Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9453
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9453, 910 aa
1>>>pF1KE9453 910 - 910 aa - 910 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6545+/-0.00126; mu= 19.6489+/- 0.075
mean_var=81.1714+/-16.299, 0's: 0 Z-trim(101.5): 88 B-trim: 3 in 1/50
Lambda= 0.142355
statistics sampled from 6463 (6552) to 6463 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34471.1 ADGRF1 gene_id:266977|Hs108|chr6 ( 910) 6012 1245.6 0
CCDS4920.1 ADGRF1 gene_id:266977|Hs108|chr6 ( 218) 1397 297.4 2e-80
CCDS4919.1 ADGRF5 gene_id:221395|Hs108|chr6 (1346) 1351 288.4 6e-77
CCDS4922.2 ADGRF4 gene_id:221393|Hs108|chr6 ( 695) 1328 283.5 9.2e-76
CCDS33159.2 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 ( 873) 959 207.8 7.2e-53
CCDS46238.1 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 ( 997) 959 207.8 8e-53
CCDS46239.1 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 (1079) 959 207.9 8.6e-53
CCDS35409.1 ADGRG4 gene_id:139378|Hs108|chrX (3080) 466 106.9 6e-22
CCDS55377.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 987) 450 103.3 2.3e-21
CCDS55376.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 993) 450 103.3 2.4e-21
CCDS43921.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 995) 450 103.3 2.4e-21
CCDS55378.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1001) 450 103.3 2.4e-21
CCDS43922.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1003) 450 103.3 2.4e-21
CCDS14191.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1014) 450 103.3 2.4e-21
CCDS43923.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1017) 450 103.3 2.4e-21
CCDS47491.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1193) 444 102.1 6.4e-21
CCDS47490.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1221) 444 102.1 6.5e-21
CCDS55064.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1222) 444 102.1 6.5e-21
CCDS47489.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1250) 444 102.1 6.7e-21
CCDS82926.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1240) 440 101.3 1.2e-20
CCDS54768.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1469) 440 101.4 1.3e-20
CCDS55379.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 966) 436 100.4 1.7e-20
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 379 88.7 5.2e-17
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 379 88.7 5.4e-17
CCDS10786.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 549) 360 84.6 5.4e-16
CCDS76879.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 429) 356 83.8 7.8e-16
CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584) 349 82.7 6e-15
CCDS10785.1 ADGRG5 gene_id:221188|Hs108|chr16 ( 528) 334 79.3 2.1e-14
CCDS32935.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 823) 324 77.4 1.2e-13
CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1551) 326 78.0 1.6e-13
CCDS32461.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 687) 310 74.4 7.9e-13
CCDS73893.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 692) 310 74.4 8e-13
CCDS59361.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 765) 303 73.0 2.3e-12
CCDS58643.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 709) 302 72.8 2.5e-12
CCDS58646.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 745) 302 72.8 2.6e-12
CCDS12175.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 886) 302 72.9 3e-12
CCDS77049.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 314) 294 70.9 4.1e-12
CCDS45714.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 375) 294 71.0 4.7e-12
CCDS42350.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 415) 294 71.0 5.1e-12
CCDS32460.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 693) 293 71.0 9e-12
CCDS45712.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 444) 290 70.2 9.6e-12
CCDS76174.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1123) 290 70.5 2e-11
CCDS41352.1 ADGRL4 gene_id:64123|Hs108|chr1 ( 690) 287 69.7 2.1e-11
CCDS72811.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1177) 290 70.5 2.1e-11
CCDS689.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1403) 290 70.5 2.4e-11
CCDS81345.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1416) 290 70.5 2.4e-11
CCDS74296.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 526) 282 68.6 3.4e-11
CCDS74297.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 600) 282 68.7 3.8e-11
CCDS12315.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 652) 282 68.7 4.1e-11
>>CCDS34471.1 ADGRF1 gene_id:266977|Hs108|chr6 (910 aa)
initn: 6012 init1: 6012 opt: 6012 Z-score: 6670.9 bits: 1245.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6012; 100.0% identity (100.0% similar) in 910 aa overlap (1-910:1-910)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MKVGVLWLISFFTFTDGHGGFLGKNDGIKTKKELIVNKKKHLGPVEEYQLLLQVTYRDSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MKVGVLWLISFFTFTDGHGGFLGKNDGIKTKKELIVNKKKHLGPVEEYQLLLQVTYRDSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 EKRDLRNFLKLLKPPLLWSHGLIRIIRAKATTDCNSLNGVLQCTCEDSYTWFPPSCLDPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EKRDLRNFLKLLKPPLLWSHGLIRIIRAKATTDCNSLNGVLQCTCEDSYTWFPPSCLDPQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 NCYLHTAGALPSCECHLNNLSQSVNFCERTKIWGTFKINERFTNDLLNSSSAIYSKYANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NCYLHTAGALPSCECHLNNLSQSVNFCERTKIWGTFKINERFTNDLLNSSSAIYSKYANG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 IEIQLKKAYERIQGFESVQVTQFRNGSIVAGYEVVGSSSASELLSAIEHVAEKAKTALHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IEIQLKKAYERIQGFESVQVTQFRNGSIVAGYEVVGSSSASELLSAIEHVAEKAKTALHK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LFPLEDGSFRVFGKAQCNDIVFGFGSKDDEYTLPCSSGYRGNITAKCESSGWQVIRETCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LFPLEDGSFRVFGKAQCNDIVFGFGSKDDEYTLPCSSGYRGNITAKCESSGWQVIRETCV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 LSLLEELNKNFSMIVGNATEAAVSSFVQNLSVIIRQNPSTTVGNLASVVSILSNISSLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSLLEELNKNFSMIVGNATEAAVSSFVQNLSVIIRQNPSTTVGNLASVVSILSNISSLSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 ASHFRVSNSTMEDVISIADNILNSASVTNWTVLLREEKYASSRLLETLENISTLVPPTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ASHFRVSNSTMEDVISIADNILNSASVTNWTVLLREEKYASSRLLETLENISTLVPPTAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 PLNFSRKFIDWKGIPVNKSQLKRGYSYQIKMCPQNTSIPIRGRVLIGSDQFQRSLPETII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PLNFSRKFIDWKGIPVNKSQLKRGYSYQIKMCPQNTSIPIRGRVLIGSDQFQRSLPETII
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 SMASLTLGNILPVSKNGNAQVNGPVISTVIQNYSINEVFLFFSKIESNLSQPHCVFWDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SMASLTLGNILPVSKNGNAQVNGPVISTVIQNYSINEVFLFFSKIESNLSQPHCVFWDFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 HLQWNDAGCHLVNETQDIVTCQCTHLTSFSILMSPFVPSTIFPVVKWITYVGLGISIGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HLQWNDAGCHLVNETQDIVTCQCTHLTSFSILMSPFVPSTIFPVVKWITYVGLGISIGSL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 ILCLIIEALFWKQIKKSQTSHTRRICMVNIALSLLIADVWFIVGATVDTTVNPSGVCTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ILCLIIEALFWKQIKKSQTSHTRRICMVNIALSLLIADVWFIVGATVDTTVNPSGVCTAA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 VFFTHFFYLSLFFWMLMLGILLAYRIILVFHHMAQHLMMAVGFCLGYGCPLIISVITIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VFFTHFFYLSLFFWMLMLGILLAYRIILVFHHMAQHLMMAVGFCLGYGCPLIISVITIAV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 TQPSNTYKRKDVCWLNWSNGSKPLLAFVVPALAIVAVNFVVVLLVLTKLWRPTVGERLSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TQPSNTYKRKDVCWLNWSNGSKPLLAFVVPALAIVAVNFVVVLLVLTKLWRPTVGERLSR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 DDKATIIRVGKSLLILTPLLGLTWGFGIGTIVDSQNLAWHVIFALLNAFQGFFILCFGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DDKATIIRVGKSLLILTPLLGLTWGFGIGTIVDSQNLAWHVIFALLNAFQGFFILCFGIL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 LDSKLRQLLFNKLSALSSWKQTEKQNSSDLSAKPKFSKPFNPLQNKGHYAFSHTGDSSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LDSKLRQLLFNKLSALSSWKQTEKQNSSDLSAKPKFSKPFNPLQNKGHYAFSHTGDSSDN
850 860 870 880 890 900
910
pF1KE9 IMLTQFVSNE
::::::::::
CCDS34 IMLTQFVSNE
910
>>CCDS4920.1 ADGRF1 gene_id:266977|Hs108|chr6 (218 aa)
initn: 1394 init1: 1394 opt: 1397 Z-score: 1557.5 bits: 297.4 E(32554): 2e-80
Smith-Waterman score: 1397; 94.9% identity (96.3% similar) in 217 aa overlap (1-217:1-217)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MKVGVLWLISFFTFTDGHGGFLGKNDGIKTKKELIVNKKKHLGPVEEYQLLLQVTYRDSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MKVGVLWLISFFTFTDGHGGFLGKNDGIKTKKELIVNKKKHLGPVEEYQLLLQVTYRDSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 EKRDLRNFLKLLKPPLLWSHGLIRIIRAKATTDCNSLNGVLQCTCEDSYTWFPPSCLDPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 EKRDLRNFLKLLKPPLLWSHGLIRIIRAKATTDCNSLNGVLQCTCEDSYTWFPPSCLDPQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 NCYLHTAGALPSCECHLNNLSQSVNFCERTKIWGTFKINERFTNDLLNSSSAIYSKYANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 NCYLHTAGALPSCECHLNNLSQSVNFCERTKIWGTFKINERFTNDLLNSSSAIYSKYANG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 IEIQLKKAYERIQGFESVQVTQFRNGSIVAGYEVVGSSSASELLSAIEHVAEKAKTALHK
:::::::::::::::::::::::: . . : :.
CCDS49 IEIQLKKAYERIQGFESVQVTQFRMSLLSPKLECNGTI
190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LFPLEDGSFRVFGKAQCNDIVFGFGSKDDEYTLPCSSGYRGNITAKCESSGWQVIRETCV
>>CCDS4919.1 ADGRF5 gene_id:221395|Hs108|chr6 (1346 aa)
initn: 1282 init1: 405 opt: 1351 Z-score: 1495.0 bits: 288.4 E(32554): 6e-77
Smith-Waterman score: 1420; 36.5% identity (70.3% similar) in 666 aa overlap (257-895:669-1321)
230 240 250 260 270
pF1KE9 IEHVAEKAKTALHKLFPLEDGSFRVFGKAQCNDIVFGFG------SKDDEYT-LPCS--S
:.: :.: : .: ... .: : :
CCDS49 DVCCHFTNAANNSVWSPSMKLNLVPGENITCQDPVIGVGEPGKVIQKLCRFSNVPSSPES
640 650 660 670 680 690
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 GYRGNITAKCESSGWQVIRETCVLSLLEELNKNFSMIVGNATE-AAVSSFVQNLSVIIRQ
:.:: :: .: :. :. :. . .. : . . .. . .. . .....::. : .
CCDS49 PIGGTITYKCVGSQWEEKRNDCISAPINSLLQMAKALIKSPSQDEMLPTYLKDLSISIDK
700 710 720 730 740 750
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 NP---STTVGNLASVVSILSNISSLSLASHFRVSNSTMEDVISIADNILNSASVTNWTVL
:.. :.:.....::. .:.. .:.. : :.: .. ::.. ...: ::
CCDS49 AEHEISSSPGSLGAIINILDLLSTVPT----QVNSEMMTHVLSTVNVILGKPVLNTWKVL
760 770 780 790 800 810
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 LREEKYASSRLLETLENIS-TLVPPTALPLNFSRKFIDWKGIPVNKSQLKRGYSYQIKMC
.. ::.::...: .: .: . ::.::. .. ... ...:. . .:: ..
CCDS49 QQQWTNQSSQLLHSVERFSQALQSGDSPPLSFSQTNVQMSSMVIKSSHPE---TYQQRFV
820 830 840 850 860 870
460 470 480 490 500 510
pF1KE9 -PQNTSIPIRGRVLIGSDQFQRSLPET-IISMASLTLGNILPVSKNGNAQVNGPVISTVI
: . . : :.: .. .. .. :..:: :: :: . . : ... :..:..
CCDS49 FPY---FDLWGNVVIDKSYLENLQSDSSIVTMAFPTLQAILAQDIQENNFAESLVMTTTV
880 890 900 910 920
520 530 540 550 560
pF1KE9 QNYSIN--EVFLFFSKIESNLSQPHCVFWDFSHLQ----WNDAGCHLVNETQDIVTCQCT
.. . .. . :.. . .. .::::.: . :...::.. . : ::: :
CCDS49 SHNTTMPFRISMTFKNNSPSGGETKCVFWNFRLANNTGGWDSSGCYVEEGDGDNVTCICD
930 940 950 960 970 980
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 HLTSFSILMSPFVP--STIFPVV-KWITYVGLGISIGSLILCLIIEALFWKQIKKSQTSH
::::::::::: : :... .. :.:::.:.:: :: ::..::. ::.. :..::.
CCDS49 HLTSFSILMSPDSPDPSSLLGILLDIISYVGVGFSILSLAACLVVEAVVWKSVTKNRTSY
990 1000 1010 1020 1030 1040
630 640 650 660 670
pF1KE9 TRRICMVNIALSLLIADVWFIVGATVDTT--VNPSGVCTAAVFFTHFFYLSLFFWMLMLG
:. :.:::: :::.:..:::: :... . . . .:.::.:: ::::::.::::: ::
CCDS49 MRHTCIVNIAASLLVANTWFIVVAAIQDNRYILCKTACVAATFFIHFFYLSVFFWMLTLG
1050 1060 1070 1080 1090 1100
680 690 700 710 720 730
pF1KE9 ILLAYRIILVFHHMAQHLMMAVGFCLGYGCPLIISVITIAVTQPSNTYKRKDVCWLNWSN
..: ::.....:. .. . :..::::::::: :::::...::: ..: ::.:::::: .
CCDS49 LMLFYRLVFILHETSRSTQKAIAFCLGYGCPLAISVITLGATQPREVYTRKNVCWLNWED
1110 1120 1130 1140 1150 1160
740 750 760 770 780 790
pF1KE9 GSKPLLAFVVPALAIVAVNFVVVLLVLTKLWRPTVGERLSRDDKATIIRVGKSLLILTPL
.: ::::..::: ::.::......:.::. ::..:.. ...:.......::. .::::
CCDS49 -TKALLAFAIPALIIVVVNITITIVVITKILRPSIGDKPCKQEKSSLFQISKSIGVLTPL
1170 1180 1190 1200 1210 1220
800 810 820 830 840 850
pF1KE9 LGLTWGFGIGTIVDSQNLAWHVIFALLNAFQGFFILCFGILLDSKLRQLLFNKLSALSSW
::::::::. :. . ::..:.:::.::.:::.::: :: : : :... :.::.: :: :
CCDS49 LGLTWGFGLTTVFPGTNLVFHIIFAILNVFQGLFILLFGCLWDLKVQEALLNKFS-LSRW
1230 1240 1250 1260 1270 1280
860 870 880 890 900 910
pF1KE9 KQTEKQNSSDLSAKPKFSKPFNPLQNKGHYAFSHTGDSSDNIMLTQFVSNE
.. .....: :. : :: .:.. . . :..::
CCDS49 SSQHSKSTSLGSSTPVFSMS-SPISRRFNNLFGKTGTYNVSTPEATSSSLENSSSASSLL
1290 1300 1310 1320 1330 1340
CCDS49 N
>--
initn: 276 init1: 172 opt: 314 Z-score: 344.0 bits: 75.5 E(32554): 7.7e-13
Smith-Waterman score: 314; 24.7% identity (56.6% similar) in 304 aa overlap (46-330:61-352)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 DGHGGFLGKNDGIKTKKELIVNKKKHLGPVEEYQLLLQVTYRDSKEKRDLRNFLKLLKPP
::: . ......... .. .:. :. :
CCDS49 IHPLSLHEHEPAGEEALRQKRAVATKSPTAEEYTVNIEISFENASFLDPIKAYLNSLSFP
40 50 60 70 80 90
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CCDS46 VSTVPHYIFTILNTLQGVFILLFGCLMDRKIQEALRKRFCRAQAPSSTISLVSCCLQILS
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: .::.:: .: .. . .. . . .... .: ..:. . .:: .:.::
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.:. ..: : : . :. . . ..: . .: . ..:. : ...: .
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...: ..: .: ::.:::: . . ::..::.. . . . . ::: ::: :..::.
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: :. .. :::.: ::: :..: . .. . .....:. .. ..:.
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.::. .. :.... . .. . ::: .:. :.: : : :: . .. . .. ::
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. . . .. ::: :.: : :. .::..: . .. ::.. . : ..
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:: :..
CCDS35 SDGSSRCQIKVGYKQEGLKKIFEHKLLTPSLKSTATSSTFKSLGSAQGTPSEISFPNDDF
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....:. . .:::.: :.: : . :. : : :... :. .... .
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860 870 880 890 900 910
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:.:..: .. . ... :. : ::.... . : :
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CCDS55 PSQDELTV---RCVFWDLGRNGGRGGWSDNGCSVKDRRLNETICTCSHLTSFGVLLD-LS
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CCDS55 LLLLNLVFLLDSWI-ALYKMQGLCISVAVFLHYFLLVSFTWMGLEAFHMYLALVKVFNTY
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pF1KE9 AQHLMMAVGFCL-GYGCPLIISVITIAVTQPSN----TYKR------KDVCWLNWSNGSK
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CCDS55 FYITVVGYFCVIFLLNVSMFIVVLVQLCRIKKKKQLGAQRKTSIQDL-RSIAGLTFLLGI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]