Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9457
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9457, 1321 aa
1>>>pF1KE9457 1321 - 1321 aa - 1321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9121+/-0.00096; mu= 22.1237+/- 0.058
mean_var=128.4412+/-25.649, 0's: 0 Z-trim(109.5): 192 B-trim: 6 in 1/52
Lambda= 0.113168
statistics sampled from 10751 (10967) to 10751 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16
Scan time: 5.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33964.1 ADGRA3 gene_id:166647|Hs108|chr4 (1321) 8849 1457.3 0
CCDS6097.2 ADGRA2 gene_id:25960|Hs108|chr8 (1338) 3039 508.8 4.1e-143
CCDS41580.1 ADGRA1 gene_id:84435|Hs108|chr10 ( 560) 1237 214.1 8.3e-55
CCDS76362.1 ADGRA1 gene_id:84435|Hs108|chr10 ( 463) 906 160.0 1.4e-38
CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1059) 430 82.7 5.8e-15
CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1119) 430 82.7 6.1e-15
CCDS35409.1 ADGRG4 gene_id:139378|Hs108|chrX (3080) 431 83.4 1.1e-14
CCDS33783.1 LRIG1 gene_id:26018|Hs108|chr3 (1093) 375 73.7 3e-12
CCDS47491.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1193) 366 72.3 8.9e-12
CCDS47490.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1221) 366 72.3 9e-12
CCDS55064.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1222) 366 72.3 9e-12
CCDS47489.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1250) 366 72.3 9.1e-12
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 361 71.6 1.8e-11
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 358 71.1 2.6e-11
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 358 71.1 2.6e-11
CCDS46221.1 PXDN gene_id:7837|Hs108|chr2 (1479) 356 70.8 3.2e-11
>>CCDS33964.1 ADGRA3 gene_id:166647|Hs108|chr4 (1321 aa)
initn: 8849 init1: 8849 opt: 8849 Z-score: 7809.5 bits: 1457.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8849; 100.0% identity (100.0% similar) in 1321 aa overlap (1-1321:1-1321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEPPGRRRGRAQPPLLLPLSLLALLALLGGGGGGGAAALPAGCKHDGRPRGAGRAAGAAE
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CCDS33 MEPPGRRRGRAQPPLLLPLSLLALLALLGGGGGGGAAALPAGCKHDGRPRGAGRAAGAAE
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70 80 90 100 110 120
pF1KE9 GKVVCSSLELAQVLPPDTLPNRTVTLILSNNKISELKNGSFSGLSLLERLDLRNNLISSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GKVVCSSLELAQVLPPDTLPNRTVTLILSNNKISELKNGSFSGLSLLERLDLRNNLISSI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 DPGAFWGLSSLKRLDLTNNRIGCLNADIFRGLTNLVRLNLSGNLFSSLSQGTFDYLASLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DPGAFWGLSSLKRLDLTNNRIGCLNADIFRGLTNLVRLNLSGNLFSSLSQGTFDYLASLR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 SLEFQTEYLLCDCNILWMHRWVKEKNITVRDTRCVYPKSLQAQPVTGVKQELLTCDPPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLEFQTEYLLCDCNILWMHRWVKEKNITVRDTRCVYPKSLQAQPVTGVKQELLTCDPPLE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LPSFYMTPSHRQVVFEGDSLPFQCMASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDESQGIFVEKNMIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LPSFYMTPSHRQVVFEGDSLPFQCMASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDESQGIFVEKNMIH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 NCSLIASALTISNIQAGSTGNWGCHVQTKRGNNTRTVDIVVLESSAQYCPPERVVNNKGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NCSLIASALTISNIQAGSTGNWGCHVQTKRGNNTRTVDIVVLESSAQYCPPERVVNNKGD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 FRWPRTLAGITAYLQCTRNTHGSGIYPGNPQDERKAWRRCDRGGFWADDDYSRCQYANDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FRWPRTLAGITAYLQCTRNTHGSGIYPGNPQDERKAWRRCDRGGFWADDDYSRCQYANDV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 TRVLYMFNQMPLNLTNAVATARQLLAYTVEAANFSDKMDVIFVAEMIEKFGRFTKEEKSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TRVLYMFNQMPLNLTNAVATARQLLAYTVEAANFSDKMDVIFVAEMIEKFGRFTKEEKSK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 ELGDVMVDIASNIMLADERVLWLAQREAKACSRIVQCLQRIATYRLAGGAHVYSTYSPNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ELGDVMVDIASNIMLADERVLWLAQREAKACSRIVQCLQRIATYRLAGGAHVYSTYSPNI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 ALEAYVIKSTGFTGMTCTVFQKVAASDRTGLSDYGRRDPEGNLDKQLSFKCNVSNTFSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALEAYVIKSTGFTGMTCTVFQKVAASDRTGLSDYGRRDPEGNLDKQLSFKCNVSNTFSSL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 ALKNTIVEASIQLPPSLFSPKQKRELRPTDDSLYKLQLIAFRNGKLFPATGNSTNLADDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALKNTIVEASIQLPPSLFSPKQKRELRPTDDSLYKLQLIAFRNGKLFPATGNSTNLADDG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 KRRTVVTPVILTKIDGVNVDTHHIPVNVTLRRIAHGADAVAARWDFDLLNGQGGWKSDGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KRRTVVTPVILTKIDGVNVDTHHIPVNVTLRRIAHGADAVAARWDFDLLNGQGGWKSDGC
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730 740 750 760 770 780
pF1KE9 HILYSDENITTIQCYSLSNYAVLMDLTGSELYTQAASLLHPVVYTTAIILLLCLLAVIVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HILYSDENITTIQCYSLSNYAVLMDLTGSELYTQAASLLHPVVYTTAIILLLCLLAVIVS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 YIYHHSLIRISLKSWHMLVNLCFHIFLTCVVFVGGITQTRNASICQAVGIILHYSTLATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YIYHHSLIRISLKSWHMLVNLCFHIFLTCVVFVGGITQTRNASICQAVGIILHYSTLATV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 LWVGVTARNIYKQVTKKAKRCQDPDEPPPPPRPMLRFYLIGGGIPIIVCGITAAANIKNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LWVGVTARNIYKQVTKKAKRCQDPDEPPPPPRPMLRFYLIGGGIPIIVCGITAAANIKNY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 GSRPNAPYCWMAWEPSLGAFYGPASFITFVNCMYFLSIFIQLKRHPERKYELKEPTEEQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSRPNAPYCWMAWEPSLGAFYGPASFITFVNCMYFLSIFIQLKRHPERKYELKEPTEEQQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 RLAANENGEINHQDSMSLSLISTSALENEHTFHSQLLGASLTLLLYVALWMFGALAVSLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RLAANENGEINHQDSMSLSLISTSALENEHTFHSQLLGASLTLLLYVALWMFGALAVSLY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 YPLDLVFSFVFGATSLSFSAFFVVHHCVNREDVRLAWIMTCCPGRSSYSVQVNVQPPNSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YPLDLVFSFVFGATSLSFSAFFVVHHCVNREDVRLAWIMTCCPGRSSYSVQVNVQPPNSN
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 GTNGEAPKCPNSSAESSCTNKSASSFKNSSQGCKLTNLQAAAAQCHANSLPLNSTPQLDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GTNGEAPKCPNSSAESSCTNKSASSFKNSSQGCKLTNLQAAAAQCHANSLPLNSTPQLDN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 SLTEHSMDNDIKMHVAPLEVQFRTNVHSSRHHKNRSKGHRASRLTVLREYAYDVPTSVEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLTEHSMDNDIKMHVAPLEVQFRTNVHSSRHHKNRSKGHRASRLTVLREYAYDVPTSVEG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 SVQNGLPKSRLGNNEGHSRSRRAYLAYRERQYNPPQQDSSDACSTLPKSSRNFEKPVSTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SVQNGLPKSRLGNNEGHSRSRRAYLAYRERQYNPPQQDSSDACSTLPKSSRNFEKPVSTT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE9 SKKDALRKPAVVELENQQKSYGLNLAIQNGPIKSNGQEGPLLGTDSTGNVRTGLWKHETT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SKKDALRKPAVVELENQQKSYGLNLAIQNGPIKSNGQEGPLLGTDSTGNVRTGLWKHETT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE9 V
:
CCDS33 V
>>CCDS6097.2 ADGRA2 gene_id:25960|Hs108|chr8 (1338 aa)
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Smith-Waterman score: 3370; 43.6% identity (69.0% similar) in 1365 aa overlap (5-1321:4-1338)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MEPPGRRRGRAQPP-LLLPLS--LLALLALLGGGGGGGAAALPAGCKHDG-RPRG-AGRA
: :: :. : ::::: :: ::: . :. : .. .:: .: ::.: .: .
CCDS60 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSI-RSCKCSGERPKGLSGGV
10 20 30 40 50
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pF1KE9 AGAAEGKVVCSSLELAQVLPPDTLPNRTVTLILSNNKISELKNGSFSGLSLLERLDLRNN
: :. .::::. .: . : ::: ::::.::::::. :.:::: ::::::.::::::
CCDS60 PGPARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LISSIDPGAFWGLSSLKRLDLTNNRIGCLNADIFRGLTNLVRLNLSGNLFSSLSQGTFDY
.::...:::: ::. ::::::.:::::::... :.:: :.:::.:::.::::. :.::
CCDS60 IISTVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 LASLRSLEFQTEYLLCDCNILWMHRWVKEKNITVRD-TRCVYPKSLQAQPVTGVKQELLT
: .:. ... ::.: :::.. :. :...... . . : :.::..:.:: . .... :
CCDS60 LPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 CDPPLELPSFYMTPSHRQVVFEGDSLPFQCMASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDESQGIFV
:. ::: . .. :: :::::.:: ::::: :::. .: .. ::.. :: ::. ::..
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240 250 260 270 280 290
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...::.:..:.: ::.:.: . ..:.: : :. .:: .. :.:::::.::.::: :::
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300 310 320 330 340 350
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.::.::::::::::::::: .: . : :. : : :::::.: : :::.:
CCDS60 ANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTR-ASRRCDRAGRWEPGDYSHC
360 370 380 390 400 410
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pF1KE9 QYANDVTRVLYMFNQMPLNLTNAVATARQLLAYTVEAANFSDKMDVIFVAEMIEKFGRFT
:.::.::::: : ::.: .::.. :.:: .::.:::.::: :::..::.::.:: ..
CCDS60 LYTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYV
420 430 440 450 460 470
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pF1KE9 KEEKSKELGDVMVDIASNIMLADERVLWLAQREAKACSRIVQCLQRIATYRLAGGAHVYS
.. ::: .::::.:::.::.::..::::::: ::::::: :.::. :. :. :
CCDS60 --DQIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERIGGAALSPHAQHIS
480 490 500 510 520 530
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pF1KE9 TYSPNIALEAYVIKSTGFTGMTCTVFQKVAAS---DRTGLSDYGRR-DPEGNLDKQLSFK
. . :.:::::.:: ...:.:::.::. .. : : . .:: :.:: :.
CCDS60 VNARNVALEAYLIKPHSYVGLTCTAFQRREGGVPGTRPGSPGQNPPPEPEPPADQQLRFR
540 550 560 570 580 590
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pF1KE9 CNVSN---TFSSLALKNTIVEASIQLPPSLFSPKQKRELRPTDDSLYKLQLIAFRNGKLF
:... ..::. .::... ::::::::::: . : : :::..::::.::
CCDS60 CTTGRPNVSLSSFHIKNSVALASIQLPPSLFS-SLPAALAPPVPPDCTLQLLVFRNGRLF
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pF1KE9 PATGNST--NLADDGKRRTVVTPVILTKIDGVNVDTHHIPVNVTLRRIAHGADAVAARWD
. .:.. . : :::: :.::::.. .: .: . :: :.::. :.::. ::: :.
CCDS60 HSHSNTSRPGAAGPGKRRGVATPVIFAGTSGCGVGNLTEPVAVSLRHWAEGAEPVAAWWS
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pF1KE9 FDLLNGQGGWKSDGCHILYSDENITTIQCYSLSNYAVLMDLTG-SELYTQAASLLHPVVY
. . ::: :.::.. :. :.....: :.: ::::.:.. . :.. ::::::
CCDS60 QEGPGEAGGWTSEGCQLRSSQPNVSALHCQHLGNVAVLMELSAFPREVGGAGAGLHPVVY
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pF1KE9 TTAIILLLCLLAVIVSYIYHHSLIRISLKSWHMLVNLCFHIFLTCVVFVGGITQTRNASI
. .:::::.:.:..:: .:: ::.: :.::::.:::::: .: .::.:::: : .
CCDS60 PCTALLLLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNYQMV
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pF1KE9 CQAVGIILHYSTLATVLWVGVTARNIYKQVTKKAKRCQDPDEPPPPPRPMLRFYLIGGGI
:::::: ::::.:.:.::.:: :: ..:..: .: :. : : : ::::::::.:::
CCDS60 CQAVGITLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGDPALPTPSPMLRFYLIAGGI
840 850 860 870 880 890
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pF1KE9 PIIVCGITAAANIKNYGSRPNAPYCWMAWEPSLGAFYGPASFITFVNCMYFLSIFIQLK-
:.:.::::::.::.:: : ..::::..:.::::::: :...: ... .::: ..:.
CCDS60 PLIICGITAAVNIHNY--RDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALILLITWIYFLCAGLRLRG
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990
pF1KE9 ---RHPE---RKYELKEPTEEQQRLAANENGEINHQDSMSLSLISTSAL-------ENEH
..:. . :. : . .: . .:: :: : . :: :.
CCDS60 PLAQNPKAGNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPL-LSDSGSL-LATGSARVGTPGPPEDGD
960 970 980 990 1000 1010
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE9 TFHSQ--LLGASLTL-LLYVALWMFGALAVSLYYPLDLVFSFVFGATSLSFSAFFVVHHC
...: ::: .: .::.:.: :::::: . .: : ..:... ... : .:::
CCDS60 SLYSPGVQLGALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYGVAASALGLFVFTHHC
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE9 VNREDVRLAWIMTCCPGRSSYSVQVNVQPPNSNGTNGE-APKCPNSSAESSCTNKSASSF
. :.::: .: .::: : . .. :: . . .: . . . : .. :.::
CCDS60 ARRRDVRASW-RACCPPASPAAPHA---PPRALPAAAEDGSPVFGEGPPSLKSSPSGSSG
1080 1090 1100 1110 1120
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE9 KNSSQG-CKLTNLQAAAAQ-CHANSLPLNSTPQLDNSLTEHSMDNDIKMHVAPLEVQFRT
. . : ::::::: : .: :.:.. .. . . . :. .. : : .:.
CCDS60 HPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGA-AAGGEGEPEPAGTRGNL-----AHRHPNNVH---
1130 1140 1150 1160 1170
1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE9 NVHSSRHHKNRSKGHRA------SRLTVLR---EYAYDVPTSVEGSVQNGLPKSRLGNNE
:. : ::.:.::::: .:: .:: : .. .: ::..:. : ::...
CCDS60 --HGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALELLSSESGSLHNSPTDSYLGSSR
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE9 GHSRSRRAYLAYRERQYNPPQQDSSDACSTLPKSSRNFEKPVSTTSKKDALRKPAVVELE
. : : : . . . :.. :. . . : ...: .. ....:.:. ...: :
CCDS60 N---SPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQR---RSASRDSLKGGGALEKE
1240 1250 1260 1270 1280
1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE9 NQQKSYGLNLAIQNGPIKSNGQEG-PLLGTD--STGNVRTGLWKHETTV
....:: :: : :: :.. . :.:.. : : ..::::: ::::
CCDS60 SHRRSYPLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWKSETTV
1290 1300 1310 1320 1330
>>CCDS41580.1 ADGRA1 gene_id:84435|Hs108|chr10 (560 aa)
initn: 1386 init1: 661 opt: 1237 Z-score: 1097.4 bits: 214.1 E(32554): 8.3e-55
Smith-Waterman score: 1438; 43.1% identity (66.6% similar) in 587 aa overlap (744-1321:1-560)
720 730 740 750 760 770
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::: : : . .::::::. . ..::
CCDS41 MDLKTVLSLPRYPGEFLHPVVYACTAVMLL
10 20 30
780 790 800 810 820 830
pF1KE9 CLLAVIVSYIYHHSLIRISLKSWHMLVNLCFHIFLTCVVFVGGITQTRNASICQAVGIIL
:::: .:.:: :.: :::: :. : :.:.::: :: .::.:::..:. .::::::.:
CCDS41 CLLASFVTYIVHQSAIRISRKGRHTLLNFCFHAALTFTVFAGGINRTKYPILCQAVGIVL
40 50 60 70 80 90
840 850 860 870 880 890
pF1KE9 HYSTLATVLWVGVTARNIYKQVTKKAKRCQDPDEPPPPPRPMLRFYLIGGGIPIIVCGIT
:::::.:.::.::::::::::::::: : : :.:: : .:.:::::..::.:.:.::.:
CCDS41 HYSTLSTMLWIGVTARNIYKQVTKKAPLCLDTDQPPYPRQPLLRFYLVSGGVPFIICGVT
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CCDS41 AATNIRNYGTEDEDTAYCWMAWEPSLGAFYGPAAIITLVTCVYFLGTYVQLRRHPGRRYE
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pF1KE9 LKEPTEEQQRLAANENGE-INHQDSMSLSLISTSALENEHTFHSQLLGASLTLLLYVALW
:. :::.:::. :.:. : . . ..:.:.:::.:..:: .:..::.:..: :
CCDS41 LRTQPEEQRRLATPEGGRGIRPGTPPAHDAPGASVLQNEHSFQAQLRAAAFTLFLFTATW
220 230 240 250 260 270
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE9 MFGALAVSLYYPLDLVFSFVFGATSLSFSAFFVVHHCVNREDVRLAWIMTCCPGRSSYSV
::::::: . ::.::: ..:: .... : ..:::..:::: : .::: :.
CCDS41 AFGALAVSQGHFLDMVFSCLYGAFCVTLGLFVLIHHCAKREDVWQCW-WACCPPRK----
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...: ..::. : .: . .. .: . ::.::::: :: ::.
CCDS41 --DAHPALDANGAALGRAACLHSPGLGQ-----PRGFAHPPGPCKMTNLQA--AQGHASC
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pF1KE9 LPLNSTPQLDNSLTEHSMDNDIKMHVAPLEVQFRTNVHSSRHHKNRSKGHRASRLTVLR-
: .:: . : .. ..:. : : . : ..:.: :: . .
CCDS41 LS-PATPCCAKMHCEPLTADEAHVHLQE-EGAFGHDPHLHGCLQGRTKPPYFSRHPAEEP
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:::: .:.:..:: ... : : : . : :. . . .: .:.: :
CCDS41 EYAYHIPSSLDGSPRSSRTDSPPSSLDGPAGTHTLACCTQGDPFPMVTQPEGSDGSPALY
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pF1KE9 TLPKSSRNFEKPVSTTSKKDALRKPAVVELENQQKSYGLNLAIQNGPIKSNGQEGPLLGT
. : : ..: :. .:. . .: .. ::: :.. :: .::
CCDS41 SCP-----------TQPGREAALGPGHLEMLRRTQSLPFGGPSQNGLPKGKLLEGLPFGT
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1310 1320
pF1KE9 DSTGNVRTGLWKHETTV
:.:::.::: ::.::::
CCDS41 DGTGNIRTGPWKNETTV
550 560
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: .:.:::::..::.:.:.::.:::.::.:::.. .. :::::::::::::::::..::
CCDS76 PRQPLLRFYLVSGGVPFIICGVTAATNIRNYGTEDEDTAYCWMAWEPSLGAFYGPAAIIT
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pF1KE9 FVNCMYFLSIFIQLKRHPERKYELKEPTEEQQRLAANENGE-INHQDSMSLSLISTSALE
.:.:.:::. ..::.::: :.:::. :::.:::. :.:. : . . ..:.:.
CCDS76 LVTCVYFLGTYVQLRRHPGRRYELRTQPEEQRRLATPEGGRGIRPGTPPAHDAPGASVLQ
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pF1KE9 NEHTFHSQLLGASLTLLLYVALWMFGALAVSLYYPLDLVFSFVFGATSLSFSAFFVVHHC
:::.:..:: .:..::.:..: : ::::::: . ::.::: ..:: .... : ..:::
CCDS76 NEHSFQAQLRAAAFTLFLFTATWAFGALAVSQGHFLDMVFSCLYGAFCVTLGLFVLIHHC
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..:::: : .::: :. ...: ..::. : .: . .. .:
CCDS76 AKREDVWQCW-WACCPPRK------DAHPALDANGAALGRAACLHSPGLGQ-----PRGF
220 230 240 250
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. ::.:::::: : ::. : .:: . : .. ..:. : : .
CCDS76 AHPPGPCKMTNLQAA--QGHASCLS-PATPCCAKMHCEPLTADEAHVHLQE-EGAFGHDP
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pF1KE9 HSSRHHKNRSKGHRASRLTVLR-EYAYDVPTSVEGSVQNGLPKSRLGNNEGHSRSRRAYL
: ..:.: :: . . :::: .:.:..:: ... : .. .: . .. :
CCDS76 HLHGCLQGRTKPPYFSRHPAEEPEYAYHIPSSLDGSPRSSRTDSPPSSLDGPAGTHT--L
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: : .: : : ..::. .: . : : ..: :. .:. . .:
CCDS76 AC-CTQGDPFPMVTQPEGSDGSPAL------YSCP--TQPGREAALGPGHLEMLRRTQSL
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pF1KE9 GLNLAIQNGPIKSNGQEGPLLGTDSTGNVRTGLWKHETTV
.. ::: :.. :: .:::.:::.::: ::.::::
CCDS76 PFGGPSQNGLPKGKLLEGLPFGTDGTGNIRTGPWKNETTV
430 440 450 460
>>CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1059 aa)
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Smith-Waterman score: 430; 31.1% identity (66.1% similar) in 254 aa overlap (85-333:279-530)
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CCDS44 NEISWTIEDMNGAFSGLDKLRRLILQGNRIRSITKKAFTGLDALEHLDLSDNAIMSLQGN
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.:. . .:..:...: :::::.. :. .:: :.:. . .. :..:. :... . .:.
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. ..:: . :.. . : . : ...:..: : : :: :. : : .:..... :
CCDS44 DGFVCDD-FPKPQITVQP-ETQSAIKGSNLSFICSAASSSDSPMTFAWKKDNELLHDAEM
430 440 450 460 470 480
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.. . . . .. : . ... .: :.. : .... :..
CCDS44 ENYAHLRAQGGEVMEYTTILRLREVEFASEGKYQCVISNHFGSSYSVKAKLTVNMLPSFT
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CCDS44 KTPMDLTIRAGAMARLECAAVGHPAPQIAWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIVDV
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CCDS89 FCQKLSELDLTFNHLSRLDDSSFLGLSLLNTLHIGNNRVSYIADCAFRGLSSLKTLDLKN
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: :: .:. ::: ::..:.:: : .::: .. : :: : .:.:: : . ::. .
CCDS89 NEISWTIEDMNGAFSGLDKLRRLILQGNRIRSITKKAFTGLDALEHLDLSDNAIMSLQGN
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.:. . .:..:...: :::::.. :. .:: :.:. . .. :..:. :... . .:.
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. ..:: . :.. . : . : ...:..: : : :: :. : : .:..... :
CCDS89 DGFVCDD-FPKPQITVQP-ETQSAIKGSNLSFICSAASSSDSPMTFAWKKDNELLHDAEM
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.. . . . .. : . ... .: :.. : .... :..
CCDS89 ENYAHLRAQGGEVMEYTTILRLREVEFASEGKYQCVISNHFGSSYSVKAKLTVNMLPSFT
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CCDS89 KTPMDLTIRAGAMARLECAAVGHPAPQIAWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIVDV
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CCDS35 SEEEMVMDRAILEQREGQEMATISYVPYSCVCQVIIKASSSLASSELMRKIKSKIHGNFT
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: .: . . ..: . : ...... :: ..: : :: .: .:
CCDS35 HGNFTQDQLTLLVNCEHVAVKKLEPGNCKADETASKYKGTYKWLLTNPTETAQTRCIKNE
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:. : : : . : . : ...:. ... . . .. ..
CCDS35 DGN------------ATRFCSISINTGKSQWEKPKFKQCKLLQELPDKIVDLANITISDE
2420 2430 2440 2450 2460
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:: .:...: :. .. . :.:. :.. ... .: : .: ::..: :..
CCDS35 NAEDVAEHILNLINESPALGKEETKIIVS----KISDISQCDEISMNLTHVMLQII-NVV
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: :. :. . ..:.. ..: . ... .... . ..:: : . . : :
CCDS35 L--EKQNNSASDLHEISNEILRIIERTG-HKMEFSGQIANLTVAGLAL-AVLRGDHTFDG
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:. .. : . : ::: : :: . ::: ::
CCDS35 MAFSIH-----SYEEGT------DPE-------IFLGNVPVG---------GILASIYLP
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:: : : : .:: : :: :... . . ....: :. ..:
CCDS35 KSL------TERIP----LSNLQTI------LFNFFGQTSLFKTKNVTKALTTYVVSASI
2620 2630 2640 2650
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pF1KE9 -DGVNVDTHHIPVNVTLRRIAHGAD---AVAARWDFDLLNGQGGWKSDGCHILYSDENIT
: . ... :: .::..:. . . . : :::. :: :::.:.::.. .. : :
CCDS35 SDDMFIQNLADPVVITLQHIGGNQNYGQVHCAFWDFENNNGLGGWNSSGCKVKETNVNYT
2660 2670 2680 2690 2700 2710
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pF1KE9 TIQCYSLSNYAVLMDLTGSELYTQAASLLHPVVYTTAIILLLCLLAVIVSYIYHHSLIRI
:: :....:::::. : . . ..: ..:: : . : ...:.:: :.: :
CCDS35 ICQCDHLTHFGVLMDLSRSTVDSVNEQILALITYTGCGISSIFLGVAVVTYIAFHKL-RK
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. . ..:.::: ... .::. . ... .....: .... ::: :.. :.:. :
CCDS35 DYPA-KILINLCTALLMLNLVFLINSWLSSFQKVGVCITAAVALHYFLLVSFTWMGLEAV
2780 2790 2800 2810 2820 2830
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pF1KE9 NIYKQVTKKAKRCQDPDEPPPPPRPMLRFYLIGGGIPIIVCGITAAANIKNYGS-RPNAP
..: ..: . : .:.: :.: ::: :. .::.... ::. :..:
CCDS35 HMYLALVKVFN--------IYIPNYILKFCLVGWGIPAIMVAITVSVKKDLYGTLSPTTP
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pF1KE9 YCWMAWEPSLGAFYGPASF--ITFVNCMYFLSIFIQLKRHPERKYELKEPTEEQQRLAAN
.::. . :. . : : : ..: .: ....::. .: .. .:
CCDS35 FCWIK-DDSIFYISVVAYFCLIFLMNLSMFCTVLVQLNS-------VKSQIQKTRRKM--
2890 2900 2910 2920 2930
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pF1KE9 ENGEINHQDSMSLSLISTSALENEHTFHSQLLGASLTLLLYVALWMFGALAVSLYYPLDL
: :. . ..:: :: ::: :: : :. .: . :.
CCDS35 ----ILHDLKGTMSL----------TF---LLG--LT-------WGFAFFA---WGPMRN
2940 2950 2960
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pF1KE9 VFSFVFGATSLSFSAFFV-VHHCVNREDVRLAW-IMTCCPGRSSYSVQVNVQPPNSNGTN
: ..:. . ....::. : ::: .:.:: : : ::
CCDS35 FFLYLFAIFN-TLQGFFIFVFHCVMKESVREQWQIHLCCGWLRLDNSSDGSSRCQIKVGY
2970 2980 2990 3000 3010 3020
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pF1KE9 GEAPKCPNSSAESSCTNKSASSFKNSSQGCKLTNLQAAAAQCHANSLPLNSTPQLDNSLT
CCDS35 KQEGLKKIFEHKLLTPSLKSTATSSTFKSLGSAQGTPSEISFPNDDFDKDPYCSSP
3030 3040 3050 3060 3070 3080
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Smith-Waterman score: 375; 30.4% identity (62.8% similar) in 253 aa overlap (86-332:336-585)
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 AGAAEGKVVCSSLELAQVLPPDTLPNRTVTLILSNNKISELKNGSFSGLSLLERLDLRNN
: ::.:.::.. .:.:.:: :. ::: .:
CCDS33 CQKLHELVLSFNNLTRLDEESLAELSSLSVLRLSHNSISHIAEGAFKGLRSLRVLDLDHN
310 320 330 340 350 360
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LIS-SIDP--GAFWGLSSLKRLDLTNNRIGCLNADIFRGLTNLVRLNLSGNLFSSLSQGT
:: .:. ::: ::.::..: : .:.: . : :: .: .:::.:: . :.. .
CCDS33 EISGTIEDTSGAFSGLDSLSKLTLFGNKIKSVAKRAFSGLEGLEHLNLGGNAIRSVQFDA
370 380 390 400 410 420
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 FDYLASLRSLEFQTEYLLCDCNILWMHRWVKEKNITVRDT-RCVYPKSLQAQPVTGVKQE
: . .:. :..... .::::.. :. :. . . . : :..:.::..: . .: :
CCDS33 FVKMKNLKELHISSDSFLCDCQLKWLPPWLIGRMLQAFVTATCAHPESLKGQSIFSVPPE
430 440 450 460 470 480
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 LLTCDPPLELPSFYMTPSHRQVVFEGDSLPFQC-MASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDESQ
..:: :. :.. : . ... : .. : : :: .. : : .:.... :. ..
CCDS33 SFVCDDFLK-PQIITQP-ETTMAMVGKDIRFTCSAASSSSSPMTFAWKKDNEVL-TNADM
490 500 510 520 530 540
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pF1KE9 GIFVEKNMIHNCSL-IASALTISNIQAGSTGNWGCHVQTKRGNNTRTVDIVVLESSAQYC
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CCDS33 ENFVHVHAQDGEVMEYTTILHLRQVTFGHEGRYQCVITNHFGSTYSHKARLTVNVLPSFT
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