FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9413, 372 aa 1>>>pF1KE9413 372 - 372 aa - 372 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2882+/-0.00108; mu= 16.3327+/- 0.063 mean_var=120.3554+/-38.804, 0's: 0 Z-trim(104.6): 259 B-trim: 994 in 2/44 Lambda= 0.116907 statistics sampled from 7573 (7991) to 7573 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16 Scan time: 2.080 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2066.1 GPR45 gene_id:11250|Hs108|chr2 ( 372) 2457 426.3 2.1e-119 CCDS5036.1 GPR63 gene_id:81491|Hs108|chr6 ( 419) 1361 241.5 1e-63 CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 398 79.1 7.8e-15 CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 353 71.4 1.4e-12 CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 353 71.4 1.4e-12 CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 353 71.5 1.4e-12 CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 353 71.5 1.4e-12 CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 353 71.5 1.5e-12 CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 353 71.5 1.5e-12 CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 ( 412) 336 68.6 1.1e-11 CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 335 68.4 1.1e-11 CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 330 67.6 2.2e-11 CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 329 67.5 2.7e-11 CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 324 66.6 4.5e-11 CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 ( 418) 320 65.9 7.2e-11 CCDS14662.1 GPR101 gene_id:83550|Hs108|chrX ( 508) 319 65.9 9.1e-11 >>CCDS2066.1 GPR45 gene_id:11250|Hs108|chr2 (372 aa) initn: 2457 init1: 2457 opt: 2457 Z-score: 2257.1 bits: 426.3 E(32554): 2.1e-119 Smith-Waterman score: 2457; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (1-372:1-372) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCIIVY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCIIVY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 QRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFVLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 QRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFVLE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 GVAILLIISVDRFLIIVQRQDKLNPRRAKVIIAVSWVLSFCIAGPSLTGWTLVEVPARAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 GVAILLIISVDRFLIIVQRQDKLNPRRAKVIIAVSWVLSFCIAGPSLTGWTLVEVPARAP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 QCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVRVHNQSDSLDLRQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 QCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVRVHNQSDSLDLRQ 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 LTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVYSLLSVFSQRFYCGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 LTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVYSLLSVFSQRFYCGS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 SFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQILPKVPERIRRRIQPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 SFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQILPKVPERIRRRIQPS 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 TVYVCNENQSAV :::::::::::: CCDS20 TVYVCNENQSAV 370 >>CCDS5036.1 GPR63 gene_id:81491|Hs108|chr6 (419 aa) initn: 1382 init1: 1360 opt: 1361 Z-score: 1257.5 bits: 241.5 E(32554): 1e-63 Smith-Waterman score: 1361; 55.2% identity (83.4% similar) in 344 aa overlap (29-372:76-419) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII : ::.:.:. .:... :.:::: :::.. 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CCDS34 WDRQLRKIKTNYFIVSLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTT 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 EGVAILLIISVDRFLIIVQR----QDKLNPRRAKVIIAVSWVL-SFCIAGPSLTGWT--- .. : ::.::. : . ..:..: : .... ::. .: : . ::. 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CCDS34 WDRQLRKIKTNYFIVSLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTT 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 EGVAILLIISVDRFLIIVQR----QDKLNPRRAKVIIAVSWVL-SFCIAGPSLTGWT--- .. : ::.::. : . ..:..: : .... ::. .: : . ::. 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