Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9544
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9544, 466 aa
1>>>pF1KE9544 466 - 466 aa - 466 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2778+/-0.000757; mu= 18.2527+/- 0.046
mean_var=72.7846+/-14.626, 0's: 0 Z-trim(109.4): 78 B-trim: 601 in 1/50
Lambda= 0.150333
statistics sampled from 10786 (10865) to 10786 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 2.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 466) 3188 700.6 9e-202
CCDS82367.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 430) 2517 555.0 5.4e-158
CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs108|chr17 ( 477) 1191 267.5 2.2e-71
CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs108|chr6 ( 463) 1012 228.6 1e-59
CCDS2127.1 SCTR gene_id:6344|Hs108|chr2 ( 440) 984 222.5 6.8e-58
CCDS11150.1 GLP2R gene_id:9340|Hs108|chr17 ( 553) 984 222.6 8.1e-58
CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 409) 924 209.5 5.3e-54
CCDS2698.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 457) 924 209.5 5.8e-54
CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 416) 920 208.7 9.8e-54
CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 447) 892 202.6 7e-52
CCDS5950.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 438) 887 201.5 1.5e-51
CCDS5433.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 468) 843 192.0 1.1e-48
CCDS5432.1 GHRHR gene_id:2692|Hs108|chr7 ( 423) 801 182.8 5.8e-46
CCDS78295.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 422) 797 182.0 1.1e-45
CCDS5631.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 474) 629 145.6 1.1e-34
CCDS2293.1 CALCRL gene_id:10203|Hs108|chr2 ( 461) 626 144.9 1.7e-34
CCDS56480.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 496) 611 141.7 1.7e-33
CCDS55125.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 508) 576 134.1 3.3e-31
CCDS56477.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 397) 461 109.1 8.7e-24
CCDS5429.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 411) 461 109.1 9e-24
CCDS56478.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 438) 461 109.1 9.4e-24
CCDS58829.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 247) 457 108.1 1.1e-23
CCDS58556.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 240) 439 104.2 1.6e-22
CCDS77049.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 314) 439 104.2 2e-22
CCDS45714.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 375) 439 104.3 2.3e-22
CCDS42350.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 415) 439 104.3 2.5e-22
CCDS45712.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 444) 439 104.4 2.6e-22
CCDS75576.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 387) 418 99.8 5.5e-21
CCDS2747.1 PTH1R gene_id:5745|Hs108|chr3 ( 593) 400 96.0 1.2e-19
CCDS2383.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 ( 550) 393 94.4 3.1e-19
CCDS45713.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 401) 310 76.3 6.4e-14
CCDS82565.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 ( 439) 291 72.2 1.2e-12
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 287 71.6 3.7e-12
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 287 71.6 3.8e-12
>>CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 (466 aa)
initn: 3188 init1: 3188 opt: 3188 Z-score: 3735.9 bits: 700.6 E(32554): 9e-202
Smith-Waterman score: 3188; 100.0% identity (100.0% similar) in 466 aa overlap (1-466:1-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MTTSPILQLLLRLSLCGLLLQRAETGSKGQTAGELYQRWERYRRECQETLAAAEPPSGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MTTSPILQLLLRLSLCGLLLQRAETGSKGQTAGELYQRWERYRRECQETLAAAEPPSGLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 CNGSFDMYVCWDYAAPNATARASCPWYLPWHHHVAAGFVLRQCGSDGQWGLWRDHTQCEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CNGSFDMYVCWDYAAPNATARASCPWYLPWHHHVAAGFVLRQCGSDGQWGLWRDHTQCEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PEKNEAFLDQRLILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLHCTRNYIHINLFTSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PEKNEAFLDQRLILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLHCTRNYIHINLFTSF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLRAAAILSRDRLLPRPGPYLGDQALALWNQALAACRTAQIVTQYCVGANYTWLLVEGVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLRAAAILSRDRLLPRPGPYLGDQALALWNQALAACRTAQIVTQYCVGANYTWLLVEGVY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LHSLLVLVGGSEEGHFRYYLLLGWGAPALFVIPWVIVRYLYENTQCWERNEVKAIWWIIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LHSLLVLVGGSEEGHFRYYLLLGWGAPALFVIPWVIVRYLYENTQCWERNEVKAIWWIIR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 TPILMTILINFLIFIRILGILLSKLRTRQMRCRDYRLRLARSTLTLVPLLGVHEVVFAPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TPILMTILINFLIFIRILGILLSKLRTRQMRCRDYRLRLARSTLTLVPLLGVHEVVFAPV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 TEEQARGALRFAKLGFEIFLSSFQGFLVSVLYCFINKEVQSEIRRGWHHCRLRRSLGEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TEEQARGALRFAKLGFEIFLSSFQGFLVSVLYCFINKEVQSEIRRGWHHCRLRRSLGEEQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE9 RQLPERAFRALPSGSGPGEVPTSRGLSSGTLPGPGNEASRELESYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RQLPERAFRALPSGSGPGEVPTSRGLSSGTLPGPGNEASRELESYC
430 440 450 460
>>CCDS82367.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 (430 aa)
initn: 2878 init1: 2517 opt: 2517 Z-score: 2949.9 bits: 555.0 E(32554): 5.4e-158
Smith-Waterman score: 2810; 92.3% identity (92.3% similar) in 466 aa overlap (1-466:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MTTSPILQLLLRLSLCGLLLQRAETGSKGQTAGELYQRWERYRRECQETLAAAEPPSGLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MTTSPILQLLLRLSLCGLLLQRAETGSKGQTAGELYQRWERYRRECQETLAAAEPPS---
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 CNGSFDMYVCWDYAAPNATARASCPWYLPWHHHVAAGFVLRQCGSDGQWGLWRDHTQCEN
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ---------------------------------VAAGFVLRQCGSDGQWGLWRDHTQCEN
60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PEKNEAFLDQRLILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLHCTRNYIHINLFTSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PEKNEAFLDQRLILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLHCTRNYIHINLFTSF
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLRAAAILSRDRLLPRPGPYLGDQALALWNQALAACRTAQIVTQYCVGANYTWLLVEGVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MLRAAAILSRDRLLPRPGPYLGDQALALWNQALAACRTAQIVTQYCVGANYTWLLVEGVY
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LHSLLVLVGGSEEGHFRYYLLLGWGAPALFVIPWVIVRYLYENTQCWERNEVKAIWWIIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LHSLLVLVGGSEEGHFRYYLLLGWGAPALFVIPWVIVRYLYENTQCWERNEVKAIWWIIR
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 TPILMTILINFLIFIRILGILLSKLRTRQMRCRDYRLRLARSTLTLVPLLGVHEVVFAPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TPILMTILINFLIFIRILGILLSKLRTRQMRCRDYRLRLARSTLTLVPLLGVHEVVFAPV
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 TEEQARGALRFAKLGFEIFLSSFQGFLVSVLYCFINKEVQSEIRRGWHHCRLRRSLGEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TEEQARGALRFAKLGFEIFLSSFQGFLVSVLYCFINKEVQSEIRRGWHHCRLRRSLGEEQ
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460
pF1KE9 RQLPERAFRALPSGSGPGEVPTSRGLSSGTLPGPGNEASRELESYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RQLPERAFRALPSGSGPGEVPTSRGLSSGTLPGPGNEASRELESYC
390 400 410 420 430
>>CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs108|chr17 (477 aa)
initn: 1437 init1: 894 opt: 1191 Z-score: 1395.0 bits: 267.5 E(32554): 2.2e-71
Smith-Waterman score: 1491; 50.4% identity (73.2% similar) in 466 aa overlap (5-459:9-459)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MTTSPILQLLLRLSLCGLLLQRAETGSKGQTAGELYQRWERYRRECQETLAAAEPP
:.: ::: :. : . : :. :...:. : .:...:. ::
CCDS54 MPPCQPQRPLLLLLLLLA-CQPQVPSA------QVMDFLFEKWKLYGDQCHHNLSLLPPP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 SGLACNGSFDMYVCWDYAAPNATARASCPWYLPWHHHVAAGFVLRQCGSDGQW-----GL
. :.:: .:: : :: . :.:: ::::::::::.: ::...:: :::: :
CCDS54 TELVCNRTFDKYSCWPDTPANTTANISCPWYLPWHHKVQHRFVFKRCGPDGQWVRGPRGQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE9 -WRDHTQCE-NPEKNEAFLDQRLILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLHCTR
::: .::. . :. :. . . .::::::::::::..::::: ::. . .:::::
CCDS54 PWRDASQCQMDGEEIEVQKEVAKMYSSFQVMYTVGYSLSLGALLLALAILGGLSKLHCTR
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 NYIHINLFTSFMLRAAAILSRDRLL-PRPGPYLGDQ-ALALW--NQALAACRTAQIVTQY
: :: :::.::.:.:...: : :: : . .::. ... : . :.:.::.: . ::
CCDS54 NAIHANLFASFVLKASSVLVIDGLLRTRYSQKIGDDLSVSTWLSDGAVAGCRVAAVFMQY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 CVGANYTWLLVEGVYLHSLLVLVGGSEEGHFRYYLLLGWGAPALFVIPWVIVRYLYENTQ
. ::: ::::::.:::.:: :. :.. : :: .::::: :::.::..:. :.::.:
CCDS54 GIVANYCWLLVEGLYLHNLLGLATLPERSFFSLYLGIGWGAPMLFVVPWAVVKCLFENVQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 CWERNEVKAIWWIIRTPILMTILINFLIFIRILGILLSKLRTRQMRCRDYRLRLARSTLT
:: :. ..:::.: :....:::::.::.::. .:..:::.:::. ::..:::.::::
CCDS54 CWTSNDNMGFWWILRFPVFLAILINFFIFVRIVQLLVAKLRARQMHHTDYKFRLAKSTLT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 LVPLLGVHEVVFAPVTEEQARGALRFAKLGFEIFLSSFQGFLVSVLYCFINKEVQSEIRR
:.::::::::::: ::.:.:.:.:: ::: :..:::::::.::.:::::.:::::::.::
CCDS54 LIPLLGVHEVVFAFVTDEHAQGTLRSAKLFFDLFLSSFQGLLVAVLYCFLNKEVQSELRR
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 GWHHCRLRRSLGEEQRQLPERAFRALPSGSGPGEVPTSRGLSSGTLPGPGNEASRELESY
::. :: . : ::. .:: .:.::. : :. :. : : :.. :
CCDS54 RWHRWRLGKVLWEERNTSNHRA------SSSPGHGPPSKELQFGR--GGGSQDSSAETPL
420 430 440 450 460
pF1KE9 C
CCDS54 AGGLPRLAESPF
470
>>CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs108|chr6 (463 aa)
initn: 1215 init1: 765 opt: 1012 Z-score: 1185.4 bits: 228.6 E(32554): 1e-59
Smith-Waterman score: 1282; 45.9% identity (69.8% similar) in 460 aa overlap (11-453:8-450)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MTTSPILQLLLRLSLCGL-LLQRAETGSKGQTAG--ELYQRWERYRRECQETLAAAEPP-
:::.: : .. :: .: :.. : :.:..:::.::..:. ::
CCDS48 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLWETVQKWREYRRQCQRSLTEDPPPA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 SGLACNGSFDMYVCWDYAAPNATARASCPWYLPWHHHVAAGFVLRQCGSDGQW------G
. : :: .:: :.:: . :.. . .:::::::: : : : : : ..: : .
CCDS48 TDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE9 L-WRDHTQCENPEKNEAFLDQRLILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLHCTR
: ::: ..::. ...: .. .: : ..:::::.::...:..: :: ::.:::::
CCDS48 LPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLLF-LYIIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCTR
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 NYIHINLFTSFMLRAAAILSRDRLLPRPGPYLGDQALALWNQALA-----ACRTAQIVTQ
::::.:::.::.::: ... .: : ..: :. :. .:: . .. :
CCDS48 NYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTAAQQHQ--WDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 YCVGANYTWLLVEGVYLHSLLVLVGGSEEGHFRYYLLLGWGAPALFVIPWVIVRYLYENT
:::.::: :::::::::..::.. ::. :: :. .:::.: :::.:: ::.::::.
CCDS48 YCVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 QCWERNEVKAIWWIIRTPILMTILINFLIFIRILGILLSKLRTRQMRCR-DYRLRLARST
:: :: : ::: :::..: .:::::.:.. :..:::.. : :. : . :::.::
CCDS48 GCWTRNSNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLM-CKTDIKCRLAKST
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 LTLVPLLGVHEVVFAPVTEEQARGALRFAKLGFEIFLSSFQGFLVSVLYCFINKEVQSEI
:::.::::.:::.:: : .:.:::.::: :: :. ..::::..:..::::.:.::: :.
CCDS48 LTLIPLLGTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLEF
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 RRGWHHCRLRRSLGEEQRQLPERAFRALPSGSGPGEVPTSRGLSSGTLPGPGNEASRELE
:..:.. ::.. . ::. :. : . ::: .::::. :
CCDS48 RKSWERWRLEHL--HIQRD----------SSMKPLKCPTS-SLSSGATAGSSMYTATCQA
420 430 440 450 460
pF1KE9 SYC
CCDS48 SCS
>>CCDS2127.1 SCTR gene_id:6344|Hs108|chr2 (440 aa)
initn: 931 init1: 449 opt: 984 Z-score: 1152.9 bits: 222.5 E(32554): 6.8e-58
Smith-Waterman score: 984; 40.6% identity (67.2% similar) in 424 aa overlap (3-413:6-409)
10 20 30 40
pF1KE9 MTTSPILQLLLRLSL-CGLLLQRAETGSKGQTAGELYQRWERYRRECQET-------
. :. :::: . : :. ::. . : ::. . ::
CCDS21 MRPHLSPPLQQLLLPVLLACAA----HSTGALPRLCDVLQVLWEEQDQCLQELSREQTGD
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 LAAAEPPSGLACNGSFDMYVCWDYAAPNATARASCPWYLPWHHHVAAGFVLRQCGSDGQW
:.. .: : :.: .: :: ..:. ... :: .: : ..:.: .:: :
CCDS21 LGTEQPVPG--CEGMWDNISCWPSSVPGRMVEVECPRFLRMLTS-RNGSLFRNCTQDG-W
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 G--LWRDHTQCENPEKNEAFLDQRL-ILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLH
. . : . : . . :.. ..: : .:.:::::::: ::. ::.:: :: :::::
CCDS21 SETFPRPNLAC-GVNVNDSSNEKRHSYLLKLKVMYTVGYSSSLVMLLVALGILCAFRRLH
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 CTRNYIHINLFTSFMLRAAAILSRDRLLPRPGPYLGDQALALWNQALAACRTAQIVTQYC
:::::::..::.::.::: . . .: .: .... .. . :.:. .... :::
CCDS21 CTRNYIHMHLFVSFILRALSNFIKDAVL------FSSDDVTYCDAHRAGCKLVMVLFQYC
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 VGANYTWLLVEGVYLHSLLVLVGGSEEGHFRYYLLLGWGAPALFVIPWVIVRYLYENTQC
. :::.::::::.:::.::.. ::. ... .. .:::.::.:: :.:.:.. :.. :
CCDS21 IMANYSWLLVEGLYLHTLLAISFFSERKYLQGFVAFGWGSPAIFVALWAIARHFLEDVGC
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 WERNEVKAIWWIIRTPILMTILINFLIFIRILGILLSKLRTRQMRCRD--YRLRLARSTL
:. : .:::::: :....:::::..:: :: ::. ::::.. : . . :::::::
CCDS21 WDINANASIWWIIRGPVILSILINFILFINILRILMRKLRTQETRGNEVSHYKRLARSTL
290 300 310 320 330 340
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CCDS21 KKWQQWHLREFPLHPVASFSNSTKASHLEQSQGTCRTSII
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40 50 60 70 80 90
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450 460
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. :
CCDS11 GDGAEKLRKLQPSLNSGRLLHLAMRGLGELGAQPQQDHARWPRGSSLSECSEGDVTMANT
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CCDS58 LQKLRPPDIRKSDSSPYSRLARSTLLLIPLFGVHYIMFA-FFPDNFKPEV---KMVFELV
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CCDS58 TCSTQ-VSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
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CCDS26 GVLGWNPK------YRH-PSGGSNG-ATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
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CCDS56 WKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQDMGVVSRNCTEDG-WSEPFPHYFDACGFDEYESET
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CCDS56 MVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIYLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVS
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CCDS56 SLASSGVNGGTQLSILSKSSSQIRMSGLPADNLAT
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