FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9558, 477 aa
1>>>pF1KE9558 477 - 477 aa - 477 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1451+/-0.000725; mu= 19.3972+/- 0.044
mean_var=79.5138+/-16.432, 0's: 0 Z-trim(110.4): 68 B-trim: 688 in 1/50
Lambda= 0.143831
statistics sampled from 11536 (11609) to 11536 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16
Scan time: 2.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs108|chr17 ( 477) 3324 699.3 2.4e-201
CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs108|chr6 ( 463) 1425 305.2 9.7e-83
CCDS11150.1 GLP2R gene_id:9340|Hs108|chr17 ( 553) 1231 265.0 1.4e-70
CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 466) 1191 256.6 4e-68
CCDS82367.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 430) 1186 255.6 7.8e-68
CCDS78295.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 422) 814 178.4 1.3e-44
CCDS5950.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 438) 814 178.4 1.4e-44
CCDS2127.1 SCTR gene_id:6344|Hs108|chr2 ( 440) 718 158.5 1.4e-38
CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 409) 698 154.3 2.3e-37
CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 416) 698 154.3 2.3e-37
CCDS2698.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 457) 698 154.3 2.5e-37
CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 447) 645 143.3 5e-34
CCDS5433.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 468) 645 143.3 5.2e-34
CCDS55125.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 508) 621 138.4 1.7e-32
CCDS2747.1 PTH1R gene_id:5745|Hs108|chr3 ( 593) 594 132.8 9.4e-31
CCDS2383.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 ( 550) 590 132.0 1.6e-30
CCDS5432.1 GHRHR gene_id:2692|Hs108|chr7 ( 423) 563 126.3 6.3e-29
CCDS82565.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 ( 439) 535 120.5 3.7e-27
CCDS45712.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 444) 521 117.6 2.8e-26
CCDS58829.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 247) 502 113.4 2.7e-25
CCDS56477.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 397) 500 113.2 5.2e-25
CCDS5429.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 411) 500 113.2 5.3e-25
CCDS56478.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 438) 500 113.2 5.6e-25
CCDS77049.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 314) 494 111.9 1e-24
CCDS45714.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 375) 494 111.9 1.2e-24
CCDS42350.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 415) 494 112.0 1.3e-24
CCDS58556.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 240) 487 110.3 2.3e-24
CCDS5631.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 474) 465 106.0 9.1e-23
CCDS2293.1 CALCRL gene_id:10203|Hs108|chr2 ( 461) 439 100.6 3.8e-21
CCDS75576.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 387) 424 97.4 2.9e-20
CCDS56480.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 496) 383 89.0 1.2e-17
CCDS45713.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 401) 348 81.7 1.6e-15
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 304 72.8 1.6e-12
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 304 72.8 1.7e-12
>>CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs108|chr17 (477 aa)
initn: 3324 init1: 3324 opt: 3324 Z-score: 3728.4 bits: 699.3 E(32554): 2.4e-201
Smith-Waterman score: 3324; 100.0% identity (100.0% similar) in 477 aa overlap (1-477:1-477)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MPPCQPQRPLLLLLLLLACQPQVPSAQVMDFLFEKWKLYGDQCHHNLSLLPPPTELVCNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MPPCQPQRPLLLLLLLLACQPQVPSAQVMDFLFEKWKLYGDQCHHNLSLLPPPTELVCNR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 TFDKYSCWPDTPANTTANISCPWYLPWHHKVQHRFVFKRCGPDGQWVRGPRGQPWRDASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TFDKYSCWPDTPANTTANISCPWYLPWHHKVQHRFVFKRCGPDGQWVRGPRGQPWRDASQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CQMDGEEIEVQKEVAKMYSSFQVMYTVGYSLSLGALLLALAILGGLSKLHCTRNAIHANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CQMDGEEIEVQKEVAKMYSSFQVMYTVGYSLSLGALLLALAILGGLSKLHCTRNAIHANL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 FASFVLKASSVLVIDGLLRTRYSQKIGDDLSVSTWLSDGAVAGCRVAAVFMQYGIVANYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FASFVLKASSVLVIDGLLRTRYSQKIGDDLSVSTWLSDGAVAGCRVAAVFMQYGIVANYC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 WLLVEGLYLHNLLGLATLPERSFFSLYLGIGWGAPMLFVVPWAVVKCLFENVQCWTSNDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WLLVEGLYLHNLLGLATLPERSFFSLYLGIGWGAPMLFVVPWAVVKCLFENVQCWTSNDN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 MGFWWILRFPVFLAILINFFIFVRIVQLLVAKLRARQMHHTDYKFRLAKSTLTLIPLLGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGFWWILRFPVFLAILINFFIFVRIVQLLVAKLRARQMHHTDYKFRLAKSTLTLIPLLGV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 HEVVFAFVTDEHAQGTLRSAKLFFDLFLSSFQGLLVAVLYCFLNKEVQSELRRRWHRWRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HEVVFAFVTDEHAQGTLRSAKLFFDLFLSSFQGLLVAVLYCFLNKEVQSELRRRWHRWRL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE9 GKVLWEERNTSNHRASSSPGHGPPSKELQFGRGGGSQDSSAETPLAGGLPRLAESPF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GKVLWEERNTSNHRASSSPGHGPPSKELQFGRGGGSQDSSAETPLAGGLPRLAESPF
430 440 450 460 470
>>CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs108|chr6 (463 aa)
initn: 1373 init1: 861 opt: 1425 Z-score: 1598.9 bits: 305.2 E(32554): 9.7e-83
Smith-Waterman score: 1425; 47.5% identity (73.9% similar) in 463 aa overlap (9-461:7-456)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MPPCQPQRPLLLLLLLLAC------QPQVPSAQVMDFLFEKWKLYGDQCHHNLSLLPPP-
:: : ::::. .:: .... . . .::. : ::...:. :::
CCDS48 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLWETV-QKWREYRRQCQRSLTEDPPPA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 TELVCNRTFDKYSCWPDTPANTTANISCPWYLPWHHKVQHRFVFKRCGPDGQWVRGPRGQ
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CCDS48 TDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 -PWRDASQCQMD--GEEIEVQKEVAKMYSSFQVMYTVGYSLSLGALLLALAILGGLSKLH
:::: :.:. . ::. .... .: ..:::::.::..::..: ::: :. .::
CCDS48 LPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLY----IIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 CTRNAIHANLFASFVLKASSVLVIDGLLRTRYSQKIGDDLSVSTWLSDGAVAGCRVAAVF
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CCDS48 CTRNYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTA-AQQHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 MQYGIVANYCWLLVEGLYLHNLLGLATLPERSFFSLYLGIGWGAPMLFVVPWAVVKCLFE
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CCDS48 MQYCVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 NVQCWTSNDNMGFWWILRFPVFLAILINFFIFVRIVQLLVAKLRARQMHHTDYKFRLAKS
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CCDS48 DEGCWTRNSNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLMCKTDIKCRLAKS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 TLTLIPLLGVHEVVFAFVTDEHAQGTLRSAKLFFDLFLSSFQGLLVAVLYCFLNKEVQSE
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CCDS48 TLTLIPLLGTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 LRRRWHRWRLGKVLWEERNTSNHRASSSPGHGPPSKELQFGRGGGSQDSSAETPLAGGLP
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CCDS48 FRKSWERWRL-------EHLHIQRDSSMKPLKCPTSSLSSGATAGSSMYTATCQASCS
420 430 440 450 460
pF1KE9 RLAESPF
>>CCDS11150.1 GLP2R gene_id:9340|Hs108|chr17 (553 aa)
initn: 1126 init1: 756 opt: 1231 Z-score: 1380.3 bits: 265.0 E(32554): 1.4e-70
Smith-Waterman score: 1231; 44.9% identity (74.1% similar) in 421 aa overlap (6-422:48-458)
10 20 30
pF1KE9 MPPCQPQRPLLLLLLLLACQPQVPSAQVMDFLFEK
: ::.: :.::.. . :: ...... .:
CCDS11 LPGVHELPMGIPAPWGTSPLSFHRKCSLWAPGRPFLTLVLLVSIK-QV-TGSLLEETTRK
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 WKLYGDQCHHNLSLLPPPTELVCNRTFDKYSCWP-DTPANTTANISCPWYLPWHHKVQHR
: : . : ..: : :. . :: :::.: ::: ..:.:.. . :: :::: . .
CCDS11 WAQYKQACLRDL--LKEPSGIFCNGTFDQYVCWPHSSPGNVS--VPCPSYLPWWSEESSG
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 FVFKRCGPDGQWVRGPRGQP-WRDASQCQMDGEEIEVQKEVAK--MYSSFQVMYTVGYSL
....: .: : . :.: :.:. :. ...: . . :..:.:::::::.
CCDS11 RAYRHCLAQGTWQTIENATDIWQDDSECS---ENHSFKQNVDRYALLSTLQLMYTVGYSF
140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 SLGALLLALAILGGLSKLHCTRNAIHANLFASFVLKASSVLVIDGLLRTRYSQKIGDDLS
:: .:.:::..: : ::::::: :: ::::::.:.. .::: : .. . ::.. .. .
CCDS11 SLISLFLALTLLLFLRKLHCTRNYIHMNLFASFILRTLAVLVKDVVFYNSYSKRPDNENG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 VSTWLSDGAVAGCRVAAVFMQYGIVANYCWLLVEGLYLHNLLGLATLPERSFFSLYLGIG
..::. ... :: . :...: . ::: ::::::::::.:: ..:::: .. :: .:
CCDS11 WMSYLSEMSTS-CRSVQVLLHYFVGANYLWLLVEGLYLHTLLEPTVLPERRLWPRYLLLG
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 WGAPMLFVVPWAVVKCLFENVQCWTSNDNMGFWWILRFPVFLAILINFFIFVRIVQLLVA
:. :.::::::. .. .::. :::.: : .:::.: :..: . .:::::..:..::..
CCDS11 WAFPVLFVVPWGFARAHLENTGCWTTNGNKKIWWIIRGPMMLCVTVNFFIFLKILKLLIS
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 KLRARQMHHTDYKFRLAKSTLTLIPLLGVHEVVFAFVTDEHAQGTLRSAKLFFDLFLSSF
::.:.:: :::.:::::::.:::::::::..:.:.::....: . .::..: ::::
CCDS11 KLKAHQMCFRDYKYRLAKSTLVLIPLLGVHEILFSFITDDQVEGFAKLIRLFIQLTLSSF
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 QGLLVAVLYCFLNKEVQSELRRRWHRWRLGKVLWEERNTSNHRASSSPGHGPPSKELQFG
.:.:::. : : : ::..:::. : :. :..
CCDS11 HGFLVALQYGFANGEVKAELRKYWVRFLLARHSGCRACVLGKDFRFLGKCPKKLSEGDGA
430 440 450 460 470 480
460 470
pF1KE9 RGGGSQDSSAETPLAGGLPRLAESPF
CCDS11 EKLRKLQPSLNSGRLLHLAMRGLGELGAQPQQDHARWPRGSSLSECSEGDVTMANTMEEI
490 500 510 520 530 540
>>CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 (466 aa)
initn: 1437 init1: 894 opt: 1191 Z-score: 1336.5 bits: 256.6 E(32554): 4e-68
Smith-Waterman score: 1491; 50.4% identity (73.2% similar) in 466 aa overlap (9-459:5-459)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MPPCQPQRPLLLLLLLLA-CQPQVPSA------QVMDFLFEKWKLYGDQCHHNLSLLPPP
:.: ::: :. : . : :. :...:. : .:...:. ::
CCDS12 MTTSPILQLLLRLSLCGLLLQRAETGSKGQTAGELYQRWERYRRECQETLAAAEPP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 TELVCNRTFDKYSCWPDTPANTTANISCPWYLPWHHKVQHRFVFKRCGPDGQWVRGPRGQ
. :.:: .:: : :: . :.:: ::::::::::.: ::...:: :::: :
CCDS12 SGLACNGSFDMYVCWDYAAPNATARASCPWYLPWHHHVAAGFVLRQCGSDGQW-----GL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 PWRDASQCQMDGEEIEVQKEVAKMYSSFQVMYTVGYSLSLGALLLALAILGGLSKLHCTR
::: .::. . :. :. . . .::::::::::::..::::: ::. . .:::::
CCDS12 -WRDHTQCE-NPEKNEAFLDQRLILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLHCTR
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 NAIHANLFASFVLKASSVLVIDGLLRTRYSQKIGDDLSVSTWLSDGAVAGCRVAAVFMQY
: :: :::.::.:.:...: : :: : . .::. ... : . :.:.::.: . ::
CCDS12 NYIHINLFTSFMLRAAAILSRDRLL-PRPGPYLGDQ-ALALW--NQALAACRTAQIVTQY
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 GIVANYCWLLVEGLYLHNLLGLATLPERSFFSLYLGIGWGAPMLFVVPWAVVKCLFENVQ
. ::: ::::::.:::.:: :. :.. : :: .::::: :::.::..:. :.::.:
CCDS12 CVGANYTWLLVEGVYLHSLLVLVGGSEEGHFRYYLLLGWGAPALFVIPWVIVRYLYENTQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 CWTSNDNMGFWWILRFPVFLAILINFFIFVRIVQLLVAKLRARQMHHTDYKFRLAKSTLT
:: :. ..:::.: :....:::::.::.::. .:..:::.:::. ::..:::.::::
CCDS12 CWERNEVKAIWWIIRTPILMTILINFLIFIRILGILLSKLRTRQMRCRDYRLRLARSTLT
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 LIPLLGVHEVVFAFVTDEHAQGTLRSAKLFFDLFLSSFQGLLVAVLYCFLNKEVQSELRR
:.::::::::::: ::.:.:.:.:: ::: :..:::::::.::.:::::.:::::::.::
CCDS12 LVPLLGVHEVVFAPVTEEQARGALRFAKLGFEIFLSSFQGFLVSVLYCFINKEVQSEIRR
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KE9 RWHRWRLGKVLWEERNTSNHRA------SSSPGHGPPSKELQFGR--GGGSQDSSAETPL
::. :: . : ::. .:: .:.::. : :. :. : : :.. :
CCDS12 GWHHCRLRRSLGEEQRQLPERAFRALPSGSGPGEVPTSRGLSSGTLPGPGNEASRELESY
410 420 430 440 450 460
470
pF1KE9 AGGLPRLAESPF
CCDS12 C
>>CCDS82367.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 (430 aa)
initn: 1237 init1: 894 opt: 1186 Z-score: 1331.3 bits: 255.6 E(32554): 7.8e-68
Smith-Waterman score: 1234; 52.8% identity (76.1% similar) in 373 aa overlap (95-459:62-423)
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 YSCWPDTPANTTANISCPWYLPWHHKVQHRFVFKRCGPDGQWVRGPRGQPWRDASQCQMD
::...:: :::: : ::: .::. .
CCDS82 AGELYQRWERYRRECQETLAAAEPPSVAAGFVLRQCGSDGQW-----GL-WRDHTQCE-N
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 GEEIEVQKEVAKMYSSFQVMYTVGYSLSLGALLLALAILGGLSKLHCTRNAIHANLFASF
:. :. . . .::::::::::::..::::: ::. . .:::::: :: :::.::
CCDS82 PEKNEAFLDQRLILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLHCTRNYIHINLFTSF
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VLKASSVLVIDGLLRTRYSQKIGDDLSVSTWLSDGAVAGCRVAAVFMQYGIVANYCWLLV
.:.:...: : :: : . .::. ... : . :.:.::.: . :: . ::: ::::
CCDS82 MLRAAAILSRDRLL-PRPGPYLGDQ-ALALW--NQALAACRTAQIVTQYCVGANYTWLLV
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 EGLYLHNLLGLATLPERSFFSLYLGIGWGAPMLFVVPWAVVKCLFENVQCWTSNDNMGFW
::.:::.:: :. :.. : :: .::::: :::.::..:. :.::.::: :. ..:
CCDS82 EGVYLHSLLVLVGGSEEGHFRYYLLLGWGAPALFVIPWVIVRYLYENTQCWERNEVKAIW
210 220 230 240 250 260
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CCDS82 WIIRTPILMTILINFLIFIRILGILLSKLRTRQMRCRDYRLRLARSTLTLVPLLGVHEVV
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CCDS82 FAPVTEEQARGALRFAKLGFEIFLSSFQGFLVSVLYCFINKEVQSEIRRGWHHCRLRRSL
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CCDS82 GEEQRQLPERAFRALPSGSGPGEVPTSRGLSSGTLPGPGNEASRELESYC
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470
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CCDS78 TSVI
420
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CCDS59 YLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVNFVLFISII
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CCDS59 RILLQKLTSPDVGGNDQSQYK-RLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVFP----ISISSKYQIL
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CCDS59 FELCLGSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKW-RSRCP----TPSASRDYRVCGSSFSRN
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CCDS59 GSEGALQFHRGSRAQSFLQTETSVI
420 430
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CCDS21 RLHCTRNYIHMHLFVSFILRALSNFIKDAVL---FS---SDDVTY----CDAHRAGCKLV
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CCDS21 MVLFQYCIMANYSWLLVEGLYLHTLLAISFFSERKYLQGFVAFGWGSPAIFVALWAIARH
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CCDS21 FLEDVGCWDINANASIWWIIRGPVILSILINFILFINILRILMRKLRTQETRGNEVSHYK
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CCDS21 GEVQLEVQKKWQQWHLREFPLHPVASFSNSTKASHLEQSQGTCRTSII
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CCDS58 GYGLSLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHMHLFISFILRAAAVFIKDLALF--------
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CCDS58 -DSGESDQCSEGSV-GCKAAMVFFQYCVMANFFWLLVEGLYLYTLLAVSFFSERKYFWGY
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CCDS58 ILIGWGVPSTFTMVWTIARIHFEDYGCWDTI-NSSLWWIIKGPILTSILVNFILFICIIR
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CCDS58 ILLQKLRPPDIRKSDSSPYSRLARSTLLLIPLFGVHYIMFAFFPDNFKP----EVKMVFE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]