FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9417, 370 aa
1>>>pF1KE9417 370 - 370 aa - 370 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4685+/-0.00136; mu= 15.3913+/- 0.081
mean_var=115.8651+/-36.339, 0's: 0 Z-trim(100.9): 341 B-trim: 786 in 2/44
Lambda= 0.119151
statistics sampled from 5772 (6295) to 5772 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16
Scan time: 2.040
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX ( 339) 666 126.5 3.4e-29
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 663 126.0 4.8e-29
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 623 119.1 5.9e-27
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 623 119.1 5.9e-27
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 617 118.1 1.2e-26
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CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 585 112.6 5.2e-25
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 578 111.4 1.3e-24
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 573 110.6 2.4e-24
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CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 568 109.7 4.4e-24
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 568 109.7 4.4e-24
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 566 109.3 5.3e-24
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 561 108.5 9.6e-24
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 558 107.9 1.3e-23
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 557 107.9 1.7e-23
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 541 105.0 1e-22
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 540 104.9 1.2e-22
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 539 104.8 1.4e-22
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 524 102.1 7.6e-22
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 524 102.1 7.8e-22
CCDS2480.1 GPR55 gene_id:9290|Hs108|chr2 ( 319) 522 101.7 9.2e-22
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 517 100.9 1.8e-21
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 516 100.8 2.1e-21
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CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 515 100.6 2.4e-21
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 516 100.9 2.5e-21
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CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 514 100.5 2.8e-21
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CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 514 100.5 2.9e-21
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CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 514 100.5 3e-21
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 512 100.0 3.2e-21
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 505 98.8 7.5e-21
CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 ( 337) 502 98.3 1e-20
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CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 496 97.3 2.2e-20
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 493 96.8 3.3e-20
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 490 96.3 4.5e-20
>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX (370 aa)
initn: 2418 init1: 2418 opt: 2418 Z-score: 2264.8 bits: 427.7 E(32554): 7.8e-120
Smith-Waterman score: 2418; 100.0% identity (100.0% similar) in 370 aa overlap (1-370:1-370)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFNRHWPFGDTLCKISGTAFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFNRHWPFGDTLCKISGTAFLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 NIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFSTTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFSTTN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VNNATTTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRKPATLSQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VNNATTTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRKPATLSQI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 GTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVRSQAITNCFLERFAKIMYPITLCLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVRSQAITNCFLERFAKIMYPITLCLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 TLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSDQTTNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSDQTTNN
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE9 GGELMLESTF
::::::::::
CCDS14 GGELMLESTF
370
>>CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 (344 aa)
initn: 1253 init1: 636 opt: 1227 Z-score: 1158.7 bits: 222.9 E(32554): 3.2e-58
Smith-Waterman score: 1227; 58.6% identity (83.1% similar) in 302 aa overlap (31-329:9-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVS
:. .:::::.: : ..:.::.::::.: :.
CCDS94 MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFNRHWPFGDTLCKISGTAFLT
...: .:.:.::. .. :::.:::::: ::::.::: .:.::::: ::::: : :
CCDS94 IYIFICVLKVRNETTTYMINLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYT
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 NIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFSTTN
:.:::.::::::::::::::::::.:.:.::.::. :::.:::. :..:. : . ..:.
CCDS94 NMYGSILFLTCISVDRFLAIVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTH
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KE9 V--NNATTTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRKPATLS
:::. .:::.: . .::::::.:.::::.:::.:::::::.:::.::.:: ::.:::
CCDS94 SQGNNASEACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLS
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 QIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVRSQAITNCFLERFAKIMYPITLC
. :: :::::: ::. .: :::::: :.::.:::.:...:: . .. :::::::
CCDS94 RSKINKTKVLKMIFVHLIIFCFCFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLC
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 LATLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYI-NAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSDQT
.:. ::::::..:::: ...:.:. . : .:
CCDS94 IAVSNCCFDPIVYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIF
280 290 300 310 320 330
360 370
pF1KE9 TNNGGELMLESTF
CCDS94 DNESAA
340
>>CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 (372 aa)
initn: 649 init1: 384 opt: 689 Z-score: 658.5 bits: 130.5 E(32554): 2.3e-30
Smith-Waterman score: 689; 35.7% identity (68.5% similar) in 311 aa overlap (22-322:2-308)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIV---DDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITN
:.:....:. .. : . :. .:::.:. :: :
CCDS85 MLANSSSTNSSVLPCPDYRPTHRLHLVVYSLVLAAGLPLN
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 SVSLFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFNRHWPFGDTLCKISGTA
...:.:: ....: ..... :::.:::::. .:: .. : .:::: : ::. .:.
CCDS85 ALALWVFLRALRVHSVVSVYMCNLAASDLLFTLSLPVRLSYYALHHWPFPDLLCQTTGAI
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 FLTNIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFS
: :.::: .:: :.:::. :::.:.: : .: : . ..: ::: :.: .. :.
CCDS85 FQMNMYGSCIFLMLINVDRYAAIVHPLRLRHLRRPRVARLLCLGVWALILVFAVPAARVH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 TTNV----NNATTTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRK
. . . :::.:: ..:: : .... :..::..:: : :. :. :: .
CCDS85 RPSRCRYRDLEVRLCFESFSDELWKGRLLPLVLLAEALGFLLPLAAVVYSSGRVFWTLAR
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 P-ATLSQIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVRSQAITNCF--LERFAK
: :: :: ..:..... .....:..:::::::.: .:.:.::. .. .:
CCDS85 PDATQSQ---RRRKTVRLLLANLVIFLLCFVPYNSTLAVYGLLRSKLVAASVPARDRVRG
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 IMYPITLCLATLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQ
... ..: :: :: .::..:::. :.:....
CCDS85 VLMVMVL-LAGANCVLDPLVYYFSAEGFRNTLRGLGTPHRARTSATNGTRAALAQSERSA
280 290 300 310 320 330
360 370
pF1KE9 EEVSDQTTNNGGELMLESTF
CCDS85 VTTDATRPDAASQGLLRPSDSHSLSSFTQCPQDSAL
340 350 360 370
>>CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX (339 aa)
initn: 337 init1: 337 opt: 666 Z-score: 637.6 bits: 126.5 E(32554): 3.4e-29
Smith-Waterman score: 666; 34.3% identity (70.0% similar) in 297 aa overlap (25-319:19-313)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDD-SFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSV
.::. : : . .:.:.: ...: ..:: ::..::.
CCDS14 MANLDKYTETFKMGSNSTSTAEIYCNVTNVKFQYSLYATTYILIFIPGLLANSA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 SLFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFNRHWPFGDTLCKISGTAFL
.:.:.: .. .... ::. ::.:.:: : .::..:.: ...:::: .:: .
CCDS14 ALWVLCRFISKKNKAIIFMINLSVADLAHVLSLPLRIYYYISHHWPFQRALCLLCFYLKY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 TNIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFSTT
:.:.:. ::::::..: . .. :::.: . :: .. . :..::.: .. . .. .:
CCDS14 LNMYASICFLTCISLQRCFFLLKPFRARDWK-RRYDVGISAAIWIVVGTACLPFPILRST
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 NVNNATTTCFEGFS-KRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRKPATLS
..:: . .:: .. :.. . : . :..::.::.:. . :. . .::.:
CCDS14 DLNN-NKSCFADLGYKQMNAVALVGMITVAELAGFVIPVIIIAWCTWKTTISLRQPPMAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 QIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVRSQAITNCFLERFAKIMYPITLC
: ....:.:.:. . ::: .::.::. ...:..:. :..: . :.: ..:. ::
CCDS14 QGISERQKALRMVFMCAAVFFICFTPYHINFIFYTMVKETIISSCPVVRIALYFHPFCLC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 LATLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSDQTT
::.: : .::..::: :.
CCDS14 LASLCCLLDPILYYFMASEFRDQLSRHGSSVTRSRLMSKESGSSMIG
300 310 320 330
>>CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX (333 aa)
initn: 653 init1: 362 opt: 663 Z-score: 634.9 bits: 126.0 E(32554): 4.8e-29
Smith-Waterman score: 663; 34.1% identity (65.0% similar) in 331 aa overlap (27-346:3-332)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDS----FKYNLNGAVYSVVFILGLIT
:: :: :. :.: . ...:.:... :::
CCDS14 MPANYTCTRPDGDNTDFRYFIYAVTYTVILVPGLIG
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 NSVSLFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFNRHWPFGDTLCKISGT
: ..:.:: :: ....::. :::..::: : .::..::: .:. :::: :: .
CCDS14 NILALWVFYGYMKETKRAVIFMINLAIADLLQVLSLPLRIFYYLNHDWPFGPGLCMFCFY
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 AFLTNIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLF
.:.:.:. ::.:::: :: ..:::: . . . . : :: :... . . :.
CCDS14 LKYVNMYASIYFLVCISVRRFWFLMYPFRFHDCKQKYDLYISIAG-WLIICLACVLFPLL
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 STTN-VNNATTTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFI-EVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRKP
:.. ... : :: . : . : . . : :..::. ::.. . :. .. .:.
CCDS14 RTSDDTSGNRTKCFVDLPTRNVNLAQSVVMMTIGELIGFVTPLLIVLYCTWKTVLSLQDK
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 ATLSQIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVRSQAITNCFLERFAKIMYP
..: .:.:.:::: . .::..::.::. . : ::.:. : .:. .: :..
CCDS14 YPMAQDLGEKQKALKMILTCAGVFLICFAPYHFSFPLDFLVKSNEIKSCLARRVILIFHS
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE9 ITLCLATLNCCFDPFIYYFTLESFQK-----SFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAI
..::::.:: :.:: ::::. . :.. ... . ... .:. ...: : : :
CCDS14 VALCLASLNSCLDPVIYYFSTNEFRRRLSRQDLHDSIQLHAKSFVSNHTASTMTPELC
280 290 300 310 320 330
350 360 370
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>>CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY (359 aa)
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CCDS14 RRAVGLAAVVLLAFVTCFAPNNFVLL------AHIVSRLFYGKSYYHVYKLTLCLSCLNN
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CCDS94 LSIYVFLQPYKKSTSVNVFMLNLAISDLLFISTLPFRADYYLRGSNWIFGDLACRIMSYS
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CCDS94 LYVNMYSSIYFLTVLSVVRFLAMVHPFRLLHVTSIRSAWILCGIIWILIMASSI-MLLDS
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CCDS14 AQSSSRLRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLE-ADCRVLNIVNVVYKVTRP
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CCDS14 LASANSCLDPVLYLLTGDKYRRQLRQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQ
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CCDS31 VA-ISPILFYSGTGVRKNKTITCYDTTSDEYLRSYFI-YSMCTTVAMFCVPLVLILGCYG
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CCDS31 CAFNDRVYATYQVTRGLASLNSCVDPILYFLAGDTFRRRLSRATRKASRRSEANLQSKSE
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CCDS31 DMTLNILPEFKQNGDTSL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]