Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9508
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9508, 322 aa
1>>>pF1KE9508 322 - 322 aa - 322 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4040+/-0.000943; mu= 15.7457+/- 0.056
mean_var=114.0611+/-32.340, 0's: 0 Z-trim(105.3): 141 B-trim: 415 in 1/51
Lambda= 0.120090
statistics sampled from 8191 (8369) to 8191 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.257), width: 16
Scan time: 2.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 ( 322) 2140 382.1 3.2e-106
CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 ( 322) 1764 316.9 1.3e-86
CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 ( 322) 1671 300.8 9.4e-82
CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 ( 330) 1284 233.8 1.5e-61
CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 ( 321) 729 137.6 1.3e-32
CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 ( 312) 630 120.5 1.8e-27
CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 ( 325) 601 115.4 6e-26
CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 ( 343) 566 109.4 4.2e-24
CCDS44520.1 MRGPRG gene_id:386746|Hs108|chr11 ( 289) 497 97.4 1.5e-20
CCDS4661.1 MAS1L gene_id:116511|Hs108|chr6 ( 378) 408 82.1 7.7e-16
>>CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 2140 init1: 2140 opt: 2140 Z-score: 2020.4 bits: 382.1 E(32554): 3.2e-106
Smith-Waterman score: 2140; 99.7% identity (99.7% similar) in 322 aa overlap (1-322:1-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPTVPVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMRRNA
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CCDS78 MDPTVPVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMRRNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VSIYILNLAAADFLFLSFQIIRSPLRLINISHLIRKILVSVMTFPYFTGLSMLSAISTER
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CCDS78 VSIYILNLAAADFLFLSFQIIRLPLRLINISHLIRKILVSVMTFPYFTGLSMLSAISTER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CLSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCDFLFSGADSSWCETSDFIP
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CCDS78 CLSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCDFLFSGADSSWCETSDFIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VAWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGILGALIY
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CCDS78 VAWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGILGALIY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 RMHLNLEVLYCHVYLVCMSLSSLNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDKPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RMHLNLEVLYCHVYLVCMSLSSLNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDKPE
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE9 VDKGEGQLPEESLELSGSRLGP
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CCDS78 VDKGEGQLPEESLELSGSRLGP
310 320
>>CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 1764 init1: 1764 opt: 1764 Z-score: 1668.3 bits: 316.9 E(32554): 1.3e-86
Smith-Waterman score: 1764; 82.8% identity (91.9% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPTVPVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMRRNA
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CCDS78 MDSTIPVLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VSIYILNLAAADFLFLSFQIIRSPLRLINISHLIRKILVSVMTFPYFTGLSMLSAISTER
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CCDS78 VSIYILNLVAADFLFLSGHIICSPLRLINIRHPISKILSPVMTFPYFIGLSMLSAISTER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CLSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCDFLFSGADSSWCETSDFIP
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CCDS78 CLSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFLFSGANSVWCETSDFIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VAWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGILGALIY
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CCDS78 IAWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQWALFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 RMHLNLEVLYCHVYLVCMSLSSLNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDKPE
:.::. .::.:::.:: . ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS78 RIHLDWKVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDTPE
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE9 VDKGEGQLPEESLELSGSRLGP
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CCDS78 VDEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
310 320
>>CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 1671 init1: 1671 opt: 1671 Z-score: 1581.2 bits: 300.8 E(32554): 9.4e-82
Smith-Waterman score: 1671; 79.7% identity (89.4% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPTVPVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMRRNA
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CCDS78 MDPTISTLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VSIYILNLAAADFLFLSFQIIRSPLRLINISHLIRKILVSVMTFPYFTGLSMLSAISTER
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CCDS78 FSIYILNLAAADFLFLSGRLIYSLLSFISIPHTISKILYPVMMFSYFAGLSFLSAVSTER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CLSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCDFLFSGADSSWCETSDFIP
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CCDS78 CLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSGADSAWCQTSDFIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VAWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGILGALIY
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CCDS78 VAWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQFFLFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 RMHLNLEVLYCHVYLVCMSLSSLNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDKPE
.:.. :::.:::.:: . ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS78 WIHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDASE
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE9 VDKGEGQLPEESLELSGSRLGP
::.: :::::: ::::::::
CCDS78 VDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
310 320
>>CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 1283 init1: 910 opt: 1284 Z-score: 1218.8 bits: 233.8 E(32554): 1.5e-61
Smith-Waterman score: 1284; 62.6% identity (80.9% similar) in 329 aa overlap (1-320:1-329)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MDPTVPVFGTKLTPINGREETP---CYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMR
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CCDS78 MDPTTPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 RNAVSIYILNLAAADFLFLSFQIIRSPLRLIN----ISHLIRKILVSVMTFPYFTGLSML
::: :.:.:.::.:::::: :::: . : : :: . .....::: :..:::::
CCDS78 RNAFSVYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLAGLSML
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SAISTERCLSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCDFLFSGADSSWC
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CCDS78 STVSTERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSDGDSGWC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 ETSDFIPVAWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFG
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CCDS78 QTFDFITAAWLIFLFMVLCGSSLALLVRILCGSRGLPLTRLYLTILLTVLVFLLCGLPFG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 ILGALIYRMHLNLEVLYCHVYLVCMSLSSLNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQN--LKLVL
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CCDS78 IQWFLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPILKLAL
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE9 QRALQDKPEVDKGEGQLPEESLELSGSRLGP
:::::: :::..:: . . . :.: : :
CCDS78 QRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
310 320 330
>>CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 620 init1: 294 opt: 729 Z-score: 699.2 bits: 137.6 E(32554): 1.3e-32
Smith-Waterman score: 729; 42.2% identity (69.1% similar) in 320 aa overlap (1-305:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPTVPVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMRRNA
:. :. :: . .: . . .. : .. :. . : :..::..:.::::.::.::
CCDS31 MNQTLNSSGTVESALNYSRGSTVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFRMHRNP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE9 VSIYILNLAAADFLFL-----SFQIIRSPLRLINISHLIRKILVSVMTFPYFTGLSMLSA
::::::::::.::: .... .:: .: . ..... .: : : .:::.:.:
CCDS31 FCIYILNLAAADLLFLFSMASTLSLETQPL--VNTTDKVHELMKRLMYFAYTVGLSLLTA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 ISTERCLSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCD-FLFSGADSSWCE
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CCDS31 ISTQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCSKFLKFNEDR--CF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 TSDFIPVAWLI-FLCVVLCVSSLVLLVRILCGS---RKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGL
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CCDS31 RVDMVQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQP-TRLFVVVLASVLVFLICSL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE9 PFGILGALIYRMHLNLEVLYCHVYLVCMSLS----SLNSSANPIIYFFVGSFR-QRQNRQ
:..: ..: . : :. ..:.::: :..:::::.:::.::: : .: .
CCDS31 PLSIYWFVLYWLSLPPEM-----QVLCFSLSRLSSSVSSSANPVIYFLVGSRRSHRLPTR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE9 NLKLVLQRALQDKPEVDKGEGQLPEESLELSGSRLGP
.: :::.::...::.. ::
CCDS31 SLGTVLQQALREEPELEGGETPTVGTNEMGA
300 310 320
>>CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 571 init1: 408 opt: 630 Z-score: 606.7 bits: 120.5 E(32554): 1.8e-27
Smith-Waterman score: 630; 37.9% identity (65.4% similar) in 298 aa overlap (9-301:8-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPTVPVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMRRNA
: .. :: .: .: : . :: ..: :: ::..:::::. . ::
CCDS41 MMEPREAGQHVGAANGAQEDVAFN--LIILSLTEGLGLGGLLGNGAVLWLLSSNVYRNP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE9 VSIYILNLAAADFLFLSFQIIR-SPLRL---INISHLIRKILVSVMTFPYFTGLSMLSAI
.::.:..: ::..::. ... : : ... ... :... : :..:::.:.:.
CCDS41 FAIYLLDVACADLIFLGCHMVAIVPDLLQGRLDFPGFVQTSLATLRFFCYIVGLSLLAAV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 STERCLSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCDFLFSGADSSWCETS
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CCDS41 SVEQCLAALFPAWYSCRRPRHLTTCVCALTWALCLLLHLLLSGACTQFFGEPSRHLCRTL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 DFIPVAWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGILG
.. .. : .:: ..: .::.::.:. : .. : . ::::::.::.:::::::
CCDS41 WLVAAVLLALLCCTMCGASLMLLLRVERGPQRPPPRGFPGLILLTVLLFLFCGLPFGI--
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 ALIYRMHLNLEVLYCHV-YLVCMSLSSLNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRAL
: . :: : : . ..... .:.:..:: .:: . : : :.:::::::
CCDS41 ---YWLSRNLLWYIPHYFYHFSFLMAAVHCAAKPVVYFCLGSAQGR--RLPLRLVLQRAL
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE9 QDKPEVDKGEGQLPEESLELSGSRLGP
:. :.
CCDS41 GDEAELGAVRETSRRGLVDIAA
300 310
>>CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 (325 aa)
initn: 603 init1: 261 opt: 601 Z-score: 579.3 bits: 115.4 E(32554): 6e-26
Smith-Waterman score: 601; 37.4% identity (69.2% similar) in 305 aa overlap (2-298:13-306)
10 20 30 40
pF1KE9 MDPTVPVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVL
.:: : . . :.... : . ..... :: ::.. :...:
CCDS52 MDGSNVTSFVVEEPTNISTGRNASVGNAHRQIP----IVHWVIMS--ISPVGFVENGILL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 WLLGYRMRRNAVSIYILNLAAAD--FLFLSFQI-IRSPLRL-INISHLIRKILVSV-MTF
:.: .::::: ..:: .:. :: .:: : . : : .. .: . .:: . :
CCDS52 WFLCFRMRRNPFTVYITHLSIADISLLFCIFILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFLF
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 PYFTGLSMLSAISTERCLSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFC-DF
: ::: .:.:::.:::::::.::::::.:: . ::.::.:::.:: : . .:. .: :
CCDS52 GYNTGLYLLTAISVERCLSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDR
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 LFSGADSSWCETSD-FIPV-AWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLT
. . . :.. :: . ..:.: ..: ::: .:.:.: .. ..::..:..:
CCDS52 EEESHSRNDCRAVIIFIAILSFLVFTPLML-VSSTILVVKIRKNTWASHSSKLYIVIMVT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 VLVFLLCGLPFGILGALIYRMHLNLEVLYCHVYLVCMSLSSLNSSANPIIYFFVGSFRQR
...::. ..:. .: : :.. .. :. :. :. .:..::::::.::::::: ...
CCDS52 IIIFLIFAMPMRLLYLLYYEYWSTFGNLH-HISLL---FSTINSSANPFIYFFVGSSKKK
240 250 260 270 280
290 300 310 320
pF1KE9 QNRQNLKLVLQRALQDKPEVDKGEGQLPEESLELSGSRLGP
. ...::.:: ::..:.
CCDS52 RFKESLKVVLTRAFKDEMQPRRQKDNCNTVTVETVV
290 300 310 320
>>CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 (343 aa)
initn: 546 init1: 278 opt: 566 Z-score: 546.3 bits: 109.4 E(32554): 4.2e-24
Smith-Waterman score: 566; 35.9% identity (67.9% similar) in 287 aa overlap (36-315:53-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 PVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMRRNAVSIYI
.. : ::.::..:::..:. ..:: :::.
CCDS81 EAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLVGNGLVLWFFGFSIKRNPFSIYF
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LNLAAAD--FLFLS--FQIIRSPLRLINISHLIRKILVSVMTFPYFTGLSMLSAISTERC
:.::.:: .:: . :.:. . : ... ::.. . ..::.:.: :.:.:::
CCDS81 LHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVCRVLGLCMFLTGVSLLPAVSAERC
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCDFLFSGADSSWCETSD-FIP
::..: :: ::: .::::::.::: :::: . :. :: :: :: .. :. : :.
CCDS81 ASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNYFCVFLGRGAPGAACRHMDIFLG
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230
pF1KE9 VAWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLT-RLYVTILLTVLVFLLCGLPFGILGALI
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CCDS81 ILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHVILAMVSVFLVSSIYLGIDWFLF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]