Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9529
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9529, 353 aa
1>>>pF1KE9529 353 - 353 aa - 353 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3084+/-0.000947; mu= 15.4382+/- 0.056
mean_var=92.5596+/-25.356, 0's: 0 Z-trim(105.0): 281 B-trim: 1125 in 2/48
Lambda= 0.133310
statistics sampled from 7803 (8171) to 7803 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 2.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 2383 469.1 2.5e-132
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 760 157.0 2.4e-38
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 645 134.9 1e-31
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 645 134.9 1.1e-31
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 645 134.9 1.1e-31
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 588 123.9 2.1e-28
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 534 113.5 2.8e-25
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 532 113.1 3.6e-25
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 515 109.8 3.5e-24
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 507 108.3 1e-23
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 502 107.4 2.1e-23
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CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 482 103.5 2.9e-22
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 482 103.5 3e-22
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 480 103.1 3.7e-22
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 480 103.1 3.8e-22
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 480 103.1 3.9e-22
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 478 102.7 5e-22
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 478 102.8 5.4e-22
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 477 102.6 5.9e-22
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 471 101.4 1.2e-21
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 468 100.8 2e-21
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 466 100.4 2.4e-21
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 460 99.3 5.4e-21
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 460 99.3 5.5e-21
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 459 99.1 6.4e-21
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 458 98.9 7e-21
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 456 98.5 9.6e-21
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 455 98.3 1.1e-20
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 453 98.0 1.4e-20
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 453 98.0 1.5e-20
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 453 98.0 1.5e-20
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 453 98.0 1.5e-20
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 453 98.0 1.5e-20
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 453 98.0 1.5e-20
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 453 98.0 1.5e-20
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CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 453 98.1 1.7e-20
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 447 96.8 3e-20
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 445 96.4 4e-20
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 439 95.2 9.1e-20
CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 ( 404) 439 95.3 9.6e-20
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 437 94.9 1.2e-19
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 437 94.9 1.3e-19
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 433 94.1 2e-19
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 433 94.1 2e-19
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 432 93.8 2.1e-19
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 432 93.9 2.2e-19
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 430 93.5 3e-19
>>CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 (353 aa)
initn: 2383 init1: 2383 opt: 2383 Z-score: 2489.3 bits: 469.1 E(32554): 2.5e-132
Smith-Waterman score: 2383; 100.0% identity (100.0% similar) in 353 aa overlap (1-353:1-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAWDLLHRVLPTFIISICFFGLLGNLFVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAWDLLHRVLPTFIISICFFGLLGNLFVLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVINGVIKAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 VFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVINGVIKAN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFLLRSIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFLLRSIQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VPDLNITACILLLPHEAWHFARIVELNILGFLLPLAAIVFFNYHILASLRTREEVSRTRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 VPDLNITACILLLPHEAWHFARIVELNILGFLLPLAAIVFFNYHILASLRTREEVSRTRC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 GGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWEDFIDLGLQLANFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 GGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWEDFIDLGLQLANFF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE9 AFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLFWRN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 AFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLFWRN
310 320 330 340 350
>>CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 (391 aa)
initn: 702 init1: 567 opt: 760 Z-score: 801.8 bits: 157.0 E(32554): 2.4e-38
Smith-Waterman score: 760; 37.7% identity (69.0% similar) in 326 aa overlap (10-333:33-353)
10 20 30
pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAWDLLHRV
::. . . : : . : .. : :. .
CCDS99 SPWKISMFLSVREDSVPTTASFSADMLNVTLQGPTLNGTFAQ--SKCPQV-EWLGWLNTI
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 LPTFIISICFFGLLGNLFVLLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWN
: :. . .. : :.::: :: : . . .::::::.::::.::... :::::: .: :
CCDS99 QPPFLWVLFVLATLENIFVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 QFNWPFGALLCRVINGVIKANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCV
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CCDS99 NFDWLFGETLCRVVNAIISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRMRGVRWAKLYSL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 LIWVVGGLLSIPTFLLRSIQAVPDL--NITACILLLPHEAWHFARIVELNILGFLLPLAA
.:: ::: : ...:... : :.:::.. : :. . ::..::::::..
CCDS99 VIWGCTLLLSSPMLVFRTMKEYSDEGHNVTACVISYPSLIWEVFTNMLLNVVGFLLPLSV
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 IVFFNYHILASLRTREEVSRTRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQ
:.: ...:. ::. .:... . . . ..:.:.:.... :..:: :... .::. : .
CCDS99 ITFCTMQIMQVLRN-NEMQKFKEI-QTERRATVLVLVVLLLFIICWLPFQISTFLDTLHR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 VQAVRGCFWEDFIDLGLQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAP
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CCDS99 LGILSSCQDERIIDVITQIASFMAYSNSCLNPLVYVIVGKRFRKKSWEVYQGVCQKGGCR
300 310 320 330 340 350
340 350
pF1KE9 ISSSHRKEIFQLFWRN
CCDS99 SEPIQMENSMGTLRTSISVERQIHKLQDWAGSRQ
360 370 380 390
>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa)
initn: 453 init1: 414 opt: 645 Z-score: 682.7 bits: 134.9 E(32554): 1e-31
Smith-Waterman score: 645; 32.8% identity (65.0% similar) in 314 aa overlap (27-334:16-324)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAW--DLLHRVLPTFIISICFFGLLGNLFV
:. :.: . . ..::. : :..:: .:
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 LLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVINGVIK
..:. . . .:: ..: ::: .:: :.: ::.:: .. :::: ::.. .. ..
CCDS31 VIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 ANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFLLRSI
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CCDS31 FNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 QAVPDLNITACILLLPHEAWHFARIVEL----NILGFLLPLAAIVFFNYHILASLRTREE
. . :::.: . .:. . . . : ::::::.:. :. : .:. :
CCDS31 FFIENTNITVCAF--HYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 VSRTRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWEDFIDLGL
..... :.:. .:...:. :. : :...:.::. :.:. .: : :..: ..
CCDS31 IQKNK--PRNDD-IFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAM
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 QLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLFWRN
.. .:. :. :::..: :.:. :. .: : ::.
CCDS31 PITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDN
290 300 310 320 330 340
CCDS31 VSSSTKKPAPCFEVE
350
>>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (388 aa)
initn: 453 init1: 414 opt: 645 Z-score: 682.3 bits: 134.9 E(32554): 1.1e-31
Smith-Waterman score: 645; 32.8% identity (65.0% similar) in 314 aa overlap (27-334:45-353)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAW--DLLHRVLPTFIISICFFGLLG
:. :.: . . ..::. : :..:
CCDS82 VFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFG
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 NLFVLLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVIN
: .:..:. . . .:: ..: ::: .:: :.: ::.:: .. :::: ::.. .
CCDS82 NSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIAS
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 GVIKANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFL
. .. ::. :.::.. .: ::: ..:::: :: .. :.:::..::...:: :.:...
CCDS82 ASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAII
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 LRSIQAVPDLNITACILLLPHEAWHFARIVEL----NILGFLLPLAAIVFFNYHILASLR
:.. . . :::.: . .:. . . . : ::::::.:. :. : .:.
CCDS82 HRNVFFIENTNITVCAF--HYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALK
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 TREEVSRTRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWEDFI
:..... :.:. .:...:. :. : :...:.::. :.:. .: : :..
CCDS82 KAYEIQKNK--PRNDD-IFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIV
260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 DLGLQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLF
: .. .. .:. :. :::..: :.:. :. .: : ::.
CCDS82 DTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYR
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 WRN
CCDS82 PSDNVSSSTKKPAPCFEVE
370 380
>>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (394 aa)
initn: 453 init1: 414 opt: 645 Z-score: 682.2 bits: 134.9 E(32554): 1.1e-31
Smith-Waterman score: 645; 32.8% identity (65.0% similar) in 314 aa overlap (27-334:51-359)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAW--DLLHRVLPTFIISICFFGLLG
:. :.: . . ..::. : :..:
CCDS82 VFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFG
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 NLFVLLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVIN
: .:..:. . . .:: ..: ::: .:: :.: ::.:: .. :::: ::.. .
CCDS82 NSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIAS
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 GVIKANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFL
. .. ::. :.::.. .: ::: ..:::: :: .. :.:::..::...:: :.:...
CCDS82 ASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAII
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 LRSIQAVPDLNITACILLLPHEAWHFARIVEL----NILGFLLPLAAIVFFNYHILASLR
:.. . . :::.: . .:. . . . : ::::::.:. :. : .:.
CCDS82 HRNVFFIENTNITVCAF--HYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALK
210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 TREEVSRTRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWEDFI
:..... :.:. .:...:. :. : :...:.::. :.:. .: : :..
CCDS82 KAYEIQKNK--PRNDD-IFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIV
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 DLGLQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLF
: .. .. .:. :. :::..: :.:. :. .: : ::.
CCDS82 DTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYR
320 330 340 350 360 370
pF1KE9 WRN
CCDS82 PSDNVSSSTKKPAPCFEVE
380 390
>>CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX (363 aa)
initn: 542 init1: 274 opt: 588 Z-score: 623.4 bits: 123.9 E(32554): 2.1e-28
Smith-Waterman score: 588; 30.9% identity (63.0% similar) in 311 aa overlap (21-328:30-334)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAWDLLHRVLPTFIISICFFG
... :.. : : ..: . : .:
CCDS14 MKGNSTLATTSKNITSGLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPS--DKHLDAIPILYYIIFVIG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 LLGNLFVLLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCR
.: :. :. .: . .:. ::. :::..::... ::.:: ...: :: ..:.
CCDS14 FLVNIVVVTLFCCQKGPKKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 VINGVIKANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIP
:... . :.: :::... .: :::. ...:. :.:.. :: :.: .. : :.:
CCDS14 VFGSFLTLNMFASIFFITCMSVDRYQSVIYPFLSQRRNPW-QASYIVPLVWCMACLSSLP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE9 TFLLRSIQAVPDLNITACILLLPHEA---WHFARIVELNILGFLLPLAAIVFFNYHILAS
:: .:..... :...:::. .: : : . . :::::..:: :. . :
CCDS14 TFYFRDVRTIEYLGVNACIMAFPPEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGIRKH
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 LRTREEVSRTRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWED
: . ...: .: .. . ..:.::..:: :.: ..::. : . .. .:
CCDS14 LLKTNSYGKNRI--TRD-QVLKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 FIDLGLQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQ
:::.: .: ...:::: .:: .: ::: :. :. ...
CCDS14 VIDLALPFAILLGFTNSCVNPFLYCFVGNRFQQKLRSVFRVPITWLQGKRESMSCRKSSS
300 310 320 330 340 350
350
pF1KE9 LFWRN
CCDS14 LREMETFVS
360
>>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 478 init1: 170 opt: 534 Z-score: 567.4 bits: 113.5 E(32554): 2.8e-25
Smith-Waterman score: 541; 30.2% identity (65.1% similar) in 315 aa overlap (22-329:20-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAWDLLHRVLPTFIISICFFGLLGNLFVLL
.:: :... : . ..:: . . .::.::..:.:
CCDS27 METPNTTEDYDTTTEFDYGDATPCQKVNER-AFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGNILVVL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVINGVIKAN
:.. .: :.. ::: ::: :::.:.. :::: . .. .: :: .:....: ..
CCDS27 VLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKD-DWVFGDAMCKILSGFYYTG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFLLRSIQA
:. ::... .. ::: ..:: . . : . . .: ..::... : :.: . . . :
CCDS27 LYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFSKTQW
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE9 VPDLNITACILLLPHEA---WHFARIVELNILGFLLPLAAIVFFNYHILASLRTREEVSR
... .: : .:::. :.. . ..::..:..::: .... :. : : .
CCDS27 --EFTHHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPN---
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 TRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFF----AFLEFLFQVQAVRGCFWEDFIDLG
.: ::.. ::..... :.. :.::.. .: .::: .. : .::.
CCDS27 -----EKKSKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLF----THECEQSRHLDLA
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 LQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLFWRN
.:... .:.:. .:::::.:::. :: . .:...
CCDS27 VQVTEVIAYTHCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSST
290 300 310 320 330 340
CCDS27 SPSTGEHELSAGF
350
>>CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 (355 aa)
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Smith-Waterman score: 532; 29.1% identity (66.9% similar) in 296 aa overlap (39-331:37-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 ELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAWDLLHRVLPTFIISICFFGLLGNLFVLLVFLLPRRQ
.: .: . :.:::: .:.::... ..
CCDS26 LSVTTVTDYYYPDIFSSPCDAELIQTNGKLLLAVFYCLLFVFSLLGNSLVILVLVVCKKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVINGVIKANLFISIFLV
.....:: ::: :::.::...:: . . .: : ::...:.:..: ... :.:..
CCDS26 RSITDVYLLNLALSDLLFVFSFPFQTYYLLDQ--WVFGTVMCKVVSGFYYIGFYSSMFFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFLLRSIQAVPDLNITA
. .: ::: ..:: . . . . :.. . :. .:... . .:: :: :.. . ..
CCDS26 TLMSVDRYLAVVHAVYALKVRTIRMGTTLCLAVWLTAIMATIP--LLVFYQVASEDGVLQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 CILLLPHEA--WHFARIVELNILGFLLPLAAIVFFNYHILASLRTREEVSRTRCGGRKDS
: . ... :.. ..::::.:.:.. ..: .:: .:. :: ... .
CCDS26 CYSFYNQQTLKWKIFTNFKMNILGLLIPFTIFMFCYIKILHQLK--------RCQNHNKT
190 200 210 220 230
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pF1KE9 KTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWEDFIDLGLQLANFFAFTNSS
:. :.: .:.: :. :.:.. :: : ... . :: . . . .......::.
CCDS26 KAIRLVLIVVIASLLFWVPFNVVLFLTSLHSMHILDGCSISQQLTYATHVTEIISFTHCC
240 250 260 270 280 290
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pF1KE9 LNPVIYVFVGRLFRTKVWELY-KQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLFWRN
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CCDS26 VNPVIYAFVGEKFKKHLSEIFQKSCSQIFNYLGRQMPRESCEKSSSCQQHSSRSSSVDYI
300 310 320 330 340 350
>>CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 (352 aa)
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:.:: . . .::..::..:.:... .:
CCDS27 MDYQVSSPIYDINYYTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFIFGFVGNMLVILILINCKR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 QLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVINGVIKANLFISIFL
....::: ::: ::: :.: .::::. : : :: .:....:. ..: .::.
CCDS27 LKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQ--WDFGNTMCQLLTGLYFIGFFSGIFF
70 80 90 100 110
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pF1KE9 VVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFLLRSIQAVPDLNIT
.. .. ::: ..:: . . . . . :: :. :::. . :.: ... : :. :
CCDS27 IILLTIDRYLAVVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWVVAVFASLPGIIFTRSQK-EGLHYT
120 130 140 150 160 170
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pF1KE9 ACILLLPHEAWHFAR---IVELNILGFLLPLAAIVFFNYHILASL-RTREEVSRTRCGGR
: .:. ..: . ... :::..::: ..:. :: .: : :.: .: :
CCDS27 -CSSHFPYSQYQFWKNFQTLKIVILGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHR----
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 KDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWEDFIDLGLQLANFFAFT
.. ::.:....... ::::.. .:. . . .. .: . .: ..:... ...:
CCDS27 ----AVRLIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQEFFGLNNCSSSNRLDQAMQVTETLGMT
240 250 260 270 280
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pF1KE9 NSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLFWRN
. .::.::.:::. ::. . .... : . : ..:
CCDS27 HCCINPIIYAFVGEKFRNYLLVFFQKHIAKRFCKCCSIFQQEAPERASSVYTRSTGEQEI
290 300 310 320 330 340
CCDS27 SVGL
350
>>CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 (369 aa)
initn: 234 init1: 199 opt: 507 Z-score: 539.1 bits: 108.3 E(32554): 1e-23
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10 20 30 40 50
pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAW-DLLHRVLPTFI-ISICFFGLLG
.: .: : . :: .. ::: . .:..:: :
CCDS11 MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTFIYFVVCIIGLCG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 NLFVLLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVIN
: .:. :.: .. ....::. ::: .: .:.::::: : .. .:::: .:::.
CCDS11 NTLVIYVILRYAKMKTITNIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQV-ALVHWPFGKAICRVVM
70 80 90 100 110
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pF1KE9 GVIKANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFL
: : : ::: ....: ::: ..:::. : . .: : :.. . .: :. :. .: ..
CCDS11 TVDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLVILPIMI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 LRSIQAVPDLNITACILLLPHE--AWHFARIVELNILGFLLPLAAIVFFNYHILASLRTR
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CCDS11 YAGLRS-NQWGRSSCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFIIIKVKS-
180 190 200 210 220 230
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pF1KE9 EEVSRTRCGG--RKDS--KTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQ---AVRGCF
: : :. :: : :.: .. .:..:. :: :...: . .. :..: :
CCDS11 ---SGIRVGSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALKGMF
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 WEDFIDLGLQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKE
::. . ....:: ::..:.:.. :.
CCDS11 --DFVVV-------LTYANSCANPILYAFLSDNFKKSFQNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQ
300 310 320 330 340
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pF1KE9 IFQLFWRN
CCDS11 DKSRLNETTETQRTLLNGDLQTSI
350 360
353 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 23:55:44 2016 done: Sun Nov 6 23:55:45 2016
Total Scan time: 2.640 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]