Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9441
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9441, 907 aa
1>>>pF1KE9441 907 - 907 aa - 907 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8400+/-0.00102; mu= 18.7569+/- 0.061
mean_var=115.2446+/-27.834, 0's: 0 Z-trim(106.2): 221 B-trim: 940 in 2/49
Lambda= 0.119471
statistics sampled from 8591 (8852) to 8591 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16
Scan time: 3.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 907) 5994 1045.4 0
CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 835) 4735 828.4 0
CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 883) 4368 765.1 0
CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 967) 3295 580.2 6.2e-165
CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 915) 3134 552.5 1.3e-156
CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 828) 2490 441.4 3.2e-123
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 1748 313.6 1.1e-84
CCDS1842.1 LHCGR gene_id:3973|Hs108|chr2 ( 699) 685 130.2 1.3e-29
CCDS1844.2 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 ( 669) 571 110.6 1e-23
CCDS1843.1 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 ( 695) 571 110.6 1.1e-23
CCDS9872.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14 ( 764) 557 108.2 6e-23
CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs108|chr19 ( 592) 495 97.4 8.3e-20
CCDS6524.1 LINGO2 gene_id:158038|Hs108|chr9 ( 606) 468 92.8 2.1e-18
CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 614) 461 91.6 5e-18
CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 620) 461 91.6 5e-18
CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 582) 449 89.5 2e-17
CCDS47218.1 LRRC70 gene_id:100130733|Hs108|chr5 ( 622) 430 86.2 2e-16
CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19 ( 713) 421 84.7 6.6e-16
CCDS1448.1 LRRN2 gene_id:10446|Hs108|chr1 ( 713) 419 84.4 8.3e-16
CCDS47272.1 LRRTM2 gene_id:26045|Hs108|chr5 ( 516) 412 83.0 1.5e-15
CCDS9039.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 ( 359) 400 80.8 5e-15
CCDS8245.1 LRRC32 gene_id:2615|Hs108|chr11 ( 662) 403 81.6 5.3e-15
CCDS75573.1 TRIL gene_id:9865|Hs108|chr7 ( 811) 402 81.5 6.9e-15
CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3 ( 545) 397 80.5 9.6e-15
CCDS13777.1 RTN4R gene_id:65078|Hs108|chr22 ( 473) 392 79.6 1.6e-14
CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 536) 392 79.6 1.7e-14
CCDS1966.1 LRRTM1 gene_id:347730|Hs108|chr2 ( 522) 389 79.1 2.4e-14
CCDS46951.1 LRRIQ4 gene_id:344657|Hs108|chr3 ( 560) 388 78.9 2.9e-14
CCDS46715.1 CHADL gene_id:150356|Hs108|chr22 ( 762) 389 79.2 3.1e-14
CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1059) 385 78.7 6.4e-14
CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7 ( 653) 382 78.0 6.5e-14
CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1119) 385 78.7 6.6e-14
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 581) 376 76.9 1.2e-13
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 587) 376 76.9 1.2e-13
CCDS3307.1 GP5 gene_id:2814|Hs108|chr3 ( 560) 372 76.2 1.9e-13
CCDS34172.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1302) 376 77.2 2.2e-13
CCDS58954.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1346) 376 77.3 2.2e-13
CCDS58951.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1367) 376 77.3 2.2e-13
CCDS3990.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1371) 376 77.3 2.2e-13
CCDS58953.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1412) 376 77.3 2.3e-13
CCDS58952.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1419) 376 77.3 2.3e-13
CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 605) 361 74.3 7.6e-13
CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 643) 361 74.3 7.9e-13
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 362 74.9 1.3e-12
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 360 74.5 1.6e-12
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 360 74.6 1.6e-12
CCDS33783.1 LRIG1 gene_id:26018|Hs108|chr3 (1093) 355 73.5 2.3e-12
CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6 ( 524) 349 72.2 2.9e-12
CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs108|chr11 ( 640) 345 71.6 5.3e-12
CCDS724.1 LRRC8B gene_id:23507|Hs108|chr1 ( 803) 346 71.9 5.5e-12
>>CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 (907 aa)
initn: 5994 init1: 5994 opt: 5994 Z-score: 5589.1 bits: 1045.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5994; 99.9% identity (100.0% similar) in 907 aa overlap (1-907:1-907)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 ERGFSAKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 VAFVPCL
:::::::
CCDS90 VAFVPCL
>>CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 (835 aa)
initn: 4731 init1: 4731 opt: 4735 Z-score: 4416.8 bits: 828.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5362; 92.0% identity (92.1% similar) in 907 aa overlap (1-907:1-835)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
:::::::::::::::::::::::
CCDS61 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSL-------------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
:::::::::::::::::::::::::
CCDS61 -----------------------------------HLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
410 420 430 440 450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
470 480 490 500 510 520
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
530 540 550 560 570 580
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 ERGFSAKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
590 600 610 620 630 640
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
650 660 670 680 690 700
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
710 720 730 740 750 760
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
770 780 790 800 810 820
pF1KE9 VAFVPCL
:::::::
CCDS61 VAFVPCL
830
>>CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 (883 aa)
initn: 4305 init1: 4305 opt: 4368 Z-score: 4074.6 bits: 765.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5779; 97.2% identity (97.4% similar) in 907 aa overlap (1-907:1-883)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS61 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKEL------------------------HFYDNPIQFVGRSA
250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 ERGFSAKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
820 830 840 850 860 870
pF1KE9 VAFVPCL
:::::::
CCDS61 VAFVPCL
880
>>CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 (967 aa)
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Smith-Waterman score: 3295; 55.7% identity (80.9% similar) in 894 aa overlap (22-906:23-904)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSE
:..:. : .::. :::. :: ..: .:::.::::
CCDS30 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDG-IMLSADCSELGLSA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 LPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVL
.:..:. .:.::::::::...: :. . :::::::::.:: :..:: ::.::::::.:
CCDS30 VPGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKIL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 MLQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPV
::::::: .:.::: .: :::::::::: :: :: : :: :::::::::::::::::
CCDS30 MLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 QAFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETL
.:. .: ::::::::::.: ::::::: ::.::::::::::::. :: . :.:::.::::
CCDS30 RALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 DLNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRS
:::::.:.:::.:::::. :.:::::.:::..::::::.::: : :::::::::::::::
CCDS30 DLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 AFQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDL
:::.::.:.::.:::: .: ::::: ::..:: :::: : : ::. .:.::: :.::.:
CCDS30 AFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLEL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 SYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFS
:.: .:.:::. ::::..: :.::.:.:: .:::.:: ::..:.:.:: : :::.:::
CCDS30 SHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 TLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQC
:: ::.::::..: :...:..:: :: :::: :: ::.. .:...::.:...:.::::::
CCDS30 TLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQC
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE9 CAFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLH--KKDAGMFQAQDE----RDLEDFLLDFEEDL
: .:.: . .: :.:: .... .:: . :. :.. : : .::... :..: :
CCDS30 CPYGMCASFFKASGQW-EAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEME-DS
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE9 KALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRS-PLYISPI
: ::::::.::::::::.:...: ::..::.:..:.. ::.:: ::: . :. . :.
CCDS30 KPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE9 KLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSV
:...:.::..: :::.: ..::.:::.:::.:...:: ::.:.::.. :::....::.::
CCDS30 KFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASV
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE9 FLLTLAALERGFSAKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLC
.::::::.. . :.. . . ..:... .: : :: ::.:: . ..:::::::
CCDS30 LLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLC
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE9 LPL--PFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIAL
:: : :.:...:. :::...::.:::... :: ::::.: .::.: .:::.::.:.:
CCDS30 LPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAW
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE9 LLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKED
:.:.. .: ::::::::.:...: ..::..: .::::.:::::::::::.::::::..:
CCDS30 LIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDD
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE9 LVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAY
: :: .. . : . ..::.:::::::::.: :.. : : . :
CCDS30 LRRLRPRA-----GDSGPLAYAAAGELEKSSCDSTQALVAF--SDVDLILEASEAGRP--
840 850 860 870 880
900
pF1KE9 PVTESCHLSSVAFVPCL
: :. . ::... :
CCDS30 PGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGG
890 900 910 920 930 940
>>CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 (915 aa)
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30 40 50 60 70 80
pF1KE9 LLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSELPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSL
: ..:.. : ::::::...: :. . :
CCDS14 MGRPRLTLVCQVSIIISARDLSMNNLTELQPGLFHHL
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 RFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLMLQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANH
::::::::.:: :..:: ::.::::::.:::::::: .:.::: .: ::::::::::
CCDS14 RFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 ISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQAFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNL
:: :: : :: :::::::::::::::::.:. .: ::::::::::.: ::::::: ::
CCDS14 ISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPVRALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNL
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 SSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNI
.::::::::::::. :: . :.:::.:::::::::.:.:::.:::::. :.:::::.:::
CCDS14 TSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETLDLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNI
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 RSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTAN
..::::::.::: : ::::::::::::::::::.::.:.::.:::: .: ::::: ::..
CCDS14 KAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTS
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 LESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEI
:: :::: : : ::. .:.::: :.::.::.: .:.:::. ::::..: :.::.:.::
CCDS14 LEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEI
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 KVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLK
.:::.:: ::..:.:.:: : :::.::::: ::.::::..: :...:..:: :: :::
CCDS14 GADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLK
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE9 LTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLH--
: :: ::.. .:...::.:...:.::::::: .:.: . .: :.:: .... .:: .
CCDS14 LKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQW-EAEDLHLDDEESS
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE9 KKDAGMFQAQDE----RDLEDFLLDFEEDLKALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIG
:. :.. : : .::... :..: : : ::::::.::::::::.:...: ::..
CCDS14 KRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEME-DSKPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLA
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 VWTIAVLALTCNALVTSTVFRS-PLYISPIKLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFG
::.:..:.. ::.:: ::: . :. . :.:...:.::..: :::.: ..::.:::.:::
CCDS14 VWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFG
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KE9 SFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAALERGFSAKYSAKFETKAPFSSLK
.:...:: ::.:.::.. :::....::.::.::::::.. . :.. . . ..:..
CCDS14 QFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVR
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KE9 VIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPL--PFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMM
. .: : :: ::.:: . ..::::::::: : :.:...:. :::...::.:::..
CCDS14 AGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVV
640 650 660 670 680 690
750 760 770 780 790 800
pF1KE9 TIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEV
. :: ::::.: .::.: .:::.::.:.: :.:.. .: ::::::::.:...: ..::.
CCDS14 AGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEA
700 710 720 730 740 750
810 820 830 840 850 860
pF1KE9 IKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQ
.: .::::.:::::::::::.::::::..:: :: .. .. : : . ..::.
CCDS14 VKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDLRRLRPRAG----DSGP-LAYAAAGELEKS
760 770 780 790 800 810
870 880 890 900
pF1KE9 SCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSSVAFVPCL
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CCDS14 SCDSTQALVAF--SDVDLILEASEAGRP--PGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCV
820 830 840 850 860
CCDS14 EPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAFASHV
870 880 890 900 910
>>CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 (828 aa)
initn: 2080 init1: 1249 opt: 2490 Z-score: 2325.6 bits: 441.4 E(32554): 3.2e-123
Smith-Waterman score: 2490; 51.0% identity (78.8% similar) in 747 aa overlap (169-906:30-765)
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 SLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQAFRSLSALQAMTLALNKI
:. : :::. :. : :. . :. :..
CCDS30 MRLEGEGRSARAGQNLSRAGSARRGAPRDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHL
10 20 30 40 50
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 HHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNYNNLDEFPTAIRTLSN
::: ::..: :: .: :.::.. .. . . : ::..::::::.:.:::.:::::.
CCDS30 SHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLDLNYNKLQEFPVAIRTLGR
60 70 80 90 100 110
260 270 280 290 300 310
pF1KE9 LKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLNGASQI
:.:::::.:::..::::::.::: : ::::::::::::::::::.::.:.::.:::: .:
CCDS30 LQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDI
120 130 140 150 160 170
320 330 340 350 360 370
pF1KE9 TEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLPSFSVCQKLQK
::::: ::..:: :::: : : ::. .:.::: :.::.::.: .:.:::. ::::..
CCDS30 QEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEE
180 190 200 210 220 230
380 390 400 410 420 430
pF1KE9 IDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSNLLSSFP
: :.::.:.:: .:::.:: ::..:.:.:: : :::.::::: ::.::::..: :...:
CCDS30 IGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLP
240 250 260 270 280 290
440 450 460 470 480 490
pF1KE9 ITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVCENAYKISNQWNKG
..:: :: :::: :: ::.. .:...::.:...:.::::::: .:.: . .: :.:: ..
CCDS30 LAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQW-EA
300 310 320 330 340 350
500 510 520 530 540 550
pF1KE9 DNSSMDDLH--KKDAGMFQAQDE----RDLEDFLLDFEEDLKALHSVQCSPSPGPFKPCE
.. .:: . :. :.. : : .::... :..: : : ::::::.::::::::
CCDS30 EDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEME-DSKPHPSVQCSPTPGPFKPCE
360 370 380 390 400 410
560 570 580 590 600 610
pF1KE9 HLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRS-PLYISPIKLLIGVIAAVNMLTGVSSA
.:...: ::..::.:..:.. ::.:: ::: . :. . :.:...:.::..: :::.: .
CCDS30 YLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCG
420 430 440 450 460 470
620 630 640 650 660 670
pF1KE9 VLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAALERGFSAKYSAK
.::.:::.:::.:...:: ::.:.::.. :::....::.::.::::::.. . :..
CCDS30 LLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRA
480 490 500 510 520 530
680 690 700 710 720
pF1KE9 FETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPL--PFGEPSTMGYMVAL
. . ..:... .: : :: ::.:: . ..::::::::: : :.:...:. :::
CCDS30 YGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVAL
540 550 560 570 580 590
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 ILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNCPVAFLSFSS
...::.:::... :: ::::.: .::.: .:::.::.:.: :.:.. .: ::::::::.:
CCDS30 VMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFAS
600 610 620 630 640 650
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 LINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYVWTRSKHPSL
...: ..::..: .::::.:::::::::::.::::::..:: :: . . .. : :
CCDS30 MLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDLRRLRPR----AGDSGP-L
660 670 680 690 700 710
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 MSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSSVAFVPCL
. ..::.:::::::::.: :.. : : . : : :. . ::... :
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720 730 740 750 760
CCDS30 GAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAFASHV
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:.: .: :. ::. ::. : . : :. : ::::: ::. .
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10 20 30 40 50
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: .::.::. ::.:::::.:: . . .. :::::.:::: :..: :..:: ::::
CCDS31 PEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLT
60 70 80 90 100 110
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::::::. ::.::...: .:::::::::::. :: . : :: .:::::::::.:::.::.
CCDS31 LQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVH
120 130 140 150 160 170
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. .: .:::.::::::: :::.:: :::::::::::::.:.::...::::: .:::::
CCDS31 PLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLD
180 190 200 210 220 230
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:::::: ::: ::..: .:::::::::.: ::. :: ::: : :::.::::..::: ::
CCDS31 LNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
:..: .:..:.. :::.. .::.::::..::::::::..:::.:...:.. :..::::
CCDS31 FHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLS
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:: ..:::::. :. :..:.:..:.::.:: ::: :.::: :.:. : : :: ::.:
CCDS31 YNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFAT
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
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: . .::.: : :.::: ::.::..:::.:: :. .....: .:. . .:::::::
CCDS31 LGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCC
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
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:: :.. .. : ::: .: .. : . : .. . : . :.. .:
CCDS31 AFWGCDSYANL----NTEDNSLQDHSVAQEKG---TADAANVTSTLENEEHSQIIIH---
480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
:.:: : :::::.:: .:.::. :: : ..:: : :: :.: : . ::.::.:.
CCDS31 CTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLIS
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
. :.. :. ...:. .:: ..: ::. : :::.: ::.: :::..:.:::..::: ::..
CCDS31 VSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATV
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 ERGFSAKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
::..::: : . .....: :: : : . . ::. ..:.:::::::.: ::
CCDS31 ERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGET
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
..:. :.:.::::: ::.:.. ::::::::.: :: . . ::.::.: :.:::::. :
CCDS31 PSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFC
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
::::.::. ::. ::::..: . :. ::::::::.::..:::.:::: :....
CCDS31 PVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRV--
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pF1KE9 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
:... .::.:
CCDS31 -TKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKS
820 830 840 850 860 870
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CCDS18 LLLLLQPPLPRALREALCPEPCNCVPDGALRCPGPTAGLTRLSLAYLPVKVIPSQAFRGL
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CCDS18 NEVIKIEISQIDSLERIEANAFDNLLNLSEILIQNTKN-LRYIEPGAFINLPRLKYLSIC
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CCDS18 NTG-IRKFPDVTKVFSSE---------SNFILEICD---NLHITTIPGNAFQGMNNESVT
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CCDS18 LKLYG-----NGFEEVQSHAFNGT-TLTSLELKENVHLEKMHNGAFRGATGPKTLDISST
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CCDS18 KLQALPSYGLESIQRLIATSSYSLKKLPSRETFVNLLEATLTYPSHCCAFRNLPTKEQNF
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...::....: .:.. ...: ..... : .: . :.: . .. .:.: :
CCDS18 SHSISENFSKQCESTVRKVNNKT--LYSSMLAESELSGW--DYEYGFCLPKTPRCAPEPD
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:.::: .. ..:. .: : .::. : : ... : .. ..:. .. ...
CCDS18 AFNPCEDIMGYDFLRVLIWLINILAIMGNMTVLFVLLTSRYKLTVPRFLMCNLSFADFCM
350 360 370 380 390 400
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CCDS18 GLYLLLIASVDSQTKGQYYNHAIDWQTGSGCSTAGFFTVFASELSVYTLTVITLERWHTI
410 420 430 440 450 460
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:. ... : . .:.: :.. .: .::.: :.: .:.:. .. :.
CCDS18 TYAIHLDQKLRLRHAILIMLGGWLFSSLIAMLPLVGVSNYMKVSICFPMDVETTLSQVYI
470 480 490 500 510 520
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 VALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENI-WDCSMVKHIALLLFTNCILNCPVAFL
.....:: . :... : :.: . . .: : ...:..:.:.::. :..:.
CCDS18 LTILILNVVAFFIICACYIKIYFAVRNPELMATNKDTKIAKKMAILIFTDFTCMAPISFF
530 540 550 560 570 580
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pF1KE9 SFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYVWTRSK
..:. ... .:. : .:.. :. .: ::.:: .:. :..:. :
CCDS18 AISAAFKVPLITVTNSKVLLVLFYPINSCANPFLYAIFTKTFQRDFFLLLSKFGCCKRRA
590 600 610 620 630 640
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pF1KE9 HPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSSVAFVP
CCDS18 ELYRRKDFSAYTSNCKNGFTGSNKPSQSTLKLSTLHCQGTALLDKTRYTEC
650 660 670 680 690
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CCDS18 MALLLVSLLAFLSLGSGCHHRICHCSNRVFLCQESKVTEIPS
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CCDS18 RIEKAN------------NLLYIN---------PEAFQN-LPNLQYLLISNTGIKHLPDV
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CCDS18 HKIHSLQKVLLWLNKNGIQEIHNCAFNGT-QLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGASGPVIL
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CCDS18 DISRTRIHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFA---N
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. .. . :.:. :... : ::. .:. :: : . .:. ::
CCDS18 WRRQISELHPICNKSI--LRQEVDYMTQARGQRSSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFDYDLC
260 270 280 290 300 310
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. . .: :::.: :.::: .. ..:. .: :..::.: : .: . : .. .
CCDS18 NEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIMGYNILRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPR
320 330 340 350 360 370
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.:. .: ... :. ..:.:: : ... .. :..:.:: . ::...:::: ::.
CCDS18 FLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVY
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:: .::: . .. ... :. . .... ..:.. : :..: :.: .::
CCDS18 TLTAITLERWHTITHAMQLDCKVQLRHAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICL
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:. . : .. :...:..:: : :... : ..: .. . .. . : ..:..:.:.
CCDS18 PMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVLAFVVICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLI
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::. . :..:...:. ... .:. :..:.. :. .: ::.:: .:. .:..:.
CCDS18 FTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFF
560 570 580 590 600 610
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:
CCDS18 ILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNGHCSSAPRVTSGSTYILVPLSHLAQN
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:::. : . : . . : . ... :.:.
CCDS18 MALLLVSLLAFLSLGSGCHHRICHCSNRVFLCQESKVTEIPS
10 20 30 40
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. : :: : ...: : . :: : .: :.. .: . . . ..:..::.:. .
CCDS18 DLP--RNAIELRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEI
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CCDS18 RIEKANNLLYINPEAFQNLPNLQYLLISNTGIKHLPDV--HKIHSLQKVLLDIQDNINIH
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. : : ..... : .: : ::. .:. .: :::. :. :: .:
CCDS18 TIERNSFVGLSFESVILWLNKNGIQEIHNCAFNGT-QLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGA
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. . ::.: . . :.: ::..: .:. ... :..: . :.. : . : .:::
CCDS18 SGPVILDISRTRIHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCA
220 230 240 250 260 270
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pF1KE9 FGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERD--LED--------FLL---D
:. : . .. . :.:. :... : ::. .:. :: : . .
CCDS18 FA---NWRRQISELHPICNKSI--LRQEVDYMTQARGQRSSLAEDNESSYSRGFDMTYTE
280 290 300 310 320 330
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pF1KE9 FEEDL-KALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPL
:. :: . . .: :::.: :.::: .. ..:. .: :..::.: : .: . :
CCDS18 FDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIMGYNILRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQY
340 350 360 370 380 390
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pF1KE9 YISPIKLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFA
.. ..:. .: ... :. ..:.:: : ... .. :..:.:: . ::...::
CCDS18 KLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFA
400 410 420 430 440 450
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CCDS18 SELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCKVQLRHAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYM
460 470 480 490 500 510
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pF1KE9 ASPLCLPLPFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDL-ENIWDCSMVK
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CCDS18 KVSICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVLAFVVICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAK
520 530 540 550 560 570
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pF1KE9 HIALLLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPH
..:.:.::. . :..:...:. ... .:. :..:.. :. .: ::.:: .:. .
CCDS18 RMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKN
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:..:. :
CCDS18 FRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNGHCSSAPRVTSGSTYILVPLSHL
640 650 660 670 680 690
907 residues in 1 query sequences
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