Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9515
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9515, 370 aa
1>>>pF1KE9515 370 - 370 aa - 370 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1530+/-0.000879; mu= 12.0445+/- 0.052
mean_var=139.1891+/-43.646, 0's: 0 Z-trim(108.7): 343 B-trim: 1285 in 2/49
Lambda= 0.108711
statistics sampled from 9712 (10354) to 9712 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.318), width: 16
Scan time: 2.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 2464 398.4 5.2e-111
CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 695 121.0 1.8e-27
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 653 114.4 1.8e-25
CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 ( 375) 634 111.4 1.3e-24
CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10 ( 375) 628 110.5 2.5e-24
CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 ( 384) 565 100.6 2.4e-21
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 562 100.1 3.2e-21
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 560 99.9 4.8e-21
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 549 98.1 1.4e-20
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 543 97.1 2.7e-20
CCDS46345.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 311) 535 95.8 5.5e-20
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 520 93.5 3.2e-19
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 508 91.6 1.2e-18
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 501 90.6 2.6e-18
CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6 ( 390) 500 90.4 2.9e-18
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 500 90.4 3e-18
CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 ( 393) 498 90.1 3.6e-18
CCDS13089.1 PROKR2 gene_id:128674|Hs108|chr20 ( 384) 496 89.8 4.4e-18
CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 496 89.8 4.5e-18
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 489 88.7 9.4e-18
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 477 86.8 3.5e-17
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 460 84.1 2.2e-16
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 458 83.8 2.8e-16
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 458 83.8 2.8e-16
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 458 83.8 2.8e-16
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 458 83.8 2.8e-16
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 458 83.8 2.8e-16
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 458 83.8 2.8e-16
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 458 83.8 2.9e-16
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 458 83.8 2.9e-16
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 458 83.9 3e-16
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 458 83.9 3.2e-16
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 451 82.7 5.7e-16
CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 446 81.9 1e-15
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 444 81.5 1.1e-15
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 438 80.7 2.4e-15
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 436 80.3 2.9e-15
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 436 80.4 3e-15
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 436 80.4 3.1e-15
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 432 79.7 4.5e-15
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 430 79.4 5.7e-15
CCDS8290.1 MTNR1B gene_id:4544|Hs108|chr11 ( 362) 429 79.2 6.2e-15
CCDS3848.1 MTNR1A gene_id:4543|Hs108|chr4 ( 350) 428 79.1 6.7e-15
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 429 79.3 7.1e-15
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 ( 425) 427 79.0 8.5e-15
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 421 78.0 1.5e-14
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 419 77.6 1.7e-14
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 366) 407 75.8 6.8e-14
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 407 75.8 6.9e-14
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 397 74.2 2e-13
>>CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 (370 aa)
initn: 2464 init1: 2464 opt: 2464 Z-score: 2106.4 bits: 398.4 E(32554): 5.2e-111
Smith-Waterman score: 2464; 99.7% identity (100.0% similar) in 370 aa overlap (1-370:1-370)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MASSTTRGPRVSDLFSGLPPAVTTPANQSAEASAGNGSVAGADAPAVTPFQSLQLVHQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MASSTTRGPRVSDLFSGLPPAVTTPANQSAEASAGNGSVAGADAPAVTPFQSLQLVHQLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 GLIVLLYSVVVVVGLVGNCLLVLVIARVRRLHNVTNFLIGNLALSDVLMCTACVPLTLAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GLIVLLYSVVVVVGLVGNCLLVLVIARVRRLHNVTNFLIGNLALSDVLMCTACVPLTLAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 AFEPRGWVFGGGLCHLVFFLQPVTVYVSVFTLTTIAVDRYVVLVHPLRRRISLRLSAYAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AFEPRGWVFGGGLCHLVFFLQPVTVYVSVFTLTTIAVDRYVVLVHPLRRRISLRLSAYAV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LAIWALSAVLALPAAVHTYHVELKPHDVRLCEEFWGSQERQRQLYAWGLLLVTYLLPLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LAIWALSAVLALPAAVHTYHVELKPHDVRLCEEFWGSQERQRQLYAWGLLLVTYLLPLLV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 ILLSYVRVSVKLRNRVVPGCVTQSQADWDRARRRRTFCLLVVVVVVFAVCWLPLHVFNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS76 ILLSYVRVSVKLRNRVVPGCVTQSQADWDRARRRRTFCLLVVIVVVFAVCWLPLHVFNLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 RDLDPHAIDPYAFGLVQLLCHWLAMSSACYNPFIYAWLHDSFREELRKLLVAWPRKIAPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RDLDPHAIDPYAFGLVQLLCHWLAMSSACYNPFIYAWLHDSFREELRKLLVAWPRKIAPH
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE9 GQNMTVSVVI
::::::::::
CCDS76 GQNMTVSVVI
370
>>CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 (381 aa)
initn: 665 init1: 227 opt: 695 Z-score: 606.8 bits: 121.0 E(32554): 1.8e-27
Smith-Waterman score: 695; 35.9% identity (68.4% similar) in 329 aa overlap (41-362:30-352)
20 30 40 50 60
pF1KE9 VSDLFSGLPPAVTTPANQSAEASAGNGSVAGADAPAVTP--FQSLQLVHQLKGLIVLLYS
: .: : ..: .:. ... ...: :
CCDS37 MGPIGAEADENQTVEEMKVEQYGPQTTPRGELVPDPEPELIDSTKLI-EVQVVLILAYC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VVVVVGLVGNCLLVLVIARVRRLHNVTNFLIGNLALSDVLMCTACVPLTLAYAFEPRGWV
....:..:: :.. :. . . ...::::.:.:::..:.:. : :.:.::.:.. . :
CCDS37 SIILLGVIGNSLVIHVVIKFKSMRTVTNFFIANLAVADLLVNTLCLPFTLTYTLMGE-WK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 FGGGLCHLVFFLQPVTVYVSVFTLTTIAVDRYVVLVHPLRRRISLRLSAYAVLAIWALSA
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CCDS37 MGPVLCHLVPYAQGLAVQVSTITLTVIALDRHRCIVYHLESKISKRISFLIIGLAWGISA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VLALPAAVHTYH--VELKPH-DVRLCEEFWGSQERQ--RQLYAWGLLLVTYLLPLLVILL
.:: : :. . .:. : .. : : : ..:.. .:. . ::. :.::: .: .
CCDS37 LLASPLAIFREYSLIEIIPDFEIVACTEKWPGEEKSIYGTVYSLSSLLILYVLPLGIISF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 SYVRVSVKLRNRVVPGCVTQSQADWDRARRRRTFCLLVVVVVVFAVCWLPLHVFNLLRDL
::.:. ::.:.: :: .. : . ::..: .:: ::::::: :::::.:.: :.
CCDS37 SYTRIWSKLKNHVSPGAAN----DHYHQRRQKTTKMLVCVVVVFAVSWLPLHAFQLAVDI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 DPHAIDPYAFGLVQLLCHWLAMSSACYNPFIYAWLHDSFREELRKLLVAWPRKIAPHGQN
: ...: . :. . : .:: :. ::..:.:.....:. . . . : : :..
CCDS37 DSQVLDLKEYKLIFTVFHIIAMCSTFANPLLYGWMNSNYRKAFLSAFRCEQRLDAIHSEV
300 310 320 330 340 350
370
pF1KE9 MTVSVVI
CCDS37 SVTFKAKKNLEVRKNSGPNDSFTEATNV
360 370 380
>>CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 (423 aa)
initn: 439 init1: 303 opt: 653 Z-score: 570.7 bits: 114.4 E(32554): 1.8e-25
Smith-Waterman score: 653; 36.9% identity (67.3% similar) in 306 aa overlap (59-360:70-370)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 SAEASAGNGSVAGADAPAVTPFQSLQLVHQLKGLIVLLYSVVVVVGLVGNCLLVLVIARV
.:.:... :: ..: .: :: :. :: .
CCDS82 HFFSWNNYTFSDWQNFVGRRRYGAESQNPTVKALLIVAYSFIIVFSLFGNVLVCHVIFKN
40 50 60 70 80 90
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 RRLHNVTNFLIGNLALSDVLMCTACVPLTLAYAFEPRGWVFGGGLCHLVFFLQPVTVYVS
.:.:..:...: :::..:... .:.::. : :.:: :.::. : : ...::
CCDS82 QRMHSATSLFIVNLAVADIMITLLNTPFTLVR-FVNSTWIFGKGMCHVSRFAQYCSLHVS
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 VFTLTTIAVDRYVVLVHPLRRRISLRLSAYAVLAIWALSAVLALPAAVHTYHVELKPHD-
..:::.:::::. :..:::. :::. .. . .::.... ..:: :. .: .
CCDS82 ALTLTAIAVDRHQVIMHPLKPRISITKGVIYIAVIWTMATFFSLPHAICQKLFTFKYSED
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 -VR-LC-EEFWGSQERQRQLYAWGLLLVTYLLPLLVILLSYVRVSVKLRNRVVPGCVTQS
:: :: .: . . . ... :.::::.: ..:.::. :: . : ::
CCDS82 IVRSLCLPDFPEPADLFWKYLDLATFILLYILPLLIISVAYARVAKKLWLCNMIGDVTTE
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 QADWDRARRRRTFCLLVVVVVVFAVCWLPLHVFNLLRDLDPHAIDPYAFGLVQLLCHWLA
: : ....:. .:..:::.::.::.::. . :: :. ..: . . . . ::.:
CCDS82 QYFALRRKKKKTIKMLMLVVVLFALCWFPLNCYVLL--LSSKVI--RTNNALYFAFHWFA
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370
pF1KE9 MSSACYNPFIYAWLHDSFREELRKLLVAWPRKIAPHGQNMTVSVVI
:::.::::::: ::...:: ::. :: : :.
CCDS82 MSSTCYNPFIYCWLNENFRIELKALLSMCQRPPKPQEDRPPSPVPSFRVAWTEKNDGQRA
340 350 360 370 380 390
CCDS82 PLANNLLPTSQLQSGKTDLSSVEPIVTMS
400 410 420
>>CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 (375 aa)
initn: 628 init1: 250 opt: 634 Z-score: 555.2 bits: 111.4 E(32554): 1.3e-24
Smith-Waterman score: 634; 38.2% identity (66.1% similar) in 322 aa overlap (62-369:43-357)
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 ASAGNGSVAGADAPAVTPFQSLQLVHQLKGLIVLLYSVVVVVGLVGNCLLVLVIARVRRL
.:: ::. .:::..:: :. : .: ..
CCDS81 KSPQGENRSKPLGTPYNFSEHCQDSVDVMVFIVTSYSIETVVGVLGNLCLMCVTVRQKEK
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 HNVTNFLIGNLALSDVLMCTACVPLTLAYAFEPRGWVFGGGLCHLVFFLQPVTVYVSVFT
::::.::.:::.:: ::: : ::: .:.. :.:: ::.. :.: ..: ::...
CCDS81 ANVTNLLIANLAFSDFLMCLLCQPLTAVYTIMDY-WIFGETLCKMSAFIQCMSVTVSILS
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200
pF1KE9 LTTIAVDRYVVLVHPLRRRISLRLSAYAVLAIWALSAVLALPAAVHTY--HVELKPH---
:. .:..:. ....: . :. . ... ::... ::.:: ... .: : :
CCDS81 LVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIACVLSLPFLANSILENVFHKNHSKA
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 -----DVRLCEEFWGSQERQRQLYAWGLLLVTYLLPLLVILLSYVRVSVKLRNRVVPGCV
: .: : : ..: .:. ::: : ::: ::. :.:. .:. . : :
CCDS81 LEFLADKVVCTESW-PLAHHRTIYTTFLLLFQYCLPLGFILVCYARIYRRLQRQ---GRV
200 210 220 230 240
270 280 290 300 310
pF1KE9 TQSQADWDRA-RRRRTFCLLVVVVVVFAVCWLPLHVFNLLRDLDPHAIDPYAFG-LVQLL
.. . :: . ... .:::.::.::: :::::::: :.: .:: : : :. :.
CCDS81 FHKGTYSLRAGHMKQVNVVLVVMVVAFAVLWLPLHVFNSLEDWHHEAI-PICHGNLIFLV
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE9 CHWLAMSSACYNPFIYAWLHDSFREELRKLLVAWPRKIAP--HGQNMTVSVVI
:: :::.:.: :::::..:. .:..:. : :: .. :: ..... .:.:
CCDS81 CHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEI-KALVLTCQQSAPLEESEHLPLSTVHTEVSKGS
310 320 330 340 350 360
CCDS81 LRLSGRSNPI
370
>>CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10 (375 aa)
initn: 624 init1: 250 opt: 628 Z-score: 550.1 bits: 110.5 E(32554): 2.5e-24
Smith-Waterman score: 628; 38.2% identity (65.8% similar) in 322 aa overlap (62-369:43-357)
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 ASAGNGSVAGADAPAVTPFQSLQLVHQLKGLIVLLYSVVVVVGLVGNCLLVLVIARVRRL
.:: ::. .:::..:: :. : .: ..
CCDS73 KSPQGENRSKPLGTPYNFSEHCQDSVDVMVFIVTSYSIETVVGVLGNLCLMCVTVRQKEK
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 HNVTNFLIGNLALSDVLMCTACVPLTLAYAFEPRGWVFGGGLCHLVFFLQPVTVYVSVFT
::::.::.:::.:: ::: : ::: .:.. :.:: ::.. :.: ..: ::...
CCDS73 ANVTNLLIANLAFSDFLMCLLCQPLTAVYTIMDY-WIFGETLCKMSAFIQCMSVTVSILS
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200
pF1KE9 LTTIAVDRYVVLVHPLRRRISLRLSAYAVLAIWALSAVLALPAAVHTY--HVELKPH---
:. .:..:. ....: . :. . ... ::... ::.:: ... .: : :
CCDS73 LVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIACVLSLPFLANSILENVFHKNHSKA
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 -----DVRLCEEFWGSQERQRQLYAWGLLLVTYLLPLLVILLSYVRVSVKLRNRVVPGCV
: .: : : ..: .:. ::: : ::: ::. :.:. :. . : :
CCDS73 LEFLADKVVCTESW-PLAHHRTIYTTFLLLFQYCLPLGFILVCYARIYRCLQRQ---GRV
200 210 220 230 240
270 280 290 300 310
pF1KE9 TQSQADWDRA-RRRRTFCLLVVVVVVFAVCWLPLHVFNLLRDLDPHAIDPYAFG-LVQLL
.. . :: . ... .:::.::.::: :::::::: :.: .:: : : :. :.
CCDS73 FHKGTYSLRAGHMKQVNVVLVVMVVAFAVLWLPLHVFNSLEDWHHEAI-PICHGNLIFLV
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE9 CHWLAMSSACYNPFIYAWLHDSFREELRKLLVAWPRKIAP--HGQNMTVSVVI
:: :::.:.: :::::..:. .:..:. : :: .. :: ..... .:.:
CCDS73 CHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEI-KALVLTCQQSAPLEESEHLPLSTVHTEVSKGS
310 320 330 340 350 360
CCDS73 LRLSGRSNPI
370
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40 50 60 70 80 90
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..: :..:...:. :: :...: . ....
CCDS34 SVHSNFSEKNAQLLAFENDDCHLPLAMIFTLALAYGAVIILGVSGNLALIIIILKQKEMR
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pF1KE9 NVTNFLIGNLALSDVLMCTACVPLTLAYAFEPRGWVFGGGLCHLVFFLQPVTVYVSVFTL
::::.:: ::..::.:. :.:.:..:.. . :::: ..:.: :.: :.. ::.:.:
CCDS34 NVTNILIVNLSFSDLLVAIMCLPFTFVYTLMDH-WVFGEAMCKLNPFVQCVSITVSIFSL
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. :::.:. ....: : . : . .. .::.:... .:: .. .. ..: :
CCDS34 VLIAVERHQLIINPRGWRPNNRHAYVGIAVIWVLAVASSLPFLIYQVMTDEPFQNVTLDA
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260
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: . . : . .: :. ::.. :. :: :.. : .. ..:. : . . ..
CCDS34 YKDKYVCFDQFPS-DSHRLSYTTLLLVLQYFGPLCFIFICYFKIYIRLKRR---NNMMDK
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CCDS34 MRDNKYRSSETKRINIMLLSIVVAFAVCWLPLTIFNTVFDWNHQIIATCNHNLLFLLCHL
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370
pF1KE9 LAMSSACYNPFIYAWLHDSFREELRKLLVAWPRKIAPHGQNMTVSVVI
:: :.: ::..:..:. .:...:.
CCDS34 TAMISTCVNPIFYGFLNKNFQRDLQFFFNFCDFRSRDDDYETIAMSTMHTDVSKTSLKQA
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>>CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 (349 aa)
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: ::.: :: :. .. :... :
CCDS12 MELAVGNLSEGNASWPEPPAPEPGPLFGIG-VENFVTL
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.: .... ..:..:: :.. :.:: . . ...::..: ::...:. . :.:. . .
CCDS12 VV--FGLIFALGVLGNSLVITVLARSKPGKPRSTTNLFILNLSIADLAYLLFCIPFQATV
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::. : ::.:. .:... .. :.. ::.:::....:::::..:: :: :::.: :
CCDS12 YAL-PT-WVLGAFICKFIHYFFTVSMLVSIFTLAAMSVDRYVAIVHS-RRSSSLRVSRNA
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 VLA---IWALSAVLALPAAVHTYHVELKPHDVRLCEEFWGSQERQRQLYAWGLLLVTYLL
.:. ::::: ..: :.: : . . . .: : : . :... :. .. :::
CCDS12 LLGVGCIWALSIAMASPVAYHQGLFHPRASNQTFCWEQW-PDPRHKKAYVVCTFVFGYLL
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:::.: . :..: .:.... .... ..: ...: ..::::::.. ::: :.
CCDS12 PLLLICFCYAKVLNHLHKKL------KNMSKKSEASKKKTAQTVLVVVVVFGISWLPHHI
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
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..: .. . : .: : .. : ::.:.. ::.:::.: ..::. .... ::
CCDS12 IHLWAEFGVFPLTPASF-LFRITAHCLAYSNSSVNPIIYAFLSENFRKAYKQVFKCHIRK
270 280 290 300 310 320
360 370
pF1KE9 IAPHGQNMTVSVVI
CCDS12 DSHLSDTKESKSRIDTPPSTNCTHV
330 340
>>CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 (465 aa)
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10 20 30
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...: . : .. . .: . .: :. :: .
CCDS36 MATLPAAETWIDGGGGVGADAVNLTASLAAGAATGAVETGWLQLLDQAGNLSSSPSALGL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 SVAGADAPAVTPFQSL--QLVHQLK--GLIVLLYSVVVVVGLVGNCLLVLVIARVRRLHN
:: . ::. :. .: :.:. .: : :.:::.:...:: ... .: .:...
CCDS36 PVA-SPAPS-QPWANLTNQFVQPSWRIALWSLAYGVVVAVAVLGNLIVIWIILAHKRMRT
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pF1KE9 VTNFLIGNLALSDVLMCTACVPLTLAYAFEPRGWVFGGGLCHLVFFLQPVTVYVSVFTLT
:::... :::.::. : . . ... ::.. . : ::.. :.. :. ..:..:....:
CCDS36 VTNYFLVNLAFSDASMAAFNTLVNFIYALHSE-WYFGANYCRFQNFFPITAVFASIYSMT
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 TIAVDRYVVLVHPLRRRISLRLSAYAVLAIWALSAVLALPAAVHTYHVELKPHDVRLCEE
.::::::.... ::. :.: . .. .:: :. .::.: ... .... : . ::
CCDS36 AIAVDRYMAIIDPLKPRLSATATKIVIGSIWILAFLLAFPQCLYS-KTKVMPGRT-LCFV
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220 230 240 250 260 270
pF1KE9 FWGSQERQRQLYAWGLLLVTYLLPLLVILLSYVRVSVKLRNRVVPGCVTQSQADWDRARR
: .:. : .....: .:::.. ..:. :.. : . .:: . .. . .:.:
CCDS36 QWPEGPKQHFTYHIIVIILVYCFPLLIMGITYTIVGITLWGGEIPGDTCDKYHEQLKAKR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 RRTFCLLVVVVVVFAVCWLPLHVFNLLRDLDPHAIDPYAFGLVQLLCHWLAMSSACYNPF
. . ....::..::.:::: :.. .: . . . : : ::::::. :::.
CCDS36 K-VVKMMIIVVMTFAICWLPYHIYFILTAIYQQLNRWKYIQQVYLASFWLAMSSTMYNPI
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:: :. :: ...
CCDS36 IYCCLNKRFRAGFKRAFRWCPFIKVSSYDELELKTTRFHPNRQSSMYTVTRMESMTVVFD
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>>CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 (407 aa)
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CCDS19 VVVMWIILAHKRMRTVTNYFLVNLAFAEASMAAFNTVVNFTYAVHNE-WYYGLFYCKFHN
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CCDS19 FFPIAAVFASIYSMTAVAFDRYMAIIHPLQPRLSATATKVVICVIWVLALLLAFPQGYYS
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.: : : .: : . . ...: . .. :.:::::: .:. :.. :
CCDS19 T-TETMPSRV-VCMIEWPEHPNKIYEKVYHICVTVLIYFLPLLVIGYAYTVVGITLWASE
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.:: .. . :.:. . ...::: .::.::::.:.: :: ..: . :
CCDS19 IPGDSSDRYHEQVSAKRK-VVKMMIVVVCTFAICWLPFHIFFLLPYINPDLYLKKFIQQV
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: ::::::. :::.:: :.: ::
CCDS19 YLAIMWLAMSSTMYNPIIYCCLNDRFRLGFKHAFRCCPFISAGDYEGLEMKSTRYLQTQG
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:: . .::: :. : :. : .:.:. .: . :
CCDS12 MHTVATSGPNASWGAPANASG--CPGCGANA-SDGPVPSP----RAVDAW-
10 20 30 40
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:. :........::::: :.. :: : . ...:::: :.::: .:: . :::.: :
CCDS12 -LVPLFFAALMLLGLVGNSLVIYVICRHKPMRTVTNFYIANLAATDVTFLLCCVPFT-AL
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pF1KE9 AFEPRGWVFGGGLCHLVFFLQPVTVYVSVFTLTTIAVDRYVVLVHPLR--RRISLRLSAY
. :::.: .:..: ..: :.: .. :::...:::. : : ::: .: . ::.
CCDS12 LYPLPGWVLGDFMCKFVNYIQQVSVQATCATLTAMSVDRWYVTVFPLRALHRRTPRLALA
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pF1KE9 AVLAIWALSAVLALPA-AVHTYHVELKPHDVRLCEEFWGSQERQRQLYAWGLLLVTYLLP
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CCDS12 VSLSIWVGSAAVSAPVLALH----RLSPGPRAYCSEAFPSRALERA-FALYNLLALYLLP
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CCDS12 LLATCACYAAMLRHLGRVAVRPAPADSALQGQVLAERAGAVRAKVSRLVAAVVLLFAACW
220 230 240 250 260 270
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:...: .:. : : . : :: .. : ...:.. ::..::.: . ::. .:.
CCDS12 GPIQLFLVLQALGPAGSWHPRSYAAYALKTWAHCMSYSNSALNPLLYAFLGSHFRQAFRR
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. ::.
CCDS12 VCPCAPRRPRRPRRPGPSDPAAPHAELLRLGSHPAPARAQKPGSSGLAARGLCVLGEDNA
340 350 360 370 380 390
370 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 15:22:09 2016 done: Sun Nov 6 15:22:09 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]