Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9421
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9421, 348 aa
1>>>pF1KE9421 348 - 348 aa - 348 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1180+/-0.00113; mu= 17.5911+/- 0.067
mean_var=168.3481+/-69.610, 0's: 0 Z-trim(104.3): 297 B-trim: 981 in 2/48
Lambda= 0.098849
statistics sampled from 7240 (7847) to 7240 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.241), width: 16
Scan time: 2.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 2320 343.8 1.2e-94
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 1690 254.0 1.4e-67
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 ( 342) 1625 244.7 8.3e-65
CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 ( 337) 1052 163.0 3.3e-40
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 983 153.2 3e-37
CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 351) 886 139.3 4.5e-33
CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 306) 849 134.0 1.6e-31
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 434 75.0 1.2e-13
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 421 73.1 4.2e-13
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 421 73.1 4.3e-13
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 421 73.1 4.3e-13
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 421 73.1 4.3e-13
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 421 73.1 4.4e-13
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 421 73.2 4.5e-13
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 409 71.3 1.3e-12
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 409 71.5 1.5e-12
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 409 71.5 1.5e-12
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 409 71.5 1.6e-12
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 409 71.5 1.6e-12
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 409 71.5 1.6e-12
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 408 71.4 1.7e-12
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 407 71.2 1.9e-12
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 405 70.8 2e-12
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 405 70.8 2.1e-12
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 ( 412) 401 70.3 3.2e-12
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 386 68.1 1.4e-11
>>CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 (348 aa)
initn: 2320 init1: 2320 opt: 2320 Z-score: 1812.5 bits: 343.8 E(32554): 1.2e-94
Smith-Waterman score: 2320; 100.0% identity (100.0% similar) in 348 aa overlap (1-348:1-348)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHF
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CCDS75 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 KQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 FHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLLFFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLLFFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQAQS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 SSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILVWCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILVWCV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE9 YYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
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CCDS75 YYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
310 320 330 340
>>CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 (345 aa)
initn: 1711 init1: 1682 opt: 1690 Z-score: 1327.0 bits: 254.0 E(32554): 1.4e-67
Smith-Waterman score: 1690; 69.0% identity (89.0% similar) in 345 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHF
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CCDS51 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 KQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASL
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CCDS51 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 FHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEEL
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CCDS51 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLLFFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQAQS
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CCDS51 SDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKTES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 SSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILVWCV
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CCDS51 SSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE9 YYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
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CCDS51 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
310 320 330 340
>>CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 (342 aa)
initn: 1657 init1: 1596 opt: 1625 Z-score: 1276.9 bits: 244.7 E(32554): 8.3e-65
Smith-Waterman score: 1625; 67.6% identity (89.8% similar) in 343 aa overlap (1-343:1-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHF
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CCDS51 MTSNFSQP-VVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 KQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASL
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CCDS51 KQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 FHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEEL
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CCDS51 LHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEEL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLLFFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQAQS
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CCDS51 VSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVES
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 SSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILVWCV
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CCDS51 SSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWSA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340
pF1KE9 YYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
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CCDS51 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
300 310 320 330 340
>>CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 (337 aa)
initn: 1100 init1: 690 opt: 1052 Z-score: 835.4 bits: 163.0 E(32554): 3.3e-40
Smith-Waterman score: 1052; 46.2% identity (75.5% similar) in 331 aa overlap (13-343:16-337)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAI
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CCDS51 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQ-VNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 LHFKQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCF
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CCDS51 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 ASLFHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGI
.:.:::: ::.::. :. ::: ::.:::: :. :. .: ..:. ..:: . : .
CCDS51 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 EELVVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLLFFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQ
. . . :::.:: ::. : : : :::.: . :. .: :::.:: .::..: .: :.
CCDS51 SQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQI-TTLSK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 AQSSSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILV
. ... ::.:::::::::::.. .:. :::. .:...:. ..::::: :..:..
CCDS51 SLAGA-------AKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE9 WCVYYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
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CCDS51 WFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
300 310 320 330
>>CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 (339 aa)
initn: 981 init1: 512 opt: 983 Z-score: 782.2 bits: 153.2 E(32554): 3e-37
Smith-Waterman score: 983; 42.8% identity (73.1% similar) in 334 aa overlap (13-343:4-336)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHF
.:.. .: ::.:. .: :. ::... . . . :::.:...: ::
CCDS51 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSISHF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 KQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASL
::::::::.:: :.: .:::.: :::.: :::.: :::::. .::.:: : . ::.
CCDS51 KQLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSSASI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 FHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEEL
::: ::.::: :: ::: : .:... : . : .:: ....:.... : .: ::.
CCDS51 FHLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGAEEI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE9 VVA-LTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLL-FFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQA
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CCDS51 YYKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLI-SDANQK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 QSSSESYKERVAK-RERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILV
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CCDS51 LQIGLEMKNGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDVLI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE9 WCVYYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
: : ::..::..::::: :: ::.:... ::... ::: .:: :
CCDS51 WFGYLNSTFNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS
300 310 320 330
>>CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (351 aa)
initn: 882 init1: 551 opt: 886 Z-score: 707.3 bits: 139.3 E(32554): 4.5e-33
Smith-Waterman score: 886; 40.2% identity (70.1% similar) in 321 aa overlap (14-333:25-337)
10 20 30 40
pF1KE9 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFG
: . :.:: .. : : : .:. .. . .. ::
CCDS34 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 NLLVMIAILHFKQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHT
:: ..:.: .:::::::::::: :.: .:::.: :.::.: .::::.::::: ..::..
CCDS34 NLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 CFDTSFCFASLFHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFY
:: . ..:.:::: ...::. :. :: : ::.:. : ..: : ...:.. .
CCDS34 SFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 TGANEEGIEELVVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLL-FFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQA
. : .::: . ..: ..: . .:. : :. :: :. :: ::.::: :....:
CCDS34 SEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 RKIESTASQAQSSSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFIT
. :.. :. ...: :...::::::::....::. :.: . ..: ..:: :
CCDS34 HAINNL-------RENQNNQV-KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFST
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 PPYVYEILVWCVYYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
: ... :.: :.::. :::::.::: :: .:.: :. ::.. .
CCDS34 PVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
300 310 320 330 340 350
>>CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (306 aa)
initn: 843 init1: 512 opt: 849 Z-score: 679.3 bits: 134.0 E(32554): 1.6e-31
Smith-Waterman score: 849; 40.7% identity (71.3% similar) in 300 aa overlap (35-333:1-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 FSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHFKQLH
.:. .. . .. :::: ..:.: .:::::
CCDS51 MYSFMAGSIFITIFGNLAMIISISYFKQLH
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 TPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASLFHLC
::::::: :.: .:::.: :.::.: .::::.::::: ..::.. :: . ..:.::::
CCDS51 TPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYYSFDLMLSITSIFHLC
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEELVVAL
...::. :. :: : ::.:. : ..: : ...:.. .. : .::: . .
CCDS51 SVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVFSEAYADGIEGYDILV
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