Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9569
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9569, 387 aa
1>>>pF1KE9569 387 - 387 aa - 387 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5773+/-0.000821; mu= 16.5326+/- 0.049
mean_var=116.2930+/-29.799, 0's: 0 Z-trim(110.7): 348 B-trim: 1437 in 2/50
Lambda= 0.118932
statistics sampled from 11177 (11822) to 11177 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.363), width: 16
Scan time: 3.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 2633 462.7 2.5e-130
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 1263 227.6 1.4e-59
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 834 154.0 1.9e-37
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 639 120.6 2.4e-27
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 625 118.3 1.4e-26
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 608 115.3 1e-25
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 608 115.4 1.1e-25
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 605 114.8 1.5e-25
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 600 113.9 2.6e-25
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 599 113.7 2.8e-25
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 599 113.7 2.9e-25
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 599 113.7 2.9e-25
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 599 113.7 2.9e-25
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 599 113.8 3e-25
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 582 110.8 2.1e-24
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 581 110.6 2.3e-24
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 578 110.1 3.3e-24
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 577 110.0 4.1e-24
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 574 109.4 5.4e-24
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 565 107.9 1.6e-23
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 543 104.0 1.9e-22
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 543 104.0 2e-22
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 540 103.6 3.1e-22
CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 539 103.4 3.6e-22
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 524 100.8 1.9e-21
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 518 99.8 4.4e-21
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 498 96.3 3.9e-20
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 495 95.8 6.3e-20
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 493 95.5 7.6e-20
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 492 95.3 9.1e-20
CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 482 93.6 3.1e-19
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 476 92.6 6.2e-19
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 472 91.9 1e-18
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 472 92.0 1.1e-18
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 453 88.6 9.3e-18
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 453 88.6 9.4e-18
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 451 88.3 1.2e-17
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 450 88.1 1.3e-17
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 450 88.2 1.4e-17
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 450 88.2 1.4e-17
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 449 88.0 1.7e-17
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 448 87.8 1.7e-17
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 444 87.1 2.7e-17
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 444 87.1 2.8e-17
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 443 87.0 3.7e-17
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 439 86.2 4.8e-17
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 437 85.9 6.3e-17
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 437 85.9 6.5e-17
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 434 85.4 9.8e-17
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 423 83.5 3.4e-16
>>CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 (387 aa)
initn: 2633 init1: 2633 opt: 2633 Z-score: 2453.3 bits: 462.7 E(32554): 2.5e-130
Smith-Waterman score: 2633; 100.0% identity (100.0% similar) in 387 aa overlap (1-387:1-387)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNVSGCPGAGNASQAGGGGGWHPEAVIVPLLFALIFLVGTVGNTLVLAVLLRGGQAVSTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MNVSGCPGAGNASQAGGGGGWHPEAVIVPLLFALIFLVGTVGNTLVLAVLLRGGQAVSTT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 NLFILNLGVADLCFILCCVPFQATIYTLDGWVFGSLLCKAVHFLIFLTMHASSFTLAAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NLFILNLGVADLCFILCCVPFQATIYTLDGWVFGSLLCKAVHFLIFLTMHASSFTLAAVS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LDRYLAIRYPLHSRELRTPRNALAAIGLIWGLSLLFSGPYLSYYRQSQLANLTVCHPAWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LDRYLAIRYPLHSRELRTPRNALAAIGLIWGLSLLFSGPYLSYYRQSQLANLTVCHPAWS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 APRRRAMDICTFVFSYLLPVLVLGLTYARTLRYLWRAVDPVAAGSGARRAKRKVTRMILI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 APRRRAMDICTFVFSYLLPVLVLGLTYARTLRYLWRAVDPVAAGSGARRAKRKVTRMILI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 VAALFCLCWMPHHALILCVWFGQFPLTRATYALRILSHLVSYANSCVNPIVYALVSKHFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VAALFCLCWMPHHALILCVWFGQFPLTRATYALRILSHLVSYANSCVNPIVYALVSKHFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 KGFRTICAGLLGRAPGRASGRVCAAARGTHSGSVLERESSDLLHMSEAAGALRPCPGASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KGFRTICAGLLGRAPGRASGRVCAAARGTHSGSVLERESSDLLHMSEAAGALRPCPGASQ
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE9 PCILEPCPGPSWQGPKAGDSILTVDVA
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PCILEPCPGPSWQGPKAGDSILTVDVA
370 380
>>CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 (368 aa)
initn: 1290 init1: 801 opt: 1263 Z-score: 1183.2 bits: 227.6 E(32554): 1.4e-59
Smith-Waterman score: 1263; 59.2% identity (77.1% similar) in 341 aa overlap (25-356:17-353)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNVSGCPGAGNASQAGGGGGWHPEAVIVPLLFALIFLVGTVGNTLVLAVLLRGGQAV---
:: ::..::::::.::::: :::::::. : ..
CCDS13 MADAQNISLDSPGSVGAVAVPVVFALIFLLGTVGNGLVLAVLLQPGPSAWQE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 --STTNLFILNLGVADLCFILCCVPFQATIYTLDGWVFGSLLCKAVHFLIFLTMHASSFT
:::.::::::.:::::::::::::::::::::.:.::.:.:::::.::.:::.:::::
CCDS13 PGSTTDLFILNLAVADLCFILCCVPFQATIYTLDAWLFGALVCKAVHLLIYLTMYASSFT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LAAVSLDRYLAIRYPLHSRELRTPRNALAAIGLIWGLSLLFSGPYLSYYRQSQLANLTVC
:::::.:::::.:.::.:: ::::::: ::.::.: :. :::.:::::: . . : .:
CCDS13 LAAVSVDRYLAVRHPLRSRALRTPRNARAAVGLVWLLAALFSAPYLSYYGTVRYGALELC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 HPAWSAPRRRAMDICTFVFSYLLPVLVLGLTYARTLRYLWRAVDPV--AAGSGARRAKRK
::: ::::.:. ::. .::::: :..:.:.::::.:: :: :. ::. . ::: .
CCDS13 VPAWEDARRRALDVATFAAGYLLPVAVVSLAYGRTLRFLWAAVGPAGAAAAEARRRATGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 VTRMILIVAALFCLCWMPHHALILCVWFGQFPLTRATYALRILSHLVSYANSCVNPIVYA
. : .: ::::. ::: :::::::: :.:.: .. :::: :. :: ..:::::.::.:::
CCDS13 AGRAMLAVAALYALCWGPHHALILCFWYGRFAFSPATYACRLASHCLAYANSCLNPLVYA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 LVSKHFRKGFRTI--CAGLLGRAPGRASGRVCAAARGTHSGSVLERESSDLLHMSEAAGA
:.:.::: :: . :. . :: :: :. : . : :. :: :.:.
CCDS13 LASRHFRARFRRLWPCGRRRRHRARRALRRVRPASSGPPGCPGDARPSGRLL----AGGG
300 310 320 330 340
360 370 380
pF1KE9 LRPCPGASQPCILEPCPGPSWQGPKAGDSILTVDVA
: :
CCDS13 QGPEPREGPVHGGEAARGPE
350 360
>>CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 (349 aa)
initn: 715 init1: 379 opt: 834 Z-score: 785.7 bits: 154.0 E(32554): 1.9e-37
Smith-Waterman score: 834; 42.5% identity (75.1% similar) in 301 aa overlap (12-306:20-317)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNVSGCPGAGNASQAGGGGGWHPEAVIVPLLFALIFLVGTVGNTLVLAVLLR
: . : : : .. ..:.::: .:..::.::..:: :
CCDS12 MELAVGNLSEGNASWPEPPAPEPGPLFGIGVENFVTLVVFGLIFALGVLGNSLVITVLAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 G--GQAVSTTNLFILNLGVADLCFILCCVPFQATIYTLDGWVFGSLLCKAVHFLIFLTMH
. :. ::::::::::..::: ..: :.:::::.:.: ::.:...:: .:... ..:
CCDS12 SKPGKPRSTTNLFILNLSIADLAYLLFCIPFQATVYALPTWVLGAFICKFIHYFFTVSML
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KE9 ASSFTLAAVSLDRYLAIRYPLHSRELRTPRNALAAIGLIWGLSLLFSGPYLSYYR---QS
.: :::::.:.:::.:: . .: ::. :::: ..: ::.::. ...: ..:.. .
CCDS12 VSIFTLAAMSVDRYVAIVHSRRSSSLRVSRNALLGVGCIWALSIAMASP-VAYHQGLFHP
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 QLANLTVCHPAWSAPR-RRAMDICTFVFSYLLPVLVLGLTYARTLRYLWRAVDPVAAGSG
. .: : : : :: ..:. .:::::.::::.:.. . ::..: .: . . .. :
CCDS12 RASNQTFCWEQWPDPRHKKAYVVCTFVFGYLLPLLLICFCYAKVLNHLHKKLKNMSKKSE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 ARRAKRKVTRMILIVAALFCLCWMPHHALILCVWFGQFPLTRATYALRILSHLVSYANSC
: .:.:... .:.:...: . :.::: . : . :: :::: :.. .:: .: ..:.::
CCDS12 A--SKKKTAQTVLVVVVVFGISWLPHHIIHLWAEFGVFPLTPASFLFRITAHCLAYSNSS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 VNPIVYALVSKHFRKGFRTICAGLLGRAPGRASGRVCAAARGTHSGSVLERESSDLLHMS
::::.::..:..:::... .
CCDS12 VNPIIYAFLSENFRKAYKQVFKCHIRKDSHLSDTKESKSRIDTPPSTNCTHV
300 310 320 330 340
>>CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 (388 aa)
initn: 434 init1: 188 opt: 639 Z-score: 604.3 bits: 120.6 E(32554): 2.4e-27
Smith-Waterman score: 642; 35.9% identity (61.8% similar) in 382 aa overlap (2-369:24-376)
10 20 30
pF1KE9 MNVSGCPGAGNASQAGGGGGWHPEAVIVPLLFALIFLV
:.:. :. .. . :: : . : . ..::. ::
CCDS42 MSAPSTLPPGGEEGLGTAWPSAANASSAPAEAEEAVAGPGDARAAGMVAIQCIYALVCLV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 GTVGNTLVLAVLLRGGQAVSTTNLFILNLGVADLCFILCCVPFQATIYTLDGWVFGSLLC
: :::.::. :.:: .. ..::...:::.::: :.: ::: :. .: : :::.::
CCDS42 GLVGNALVIFVILRYAKMKTATNIYLLNLAVADELFMLS-VPFVASSAALRHWPFGSVLC
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 KAVHFLIFLTMHASSFTLAAVSLDRYLAIRYPLHSRELRTPRNA-LAAIGLIWGLSLLFS
.:: . :.: .: : :...:.:::.:. .::.. : : : : .: .: ::: .
CCDS42 RAVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSVDRYVAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLG-VWLASLLVT
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 GPYLSYY--RQSQLANLTVC-----HPAWSAPRRRAMDICTFVFSYLLPVLVLGLTYART
: . : .. .. ..: :::::: .. . ::....:::::..:: :
CCDS42 LPIAIFADTRPARGGQAVACNLQWPHPAWSA----VFVVYTFLLGFLLPVLAIGLCYLLI
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 LRYLWRAVDPVAAGSGARRAKRKVTRMILIVAALFCLCWMPHHALILCVWFGQFPLTRAT
. . ::: :. . ::...:.::..:.:...: ::::: ... : : .:
CCDS42 VGKM-RAVALRAGWQQRRRSEKKITRLVLMVVVVFVLCWMPFYVVQLLNLF----VTSLD
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KE9 YALRILSHLVSYANSCVNPIVYALVSKHFRKGF-RTICAGLLGRAPGRASGRVCAAARGT
.. .: ..::::::.:::.:...: .::. : :..: : : .:
CCDS42 ATVNHVSLILSYANSCANPILYGFLSDNFRRFFQRVLCL------------RCCLL-EG-
290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 HSGSVLERESSDLLH--MSEAAGALRPCPGASQPC---ILEPCPGPSWQGPKAGDSILTV
.:.. :.: : .. .:: :: :: :.: ::
CCDS42 -AGGA-EEEPLDYYATALKSKGGAGCMCP--PLPCQQEALQPEPGRKRIPLTRTTTF
340 350 360 370 380
pF1KE9 DVA
>>CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (446 aa)
initn: 569 init1: 206 opt: 625 Z-score: 590.6 bits: 118.3 E(32554): 1.4e-26
Smith-Waterman score: 632; 30.2% identity (60.6% similar) in 378 aa overlap (4-375:57-415)
10 20 30
pF1KE9 MNVSGCPGAGNASQAGGGGGWHPEAVIVPLLFA
: :: .:. :. :. . :..
CCDS43 SPGSWVNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSLCPPTGSPSMI--------TAITIMALYS
30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 LIFLVGTVGNTLVLAVLLRGGQAVSTTNLFILNLGVADLCFILCCVPFQATIYTLDGWVF
.. .:: :: ::. :..: . ..::..:.::..:: . .:::.. : . : :
CCDS43 IVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALAD-ALATSTLPFQSVNYLMGTWPF
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 GSLLCKAVHFLIFLTMHASSFTLAAVSLDRYLAIRYPLHSRELRTPRNALAAIGLIWGLS
:..::: : . . .: .: ::: ..:.:::.:. .:... ..:::::: : ::
CCDS43 GTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPRNAKIINVCNWILS
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200
pF1KE9 LLFSGPYL----SYYRQSQL-ANLTVCHPAWSAPRRRAMDICTFVFSYLLPVLVLGLTYA
.. : . . :::... .:: ::.: . . ::.:.:....:::.. . :.
CCDS43 SAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYW--ENLLKICVFIFAFIMPVLIITVCYG
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 RTLRYLWRAVDPVAAGSGARRAKRKVTRMILIVAALFCLCWMPHHALILCVWFGQFPLTR
. : ..: ..... : :..:::.:.:.:.: .:: : : .. . .: :
CCDS43 LMILRL-KSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPIHIYVIIKALVTIPETT
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 ATYALRILSHLVSYANSCVNPIVYALVSKHFRKGFRTICAGLLGRAPGRASGRVCAAARG
. . ..:.:::.::..::.....:.. :: .: . . : :. .:
CCDS43 FQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPTSSNIEQQNSTRIRQNTRD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]