Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9420
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9420, 337 aa
1>>>pF1KE9420 337 - 337 aa - 337 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1731+/-0.00105; mu= 16.9313+/- 0.062
mean_var=175.8025+/-63.959, 0's: 0 Z-trim(104.8): 363 B-trim: 1018 in 2/47
Lambda= 0.096730
statistics sampled from 7463 (8101) to 7463 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 2.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 ( 337) 2286 332.1 4e-91
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 1052 159.9 2.8e-39
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 1025 156.1 3.8e-38
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 ( 342) 1019 155.3 6.8e-38
CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 351) 973 148.9 5.9e-36
CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 306) 923 141.8 6.9e-34
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 561 91.4 1.2e-18
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 538 88.2 1.1e-17
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 538 88.3 1.2e-17
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 398 68.8 9.6e-12
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 395 68.2 1.1e-11
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 395 68.3 1.2e-11
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 395 68.3 1.2e-11
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 395 68.3 1.2e-11
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 395 68.3 1.2e-11
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 395 68.4 1.2e-11
>>CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 (337 aa)
initn: 2286 init1: 2286 opt: 2286 Z-score: 1749.5 bits: 332.1 E(32554): 4e-91
Smith-Waterman score: 2286; 100.0% identity (100.0% similar) in 337 aa overlap (1-337:1-337)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAVS
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CCDS51 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 YFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 YFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 SIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 QWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLSKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 QWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLSKSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 AGAAKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFIWFAYFNSAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 AGAAKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFIWFAYFNSAC
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE9 NPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 NPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
310 320 330
>>CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 (348 aa)
initn: 1100 init1: 690 opt: 1052 Z-score: 818.7 bits: 159.9 E(32554): 2.8e-39
Smith-Waterman score: 1052; 46.2% identity (75.5% similar) in 331 aa overlap (16-337:13-343)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQ-VNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV
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CCDS75 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL
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CCDS75 LHFKQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL
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CCDS75 ASLFHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 SQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQI-TTLSK
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CCDS75 EELVVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLLFFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 SLAGA-------AKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFI
. ... ::.:::::::::::.. .:. :::. .:...:. ..::::: :..:..
CCDS75 AQSSSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE9 WFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
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CCDS75 WCVYYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
300 310 320 330 340
>>CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 (345 aa)
initn: 1037 init1: 699 opt: 1025 Z-score: 798.3 bits: 156.1 E(32554): 3.8e-38
Smith-Waterman score: 1025; 43.8% identity (74.9% similar) in 331 aa overlap (16-337:13-343)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MRAVFIQGAEEHPAAFCY-QVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV
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CCDS51 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL
.:: ::.:::::. ::: ::...:. :.:.: .:.:::::.:: .: .:: :. ::
CCDS51 LHFKQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL
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CCDS51 SSLFHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 SQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQI-TTLSK
. . . :.:.:: ..:. : .: ::.: .::: :: .::.:: :::..: .: ::
CCDS51 EELSDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 SLAGA-------AKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFI
. ... :..:::::::::..: ... :::..::...:... :::: ...:
CCDS51 TESSSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE9 WFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
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CCDS51 WCAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
300 310 320 330 340
>>CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 (342 aa)
initn: 1063 init1: 690 opt: 1019 Z-score: 793.8 bits: 155.3 E(32554): 6.8e-38
Smith-Waterman score: 1019; 44.1% identity (73.7% similar) in 331 aa overlap (16-337:12-342)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQ-VNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV
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CCDS51 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL
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CCDS51 LHFKQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL
.:..::::: :::. .. :::.: .:::: :. : ..: .: .:.. .:: : . :
CCDS51 SSVLHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 SQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLSKS
. . . :::.::..... : ..: :::.: :.:: :: :::..: .:: .: : :..
CCDS51 EELVSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 LAGA--------AKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFI
. .. ::.:::::::::..: ... :::.:.: ..:... :.:: ...:
CCDS51 VESSSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE9 WFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
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CCDS51 WSAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
300 310 320 330 340
>>CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (351 aa)
initn: 976 init1: 566 opt: 973 Z-score: 759.0 bits: 148.9 E(32554): 5.9e-36
Smith-Waterman score: 973; 43.3% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (21-326:30-336)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLG
: :::.. ..::.....: :....: ..:
CCDS34 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 NVFVAFAVSYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHT
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CCDS34 NLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 YLDTLFCLTSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLY
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CCDS34 SFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 TDVVETRLSQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPL-FFVPCLIMISLYVKIFVVATRQA
... . . . : .:: ...::.:: : ::.: .:...: :::.:. ..:
CCDS34 SEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 QQITTLSKSLAGAAKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIF
. :..: .. . .:...::::::::..:..::::.: . ..: .:.: :: ..:: .
CCDS34 HAINNLRENQNNQVKKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPVVLFDAL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330
pF1KE9 IWFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
::.::::.:::.:: : : :::.::: : :.::
CCDS34 TWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
310 320 330 340 350
>>CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (306 aa)
initn: 924 init1: 514 opt: 923 Z-score: 721.9 bits: 141.8 E(32554): 6.9e-34
Smith-Waterman score: 923; 43.6% identity (74.9% similar) in 291 aa overlap (37-326:1-291)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 QGAEEHPAAFCYQVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAVSYFKALH
.: :....: ..::. . ...:::: ::
CCDS51 MYSFMAGSIFITIFGNLAMIISISYFKQLH
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 TPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCLTSIFHLC
::::::.::.:..:..::. ..: : :::::.::.:: .:... .: .. .:::::::
CCDS51 TPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYYSFDLMLSITSIFHLC
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 FISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRLSQWLEEM
..::: ::: :::: .:.:. : : .: :.::.:.. ..... . . .
CCDS51 SVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVFSEAYADGIEGYDILV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 PCVGSCQLLLNKFWGWLNFPL-FFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLSKSLAGAAK
: .:: ...::.:: : ::.: .:...: :::.:. ..:. :..: .. . .:
CCDS51 ACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHAHAINNLRENQNNQVK
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 HERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFIWFAYFNSACNPIIY
...::::::::..:..::::.: . ..: .:.: :: ..:: . ::.::::.:::.::
CCDS51 KDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIY
220 230 240 250 260 270
310 320 330
pF1KE9 VFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
: : :::.::: : :.::
CCDS51 GFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
280 290 300
>>CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 (339 aa)
initn: 762 init1: 440 opt: 561 Z-score: 448.5 bits: 91.4 E(32554): 1.2e-18
Smith-Waterman score: 893; 39.0% identity (71.5% similar) in 333 aa overlap (16-337:4-336)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQV-NGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV
::... : :: .. . .. .: . .: ..::..: ..
CCDS51 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSI
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL
:.:: ::::::.:. :.: .:..:: ::.: : .::.: ::.::. .:..:: : ..
CCDS51 SHFKQLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL
.::::: ::::::. :.:::: : .:... : .:. .:.:::... ... ..
CCDS51 ASIFHLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 SQ-WLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPL-FFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLS
. . ... : :.:.....:. : :.: :..: ::. .: .:...: .::. :. .
CCDS51 EEIYYKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLISDAN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE9 KSLA-------GAAK-HERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDI
..: : .. .::::.:::::..:..:.:: :: : :..: .::.: :: . :.
CCDS51 QKLQIGLEMKNGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDV
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE9 FIWFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
.:::.:.::. ::..:.: : :::::::. : :.:. .. :. :
CCDS51 LIWFGYLNSTFNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS
290 300 310 320 330
>>CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 (359 aa)
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Smith-Waterman score: 538; 35.7% identity (66.4% similar) in 283 aa overlap (34-313:18-296)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]