Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9559
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9559, 351 aa
1>>>pF1KE9559 351 - 351 aa - 351 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6848+/-0.00105; mu= 14.1324+/- 0.061
mean_var=127.1502+/-42.847, 0's: 0 Z-trim(104.9): 176 B-trim: 1007 in 2/48
Lambda= 0.113741
statistics sampled from 7869 (8155) to 7869 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 2.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 ( 351) 2307 390.5 1.1e-108
CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 ( 364) 1225 213.0 3.2e-55
CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 ( 353) 1119 195.6 5.4e-50
CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 ( 382) 727 131.3 1.3e-30
CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 ( 378) 666 121.3 1.3e-27
CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 ( 398) 639 116.9 3e-26
CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 ( 384) 622 114.1 2e-25
CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 ( 353) 532 99.3 5.3e-21
CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 ( 330) 478 90.4 2.4e-18
CCDS5079.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 362) 457 87.0 2.7e-17
CCDS69172.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 377) 457 87.0 2.8e-17
CCDS9319.1 GPR12 gene_id:2835|Hs108|chr13 ( 334) 443 84.6 1.3e-16
CCDS11868.1 MC5R gene_id:4161|Hs108|chr18 ( 325) 394 76.6 3.3e-14
CCDS13449.2 MC3R gene_id:4159|Hs108|chr20 ( 323) 369 72.5 5.7e-13
CCDS11976.1 MC4R gene_id:4160|Hs108|chr18 ( 332) 369 72.5 5.8e-13
CCDS245.1 CNR2 gene_id:1269|Hs108|chr1 ( 360) 357 70.5 2.4e-12
>>CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 (351 aa)
initn: 2307 init1: 2307 opt: 2307 Z-score: 2064.6 bits: 390.5 E(32554): 1.1e-108
Smith-Waterman score: 2307; 100.0% identity (100.0% similar) in 351 aa overlap (1-351:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLVIAAIASN
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CCDS12 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLVIAAIASN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDTSLTASVA
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CCDS12 RRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDTSLTASVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 TLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLCALDRCSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLCALDRCSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAEHVSCHPRYRETTLSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAEHVSCHPRYRETTLSLV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 KTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLLAEANSLVNAAVYSCRDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLLAEANSLVNAAVYSCRDA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE9 EMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMDSTL
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CCDS12 EMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMDSTL
310 320 330 340 350
>>CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 (364 aa)
initn: 1043 init1: 1043 opt: 1225 Z-score: 1104.9 bits: 213.0 E(32554): 3.2e-55
Smith-Waterman score: 1225; 57.3% identity (83.7% similar) in 307 aa overlap (6-312:23-328)
10 20 30 40
pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVALGLTVS
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CCDS67 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGLGITVC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 VLVLLTNLLVIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEG
....:.::::..:: ::::: :::::..::::::.:::.::..:::.::: : ::..
CCDS67 IFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTVST
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 WFLRQGLLDTSLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGL
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CCDS67 WLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVMGA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 LPAHSWHCLCALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMA
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CCDS67 IPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMRMS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 EHVSCHPRYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLL
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CCDS67 RHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFLLL
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 AEANSLVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENG
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CCDS67 AEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVHSN
300 310 320 330 340 350
>>CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 (353 aa)
initn: 1063 init1: 1030 opt: 1119 Z-score: 1011.0 bits: 195.6 E(32554): 5.4e-50
Smith-Waterman score: 1119; 48.0% identity (78.7% similar) in 333 aa overlap (4-335:1-333)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWR-PKDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLVIAAIAS
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CCDS70 MNECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLVIAAVIK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 NRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDTSLTASV
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CCDS70 NRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTASL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 ATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLCALDRCS
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CCDS70 TNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISACS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 RMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAEHVSCHPRYRETTLSL
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CCDS70 SLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLSPHTSGSISRRRTPMKL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 VKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLLAEANSLVNAAVYSCRD
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CCDS70 MKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFLLLALLNSVVNPIIYSYKD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 AEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMDSTL
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CCDS70 EDMYGTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
300 310 320 330 340 350
>>CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 (382 aa)
initn: 589 init1: 468 opt: 727 Z-score: 663.0 bits: 131.3 E(32554): 1.3e-30
Smith-Waterman score: 727; 37.8% identity (69.7% similar) in 304 aa overlap (17-314:29-331)
10 20 30 40
pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGK-ELSSHWRPKDVVVVALGLTVSVLVL
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CCDS77 MGPTSVPLVKAHRSSVSDYVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENSIKLTSVVFILICCFII
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 LTNLLVIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLR
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CCDS77 LENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWFLR
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 QGLLDTSLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAH
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CCDS77 EGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISACWVISLILGGLPIM
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 SWHCLCALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMA--EH
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CCDS77 GWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKN
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 VSCHPRYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCE--SCNVLAVEKYFLLL
.: : : .:.:.:::.:.:..:..::.: ..:::: .::. .:..: .:::.:
CCDS77 ISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLD-VGCKVKTCDILFRAEYFLVL
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 AEANSLVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLL-CCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPEN
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CCDS77 AVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCKCPSGDSAGKFKRPIIAGMEFSRSKSDNSS
300 310 320 330 340 350
350
pF1KE9 GHPLMDSTL
CCDS77 HPQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS
360 370 380
>>CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 (378 aa)
initn: 611 init1: 440 opt: 666 Z-score: 609.0 bits: 121.3 E(32554): 1.3e-27
Smith-Waterman score: 666; 36.1% identity (68.7% similar) in 313 aa overlap (10-315:15-317)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKD---VVVVALGLTVSVLVLLTNLL
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CCDS66 MATALPPRLQPVRGNETLREHYQYVGK-LAGRLKEASEGSTLTTVLFLVICSFIVLENLM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLD
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CCDS66 VLIAIWKNNKFHNRMYFFIGNLALCDLLAGIAYKVNILMSGKKTFSLSPTVWFLREGSMF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 TSLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCL
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CCDS66 VALGASTCSLLAIAIERHLTMIKMRPYDANKRHRVFLLIGMCWLIAFTLGALPILGWNCL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 CALDRCSRMAPLLSRSYLA--VWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAEHVSCHP
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CCDS66 HNLPDCSTILPLYSKKYIAFCISIFTAILV--TIVILYARIYFLVKSSSRKVANHNNS--
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE9 RYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGC--ESCNVLAVEKYFLLLAEANS
: ...:..::::....:..::.: ...:.: ..: ..: .: ..:..:: ::
CCDS66 ---ERSMALLRTVVIVVSVFIACWSPLFILFLID-VACRVQACPILFKAQWFIVLAVLNS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 LVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMD
.: ..:. . ::::.: ::.: ::
CCDS66 AMNPVIYTLASKEMRRAFFRLVC-NCLVRGRGARASPIQPALDPSRSKSSSSNNSSHSPK
300 310 320 330 340 350
>>CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 (398 aa)
initn: 643 init1: 419 opt: 639 Z-score: 584.8 bits: 116.9 E(32554): 3e-26
Smith-Waterman score: 657; 35.2% identity (65.4% similar) in 358 aa overlap (10-351:12-360)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRP-----KDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLV
.:.: . :: .:: .....: :.:: :.: ....: :: :
CCDS12 MESGLLRPAPVSEVIVLHYNYTGKLRGARYQPGAGLRADAVVC---LAVCAFIVLENLAV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 IAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDT
. ... . ::: :.. :::.:. .::.::.:: .. .:: : .:: :: :.: . .
CCDS12 LLVLGRHPRFHAPMFLLLGSLTLSDLLAGAAYAANILLSGPLTLKLSPALWFAREGGVFV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLC
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CCDS12 ALTASVLSLLAIALERSLTMARRGPAPVSSRGRTLAMAAAAWGVSLLLGLLPALGWNCLG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE9 ALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRM------AEHVS
:: :: . :: ...:. .:. . .. . :.:.::. :: ..:. : .:
CCDS12 RLDACSTVLPLYAKAYVLFCVLAFVGILAAICALYARIYCQVRANARRLPARPGTAGTTS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 CHPRYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGC--ESCNVLAVEKYFLLLAE
. : . .:.:..:. ..: :::.:: : ..:::: ..: ..: :: :: ::
CCDS12 TRARRKPRSLALLRTLSVVLLAFVACWGPLFLLLLLD-VACPARTCPVLLQADPFLGLAM
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 ANSLVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLLCC---ACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPEN
::::.: .:. . ..:... ::.:: .: :. . : . .:.:..... : ::
CCDS12 ANSLLNPIIYTLTNRDLRHALLRLVCCGRHSCGRDPSG-SQQSASAAEASGGLRRCLP--
300 310 320 330 340 350
350
pF1KE9 GHPLMDSTL
: .:...
CCDS12 --PGLDGSFSGSERSSPQRDGLDTSGSTGSPGAPTAARTLVSEPAAD
360 370 380 390
>>CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 (384 aa)
initn: 588 init1: 233 opt: 622 Z-score: 569.9 bits: 114.1 E(32554): 2e-25
Smith-Waterman score: 622; 38.4% identity (64.9% similar) in 336 aa overlap (9-335:21-350)
10 20 30 40
pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVAL-GLTV--SVL
... : . ::.::. :... :.: . :: ::.: : :
CCDS12 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGR-LAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 VLLTNLLVIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWF
:.: ::::.:::.:. : .. .:: : :.. .::..:.::: .. .: :: ::. ::
CCDS12 VVLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWF
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 LRQGLLDTSLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGV-WVAALGLGLL
::.::: :.:.::. .:: : :: ... .: . :. ..:. :. : ::.:
CCDS12 LREGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGML
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 PAHSWHCLCALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAE
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CCDS12 PLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYI----LFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 HVSCHPRYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCE--SCNVLAVEKYFLL
.. .: :. . :.:::..:: ::.::: : .:: : .: . . . : ..:
CCDS12 KAP-RPAARRKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE9 LAEANSLVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTR---ESVHYTSSAQGGASTRIML
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340 350
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CCDS12 PTFLEGNTVV
350
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CCDS30 YAFRNQDVQKVLWAV-CCCCSSSKIPFRSRSPSDV
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CCDS50 LGAGGGANGSLELSSQLSAGPPGLLLPAVNPWDVLLCVSGTVIAG----ENALVVALIAS
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60 70 80 90 100 110
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 13:23:20 2016 done: Sun Nov 6 13:23:21 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]