Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9574
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9574, 350 aa
1>>>pF1KE9574 350 - 350 aa - 350 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5687+/-0.00102; mu= 14.3469+/- 0.060
mean_var=113.3727+/-34.452, 0's: 0 Z-trim(104.2): 308 B-trim: 1047 in 2/46
Lambda= 0.120454
statistics sampled from 7247 (7782) to 7247 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.587), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 2.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 2296 410.6 9.7e-115
CCDS12699.1 C5AR2 gene_id:27202|Hs108|chr19 ( 337) 774 146.1 4e-35
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 628 120.8 1.8e-27
CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12 ( 482) 516 101.5 1.6e-21
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 498 98.2 1.2e-20
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 488 96.4 3.7e-20
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 487 96.3 4.2e-20
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 483 95.6 6.9e-20
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 482 95.4 7.7e-20
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 480 95.1 9.8e-20
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 480 95.1 1e-19
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 479 94.9 1.2e-19
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 477 94.6 1.5e-19
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 472 93.7 2.6e-19
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 472 93.7 2.7e-19
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 472 93.7 2.7e-19
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 472 93.7 2.9e-19
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 471 93.5 3e-19
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 471 93.5 3e-19
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 469 93.2 3.9e-19
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 469 93.2 4e-19
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 469 93.2 4e-19
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 469 93.2 4e-19
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 469 93.2 4e-19
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 469 93.2 4.1e-19
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 469 93.3 4.3e-19
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 469 93.3 4.6e-19
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 463 92.1 7.6e-19
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 463 92.1 7.6e-19
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 463 92.1 7.8e-19
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 463 92.2 8.4e-19
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 457 91.1 1.7e-18
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 456 90.9 1.8e-18
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 456 90.9 1.8e-18
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 447 89.3 5.1e-18
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 446 89.2 5.9e-18
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 446 89.2 6.6e-18
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 445 89.0 6.7e-18
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 445 89.0 7.1e-18
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 445 89.0 7.1e-18
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 436 87.4 2e-17
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 432 86.7 3.2e-17
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 430 86.4 4.1e-17
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 429 86.2 4.7e-17
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 428 86.0 5.2e-17
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 427 85.8 5.8e-17
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 426 85.7 6.8e-17
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 425 85.5 7.4e-17
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 425 85.5 7.5e-17
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 423 85.1 9.3e-17
>>CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 (350 aa)
initn: 2296 init1: 2296 opt: 2296 Z-score: 2173.4 bits: 410.6 E(32554): 9.7e-115
Smith-Waterman score: 2296; 99.4% identity (100.0% similar) in 350 aa overlap (1-350:1-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGNALVVW
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MDSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGNALVVW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLILLNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLILLNM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 YASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVVREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVVREE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 YFPPKVLCGVDYSHDKRRERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRRATRSTKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YFPPKVLCGVDYSHDKRRERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRRATRSTKT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLLNKLDSLCVSFAYINCCINPIIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS33 LKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLLKKLDSLCVSFAYINCCINPIIY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE9 VVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMAQKTQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMAQKTQAV
310 320 330 340 350
>>CCDS12699.1 C5AR2 gene_id:27202|Hs108|chr19 (337 aa)
initn: 769 init1: 601 opt: 774 Z-score: 744.2 bits: 146.1 E(32554): 4e-35
Smith-Waterman score: 797; 38.4% identity (68.9% similar) in 341 aa overlap (10-343:9-335)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDIL---ALVIFAVVFLVGVLGNAL
.:: :.: . . ::: ... . : : : ..:..::::: :::.
CCDS12 MGNDSVSYEYGDYSDLS----DRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLPLYAAIFLVGVPGNAM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VVWVTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLIL
:.::.. :.: ..: :.:.:::::.: ::.:::: . :.. :::.:...: :::.::
CCDS12 VAWVAGKVARRRVGATWLLHLAVADLLCCLSLPILAVPIARGGHWPYGAVGCRALPSIIL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LNMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVV
:.::::.::::..::: .:.. : : .. . : . .::..:: ::::::.:: .:: .
CCDS12 LTMYASVLLLAALSADLCFLALGPAWWSTVQRACGVQVACGAAWTLALLLTVPSAIYRRL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 REEYFPPKVLCGVDYSHDKRRERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRRATRS
..:.:: .. : :::. .. : ::. .:...::: ::.... :.. .: :. : :
CCDS12 HQEHFPARLQCVVDYGGSSSTENAVTAIRFLFGFLGPLVAVASCHSALL--CWAARRCRP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 TKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLLNKLDSLCVSFAYINCCINP
: :.:..::. : ::.. :.... :.: . . . : :..: . :.::
CCDS12 LGT-----AIVVGFFVCWAPYHLLGLVLTVAAPNSALLARALRAEPLIVGLALAHSCLNP
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 IIYVVAGQGFQGRLRKSLPSL----LRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMAQKTQAV
.... :.. .::.:::. ::. .. : .:: ... :. :
CCDS12 MLFLYFGRA---QLRRSLPAACHWALRESQGQDESVDSKKSTSHDLVSEMEV
290 300 310 320 330
>>CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 (355 aa)
initn: 561 init1: 336 opt: 628 Z-score: 606.8 bits: 120.8 E(32554): 1.8e-27
Smith-Waterman score: 628; 31.2% identity (68.1% similar) in 317 aa overlap (16-327:18-331)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGNALV
: : .:.. ... . : : ..::.. ..:..:. :::.:
CCDS23 MEDLEETLFEEFENYSYDLDYYSLESDLEEKVQ-LGVVHWVSLVLYCLAFVLGIPGNAIV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VWVTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLILL
.: :.:. :.:....::::::.:::. : ::. .. .... ::::: :. :
CCDS23 IWFTGFKWKKTVTTLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 NMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVVR
::.::...:..:: :... ...:. . : . :. : :: :. :.. .: .
CCDS23 NMFASVFFLTVISLDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDTV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 EEYFPPKVLCGVDYS-HDKR----RERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRR
: : ..:: ... :: :..... :....:.:.::::..::: ..... .:
CCDS23 E--FNNHTLCYNNFQKHDPDLTLIRHHVLTWVKFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKRS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 ATRSTKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLLNKLDSLCVSFAYINC
:.. . ....::..: . : ::.. .: .. .: . ... : ...:..:
CCDS23 ILISSRHFWTILVVVVAFVVCWTPYHLFSIWELTIHHNSYSHHVMQAGIPLSTGLAFLNS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 CINPIIYVVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMAQKTQAV
:.:::.::. .. ::.:.:.:. .:. .: : :
CCDS23 CLNPILYVLISKKFQARFRSSVAEILKYTLWEVSCSGTVSEQLRNSETKNLCLLETAQ
300 310 320 330 340 350
>>CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12 (482 aa)
initn: 747 init1: 516 opt: 516 Z-score: 500.0 bits: 101.5 E(32554): 1.6e-21
Smith-Waterman score: 516; 47.9% identity (83.8% similar) in 142 aa overlap (36-177:22-163)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 YTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGNALVVWVTAFE
: ::..::....::.:. ::.::.::....
CCDS85 MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAGLK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 AKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLILLNMYASIL
.::.:.::::.:..::.: ::.::. .. .. . .::.: :...::.:.:::.::..
CCDS85 MQRTVNTIWFLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFASVF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVVREEYFPPK
::..:: :: :.::::::::: :..:.: :. : .:... :: :.:: .
CCDS85 LLTAISLDRCLVVFKPIWCQNHRNVGMACSICGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTTDNHNR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VLCGVDYSHDKRRERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRRATRSTKTLKVVV
CCDS85 CGYKFGLSSSLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWTVPTVFQP
180 190 200 210 220 230
>>CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 (369 aa)
initn: 434 init1: 256 opt: 498 Z-score: 484.5 bits: 98.2 E(32554): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 498; 31.0% identity (60.9% similar) in 348 aa overlap (12-347:23-359)
10 20 30 40
pF1KE9 MNSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPV-DKTSNTLRVPDILALVIFAVVF
: . .: . . : : :::. .:... : ::
CCDS11 MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNA-----VLTFIYF-VVC
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 LVGVLGNALVVWVTAFEAK-RTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGA
..:. ::.::..: :: .::. :..::::.:: : :.::.: ... : :::: :
CCDS11 IIGLCGNTLVIYVILRYAKMKTITNIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVH-WPFGKA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 ACSILPSLILLNMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLL
: .. .. .:...::. :...: ::.: : .:: ..: : . ..::..::.
CCDS11 ICRVVMTVDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 TIPSFLYRVVREEYFPPKVLCGVDYSHDKRR-ERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFIL
.: ..: .: . . . : ... .. . : ..:::: :: . .:: ::.
CCDS11 ILPIMIYAGLRSNQWG-RSSCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFII
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE9 L-------RTWSRRATRSTKTLKVVVAVVASFFIF-WLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLL
. :. : . .: : . .:..:.. ::: :::. . .. : ::: :
CCDS11 IKVKSSGIRVGSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVS-SVSMAISPTPALK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 NKLDSLCVSFAYINCCINPIIYVVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESKS-FTR
. .: . : ..: : : :::.:. ...:. ... : :.. :... .::. .:
CCDS11 GMFD-FVVVLTYANSCANPILYAFLSDNFKKSFQNVL-CLVKVSGTDDGERSDSKQDKSR
300 310 320 330 340
340 350
pF1KE9 STVDTMAQKTQAV
. : .:.:
CCDS11 LNETTETQRTLLNGDLQTSI
350 360
>>CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 (350 aa)
initn: 423 init1: 174 opt: 488 Z-score: 475.4 bits: 96.4 E(32554): 3.7e-20
Smith-Waterman score: 488; 29.5% identity (62.0% similar) in 353 aa overlap (5-341:3-345)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSN-----TLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGN
: : :.. .:: . . :.:. . : . .... .:.:::...:::
CCDS24 MSNITDPQMWDFDDLNFTGM-PPADEDYSPCMLETETLNKYVVIIAYALVFLLSLLGN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 ALVVWVTAF-EAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPS
.::. : . .. :... ...::::.::.: :.::: .: : . : :: :...
CCDS24 SLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKV--NGWIFGTFLCKVVSL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LILLNMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLY
: .:.:..::::: ::.::.: . . . . :. ..: :::.. :..: ::.
CCDS24 LKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQK-RHLVKFVCLGCWGLSMNLSLPFFLF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE9 RVVREEYFPPKV--LCGVDYSHDKRRERAVA-IVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWS
:. : : . .: ..: . : : :. ..::. ::... .:: : : ..
CCDS24 ---RQAYHPNNSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRTLFK
180 190 200 210 220 230
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. .. ....:. ::: :.. ::::.. : . . .. : ... ::.
CCDS24 AHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRALDATE
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CCDS24 I-LGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILA--MHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVNVSS
300 310 320 330 340
350
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CCDS24 NL
350
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:: :: . : : :: .:... ..: ....::..:..:: :::
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CCDS27 VLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLP-FWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGFYYTG
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CCDS27 LYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFSKTQW
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.:..... ... ::.:: ::..: :..: .. ::. .. .. : :. .
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:: .::.::.::. .:. :. ::.
CCDS27 AYTHCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSSTSPSTGEH
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.. . .. ....:. ::: :.. ::::... . .... . . : :..: .
CCDS24 RTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRA
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CCDS24 LDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILA--IHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSS
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CCDS24 GHTSTTL
360
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CCDS96 ----VPWKTNMSLCFPRYPSEGHRAFHL-IFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQARRF
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pF1KE9 QKTQAV
CCDS96 ALEPGPSESLTASSPLKLNELN
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