FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9502, 333 aa
1>>>pF1KE9502 333 - 333 aa - 333 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8364+/-0.00109; mu= 12.9679+/- 0.064
mean_var=122.1456+/-35.812, 0's: 0 Z-trim(105.5): 292 B-trim: 1106 in 2/46
Lambda= 0.116047
statistics sampled from 7987 (8480) to 7987 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 2.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 2205 380.8 8.1e-106
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 1304 230.0 2.1e-60
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 832 151.0 1.4e-36
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 827 150.2 2.5e-36
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 821 149.2 4.9e-36
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 804 146.4 3.7e-35
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 791 144.2 1.7e-34
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 789 143.9 2.1e-34
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 789 143.9 2.1e-34
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 789 143.9 2.1e-34
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 789 143.9 2.1e-34
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 789 143.9 2.1e-34
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 789 143.9 2.2e-34
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 789 143.9 2.2e-34
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 789 143.9 2.2e-34
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 789 143.9 2.3e-34
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 789 144.0 2.5e-34
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 769 140.5 2.1e-33
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 759 138.8 6.8e-33
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 734 134.6 1.2e-31
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 707 130.0 2.5e-30
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 697 128.3 7.6e-30
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 670 123.8 1.7e-28
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 535 101.4 1.4e-21
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 531 100.6 2e-21
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 524 99.5 4.7e-21
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 494 94.4 1.5e-19
CCDS5044.1 MCHR2 gene_id:84539|Hs108|chr6 ( 340) 473 90.9 1.6e-18
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 473 90.9 1.7e-18
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 473 90.9 1.7e-18
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 473 90.9 1.7e-18
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 473 90.9 1.8e-18
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 473 91.0 1.8e-18
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 471 90.6 2.1e-18
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 469 90.3 2.7e-18
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 469 90.3 2.7e-18
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 466 89.7 3.8e-18
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 459 88.6 8.7e-18
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 456 88.0 1.2e-17
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 446 86.4 3.9e-17
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 446 86.4 3.9e-17
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 442 85.7 6.2e-17
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 442 85.8 6.5e-17
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 441 85.6 6.8e-17
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 436 84.7 1.3e-16
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 434 84.4 1.5e-16
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 428 83.4 3.3e-16
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 427 83.2 3.5e-16
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 427 83.2 3.5e-16
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 423 82.6 5.7e-16
>>CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 (333 aa)
initn: 2205 init1: 2205 opt: 2205 Z-score: 2013.2 bits: 380.8 E(32554): 8.1e-106
Smith-Waterman score: 2205; 100.0% identity (100.0% similar) in 333 aa overlap (1-333:1-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MQAAGHPEPLDSRGSFSLPTMGANVSQDNGTGHNATFSEPLPFLYVLLPAVYSGICAVGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MQAAGHPEPLDSRGSFSLPTMGANVSQDNGTGHNATFSEPLPFLYVLLPAVYSGICAVGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 TGNTAVILVILRAPKMKTVTNVFILNLAVADGLFTLVLPVNIAEHLLQYWPFGELLCKLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TGNTAVILVILRAPKMKTVTNVFILNLAVADGLFTLVLPVNIAEHLLQYWPFGELLCKLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LAVDHYNIFSSIYFLAVMSVDRYLVVLATVRSRHMPWRTYRGAKVASLCVWLGVTVLVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LAVDHYNIFSSIYFLAVMSVDRYLVVLATVRSRHMPWRTYRGAKVASLCVWLGVTVLVLP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 FFSFAGVYSNELQVPSCGLSFPWPEQVWFKASRVYTLVLGFVLPVCTICVLYTDLLRRLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FFSFAGVYSNELQVPSCGLSFPWPEQVWFKASRVYTLVLGFVLPVCTICVLYTDLLRRLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 AVRLRSGAKALGKARRKVTVLVLVVLAVCLLCWTPFHLASVVALTTDLPQTPLVISMSYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVRLRSGAKALGKARRKVTVLVLVVLAVCLLCWTPFHLASVVALTTDLPQTPLVISMSYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE9 ITSLSYANSCLNPFLYAFLDDNFRKNFRSILRC
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ITSLSYANSCLNPFLYAFLDDNFRKNFRSILRC
310 320 330
>>CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 (328 aa)
initn: 1327 init1: 657 opt: 1304 Z-score: 1198.0 bits: 230.0 E(32554): 2.1e-60
Smith-Waterman score: 1304; 63.7% identity (83.5% similar) in 322 aa overlap (15-333:5-324)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MQAAGHPEPLDSRGSFSLPTMGANVSQDNG--TGHNATFSEPLPF-LYVLLPAVYSGICA
::: : ::.: . . ::. ::: : : .:.::. :::
CCDS61 MDNASFSEP-WPANASGPDPALSCSNASTLAPLPAPLAVAVPVVYAVICA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VGLTGNTAVILVILRAPKMKTVTNVFILNLAVADGLFTLVLPVNIAEHLLQYWPFGELLC
:::.::.::. :.::::.::::::.::::::.:: :::::::.:::. ::. ::::::.:
CCDS61 VGLAGNSAVLYVLLRAPRMKTVTNLFILNLAIADELFTLVLPINIADFLLRQWPFGELMC
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 KLVLAVDHYNIFSSIYFLAVMSVDRYLVVLATVRSRHMPWRTYRGAKVASLCVWLGVTVL
::..:.:.:: :::.:::.:::.:::::::::..::.. ::: .:...:: :: ::..
CCDS61 KLIVAIDQYNTFSSLYFLTVMSADRYLVVLATAESRRVAGRTYSAARAVSLAVWGIVTLV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 VLPFFSFAGVYSNELQVPSCGLSFPWPEQVWFKASRVYTLVLGFVLPVCTICVLYTDLLR
:::: :: . ..: .: : :: :: :..:::.:::::::..:: ::::::: ::
CCDS61 VLPFAVFARL-DDEQGRRQCVLVFPQPEAFWWRASRLYTLVLGFAIPVSTICVLYTTLLC
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 RLRAVRLRSGAKALGKARRKVTVLVLVVLAVCLLCWTPFHLASVVALTTDLPQTPLVISM
::.:.:: : :::: .:...:: ::...::::::::::.::..:::::::::::::::..
CCDS61 RLHAMRLDSHAKALERAKKRVTFLVVAILAVCLLCWTPYHLSTVVALTTDLPQTPLVIAI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE9 SYVITSLSYANSCLNPFLYAFLDDNFRKNFRSILRC
:: :::::::::::::::::::: .::.:.:... :
CCDS61 SYFITSLSYANSCLNPFLYAFLDASFRRNLRQLITCRAAA
290 300 310 320
>>CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 (369 aa)
initn: 811 init1: 464 opt: 832 Z-score: 770.3 bits: 151.0 E(32554): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 832; 40.2% identity (70.1% similar) in 331 aa overlap (8-333:6-328)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MQAAGHPEPLDSRGSF-SLP-TMGANVSQDNGTGHNATFSEPLPFLY--VLLPAVYSGIC
:::.. .. :.: ....: . : ... .:: : ..: .: .:
CCDS11 MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQ----TEPYYDLTSNAVLTFIYFVVC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 AVGLTGNTAVILVILRAPKMKTVTNVFILNLAVADGLFTLVLPVNIAEHLLQYWPFGELL
.:: ::: :: :::: ::::.::..:::::.:: :: : :: . : .::::. .
CCDS11 IIGLCGNTLVIYVILRYAKMKTITNIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVHWPFGKAI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 CKLVLAVDHYNIFSSIYFLAVMSVDRYLVVLATVRSRHMPWRTYRGAKVASLCVWLGVTV
:..:..:: : :.::. :.:::.::::.:. ..: . :: : ::. .. :: ::..
CCDS11 CRVVMTVDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAK--WRRPRTAKMITMAVW-GVSL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 LV-LPFFSFAGVYSNELQVPSCGLSFPWPEQVWFKASRVYTLVLGFVLPVCTICVLYTDL
:: ::.. .::. ::. :: ...: .:. . .::..:::..:. ::. : .
CCDS11 LVILPIMIYAGLRSNQWGRSSCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 LRRLRAVRLRSGAKALGKARRKVTVLVLVVLAVCLLCWTPFHLASVVALTTDLPQTPLVI
. .... .: :.. :...::: .: .:.:: ..:: ::.. .: ... . :: .
CCDS11 IIKVKSSGIRVGSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE9 SMSYVITSLSYANSCLNPFLYAFLDDNFRKNFRSILRC
.: .. :.::::: ::.:::::.:::.:.:...: :
CCDS11 GMFDFVVVLTYANSCANPILYAFLSDNFKKSFQNVL-CLVKVSGTDDGERSDSKQDKSRL
300 310 320 330 340 350
CCDS11 NETTETQRTLLNGDLQTSI
360
>>CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 (372 aa)
initn: 742 init1: 398 opt: 827 Z-score: 765.8 bits: 150.2 E(32554): 2.5e-36
Smith-Waterman score: 827; 41.0% identity (72.4% similar) in 315 aa overlap (19-332:28-334)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MQAAGHPEPLDSRGSFSLPTMGANVSQDNGTGHNATFSEPLPFLYVLLPAV
:. :::.: :. .... : . . :.
CCDS32 MEPAPSAGAELQPPLFANASDAYPSACPSAGANASGPPGARSASSLA-----LAIAITAL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 YSGICAVGLTGNTAVILVILRAPKMKTVTNVFILNLAVADGLFTLVLPVNIAEHLLQYWP
::..::::: ::. :.. :.: ::::.::..:.:::.::.: : .:: . :..:.. ::
CCDS32 YSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSAKYLMETWP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 FGELLCKLVLAVDHYNIFSSIYFLAVMSVDRYLVVLATVRSRHMPWRTYRGAKVASLCVW
::::::: ::..:.::.:.::. :..::::::..: :.. . .:: ::. ..:.:
CCDS32 FGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKA--LDFRTPAKAKLINICIW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 LGVTVLVLPFFSFAGVYSNELQVPSCGLSFPWPEQVWFKASRVYTLVLGFVLPVCTICVL
. .. . .:.. .: . . : : :.:: : : .... .....::.:. : :
CCDS32 VLASGVGVPIMVMAVTRPRDGAV-VCMLQFPSPSWYWDTVTKICVFLFAFVVPILIITVC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 YTDLLRRLRAVRLRSGAKALGKARRKVTVLVLVVLAVCLLCWTPFHLASVVALTTDLPQT
: .: :::.::: ::.: .. :..: .::::... ..::.:.:. .: .:. .
CCDS32 YGLMLLRLRSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPIHIFVIVWTLVDIDRR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE9 -PLVISMSYVITSLSYANSCLNPFLYAFLDDNFRKNFRSILRC
:::.. .. .:.:::: ::: ::::::.::.. ::.. :
CCDS32 DPLVVAALHLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRCFRQLCRKPCGRPDPSSFSRAREAT
300 310 320 330 340 350
CCDS32 ARERVTACTPSDGPGGGAAA
360 370
>>CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 (364 aa)
initn: 810 init1: 380 opt: 821 Z-score: 760.5 bits: 149.2 E(32554): 4.9e-36
Smith-Waterman score: 821; 43.0% identity (67.3% similar) in 321 aa overlap (17-333:8-320)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MQAAGHPEPLDSRGSFSLPTMGANV-SQDNGTGHNATFSEPLPFL---YVLLPAVYSGIC
: :. .:. . .: : : :. : : ::.:..: .:
CCDS10 MEPLFPASTPSWNASSPGAASGGGDNRTLVGPAPSAGARAVLVPVLYLLVC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 AVGLTGNTAVILVILRAPKMKTVTNVFILNLAVADGLFTLVLPVNIAEHLLQYWPFGELL
:.:: ::: :: :.:: :::::::..:::::::: :. : :: ... ..:::: .:
CCDS10 AAGLGGNTLVIYVVLRFAKMKTVTNIYILNLAVADVLYMLGLPFLATQNAASFWPFGPVL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 CKLVLAVDHYNIFSSIYFLAVMSVDRYLVVLATVRSRHMPWRTYRGAKVASLCVWLGVTV
:.::...: : :.:.. :.::::::::.:. . : . :: : ::.:: .:.
CCDS10 CRLVMTLDGVNQFTSVFCLTVMSVDRYLAVVHPLSSAR--WRRPRVAKLASAAAWVLSLC
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 LVLPFFSFAGVYSNELQVPSCGLSFPWPEQVWFKASRVYTLVLGFVLPVCTICVLYTDLL
. ::.. :: : . .:. :.: : .: . .:: :::: :. .::. : ..
CCDS10 MSLPLLVFADVQEG----GTCNASWPEPVGLWGAVFIIYTAVLGFFAPLLVICLCYLLIV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 RRLRAVRLRSGAKALGKARRKVTVLVLVVLAVCLLCWTPFHLASVVALTTDLPQTPLVIS
..::. .: : . ...:::: .::::. : :: :: ...: :.. ::: : .
CCDS10 VKVRAAGVRVGC-VRRRSERKVTRMVLVVVLVFAGCWLPFFTVNIVNLAVALPQEPASAG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE9 MSYVITSLSYANSCLNPFLYAFLDDNFRKNFRSILRC
. . .. ::::::: :: ::.::.::::..:...: :
CCDS10 LYFFVVILSYANSCANPVLYGFLSDNFRQSFQKVL-CLRKGSGAKDADATEPRPDRIRQQ
290 300 310 320 330 340
CCDS10 QEATPPAHRAAANGLMQTSKL
350 360
>>CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 (391 aa)
initn: 680 init1: 394 opt: 804 Z-score: 744.7 bits: 146.4 E(32554): 3.7e-35
Smith-Waterman score: 804; 41.7% identity (71.8% similar) in 312 aa overlap (22-333:42-339)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MQAAGHPEPLDSRGSFSLPTMGANVSQDNGTGHNATFSEPLPFLYVLLPAV
: :.:: ::: .. : .:. .
CCDS96 SSPSPSPGSCGEGGGSRGPGAGAADGMEEPGRNASQ-NGTLSEGQGSA------ILISFI
20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 YSGICAVGLTGNTAVILVILRAPKMKTVTNVFILNLAVADGLFTLVLPVNIAEHLLQYWP
:: .: ::: ::. :: :::: ::::.::..:::::.:: :. : .: .. ::..::
CCDS96 YSVVCLVGLCGNSMVIYVILRYAKMKTATNIYILNLAIADELLMLSVPFLVTSTLLRHWP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 FGELLCKLVLAVDHYNIFSSIYFLAVMSVDRYLVVLATVRSRHMPWRTYRGAKVASLCVW
:: :::.:::.:: :.:.::: :.:.:::::..:. ... . .: :::..: ::
CCDS96 FGALLCRLVLSVDAVNMFTSIYCLTVLSVDRYVAVVHPIKAAR--YRRPTVAKVVNLGVW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 LGVTVLVLPFFSFAGVYSNELQVPSCGLSFPWPEQVWFKASRVYTLVLGFVLPVCTICVL
. ...::. :. . .: . .:.. .: : : :. . .::...::.::: .::.
CCDS96 VLSLLVILPIVVFSRTAANSDGTVACNMLMPEPAQRWLVGFVLYTFLMGFLLPVGAICLC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 YTDLLRRLRAVRLRSGAKALGKARRKVTVLVLVVLAVCLLCWTPFHLASVVALTTDLPQT
:. .. ..: : :..: . ...::.:..:..:. : ..:: ::.....: . .. :
CCDS96 YVLIIAKMRMVALKAGWQQRKRSERKITLMVMMVVMVFVICWMPFYVVQLVNVFAE--QD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330
pF1KE9 PLVISMSYVITSLSYANSCLNPFLYAFLDDNFRKNFRSILRC
..:. :: :.::::: ::.::.::.:::...:. :: :
CCDS96 DATVSQLSVI--LGYANSCANPILYGFLSDNFKRSFQRIL-CLSWMDNAAEEPVDYYATA
310 320 330 340 350
CCDS96 LKSRAYSVEDFQPENLESGGVFRNGTCTSRITTL
360 370 380 390
>>CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 (418 aa)
initn: 747 init1: 393 opt: 791 Z-score: 732.6 bits: 144.2 E(32554): 1.7e-34
Smith-Waterman score: 791; 40.1% identity (66.9% similar) in 332 aa overlap (6-331:5-328)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MQAAGHPEPLDSRGSFSLPTMGANV-SQDNGTGHNATFSEP--LPFLYVLLPAVYSGICA
:: .: .. : : .... : :. .. : : ::.: :: .:.
CCDS13 MDMLHP---SSVSTTSEPENASSAWPPDATLGNVSAGPSPAGLAVSGVLIPLVYLVVCV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VGLTGNTAVILVILRAPKMKTVTNVFILNLAVADGLFTLVLPVNIAEHLLQYWPFGELLC
::: ::. :: :.:: .::::.:::::.:: :: : :: :.. :.::::: :.:
CCDS13 VGLLGNSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYWPFGSLMC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 KLVLAVDHYNIFSSIYFLAVMSVDRYLVVLATVRSRHMPWRTYRGAKVASLCVWLGVTVL
.::.::: : :.::. :.::::::::.:. .:: . ::: :...: ::.. .:.
CCDS13 RLVMAVDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSAR--WRTAPVARTVSAAVWVASAVV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 VLPFFSFAGVYSNELQVPSCGLSFPWPEQVWFKASRVYTLVLGFVLPVCTICVLYTDLLR
::: :.:: . . .: ...: : .: . .:: .::: :. .::. : ..
CCDS13 VLPVVVFSGVPRG---MSTCHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIVV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 RLRAVRLRSGAKALGKARR---KVTVLVLVVLAVCLLCWTPFHLASVVALTTDLPQTPLV
..:.. : : . . :: .:: .:..:.:. .::: ::.. ..: .. ::. :
CCDS13 KVRSAGRRVWAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPAF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE9 ISMSYVITSLSYANSCLNPFLYAFLDDNFRKNFRSILRC
... .....: ::::: ::.::.::. :...:: .:
CCDS13 FGLYFLVVALPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVLLRPSRRVRSQEPTVGPPEKTEEE
300 310 320 330 340 350
CCDS13 DEEEEDGEESREGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQERPPSRVASKEQQLLPQEASTGEKSS
360 370 380 390 400 410
>>CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (389 aa)
initn: 689 init1: 368 opt: 789 Z-score: 731.2 bits: 143.9 E(32554): 2.1e-34
Smith-Waterman score: 792; 38.4% identity (68.6% similar) in 331 aa overlap (9-328:24-350)
10 20 30
pF1KE9 MQAAGHPEPLDSRGSF-SLPTMGANVSQDNGT-----GHNATFSE
: : ::. .: . .:.:. : : ..
CCDS55 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSWVNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSLCP
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 PL--PFLY--VLLPAVYSGICAVGLTGNTAVILVILRAPKMKTVTNVFILNLAVADGLFT
: : . . . :.:: .:.::: :: :. ::.: ::::.::..:.:::.::.: :
CCDS55 PTGSPSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALAT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LVLPVNIAEHLLQYWPFGELLCKLVLAVDHYNIFSSIYFLAVMSVDRYLVVLATVRSRHM
.:: . ...:. :::: .:::.:...:.::.:.::. : .::::::..: :.. .
CCDS55 STLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKA--L
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 PWRTYRGAKVASLCVWLGVTVLVLPFFSFAGVYSNELQVPSCGLSFPWPEQVWFKASRVY
.:: :.::. ..: :. ... :: . .: . . .. .: :.: : : . ..
CCDS55 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSI-DCTLTFSHPTWYWENLLKIC
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 TLVLGFVLPVCTICVLYTDLLRRLRAVRLRSGAKALGKARRKVTVLVLVVLAVCLLCWTP
.....:..:: : : : .. ::..::. ::.: . :..: .::::.:: ..::::
CCDS55 VFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTP
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 FHLASVVALTTDLPQTPL-VISMSYVITSLSYANSCLNPFLYAFLDDNFRKNFRSILRC
.:. .. . .:.: . ..: . : .:.:.:::::: ::::::.::.. ::
CCDS55 IHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCI-ALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPT
300 310 320 330 340 350
CCDS55 SSNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQS
360 370 380
>>CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (392 aa)
initn: 689 init1: 368 opt: 789 Z-score: 731.1 bits: 143.9 E(32554): 2.1e-34
Smith-Waterman score: 792; 38.4% identity (68.6% similar) in 331 aa overlap (9-328:24-350)
10 20 30
pF1KE9 MQAAGHPEPLDSRGSF-SLPTMGANVSQDNGT-----GHNATFSE
: : ::. .: . .:.:. : : ..
CCDS47 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSWVNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSLCP
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 PL--PFLY--VLLPAVYSGICAVGLTGNTAVILVILRAPKMKTVTNVFILNLAVADGLFT
: : . . . :.:: .:.::: :: :. ::.: ::::.::..:.:::.::.: :
CCDS47 PTGSPSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALAT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LVLPVNIAEHLLQYWPFGELLCKLVLAVDHYNIFSSIYFLAVMSVDRYLVVLATVRSRHM
.:: . ...:. :::: .:::.:...:.::.:.::. : .::::::..: :.. .
CCDS47 STLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKA--L
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 PWRTYRGAKVASLCVWLGVTVLVLPFFSFAGVYSNELQVPSCGLSFPWPEQVWFKASRVY
.:: :.::. ..: :. ... :: . .: . . .. .: :.: : : . ..
CCDS47 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSI-DCTLTFSHPTWYWENLLKIC
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 TLVLGFVLPVCTICVLYTDLLRRLRAVRLRSGAKALGKARRKVTVLVLVVLAVCLLCWTP
.....:..:: : : : .. ::..::. ::.: . :..: .::::.:: ..::::
CCDS47 VFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTP
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 FHLASVVALTTDLPQTPL-VISMSYVITSLSYANSCLNPFLYAFLDDNFRKNFRSILRC
.:. .. . .:.: . ..: . : .:.:.:::::: ::::::.::.. ::
CCDS47 IHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCI-ALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPT
300 310 320 330 340 350
CCDS47 SSNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQVRSL
360 370 380 390
>>CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (397 aa)
initn: 689 init1: 368 opt: 789 Z-score: 731.1 bits: 143.9 E(32554): 2.1e-34
Smith-Waterman score: 792; 38.4% identity (68.6% similar) in 331 aa overlap (9-328:24-350)
10 20 30
pF1KE9 MQAAGHPEPLDSRGSF-SLPTMGANVSQDNGT-----GHNATFSE
: : ::. .: . .:.:. : : ..
CCDS47 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSWVNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSLCP
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 PL--PFLY--VLLPAVYSGICAVGLTGNTAVILVILRAPKMKTVTNVFILNLAVADGLFT
: : . . . :.:: .:.::: :: :. ::.: ::::.::..:.:::.::.: :
CCDS47 PTGSPSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALAT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LVLPVNIAEHLLQYWPFGELLCKLVLAVDHYNIFSSIYFLAVMSVDRYLVVLATVRSRHM
.:: . ...:. :::: .:::.:...:.::.:.::. : .::::::..: :.. .
CCDS47 STLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKA--L
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 PWRTYRGAKVASLCVWLGVTVLVLPFFSFAGVYSNELQVPSCGLSFPWPEQVWFKASRVY
.:: :.::. ..: :. ... :: . .: . . .. .: :.: : : . ..
CCDS47 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSI-DCTLTFSHPTWYWENLLKIC
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 TLVLGFVLPVCTICVLYTDLLRRLRAVRLRSGAKALGKARRKVTVLVLVVLAVCLLCWTP
.....:..:: : : : .. ::..::. ::.: . :..: .::::.:: ..::::
CCDS47 VFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTP
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 FHLASVVALTTDLPQTPL-VISMSYVITSLSYANSCLNPFLYAFLDDNFRKNFRSILRC
.:. .. . .:.: . ..: . : .:.:.:::::: ::::::.::.. ::
CCDS47 IHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCI-ALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPT
300 310 320 330 340 350
CCDS47 SSNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQRERRQKSDW
360 370 380 390
333 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 03:48:43 2016 done: Mon Nov 7 03:48:44 2016
Total Scan time: 2.630 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]