Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9402
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9402, 334 aa
1>>>pF1KE9402 334 - 334 aa - 334 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7922+/-0.00104; mu= 13.2750+/- 0.061
mean_var=185.0540+/-78.732, 0's: 0 Z-trim(104.2): 187 B-trim: 1027 in 2/47
Lambda= 0.094281
statistics sampled from 7481 (7791) to 7481 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 2.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9319.1 GPR12 gene_id:2835|Hs108|chr13 ( 334) 2166 307.9 7.5e-84
CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 ( 330) 1276 186.8 2.1e-47
CCDS5079.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 362) 1261 184.9 8.9e-47
CCDS69172.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 377) 1261 184.9 9.1e-47
CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 ( 351) 443 73.6 2.7e-13
CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 ( 353) 437 72.8 4.8e-13
CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 ( 378) 433 72.3 7.3e-13
CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 ( 364) 431 72.0 8.6e-13
CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 ( 382) 428 71.6 1.2e-12
CCDS245.1 CNR2 gene_id:1269|Hs108|chr1 ( 360) 412 69.4 5.1e-12
CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 ( 398) 398 67.5 2e-11
CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 ( 353) 386 65.8 5.9e-11
>>CCDS9319.1 GPR12 gene_id:2835|Hs108|chr13 (334 aa)
initn: 2166 init1: 2166 opt: 2166 Z-score: 1618.9 bits: 307.9 E(32554): 7.5e-84
Smith-Waterman score: 2166; 100.0% identity (100.0% similar) in 334 aa overlap (1-334:1-334)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNEDLKVNLSGLPRDYLDAAAAENISAAVSSRVPAVEPEPELVVNPWDIVLCTSGTLISC
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CCDS93 MNEDLKVNLSGLPRDYLDAAAAENISAAVSSRVPAVEPEPELVVNPWDIVLCTSGTLISC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ENAIVVLIIFHNPSLRAPMFLLIGSLALADLLAGIGLITNFVFAYLLQSEATKLVTIGLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 ENAIVVLIIFHNPSLRAPMFLLIGSLALADLLAGIGLITNFVFAYLLQSEATKLVTIGLI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VASFSASVCSLLAITVDRYLSLYYALTYHSERTVTFTYVMLVMLWGTSICLGLLPVMGWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VASFSASVCSLLAITVDRYLSLYYALTYHSERTVTFTYVMLVMLWGTSICLGLLPVMGWN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 CLRDESTCSVVRPLTKNNAAILSVSFLFMFALMLQLYIQICKIVMRHAHQIALQHHFLAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 CLRDESTCSVVRPLTKNNAAILSVSFLFMFALMLQLYIQICKIVMRHAHQIALQHHFLAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 SHYVTTRKGVSTLAIILGTFAACWMPFTLYSLIADYTYPSIYTYATLLPATYNSIINPVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SHYVTTRKGVSTLAIILGTFAACWMPFTLYSLIADYTYPSIYTYATLLPATYNSIINPVI
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE9 YAFRNQEIQKALCLICCGCIPSSLAQRARSPSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 YAFRNQEIQKALCLICCGCIPSSLAQRARSPSDV
310 320 330
>>CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 (330 aa)
initn: 1255 init1: 1255 opt: 1276 Z-score: 964.7 bits: 186.8 E(32554): 2.1e-47
Smith-Waterman score: 1276; 57.1% identity (82.8% similar) in 326 aa overlap (10-334:5-330)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNEDLKVNLSGLPRDYLDAAAAE-NISAAVSSRVPAVEPEPELVVNPWDIVLCTSGTLIS
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CCDS30 MMWGAGSPLAWLSAGSGNVNVSSVGPAEGPTGPAAPLPSPKAWDVVLCISGTLVS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 CENAIVVLIIFHNPSLRAPMFLLIGSLALADLLAGIGLITNFVFAYLLQSEATKLVTIGL
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CCDS30 CENALVVAIIVGTPAFRAPMFLLVGSLAVADLLAGLGLVLHFAAVFCIGSAEMSLVLVGV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 IVASFSASVCSLLAITVDRYLSLYYALTYHSERTVTFTYVMLVMLWGTSICLGLLPVMGW
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CCDS30 LAMAFTASIGSLLAITVDRYLSLYNALTYYSETTVTRTYVMLALVWGGALGLGLLPVLAW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 NCLRDESTCSVVRPLTKNNAAILSVSFLFMFALMLQLYIQICKIVMRHAHQIALQHHFLA
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CCDS30 NCLDGLTTCGVVYPLSKNHLVVLAIAFFMVFGIMLQLYAQICRIVCRHAQQIALQRHLLP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 TSHYVTTRKGVSTLAIILGTFAACWMPFTLYSLIADYTYPSIYTYATLLPATYNSIINPV
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CCDS30 ASHYVATRKGIATLAVVLGAFAACWLPFTVYCLLGDAHSPPLYTYLTLLPATYNSMINPI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE9 IYAFRNQEIQKALCLICCGCIPSSLAQRARSPSDV
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CCDS30 IYAFRNQDVQKVLWAVCCCCSSSKIPFRSRSPSDV
300 310 320 330
>>CCDS5079.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 (362 aa)
initn: 1264 init1: 1243 opt: 1261 Z-score: 953.3 bits: 184.9 E(32554): 8.9e-47
Smith-Waterman score: 1261; 58.6% identity (86.2% similar) in 319 aa overlap (17-334:44-362)
10 20 30 40
pF1KE9 MNEDLKVNLSGLPRDYLDAAAAENISAAVSSRVPAVEPEPEL-VVN
: :... : : .::.. : : : .::
CCDS50 VVVAAEGAAAAATAAGGPDTGEWGPPAAAALGAGGGANGSLELSSQLSAGPPGLLLPAVN
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 PWDIVLCTSGTLISCENAIVVLIIFHNPSLRAPMFLLIGSLALADLLAGIGLITNFVFAY
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CCDS50 PWDVLLCVSGTVIAGENALVVALIASTPALRTPMFVLVGSLATADLLAGCGLILHFVFQY
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 LLQSEATKLVTIGLIVASFSASVCSLLAITVDRYLSLYYALTYHSERTVTFTYVMLVMLW
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CCDS50 LVPSETVSLLTVGFLVASFAASVSSLLAITVDRYLSLYNALTYYSRRTLLGVHLLLAATW
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 GTSICLGLLPVMGWNCLRDESTCSVVRPLTKNNAAILSVSFLFMFALMLQLYIQICKIVM
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CCDS50 TVSLGLGLLPVLGWNCLAERAACSVVRPLARSHVALLSAAFFMVFGIMLHLYVRICQVVW
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 RHAHQIALQHHFLATSHYVTTRKGVSTLAIILGTFAACWMPFTLYSLIADYTYPSIYTYA
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CCDS50 RHAHQIALQQHCLAPPHLAATRKGVGTLAVVLGTFGASWLPFAIYCVVGSHEDPAVYTYA
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KE9 TLLPATYNSIINPVIYAFRNQEIQKALCLICCGCIPSSLAQRARSPSDV
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CCDS50 TLLPATYNSMINPIIYAFRNQEIQRALWLLLCGCFQSKVPFRSRSPSEV
320 330 340 350 360
>>CCDS69172.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 (377 aa)
initn: 1264 init1: 1243 opt: 1261 Z-score: 953.1 bits: 184.9 E(32554): 9.1e-47
Smith-Waterman score: 1261; 58.6% identity (86.2% similar) in 319 aa overlap (17-334:59-377)
10 20 30 40
pF1KE9 MNEDLKVNLSGLPRDYLDAAAAENISAAVSSRVPAVEPEPEL-VVN
: :... : : .::.. : : : .::
CCDS69 VVVAAEGAAAAATAAGGPDTGEWGPPAAAALGAGGGANGSLELSSQLSAGPPGLLLPAVN
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 PWDIVLCTSGTLISCENAIVVLIIFHNPSLRAPMFLLIGSLALADLLAGIGLITNFVFAY
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CCDS69 PWDVLLCVSGTVIAGENALVVALIASTPALRTPMFVLVGSLATADLLAGCGLILHFVFQY
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 LLQSEATKLVTIGLIVASFSASVCSLLAITVDRYLSLYYALTYHSERTVTFTYVMLVMLW
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CCDS69 LVPSETVSLLTVGFLVASFAASVSSLLAITVDRYLSLYNALTYYSRRTLLGVHLLLAATW
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 GTSICLGLLPVMGWNCLRDESTCSVVRPLTKNNAAILSVSFLFMFALMLQLYIQICKIVM
.:. ::::::.::::: ....:::::::.....:.::..:...:..::.::..::..:
CCDS69 TVSLGLGLLPVLGWNCLAERAACSVVRPLARSHVALLSAAFFMVFGIMLHLYVRICQVVW
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 RHAHQIALQHHFLATSHYVTTRKGVSTLAIILGTFAACWMPFTLYSLIADYTYPSIYTYA
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CCDS69 RHAHQIALQQHCLAPPHLAATRKGVGTLAVVLGTFGASWLPFAIYCVVGSHEDPAVYTYA
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330
pF1KE9 TLLPATYNSIINPVIYAFRNQEIQKALCLICCGCIPSSLAQRARSPSDV
:::::::::.:::.::::::::::.:: :. :::. :.. :.::::.:
CCDS69 TLLPATYNSMINPIIYAFRNQEIQRALWLLLCGCFQSKVPFRSRSPSEV
330 340 350 360 370
>>CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 (351 aa)
initn: 282 init1: 162 opt: 443 Z-score: 352.1 bits: 73.6 E(32554): 2.7e-13
Smith-Waterman score: 443; 31.2% identity (62.4% similar) in 295 aa overlap (46-323:30-318)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 YLDAAAAENISAAVSSRVPAVEPEPELVVNPWDIVLCTSGTLISC----ENAIVVLIIFH
: :.:. . : .: : .:. :
CCDS12 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLVIAAIAS
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120
pF1KE9 NPSLRAPMFLLIGSLALADLLAGIGLITNFVFAYLLQSEATKLVTI-------GLIVASF
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CCDS12 NRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVA----YLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDTSL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 SASVCSLLAITVDRYLSLYYALTYHSERTVTFTYVMLVMLWGTSICLGLLPVMGWNCLRD
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CCDS12 TASVATLLAIAVERHRSVM-AVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLCA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 ESTCSVVRPL-TKNNAAILSVSFLFMFALMLQLYIQICKIVMRHAHQIALQHHFLATSHY
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CCDS12 LDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMA-EHVSCHPRYR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE9 VTTRKGVSTLAIILGTFAACWMPFTLYSLIADYTYPSIYTYAT----LLPATYNSIINPV
:: . :.:..::::.:..:: : . :. : . :. :: : ::..: .
CCDS12 ETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLLAEANSLVNAA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE9 IYAFRNQEIQKALC-LICCGCIPSSLAQRARSPSDV
.:. :. :..... :.::.:. .:
CCDS12 VYSCRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMDSTL
300 310 320 330 340 350
>>CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 (353 aa)
initn: 392 init1: 193 opt: 437 Z-score: 347.7 bits: 72.8 E(32554): 4.8e-13
Smith-Waterman score: 437; 28.7% identity (64.0% similar) in 303 aa overlap (49-334:32-327)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 AAAAENISAAVSSRVPAVEPEPELVVNPWDIVLCTSGTL----ISCENAIVVLIIFHNPS
::::. ::. : :..:. ...: .
CCDS70 NECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCV-GTFFCLFIFFSNSLVIAAVIKNRK
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120
pF1KE9 LRAPMFLLIGSLALADLLAGIGLITNFVFAYLLQSEATKLVTI-------GLIVASFSAS
.. :.. :...:: ::..:::. .:: .. . ..: .:. ::. .:..::
CCDS70 FHFPFYYLLANLAAADFFAGIA----YVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTAS
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VCSLLAITVDRYLSLYYALTYHSERTVTFTYVMLVMLWGTSICLGLLPVMGWNCLRDEST
. .::.:.:.:..:.. . ::. : . ......:. .: .: .:..::::: . :.
CCDS70 LTNLLVIAVERHMSIMR-MRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 CSVVRPL-TKNNAAILSVSFLFMFALMLQLYIQICKIVMRHAHQIALQHHFLATSHYVTT
:: . :. ... .. .:: :. : .:. .:..: : :... .. : . :. :
CCDS70 CSSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLS-PHTSGSISRRRTP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 RKGVSTLAIILGTFAACWMPFTLYSLIADYTYPSIYTYAT----LLPATYNSIINPVIYA
: ..:. .::.:..:: : . :. . . . . :: : ::..::.::.
CCDS70 MKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFLLLALLNSVVNPIIYS
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE9 FRNQEIQKALC-LICCGCIPSSLAQRARSPSDV
...... .. .::: . . .: :: :
CCDS70 YKDEDMYGTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
300 310 320 330 340 350
>>CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 (378 aa)
initn: 304 init1: 149 opt: 433 Z-score: 344.4 bits: 72.3 E(32554): 7.3e-13
Smith-Waterman score: 433; 29.1% identity (64.7% similar) in 292 aa overlap (49-331:47-327)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 AAAAENISAAVSSRVPAVEPEPELVVNPWDIVLCTSGTLISCENAIVVLIIFHNPSLRAP
.:.:. .: :: .:.. :..: ...
CCDS66 TLREHYQYVGKLAGRLKEASEGSTLTTVLFLVICS---FIVLENLMVLIAIWKNNKFHNR
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 MFLLIGSLALADLLAGIGLITNFVFA---YLLQSEATKLVTIGLIVASFSASVCSLLAIT
:...::.::: ::::::. .:.... . : .. .. : . ....::.::::::.
CCDS66 MYFFIGNLALCDLLAGIAYKVNILMSGKKTFSLSPTVWFLREGSMFVALGASTCSLLAIA
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 VDRYLSLYYALTYHSERTVTFTYVMLVMLWGTSICLGLLPVMGWNCLRDESTCSVVRPLT
..:.:.. : ... ..... : : .. :: ::..:::::.. ::.. ::
CCDS66 IERHLTMIKMRPYDANKRHR-VFLLIGMCWLIAFTLGALPILGWNCLHNLPDCSTILPLY
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 KNNAAILSVS-FLFMFALMLQLYIQICKIVMRHAHQIALQHHFLATSHYVTTRKGVSTLA
... . .: : ... .. :: .: .: ....: .: . .. : :..
CCDS66 SKKYIAFCISIFTAILVTIVILYARIYFLVKSSSRKVA--NHNNSERSMALLR----TVV
200 210 220 230 240
260 270 280 290 300
pF1KE9 IILGTFAACWMP-FTLYSL-IADYTY--PSIYTYATLLP-ATYNSIINPVIYAFRNQEIQ
:....: ::: : : :. . .: . : .. .. :. :: .:::::.. ..:..
CCDS66 IVVSVFIACWSPLFILFLIDVACRVQACPILFKAQWFIVLAVLNSAMNPVIYTLASKEMR
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE9 KALCLICCGCIPSSLAQRARSPSDV
.:. . :.:. . . :: ::
CCDS66 RAFFRLVCNCLVRGRGARA-SPIQPALDPSRSKSSSSNNSSHSPKVKEDLPHTAPSSCIM
310 320 330 340 350 360
>>CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 (364 aa)
initn: 284 init1: 117 opt: 431 Z-score: 343.1 bits: 72.0 E(32554): 8.6e-13
Smith-Waterman score: 431; 29.8% identity (62.0% similar) in 292 aa overlap (49-332:57-335)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 AAAAENISAAVSSRVPAVEPEPELVVNPWDIVLCTSGTLISCENAIVVLIIFHNPSLRAP
:..: .: : .:.. :. : .. :
CCDS67 NESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGLGITVCI---FIMLANLLVMVAIYVNRRFHFP
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 MFLLIGSLALADLLAGIG---LITNFVFAYLLQSEATKLVTIGLIVASFSASVCSLLAIT
.. :...:: ::..::.. :. : . .: :. ::: .:..::: .::::.
CCDS67 IYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTVSTWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIA
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 VDRYLSLYYALTYHSERTVTFTYVMLVMLWGTSICLGLLPVMGWNCLRDESTCSVVRPLT
..:..... . :.. . . :..:..: .: .: .: .::::. : .:: . ::
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