Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9449
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9449, 354 aa
1>>>pF1KE9449 354 - 354 aa - 354 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1117+/-0.00107; mu= 17.0973+/- 0.064
mean_var=146.2574+/-57.279, 0's: 0 Z-trim(104.0): 259 B-trim: 1000 in 2/46
Lambda= 0.106051
statistics sampled from 7231 (7671) to 7231 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.587), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 2.190
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4923.1 OPN5 gene_id:221391|Hs108|chr6 ( 354) 2420 382.9 2.2e-106
CCDS3687.1 RRH gene_id:10692|Hs108|chr4 ( 337) 595 103.6 2.4e-22
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 547 96.5 4.8e-20
CCDS31237.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 489) 515 91.7 1.4e-18
CCDS31072.1 OPN3 gene_id:23596|Hs108|chr1 ( 402) 491 87.9 1.7e-17
CCDS3063.1 RHO gene_id:6010|Hs108|chr3 ( 348) 449 81.3 1.3e-15
CCDS35447.1 OPN1MW2 gene_id:728458|Hs108|chrX ( 364) 446 80.9 1.9e-15
CCDS83509.1 OPN1MW3 gene_id:101060233|Hs108|chrX ( 364) 446 80.9 1.9e-15
CCDS14743.1 OPN1MW gene_id:2652|Hs108|chrX ( 364) 446 80.9 1.9e-15
CCDS14742.1 OPN1LW gene_id:5956|Hs108|chrX ( 364) 438 79.7 4.3e-15
CCDS5806.1 OPN1SW gene_id:611|Hs108|chr7 ( 348) 402 74.1 1.9e-13
>>CCDS4923.1 OPN5 gene_id:221391|Hs108|chr6 (354 aa)
initn: 2420 init1: 2420 opt: 2420 Z-score: 2023.4 bits: 382.9 E(32554): 2.2e-106
Smith-Waterman score: 2420; 100.0% identity (100.0% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MALNHTALPQDERLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MALNHTALPQDERLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSSR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RKKKLRPAEIMTINLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYGWAGFFFGCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 RKKKLRPAEIMTINLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYGWAGFFFGCGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LITMTAVSLDRYLKICYLSYGVWLKRKHAYICLAAIWAYASFWTTMPLVGLGDYVPEPFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LITMTAVSLDRYLKICYLSYGVWLKRKHAYICLAAIWAYASFWTTMPLVGLGDYVPEPFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 TSCTLDWWLAQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKSSSKEVAHFDSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 TSCTLDWWLAQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKSSSKEVAHFDSRI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 HSSHVLEMKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAFGRPDSIPIQLSVVPTLLAKSAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 HSSHVLEMKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAFGRPDSIPIQLSVVPTLLAKSAAM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE9 YNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHEEWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 YNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHEEWE
310 320 330 340 350
>>CCDS3687.1 RRH gene_id:10692|Hs108|chr4 (337 aa)
initn: 567 init1: 368 opt: 595 Z-score: 514.5 bits: 103.6 E(32554): 2.4e-22
Smith-Waterman score: 595; 32.4% identity (65.9% similar) in 296 aa overlap (20-313:16-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MALNHTALPQDERLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSSR
::. :.. : ..:: :: . :..: ..: :: . .
CCDS36 MLRNNLGNSSDSKNEDGSVFSQT---EHNIVAT-YLIMAGMISIISNIIVLGIFIK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RKKKLRPAEIMTINLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYGWAGFFFGCGS
:. :.. . ::::: :.:.: .: :.. : . : ::. ::. :. ..::: .:
CCDS36 YKELRTPTNAIIINLAVTDIGVSSIGYPMSAASDLYGSWKFGYAGCQVYAGLNIFFGMAS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE9 LITMTAVSLDRYLKICYLSYGVWLKRKHAYICLA-AIWAYASFWTTMPLVGLGDYVPEPF
. .:.:..:::: :: . : . ..:: : . : . ::. ::..: ..:.:.:
CCDS36 IGLLTVVAVDRYLTICLPDVGRRMTT-NTYIGLILGAWINGLFWALMPIIGWASYAPDPT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GTSCTLDWWLAQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKS-SSKEVAHFDS
:..::..: . : . . .... . ...: .:. . : .. ..: .... .. .
CCDS36 GATCTINWRKNDRSFVS--YTMTVIAINFIVPLTVMFYCYYHVTLSIKHHTTSDCTESLN
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 RIHSSHVLEMKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAFGRPDSIPIQLSVVPTLLAKSA
: :... :.. ...:: ::.:: ::..: .:..:: : .:: .... :.:::.
CCDS36 RDWSDQIDVTKMS--VIMICM-FLVAWSPYSIVCLWASFGDPKKIPPPMAIIAPLFAKSS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 AMYNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHEEWE
..::: :: : . ::
CCDS36 TFYNPCIYVVANKKFRRAMLAMFKCQTHQTMPVTSILPMDVSQNPLASGRI
290 300 310 320 330
>>CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 (478 aa)
initn: 418 init1: 229 opt: 547 Z-score: 473.4 bits: 96.5 E(32554): 4.8e-20
Smith-Waterman score: 547; 30.8% identity (62.0% similar) in 292 aa overlap (32-313:69-357)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 ALNHTALPQDERLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSSRR
: . : . ..:. . .:: :.: :
CCDS73 LGRLPSISPTAPGTWAAAWVPLPTVDVPDHAHYTLGTVILLVGLTGMLGNLTVIYTFCRS
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 KKKLRPAEIMTINLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYGWAGFFFGCGSL
.. ::... ::::: :. .: . : . : . ..:.:: ::..:.. : .:: .:.
CCDS73 RSLRTPANMFIINLAVSDFLMSFTQAPVFFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCGALFGISSM
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170
pF1KE9 ITMTAVSLDRYLKICY--LSYGVWLKRKHAYICLAAIWAYASFWTTMPLVGLGDYVPEPF
::.::..::::: : ..:: ::. :.. :. .: :: :. :. : . :::: .
CCDS73 ITLTAIALDRYLVITRPLATFGVASKRRAAFVLLG-VWLYALAWSLPPFFGWSAYVPEGL
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GTSCTLDWWLAQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKSSSKEVAHFDSR
:::. :. .: ... . . : ..:: .:.. :. :. .. ... . : .
CCDS73 LTSCSWDYMSFTPAV--RAYTMLLCCFVFFLPLLIIIYCYIFIFRAIRETGRALQTFGAC
220 230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 IHSSHVL--------EMKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAFGRPDSIPIQLSVVP
... : : :..:. .:. :...: ::..:.. . : . .: ::
CCDS73 KGNGESLWQRQRLQSECKMAKIMLLVILLFVLSWAPYSAVALVAFAGYAHVLTPYMSSVP
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 TLLAKSAAMYNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHE
...::..:..::::: . :.
CCDS73 AVIAKASAIHNPIIYAITHPKYRVAIAQHLPCLGVLLGVSRRHSRPYPSYRSTHRSTLTS
340 350 360 370 380 390
>>CCDS31237.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 (489 aa)
initn: 397 init1: 208 opt: 515 Z-score: 446.8 bits: 91.7 E(32554): 1.4e-18
Smith-Waterman score: 526; 30.4% identity (61.1% similar) in 303 aa overlap (32-313:69-368)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 ALNHTALPQDERLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSSR-
: . : . ..:. . .:: :.: :
CCDS31 LGRLPSISPTAPGTWAAAWVPLPTVDVPDHAHYTLGTVILLVGLTGMLGNLTVIYTFCRA
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110
pF1KE9 ---------RKKKLR-PAEIMTINLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYG
....:: ::... ::::: :. .: . : . : . ..:.:: ::..:.
CCDS31 VLRGVTVMMQSRSLRTPANMFIINLAVSDFLMSFTQAPVFFTSSLYKQWLFGETGCEFYA
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160
pF1KE9 WAGFFFGCGSLITMTAVSLDRYLKICY--LSYGVWLKRKHAYICLAAIWAYASFWTTMPL
. : .:: .:.::.::..::::: : ..:: ::. :.. :. .: :: :. :.
CCDS31 FCGALFGISSMITLTAIALDRYLVITRPLATFGVASKRRAAFVLLG-VWLYALAWSLPPF
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 VGLGDYVPEPFGTSCTLDWWLAQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKS
: . :::: . :::. :. .: ... . . : ..:: .:.. :. :. ..
CCDS31 FGWSAYVPEGLLTSCSWDYMSFTPAV--RAYTMLLCCFVFFLPLLIIIYCYIFIFRAIRE
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 SSKEVAHFDSRIHSSHVL--------EMKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAFGRP
... . : . ... : : :..:. .:. :...: ::..:.. . :
CCDS31 TGRALQTFGACKGNGESLWQRQRLQSECKMAKIMLLVILLFVLSWAPYSAVALVAFAGYA
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 DSIPIQLSVVPTLLAKSAAMYNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTV
. .: ::...::..:..::::: . :.
CCDS31 HVLTPYMSSVPAVIAKASAIHNPIIYAITHPKYRVAIAQHLPCLGVLLGVSRRHSRPYPS
340 350 360 370 380 390
350
pF1KE9 RKSSAVLEIHEEWE
CCDS31 YRSTHRSTLTSHTSNLSWISIRRRQESLGSESEVGWTHMEAAAVWGAAQQANGRSLYGQG
400 410 420 430 440 450
>>CCDS31072.1 OPN3 gene_id:23596|Hs108|chr1 (402 aa)
initn: 492 init1: 228 opt: 491 Z-score: 427.8 bits: 87.9 E(32554): 1.7e-17
Smith-Waterman score: 491; 30.4% identity (63.0% similar) in 276 aa overlap (43-313:51-316)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 RLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSSRRKKKLRPAEIMT
::.:.. .: :: . . .. :....
CCDS31 AEGPAPAGTLSPAPLFSPGTYERLALLLGSIGLLGVGNNLLVLVLYYKFQRLRTPTHLLL
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 INLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYGWAGFFFGCGSLITMTAVSLDRY
.:... :: .:. : ::..::. . ::. .:: : :..: .:: :. :.:... .::
CCDS31 VNISLSDLLVSLFGVTFTFVSCLRNGWVWDTVGCVWDGFSGSLFGIVSIATLTVLAYERY
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180
pF1KE9 LKICY---LSYGVWLKRKHAYICLAAIWAYASFWTTMPLVGLGDYVPEPFGTSCTLDWWL
... . .... : : .:: : :. :. ::.: . :. . : .::.::
CCDS31 IRVVHARVINFS-WAWRAITYI-----WLYSLAWAGAPLLGWNRYILDVHGLGCTVDWKS
150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 AQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKSSSKEVAHFDSRIHSSHVL--E
.:. . :.: ... ::..: .::. : .:. ... . : ... :. ..: :
CCDS31 KDAN--DSSFVLFLFLGCLVVPLGVIAHCYGHILYSIRML-RCVEDLQT-IQVIKILKYE
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 MKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAFGRPDSIPIQLSVVPTLLAKSAAMYNPIIYQ
::.:. .:. ::. :.:: :. . :. . .:.: :.::: ..:::.::
CCDS31 KKLAKMCFLMIFTFLVCWMPYIVICFLVVNGHGHLVTPTISIVSYLFAKSNTVYNPVIYV
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350
pF1KE9 VIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHEEWE
. ::
CCDS31 FMIRKFRRSLLQLLCLRLLRCQRPAKDLPAAGSEMQIRPIVMSQKDGDRPKKKVTFNSSS
320 330 340 350 360 370
>>CCDS3063.1 RHO gene_id:6010|Hs108|chr3 (348 aa)
initn: 452 init1: 275 opt: 449 Z-score: 393.7 bits: 81.3 E(32554): 1.3e-15
Smith-Waterman score: 449; 27.7% identity (63.0% similar) in 289 aa overlap (30-316:35-316)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MALNHTALPQDERLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSS
:. ...:.... .: .:. : .::..
CCDS30 EGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLAAYMFLLI-VLGFPINFLTLYVTV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 RRKKKLRPAEIMTINLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYGWAGFFFGCG
..:: : . . .:::: :: . . : :. . . .::: :: :. . . :
CCDS30 QHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHGYFVFGPTGCNLEGFFATLGGEI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SLITMTAVSLDRYLKICYLSYGVWLKRKHAYICLAAIWAYASFWTTMPLVGLGDYVPEPF
.: ........::. .: . . ..:: . .: :..: .. ::.: . :.:: .
CCDS30 ALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTWVMALACAAPPLAGWSRYIPEGL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GTSCTLDWWLAQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKSSSKEVAHFDSR
:: .:.. . :... :.. .. . .: .: : : ... : ::.: ...
CCDS30 QCSCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPMIIIFFCYGQLVFTV----KEAAAQQQE
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 IHSSHVLEMKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAFGRPDSI--PIQLSVVPTLLAKS
... : ..:...... .::: :.::: :. . : . : :: ... :...:::
CCDS30 SATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFY-IFTHQGSNFGPIFMTI-PAFFAKS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 AAMYNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHEEWE
::.:::.:: ... .: :
CCDS30 AAIYNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTETSQVAPA
300 310 320 330 340
>>CCDS35447.1 OPN1MW2 gene_id:728458|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 430 init1: 282 opt: 446 Z-score: 391.0 bits: 80.9 E(32554): 1.9e-15
Smith-Waterman score: 446; 26.2% identity (61.2% similar) in 317 aa overlap (30-344:51-357)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MALNHTALPQDERLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSS
: :.. ... .. : :.: :: :: .
CCDS35 DSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWMIFVV-IASVFTNGLVLAATM
30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 RRKKKLRPAEIMTINLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYGWAGFFFGCG
. :: .: . . .:::: ::. .:... ..... .:.: : :.. . :
CCDS35 KFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFVLGHPMCVLEGYTVSLCGIT
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SLITMTAVSLDRYLKICYLSYGVWLKRKHAYICLAAIWAYASFWTTMPLVGLGDYVPEPF
.: ... .: .:.. .: .: . : : . .: : .:. ::. :. : . : :. .
CCDS35 GLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWAAVWTAPPIFGWSRYWPHGL
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GTSCTLDWWLAQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKSSSKEVAHFDSR
::: : . ... : : ... .. : . : ..::. :... ... .:. ...
CCDS35 KTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYLQVWLAIRAVAKQ----QKE
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 IHSSHVLEMKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAF--GRPDSIPIQLSVVPTLLAKS
.:.. : ..:...... .: . : ::: . ..: : : :. ....:...:::
CCDS35 SESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFH-PL-MAALPAFFAKS
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 AAMYNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHEEWE
:..:::.:: .. .: : :. :: .: .: ... .. ::
CCDS35 ATIYNPVIYVFMNRQFRNCI---LQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSSVSPA
320 330 340 350 360
>>CCDS83509.1 OPN1MW3 gene_id:101060233|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 430 init1: 282 opt: 446 Z-score: 391.0 bits: 80.9 E(32554): 1.9e-15
Smith-Waterman score: 446; 26.2% identity (61.2% similar) in 317 aa overlap (30-344:51-357)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MALNHTALPQDERLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSS
: :.. ... .. : :.: :: :: .
CCDS83 DSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWMIFVV-IASVFTNGLVLAATM
30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 RRKKKLRPAEIMTINLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYGWAGFFFGCG
. :: .: . . .:::: ::. .:... ..... .:.: : :.. . :
CCDS83 KFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFVLGHPMCVLEGYTVSLCGIT
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SLITMTAVSLDRYLKICYLSYGVWLKRKHAYICLAAIWAYASFWTTMPLVGLGDYVPEPF
.: ... .: .:.. .: .: . : : . .: : .:. ::. :. : . : :. .
CCDS83 GLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWAAVWTAPPIFGWSRYWPHGL
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GTSCTLDWWLAQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKSSSKEVAHFDSR
::: : . ... : : ... .. : . : ..::. :... ... .:. ...
CCDS83 KTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYLQVWLAIRAVAKQ----QKE
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 IHSSHVLEMKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAF--GRPDSIPIQLSVVPTLLAKS
.:.. : ..:...... .: . : ::: . ..: : : :. ....:...:::
CCDS83 SESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFH-PL-MAALPAFFAKS
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 AAMYNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHEEWE
:..:::.:: .. .: : :. :: .: .: ... .. ::
CCDS83 ATIYNPVIYVFMNRQFRNCI---LQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSSVSPA
320 330 340 350 360
>>CCDS14743.1 OPN1MW gene_id:2652|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 430 init1: 282 opt: 446 Z-score: 391.0 bits: 80.9 E(32554): 1.9e-15
Smith-Waterman score: 446; 26.2% identity (61.2% similar) in 317 aa overlap (30-344:51-357)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MALNHTALPQDERLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSS
: :.. ... .. : :.: :: :: .
CCDS14 DSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWMIFVV-IASVFTNGLVLAATM
30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 RRKKKLRPAEIMTINLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYGWAGFFFGCG
. :: .: . . .:::: ::. .:... ..... .:.: : :.. . :
CCDS14 KFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFVLGHPMCVLEGYTVSLCGIT
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SLITMTAVSLDRYLKICYLSYGVWLKRKHAYICLAAIWAYASFWTTMPLVGLGDYVPEPF
.: ... .: .:.. .: .: . : : . .: : .:. ::. :. : . : :. .
CCDS14 GLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWAAVWTAPPIFGWSRYWPHGL
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GTSCTLDWWLAQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKSSSKEVAHFDSR
::: : . ... : : ... .. : . : ..::. :... ... .:. ...
CCDS14 KTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYLQVWLAIRAVAKQ----QKE
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 IHSSHVLEMKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAF--GRPDSIPIQLSVVPTLLAKS
.:.. : ..:...... .: . : ::: . ..: : : :. ....:...:::
CCDS14 SESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFH-PL-MAALPAFFAKS
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 AAMYNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHEEWE
:..:::.:: .. .: : :. :: .: .: ... .. ::
CCDS14 ATIYNPVIYVFMNRQFRNCI---LQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSSVSPA
320 330 340 350 360
>>CCDS14742.1 OPN1LW gene_id:5956|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 342 init1: 236 opt: 438 Z-score: 384.4 bits: 79.7 E(32554): 4.3e-15
Smith-Waterman score: 438; 24.8% identity (61.0% similar) in 315 aa overlap (30-344:51-357)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MALNHTALPQDERLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSS
: :.. ... .. :.: :: :: .
CCDS14 DSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWMIFVVTA-SVFTNGLVLAATM
30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 RRKKKLRPAEIMTINLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYGWAGFFFGCG
. :: .: . . .:::: ::. .:... ..:.. .:.: : :.. . :
CCDS14 KFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISIVNQVSGYFVLGHPMCVLEGYTVSLCGIT
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SLITMTAVSLDRYLKICYLSYGVWLKRKHAYICLAAIWAYASFWTTMPLVGLGDYVPEPF
.: ... .: .:.. .: .: . : : . .: : .:. ::. :. : . : :. .
CCDS14 GLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWAAVWTAPPIFGWSRYWPHGL
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GTSCTLDWWLAQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKSSSKEVAHFDSR
::: : . ... : : ... .. : ..: :.:.. :... ... .:. ...
CCDS14 KTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCIIPLAIIMLCYLQVWLAIRAVAKQ----QKE
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 IHSSHVLEMKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAFGRPDSIPIQLSVVPTLLAKSAA
.:.. : ..:...... .. . : ::. . ..: . .. ....:. .::::.
CCDS14 SESTQKAEKEVTRMVVVMIFAYCVCWGPYTFFACFAAANPGYAFHPLMAALPAYFAKSAT
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 MYNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHEEWE
.:::.:: .. .: : :. :: .: .: ... .. ::
CCDS14 IYNPVIYVFMNRQFRNCI---LQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSSVSPA
320 330 340 350 360
354 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 06:44:46 2016 done: Sun Nov 6 06:44:47 2016
Total Scan time: 2.190 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]