Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9565
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9565, 393 aa
1>>>pF1KE9565 393 - 393 aa - 393 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1612+/-0.00132; mu= 17.1858+/- 0.079
mean_var=125.4551+/-44.388, 0's: 0 Z-trim(101.3): 284 B-trim: 942 in 2/42
Lambda= 0.114506
statistics sampled from 5986 (6454) to 5986 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.534), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 1.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 ( 393) 2605 442.8 2.5e-124
CCDS13089.1 PROKR2 gene_id:128674|Hs108|chr20 ( 384) 2258 385.5 4.5e-107
CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 528 99.7 4.8e-21
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 499 94.9 1.3e-19
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 469 90.0 4.3e-18
CCDS46345.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 311) 467 89.5 4.6e-18
CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 455 87.6 2.1e-17
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 441 85.4 1.1e-16
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 437 84.8 1.8e-16
CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 ( 384) 419 81.7 1.3e-15
CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4 ( 431) 419 81.7 1.4e-15
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 414 80.9 2.3e-15
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 ( 425) 403 79.1 8.4e-15
CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6 ( 390) 401 78.7 1e-14
CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 ( 430) 401 78.8 1.1e-14
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 400 78.5 1.1e-14
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 400 78.6 1.2e-14
CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 ( 375) 394 77.5 2.2e-14
CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10 ( 375) 391 77.0 3.1e-14
CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 390 76.9 3.6e-14
CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 420) 379 75.1 1.3e-13
CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 423) 379 75.1 1.3e-13
CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 522) 379 75.2 1.5e-13
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 374 74.2 2.1e-13
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 373 74.1 2.5e-13
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 360 71.9 1.1e-12
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 351 70.5 3.2e-12
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 348 70.0 4.3e-12
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 346 69.6 5.3e-12
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 346 69.6 5.5e-12
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 345 69.4 6e-12
CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 377) 343 69.1 7.6e-12
CCDS3804.1 NPY5R gene_id:4889|Hs108|chr4 ( 445) 342 69.0 9.4e-12
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 340 68.5 9.9e-12
CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 371) 340 68.6 1.1e-11
CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 390) 340 68.6 1.1e-11
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 335 67.9 2e-11
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 334 67.6 2.2e-11
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 334 67.6 2.2e-11
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 334 67.7 2.2e-11
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 334 67.7 2.2e-11
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 334 67.7 2.2e-11
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 334 67.7 2.2e-11
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 334 67.7 2.3e-11
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 334 67.7 2.3e-11
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 334 67.7 2.3e-11
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 334 67.8 2.5e-11
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 366) 324 66.0 6.6e-11
>>CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 (393 aa)
initn: 2605 init1: 2605 opt: 2605 Z-score: 2345.5 bits: 442.8 E(32554): 2.5e-124
Smith-Waterman score: 2605; 100.0% identity (100.0% similar) in 393 aa overlap (1-393:1-393)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 METTMGFMDDNATNTSTSFLSVLNPHGAHATSFPFNFSYSDYDMPLDEDEDVTNSRTFFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 METTMGFMDDNATNTSTSFLSVLNPHGAHATSFPFNFSYSDYDMPLDEDEDVTNSRTFFA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 AKIVIGMALVGIMLVCGIGNFIFIAALVRYKKLRNLTNLLIANLAISDFLVAIVCCPFEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 AKIVIGMALVGIMLVCGIGNFIFIAALVRYKKLRNLTNLLIANLAISDFLVAIVCCPFEM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 DYYVVRQLSWEHGHVLCTSVNYLRTVSLYVSTNALLAIAIDRYLAIVHPLRPRMKCQTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 DYYVVRQLSWEHGHVLCTSVNYLRTVSLYVSTNALLAIAIDRYLAIVHPLRPRMKCQTAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 GLIALVWTVSILIAIPSAYFTTETVLVIVKSQEKIFCGQIWPVDQQLYYKSYFLFIFGIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GLIALVWTVSILIAIPSAYFTTETVLVIVKSQEKIFCGQIWPVDQQLYYKSYFLFIFGIE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 FVGPVVTMTLCYARISRELWFKAVPGFQTEQIRKRLRCRRKTVLVLMCILTAYVLCWAPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 FVGPVVTMTLCYARISRELWFKAVPGFQTEQIRKRLRCRRKTVLVLMCILTAYVLCWAPF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 YGFTIVRDFFPTVFVKEKHYLTAFYIVECIAMSNSMINTLCFVTVKNDTVKYFKKIMLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 YGFTIVRDFFPTVFVKEKHYLTAFYIVECIAMSNSMINTLCFVTVKNDTVKYFKKIMLLH
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KE9 WKASYNGGKSSADLDLKTIGMPATEEVDCIRLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 WKASYNGGKSSADLDLKTIGMPATEEVDCIRLK
370 380 390
>>CCDS13089.1 PROKR2 gene_id:128674|Hs108|chr20 (384 aa)
initn: 2258 init1: 2258 opt: 2258 Z-score: 2035.8 bits: 385.5 E(32554): 4.5e-107
Smith-Waterman score: 2258; 87.4% identity (95.5% similar) in 382 aa overlap (12-393:3-384)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 METTMGFMDDNATNTSTSFLSVLNPHGAHATSFPFNFSYSDYDMPLDEDEDVTNSRTFFA
: : .::: .:: ::.:. :::::.:::.:.:::::.:..:::::
CCDS13 MAAQNGNTSFTPNFNPPQDHASSLSFNFSYGDYDLPMDEDEDMTKTRTFFA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 AKIVIGMALVGIMLVCGIGNFIFIAALVRYKKLRNLTNLLIANLAISDFLVAIVCCPFEM
::::::.::.:::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS13 AKIVIGIALAGIMLVCGIGNFVFIAALTRYKKLRNLTNLLIANLAISDFLVAIICCPFEM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 DYYVVRQLSWEHGHVLCTSVNYLRTVSLYVSTNALLAIAIDRYLAIVHPLRPRMKCQTAT
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::. :::.
CCDS13 DYYVVRQLSWEHGHVLCASVNYLRTVSLYVSTNALLAIAIDRYLAIVHPLKPRMNYQTAS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 GLIALVWTVSILIAIPSAYFTTETVLVIVKSQEKIFCGQIWPVDQQLYYKSYFLFIFGIE
:::::: ::::::::::::.::::: :::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS13 FLIALVWMVSILIAIPSAYFATETVLFIVKSQEKIFCGQIWPVDQQLYYKSYFLFIFGVE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 FVGPVVTMTLCYARISRELWFKAVPGFQTEQIRKRLRCRRKTVLVLMCILTAYVLCWAPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FVGPVVTMTLCYARISRELWFKAVPGFQTEQIRKRLRCRRKTVLVLMCILTAYVLCWAPF
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 YGFTIVRDFFPTVFVKEKHYLTAFYIVECIAMSNSMINTLCFVTVKNDTVKYFKKIMLLH
:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::.:.:::::.::::
CCDS13 YGFTIVRDFFPTVFVKEKHYLTAFYVVECIAMSNSMINTVCFVTVKNNTMKYFKKMMLLH
300 310 320 330 340 350
370 380 390
pF1KE9 WKASYNGGKSSADLDLKTIGMPATEEVDCIRLK
:. : :.::::::::.: :.:.::::::::::
CCDS13 WRPSQRGSKSSADLDLRTNGVPTTEEVDCIRLK
360 370 380
>>CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 (381 aa)
initn: 350 init1: 212 opt: 528 Z-score: 491.3 bits: 99.7 E(32554): 4.8e-21
Smith-Waterman score: 528; 29.5% identity (65.3% similar) in 308 aa overlap (47-353:35-336)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 TSFLSVLNPHGAHATSFPFNFSYSDYDMPLDEDEDVTNSRTFFAAKIVIGMALVGIMLVC
: . .. .: .. ...:. .: .:.:.
CCDS37 GAEADENQTVEEMKVEQYGPQTTPRGELVPDPEPELIDSTKLIEVQVVLILAYCSIILLG
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 GIGNFIFIAALVRYKKLRNLTNLLIANLAISDFLVAIVCCPFEMDYYVVRQLSWEHGHVL
::: . : .....:..:..::..:::::..:.:: .: :: . : .. . :. : ::
CCDS37 VIGNSLVIHVVIKFKSMRTVTNFFIANLAVADLLVNTLCLPFTLTYTLMGE--WKMGPVL
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 CTSVNYLRTVSLYVSTNALLAIAIDRYLAIVHPLRPRMKCQTATGLIALVWTVSILIAIP
: : : . ... ::: .: .::.::. ::. :. ... . . .:.:.: .: :.: :
CCDS37 CHLVPYAQGLAVQVSTITLTVIALDRHRCIVYHLESKISKRISFLIIGLAWGISALLASP
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 SAYFTTETVLVIVKSQEKIFCGQIWPVDQQLYYKS-YFLFIFGIEFVGPVVTMTLCYARI
: : ... :. . : . : . :: ... : . : : . : .: :. ... :.::
CCDS37 LAIFREYSLIEIIPDFEIVACTEKWPGEEKSIYGTVYSLSSLLILYVLPLGIISFSYTRI
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE9 SRELWFKAVPGFQTEQIRKRLRCRRKTVLVLMCILTAYVLCWAPFYGFTIVRDFFPTVFV
.: .. :: ... ..: :.::. .:.:....... : :...: .. :. :.
CCDS37 WSKLKNHVSPGAANDHYHQR---RQKTTKMLVCVVVVFAVSWLPLHAFQLAVDIDSQVL-
250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KE9 KEKHYLTAFYIVECIAMSNSMINTLCFVTVKNDTVKYFKKIMLLHWKASYNGGKSSADLD
:.: : . . ::: ... : : . .... : :
CCDS37 DLKEYKLIFTVFHIIAMCSTFANPLLYGWMNSNYRKAFLSAFRCEQRLDAIHSEVSVTFK
300 310 320 330 340 350
380 390
pF1KE9 LKTIGMPATEEVDCIRLK
CCDS37 AKKNLEVRKNSGPNDSFTEATNV
360 370 380
>>CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 (370 aa)
initn: 416 init1: 179 opt: 499 Z-score: 465.5 bits: 94.9 E(32554): 1.3e-19
Smith-Waterman score: 499; 28.9% identity (63.4% similar) in 350 aa overlap (21-361:21-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 METTMGFMDDNATNTSTSFLSVLNPHGAHATSFPFNFSYSDYDMPLDEDEDVTNSRTFFA
.: .: . : . : : . : : :: ...
CCDS76 MASSTTRGPRVSDLFSGLPPAVTTPANQSAEASAGNGSVAGADAPA-----VTPFQSLQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE9 AKIVIGMA--LVGIMLVCG-IGNFIFIAALVRYKKLRNLTNLLIANLAISDFLVAIVCCP
.. . :. : ....: : .:: ... ...: ..:.:.::.::.:::.:: :. .: :
CCDS76 VHQLKGLIVLLYSVVVVVGLVGNCLLVLVIARVRRLHNVTNFLIGNLALSDVLMCTACVP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 FEMDYYVVRQLSWEHGHVLCTSVNYLRTVSLYVSTNALLAIAIDRYLAIVHPLRPRMKCQ
. . : . . .: : :: : .:. :..:::. .: .::.:::...::::: :.. .
CCDS76 LTLAY-AFEPRGWVFGGGLCHLVFFLQPVTVYVSVFTLTTIAVDRYVVLVHPLRRRISLR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 TATGLIALVWTVSILIAIPSAYFTTETVLVIVKSQEKIFCGQIWPVDQQLYYKSYFLFIF
.. . .:..: ..:.:.: : .. : : .. .: ..: .:. . : ..
CCDS76 LSAYAVLAIWALSAVLALPAAVHTYHVEL---KPHDVRLCEEFWG-SQERQRQLYAWGLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 GIEFVGPVVTMTLCYARISRELWFKAVPGF--QTEQIRKRLRCRRKTVLVLMCILTAYVL
. .. :.... : :.:.: .: ..::: :.. : : ::.: .:. :......
CCDS76 LVTYLLPLLVILLSYVRVSVKLRNRVVPGCVTQSQADWDRAR-RRRTFCLLVVIVVVFAV
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 CWAPFYGFTIVRDFFPTVFVKEKHYLTAFYIVE--C--IAMSNSMINTLCFVTVKNDTVK
:: :.. :...::. : .. : :: .:. : .:::.. : . .. .... .
CCDS76 CWLPLHVFNLLRDLDPHAI---DPY--AFGLVQLLCHWLAMSSACYNPFIYAWLHDSFRE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390
pF1KE9 YFKKIMLLHWKASYNGGKSSADLDLKTIGMPATEEVDCIRLK
..: .:. :
CCDS76 ELRK-LLVAWPRKIAPHGQNMTVSVVI
350 360 370
>>CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 (407 aa)
initn: 373 init1: 183 opt: 469 Z-score: 438.3 bits: 90.0 E(32554): 4.3e-18
Smith-Waterman score: 469; 23.8% identity (61.8% similar) in 319 aa overlap (41-354:8-317)
20 30 40 50 60
pF1KE9 NATNTSTSFLSVLNPHGAHATSFPFNFSYSDYDMPLDEDEDVTNSRTFF--AAKIVIGMA
: :. . . .... : : .::. :
CCDS19 MDNVLPVDSDLSPNISTNTSEPNQFVQPAWQIVLWAA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LVGIMLVCGI-GNFIFIAALVRYKKLRNLTNLLIANLAISDFLVAIVCCPFEMDYYVVRQ
...: .. :: . . .. .:..:..:: ...:::... .: .. : : .
CCDS19 AYTVIVVTSVVGNVVVMWIILAHKRMRTVTNYFLVNLAFAEASMAAFNTVVNFTYAVHNE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LSWEHGHVLCTSVNYLRTVSLYVSTNALLAIAIDRYLAIVHPLRPRMKCQTATGLIALVW
: .: : :.. .....: .. :.:.:::.::.:::.::.. .. .: ..:
CCDS19 --WYYGLFYCKFHNFFPIAAVFASIYSMTAVAFDRYMAIIHPLQPRLSATATKVVICVIW
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 TVSILIAIPSAYFTTETVLVIVKSQEKIFCGQIWPVD-QQLYYKSYFLFIFGIEFVGPVV
....:.:.:..:..: .. .. : :: ...: : : . . . . :..
CCDS19 VLALLLAFPQGYYSTTETM-----PSRVVCMIEWPEHPNKIYEKVYHICVTVLIYFLPLL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 TMTLCYARISRELWFKAVPGFQTEQIRKRLRCRRKTVLVLMCILTAYVLCWAPFYGFTIV
.. :. .. :: . .:: .... .... .::.: ... .. ....:: ::. : ..
CCDS19 VIGYAYTVVGITLWASEIPGDSSDRYHEQVSAKRKVVKMMIVVVCTFAICWLPFHIFFLL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 RDFFPTVFVKEKHYLTAFYIVECIAMSNSMINTLCFVTVKNDTVKY-FKKIMLLHWKASY
. : ...: : .. . .:::..: : . . . :: . ::
CCDS19 PYINPDLYLK-KFIQQVYLAIMWLAMSSTMYNPIIYCCL-NDRFRLGFKHAFRCCPFISA
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370 380 390
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CCDS19 GDYEGLEMKSTRYLQTQGSVYKVSRLETTISTVVGAHEEEPEDGPKATPSSLDLTSNCSS
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20 30 40 50 60
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: :. . . .... : : .::. :
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...: .. :: . . .. .:..:..:: ...:::... .: .. : : .
CCDS46 AYTVIVVTSVVGNVVVMWIILAHKRMRTVTNYFLVNLAFAEASMAAFNTVVNFTYAVHNE
40 50 60 70 80 90
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pF1KE9 LSWEHGHVLCTSVNYLRTVSLYVSTNALLAIAIDRYLAIVHPLRPRMKCQTATGLIALVW
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CCDS46 --WYYGLFYCKFHNFFPIAAVFASIYSMTAVAFDRYMAIIHPLQPRLSATATKVVICVIW
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190 200 210 220 230 240
pF1KE9 TVSILIAIPSAYFTTETVLVIVKSQEKIFCGQIWPVD-QQLYYKSYFLFIFGIEFVGPVV
....:.:.:..:..: .. .. : :: ...: : : . . . . :..
CCDS46 VLALLLAFPQGYYSTTETM-----PSRVVCMIEWPEHPNKIYEKVYHICVTVLIYFLPLL
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pF1KE9 TMTLCYARISRELWFKAVPGFQTEQIRKRLRCRRKTVLVLMCILTAYVLCWAPFYGFTIV
.. :. .. :: . .:: .... .... .::.: ... .. ....:: ::. : ..
CCDS46 VIGYAYTVVGITLWASEIPGDSSDRYHEQVSAKRKVVKMMIVVVCTFAICWLPFHIFFLL
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. : ...: : .. . .:::..: : . . . ::
CCDS46 PYINPDLYLK-KFIQQVYLAIMWLAMSSTMYNPIIYCCL-NDR
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: ....:: :: : : .. ....:..:
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CCDS72 NYFIVNLALADLCMAAFNAAFNFVY--ASHNIWYFGRAFCYFQNLFPITAMFVSIYSMTA
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CCDS72 IAADRYMAIVHPFQPRLSAPSTKAVIAGIWLVALALASPQCFYSTVTM-----DQGATKC
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:: :. : : .... . :...: . :. :. :: .:::: :.. :
CCDS72 VVAWPEDSGGKTLLLYHLVVIALIYFLPLAVMFVAYSVIGLTLWRRAVPGHQAHGANLRH
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CCDS72 LQAMKKFVKTMVLVVLTFAICWLPYHLYFILGSFQEDIYCHKFIQQVYLALFWL----AM
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:..: : . . ... . :.
CCDS72 SSTMYNPIIYCCLNHRFRSGFRLAFRCCPWVTPTKEDKLELTPTTSLSTRVNRCHTKETL
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:...: :. :...::.. . . . ..
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CCDS82 SQNPTVKALLI-VAYSFIIVFSLFGNVLVCHVIFKNQRMHSATSLFIVNLAVADIMITLL
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pF1KE9 CCPFEMDYYVVRQLSWEHGHVLCTSVNYLRTVSLYVSTNALLAIAIDRYLAIVHPLRPRM
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CCDS82 NTPFTLVRFV--NSTWIFGKGMCHVSRFAQYCSLHVSALTLTAIAVDRHQVIMHPLKPRI
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. .. ::..::.. ....: : :: . ::.: .: .: .:..:
CCDS82 SITKGVIYIAVIWTMATFFSLPHAICQKLFTFKYSEDIVRS----LCLPDFPEPADLFWK
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: : . .. :.. ... :::....::. . : ::: : ..::. .:: .
CCDS82 YLDLATFILLYILPLLIISVAYARVAKKLWLCNMIGDVTTEQYFALRRKKKKTIKMLMLV
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.. ..::: :. .... . . .. .. : .. . .:::.. : . . . :..
CCDS82 VVLFALCWFPLNCYVLL---LSSKVIRTNNAL--YFAFHWFAMSSTCYNPFIYCWL-NEN
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. : .:
CCDS82 FRIELKALLSMCQRPPKPQEDRPPSPVPSFRVAWTEKNDGQRAPLANNLLPTSQLQSGKT
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. ..::. . . .:.. :.... .. ::.: : .. .:..:..:: ...::
CCDS36 SQPWANLTNQFVQPSWRIALWSLAYGVVVAVAVLGNLIVIWIILAHKRMRTVTNYFLVNL
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:.:: .... ... . . : : : :.. .....: .. :::.:::.
CCDS36 AFSD--ASMAAFNTLVNFIYALHSEWYFGANYCRFQNFFPITAVFASIYSMTAIAVDRYM
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::. ::.::.. .. .:. .: ...:.:.:. .. :. . .: ::
CCDS36 AIIDPLKPRLSATATKIVIGSIWILAFLLAFPQCLYSKTKVM-----PGRTLCFVQWPEG
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. .. .: .... . . :.. : . :. .. :: .:: .. ...:. .::.:
CCDS36 PKQHF-TYHIIVIILVYCFPLLIMGITYTIVGITLWGGEIPGDTCDKYHEQLKAKRKVVK
250 260 270 280 290
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... .. ....:: :.. . :. .. ... .:. :.. .:::..: : . .
CCDS36 MMIIVVMTFAICWLPYHIYFILTAIYQQ--LNRWKYIQQVYLASFWLAMSSTMYNPIIYC
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CCDS36 CLNKRFRAGFKRA--FRW-CPFIKVSSYDELELKTTRFHPNRQSSMYTVTRMESMTVVFD
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CCDS36 PNDADTTRSSRKKRATPRDPSFNGCSRRNSKSASATSSFISSPYTSVDEYS
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CCDS34 MNSTLFSQVEN-HSVHS-----NFSEKNAQLLAFENDDC-----HLP
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CCDS34 LAMIFTLALAYGAVIILGVSGNLALIIIILKQKEMRNVTNILIVNLSFSDLLVAIMCLPF
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CCDS34 AVCWLPLTIFNTVFDWNHQIIATCNHNLL-FLLCHLTAMISTCVNPI-FYGFLN---KNF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]