Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9501
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9501, 487 aa
1>>>pF1KE9501 487 - 487 aa - 487 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4176+/-0.000976; mu= 13.0332+/- 0.058
mean_var=156.5380+/-49.929, 0's: 0 Z-trim(107.0): 235 B-trim: 1117 in 2/48
Lambda= 0.102510
statistics sampled from 8841 (9298) to 8841 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16
Scan time: 2.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 ( 487) 3291 499.4 3.6e-141
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 464 81.4 2.7e-15
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 454 79.9 8.1e-15
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 ( 466) 452 79.5 8.5e-15
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 450 79.2 1.1e-14
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 443 78.2 2.1e-14
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 428 75.9 8.5e-14
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 427 75.7 9.8e-14
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 412 73.5 4.8e-13
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 405 72.4 8.9e-13
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 405 72.5 9.5e-13
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 398 71.4 1.8e-12
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 398 71.4 1.9e-12
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 386 69.7 6.9e-12
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 382 69.0 9.1e-12
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 384 69.5 9.2e-12
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 382 69.1 1.1e-11
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 382 69.2 1.1e-11
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 382 69.2 1.1e-11
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 382 69.2 1.1e-11
CCDS13493.1 HRH3 gene_id:11255|Hs108|chr20 ( 445) 379 68.7 1.5e-11
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 368 67.2 5.4e-11
>>CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 (487 aa)
initn: 3291 init1: 3291 opt: 3291 Z-score: 2648.0 bits: 499.4 E(32554): 3.6e-141
Smith-Waterman score: 3291; 100.0% identity (100.0% similar) in 487 aa overlap (1-487:1-487)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MSLPNSSCLLEDKMCEGNKTTMASPQLMPLVVVLSTICLVTVGLNLLVLYAVRSERKLHT
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CCDS26 MSLPNSSCLLEDKMCEGNKTTMASPQLMPLVVVLSTICLVTVGLNLLVLYAVRSERKLHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASIFSVFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 VGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASIFSVFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSFLWVIPILGWNHFMQQTSVRREDKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 LCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSFLWVIPILGWNHFMQQTSVRREDKC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 ETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHCQHRELINRSLPSFSEIKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 ETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHCQHRELINRSLPSFSEIKLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 PENPKGDAKKPGKESPWEVLKRKPKDAGGGSVLKSPSQTPKEMKSPVVFSQEDDREVDKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 PENPKGDAKKPGKESPWEVLKRKPKDAGGGSVLKSPSQTPKEMKSPVVFSQEDDREVDKL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 YCFPLDIVHMQAAAEGSSRDYVAVNRSHGQLKTDEQGLNTHGASEISEDQMLGDSQSFSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 YCFPLDIVHMQAAAEGSSRDYVAVNRSHGQLKTDEQGLNTHGASEISEDQMLGDSQSFSR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 TDSDTTTETAPGKGKLRSGSNTGLDYIKFTWKRLRSHSRQYVSGLHMNRERKAAKQLGFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 TDSDTTTETAPGKGKLRSGSNTGLDYIKFTWKRLRSHSRQYVSGLHMNRERKAAKQLGFI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 MAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 MAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTFK
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 RILHIRS
:::::::
CCDS26 RILHIRS
>>CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 (532 aa)
initn: 701 init1: 398 opt: 464 Z-score: 388.0 bits: 81.4 E(32554): 2.7e-15
Smith-Waterman score: 688; 29.0% identity (58.8% similar) in 486 aa overlap (26-486:29-513)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MSLPNSSCLLEDKMCEGNKTTMASPQLMPLVVVLSTICLVTVGLNLLVLYAVRSERK
... ...: ... :.:. :.::. . . . .
CCDS10 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 LHTVGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASIFS
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CCDS10 LKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVASNASVMN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 VFILCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSF-LWVIPILGWNHFMQQTSVRR
.... .::: :. .:: : :: ::. : ::..:: ::. :: :.... . .:
CCDS10 LLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRTVPL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 EDKCETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHCQHRELINRSLPSFSE
:.:. .: . . ::: ::.:. .: .: .::. .... . .. : .
CCDS10 -DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVTKA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE9 IKLRPEN----------PKGD-AKKPGKESPWEVLKRKPKDAGGGSVLKSPSQT-PKEMK
: .: . :. :.. ... : .:. . .: : .:: . : .
CCDS10 EKRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 SPVVFSQEDDREVDKLYCFP-LDIVHMQAAAEGSSRDYVA--VNRSHGQLKTDEQGLNTH
. : .... :: : :..:. . . :. .... : .... . .:... .:
CCDS10 LTTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE9 G------ASEISEDQMLGDSQSFSRTDSDTTTETAPGKGKLRSGSNTGLDYIKFTWKRLR
. :.. ..: . . .: . :: : :.. . . : :
CCDS10 NYLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPFPVAKEPSTKGLN
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 ---SHSRQYVSGLHMNRERKAAKQLGFIMAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMF
::. . . . .:::::. :. :. :::. : :: :. .: .:: .: : .
CCDS10 PNPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHL
420 430 440 450 460 470
460 470 480
pF1KE9 TIWLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTFKRILHIRS
:: :.:::.::. : :::..:.:::: .: :
CCDS10 GYWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
480 490 500 510 520 530
>>CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 (590 aa)
initn: 754 init1: 412 opt: 454 Z-score: 379.5 bits: 79.9 E(32554): 8.1e-15
Smith-Waterman score: 663; 28.4% identity (58.9% similar) in 496 aa overlap (26-483:67-559)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MSLPNSSCLLEDKMCEGNKTTMASPQLMPLVVVLSTICLVTVGLNLLVLYAVRSE
:.. .. . . . :::. :.::. . . .
CCDS16 FGSYNVSRAAGNFSSPDGTTDDPLGGHTVWQVVFIAFLTGILALVTIIGNILVIVSFKVN
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 RKLHTVGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASI
..:.::.: ...::. ::::.:.. : . :..:..:.:: : .::..:::::.::.
CCDS16 KQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLAIDYVASNASV
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 FSVFILCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSF-LWVIPILGWNHFMQQTSV
...... .::: :. .:: : :: ::.. : :: .:: ::. :: :..:. . .:
CCDS16 MNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTV
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220
pF1KE9 RREDKCETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHCQH----------R
.: .: . . ::: ::.:. .: .: .::: .... ..
CCDS16 P-PGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIYKETEKRTKELAGLQASGTEA
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270
pF1KE9 ELINRSLP-----SFSEIKLRPENPK-GDAKKPGKESPWEVLKR-KPK-DAGGGSVLKSP
: : : : : .:. .. : .. .: :. : . : ::. . . .:
CCDS16 ETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSMKRSNRRKYGRCHFWFTTKSWKPSSEQMDQDHSSSD
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 SQTPKEMKSPVVFSQEDDREVDKLYCFPLDIVHMQAAAEGSSRDYVAVNRSHG-QLKTDE
: . .. . . : .:.: . . .. .... . . . : . :. .:
CCDS16 SWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSETRAIYSIVLKLPGHSTILNSTKLPSSDNLQVPEEE
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380
pF1KE9 QGLNT--HGASEISEDQMLGDSQSFSRT------------DSDTTTETAPGKGKLRSGSN
:. . :.... .. . :. :: .. :. :... . :: : ..
CCDS16 LGMVDLERKADKLQAQKSVDDGGSFPKSFSKLPIQLESAVDTAKTSDVNSSVGK--STAT
400 410 420 430 440 450
390 400 410 420 430
pF1KE9 TGLDYIKFTW-KRLRSHSRQYVSG---LHMNRERKAAKQLGFIMAAFILCWIPYFIFFMV
:.. . : ::. ..:. .. . . .:.:::. :. :. :::. : :: :. .:
CCDS16 LPLSFKEATLAKRFALKTRSQITKRKRMSLVKEKKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLV
460 470 480 490 500 510
440 450 460 470 480
pF1KE9 IAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTFKRILHIRS
.:: .: . . . :: :::::.::. : :::..:. ::: .:
CCDS16 NTFCDSCIPKTFWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCNKTFRTTFKMLLLCQCDKKKRRKQQY
520 530 540 550 560 570
CCDS16 QQRQSVIFHKRAPEQAL
580 590
>>CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 (466 aa)
initn: 690 init1: 409 opt: 452 Z-score: 379.1 bits: 79.5 E(32554): 8.5e-15
Smith-Waterman score: 671; 29.5% identity (61.1% similar) in 475 aa overlap (18-483:10-455)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MSLPNSSCLLEDKMCEGNKTTMASP----QLMPLVVVLSTICLVTVGLNLLVLYAVRSER
:. ...:: ... .:.: ... :::. :.::. ... .:
CCDS58 MNNSTNSSNNSLALTSPYKTFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVSIKVNR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 KLHTVGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASIF
.:.::.: .. ::. ::::.:. : . :: ... : :: .: .::..:::.:.::..
CCDS58 HLQTVNNYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVSNASVM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SVFILCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSF-LWVIPILGWNHFMQQTSVR
...:. .::: : .:: : :: :. : .:: ::: ::. :: : .:. . .
CCDS58 NLLIISFDRYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFW-QFIVGVRTV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 REDKCETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHCQHRELINRSLPSFS
.. .: .:.. . ::: ::::...: .: .: .: ... .. ... : .
CCDS58 EDGECYIQFFSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRIKK----DKKEPVAN
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 EIKLRPENPKGDAKKPGKESPWEVLKRKPKDAGGGSVLKSPSQTPKEMKSPVVFSQEDDR
. . : .: ::.... :.. : . .. :. : ..::. :.
CCDS58 QDPVSPSLVQGRIVKPNNNN-------MPSSDDG--LEHNKIQNGKAPRDPVT---EN--
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 EVDKLYCFPLDIVHMQAAAEGSSRDYVAVNRSHGQLKTDEQGLNT---HGASEISEDQML
: . . ... ...: . :: : .. ::. ..: :. .: :.. .
CCDS58 ------CVQGE--EKESSNDSTSVSAVASNMRDDEITQDENTVSTSLGHSKDENSKQTCI
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 GDSQSFSRTDSDTTTETAPGKGKLRSGSNTGLDYIKFTWKRLRSHSRQYVSGLHM-NRER
. . ..:: : :.:. . ::.: : . ... ... . ..: .. .::.
CCDS58 RIGTKTPKSDSCTPTNTTV-EVVGSSGQN-GDEKQNIVARKIVKMTKQPAKKKPPPSREK
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 KAAKQLGFIMAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIYPLC
:... . :. :::. : :: .. .. .:: : . . . :: :::::.:: : ::
CCDS58 KVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVLINTFCAPCIPNTVWTIGYWLCYINSTINPACYALC
390 400 410 420 430 440
480
pF1KE9 NENFKKTFKRILHIRS
: .::::::..:
CCDS58 NATFKKTFKHLLMCHYKNIGATR
450 460
>>CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 (479 aa)
initn: 691 init1: 401 opt: 450 Z-score: 377.4 bits: 79.2 E(32554): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 669; 29.9% identity (61.0% similar) in 461 aa overlap (26-483:31-468)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MSLPNSSCLLEDKMCEGNKTTMASPQLMPLVVVLSTICLVTVGLNLLVLYAVRSE
... ...: ... :::: :.::. ... .
CCDS44 MANFTPVNGSSGNQSVRLVTSSSHNRYETVEMVFIATVTGSLSLVTVVGNILVMLSIKVN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 RKLHTVGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASI
:.:.::.: .. ::. ::::.:: : . .:.. . : :: .: .::..:::.:.::.
CCDS44 RQLQTVNNYFLFSLACADLIIGAFSMNLYTVYIIKGYWPLGAVVCDLWLALDYVVSNASV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 FSVFILCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSF-LWVIPILGWNHFMQQTSV
....:. .::: : .:: : :: :. : .:: ::: ::. :: :. . . .:
CCDS44 MNLLIISFDRYFCVTKPLTYPARRTTKMAGLMIAAAWVLSFVLWAPAILFWQFVVGKRTV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 RREDKCETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHC-QHRELINRSLPS
...: .: . ::: ::::...: .: .: : :.. .:: . .
CCDS44 P-DNQCFIQFLSNPAVTFGTAIAAFYLPVVIMTVLYIHISLASRSRVHKHRPEGPKEKKA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 FSEIKLRPENPKGDAKKPGKESPWEVLKRKPKDAGGGSVLKSPSQTPKEMKSPVVFSQED
. :. : ..::: : :. ... .. :.. ..: : . : .
CCDS44 KTLAFLKSPLMKQSVKKP---PPGEAAREELRN---GKLEEAP---PPALPPPPRPVADK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 DREVDKLYCFPLDIVHMQAAAEGSSRDYVAVNRSHGQLKTDEQGLNTHGASEISEDQMLG
: .. . .. . :.: :. . :.. . . ..:: ::. :. :..
CCDS44 DTSNESSSGSATQNTKERPATELSTTE--ATTPAMPAPPLQPRALNP--ASRWSKIQIVT
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 DSQSFSRTDSDTTTETAPGK-GKLRSGSNTGLDYIKFTWKRLRSHSRQYVSGLHMNRERK
. . .. :. : .:. . .: ..:.. . ... ...:.. ::... ::::
CCDS44 KQTG---NECVTAIEIVPATPAGMRPAANVARKFASIARNQVRKK-RQMAA-----RERK
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 AAKQLGFIMAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIYPLCN
... . :. :::: : :: .. .: .::..: . . . :: :.:::.:: : :::
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480
pF1KE9 ENFKKTFKRILHIRS
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CCDS44 ATFKKTFRHLLLCQYRNIGTAR
460 470
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480
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::. .: :
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pF1KE9 LCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSFLWVIPILGWNHFMQQTSVRREDKC
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CCDS50 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPP--PSQC
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CCDS50 TIQ-HDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKR----------------
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pF1KE9 PENPKGDAKKPGKESPWEVLKRKPKDAGGGSVLKSPSQTPKEMKSPVVFSQEDDREVDKL
CCDS50 ------------------------------------------------------------
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CCDS50 ---------------GSSRHLS--NRS-----TDSQ--NSFASCKLTQTFCVSD---FST
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pF1KE9 TDSDTTTETAPGKGKLRSGS-NTGLDYIKFTWKRLRSHSRQYVSGLHMNRERKAAKQLGF
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CCDS50 --SDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDH---------PGERQQISS---TRERKAARILGL
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pF1KE9 IMAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTF
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CCDS50 ILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAF
300 310 320 330 340 350
480
pF1KE9 KRILHIRS
:.... :
CCDS50 KKLIRCREHT
360
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10 20 30
pF1KE9 MSLPNSSCLLEDKMCEGNKTTMASPQLMPLVVVLS
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40 50 60 70 80 90
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CCDS49 LITLATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTL
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CCDS49 GQVVCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFS
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CCDS49 ISISLPPFFW----RQAKAEEEVSECVVNT-DHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIY
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CCDS49 TPNRTGKRL-------------------------------------------TRAQLITD
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CCDS49 -SDALLEKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDF
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pF1KE9 --WLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTFKRILHIRS
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CCDS49 FTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
360 370 380 390
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CCDS42 TNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVI
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CCDS42 AVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAN
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CCDS42 ETC-CDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQK---IDKSEGRFHVQ
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240 250 260 270 280 290
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CCDS42 NLSQVEQDGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLI
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CCDS43 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAVGLNRRLRN
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CCDS43 LTNCFIVSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFM
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CCDS43 SKCKVQVNEV--YGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHISSWKAATIRE
180 190 200 210 220
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]