Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9547
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9547, 553 aa
1>>>pF1KE9547 553 - 553 aa - 553 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0538+/-0.000898; mu= 20.5828+/- 0.054
mean_var=75.3743+/-15.351, 0's: 0 Z-trim(107.2): 69 B-trim: 158 in 1/51
Lambda= 0.147728
statistics sampled from 9367 (9439) to 9367 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 3.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11150.1 GLP2R gene_id:9340|Hs108|chr17 ( 553) 3802 820.0 0
CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs108|chr6 ( 463) 1281 282.6 7.1e-76
CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs108|chr17 ( 477) 1231 272.0 1.2e-72
CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 466) 985 219.5 6.9e-57
CCDS82367.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 430) 978 218.0 1.8e-56
CCDS78295.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 422) 772 174.1 3e-43
CCDS5950.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 438) 769 173.5 4.8e-43
CCDS2127.1 SCTR gene_id:6344|Hs108|chr2 ( 440) 660 150.2 4.7e-36
CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 416) 634 144.7 2.1e-34
CCDS2698.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 457) 634 144.7 2.3e-34
CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 409) 632 144.2 2.8e-34
CCDS5433.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 468) 626 143.0 7.5e-34
CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 447) 590 135.3 1.5e-31
CCDS55125.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 508) 590 135.4 1.6e-31
CCDS2747.1 PTH1R gene_id:5745|Hs108|chr3 ( 593) 559 128.8 1.8e-29
CCDS5432.1 GHRHR gene_id:2692|Hs108|chr7 ( 423) 503 116.8 5.4e-26
CCDS45712.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 444) 495 115.1 1.8e-25
CCDS56477.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 397) 468 109.3 9.1e-24
CCDS5429.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 411) 468 109.3 9.3e-24
CCDS56478.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 438) 468 109.3 9.8e-24
CCDS58829.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 247) 442 103.6 3e-22
CCDS2293.1 CALCRL gene_id:10203|Hs108|chr2 ( 461) 439 103.1 7.4e-22
CCDS5631.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 474) 435 102.3 1.4e-21
CCDS77049.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 314) 431 101.3 1.8e-21
CCDS45714.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 375) 431 101.4 2.1e-21
CCDS42350.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 415) 431 101.4 2.2e-21
CCDS56480.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 496) 431 101.5 2.5e-21
CCDS75576.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 387) 428 100.7 3.3e-21
CCDS58556.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 240) 415 97.8 1.6e-20
CCDS2383.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 ( 550) 403 95.5 1.7e-19
CCDS45713.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 401) 344 82.9 8.3e-16
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 293 72.3 2.8e-12
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 293 72.3 2.8e-12
>>CCDS11150.1 GLP2R gene_id:9340|Hs108|chr17 (553 aa)
initn: 3802 init1: 3802 opt: 3802 Z-score: 4378.4 bits: 820.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3802; 99.8% identity (100.0% similar) in 553 aa overlap (1-553:1-553)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MKLGSSRAGPGRGSAGLLPGVHELPMGIPAPWGTSPLSFHRKCSLWAPGRPFLTLVLLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MKLGSSRAGPGRGSAGLLPGVHELPMGIPAPWGTSPLSFHRKCSLWAPGRPFLTLVLLVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 IKQVTGSLLEETTRKWAQYKQACLRDLLKEPSGIFCNGTFDQYVCWPHSSPGNVSVPCPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IKQVTGSLLEETTRKWAQYKQACLRDLLKEPSGIFCNGTFDQYVCWPHSSPGNVSVPCPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 YLPWWSEESSGRAYRHCLAQGTWQTIENATDIWQDDSECSENHSFKQNVDRYALLSTLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YLPWWSEESSGRAYRHCLAQGTWQTIENATDIWQDDSECSENHSFKQNVDRYALLSTLQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MYTVGYSFSLISLFLALTLLLFLRKLHCTRNYIHMNLFASFILRTLAVLVKDVVFYNSYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MYTVGYSFSLISLFLALTLLLFLRKLHCTRNYIHMNLFASFILRTLAVLVKDVVFYNSYS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 KRPDNENGWMSYLSEMSTSCRSVQVLLHYFVGANYLWLLVEGLYLHTLLEPTVLPERRLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KRPDNENGWMSYLSEMSTSCRSVQVLLHYFVGANYLWLLVEGLYLHTLLEPTVLPERRLW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 PRYLLLGWAFPVLFVVPWGFARAHLENTGCWTTNGNKKIWWIIRGPMMLCVTVNFFIFLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PRYLLLGWAFPVLFVVPWGFARAHLENTGCWTTNGNKKIWWIIRGPMMLCVTVNFFIFLK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 ILKLLISKLKAHQMCFRDYKYRLAKSTLVLIPLLGVHEILFSFITDDQVEGFAKLIRLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ILKLLISKLKAHQMCFRDYKYRLAKSTLVLIPLLGVHEILFSFITDDQVEGFAKLIRLFI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 QLTLSSFHGFLVALQYGFANGEVKAELRKYWVRFLLARHSGCRACVLGKNFRFLGKCPKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS11 QLTLSSFHGFLVALQYGFANGEVKAELRKYWVRFLLARHSGCRACVLGKDFRFLGKCPKK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 LSEGDGAEKLRKLQPSLNSGRLLHLAMRGLGELGAQPQQDHARWPRGSSLSECSEGDVTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSEGDGAEKLRKLQPSLNSGRLLHLAMRGLGELGAQPQQDHARWPRGSSLSECSEGDVTM
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE9 ANTMEEILEESEI
:::::::::::::
CCDS11 ANTMEEILEESEI
550
>>CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs108|chr6 (463 aa)
initn: 1224 init1: 993 opt: 1281 Z-score: 1475.7 bits: 282.6 E(32554): 7.1e-76
Smith-Waterman score: 1287; 45.0% identity (72.6% similar) in 453 aa overlap (47-487:4-449)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 LLPGVHELPMGIPAPWGTSPLSFHRKCSLWAPGRPFLTLVLLVSIKQV----TGSL--LE
::: :.:.:: . .. :. :
CCDS48 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLW
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KE9 ETTRKWAQYKQACLRDLLKEP---SGIFCNGTFDQYVCWPHSSPGN-VSVPCPSYLPWWS
::..:: .:.. : :.: ..: . .::: :::.:.::: . ::. :.: :: :::: :
CCDS48 ETVQKWREYRRQCQRSLTEDPPPATDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWAS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 EESSGRAYRHCLAQGTWQTIENATDIWQDDSECSENHSFKQNVDRYALLSTLQLMYTVGY
.:..:: : :.: : .:.. :.: ::: :.. ... . :: : ..:::::
CCDS48 SVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSSLPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLL-FLYIIYTVGY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 SFSLISLFLALTLLLFLRKLHCTRNYIHMNLFASFILRTLAVLVKDVVFYNSYSKRPDNE
..:. .: .: ..:: .:.:::::::::.:::::::::.:.:..::... :: . .
CCDS48 ALSFSALVIASAILLGFRHLHCTRNYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTAAQ-Q
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 NGWMSYLSEM-STSCRSVQVLLHYFVGANYLWLLVEGLYLHTLLEPTVLPERRLWPRYLL
. : . :: . : ::: : .:..: :.::: ::::::.::.::: .:: :. .. :.
CCDS48 HQWDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQYCVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVS
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 LGWAFPVLFVVPWGFARAHLENTGCWTTNGNKKIWWIIRGPMMLCVTVNFFIFLKILKLL
.::. :.:::::::... :. :::: :.: . : ::: :... . :::.::.... ..
CCDS48 IGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDEGCWTRNSNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIV
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 ISKLKAHQMCFRDYKYRLAKSTLVLIPLLGVHEILFSFITDDQVEGFAKLIRLFIQLTLS
.:::::. :: : : :::::::.::::::.::..:.:. :....: ..:.:: .:...
CCDS48 VSKLKANLMCKTDIKCRLAKSTLTLIPLLGTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFT
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 SFHGFLVALQYGFANGEVKAELRKYWVRFLLARHSGCRACVLGKNFRFLGKCP-KKLSEG
::.:..::. : :.:.::. :.:: : :. : . : .... : ::: ..:: :
CCDS48 SFQGLMVAILYCFVNNEVQLEFRKSWERWRLEHLHIQR----DSSMKPL-KCPTSSLSSG
400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 DGAEKLRKLQPSLNSGRLLHLAMRGLGELGAQPQQDHARWPRGSSLSECSEGDVTMANTM
:
CCDS48 ATAGSSMYTATCQASCS
450 460
>>CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs108|chr17 (477 aa)
initn: 1126 init1: 756 opt: 1231 Z-score: 1417.9 bits: 272.0 E(32554): 1.2e-72
Smith-Waterman score: 1231; 44.6% identity (74.5% similar) in 419 aa overlap (48-458:6-422)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 LPGVHELPMGIPAPWGTSPLSFHRKCSLWAPGRPFLTLVLLVSIK-QV-TGSLLEETTRK
: ::.: :.::.. . :: ...... .:
CCDS54 MPPCQPQRPLLLLLLLLACQPQVPSAQVMDFLFEK
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 WAQYKQACLRDL--LKEPSGIFCNGTFDQYVCWPHSSPGNVS--VPCPSYLPWWSEESSG
: : . : ..: : :. . :: :::.: ::: ..:.:.. . :: :::: . .
CCDS54 WKLYGDQCHHNLSLLPPPTELVCNRTFDKYSCWP-DTPANTTANISCPWYLPWHHKVQHR
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 RAYRHCLAQGTWQTIENATDIWQDDSECS-ENHSFKQNVDRYALLSTLQLMYTVGYSFSL
....: .: : . :.: :.:. ... .. . . . :..:.:::::::.::
CCDS54 FVFKRCGPDGQWVRGPRGQP-WRDASQCQMDGEEIEVQKEVAKMYSSFQVMYTVGYSLSL
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 ISLFLALTLLLFLRKLHCTRNYIHMNLFASFILRTLAVLVKDVVFYNSYSKRPDNENGWM
.:.:::..: : ::::::: :: ::::::.:.. .::: : .. . ::.. .. .
CCDS54 GALLLALAILGGLSKLHCTRNAIHANLFASFVLKASSVLVIDGLLRTRYSQKIGDDLSVS
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300
pF1KE9 SYLSEMSTS-CRSVQVLLHYFVGANYLWLLVEGLYLHTLLEPTVLPERRLWPRYLLLGWA
..::. ... :: . :...: . ::: ::::::::::.:: ..:::: .. :: .::.
CCDS54 TWLSDGAVAGCRVAAVFMQYGIVANYCWLLVEGLYLHNLLGLATLPERSFFSLYLGIGWG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 FPVLFVVPWGFARAHLENTGCWTTNGNKKIWWIIRGPMMLCVTVNFFIFLKILKLLISKL
:.::::::. .. .::. :::.: : .:::.: :..: . .:::::..:..::..::
CCDS54 APMLFVVPWAVVKCLFENVQCWTSNDNMGFWWILRFPVFLAILINFFIFVRIVQLLVAKL
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 KAHQMCFRDYKYRLAKSTLVLIPLLGVHEILFSFITDDQVEGFAKLIRLFIQLTLSSFHG
.:.:: :::.:::::::.:::::::::..:.:.::....: . .::..: ::::.:
CCDS54 RARQMHHTDYKFRLAKSTLTLIPLLGVHEVVFAFVTDEHAQGTLRSAKLFFDLFLSSFQG
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 FLVALQYGFANGEVKAELRKYWVRFLLARHSGCRACVLGKNFRFLGKCPKKLSEGDGAEK
.:::. : : : ::..:::. : :. :..
CCDS54 LLVAVLYCFLNKEVQSELRRRWHRWRLGKVLWEERNTSNHRASSSPGHGPPSKELQFGRG
400 410 420 430 440 450
>>CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 (466 aa)
initn: 1097 init1: 701 opt: 985 Z-score: 1134.7 bits: 219.5 E(32554): 6.9e-57
Smith-Waterman score: 1194; 41.7% identity (68.9% similar) in 453 aa overlap (51-486:5-445)
30 40 50 60 70
pF1KE9 VHELPMGIPAPWGTSPLSFHRKCSLWAPGRPFLTLVLLVSI------KQVTGSLLE---E
:.: :.: .:. . ::: . :
CCDS12 MTTSPILQLLLRLSLCGLLLQRAETGSKGQTAGE
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KE9 TTRKWAQYKQACLRDLL--KEPSGIFCNGTFDQYVCWPHSSPGNVS-VPCPSYLPWWSEE
..: .:.. : . : . :::. :::.::.:::: ...:. .. . :: :::: .
CCDS12 LYQRWERYRRECQETLAAAEPPSGLACNGSFDMYVCWDYAAPNATARASCPWYLPWHHHV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 SSGRAYRHCLAQGTWQTIENATDIWQDDSECSENHSFKQNVDRYALLSTLQLMYTVGYSF
..: . :.: ..: : .:.: ..: . .. . .:. .: ::.:::::::.
CCDS12 AAGFVLRQCGSDGQW-------GLWRDHTQCENPEKNEAFLDQRLILERLQVMYTVGYSL
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 SLISLFLALTLLLFLRKLHCTRNYIHMNLFASFILRTLAVLVKDVVFYNSYSKRPDNENG
:: .:.::: .: ..:.:::::::::.:::.::.::. :.: .: .. :: :
CCDS12 SLATLLLALLILSLFRRLHCTRNYIHINLFTSFMLRAAAILSRDRLL-----PRPGPYLG
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 --WMSYLSEMSTSCRSVQVLLHYFVGANYLWLLVEGLYLHTLLEPTVLPERRLWPRYLLL
.. .. ..::..:.. .: ::::: ::::::.:::.:: . :. . ::::
CCDS12 DQALALWNQALAACRTAQIVTQYCVGANYTWLLVEGVYLHSLLVLVGGSEEGHFRYYLLL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 GWAFPVLFVVPWGFARAHLENTGCWTTNGNKKIWWIIRGPMMLCVTVNFFIFLKILKLLI
::. :.:::.:: ..: ::: :: : : :::::: :... . .::.::..:: .:.
CCDS12 GWGAPALFVIPWVIVRYLYENTQCWERNEVKAIWWIIRTPILMTILINFLIFIRILGILL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 SKLKAHQMCFRDYKYRLAKSTLVLIPLLGVHEILFSFITDDQVEGFAKLIRLFIQLTLSS
:::...:: :::. :::.:::.:.:::::::..:. .:..:..: .. .: ... :::
CCDS12 SKLRTRQMRCRDYRLRLARSTLTLVPLLGVHEVVFAPVTEEQARGALRFAKLGFEIFLSS
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 FHGFLVALQYGFANGEVKAELRKYWVRFLLARHSGCRACVLG-KNFRFL--GKCPKKLSE
:.::::.. : : : ::..:.:. : . : : : . : . :: : :. : ..
CCDS12 FQGFLVSVLYCFINKEVQSEIRRGWHHCRLRRSLGEEQRQLPERAFRALPSGSGPGEVPT
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 GDGAEKLRKLQPSLNSGRLLHLAMRGLGELGAQPQQDHARWPRGSSLSECSEGDVTMANT
. :
CCDS12 SRGLSSGTLPGPGNEASRELESYC
450 460
>>CCDS82367.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 (430 aa)
initn: 946 init1: 701 opt: 978 Z-score: 1127.1 bits: 218.0 E(32554): 1.8e-56
Smith-Waterman score: 999; 43.3% identity (70.5% similar) in 363 aa overlap (129-486:59-409)
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 TFDQYVCWPHSSPGNVSVPCPSYLPWWSEESSGRAYRHCLAQGTWQTIENATDIWQDDSE
..: . :.: ..: : .:.: ..
CCDS82 GQTAGELYQRWERYRRECQETLAAAEPPSVAAGFVLRQCGSDGQW-------GLWRDHTQ
30 40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 CSENHSFKQNVDRYALLSTLQLMYTVGYSFSLISLFLALTLLLFLRKLHCTRNYIHMNLF
: . .. . .:. .: ::.:::::::.:: .:.::: .: ..:.:::::::::.:::
CCDS82 CENPEKNEAFLDQRLILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLHCTRNYIHINLF
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 ASFILRTLAVLVKDVVFYNSYSKRPDNENG--WMSYLSEMSTSCRSVQVLLHYFVGANYL
.::.::. :.: .: .. :: : .. .. ..::..:.. .: :::::
CCDS82 TSFMLRAAAILSRDRLL-----PRPGPYLGDQALALWNQALAACRTAQIVTQYCVGANYT
150 160 170 180 190
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CCDS82 WLLVEGVYLHSLLVLVGGSEEGHFRYYLLLGWGAPALFVIPWVIVRYLYENTQCWERNEV
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340 350 360 370 380 390
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CCDS82 KAIWWIIRTPILMTILINFLIFIRILGILLSKLRTRQMRCRDYRLRLARSTLTLVPLLGV
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CCDS82 HEVVFAPVTEEQARGALRFAKLGFEIFLSSFQGFLVSVLYCFINKEVQSEIRRGWHHCRL
320 330 340 350 360 370
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: : . : . :: : :. : .. . :
CCDS82 RRSLGEEQRQLPERAFRALPSGSGPGEVPTSRGLSSGTLPGPGNEASRELESYC
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CCDS78 SLATGSIILCLFRKLHCTRNYIHLNLFLSFILRAISVLVKDDVLYSSSGTLHCPDQPSSW
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.. :. :.:.: . ::..::::::::::::: ..:: :: . :::.::.
CCDS78 VG--------CKLSLVFLQYCIMANFFWLLVEGLYLHTLLV-AMLPPRRCFLAYLLIGWG
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CCDS78 LPTVCIGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVNFVLFISIIRILLQKL
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CCDS78 TSPDVGGNDQSQYK-RLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVFP---ISISSKYQILF-ELCLGS
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CCDS78 FQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKW-------RSRCPTPSASRDYRVCGSSFSRNGSEGA
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CCDS78 LQFHRGSRAQSFLQTETSVI
410 420
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CCDS59 FYSKA-GNISKNCTSDGWSETFPDFVDA------C--GYSDPEDESKITFYILVKAIYTL
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CCDS59 GYSVSLMSLATGSIILCLFRKLHCTRNYIHLNLFLSFILRAISVLVKDDVLYSSSGTLHC
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CCDS59 PDQPSSWVG--------CKLSLVFLQYCIMANFFWLLVEGLYLHTLLV-AMLPPRRCFLA
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CCDS59 YLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVNFVLFISII
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CCDS59 RILLQKLTSPDVGGNDQSQYK-RLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVF---PISISSKYQILF
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CCDS59 -ELCLGSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKW-------RSRCPTPSASRDYRVCGSSFS
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CCDS59 RNGSEGALQFHRGSRAQSFLQTETSVI
420 430
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CCDS21 LWEEQDQ-CLQELSREQTGDLGTEQPVPGCEGMWDNISCWPSSVPGRMVEVECPRFLRML
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CCDS21 TSRN-GSLFRNCTQDG-W-----SETFPRPNLACGVNVNDSSNEKRHSYLLKLKVMYTVG
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CCDS21 YSSSLVMLLVALGILCAFRRLHCTRNYIHMHLFVSFILRALSNFIKDAVLFSS-----DD
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..: . ..:. :.::..: . ::: ::::::::::::: . . ::. ..
CCDS21 ----VTYCDAHRAGCKLVMVLFQYCIMANYSWLLVEGLYLHTLLAISFFSERKYLQGFVA
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.::. :..::. :..:: ::..::: :.: .::::::::..: . .::..:..::..:
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pF1KE9 ISKLKAHQMCFRDYKY--RLAKSTLVLIPLLGVHEILFSFITDDQVEGFAKLIRLFIQLT
. ::.... . .. :::.:::.::::.:.: :.:.: .: .: :.::..:.
CCDS21 MRKLRTQETRGNEVSHYKRLARSTLLLIPLFGIHYIVFAFSPEDAME-----IQLFFELA
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CCDS21 LGSFQGLVVAVLYCFLNGEVQLEVQKKWQQWHLREFPLHPVASFSNSTKASHLEQSQGTC
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CCDS21 RTSII
440
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. . .. . .... ::.::..:: .:..: ..: ..::::::::::::.:: :::::.
CCDS58 SLDEQQTMFYGSVKTGYTIGYGLSLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHMHLFISFILRA
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CCDS58 YTLLAVSFFSERKYFWGYILIGWGVPSTFTMVWTIARIHFEDYGCWDTI-NSSLWWIIKG
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pF1KE9 ITDDQVEGFAKLIRLFIQLTLSSFHGFLVALQYGFANGEVKAELRKYWVRFLLARHSGCR
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CCDS58 FPDN----FKPEVKMVFELVVGSFQGFVVAILYCFLNGEVQAELRRKWRRWHL---QG--
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::: : .. . :. :.:
CCDS58 --VLGWNPKY--RHPSGGSNGATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
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CCDS26 AGALAWALGPAGGQAARLQEECDYVQMIEVQHKQ-CLEEAQLENETIGCSKMWDNLTCWP
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. :.: : :: . .: .. . : : .: : .: . :. ....
CCDS26 ATPRGQVVVLACPLIFKLFSSIQGRNVSRSCTDEG-WTHLEPGPY----PIACGLDDKAA
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pF1KE9 KQNVDRYALLSTLQLMYTVGYSFSLISLFLALTLLLFLRKLHCTRNYIHMNLFASFILRT
. . .. . .... ::.::..:: .:..: ..: ..::::::::::::.:: :::::.
CCDS26 SLDEQQTMFYGSVKTGYTIGYGLSLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHMHLFISFILRA
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pF1KE9 LAVLVKDVVFYNSYSKRPDNENGWMSYLSEMSTSCRSVQVLLHYFVGANYLWLLVEGLYL
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CCDS26 AAVFIKDLALFDS---------GESDQCSEGSVGCKAAMVFFQYCVMANFFWLLVEGLYL
190 200 210 220 230 240
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CCDS26 YTLLAVSFFSERKYFWGYILIGWGVPSTFTMVWTIARIHFEDYGCWDTI-NSSLWWIIKG
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CCDS26 PILTSILVNFILFICIIRILLQKLRPPDIRKSDSSPYSRLARSTLLLIPLFGVHYIMFAF
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pF1KE9 ITDDQVEGFAKLIRLFIQLTLSSFHGFLVALQYGFANGEVKAELRKYWVRFLLARHSGCR
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CCDS26 FPDN----FKPEVKMVFELVVGSFQGFVVAILYCFLNGEVQAELRRKWRRWHL---QG--
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CCDS26 --VLGWNPKY--RHPSGGSNGATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]