Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9567
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9567, 488 aa
1>>>pF1KE9567 488 - 488 aa - 488 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5994+/-0.000788; mu= 16.9583+/- 0.048
mean_var=108.7158+/-35.124, 0's: 0 Z-trim(108.8): 190 B-trim: 1217 in 2/51
Lambda= 0.123006
statistics sampled from 10105 (10449) to 10105 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.321), width: 16
Scan time: 3.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3930.1 PTGER4 gene_id:5734|Hs108|chr5 ( 488) 3172 574.1 1.2e-163
CCDS12686.1 PTGIR gene_id:5739|Hs108|chr19 ( 386) 499 99.6 6.3e-21
CCDS12309.1 PTGER1 gene_id:5731|Hs108|chr19 ( 402) 456 92.0 1.3e-18
CCDS61454.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 ( 296) 405 82.8 5.5e-16
CCDS9707.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 ( 359) 405 82.9 6.3e-16
CCDS9708.1 PTGER2 gene_id:5732|Hs108|chr14 ( 358) 403 82.6 8e-16
CCDS44160.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 365) 355 74.0 3e-13
CCDS652.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 374) 355 74.1 3e-13
CCDS658.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 388) 355 74.1 3.1e-13
CCDS657.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 390) 355 74.1 3.1e-13
CCDS656.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 390) 355 74.1 3.1e-13
CCDS655.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 418) 355 74.1 3.3e-13
CCDS42467.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 ( 343) 313 66.6 5e-11
CCDS54198.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 ( 407) 313 66.6 5.6e-11
>>CCDS3930.1 PTGER4 gene_id:5734|Hs108|chr5 (488 aa)
initn: 3172 init1: 3172 opt: 3172 Z-score: 3051.5 bits: 574.1 E(32554): 1.2e-163
Smith-Waterman score: 3172; 100.0% identity (100.0% similar) in 488 aa overlap (1-488:1-488)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLCKSRKEQKETTFYTLVCG
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CCDS39 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLCKSRKEQKETTFYTLVCG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQWPGGQPLCEYSTFILLFFSLSGLSIICAMSVERYLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQWPGGQPLCEYSTFILLFFSLSGLSIICAMSVERYLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 INHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLGSSRLQYPDTWCFIDWTTNVTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 INHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLGSSRLQYPDTWCFIDWTTNVTA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 HAAYSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMRRTSLGTEQHHAAAAASVASRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 HAAYSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMRRTSLGTEQHHAAAAASVASRG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 HPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATSLVVLICSIPLVVRVFVNQLYQP
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CCDS39 HPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATSLVVLICSIPLVVRVFVNQLYQP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 SLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLSKAIEKIKCLFCRIGGSRRERSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 SLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLSKAIEKIKCLFCRIGGSRRERSG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 QHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEISSTSQTLLPDLSLPDLSENGLGGRNLLPGVPG
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CCDS39 QHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEISSTSQTLLPDLSLPDLSENGLGGRNLLPGVPG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 MGLAQEDTTSLRTLRISETSDSSQGQDSESVLLVDEAGGSGRAGPAPKGSSLQVTFPSET
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CCDS39 MGLAQEDTTSLRTLRISETSDSSQGQDSESVLLVDEAGGSGRAGPAPKGSSLQVTFPSET
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 LNLSEKCI
::::::::
CCDS39 LNLSEKCI
>>CCDS12686.1 PTGIR gene_id:5739|Hs108|chr19 (386 aa)
initn: 659 init1: 358 opt: 499 Z-score: 489.2 bits: 99.6 E(32554): 6.3e-21
Smith-Waterman score: 631; 36.7% identity (62.1% similar) in 335 aa overlap (20-349:17-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLCKSRKEQKETTFYTLVCG
:.: ..::. ::::: .:. .: ..:. . ..: .:: :
CCDS12 MADSCRNLTYVRGSVGPAT-STLMFVAGVVGNGLALGIL-SARRPARPSAFAVLVTG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE9 LAVTDLLGTLLVSPVTIATYMK-----GQWPGGQPLCEYSTFILLFFSLSGLSIICAMSV
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CCDS12 LAATDLLGTSFLSPAVFVAYARNSSLLGLARGGPALCDAFAFAMTFFGLASMLILFAMAV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 ERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLGSSRLQYPDTWCFIDWT
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CCDS12 ERCLALSHPYLYAQLDGPRCARLALPAIYAFCVLFCALPLLGLGQHQQYCPGSWCFLRMR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 TNVTAHAAYSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMRRTSLGTEQHHAAAAAS
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CCDS12 WAQPGGAAFSLAYAGLVALLVAAIFLCNGSVTLSLCRMYRQ---------QKRHQG---S
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 VASRGHPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATSLVVLICSIPLVVRVFVN
.. : :: .. :.. .::: ..:. .::.::..: :.
CCDS12 LGPR---------PRTGE------------DEVDHLILLALMTVVMAVCSLPLTIRCFT-
230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 QLYQPSLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLSKAIEKIKCLFCRIGGSR
: :. :.. :: :.:. . :::::::..::.::.:... . :: :
CCDS12 QAVAPDSSSEMG---DLLAFRFYAFNPILDPWVFILFRKAVFQRLKLWVCCL-CLGPAHG
270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 RERSGQHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEISSTSQTLLPDLSLPDLSENGLGGRNLL
CCDS12 DSQTPLSQLASGRRDPRAPSAPVGKEGSCVPLSAWGEGQVEPLPPTQQSSGSAVGTSSKA
320 330 340 350 360 370
>>CCDS12309.1 PTGER1 gene_id:5731|Hs108|chr19 (402 aa)
initn: 343 init1: 161 opt: 456 Z-score: 447.7 bits: 92.0 E(32554): 1.3e-18
Smith-Waterman score: 467; 30.9% identity (60.9% similar) in 353 aa overlap (2-339:19-361)
10 20 30 40
pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLC
..: : ..... :. ::. .: . .:.:.::.:...:
CCDS12 MSPCGPLNLSLAGEATTCAAPWVPNTSAVPPSG-ASPA-LPIFSMTLGAVSNLLALALLA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KE9 KS----RKEQKETTFYTLVCGLAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQWPGGQPLCEYSTFIL
.. :.... .:: .: .: .::: : .. . ... : :. :.: :.. .
CCDS12 QAAGRLRRRRSAATFLLFVASLLATDLAGHVIPGALVLRLYTAGRAPAGGA-CHFLGGCM
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LFFSLSGLSIICAMSVERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLG
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CCDS12 VFFGLCPLLLGCGMAVERCVGVTRPLLHAARVSVARARLALAAVAAVALAVALLPLARVG
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 SSRLQYPDTWCFIDW-TTNVTAHAAYSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMH-RQF
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CCDS12 RYELQYPGTWCFIGLGPPGGWRQALLAGLFASLGLVALLAALVCNTLSGLALLRARWRRR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 MRRT--SLGTEQH-----HAAAAASVASRGHPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQM
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CCDS12 SRRPPPASGPDSRRRWGAHGPRSASASSASSIASASTF--FGGSRSSGSARRARAHDVEM
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KE9 VILLIATSLVVLICSIPLVVRVF--VNQLYQPSLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWI
: :.. .: :: :..: : :. . ::.: : . :.:.:: : :::::.
CCDS12 VGQLVGIMVVSCICWSPMLVLVALAVGGWSSTSLQR-----PLFLAVRLASWNQILDPWV
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 YILLRKTVLSKAIEKIKCLFCRIGGSRRERSGQHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEI
:::::..:: .
CCDS12 YILLRQAVLRQLLRLLPPRAGAKGGPAGLGLTPSAWEASSLRSSRHSGLSHF
360 370 380 390 400
>>CCDS61454.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 (296 aa)
initn: 445 init1: 218 opt: 405 Z-score: 400.5 bits: 82.8 E(32554): 5.5e-16
Smith-Waterman score: 454; 32.0% identity (61.5% similar) in 309 aa overlap (1-292:1-285)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLCKS------RKEQKE--T
:..: . . : .. :: : . .:.: :..:::.:. .: .: :. . .
CCDS61 MKSPFYRCQNTTSVEKGNSAV-MGGVLFSTGLLGNLLALGLLARSGLGWCSRRPLRPLPS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE9 TFYTLVCGLAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQ-----WPG-GQPLCEYSTFILLFFSLSG
.:: :::::.:::::: :.:::..:.: ... :. . ::. .:.. ::.::.
CCDS61 VFYMLVCGLTVTDLLGKCLLSPVVLAAYAQNRSLRVLAPALDNSLCQAFAFFMSFFGLSS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 LSIICAMSVERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLGSSRLQY-
. ::..: .:...: .:: ... ::..:. .: : .. ::::: ::.:. .::
CCDS61 TLQLLAMALECWLSLGHPFFYRRHITLRLGALVAPVVSAFSLAFCALPFMGFGKF-VQYC
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 PDTWCFIDWTTNVTAHAA--YSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMRRTSL
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CCDS61 PGTWCFIQMVHEEGSLSVLGYSVLYSSLMALLVLATVLCNLGAMRNLYAMHRRLQRHPRS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 GTEQHHAAAAASVASRGHPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATSLVVLI
:.. : . :. :. : :.. ..:: ... .
CCDS61 CTRD-----CAEPRADGREASPQPLE-----------------ELDHLLLLALMTVLFTM
240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 CSIPLVVRVFVNQLYQPSLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLSKAIEK
::.:... :
CCDS61 CSLPVIAFVPGVPAKTPGSR
280 290
>>CCDS9707.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 (359 aa)
initn: 514 init1: 218 opt: 405 Z-score: 399.4 bits: 82.9 E(32554): 6.3e-16
Smith-Waterman score: 560; 32.0% identity (61.6% similar) in 391 aa overlap (1-373:1-359)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLCKS------RKEQKE--T
:..: . . : .. :: : . .:.: :..:::.:. .: .: :. . .
CCDS97 MKSPFYRCQNTTSVEKGNSAV-MGGVLFSTGLLGNLLALGLLARSGLGWCSRRPLRPLPS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE9 TFYTLVCGLAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQ-----WPG-GQPLCEYSTFILLFFSLSG
.:: :::::.:::::: :.:::..:.: ... :. . ::. .:.. ::.::.
CCDS97 VFYMLVCGLTVTDLLGKCLLSPVVLAAYAQNRSLRVLAPALDNSLCQAFAFFMSFFGLSS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 LSIICAMSVERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLGSSRLQY-
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CCDS97 TLQLLAMALECWLSLGHPFFYRRHITLRLGALVAPVVSAFSLAFCALPFMGFGKF-VQYC
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 PDTWCFIDWTTNVTAHAA--YSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMRRTSL
: :::::. . . . .. :: .:... ..:.:::::::. . : :::...:.
CCDS97 PGTWCFIQMVHEEGSLSVLGYSVLYSSLMALLVLATVLCNLGAMRNLYAMHRRLQRHPRS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 GTEQHHAAAAASVASRGHPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATSLVVLI
:.. : . :. :. : :.. ..:: ... .
CCDS97 CTRD-----CAEPRADGREASPQPLE-----------------ELDHLLLLALMTVLFTM
240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 CSIPLVVRVFVNQLYQPSLEREVSKNP-DLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLSKAIE
::.:.. :.. . . . . . ..:.. ::.:.:. :: :.::::.:..:. :. ..
CCDS97 CSLPVIYRAYYGAFKDVKEKNRTSEEAEDLRALRFLSVISIVDPWIFIIFRSPVFRIFFH
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 KIKCLFCRIGGSRRERSGQHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEISSTSQTLLPDLSLP
:: : : : :: .::.: :..
CCDS97 KI---FIR---PLRYRS--RCSNSTNMESSL
340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 DLSENGLGGRNLLPGVPGMGLAQEDTTSLRTLRISETSDSSQGQDSESVLLVDEAGGSGR
>>CCDS9708.1 PTGER2 gene_id:5732|Hs108|chr14 (358 aa)
initn: 666 init1: 237 opt: 403 Z-score: 397.5 bits: 82.6 E(32554): 8e-16
Smith-Waterman score: 615; 35.2% identity (62.9% similar) in 369 aa overlap (19-370:24-353)
10 20 30 40
pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVL---------CKSR
::. : .::: ::.:::.:...: :..
CCDS97 MGNASNDSQSEDCETRQWLPPGESPA-ISSVMFSAGVLGNLIALALLARRWRGDVGCSAG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 KEQKETTFYTLVCGLAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQW-----PGGQPLCEYSTFILLF
.... . :..:: :. :::::: :.:::..:.: ..: : .. : : .: . :
CCDS97 RRSSLSLFHVLVTELVFTDLLGTCLISPVVLASYARNQTLVALAPESRA-CTYFAFAMTF
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 FSLSGLSIICAMSVERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAV-YASNVLFCALPNMGLGS
:::. . .. ::..::::.:.: :::.. :. : .::... : :: ..:::.:: . :.
CCDS97 FSLATMLMLFAMALERYLSIGHPYFYQRRVS-RSGGLAVLPVIYAVSLLFCSLPLLDYGQ
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE9 SRLQY-PDTWCFIDWTTNVTAHAAYSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMR
.:: : ::::: ...:: .:: . .::.... :: : :.::::. :
CCDS97 -YVQYCPGTWCFIR-----HGRTAYLQLYATLLLLLIVSVLACNFSVILNLIRMHRR-SR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 RTSLGTEQHHAAAAASVAS-RGHPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATS
:. : :..: :: :.: :::. : . : . .::: .
CCDS97 RSRCGP---------SLGSGRGGPGA-----------RRRGERVSMAEETDHLILLAIMT
240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 LVVLICSIPLVVRVFVNQLYQPSLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLS
.. .::.:... ...: . : ..: . ::::.:. :.: :.:::.. .:: ::
CCDS97 ITFAVCSLPFTIFAYMN---ETSSRKE---KWDLQALRFLSINSIIDPWVFAILRPPVL-
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 KAIEKIKCLFCRIGGSRRERSGQHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEISSTSQTLLPD
. .... : :::. .. . :: .. .:
CCDS97 RLMRSVLC--CRISLRTQDATQTSCSTQSDASKQADL
330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 LSLPDLSENGLGGRNLLPGVPGMGLAQEDTTSLRTLRISETSDSSQGQDSESVLLVDEAG
>>CCDS44160.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (365 aa)
initn: 363 init1: 199 opt: 355 Z-score: 351.4 bits: 74.0 E(32554): 3e-13
Smith-Waterman score: 434; 31.9% identity (58.2% similar) in 342 aa overlap (21-339:52-356)
10 20 30 40
pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLCKS--RKE
:..: .:.. : ::: .:.... .: :.:
CCDS44 TGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLLTGFVGNALAMLLVSRSYRRRE
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 QKETTFYTLVCG-LAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQ-W----PGGQPLCEYSTFILLFF
.:. . : : ::.:::.: ::..::.:..:.. : : :.:. :: . . . :
CCDS44 SKRKKSFLLCIGWLALTDLVGQLLTTPVVIVVYLSKQRWEHIDPSGR-LCTFFGLTMTVF
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