Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9413
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9413, 372 aa
1>>>pF1KE9413 372 - 372 aa - 372 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2882+/-0.00108; mu= 16.3327+/- 0.063
mean_var=120.3554+/-38.804, 0's: 0 Z-trim(104.6): 259 B-trim: 994 in 2/44
Lambda= 0.116907
statistics sampled from 7573 (7991) to 7573 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16
Scan time: 2.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2066.1 GPR45 gene_id:11250|Hs108|chr2 ( 372) 2457 426.3 2.1e-119
CCDS5036.1 GPR63 gene_id:81491|Hs108|chr6 ( 419) 1361 241.5 1e-63
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 398 79.1 7.8e-15
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 353 71.4 1.4e-12
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 353 71.4 1.4e-12
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 353 71.5 1.4e-12
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 353 71.5 1.4e-12
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 353 71.5 1.5e-12
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 353 71.5 1.5e-12
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 ( 412) 336 68.6 1.1e-11
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 335 68.4 1.1e-11
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 330 67.6 2.2e-11
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 329 67.5 2.7e-11
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 324 66.6 4.5e-11
CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 ( 418) 320 65.9 7.2e-11
CCDS14662.1 GPR101 gene_id:83550|Hs108|chrX ( 508) 319 65.9 9.1e-11
>>CCDS2066.1 GPR45 gene_id:11250|Hs108|chr2 (372 aa)
initn: 2457 init1: 2457 opt: 2457 Z-score: 2257.1 bits: 426.3 E(32554): 2.1e-119
Smith-Waterman score: 2457; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (1-372:1-372)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCIIVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCIIVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 QRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 QRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFVLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 GVAILLIISVDRFLIIVQRQDKLNPRRAKVIIAVSWVLSFCIAGPSLTGWTLVEVPARAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 GVAILLIISVDRFLIIVQRQDKLNPRRAKVIIAVSWVLSFCIAGPSLTGWTLVEVPARAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 QCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVRVHNQSDSLDLRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 QCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVRVHNQSDSLDLRQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVYSLLSVFSQRFYCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVYSLLSVFSQRFYCGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 SFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQILPKVPERIRRRIQPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQILPKVPERIRRRIQPS
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE9 TVYVCNENQSAV
::::::::::::
CCDS20 TVYVCNENQSAV
370
>>CCDS5036.1 GPR63 gene_id:81491|Hs108|chr6 (419 aa)
initn: 1382 init1: 1360 opt: 1361 Z-score: 1257.5 bits: 241.5 E(32554): 1e-63
Smith-Waterman score: 1361; 55.2% identity (83.4% similar) in 344 aa overlap (29-372:76-419)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII
: ::.:.:. .:... :.:::: :::..
CCDS50 YSFETMAPTGLSSLTVNSTAVPTTPAAFKSLNLPLQITLSAIMIFILFVSFLGNLVVCLM
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VYQRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFV
:::. :::::::.:::.:::.:..:.. :::. ::..:.:: :: :::.:: ..:.::
CCDS50 VYQKAAMRSAINILLASLAFADMLLAVLNMPFALVTILTTRWIFGKFFCRVSAMFFWLFV
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LEGVAILLIISVDRFLIIVQRQDKLNPRRAKVIIAVSWVLSFCIAGPSLTGWTLVEVPAR
.::::::::::.::::::::::::::: ::::.:::::. :::.: : .: ...:.:
CCDS50 IEGVAILLIISIDRFLIIVQRQDKLNPYRAKVLIAVSWATSFCVAFPLAVGNPDLQIPSR
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 APQCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVRVHNQSDSLDL
:::::.::: :. .:::. . . :: :: :.: ..: ::::.:.::.:.:. ... :
CCDS50 APQCVFGYTTNPGYQAYVILISLISFFIPFLVILYSFMGILNTLRHNALRIHSYPEGICL
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 RQLTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVYSLLSVFSQRFYC
: .. :: ::: :.:.:..:::.:::::::::. : .:: : ..:::...::..::
CCDS50 SQASKLGLMSLQRPFQMSIDMGFKTRAFTTILILFAVFIVCWAPFTTYSLVATFSKHFYY
290 300 310 320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 GSSFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQILPKVPERIRRRIQ
.:. :: .::: ::::..::..: ::::::..::....:..:..::..: . .:::.
CCDS50 QHNFFEISTWLLWLCYLKSALNPLIYYWRIKKFHDACLDMMPKSFKFLPQLPGHTKRRIR
350 360 370 380 390 400
360 370
pF1KE9 PSTVYVCNENQSAV
::.::::.:....:
CCDS50 PSAVYVCGEHRTVV
410
>>CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 (413 aa)
initn: 309 init1: 178 opt: 398 Z-score: 379.8 bits: 79.1 E(32554): 7.8e-15
Smith-Waterman score: 401; 26.1% identity (59.6% similar) in 337 aa overlap (17-339:15-340)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRI-SLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCIIV
: :.: : :: . . ...::: :.... .::..: .
CCDS42 MGQPGNGSAFLLAPNGSHAPDHDVTQERDEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 YQRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFVL
. .... : ....:: .:....: .:: :. .. : ::. .:.. ... . :
CCDS42 AKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 EGVAILLIISVDRFLIIV---QRQDKLNPRRAKVIIAVSWVLSFCIAG-PSLTGWTLVEV
.. : .:.:::.. :. . :. :. .:.::: . :..: . : : .
CCDS42 ASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHW-YRAT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE9 PARAPQCVLGYT--ELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCI-------LNTVRKNA
.: .: . : .. ...::... .. :..:. .:. .: . :. . :.
CCDS42 HQEAINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 VRVHNQSDSLDLRQLTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVY
: : :. : ...: :.: . :.:... . . ::. :. :.. :.::::: .
CCDS42 GRFHVQNLS-QVEQDGRTG-HGLRRSSKFCLK---EHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 SLLSVFSQRFYCGSSFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQIL
... :... . . . :..:..: :::..:: : :: : :::
CCDS42 NIVHVIQDNLIRKEVYILLN----WIGYVNSGFNPLIYC-RSPDFRIAFQELLCLRRSSL
300 310 320 330 340
350 360 370
pF1KE9 PKVPERIRRRIQPSTVYVCNENQSAV
CCDS42 KAYGNGYSSNGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNIDSQGRNCS
350 360 370 380 390 400
>>CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 (360 aa)
initn: 280 init1: 149 opt: 353 Z-score: 339.5 bits: 71.4 E(32554): 1.4e-12
Smith-Waterman score: 403; 27.4% identity (57.9% similar) in 340 aa overlap (16-339:4-327)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCIIV-
:... .:. : .. . ... ...::.. ::: .: . :
CCDS34 MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAI---LGNLLVMVAVC
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 YQRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFVL
..: . : ....:::.:...:. ::: :. :. : .:. :: . ..: ...
CCDS34 WDRQLRKIKTNYFIVSLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 EGVAILLIISVDRFLIIVQR----QDKLNPRRAKVIIAVSWVL-SFCIAGPSLTGWT---
.. : ::.::. : . ..:..: : .... ::. .: : . ::.
CCDS34 ASIFHLCCISLDRYYAICCQPLVYRNKMTPLRIALMLGGCWVIPTFISFLPIMQGWNNIG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KE9 ---LVEVPARAPQCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVR
:.: . : . ... :..: :..:. :: .:. ::. : :....:
CCDS34 IIDLIEKRKFNQNSNSTYCVFMVNKPYAITCSVVAFYIPFLLMVLAYYRIYVTAKEHA--
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 VHNQSDSLDLRQLTRAGLRRLQRQQ---QVSVD-LSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHS
:. ...: ::: .: : : :. . .::: :. :.. : ::: :
CCDS34 -HQ------IQMLQRAGASSESRPQSADQHSTHRMRTETKAAKTLCIIMGCFCLCWAPFF
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 VYSLLSVFSQRFYCGSSFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQ
: .... : . :. . : :::.:..: .::..: . :.::.: . .:
CCDS34 VTNIVDPFIDYTVPGQVW----TAFLWLGYINSGLNPFLYAFLNKSFRRAFLIILCCDDE
280 290 300 310 320 330
350 360 370
pF1KE9 ILPKVPERIRRRIQPSTVYVCNENQSAV
CCDS34 RYRRPSILGQTVPCSTTTINGSTHVLRF
340 350 360
>>CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 (378 aa)
initn: 280 init1: 149 opt: 353 Z-score: 339.2 bits: 71.4 E(32554): 1.4e-12
Smith-Waterman score: 403; 27.4% identity (57.9% similar) in 340 aa overlap (16-339:4-327)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCIIV-
:... .:. : .. . ... ...::.. ::: .: . :
CCDS34 MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAI---LGNLLVMVAVC
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 YQRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFVL
..: . : ....:::.:...:. ::: :. :. : .:. :: . ..: ...
CCDS34 WDRQLRKIKTNYFIVSLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 EGVAILLIISVDRFLIIVQR----QDKLNPRRAKVIIAVSWVL-SFCIAGPSLTGWT---
.. : ::.::. : . ..:..: : .... ::. .: : . ::.
CCDS34 ASIFHLCCISLDRYYAICCQPLVYRNKMTPLRIALMLGGCWVIPTFISFLPIMQGWNNIG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KE9 ---LVEVPARAPQCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVR
:.: . : . ... :..: :..:. :: .:. ::. : :....:
CCDS34 IIDLIEKRKFNQNSNSTYCVFMVNKPYAITCSVVAFYIPFLLMVLAYYRIYVTAKEHA--
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 VHNQSDSLDLRQLTRAGLRRLQRQQ---QVSVD-LSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHS
:. ...: ::: .: : : :. . .::: :. :.. : ::: :
CCDS34 -HQ------IQMLQRAGASSESRPQSADQHSTHRMRTETKAAKTLCIIMGCFCLCWAPFF
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 VYSLLSVFSQRFYCGSSFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQ
: .... : . :. . : :::.:..: .::..: . :.::.: . .:
CCDS34 VTNIVDPFIDYTVPGQVW----TAFLWLGYINSGLNPFLYAFLNKSFRRAFLIILCCDDE
280 290 300 310 320 330
350 360 370
pF1KE9 ILPKVPERIRRRIQPSTVYVCNENQSAV
CCDS34 RYRRPSILGQTVPCSTTTINGSTHVLSGCSPVSSFLLLFCNRPVPV
340 350 360 370
>>CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 (387 aa)
initn: 280 init1: 149 opt: 353 Z-score: 339.1 bits: 71.5 E(32554): 1.4e-12
Smith-Waterman score: 403; 27.4% identity (57.9% similar) in 340 aa overlap (16-339:4-327)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCIIV-
:... .:. : .. . ... ...::.. ::: .: . :
CCDS34 MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAI---LGNLLVMVAVC
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 YQRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFVL
..: . : ....:::.:...:. ::: :. :. : .:. :: . ..: ...
CCDS34 WDRQLRKIKTNYFIVSLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 EGVAILLIISVDRFLIIVQR----QDKLNPRRAKVIIAVSWVL-SFCIAGPSLTGWT---
.. : ::.::. : . ..:..: : .... ::. .: : . ::.
CCDS34 ASIFHLCCISLDRYYAICCQPLVYRNKMTPLRIALMLGGCWVIPTFISFLPIMQGWNNIG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KE9 ---LVEVPARAPQCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVR
:.: . : . ... :..: :..:. :: .:. ::. : :....:
CCDS34 IIDLIEKRKFNQNSNSTYCVFMVNKPYAITCSVVAFYIPFLLMVLAYYRIYVTAKEHA--
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 VHNQSDSLDLRQLTRAGLRRLQRQQ---QVSVD-LSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHS
:. ...: ::: .: : : :. . .::: :. :.. : ::: :
CCDS34 -HQ------IQMLQRAGASSESRPQSADQHSTHRMRTETKAAKTLCIIMGCFCLCWAPFF
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 VYSLLSVFSQRFYCGSSFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQ
: .... : . :. . : :::.:..: .::..: . :.::.: . .:
CCDS34 VTNIVDPFIDYTVPGQVW----TAFLWLGYINSGLNPFLYAFLNKSFRRAFLIILCCDDE
280 290 300 310 320 330
350 360 370
pF1KE9 ILPKVPERIRRRIQPSTVYVCNENQSAV
CCDS34 RYRRPSILGQTVPCSTTTINGSTHVLRYTVLHRGHHQELEKLPIHNDPESLESCF
340 350 360 370 380
>>CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 (388 aa)
initn: 280 init1: 149 opt: 353 Z-score: 339.1 bits: 71.5 E(32554): 1.4e-12
Smith-Waterman score: 403; 27.4% identity (57.9% similar) in 340 aa overlap (16-339:4-327)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCIIV-
:... .:. : .. . ... ...::.. ::: .: . :
CCDS42 MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAI---LGNLLVMVAVC
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 YQRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFVL
..: . : ....:::.:...:. ::: :. :. : .:. :: . ..: ...
CCDS42 WDRQLRKIKTNYFIVSLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTT
50 60 70 80 90 100
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pF1KE9 EGVAILLIISVDRFLIIVQR----QDKLNPRRAKVIIAVSWVL-SFCIAGPSLTGWT---
.. : ::.::. : . ..:..: : .... ::. .: : . ::.
CCDS42 ASIFHLCCISLDRYYAICCQPLVYRNKMTPLRIALMLGGCWVIPTFISFLPIMQGWNNIG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]