLKLVMIVGID
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KE9 CFHDIVNRQKSIAGFVASTNAELTKWYSQCVIQKTGEELVKELEICLKAALDVWCKNESS
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CCDS92 CYHDMTAGRRSIAGFVASINEGMTRWFSRCIFQDRGQELVDGLKVCLQAALRAWNSCNEY
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE9 MPHSVIVYRDGVGDGQLQALLDHEAKKMSTYLKTISPN-NFTLAFIVVKKRINTRFFLKH
:: .::::::::::::..:...:. .. ::.:. . : :. ::::::.::::: .
CCDS92 MPSRIIVYRDGVGDGQLKTLVNYEVPQFLDCLKSIGRGYNPRLTVIVVKKRVNTRFFAQS
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KE9 GSNFQNPPPGTVIDVELTRNEWYDFFIVSQSVQDGTVTPTHYNVIYDTIGLSPDTVQRLT
:. .::: ::::::::.:: ::::::::::.:..:.:.:::::::::. ::.:: .::::
CCDS92 GGRLQNPLPGTVIDVEVTRPEWYDFFIVSQAVRSGSVSPTHYNVIYDNSGLKPDHIQRLT
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880
pF1KE9 YCLCHMYYNLPGIIRVPAPCHYAHKLAYLVGQSIHQEPNRSLSTRLFYL
: :::.::: ::.:::::::.::::::.:::::::.::: :::.::.::
CCDS92 YKLCHIYYNWPGVIRVPAPCQYAHKLAFLVGQSIHREPNLSLSNRLYYL
820 830 840 850 860
>>CCDS6029.1 PIWIL2 gene_id:55124|Hs108|chr8 (973 aa)
initn: 1322 init1: 809 opt: 1791 Z-score: 1516.7 bits: 291.9 E(32554): 3.7e-78
Smith-Waterman score: 1799; 34.7% identity (66.3% similar) in 833 aa overlap (65-882:157-973)
40 50 60 70 80
pF1KE9 TQEPPQLQSTPRPLQEEVPVVRPLQPRAARGGAGGGAQSQGVKEP----GPEAG---LHT
: :.:: . . : : : : : .
CCDS60 AAGDSKMAETSVGWSRTLGRGSSDASLLPLGRAAGGISREVDKPPCTFSTPSRGPPQLSS
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 AP-LQERRIGGVFQDLVVNTRQDMKHVKDSKTGSEGTVVQLLANHFRVISRPQWVAYKYN
: : . . . . ::..... :.. : ::.:: .: : .. . . : :.:.
CCDS60 PPALPQSPLHSPDRPLVLTVEHKEKELI-VKQGSKGTPQSLGLNLVKIQCHNEAV-YQYH
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 VDYKPDIEDGNLRTILLDQHRRKFGERHIFDGNSLLLSRPLKERRVEWLSTTK--DKNIV
: ..:..: ..: .: .:. :. :::. : : :.: ..: :.. . :. .
CCDS60 VTFSPNVECKSMRFGMLKDHQAVTGNVTAFDGSILYL--PVKLQQVLELKSQRKTDSAEI
250 260 270 280 290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 KITVEFSKELTPTSPDCLRYYNILFRRTFKLLDFEQVGRNYYTKKKAIQLYRHGTSLEIW
.: ....: : : : :. .::..:::..::::.. ::::.: .:. : .: :.::
CCDS60 SIKIQMTKILEPCSDLCIPFYNVVFRRVMKLLDMKLVGRNFYDPTSAMVLQQH--RLQIW
310 320 330 340 350 360
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 LGYVTSVLQYENSITLCADVSHKLLRIETAYDFIKRTSAQAQTGNIREEVTNKLIGSIVL
::..:. . .... : ::::::..: . . : .. : . ....: :. :.:.::.
CCDS60 PGYAASIRRTDGGLFLLADVSHKVIRNDCVLDVMHAIYQQNKE-HFQDECTKLLVGNIVI
370 380 390 400 410
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 TKYNNKTYRVDDIDWKQNPEDTFNKSDGSKITYIDYYRQQHKEIVTVKKQPLLVSQGRWK
:.:::.:::.::.::...:.:.:. :::..::...:: ... : . ::::. . .
CCDS60 TRYNNRTYRIDDVDWNKTPKDSFTMSDGKEITFLEYYSKNYGITVKEEDQPLLIHRPSER
420 430 440 450 460 470
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 KGLTGTQ-REPILLIPQLCHMTGLTDEICKDYSIVKELAKHTRLSPRRRHHTLKEFINTL
. : . :::.:.: :::. ... ::. .:.::.. :::...: .:. ... .
CCDS60 QDNHGMLLKGEILLLPELSFMTGIPEKMKKDFRAMKDLAQQINLSPKQHHSALECLLQRI
480 490 500 510 520 530
450 460 470 480 490 500
pF1KE9 QDNKKVRELLQLWDLKFDTNFLSVPGRVLKNANIVQGRRMVKANSQGDWSREIRELPLLN
:. . . :. : :... . .. :::: : .... .: .:. . : .
CCDS60 AKNEAATNELMRWGLRLQKDVHKIEGRVLPMERINLKNTSFITSQELNWVKEVTRDPSIL
540 550 560 570 580 590
510 520 530 540 550 560
pF1KE9 AMPLHSWLILYSRSSHREAMSLKGHLQSVTAPMGITMKPAEMIEVDGD-ANSYIDTLRKY
..:.: : ..: . . .: : . :.....:.:. :.: .:. : ..:. :...
CCDS60 TIPMHFWALFYPKRAMDQARELVNMLEKIAGPIGMRMSPPAWVELKDDRIETYVRTIQST
600 610 620 630 640 650
570 580 590 600 610
pF1KE9 TRPTLQMGMSCLLVFKVICIL--PNDDKRRYDSIKRYLCTKCPIPSQCVVKKTL-EKVQA
.. : :.::. : :: : .::. :.. :.::: : .:. . ..
CCDS60 LGAEGKIQM-------VVCIIMGPRDDL--YGAIKKLCCVQSPVPSQVVNVRTIGQPTRL
660 670 680 690 700 710
620 630 640 650 660 670
pF1KE9 RTIVTKIAQQMNCKMGGALWKVETDVQRTMFVGIDCFHDIVNRQKSIAGFVASTNAELTK
:... :: :.:::.:: :: :. ... : .:.: .:: ..:..::::: : :::
CCDS60 RSVAQKILLQINCKLGGELWGVDIPLKQLMVIGMDVYHDPSRGMRSVVGFVASINLTLTK
720 730 740 750 760 770
680 690 700 710 720 730
pF1KE9 WYSQCVIQKTGEELVKELEICLKAALDVWCKNESSMPHSVIVYRDGVGDGQLQALLDHEA
:::. :.: .:.: :..:: ..: . . . .:....::::::.::::... ..:
CCDS60 WYSRVVFQMPHQEIVDSLKLCLVGSLKKFYEVNHCLPEKIVVYRDGVSDGQLKTVANYEI
780 790 800 810 820 830
740 750 760 770 780 790
pF1KE9 KKMSTYLKTISPNNFTLAFIVVKKRINTRFFLKHGSNFQNPPPGTVIDVELTRNEWYDFF
... .... . .. .::.:.:.: ..: .:: .: ::::.: .: :: ::.
CCDS60 PQLQKCFEAFENYQPKMVVFVVQKKISTNLYLAAPQNFVTPTPGTVVDHTITSCEWVDFY
840 850 860 870 880 890
800 810 820 830 840 850
pF1KE9 IVSQSVQDGTVTPTHYNVIYDTIGLSPDTVQRLTYCLCHMYYNLPGIIRVPAPCHYAHKL
.... :..: :::: . .: .:::: .::::. :::::.: :: :::::::.:::::
CCDS60 LLAHHVRQGCGIPTHYVCVLNTANLSPDHMQRLTFKLCHMYWNWPGTIRVPAPCKYAHKL
900 910 920 930 940 950
860 870 880
pF1KE9 AYLVGQSIHQEPNRSLSTRLFYL
:.: :. .:.:: .: ::.:
CCDS60 AFLSGHILHHEPAIQLCENLFFL
960 970
>>CCDS31656.1 PIWIL4 gene_id:143689|Hs108|chr11 (852 aa)
initn: 1432 init1: 561 opt: 1454 Z-score: 1233.1 bits: 239.3 E(32554): 2.3e-62
Smith-Waterman score: 2193; 39.5% identity (69.7% similar) in 887 aa overlap (1-882:1-852)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MPGRARTRARGRARRRESYQQEAPGGPRAPGSATTQEPPQLQSTPRPLQEEVPVVRPLQP
: ::::..::: : :.: ::: : ..:..: : . .. .
CCDS31 MSGRARVKARGIA--------------RSP-SAT--EVGRIQASPLPRSVDLSN----NE
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE9 RAARGGAGGGAQSQGVKEPGPEAGLHTAPLQERRIGGV--FQDLVVNTRQDMKHVKDSKT
.. .: : .. . . : .: . ..:: . . :.:: . ::. . ::.. ::
CCDS31 ASSSNGFLGTSRISTNDKYGISSGDAGSTFMERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKT
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 GSEGTVVQLLANHFRVISRPQ-WVAYKYNVDYKPDIEDGNLRTILLDQHRRKFGERHIFD
:: : :.:..: : .. :: : :.:.: : ::. . :: :: .: . .. . ::
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pF1KE9 GNSLLLSRPLKERRVEWLSTTKDKNIVKITVEFSKELTPTSPDCLRYYNILFRRTFKLLD
: :.::. :.:. .: : :. . .:.:. ...:: .:: :.. .::.::. .: :.
CCDS31 GAILFLSQKLEEKVTELSSETQRGETIKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLS
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pF1KE9 FEQVGRNYYTKKKAIQLYRHGTSLEIWLGYVTSVLQYENSITLCADVSHKLLRIETAYDF
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CCDS31 MYQIGRNFYNPSEPMEIPQHKLSL--WPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEF
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pF1KE9 IKRTSAQAQTGNIREEVTNKLIGSIVLTKYNNKTYRVDDIDWKQNPEDTFNKSDGSKITY
. .. . . . ..::: ::::.:::.:: .:::::. .: ::.: ::..:::
CCDS31 MTALCQRTGLSCFTQTCEKQLIGLIVLTRYNNRTYSIDDIDWSVKPTHTFQKRDGTEITY
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pF1KE9 IDYYRQQHKEIVTVKKQPLLVSQGRWKKGLTGTQREPILLIPQLCHMTGLTDEICKDYSI
.:::.::. :. .::.::: . :.. ... . :::.:: .:::::. .:...
CCDS31 VDYYKQQYDITVSDLNQPMLVSLLKKKRN-DNSEAQLAHLIPELCFLTGLTDQATSDFQL
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pF1KE9 VKELAKHTRLSPRRRHHTLKEFINTLQDNKKVRELLQLWDLKFDTNFLSVPGRVLKNANI
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CCDS31 MKAVAEKTRLSPSGRQQRLARLVDNIQRNTNARFELETWGLHFGSQ-ISLTGRIVPSEKI
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.. .. . : .:::..:: .:::. :..:::: : .. : :. . :. :.. ::
CCDS31 LMQDHICQPVSAADWSKDIRTCKILNAQSLNTWLILCSDRTEYVAESFLNCLRRVAGSMG
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pF1KE9 ITMKPAEMIEVDGDANSYIDTLRKYTRPTLQMGMSCLLVFKVICILPNDDKRRYDSIKRY
... ..:.:. . ... ....:. : .:. :.::::...: :::::.:
CCDS31 FNVDYPKIIKVQENPAAFVRAIQQYVDPDVQL---------VMCILPSNQKTYYDSIKKY
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: . ::.:::::. .::.: . .:.::::.::.::.:: :: :: .. : ::::
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pF1KE9 HDIVNRQKSIAGFVASTNAELTKWYSQCVIQKTGEELVKELEICLKAALDVWCKNESSMP
.: .... ..: :::.: ..:.:.:.:..:.: ... :.. . .::. : : . ..:
CCDS31 KDALSKDVMVVGCVASVNPRITRWFSRCILQRTMTDVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLP
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pF1KE9 HSVIVYRDGVGDGQLQALLDHEAKKM-STYLKTISPNNFTLAFIVVKKRINTRFFLKHGS
.:::: :::::::..:...:. .. :. .. : .. :. :::.:. ::: . .
CCDS31 ARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYEVPQLLSSVAESSSNTSSRLSVIVVRKKCMPRFFTEMNR
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pF1KE9 NFQNPPPGTVIDVELTRNEWYDFFIVSQSVQDGTVTPTHYNVIYDTIGLSPDTVQRLTYC
. :::: :::.: : ::::::::...:: . :::.::.:::::: ::.:: .::::.
CCDS31 TVQNPPLGTVVDSEATRNEWYDFYLISQVACRGTVSPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFK
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CCDS31 LCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAHKLTFLVAQSIHKEPSLELANHLFYL
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.: ....: : : : :. .::..:::..::::.. ::::.: .:. : .: :.::
CCDS83 SIKIQMTKILEPCSDLCIPFYNVVFRRVMKLLDMKLVGRNFYDPTSAMVLQQH--RLQIW
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::..:. . .... : ::::::..: . . : .. : . ....: :. :.:.::.
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CCDS83 TRYNNRTYRIDDVDWNKTPKDSFTMSDGKEITFLEYYSKNYGITVKEEDQPLLIHRPSER
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CCDS83 QDNHGMLLKGEILLLPELSFMTGIPEKMKKDFRAMKDLAQQINLSPKQHHSALECLLQRI
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CCDS83 AKNEAATNELMRWGLRLQKDVHKIEGRVLPMERINLKNTSFITSQELNWVKEVTRDPSIL
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..:.: : ..: . . .: : . :.....:.:. :.: .:. : ..:. :...
CCDS83 TIPMHFWALFYPKRAMDQARELVNMLEKIAGPIGMRMSPPAWVELKDDRIETYVRTIQST
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CCDS83 LGAEGKIQM-------VVCIIMGPRDDL--YGAIKKLCCVQSPVPSQVVNVRTIGQPTRL
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:... :: :.:::.:: :: :. ... : .:.: .:: ..:..::::: : :::
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CCDS83 WYSRVVFQMPHQEIVDSLKLCLVGSLKKFYEVNHCLPEKIVVYRDGVSDGQLKTVANYEI
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... .... . .. .::.:.:.: ..: .:: .: ::::.: .: ::
CCDS83 PQLQKCFEAFENYQPKMVVFVVQKKISTNLYLAAPQNFVTPTPGTVVDHTITSCEW----
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CCDS83 --------------------------------LTFKLCHMYWNWPGTIRVPAPCKYAHKL
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CCDS83 AFLSGHILHHEPAIQLCENLFFL
920 930
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CCDS63 IKPEKCPRRVNREIVEHMVQHFKTQIFGDRKPVFDGRKNLYTAMPLPIGRDKVELEVTLP
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CCDS63 GEGKDR-IFKVSIKWVSCVSLQALHDALSGRLPSVPFETIQALDVVMRH-LPSMRYTPVG
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. .:. . : .:....:: .. . : : . :. .: . .. : : .
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:::. . .... : : .: :... : . . ... . :::. . ..
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:. :::. : .:: : . .::: :..... .:. ... ..: :.:
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. .:....: .. : . :. : .: :::::..::.: .: :: . .
CCDS63 QHRQEIIQDLAAMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFQQVLHHELLAIREACI
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: . . ..::::.:: .::.: .. : : ::..:...:. .::.. :
CCDS63 KLEKDYQPGITFIVVQKRHHTRLFCTDKNERVGKSGNIPAGTTVDTKITHPTEFDFYLCS
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CCDS63 ARYHLVDKEHDSAEGSHTSGQSNGRDHQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
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: .:: : . .::: :.. :.. .:. ... ..: :.:: . .. . ::
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..:.: : : .. .. :::. :.: .:. ... . .:. .:....:
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.. : . :. : .: :::::..::.. .: .: . .. . . ..
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::. . :....: .... : : . .. ....:. .
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. .. . :: . ::: .:.... :. .. . ... . .. . .. . :
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..: :.:: . .. . :: ..:.: : : .. .. :::. :.: .:. .
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.. . .:. .:....: .. : . :. : .: :::::..::.. .: .:
CCDS39 RYCATVRVQRPRQEIIQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYE
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. .. . . ...:::.:: .::.: .. : : ::..:...:.
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.::: .:.
CCDS39 YYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA
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>>CCDS81300.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1 (782 aa)
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190 200 210 220 230
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CCDS81 NERVDFEVTIPGEGKDR-IFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIPVPLESVQALDVAMRH
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CCDS81 -LASMRYTPVGRSFFSPPEG---YYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAF
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. . . .: :. . : . : . : . :... : : . . . . ::: ..
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. ..:: . .:. . : .:..:... . . : : . :. .: .
CCDS81 TRRPASHQTFPLQLESGQTVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCL-QVGQEQKHTYLPLEV
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.: . .: .. : :::: : :.: :: : . . .:: : ..: . :.. ..
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: : . ... :: . .. .:.... :. .. . ... . .. . .. .
CCDS81 VWAIACFAPQKQCREEVLKNFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLK
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: . :.. ..: :::. : .:: : . .::: :.. :.. .:. .
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CCDS81 NLCLKINVKLGG-INNILVPHQRSAVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSITAVVGSMDA
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. ... . .:. .:....: .. : . :. : .: ::::: .::: .:
CCDS81 HPSRYCATVRVQRPRQEIIEDLSYMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVPEGQLPQIL
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.: . .. .: . . ...:::.:: .::.: .. : : ::..:...
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CCDS81 THPFEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYYVLWDDNRFTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIP
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pF1KE9 APCHYAHKLAYLVGQSIHQEPNRSLSTRLFYL
:: .::. .:.
CCDS81 APAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHISGQSNGRDPQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
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CCDS39 MEAGPSGAAAGAYLPPLQQ-----VFQ---APRRPG
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pF1KE9 MKHVKDSKTGSEGTVVQLLANHFRVISRPQWVAYKYNVDYKPDIEDGNL-RTIL--LDQH
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CCDS39 I--------GTVGKPIKLLANYFEV-DIPKIDVYHYEVDIKPDKCPRRVNREVVEYMVQH
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CCDS39 FKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALPIGNERVDFEVTIPGEGKDR-IFKVSIKWLAIVSW
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:. . .. .. .:. . . . :::.... .. : : : .
CCDS39 RMLHEALVSGQIPVPLESVQALDVAMRH-LASMRYTPVGRSFFSPPEG---YYHPLGGGR
140 150 160 170 180 190
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. . . : : . :. .: . .. : : . :::. . ...: :
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