Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9456
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9456, 695 aa
1>>>pF1KE9456 695 - 695 aa - 695 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8575+/-0.00134; mu= 17.3452+/- 0.079
mean_var=84.9066+/-17.509, 0's: 0 Z-trim(101.5): 89 B-trim: 237 in 1/50
Lambda= 0.139189
statistics sampled from 6440 (6530) to 6440 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4922.2 ADGRF4 gene_id:221393|Hs108|chr6 ( 695) 4548 924.1 0
CCDS34471.1 ADGRF1 gene_id:266977|Hs108|chr6 ( 910) 1328 277.6 5.6e-74
CCDS4919.1 ADGRF5 gene_id:221395|Hs108|chr6 (1346) 1186 249.2 3e-65
CCDS33159.2 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 ( 873) 793 170.2 1.2e-41
CCDS46238.1 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 ( 997) 793 170.2 1.3e-41
CCDS46239.1 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 (1079) 785 168.6 4.3e-41
CCDS55377.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 987) 429 97.1 1.3e-19
CCDS55376.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 993) 429 97.1 1.3e-19
CCDS43921.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 995) 429 97.1 1.3e-19
CCDS55378.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1001) 429 97.1 1.3e-19
CCDS43922.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1003) 429 97.1 1.3e-19
CCDS14191.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1014) 429 97.1 1.4e-19
CCDS43923.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1017) 429 97.1 1.4e-19
CCDS55379.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 966) 425 96.3 2.3e-19
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 405 92.2 3.4e-18
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 405 92.2 3.5e-18
CCDS47491.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1193) 397 90.7 1.3e-17
CCDS47490.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1221) 397 90.7 1.4e-17
CCDS55064.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1222) 397 90.7 1.4e-17
CCDS47489.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1250) 397 90.7 1.4e-17
CCDS35409.1 ADGRG4 gene_id:139378|Hs108|chrX (3080) 402 92.0 1.4e-17
CCDS82926.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1240) 392 89.7 2.7e-17
CCDS54768.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1469) 392 89.8 3.2e-17
CCDS58643.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 709) 366 84.4 6.5e-16
CCDS58646.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 745) 366 84.4 6.8e-16
CCDS12175.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 886) 366 84.4 7.8e-16
CCDS81345.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1416) 341 79.5 3.7e-14
CCDS32931.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 742) 326 76.3 1.8e-13
CCDS32930.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 786) 326 76.3 1.8e-13
CCDS76174.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1123) 328 76.8 1.9e-13
CCDS32929.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 835) 326 76.4 1.9e-13
CCDS72811.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1177) 328 76.9 1.9e-13
CCDS689.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1403) 328 76.9 2.2e-13
CCDS41352.1 ADGRL4 gene_id:64123|Hs108|chr1 ( 690) 323 75.7 2.5e-13
CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584) 315 74.3 1.5e-12
CCDS74297.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 600) 303 71.7 3.6e-12
CCDS12315.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 652) 303 71.7 3.9e-12
CCDS74296.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 526) 301 71.2 4.3e-12
CCDS12307.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1469) 305 72.3 5.7e-12
CCDS32928.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1474) 305 72.3 5.7e-12
CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1551) 305 72.3 6e-12
CCDS32935.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 823) 289 68.9 3.3e-11
>>CCDS4922.2 ADGRF4 gene_id:221393|Hs108|chr6 (695 aa)
initn: 4548 init1: 4548 opt: 4548 Z-score: 4937.8 bits: 924.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4548; 100.0% identity (100.0% similar) in 695 aa overlap (1-695:1-695)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MKMKSQATMICCLVFFLSTECSHYRSKIHLKAGDKLQSPEGKPKTGRIQEKCEGPCISSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MKMKSQATMICCLVFFLSTECSHYRSKIHLKAGDKLQSPEGKPKTGRIQEKCEGPCISSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 NCSQPCAKDFHGEIGFTCNQKKWQKSAETCTSLSVEKLFKDSTGASRLSVAAPSIPLHIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 NCSQPCAKDFHGEIGFTCNQKKWQKSAETCTSLSVEKLFKDSTGASRLSVAAPSIPLHIL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 DFRAPETIESVAQGIRKNCPFDYACITDMVKSSETTSGNIAFIVELLKNISTDLSDNVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 DFRAPETIESVAQGIRKNCPFDYACITDMVKSSETTSGNIAFIVELLKNISTDLSDNVTR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 EKMKSYSEVANHILDTAAISNWAFIPNKNASSDLLQSVNLFARQLHIHNNSENIVNELFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 EKMKSYSEVANHILDTAAISNWAFIPNKNASSDLLQSVNLFARQLHIHNNSENIVNELFI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 QTKGFHINHNTSEKSLNFSMSMNNTTEDILGMVQIPRQELRKLWPNASQAISIAFPTLGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 QTKGFHINHNTSEKSLNFSMSMNNTTEDILGMVQIPRQELRKLWPNASQAISIAFPTLGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 ILREAHLQNVSLPRQVNGLVLSVVLPERLQEIILTFEKINKTRNARAQCVGWHSKKRRWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 ILREAHLQNVSLPRQVNGLVLSVVLPERLQEIILTFEKINKTRNARAQCVGWHSKKRRWD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 EKACQMMLDIRNEVKCRCNYTSVVMSFSILMSSKSMTDKVLDYITCIGLSVSILSLVLCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 EKACQMMLDIRNEVKCRCNYTSVVMSFSILMSSKSMTDKVLDYITCIGLSVSILSLVLCL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 IIEATVWSRVVVTEISYMRHVCIVNIAVSLLTANVWFIIGSHFNIKAQDYNMCVAVTFFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 IIEATVWSRVVVTEISYMRHVCIVNIAVSLLTANVWFIIGSHFNIKAQDYNMCVAVTFFS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 HFFYLSLFFWMLFKALLIIYGILVIFRRMMKSRMMVIGFAIGYGCPLIIAVTTVAITEPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 HFFYLSLFFWMLFKALLIIYGILVIFRRMMKSRMMVIGFAIGYGCPLIIAVTTVAITEPE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 KGYMRPEACWLNWDNTKALLAFAIPAFVIVAVNLIVVLVVAVNTQRPSIGSSKSQDVVII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KGYMRPEACWLNWDNTKALLAFAIPAFVIVAVNLIVVLVVAVNTQRPSIGSSKSQDVVII
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 MRISKNVAILTPLLGLTWGFGIATLIEGTSLTFHIIFALLNAFQGFFILLFGTIMDHKIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MRISKNVAILTPLLGLTWGFGIATLIEGTSLTFHIIFALLNAFQGFFILLFGTIMDHKIR
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE9 DALRMRMSSLKGKSRAAENASLGPTNGSKLMNRQG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 DALRMRMSSLKGKSRAAENASLGPTNGSKLMNRQG
670 680 690
>>CCDS34471.1 ADGRF1 gene_id:266977|Hs108|chr6 (910 aa)
initn: 1109 init1: 603 opt: 1328 Z-score: 1441.6 bits: 277.6 E(32554): 5.6e-74
Smith-Waterman score: 1365; 37.9% identity (69.8% similar) in 630 aa overlap (65-681:274-868)
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 KLQSPEGKPKTGRIQEKCEGPCISSSNCSQPCAKDFHGEIGFTCNQKKWQKSAETCTSLS
::.. ..:.: :... :: :::.
CCDS34 LEDGSFRVFGKAQCNDIVFGFGSKDDEYTLPCSSGYRGNITAKCESSGWQVIRETCVLSL
250 260 270 280 290 300
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 VEKLFKDSTGASRLSVAAPSIPLHILDFRAPETIESVAQGIRKNCPFDYACITDMVKSSE
.:.: :. . ... . . .: ..... ::.: :
CCDS34 LEELNKNFS-----MIVGNATEAAVSSF-----VQNLSVIIRQN-P-------------S
310 320 330
160 170 180 190 200
pF1KE9 TTSGNIAFIVELLKNIST-DLSDN--VTREKMKSYSEVANHILDTAAISNWAFI--PNKN
:: ::.: .: .:.:::. .:... :. :.. .:..::..:...::. . .:
CCDS34 TTVGNLASVVSILSNISSLSLASHFRVSNSTMEDVISIADNILNSASVTNWTVLLREEKY
340 350 360 370 380 390
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 ASSDLLQSVNLFARQLHIHNNSENIVNELFIQTKGFHINHNTSEKSLNFSMSM--NNTTE
::: ::.... .. . :. . ::. ::. .:.. ... .....: .::.
CCDS34 ASSRLLETLENISTLVPPTALPLNFSRK-FIDWKGIPVNKSQLKRGYSYQIKMCPQNTSI
400 410 420 430 440 450
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 DILGMVQIPRQELRKLWPNASQAISIAFPTLGAILREAHLQNVSLPRQVNGLVLSVVLPE
: : : : ..... :.. ::.: ::: :: .. :. :::: :.:.:. .
CCDS34 PIRGRVLIGSDQFQRSLPET--IISMASLTLGNILPVSKNGNA----QVNGPVISTVIQN
460 470 480 490 500 510
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 R-LQEIILTFEKINKTRNARAQCVGWHSKKRRWDEKACQMMLDIRNEVKCRCNYTSVVMS
..:..: : :: .. .. .:: : .. .:.. .:... . .. : :.:.. . :
CCDS34 YSINEVFLFFSKI-ESNLSQPHCVFWDFSHLQWNDAGCHLVNETQDIVTCQCTHLT---S
520 530 540 550 560
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 FSILMSS--KSMTDKVLDYITCIGLSVSILSLVLCLIIEATVWSRVVVTEISYMRHVCIV
:::::: : :. .:: .::..:: ::.::::::: :... .. :. :..:.:
CCDS34 FSILMSPFVPSTIFPVVKWITYVGLGISIGSLILCLIIEALFWKQIKKSQTSHTRRICMV
570 580 590 600 610 620
450 460 470 480 490 500
pF1KE9 NIAVSLLTANVWFIIGSHFNIKAQDYNMCVAVTFFSHFFYLSLFFWMLFKALLIIYGILV
:::.::: :.::::.:. . .. ..:.:..::.::::::::::::. ..:. : :..
CCDS34 NIALSLLIADVWFIVGATVDTTVNPSGVCTAAVFFTHFFYLSLFFWMLMLGILLAYRIIL
630 640 650 660 670 680
510 520 530 540 550 560
pF1KE9 IFRRMMKSRMMVIGFAIGYGCPLIIAVTTVAITEPEKGYMRPEACWLNWDN-TKALLAFA
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CCDS34 VFHHMAQHLMMAVGFCLGYGCPLIISVITIAVTQPSNTYKRKDVCWLNWSNGSKPLLAFV
690 700 710 720 730 740
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 IPAFVIVAVNLIVVLVVAVNTQRPSIGSSKSQD-VVIIMRISKNVAILTPLLGLTWGFGI
.::..:::::..:::.: .. ::..: :.: . :.:..:.. ::::::::::::::
CCDS34 VPALAIVAVNFVVVLLVLTKLWRPTVGERLSRDDKATIIRVGKSLLILTPLLGLTWGFGI
750 760 770 780 790 800
630 640 650 660 670 680
pF1KE9 ATLIEGTSLTFHIIFALLNAFQGFFILLFGTIMDHKIRDALRMRMSSLKG-KSRAAENAS
.:.... .:..:.:::::::::::::: :: ..: :.:. : ..:.:.. :. .:.:
CCDS34 GTIVDSQNLAWHVIFALLNAFQGFFILCFGILLDSKLRQLLFNKLSALSSWKQTEKQNSS
810 820 830 840 850 860
690
pF1KE9 LGPTNGSKLMNRQG
CCDS34 DLSAKPKFSKPFNPLQNKGHYAFSHTGDSSDNIMLTQFVSNE
870 880 890 900 910
>>CCDS4919.1 ADGRF5 gene_id:221395|Hs108|chr6 (1346 aa)
initn: 1051 init1: 454 opt: 1186 Z-score: 1285.0 bits: 249.2 E(32554): 3e-65
Smith-Waterman score: 1242; 34.8% identity (64.6% similar) in 706 aa overlap (5-685:635-1299)
10 20 30
pF1KE9 MKMKSQATMICCLVFFLSTECSHYRS---KIHLK
:... .:: : .. . : :..:
CCDS49 GSSSLPAAKEVNKKQVCYKHNFNASSVSWCSKTVDVCC--HFTNAANNSVWSPSMKLNLV
610 620 630 640 650 660
40 50 60 70 80
pF1KE9 AGDKL--QSPE-GKPKTGR-IQEKCEGPCISSSNCSQPCAKDFHGEIGFTCNQKKWQKSA
:... :.: : . :. ::. :. . :: : : . : : . : ..:...
CCDS49 PGENITCQDPVIGVGEPGKVIQKLCRFSNVPSSPES-PIG----GTITYKCVGSQWEEKR
670 680 690 700 710
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 ETCTSLSVEKLFKDSTGASRLSVAAPSIPLHILDFRAPETIESVAQGIRKNCPFDYACIT
. : : ...:.. .. . .:: : : ..... .: :
CCDS49 NDCISAPINSLLQ----MAKALIKSPS-----QDEMLPTYLKDLSISIDKA--------E
720 730 740 750 760
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 DMVKSSETTSGNIAFIVELLKNISTDLSDNVTREKMKSYSEVANHILDTAAISNWAFIPN
..:: . : : :..::... :. :. : : ..: :: ....: . .
CCDS49 HEISSSPGSLGAIINILDLLSTVPTQ----VNSEMMTHVLSTVNVILGKPVLNTWKVLQQ
770 780 790 800 810
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 K--NASSDLLQSVNLFARQLHIHNNSENIVNELFIQTKGFHINHNTSEKSLNFSMSMNNT
. : ::.::.::. :.. :. .. .. .: ... :. . : .... .
CCDS49 QWTNQSSQLLHSVERFSQALQSGDSPPLSFSQTNVQMSSMVIKSSHPE---TYQQRFVFP
820 830 840 850 860 870
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 TEDILGMVQIPRQELRKLWPNASQAISIAFPTLGAILREAHLQNVSLPRQVNGLVLS--V
:. : : : .. :..: ..: ...::::: ::: . .: : ..: .
CCDS49 YFDLWGNVVIDKSYLENLQSDSS-IVTMAFPTLQAILAQDIQENNFAESLVMTTTVSHNT
880 890 900 910 920 930
330 340 350 360 370
pF1KE9 VLPERLQEIILTFEKINKTRNARAQCVGWHSKKRR----WDEKACQMMLDIRNEVKCRCN
..: :.. .:: : :. .....:: :. . :: ..: . ..: : :.
CCDS49 TMPFRIS---MTF-KNNSPSGGETKCVFWNFRLANNTGGWDSSGCYVEEGDGDNVTCICD
940 950 960 970 980
380 390 400 410 420 430
pF1KE9 YTSVVMSFSILMSS-----KSMTDKVLDYITCIGLSVSILSLVLCLIIEATVWSRVVVTE
. . ::::::: .:. .:: :. .:.. :::::. ::..::.::. :. ..
CCDS49 HLT---SFSILMSPDSPDPSSLLGILLDIISYVGVGFSILSLAACLVVEAVVWKSVTKNR
990 1000 1010 1020 1030 1040
440 450 460 470 480 490
pF1KE9 ISYMRHVCIVNIAVSLLTANVWFIIGSHFNIKAQDYNMC----VAVTFFSHFFYLSLFFW
:::::.::::::.:::.::.:::. . :. . : .: ::.::: ::::::.:::
CCDS49 TSYMRHTCIVNIAASLLVANTWFIVVA--AIQDNRYILCKTACVAATFFIHFFYLSVFFW
1050 1060 1070 1080 1090 1100
500 510 520 530 540 550
pF1KE9 MLFKALLIIYGILVIFRRMMKSRMMVIGFAIGYGCPLIIAVTTVAITEPEKGYMRPEACW
:: .:...: .. :... .: . .:.: .:::::: :.: :.. :.:.. : : ..::
CCDS49 MLTLGLMLFYRLVFILHETSRSTQKAIAFCLGYGCPLAISVITLGATQPREVYTRKNVCW
1110 1120 1130 1140 1150 1160
560 570 580 590 600
pF1KE9 LNWDNTKALLAFAIPAFVIVAVNLIVVLVVAVNTQRPSIGSSK-SQDVVIIMRISKNVAI
:::..:::::::::::..::.::. ...:: .. :::::.. .:. ...:::....
CCDS49 LNWEDTKALLAFAIPALIIVVVNITITIVVITKILRPSIGDKPCKQEKSSLFQISKSIGV
1170 1180 1190 1200 1210 1220
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 LTPLLGLTWGFGIATLIEGTSLTFHIIFALLNAFQGFFILLFGTIMDHKIRDALRMRMSS
::::::::::::..:.. ::.:.::::::.::.:::.:::::: . : :...:: ..:
CCDS49 LTPLLGLTWGFGLTTVFPGTNLVFHIIFAILNVFQGLFILLFGCLWDLKVQEALLNKFSL
1230 1240 1250 1260 1270 1280
670 680 690
pF1KE9 LKGKSRAAENASLGPTNGSKLMNRQG
. .:. ....::: .
CCDS49 SRWSSQHSKSTSLGSSTPVFSMSSPISRRFNNLFGKTGTYNVSTPEATSSSLENSSSASS
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CCDS55 AWGPVNVTFMYLFAIFNTLQGFFIFIFYCVAKENVRKQWRRYLCC--GKLRLAENSDWSK
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CCDS55 TATNGLKKQTVNQGVSSSSNSLQSSSNSTNSTTLLVNNDCSVHASGNGNASTERNGVSFS
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CCDS55 WIALYKMQ--GLCISVAVFLHYFLLVSFTWMGLEAFHMYLALVKVFNTYI--RKYILKFC
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