Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9439
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9439, 549 aa
1>>>pF1KE9439 549 - 549 aa - 549 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1759+/-0.000871; mu= 19.6400+/- 0.052
mean_var=72.2857+/-15.045, 0's: 0 Z-trim(106.7): 88 B-trim: 9 in 1/48
Lambda= 0.150851
statistics sampled from 9038 (9129) to 9038 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 2.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10786.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 549) 3667 807.5 0
CCDS76879.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 429) 2860 631.8 4.8e-181
CCDS55379.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 966) 804 184.6 4.5e-46
CCDS55377.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 987) 804 184.6 4.6e-46
CCDS55376.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 993) 804 184.7 4.6e-46
CCDS43921.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 995) 804 184.7 4.6e-46
CCDS55378.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1001) 804 184.7 4.6e-46
CCDS43922.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1003) 804 184.7 4.6e-46
CCDS14191.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1014) 804 184.7 4.7e-46
CCDS43923.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1017) 804 184.7 4.7e-46
CCDS32460.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 693) 784 180.2 7.1e-45
CCDS32461.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 687) 783 180.0 8.2e-45
CCDS73893.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 692) 783 180.0 8.3e-45
CCDS47491.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1193) 747 172.3 2.9e-42
CCDS47490.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1221) 747 172.3 2.9e-42
CCDS55064.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1222) 747 172.3 2.9e-42
CCDS47489.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1250) 747 172.3 3e-42
CCDS10785.1 ADGRG5 gene_id:221188|Hs108|chr16 ( 528) 740 170.5 4.4e-42
CCDS35409.1 ADGRG4 gene_id:139378|Hs108|chrX (3080) 724 167.6 1.9e-40
CCDS82926.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1240) 459 109.6 2.2e-23
CCDS54768.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1469) 459 109.7 2.5e-23
CCDS74296.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 526) 423 101.5 2.6e-21
CCDS74297.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 600) 423 101.6 2.8e-21
CCDS12315.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 652) 423 101.6 3e-21
CCDS12307.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1469) 411 99.2 3.5e-20
CCDS32928.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1474) 411 99.2 3.5e-20
CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584) 407 98.4 6.8e-20
CCDS32935.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 823) 396 95.8 2.1e-19
CCDS41352.1 ADGRL4 gene_id:64123|Hs108|chr1 ( 690) 385 93.3 9.8e-19
CCDS33159.2 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 ( 873) 383 93.0 1.6e-18
CCDS46238.1 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 ( 997) 383 93.0 1.8e-18
CCDS46239.1 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 (1079) 383 93.1 1.9e-18
CCDS76174.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1123) 370 90.2 1.4e-17
CCDS72811.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1177) 370 90.3 1.4e-17
CCDS689.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1403) 370 90.3 1.6e-17
CCDS81345.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1416) 370 90.3 1.6e-17
CCDS4919.1 ADGRF5 gene_id:221395|Hs108|chr6 (1346) 369 90.1 1.8e-17
CCDS34471.1 ADGRF1 gene_id:266977|Hs108|chr6 ( 910) 360 88.0 5.3e-17
CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1551) 362 88.6 5.9e-17
CCDS58643.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 709) 333 82.0 2.5e-15
CCDS58646.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 745) 333 82.1 2.6e-15
CCDS12175.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 886) 333 82.1 3e-15
CCDS72747.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1584) 332 82.1 5.5e-15
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 326 80.6 8.6e-15
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 326 80.6 8.9e-15
CCDS32931.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 742) 320 79.2 1.9e-14
CCDS32930.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 786) 320 79.2 2e-14
CCDS32929.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 835) 320 79.3 2.1e-14
CCDS796.1 CELSR2 gene_id:1952|Hs108|chr1 (2923) 326 81.0 2.2e-14
CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6 (1522) 322 79.9 2.4e-14
>>CCDS10786.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 (549 aa)
initn: 3667 init1: 3667 opt: 3667 Z-score: 4311.5 bits: 807.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3667; 100.0% identity (100.0% similar) in 549 aa overlap (1-549:1-549)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MATPRGLGALLLLLLLPTSGQEKPTEGPRNTCLGSNNMYDIFNLNDKALCFTKCRQSGSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MATPRGLGALLLLLLLPTSGQEKPTEGPRNTCLGSNNMYDIFNLNDKALCFTKCRQSGSD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 SCNVENLQRYWLNYEAHLMKEGLTQKVNTPFLKALVQNLSTNTAEDFYFSLEPSQVPRQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SCNVENLQRYWLNYEAHLMKEGLTQKVNTPFLKALVQNLSTNTAEDFYFSLEPSQVPRQV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 MKDEDKPPDRVRLPKSLFRSLPGNRSVVRLAVTILDIGPGTLFKGPRLGLGDGSGVLNNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MKDEDKPPDRVRLPKSLFRSLPGNRSVVRLAVTILDIGPGTLFKGPRLGLGDGSGVLNNR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LVGLSVGQMHVTKLAEPLEIVFSHQRPPPNMTLTCVFWDVTKGTTGDWSSEGCSTEVRPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LVGLSVGQMHVTKLAEPLEIVFSHQRPPPNMTLTCVFWDVTKGTTGDWSSEGCSTEVRPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 GTVCCCDHLTFFALLLRPTLDQSTVHILTRISQAGCGVSMIFLAFTIILYAFLRLSRERF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GTVCCCDHLTFFALLLRPTLDQSTVHILTRISQAGCGVSMIFLAFTIILYAFLRLSRERF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 KSEDAPKIHVALGGSLFLLNLAFLVNVGSGSKGSDAACWARGAVFHYFLLCAFTWMGLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KSEDAPKIHVALGGSLFLLNLAFLVNVGSGSKGSDAACWARGAVFHYFLLCAFTWMGLEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 FHLYLLAVRVFNTYFGHYFLKLSLVGWGLPALMVIGTGSANSYGLYTIRDRENRTSLELC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FHLYLLAVRVFNTYFGHYFLKLSLVGWGLPALMVIGTGSANSYGLYTIRDRENRTSLELC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 WFREGTTMYALYITVHGYFLITFLFGMVVLALVVWKIFTLSRATAVKERGKNRKKVLTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WFREGTTMYALYITVHGYFLITFLFGMVVLALVVWKIFTLSRATAVKERGKNRKKVLTLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 GLSSLVGVTWGLAIFTPLGLSTVYIFALFNSLQGVFICCWFTILYLPSQSTTVSSSTARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLSSLVGVTWGLAIFTPLGLSTVYIFALFNSLQGVFICCWFTILYLPSQSTTVSSSTARL
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 DQAHSASQE
:::::::::
CCDS10 DQAHSASQE
>>CCDS76879.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 (429 aa)
initn: 2860 init1: 2860 opt: 2860 Z-score: 3363.8 bits: 631.8 E(32554): 4.8e-181
Smith-Waterman score: 2860; 100.0% identity (100.0% similar) in 429 aa overlap (121-549:1-429)
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 FLKALVQNLSTNTAEDFYFSLEPSQVPRQVMKDEDKPPDRVRLPKSLFRSLPGNRSVVRL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MKDEDKPPDRVRLPKSLFRSLPGNRSVVRL
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 AVTILDIGPGTLFKGPRLGLGDGSGVLNNRLVGLSVGQMHVTKLAEPLEIVFSHQRPPPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AVTILDIGPGTLFKGPRLGLGDGSGVLNNRLVGLSVGQMHVTKLAEPLEIVFSHQRPPPN
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 MTLTCVFWDVTKGTTGDWSSEGCSTEVRPEGTVCCCDHLTFFALLLRPTLDQSTVHILTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MTLTCVFWDVTKGTTGDWSSEGCSTEVRPEGTVCCCDHLTFFALLLRPTLDQSTVHILTR
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 ISQAGCGVSMIFLAFTIILYAFLRLSRERFKSEDAPKIHVALGGSLFLLNLAFLVNVGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ISQAGCGVSMIFLAFTIILYAFLRLSRERFKSEDAPKIHVALGGSLFLLNLAFLVNVGSG
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 SKGSDAACWARGAVFHYFLLCAFTWMGLEAFHLYLLAVRVFNTYFGHYFLKLSLVGWGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SKGSDAACWARGAVFHYFLLCAFTWMGLEAFHLYLLAVRVFNTYFGHYFLKLSLVGWGLP
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 ALMVIGTGSANSYGLYTIRDRENRTSLELCWFREGTTMYALYITVHGYFLITFLFGMVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ALMVIGTGSANSYGLYTIRDRENRTSLELCWFREGTTMYALYITVHGYFLITFLFGMVVL
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KE9 ALVVWKIFTLSRATAVKERGKNRKKVLTLLGLSSLVGVTWGLAIFTPLGLSTVYIFALFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ALVVWKIFTLSRATAVKERGKNRKKVLTLLGLSSLVGVTWGLAIFTPLGLSTVYIFALFN
340 350 360 370 380 390
520 530 540
pF1KE9 SLQGVFICCWFTILYLPSQSTTVSSSTARLDQAHSASQE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SLQGVFICCWFTILYLPSQSTTVSSSTARLDQAHSASQE
400 410 420
>>CCDS55379.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (966 aa)
initn: 516 init1: 298 opt: 804 Z-score: 940.6 bits: 184.6 E(32554): 4.5e-46
Smith-Waterman score: 804; 33.9% identity (64.1% similar) in 460 aa overlap (84-523:440-881)
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 CRQSGSDSCNVENLQRYWLNYEAHLMKEGLTQKVNTPFLK-ALVQNLSTNTAEDFYFSLE
: ....: : :... ... . . .
CCDS55 HSPPDMLAPLAQRLLKVVDDIGLQLNFSNTTISLTSPSLALAVIRVNASSFNTTTFVAQD
410 420 430 440 450 460
120 130 140 150 160
pF1KE9 PSQVPRQVMKDEDKPPDRV---RLPKSLFRSLPGNRSVVRLAVTILDIGPGTLFKGPRLG
:... :: . . : . . ::.::. .::.. . : . . .::. : :
CCDS55 PANL--QVSLETQAPENSIGTITLPSSLMNNLPAHDMELASRVQFNFFETPALFQDPSL-
470 480 490 500 510 520
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 LGDGSGVLNNRLVGLSVGQMHVTKLAEPLEIVFSHQRPPPN-MTLTCVFWDVTK-GTTGD
. : . ... ::... : .:.. . ....: : . .:. :::::. . : :
CCDS55 ---ENLSLISYVISSSVANLTVRNLTRNVTVTLKHINPSQDELTVRCVFWDLGRNGGRGG
530 540 550 560 570 580
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 WSSEGCST-EVRPEGTVCCCDHLTFFALLL---RPTLDQSTVHILTRISQAGCGVSMIFL
::..:::. . : . :.: :.::: :..:: : .. . . :: :. :::.: :::
CCDS55 WSDNGCSVKDRRLNETICTCSHLTSFGVLLDLSRTSVLPAQMMALTFITYIGCGLSSIFL
590 600 610 620 630 640
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 AFTIILY-AFLRLSRERFKSEDAP-KIHVALGGSLFLLNLAFLVNVGSGSKGSDAACWAR
. :.. : :: .. : : : :: . : ..:.::::.::.. . .. : .
CCDS55 SVTLVTYIAFEKIRR------DYPSKILIQLCAALLLLNLVFLLDSWIALYKMQGLCISV
650 660 670 680 690
350 360 370 380 390
pF1KE9 GAVFHYFLLCAFTWMGLEAFHLYLLAVRVFNTYFGHYFLKLSLVGWGLPALMV--IGTGS
.. .::::: .::::::::::.:: :.:::::. .:.::. .::::.::..: : : :
CCDS55 AVFLHYFLLVSFTWMGLEAFHMYLALVKVFNTYIRKYILKFCIVGWGVPAVVVTIILTIS
700 710 720 730 740 750
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 ANSYGLYTIRDRENRTSLELCWFREGTTMYALYITVHGYFLITFLFGMVVLALVVWKIFT
..::: . : . ..::. ... ..:::: ::: . ::... .. .:. .
CCDS55 PDNYGLGSYGKFPNGSPDDFCWINNNA---VFYITVVGYFCVIFLLNVSMFIVVLVQ---
760 770 780 790 800 810
460 470 480 490 500 510
pF1KE9 LSRATAVKERGKNRKKVL----TLLGLSSLVGVTWGLAIFT--PLGLSTVYIFALFNSLQ
: : :. : .:: . .. ::. :.:.:::.:.:. :.... .:.::.::.::
CCDS55 LCRIKKKKQLGAQRKTSIQDLRSIAGLTFLLGITWGFAFFAWGPVNVTFMYLFAIFNTLQ
820 830 840 850 860 870
520 530 540
pF1KE9 GVFICCWFTILYLPSQSTTVSSSTARLDQAHSASQE
: :: .. .
CCDS55 GFFIFIFYCVAKENVRKQWRRYLCCGKLRLAENSGNASTERNGVSFSVQNGDVCLHDFTG
880 890 900 910 920 930
>>CCDS55377.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (987 aa)
initn: 516 init1: 298 opt: 804 Z-score: 940.5 bits: 184.6 E(32554): 4.6e-46
Smith-Waterman score: 804; 33.9% identity (64.1% similar) in 460 aa overlap (84-523:410-851)
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 CRQSGSDSCNVENLQRYWLNYEAHLMKEGLTQKVNTPFLK-ALVQNLSTNTAEDFYFSLE
: ....: : :... ... . . .
CCDS55 HSPPDMLAPLAQRLLKVVDDIGLQLNFSNTTISLTSPSLALAVIRVNASSFNTTTFVAQD
380 390 400 410 420 430
120 130 140 150 160
pF1KE9 PSQVPRQVMKDEDKPPDRV---RLPKSLFRSLPGNRSVVRLAVTILDIGPGTLFKGPRLG
:... :: . . : . . ::.::. .::.. . : . . .::. : :
CCDS55 PANL--QVSLETQAPENSIGTITLPSSLMNNLPAHDMELASRVQFNFFETPALFQDPSL-
440 450 460 470 480 490
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 LGDGSGVLNNRLVGLSVGQMHVTKLAEPLEIVFSHQRPPPN-MTLTCVFWDVTK-GTTGD
. : . ... ::... : .:.. . ....: : . .:. :::::. . : :
CCDS55 ---ENLSLISYVISSSVANLTVRNLTRNVTVTLKHINPSQDELTVRCVFWDLGRNGGRGG
500 510 520 530 540 550
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 WSSEGCST-EVRPEGTVCCCDHLTFFALLL---RPTLDQSTVHILTRISQAGCGVSMIFL
::..:::. . : . :.: :.::: :..:: : .. . . :: :. :::.: :::
CCDS55 WSDNGCSVKDRRLNETICTCSHLTSFGVLLDLSRTSVLPAQMMALTFITYIGCGLSSIFL
560 570 580 590 600 610
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 AFTIILY-AFLRLSRERFKSEDAP-KIHVALGGSLFLLNLAFLVNVGSGSKGSDAACWAR
. :.. : :: .. : : : :: . : ..:.::::.::.. . .. : .
CCDS55 SVTLVTYIAFEKIRR------DYPSKILIQLCAALLLLNLVFLLDSWIALYKMQGLCISV
620 630 640 650 660
350 360 370 380 390
pF1KE9 GAVFHYFLLCAFTWMGLEAFHLYLLAVRVFNTYFGHYFLKLSLVGWGLPALMV--IGTGS
.. .::::: .::::::::::.:: :.:::::. .:.::. .::::.::..: : : :
CCDS55 AVFLHYFLLVSFTWMGLEAFHMYLALVKVFNTYIRKYILKFCIVGWGVPAVVVTIILTIS
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