Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9538
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9538, 328 aa
1>>>pF1KE9538 328 - 328 aa - 328 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2580+/-0.000982; mu= 16.0806+/- 0.059
mean_var=115.3145+/-41.271, 0's: 0 Z-trim(104.3): 219 B-trim: 1031 in 2/49
Lambda= 0.119435
statistics sampled from 7530 (7838) to 7530 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.241), width: 16
Scan time: 2.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3517.1 GNRHR gene_id:2798|Hs108|chr4 ( 328) 2212 392.7 2.1e-109
CCDS47064.1 GNRHR gene_id:2798|Hs108|chr4 ( 249) 1123 204.9 5.4e-53
CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX ( 371) 376 76.4 3.9e-14
CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 358 73.4 3.5e-13
CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 371) 350 72.0 8.6e-13
CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 377) 350 72.0 8.7e-13
CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 390) 350 72.0 8.9e-13
CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 ( 418) 348 71.7 1.2e-12
CCDS55539.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX ( 309) 336 69.4 4.1e-12
CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1 ( 424) 335 69.4 5.6e-12
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 334 69.2 5.9e-12
CCDS13089.1 PROKR2 gene_id:128674|Hs108|chr20 ( 384) 322 67.2 2.5e-11
CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 ( 393) 317 66.3 4.6e-11
CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4 ( 431) 313 65.7 7.9e-11
>>CCDS3517.1 GNRHR gene_id:2798|Hs108|chr4 (328 aa)
initn: 2212 init1: 2212 opt: 2212 Z-score: 2077.6 bits: 392.7 E(32554): 2.1e-109
Smith-Waterman score: 2212; 100.0% identity (100.0% similar) in 328 aa overlap (1-328:1-328)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGNLPTLTLSGKIRVTVTFFLFLLSATFNASFLLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGNLPTLTLSGKIRVTVTFFLFLLSATFNASFLLKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 QKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLIVMPLDGMWNITVQWYAGELLCKVLSYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLIVMPLDGMWNITVQWYAGELLCKVLSYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 KLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQSMVGLAWILSSVFAGPQLYIFRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQSMVGLAWILSSVFAGPQLYIFRM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 IHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIMLICNAKIIFTLTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIMLICNAKIIFTLTR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 VLHQDPHELQLNQSKNNIPRARLKTLKMTVAFATSFTVCWTPYYVLGIWYWFDPEMLNRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VLHQDPHELQLNQSKNNIPRARLKTLKMTVAFATSFTVCWTPYYVLGIWYWFDPEMLNRL
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE9 SDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL
310 320
>>CCDS47064.1 GNRHR gene_id:2798|Hs108|chr4 (249 aa)
initn: 1119 init1: 1119 opt: 1123 Z-score: 1064.9 bits: 204.9 E(32554): 5.4e-53
Smith-Waterman score: 1123; 95.7% identity (97.3% similar) in 186 aa overlap (1-185:1-186)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGNLPTLTLSGKIRVTVTFFLFLLSATFNASFLLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGNLPTLTLSGKIRVTVTFFLFLLSATFNASFLLKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 QKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLIVMPLDGMWNITVQWYAGELLCKVLSYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLIVMPLDGMWNITVQWYAGELLCKVLSYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE9 KLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQSMVGLAWILSSVFAGPQLYIFR-
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: . .
CCDS47 KLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQSMVGLAWILSSVFAGPQLPLHHP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 MIHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIMLICNAKIIFTLT
.: ::
CCDS47 SFHHADLQCKNHLHPDTGPSSGPPRTTTESVQEQYTKSTAEDSKNDGCICHFIYCLLDSL
190 200 210 220 230 240
>>CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX (371 aa)
initn: 361 init1: 152 opt: 376 Z-score: 367.3 bits: 76.4 E(32554): 3.9e-14
Smith-Waterman score: 376; 28.1% identity (60.2% similar) in 299 aa overlap (45-327:41-329)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 SAINNSIPLMQGNLPTLTLSGKIRVTVTFFLFLLSATFNASFL---LKLQKWTQKKEKGK
: ::: .: : : : : ... ..:.
CCDS14 PGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLAALARRGRRGH
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 KLSRMKLLLKHLTLANLLETLI-VMPLDGMWNITVQWYAGELLCKVLSYLKLFSMYAPAF
. ..... :: ::.: .:. :.: . :. : .. . . ::....::.. .::: ..
CCDS14 -WAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLP-QLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQMVGMYASSY
80 90 100 110 120
140 150 160 170 180
pF1KE9 MMVVISLDRSLAITRP-LALKSNSKVGQSM-VGLAWILSSVFAGPQLYIFRMIHLADSSG
:.....::: :: :: :: . .: . . : .:: .: ... :::.:: . .. .::
CCDS14 MILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQRNVEGGSG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 QTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIMLICNAKIIFTLTRVLHQDPHE
: .. : :.. : . : . .:. : . . :.. :. . : : :
CCDS14 VTDCWA-C-----FAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASLVPGPSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE9 LQLNQSKN----------NIPRARLKTLKMTVAFATSFTVCWTPYYVLGIWYWFDPEMLN
.. .. .. : ::..::..... ...::.:.... .: .:::
CCDS14 RPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEAPL
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE9 RLSDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL
. . : ...:.: :: : .: ::. ::
CCDS14 EGAPFV--LLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRSLLCCARGRTPPSLGPQDESCTT
310 320 330 340 350 360
>>CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX (399 aa)
initn: 197 init1: 126 opt: 358 Z-score: 350.2 bits: 73.4 E(32554): 3.5e-13
Smith-Waterman score: 358; 27.1% identity (60.2% similar) in 269 aa overlap (69-327:74-334)
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 VTVTFFLFLLSATFNASFLLKLQKWTQKKEKGKKLSRM-KLLLKHLTLANLLETLIVMPL
: :... . .... :....:: : .:.
CCDS14 IEALCAIYITYAVIISVGILGNAILIKVFFKTKSMQTVPNIFITSLAFGDLLLLLTCVPV
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 DGMWNITVQWYAGELLCKVLSYLKLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQ
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CCDS14 DATHYLAEGWLFGRIGCKVLSFIRLTSVGVSVFTLTILSADRYKAVVKPLERQPSNAILK
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 SMV--GLAWILSSVFAGPQLYIFRMIHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFT
. : : .::.: .:: :. :: .. . ... .: .:... :. : .....
CCDS14 TCVKAGCVWIVSMIFALPEA-IFSNVYTFRDPNKNMTFESCTSY-PVSKKLLQEIHSLLC
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 FSCLFIIPLFIMLICNAKIIFTLTRVLHQDPHELQLNQSKNNIPRARL-KTLKMTVAFAT
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CCDS14 FLVFYIIPLSIISVYYSLIARTLYKSTLNIPTEEQSHARKQIESRKRIARTVLVLVAL--
230 240 250 260 270
280 290 300 310 320
pF1KE9 SFTVCWTPYYVLGIWYWFDPEMLNRLSDP-VNHFFF-----LFAFLNPCFDPLIYGYFSL
:..:: : ..: ... : . :: . ::.: ..:: : : .:. ..:
CCDS14 -FALCWLPNHLLYLYHSFTSQ---TYVDPSAMHFIFTIFSRVLAFSNSCVNPFALYWLSK
280 290 300 310 320 330
CCDS14 SFQKHFKAQLFCCKAERPEPPVADTSLTTLAVMGTVPGTGSIQMSEISVTSFTGCSVKQA
340 350 360 370 380 390
>>CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (371 aa)
initn: 288 init1: 288 opt: 350 Z-score: 343.1 bits: 72.0 E(32554): 8.6e-13
Smith-Waterman score: 350; 24.9% identity (59.4% similar) in 325 aa overlap (14-327:26-334)
10 20 30 40
pF1KE9 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGN-LPTLTLSGKIRVTVTFFLFL
:. . ...:. .. : : . .:.....
CCDS54 MPANFTEGSFDSSGTGQTLDSSPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 LSATFNASFLLKLQKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLIVMPLDGMWNITVQW
. . . : .: .. : .::. ::: ... .:.... . :. . : : .: ..
CCDS54 VFTIVGNSVVL-FSTWRRKKK-----SRMTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDF
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 YAGELLCKVLSYLKLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQSMVGLAWILS
: .:.:.:. ::.. .:: ....: .:.:: ::. :. . .. : .. .. .:: ::
CCDS54 TAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYVLVSLSIDRYHAIVYPMKFLQGEKQARVLIVIAWSLS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 SVFAGPQLYIFRMIHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIM
.:. : : :: : :.:.. :: . ...: .... .: ...::: :.
CCDS54 FLFSIPTLIIFGKRTL--SNGEV----QCWALWPDDSYW-TPYMTIVAF-LVYFIPLTII
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE9 LICNAKIIFTL--------TRVLHQDPHELQLNQSKNNIPRARLKTLKMTVAFATSFTVC
: . .: :. : . . . .: . ... : .:..:..:... . .: :
CCDS54 SIMYGIVIRTIWIKSKTYETVISNCSDGKLCSSYNRGLISKAKIKAIKYSIIIILAFICC
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KE9 WTPYYVLGIWYWFD--PEMLNRLSDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL
:.::... : :. :. .:. : .. . :: ..:::: ::
CCDS54 WSPYFLFDILDNFNLLPDTQERFYASV--IIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCREQ
290 300 310 320 330 340
CCDS54 RSQDSRMTFRERTERHEMQILSKPEFI
350 360 370
>>CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (377 aa)
initn: 288 init1: 288 opt: 350 Z-score: 343.0 bits: 72.0 E(32554): 8.7e-13
Smith-Waterman score: 350; 24.9% identity (59.4% similar) in 325 aa overlap (14-327:26-334)
10 20 30 40
pF1KE9 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGN-LPTLTLSGKIRVTVTFFLFL
:. . ...:. .. : : . .:.....
CCDS54 MPANFTEGSFDSSGTGQTLDSSPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 LSATFNASFLLKLQKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLIVMPLDGMWNITVQW
. . . : .: .. : .::. ::: ... .:.... . :. . : : .: ..
CCDS54 VFTIVGNSVVL-FSTWRRKKK-----SRMTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDF
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110 120 130 140 150 160
pF1KE9 YAGELLCKVLSYLKLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQSMVGLAWILS
: .:.:.:. ::.. .:: ....: .:.:: ::. :. . .. : .. .. .:: ::
CCDS54 TAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYVLVSLSIDRYHAIVYPMKFLQGEKQARVLIVIAWSLS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 SVFAGPQLYIFRMIHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIM
.:. : : :: : :.:.. :: . ...: .... .: ...::: :.
CCDS54 FLFSIPTLIIFGKRTL--SNGEV----QCWALWPDDSYW-TPYMTIVAF-LVYFIPLTII
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE9 LICNAKIIFTL--------TRVLHQDPHELQLNQSKNNIPRARLKTLKMTVAFATSFTVC
: . .: :. : . . . .: . ... : .:..:..:... . .: :
CCDS54 SIMYGIVIRTIWIKSKTYETVISNCSDGKLCSSYNRGLISKAKIKAIKYSIIIILAFICC
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KE9 WTPYYVLGIWYWFD--PEMLNRLSDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL
:.::... : :. :. .:. : .. . :: ..:::: ::
CCDS54 WSPYFLFDILDNFNLLPDTQERFYASV--IIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCRVI
290 300 310 320 330 340
CCDS54 RLRQLQEAALMLCPQRENWKGTWPGVPSWALPR
350 360 370
>>CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (390 aa)
initn: 288 init1: 288 opt: 350 Z-score: 342.8 bits: 72.0 E(32554): 8.9e-13
Smith-Waterman score: 350; 24.9% identity (59.4% similar) in 325 aa overlap (14-327:26-334)
10 20 30 40
pF1KE9 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGN-LPTLTLSGKIRVTVTFFLFL
:. . ...:. .. : : . .:.....
CCDS75 MPANFTEGSFDSSGTGQTLDSSPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE9 LSATFNASFLLKLQKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLIVMPLDGMWNITVQW
. . . : .: .. : .::. ::: ... .:.... . :. . : : .: ..
CCDS75 VFTIVGNSVVL-FSTWRRKKK-----SRMTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDF
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110 120 130 140 150 160
pF1KE9 YAGELLCKVLSYLKLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQSMVGLAWILS
: .:.:.:. ::.. .:: ....: .:.:: ::. :. . .. : .. .. .:: ::
CCDS75 TAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYVLVSLSIDRYHAIVYPMKFLQGEKQARVLIVIAWSLS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 SVFAGPQLYIFRMIHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIM
.:. : : :: : :.:.. :: . ...: .... .: ...::: :.
CCDS75 FLFSIPTLIIFGKRTL--SNGEV----QCWALWPDDSYW-TPYMTIVAF-LVYFIPLTII
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE9 LICNAKIIFTL--------TRVLHQDPHELQLNQSKNNIPRARLKTLKMTVAFATSFTVC
: . .: :. : . . . .: . ... : .:..:..:... . .: :
CCDS75 SIMYGIVIRTIWIKSKTYETVISNCSDGKLCSSYNRGLISKAKIKAIKYSIIIILAFICC
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KE9 WTPYYVLGIWYWFD--PEMLNRLSDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL
:.::... : :. :. .:. : .. . :: ..:::: ::
CCDS75 WSPYFLFDILDNFNLLPDTQERFYASV--IIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCRAN
290 300 310 320 330 340
CCDS75 SSVYLLACDVSVLWALVLTSEKESCESWRRKGAKITGFQNDVPGEN
350 360 370 380 390
>>CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 (418 aa)
initn: 453 init1: 207 opt: 348 Z-score: 340.6 bits: 71.7 E(32554): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 483; 29.0% identity (61.9% similar) in 331 aa overlap (23-327:35-352)
10 20 30 40
pF1KE9 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGNLPTLTLSG----KIRVTVTFFLFLL
: .:: : . . :....: : .
CCDS89 AGPDAGPSGNSSPWWPLATGAGNTSREAEALGEGNGPPRDVRNEELAKLEIAVLAVTFAV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 SATFNASFLLKLQKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLI-VMPLDGMWNITVQW
.. :.: :: :.. .: :::.:...::.::.: ... :.: . :.:: ..
CCDS89 AVLGNSSVLLALHR------TPRKTSRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLP-QMCWDITYRF
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 YAGELLCKVLSYLKLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPL-ALKSNSKVGQSMVGLAWIL
. . ::.:...:..:.:.: :.:.::.. :: .:. .:: .:.. .. .. :.. ::.:
CCDS89 RGPDWLCRVVKHLQVFGMFASAYMLVVMTADRYIAVCHPLKTLQQPARRSRLMIAAAWVL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 SSVFAGPQLYIFRMIHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFI
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