Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9426
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9426, 797 aa
1>>>pF1KE9426 797 - 797 aa - 797 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1993+/-0.00141; mu= 15.7276+/- 0.083
mean_var=89.1968+/-18.193, 0's: 0 Z-trim(100.0): 106 B-trim: 13 in 1/47
Lambda= 0.135800
statistics sampled from 5827 (5934) to 5827 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.519), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2938.1 ADGRG7 gene_id:84873|Hs108|chr3 ( 797) 5171 1024.5 0
CCDS77778.1 ADGRG7 gene_id:84873|Hs108|chr3 ( 502) 3150 628.4 8.8e-180
CCDS47491.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1193) 318 73.8 1.9e-12
CCDS47490.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1221) 318 73.8 2e-12
CCDS55064.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1222) 318 73.8 2e-12
CCDS47489.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1250) 318 73.8 2e-12
CCDS55379.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 966) 292 68.6 5.5e-11
CCDS55377.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 987) 292 68.6 5.6e-11
CCDS55376.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 993) 292 68.6 5.6e-11
CCDS43921.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 995) 292 68.6 5.7e-11
CCDS55378.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1001) 292 68.6 5.7e-11
CCDS43922.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1003) 292 68.6 5.7e-11
CCDS14191.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1014) 292 68.6 5.7e-11
CCDS43923.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1017) 292 68.6 5.8e-11
>>CCDS2938.1 ADGRG7 gene_id:84873|Hs108|chr3 (797 aa)
initn: 5171 init1: 5171 opt: 5171 Z-score: 5478.0 bits: 1024.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5171; 99.9% identity (100.0% similar) in 797 aa overlap (1-797:1-797)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MASCRAWNLRVLVAVVCGLLTGIILGLGIWRIVIRIQRGKSTSSSSTPTEFCRNGGTWEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MASCRAWNLRVLVAVVCGLLTGIILGLGIWRIVIRIQRGKSTSSSSTPTEFCRNGGTWEN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 GRCICTEEWKGLRCTIANFCENSTYMGFTFARIPVGRYGPSLQTCGKDTPNAGNPMAVRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 GRCICTEEWKGLRCTIANFCENSTYMGFTFARIPVGRYGPSLQTCGKDTPNAGNPMAVRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CSLSLYGEIELQKVTIGNCNENLETLEKQVKDVTAPLNNISSEVQILTSDANKLTAENIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 CSLSLYGEIELQKVTIGNCNENLETLEKQVKDVTAPLNNISSEVQILTSDANKLTAENIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 SATRVVGQIFNTSRNASPEAKKVAIVTVSQLLDASEDAFQRVAATANDDALTTLIEQMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 SATRVVGQIFNTSRNASPEAKKVAIVTVSQLLDASEDAFQRVAATANDDALTTLIEQMET
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 YSLSLGNQSVVEPNIAIQSANFSSENAVGPSNVRFSVQKGASSSLVSSSTFIHTNVDGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 YSLSLGNQSVVEPNIAIQSANFSSENAVGPSNVRFSVQKGASSSLVSSSTFIHTNVDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 PDAQTELQVLLNMTKNYTKTCGFVVYQNDKLFQSKTFTAKSDFSQKIISSKTDENEQDQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 PDAQTELQVLLNMTKNYTKTCGFVVYQNDKLFQSKTFTAKSDFSQKIISSKTDENEQDQS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 ASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKDWDTYGCQKDKGTDGFLRCRCNHTTNFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 ASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKDWDTYGCQKDKGTDGFLRCRCNHTTNFAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 LMTFRKDYQYPKSLDILSNVGCALSVTGLALTVIFQIVTRKVRKTSVTWVLVNLCISMLI
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LMTFKKDYQYPKSLDILSNVGCALSVTGLALTVIFQIVTRKVRKTSVTWVLVNLCISMLI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 FNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFDNNDIPRTDTINIPNPMCTAIAALLHYFLLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 FNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFDNNDIPRTDTINIPNPMCTAIAALLHYFLLVT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 FTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILFISLIGWGVPAIVVAITVGVIYSQNGNNPQWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 FTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILFISLIGWGVPAIVVAITVGVIYSQNGNNPQWE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 LDYRQEKICWLAIPEPNGVIKSPLLWSFIVPVTIILISNVVMFITISIKVLWKNNQNLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LDYRQEKICWLAIPEPNGVIKSPLLWSFIVPVTIILISNVVMFITISIKVLWKNNQNLTS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 TKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGITWILAYLMLVNDDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 TKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGITWILAYLMLVNDDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 TVRTKVFQSEASKVLMLLSSIGRRKSLPSVTRPRLRVKMYNFLRSLPTLHERFRLLETSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 TVRTKVFQSEASKVLMLLSSIGRRKSLPSVTRPRLRVKMYNFLRSLPTLHERFRLLETSP
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE9 STEEITLSESDNAKESI
:::::::::::::::::
CCDS29 STEEITLSESDNAKESI
790
>>CCDS77778.1 ADGRG7 gene_id:84873|Hs108|chr3 (502 aa)
initn: 3140 init1: 3140 opt: 3150 Z-score: 3341.1 bits: 628.4 E(32554): 8.8e-180
Smith-Waterman score: 3150; 98.2% identity (99.0% similar) in 494 aa overlap (306-797:9-502)
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 SVQKGASSSLVSSSTFIHTNVDGLNPDAQTELQVLLNMT--KNYTKTCGFVVYQNDKLFQ
:: .:: : ..:::::::::::::::::
CCDS77 MPVKMLFKELLLLLMMMPLQHYTKTCGFVVYQNDKLFQ
10 20 30
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 SKTFTAKSDFSQKIISSKTDENEQDQSASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SKTFTAKSDFSQKIISSKTDENEQDQSASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKDW
40 50 60 70 80 90
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 DTYGCQKDKGTDGFLRCRCNHTTNFAVLMTFRKDYQYPKSLDILSNVGCALSVTGLALTV
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DTYGCQKDKGTDGFLRCRCNHTTNFAVLMTFKKDYQYPKSLDILSNVGCALSVTGLALTV
100 110 120 130 140 150
460 470 480 490 500 510
pF1KE9 IFQIVTRKVRKTSVTWVLVNLCISMLIFNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFDNNDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IFQIVTRKVRKTSVTWVLVNLCISMLIFNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFDNNDI
160 170 180 190 200 210
520 530 540 550 560 570
pF1KE9 PRTDTINIPNPMCTAIAALLHYFLLVTFTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILFISLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PRTDTINIPNPMCTAIAALLHYFLLVTFTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILFISLI
220 230 240 250 260 270
580 590 600 610 620 630
pF1KE9 GWGVPAIVVAITVGVIYSQNGNNPQWELDYRQEKICWLAIPEPNGVIKSPLLWSFIVPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GWGVPAIVVAITVGVIYSQNGNNPQWELDYRQEKICWLAIPEPNGVIKSPLLWSFIVPVT
280 290 300 310 320 330
640 650 660 670 680 690
pF1KE9 IILISNVVMFITISIKVLWKNNQNLTSTKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGITWILAYLMLVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IILISNVVMFITISIKVLWKNNQNLTSTKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGITWILAYLMLVN
340 350 360 370 380 390
700 710 720 730 740 750
pF1KE9 DDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILYTVRTKVFQSEASKVLMLLSSIGRRKSLPSVTRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILYTVRTKVFQSEASKVLMLLSSIGRRKSLPSVTRP
400 410 420 430 440 450
760 770 780 790
pF1KE9 RLRVKMYNFLRSLPTLHERFRLLETSPSTEEITLSESDNAKESI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RLRVKMYNFLRSLPTLHERFRLLETSPSTEEITLSESDNAKESI
460 470 480 490 500
>>CCDS47491.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1193 aa)
initn: 405 init1: 228 opt: 318 Z-score: 336.8 bits: 73.8 E(32554): 1.9e-12
Smith-Waterman score: 651; 25.7% identity (56.3% similar) in 678 aa overlap (82-730:490-1096)
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 CRNGGTWENGRCICTEEWKGLRCTIANFCENSTYMGFTFA-RIPVGRYGPSLQTCGKDTP
: .: .: . : : : ::.: :
CCDS47 NNTNLEGKIIQQKLLKNNESLDEGLRLHTVNVRQLGHCLAMEEPKGYYWPSIQPSEYVLP
460 470 480 490 500 510
120 130 140 150 160
pF1KE9 NAGNP--MAVRLCSLSLYGEIELQ--KVTIGNCNENLETLEKQVKDVTAPLNNISSEVQI
.: : :.: . . . : :.:: .:.. :......
CCDS47 CPDKPGFSASRICFYNATNPLVTYWGPVDISNC----------LKEA----NEVANQILN
520 530 540 550 560
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 LTSDANKLTAENITSATRVVGQIFNTSRNASPEAKKVAIVTVSQLLDASEDAFQRVAATA
::.:...::. :::. .. : .: : .: . .. . :..:..:.. . . .
CCDS47 LTADGQNLTSANITNIVEQVKRIVNKEENIDITLGSTLMNIFSNILSSSDSDLLE----S
570 580 590 600 610 620
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 NDDALTTLIEQMETYSL-SLGNQSVVEPNIAIQ-SANFSSENAVGPSNVRFSVQKGASSS
...:: :. : .: : .. ... :.:.. :. . . ::. :: ::. ...
CCDS47 SSEALKTIDELAFKIDLNSTSHVNITTRNLALSVSSLLPGTNAI--SN--FSIGLPSNNE
630 640 650 660 670
290 300 310 320 330
pF1KE9 LVSSSTFIHTNVDGLNPDAQTEL--QVLLNMTKNYT---KTCGFVVYQNDKLFQSKTFTA
. : .:: : :.. : ..: :.. . . . :. ... :::.
CCDS47 SYFQMDFESGQVD---PLASVILPPNLLENLSPEDSVLVRRAQFTFFNKTGLFQDVGPQR
680 690 700 710 720 730
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 KSDFSQKIISSKTDENEQDQSASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKD----WDT
:. : . : . . :. . :.. .. .: ... :..:.:. . :.:
CCDS47 KTLVSYVMACSIGNITIQNLKDPVQIKIKHTRTQ---EVHHPICAFWDLNKNKSFGGWNT
740 750 760 770 780 790
400 410 420 430 440
pF1KE9 YGCQKDKGTDGFLR-CRCNHTTNFAVLMTFRK-----DYQYPKSLDILSNVGCALSVTGL
:: . .:. : ::: :.:.::: . . : . : : ..: .::..:.
CCDS47 SGCVAHRDSDASETVCLCNHFTHFGVLMDLPRSASQLDARNTKVLTFISYIGCGISAIFS
800 810 820 830 840 850
450 460 470 480 490 500
pF1KE9 ALTVIFQIVTRKVRKTSVTWVLVNLCISMLIFNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFD
: :.. .. .:.:. . .:.:: ..:..::::.. :: :.... :
CCDS47 AATLLTYVAFEKLRRDYPSKILMNLSTALLFLNLLFLL------------DGWITSFNVD
860 870 880 890
510 520 530 540 550 560
pF1KE9 NNDIPRTDTINIPNPMCTAIAALLHYFLLVTFTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILF
. .: :.:.:::.:::.:::: .: : ..: :..... :..::
CCDS47 G--------------LCIAVAVLLHFFLLATFTWMGLEAIHMYIALVKVFNTYIRRYILK
900 910 920 930 940
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 ISLIGWGVPAIVVAITVGVIYSQNGNNPQWELDYRQEK---ICWLAIPEPNGVIKSPLLW
. .::::.::.::.. :. :.:.:. . .: .:: .:: :..:..
CCDS47 FCIIGWGLPALVVSV---VLASRNNNEVYGKESYGKEKGDEFCW---------IQDPVI-
950 960 970 980 990
630 640 650 660 670 680
pF1KE9 SFIVPVT----IILISNVVMFITISIKVLWKNNQNLTSTKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGI
: : . .... :..:::.. ... .:.. . : . .... :..:.. ..:.
CCDS47 -FYVTCAGYFGVMFFLNIAMFIVVMVQICGRNGKRSNRTLREEVLRNLRSVVSLTFLLGM
1000 1010 1020 1030 1040 1050
690 700 710 720 730 740
pF1KE9 TWILAYLMLVNDDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILYTVRTKVFQSEASKVLMLLSSIG
:: .:.. . : : :.: .::. ::: :::.. . . :..
CCDS47 TWGFAFFAW---GPLNIPFMYLFSIFNSLQGLFIFIFHCAMKENVQKQWRQHLCCGRFRL
1060 1070 1080 1090 1100
750 760 770 780 790
pF1KE9 RRKSLPSVTRPRLRVKMYNFLRSLPTLHERFRLLETSPSTEEITLSESDNAKESI
CCDS47 ADNSDWSKTATNIIKKSSDNLGKSLSSSSIGSNSTYLTSKSKSSSTTYFKRNSHTDNVSY
1110 1120 1130 1140 1150 1160
>>CCDS47490.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1221 aa)
initn: 405 init1: 228 opt: 318 Z-score: 336.7 bits: 73.8 E(32554): 2e-12
Smith-Waterman score: 651; 25.7% identity (56.3% similar) in 678 aa overlap (82-730:518-1124)
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 CRNGGTWENGRCICTEEWKGLRCTIANFCENSTYMGFTFA-RIPVGRYGPSLQTCGKDTP
: .: .: . : : : ::.: :
CCDS47 NNTNLEGKIIQQKLLKNNESLDEGLRLHTVNVRQLGHCLAMEEPKGYYWPSIQPSEYVLP
490 500 510 520 530 540
120 130 140 150 160
pF1KE9 NAGNP--MAVRLCSLSLYGEIELQ--KVTIGNCNENLETLEKQVKDVTAPLNNISSEVQI
.: : :.: . . . : :.:: .:.. :......
CCDS47 CPDKPGFSASRICFYNATNPLVTYWGPVDISNC----------LKEA----NEVANQILN
550 560 570 580 590
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 LTSDANKLTAENITSATRVVGQIFNTSRNASPEAKKVAIVTVSQLLDASEDAFQRVAATA
::.:...::. :::. .. : .: : .: . .. . :..:..:.. . . .
CCDS47 LTADGQNLTSANITNIVEQVKRIVNKEENIDITLGSTLMNIFSNILSSSDSDLLE----S
600 610 620 630 640
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 NDDALTTLIEQMETYSL-SLGNQSVVEPNIAIQ-SANFSSENAVGPSNVRFSVQKGASSS
...:: :. : .: : .. ... :.:.. :. . . ::. :: ::. ...
CCDS47 SSEALKTIDELAFKIDLNSTSHVNITTRNLALSVSSLLPGTNAI--SN--FSIGLPSNNE
650 660 670 680 690 700
290 300 310 320 330
pF1KE9 LVSSSTFIHTNVDGLNPDAQTEL--QVLLNMTKNYT---KTCGFVVYQNDKLFQSKTFTA
. : .:: : :.. : ..: :.. . . . :. ... :::.
CCDS47 SYFQMDFESGQVD---PLASVILPPNLLENLSPEDSVLVRRAQFTFFNKTGLFQDVGPQR
710 720 730 740 750 760
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 KSDFSQKIISSKTDENEQDQSASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKD----WDT
:. : . : . . :. . :.. .. .: ... :..:.:. . :.:
CCDS47 KTLVSYVMACSIGNITIQNLKDPVQIKIKHTRTQ---EVHHPICAFWDLNKNKSFGGWNT
770 780 790 800 810
400 410 420 430 440
pF1KE9 YGCQKDKGTDGFLR-CRCNHTTNFAVLMTFRK-----DYQYPKSLDILSNVGCALSVTGL
:: . .:. : ::: :.:.::: . . : . : : ..: .::..:.
CCDS47 SGCVAHRDSDASETVCLCNHFTHFGVLMDLPRSASQLDARNTKVLTFISYIGCGISAIFS
820 830 840 850 860 870
450 460 470 480 490 500
pF1KE9 ALTVIFQIVTRKVRKTSVTWVLVNLCISMLIFNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFD
: :.. .. .:.:. . .:.:: ..:..::::.. :: :.... :
CCDS47 AATLLTYVAFEKLRRDYPSKILMNLSTALLFLNLLFLL------------DGWITSFNVD
880 890 900 910 920
510 520 530 540 550 560
pF1KE9 NNDIPRTDTINIPNPMCTAIAALLHYFLLVTFTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILF
. .: :.:.:::.:::.:::: .: : ..: :..... :..::
CCDS47 G--------------LCIAVAVLLHFFLLATFTWMGLEAIHMYIALVKVFNTYIRRYILK
930 940 950 960 970
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 ISLIGWGVPAIVVAITVGVIYSQNGNNPQWELDYRQEK---ICWLAIPEPNGVIKSPLLW
. .::::.::.::.. :. :.:.:. . .: .:: .:: :..:..
CCDS47 FCIIGWGLPALVVSV---VLASRNNNEVYGKESYGKEKGDEFCW---------IQDPVI-
980 990 1000 1010 1020
630 640 650 660 670 680
pF1KE9 SFIVPVT----IILISNVVMFITISIKVLWKNNQNLTSTKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGI
: : . .... :..:::.. ... .:.. . : . .... :..:.. ..:.
CCDS47 -FYVTCAGYFGVMFFLNIAMFIVVMVQICGRNGKRSNRTLREEVLRNLRSVVSLTFLLGM
1030 1040 1050 1060 1070
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pF1KE9 TWILAYLMLVNDDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILYTVRTKVFQSEASKVLMLLSSIG
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CCDS55 PQSETISSPMPQTHVSGTPPPVKASFSSPTVSAPANVNTTSAPPVQTDIVNTSSISDLEN
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CCDS55 QVLQMEKALSLG-SLEPNLAGEMINQVSRLLHSPPDMLAPLAQRLLKVVDDIGLQL---N
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