FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9410, 319 aa
1>>>pF1KE9410 319 - 319 aa - 319 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0284+/-0.000812; mu= 17.3238+/- 0.048
mean_var=118.2618+/-35.878, 0's: 0 Z-trim(108.4): 262 B-trim: 1313 in 2/50
Lambda= 0.117938
statistics sampled from 9726 (10188) to 9726 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 ( 319) 2136 374.7 5.3e-104
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 679 126.9 2.5e-29
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 670 125.3 7e-29
CCDS9236.1 HCAR1 gene_id:27198|Hs108|chr12 ( 346) 611 115.3 7.2e-26
CCDS1810.1 OXER1 gene_id:165140|Hs108|chr2 ( 423) 580 110.1 3.1e-24
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 447 87.4 1.9e-17
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 436 85.5 6.9e-17
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 435 85.4 7.8e-17
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 427 84.0 1.9e-16
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 420 82.8 4.5e-16
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 417 82.2 6.1e-16
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 405 80.3 2.7e-15
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 398 79.1 6.1e-15
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 396 78.7 7.5e-15
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 396 78.7 7.6e-15
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 396 78.8 7.9e-15
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 390 77.7 1.5e-14
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 390 77.7 1.5e-14
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 386 77.0 2.4e-14
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 386 77.0 2.5e-14
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 380 76.0 4.9e-14
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 380 76.0 5.1e-14
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 378 75.7 6.9e-14
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 376 75.4 8.3e-14
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 375 75.1 9e-14
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 374 74.9 9.8e-14
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 373 74.8 1.1e-13
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 371 74.5 1.5e-13
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 369 74.2 1.9e-13
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 369 74.2 1.9e-13
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CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 369 74.2 1.9e-13
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 369 74.2 2e-13
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 369 74.2 2e-13
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 368 73.9 2e-13
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CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 369 74.2 2.1e-13
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 369 74.3 2.2e-13
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 364 73.3 3.3e-13
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 362 72.9 4.2e-13
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 362 72.9 4.2e-13
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 362 73.0 4.3e-13
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 362 73.0 4.5e-13
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 360 72.6 5.4e-13
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 358 72.3 6.8e-13
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 357 72.1 8e-13
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 356 71.9 8.4e-13
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 356 71.9 8.5e-13
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 356 72.0 8.9e-13
>>CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 (319 aa)
initn: 2136 init1: 2136 opt: 2136 Z-score: 1980.6 bits: 374.7 E(32554): 5.3e-104
Smith-Waterman score: 2136; 99.7% identity (100.0% similar) in 319 aa overlap (1-319:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MPFPNCSAPSTVVATAVGVLLGLECGLGLLGNAVALWTFLFRVRVWKPYAVYLLNLALAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MPFPNCSAPSTVVATAVGVLLGLECGLGLLGNAVALWTFLFRVRVWKPYAVYLLNLALAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LLLAACLPFLAAFYLSLQAWHLGRVGCWALRFLLDLSRSVGMAFLAAVALDRYLRVVHPR
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LLLAACLPFLAAFYLSLQAWHLGRVGCWALHFLLDLSRSVGMAFLAAVALDRYLRVVHPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LKVNLLSPQAALGVSGLVWLLMVALTCPGLLISEAAQNSTRCHSFYSRADGSFSIIWQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LKVNLLSPQAALGVSGLVWLLMVALTCPGLLISEAAQNSTRCHSFYSRADGSFSIIWQEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LSCLQFVLPFGLIVFCNAGIIRALQKRLREPEKQPKLQRAQALVTLVVVLFALCFLPCFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LSCLQFVLPFGLIVFCNAGIIRALQKRLREPEKQPKLQRAQALVTLVVVLFALCFLPCFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 ARVLMHIFQNLGSCRALCAVAHTSDVTGSLTYLHSVLNPVVYCFSSPTFRSSYRRVFHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 ARVLMHIFQNLGSCRALCAVAHTSDVTGSLTYLHSVLNPVVYCFSSPTFRSSYRRVFHTL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE9 RGKGQAAEPPDFNPRDSYS
:::::::::::::::::::
CCDS52 RGKGQAAEPPDFNPRDSYS
310
>>CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 (387 aa)
initn: 641 init1: 381 opt: 679 Z-score: 640.0 bits: 126.9 E(32554): 2.5e-29
Smith-Waterman score: 679; 36.7% identity (66.8% similar) in 313 aa overlap (6-311:19-323)
10 20 30 40
pF1KE9 MPFPNCSAPSTVVATAVGVLLGLECGLGLLGNAVALWTFLFRVRVWK
: . .: .. .:::: .:::::..::: : :... ::
CCDS53 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 PYAVYLLNLALADLLLAACLPFLAAFYLSLQAWHLGRVGCWALRFLLDLSRSVGMAFLAA
..:.:::.::.:: ::::. .:. . :..: . : . :.. ..:. .. ::..
CCDS53 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMFAMNRQGSIIFLTV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 VALDRYLRVVHPRLKVNLLSPQAALGVSGLVWLLMVALTCPGLLISEAAQNSTR--CHSF
::.:::.:::::. .: .: .: .: :.: . :.:: : . ::.: : ::
CCDS53 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISCLLWGITVGLTVHLLKKKLLIQNGTANVCISF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 YSRADGSFSIIWQEALSCLQFVLPFGLIVFCNAGIIRALQKRLREPEKQPKLQRAQALVT
. .. :.::. :.: ::.:.:.::.: :: .: : :. ... :..:: ...
CCDS53 ----SICHTFRWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSL--RQRQMDRHAKIKRAITFIM
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 LVVVLFALCFLPCFLARVLMHIFQNLGSCRAL-CAVAHTSD----VTGSLTYLHSVLNPV
.:...:..:::: ..:. ::: : . . : : .. : .: :.::..:.:.::
CCDS53 VVAIVFVICFLPSVVVRI--HIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPV
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE9 VYCFSSPTFRSSYRRVFHTLRGKGQAAEPPDFNPRDSYS
:: ::::.: . . ... . ..:: .
CCDS53 VYYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKITGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALIANSGEP
300 310 320 330 340 350
CCDS53 WSPSYLGPTSNNHSKKGHCHQEPASLEKQLGCCIE
360 370 380
>>CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 (363 aa)
initn: 627 init1: 385 opt: 670 Z-score: 632.0 bits: 125.3 E(32554): 7e-29
Smith-Waterman score: 670; 36.1% identity (66.8% similar) in 313 aa overlap (6-311:19-323)
10 20 30 40
pF1KE9 MPFPNCSAPSTVVATAVGVLLGLECGLGLLGNAVALWTFLFRVRVWK
: . .. .. .:::: .:::::..::: : :... ::
CCDS92 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIVKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 PYAVYLLNLALADLLLAACLPFLAAFYLSLQAWHLGRVGCWALRFLLDLSRSVGMAFLAA
..:.:::.::.:: ::::: :. :..: . : . :.: ..:. .. ::..
CCDS92 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFLMDNYVRRWDWKFGDIPCRLMLFMLAMNRQGSIIFLTV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 VALDRYLRVVHPRLKVNLLSPQAALGVSGLVWLLMVALTCPGLLISEAAQN--STRCHSF
::.:::.:::::. .: .: ..: .: :.: . ..:: : . :: .. : ::
CCDS92 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNRTAAIISCLLWGITIGLTVHLLKKKMPIQNGGANLCSSF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 YSRADGSFSIIWQEALSCLQFVLPFGLIVFCNAGIIRALQKRLREPEKQPKLQRAQALVT
. .. :.::. :.: ::.:.:.::.: :: .: : :. ... :..:: ...
CCDS92 ----SICHTFQWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSL--RQRQMDRHAKIKRAITFIM
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 LVVVLFALCFLPCFLARVLMHIFQNLGSCRAL-CAVAHTSD----VTGSLTYLHSVLNPV
.:...:..:::: ..:. .:: : . . : : .. : .: :.::..:.:.::
CCDS92 VVAIVFVICFLPSVVVRI--RIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPV
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE9 VYCFSSPTFRSSYRRVFHTLRGKGQAAEPPDFNPRDSYS
:: ::::.: . . ... . ...:: .
CCDS92 VYYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALMANSGEP
300 310 320 330 340 350
CCDS92 WSPSYLGPTSP
360
>>CCDS9236.1 HCAR1 gene_id:27198|Hs108|chr12 (346 aa)
initn: 434 init1: 359 opt: 611 Z-score: 577.9 bits: 115.3 E(32554): 7.2e-26
Smith-Waterman score: 611; 34.4% identity (67.0% similar) in 294 aa overlap (6-296:7-292)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MPFPNCSAPSTVVATAVGVLLGLECGLGLLGNAVALWTFLFRVRVWKPYAVYLLNLALA
: . ... .. :: . :: :::.::: : :....::: .:::.:::.:
CCDS92 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGNGVALCGFCFHMKTWKPSTVYLFNLAVA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 DLLLAACLPFLAAFYLSLQAWHLGRVGCWALRFLLDLSRSVGMAFLAAVALDRYLRVVHP
:.:: :::: . .:: . : .: . : . : : ..:. ...::..:: :::..::::
CCDS92 DFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLFTLAMNRAGSIVFLTVVAADRYFKVVHP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 RLKVNLLSPQAALGVSGLVWLLMVALTCPGLLISE--AAQNSTRCHSF-YSRADGSFSII
. :: .: ..: :. .: :.. : :: .. . .... :.:: . :.:
CCDS92 HHAVNTISTRVAAGIVCTLWALVILGTVYLLLENHLCVQETAVSCESFIMESANG-----
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 WQEALSCLQFVLPFGLIVFCNAGIIRALQKRLREPEKQPKLQRAQALVTLVVVLFALCFL
:.. . :.: .:.:.:.::. :. .:..: .. .: ....: .. .:...: :.:
CCDS92 WHDIMFQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLRRR-QQLARQARMKKATRFIMVVAIVFITCYL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 PCFLARVLMHIFQNLGSCRALCAVAHTSDVTGSLTYLHSVLNPVVYCFSSPTFRSSYRRV
: :: .... .. : .: . .: :.::..:.:.:.:: ::::.: . : ..
CCDS92 PSVSAR--LYFLWTVPSSACDPSVHGALHITLSFTYMNSMLDPLVYYFSSPSFPKFYNKL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE9 FHTLRGKGQAAEPPDFNPRDSYS
CCDS92 KICSLKPKQPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISVANSFQSQSDGQWDPHIVEWH
300 310 320 330 340
>>CCDS1810.1 OXER1 gene_id:165140|Hs108|chr2 (423 aa)
initn: 527 init1: 299 opt: 580 Z-score: 548.5 bits: 110.1 E(32554): 3.1e-24
Smith-Waterman score: 580; 33.7% identity (68.6% similar) in 312 aa overlap (4-314:82-388)
10 20 30
pF1KE9 MPFPNCSAPSTVVATAVGVLLGLECGLGLLGNA
: . :..:.. .. .:.:: :::.::.
CCDS18 LSSSVLPPSFSPSPSSAPSAFTTVGGSSGGPCHPTSSSLVSAFLAPILALEFVLGLVGNS
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 VALWTFLFRVRVWKPYAVYLLNLALADLLLAACLPFLAAFYLSLQAWHLGRVGCWALRFL
.::. : ...: : .:.:..:. ::.:: . ::. . .:: ..:..: ..: . :.
CCDS18 LALFIFCIHTRPWTSNTVFLVSLVAADFLLISNLPLRVDYYLLHETWRFGAAACKVNLFM
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LDLSRSVGMAFLAAVALDRYLRVVHPRLKVNLLSPQAALGVSGLVWLLMVALTCPGLLIS
:. .:.....::.:.::.:::.::.:. .. : :: :.: .:. .. :. ::.:
CCDS18 LSTNRTASVVFLTAIALNRYLKVVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLWVGILLLN-GHLLLS
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 EAAQNSTRCHSFYSRADGSFSIIWQEALSCLQFVLPFGLIVFCNAGIIRALQKRLREPEK
. : : :. . : :. :..:: :.: ::..::.: ..: ....: .
CCDS18 TFSGPS--CLSYRVGTKPSASLRWHQALYLLEFFLPLALILFAIVSIGLTIRNRGLGGQA
240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 QPKLQRAQALVTLVVVLFALCFLPCFLARVLMHIFQNLGSCRALCAVAHTSDVTGSLTYL
: :::. ....::.....:::: .. . . :..::.: .. . ..:::
CCDS18 GP--QRAMRVLAMVVAVYTICFLPSIIFGMASMVAFWLSACRSLDLCTQLFHGSLAFTYL
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310
pF1KE9 HSVLNPVVYCFSSPTFRSSYRRVFHTLRGK-GQAAEPPDFNPRDSYS
.:::.::.::::::.: . : .. ::. : ... ...:
CCDS18 NSVLDPVLYCFSSPNFLHQSRALLGLTRGRQGPVSDESSYQPSRQWRYREASRKAEAIGK
350 360 370 380 390 400
CCDS18 LKVQGEVSLEKEGSSQG
410 420
>>CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 (367 aa)
initn: 367 init1: 218 opt: 447 Z-score: 426.9 bits: 87.4 E(32554): 1.9e-17
Smith-Waterman score: 447; 29.2% identity (62.5% similar) in 301 aa overlap (23-319:68-359)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MPFPNCSAPSTVVATAVGVLLGLECGLGLLGNAVALWTFLFRVRVWKPYAVY
:. :.:.::..::: :. . : :.
CCDS21 GLITNFSLATAEQCGQETPLENMLFASFYLLDFILALVGNTLALWLFIRDHKSGTPANVF
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 LLNLALADLLLAACLPFLAAFYLSLQAWHLGRVGCWALRFLLDLSRSVGMAFLAAVALDR
:..::.::: . :: ....: . : .:...: ::. :. ... ::. .. ::
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CCDS21 FLAIVHPVKSLKLRRPLYAHLACAFLWVVVAVAMAPLLVSPQTVQTNHTVVCLQLY-REK
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180 190 200 210 220 230
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240 250 260 270 280
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CCDS21 FLVCFVPYHVNRSVYVLHYRSHGASCATQRILALANRITSCLTSLNGALDPIMYFFVAEK
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290 300 310
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240 250 260 270 280
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..: . .. :.. : . :.:: : : .:: .:. :.: ..:..: ... :
CCDS31 SYIPFHVMKT-MNLRARLDFQTPAMCAFNDRVYATYQVTRGLASLNSCVDPILYFLAGDT
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CCDS31 FR---RRLSRATRKASRRSEANLQSKSEDMTLNILPEFKQNGDTSL
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. : :: . .. .. : :..::..:. : . . : : : :. .: ..
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...:...::::::: ..:.:.. :..: ::..: :. . :: :. .: :.::.
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:
CCDS82 YFLAGQRLVRFARDAKPPTGPSPATPARRRLGLRRSDRTDMQRIEDVLGSSEDSRRTEST
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CCDS12 RSKPGKPRSTTNLFILNLSIADLAYLLFCIPFQATVY-ALPTWVLGAFICKFIHYFFTVS
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CCDS12 MLVSIFTLAAMSVDRYVAIVHSRRSSSLRVSRNALLGV-GCIWALSIAMASPVAYHQGLF
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CCDS12 SKKSEASKKKTAQTVLVVVVVFGISWLP----HHIIHLWAEFG-VFPLTPASFLFRITAH
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CCDS12 CLAYSNSSVNPIIYAFLSENFRKAYKQVFKCHIRKDSHLSDTKESKSRIDTPPSTNCTHV
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CCDS14 GSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGL--NAPTLWLFIFRLRPWDATATYMFH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]