Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9445
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9445, 343 aa
1>>>pF1KE9445 343 - 343 aa - 343 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1239+/-0.000753; mu= 17.1005+/- 0.045
mean_var=82.4260+/-20.209, 0's: 0 Z-trim(109.4): 112 B-trim: 1346 in 2/46
Lambda= 0.141267
statistics sampled from 10730 (10878) to 10730 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 2.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 ( 343) 2390 496.8 1.1e-140
CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 ( 321) 650 142.1 5.9e-34
CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 ( 330) 630 138.1 1e-32
CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 ( 322) 606 133.2 3e-31
CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 ( 325) 571 126.0 4.2e-29
CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 ( 322) 563 124.4 1.3e-28
CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 ( 312) 551 121.9 6.8e-28
CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 ( 322) 550 121.7 8.1e-28
CCDS4661.1 MAS1L gene_id:116511|Hs108|chr6 ( 378) 471 105.7 6.4e-23
CCDS44520.1 MRGPRG gene_id:386746|Hs108|chr11 ( 289) 361 83.2 2.9e-16
>>CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 (343 aa)
initn: 2390 init1: 2390 opt: 2390 Z-score: 2639.2 bits: 496.8 E(32554): 1.1e-140
Smith-Waterman score: 2390; 100.0% identity (100.0% similar) in 343 aa overlap (1-343:1-343)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MAGNCSWEAHPGNRNKMCPGLSEAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLV
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CCDS81 MAGNCSWEAHPGNRNKMCPGLSEAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 GNGLVLWFFGFSIKRNPFSIYFLHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVCR
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CCDS81 GNGLVLWFFGFSIKRNPFSIYFLHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVCR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VLGLCMFLTGVSLLPAVSAERCASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VLGLCMFLTGVSLLPAVSAERCASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 FCVFLGRGAPGAACRHMDIFLGILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHV
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CCDS81 FCVFLGRGAPGAACRHMDIFLGILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 ILAMVSVFLVSSIYLGIDWFLFWVFQIPAPFPEYVTDLCICINSSAKPIVYFLAGRDKSQ
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CCDS81 ILAMVSVFLVSSIYLGIDWFLFWVFQIPAPFPEYVTDLCICINSSAKPIVYFLAGRDKSQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE9 RLWEPLRVVFQRALRDGAELGEAGGSTPNTVTMEMQCPPGNAS
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CCDS81 RLWEPLRVVFQRALRDGAELGEAGGSTPNTVTMEMQCPPGNAS
310 320 330 340
>>CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 599 init1: 256 opt: 650 Z-score: 723.1 bits: 142.1 E(32554): 5.9e-34
Smith-Waterman score: 650; 37.4% identity (66.8% similar) in 334 aa overlap (13-335:2-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MAGNCSWEAHPGNRNKMCPGLSEAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLV
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CCDS31 MNQTLNSSGTVESALNYSRG--STVHTAYL----VLSSLAMFTCLCGMA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 GNGLVLWFFGFSIKRNPFSIYFLHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVCR
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CCDS31 GNSMVIWLLGFRMHRNPFCIYILNLAAADLLFLFSMASTLSLETQPLVNT-TDKVHELMK
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VLGLCMFLTGVSLLPAVSAERCASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNY
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CCDS31 RLMYFAYTVGLSLLTAISTQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE9 FCV-FLGRGAPGAACRHMDIFLGILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARR-RQRSAKLN
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CCDS31 FCSKFLKFNED--RCFRVDMVQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQPTRLF
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 HVILAMVSVFLVSSIYLGIDWFLFWVFQIPAPFPEY------VTDLCICINSSAKPIVYF
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CCDS31 VVVLASVLVFLICSLPLSIYWFVLYWLSLP---PEMQVLCFSLSRLSSSVSSSANPVIYF
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE9 LAGRDKSQRLWEPLR---VVFQRALRDGAELGEAGGSTPNTVTMEMQCPPGNAS
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CCDS31 LVGSRRSHRL--PTRSLGTVLQQALREEPEL--EGGETPTVGTNEMGA
280 290 300 310 320
>>CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 580 init1: 442 opt: 630 Z-score: 700.9 bits: 138.1 E(32554): 1e-32
Smith-Waterman score: 630; 37.8% identity (69.6% similar) in 286 aa overlap (49-325:35-315)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 PGLSEAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLVGNGLVLWFFGFSIKRNPF
...:.. : ::::::.:::..:: ..:: :
CCDS78 TPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMRRNAF
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 SIYFLHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVCRVLGLCMFLTGVSLLPAVS
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CCDS78 SVYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLAGLSMLSTVS
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 AERCASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNYFCVFLGRGAPGAACRHMD
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CCDS78 TERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSDGDSGWCQTFD
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 IFLG---ILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHVILAMVSVFLVSSIYL
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CCDS78 FITAAWLIFLFMVLCG----SSLALLVRILCGSRGLPLT-RLYLTILLTVLVFLLCGLPF
190 200 210 220 230
260 270 280 290 300
pF1KE9 GIDWFL-FWVFQIPAPFPEYVTDLCICI---NSSAKPIVYFLAGRDKSQ-RLWEP-LRVV
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CCDS78 GIQWFLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPILKLA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340
pF1KE9 FQRALRDGAELGEAGGSTPNTVTMEMQCPPGNAS
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CCDS78 LQRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
300 310 320 330
>>CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 596 init1: 265 opt: 606 Z-score: 674.6 bits: 133.2 E(32554): 3e-31
Smith-Waterman score: 606; 36.7% identity (69.2% similar) in 286 aa overlap (53-331:36-312)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 EAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLVGNGLVLWFFGFSIKRNPFSIYF
.. : ::.::..:::..: ..:: ::::.
CCDS78 STLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNAFSIYI
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130
pF1KE9 LHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVCRVLGLCM---FLTGVSLLPAVSA
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CCDS78 LNLAAADFLFLSGRLIYSLL-------SFISIPHTISKILYPVMMFSYFAGLSFLSAVST
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 ERCASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNYFCVFLGRGAPGAACRHMDI
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CCDS78 ERCLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSGADSAWCQTSD-
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 FLGILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHVILAMVSVFLVSSIYLGIDW
:. . ... : .. :.:.... : .:. . .: .:: : :::. .. .::..
CCDS78 FITVAWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLT-RLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQF
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KE9 FLF-WVF---QIPAPFPEYVTDLCICINSSAKPIVYFLAGRDKSQRLWEPLRVVFQRALR
::: :. .. . :. . .::::.::.::..: .... . :..:.::::.
CCDS78 FLFLWIHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQ
240 250 260 270 280 290
320 330 340
pF1KE9 DGAELGEAGGSTPNTVTMEMQCPPGNAS
:..:. :.::. :. .
CCDS78 DASEVDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
300 310 320
>>CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 (325 aa)
initn: 559 init1: 343 opt: 571 Z-score: 636.0 bits: 126.0 E(32554): 4.2e-29
Smith-Waterman score: 571; 34.5% identity (65.5% similar) in 293 aa overlap (46-334:34-322)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 KMCPGLSEAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLVGNGLVLWFFGFSIKR
....... . :.: ::..:::. : ..:
CCDS52 SNVTSFVVEEPTNISTGRNASVGNAHRQIPIVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFRMRR
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 NPFSIYFLHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVC-RVLGLCMFLTGVSLL
:::..:. ::. ::.. :: ..:: . . . . : : : : . ::. ::
CCDS52 NPFTVYITHLSIADISLLFCIFILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFLFGYNTGLYLL
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 PAVSAERCASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNYFCVFLGRGAPGAA-
:.:.::: ::..: :: .::: ::.::::::.:: ::: .. .:. : . .
CCDS52 TAISVERCLSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCI--DREEESHSR
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 --CRHMDIFLGILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHVILAMVSVFLVS
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CCDS52 NDCRAVIIFIAILSFLVFTPLMLVSSTILVVKIR-KNTWASHSSKLYIVIMVTIIIFLIF
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE9 SIYLGIDWFLFWVFQIPAPFPEYVTDLCICINSSAKPIVYFLAGRDKSQRLWEPLRVVFQ
.. . . ..:.. . .... : :::::.:..::..: .:..:. : :.::.
CCDS52 AMPMRLLYLLYYEYWSTFGNLHHISLLFSTINSSANPFIYFFVGSSKKKRFKESLKVVLT
250 260 270 280 290 300
320 330 340
pF1KE9 RALRDGAELGEAGGSTPNTVTMEMQCPPGNAS
::..: . . . ::::.:
CCDS52 RAFKDEMQPRRQKDNC-NTVTVETVV
310 320
>>CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 543 init1: 278 opt: 563 Z-score: 627.2 bits: 124.4 E(32554): 1.3e-28
Smith-Waterman score: 563; 35.9% identity (67.6% similar) in 287 aa overlap (53-335:36-315)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 EAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLVGNGLVLWFFGFSIKRNPFSIYF
.. : ::.::..:::..:. ..:: :::.
CCDS78 PVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMRRNAVSIYI
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 LHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVCRVLGLCMFLTGVSLLPAVSAERC
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CCDS78 LNLAAAD--FLFLS--FQIIRLPLRLINISHLIRKILVSVMTFPYFTGLSMLSAISTERC
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 ASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNYFCVFLGRGAPGAACRHMDIFLG
::..: :: ::: .::::::.::: :::: . :. :: :: :: .. :. : :.
CCDS78 LSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCDFLFSGADSSWCETSD-FIP
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 ILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHVILAMVSVFLVSSIYLGIDWFLF
. ... : .. . :.:.... : .:. . .: .:: : :::. .. .:: :.
CCDS78 VAWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLT-RLYVTILLTVLVFLLCGLPFGILGALI
190 200 210 220 230
270 280 290 300 310
pF1KE9 WVFQIPAP-FPEYVTDLCICI---NSSAKPIVYFLAGRDKSQRLWEPLRVVFQRALRDGA
. ... . .: .:. . ::::.::.::..: .... . :..:.::::.:
CCDS78 YRMHLNLEVLYCHVYLVCMSLSSLNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDKP
240 250 260 270 280 290
320 330 340
pF1KE9 ELGEAGGSTPNTVTMEMQCPPGNAS
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CCDS78 EVDKGEGQLPEE-SLELSGSRLGP
300 310 320
>>CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 515 init1: 368 opt: 551 Z-score: 614.2 bits: 121.9 E(32554): 6.8e-28
Smith-Waterman score: 551; 39.6% identity (64.5% similar) in 273 aa overlap (54-321:34-297)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 APELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLVGNGLVLWFFGFSIKRNPFSIYFL
: : ::.::: :::... .. ::::.::.:
CCDS41 PREAGQHVGAANGAQEDVAFNLIILSLTEGLGLGGLLGNGAVLWLLSSNVYRNPFAIYLL
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 HLASADVGYLFSKAVFSILNT-GGFLGTFADYIRSVCRVLGLCMFLTGVSLLPAVSAERC
.: ::. .: . : . . : : : .... .: . ...:.::: :::.:.:
CCDS41 DVACADLIFLGCHMVAIVPDLLQGRLD-FPGFVQTSLATLRFFCYIVGLSLLAAVSVEQC
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 ASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNYFCV-FLGRGAPGAACRHMDIFL
...::::: :::..:.. :::: :.: ::. : . :. :.:. . :: . .
CCDS41 LAALFPAWYSCRRPRHLTTCVCALTWALCLLLHLLLSGACTQFFGEPSRHL-CRTLWLVA
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 GILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHVILAMVSVFLVSSIYLGIDWF-
..:: :::: : : :.:.:: :. .: . .:: : .:: .. .:: :.
CCDS41 AVLLALLCCT-MCGASLMLLLRVE-RGPQRPPPRGFPGLILLTVLLFLFCGLPFGIYWLS
190 200 210 220 230
270 280 290 300 310
pF1KE9 --LFWVFQIPAPFPEYVTDLCICINSSAKPIVYFLAGRDKSQRLWEPLRVVFQRALRDGA
:.: :: : .. . : .. .:::.::: : ...:: :::.:.:::: : :
CCDS41 RNLLWY--IPHYFYHF-SFLMAAVHCAAKPVVYFCLGSAQGRRL--PLRLVLQRALGDEA
240 250 260 270 280 290
320 330 340
pF1KE9 ELGEAGGSTPNTVTMEMQCPPGNAS
:::
CCDS41 ELGAVRETSRRGLVDIAA
300 310
>>CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 510 init1: 226 opt: 550 Z-score: 612.9 bits: 121.7 E(32554): 8.1e-28
Smith-Waterman score: 550; 34.9% identity (64.7% similar) in 295 aa overlap (53-335:33-315)
30 40 50 60 70
pF1KE9 EAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLV---GNGLVLWFFGFSIKRNPFS
: :. .:: ::..:::..: ..:: :
CCDS78 STIPVLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNAVS
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 IYFLHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVCRVLGLCM---FLTGVSLLPA
::.:.:..:: .: .. . : : . . . . ..:. : .. :.:.: :
CCDS78 IYILNLVAADFLFLSGHIICSPLR-------LINIRHPISKILSPVMTFPYFIGLSMLSA
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 VSAERCASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNYFCVFLGRGAPGAACRH
.:.::: :...: :: :::. ::.:.:.:::.:::: . :. .:: :: :: .. :.
CCDS78 ISTERCLSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFLFSGANSVWCET
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]