Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9394
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9394, 1163 aa
1>>>pF1KE9394 1163 - 1163 aa - 1163 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.7095+/-0.00115; mu= -10.9735+/- 0.069
mean_var=393.7285+/-80.704, 0's: 0 Z-trim(114.0): 65 B-trim: 60 in 1/52
Lambda= 0.064636
statistics sampled from 14510 (14562) to 14510 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.736), E-opt: 0.2 (0.447), width: 16
Scan time: 6.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163) 7646 728.0 3.1e-209
CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218) 1581 162.5 5.7e-39
CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210) 1579 162.3 6.5e-39
CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226) 1138 121.2 1.6e-26
CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251) 1138 121.2 1.6e-26
CCDS78510.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 1013 109.5 5.2e-23
CCDS55521.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX ( 952) 999 108.1 1e-22
CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 999 108.2 1.3e-22
CCDS14684.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1311) 999 108.2 1.3e-22
>>CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163 aa)
initn: 7646 init1: 7646 opt: 7646 Z-score: 3869.9 bits: 728.0 E(32554): 3.1e-209
Smith-Waterman score: 7646; 100.0% identity (100.0% similar) in 1163 aa overlap (1-1163:1-1163)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQSMLGNYD
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CCDS41 MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQSMLGNYD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 EMKDFIGDRSIPKLVAIPKPTVPPSADEKSNPNFFEQRHGGSHQSSKWTPVGPAPSTSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EMKDFIGDRSIPKLVAIPKPTVPPSADEKSNPNFFEQRHGGSHQSSKWTPVGPAPSTSQS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 QKRSSGLQSGHSSQRTSAGSSSGTNSSGQRHDRESYNNSGSSSRKKGQHGSEHSKSRSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QKRSSGLQSGHSSQRTSAGSSSGTNSSGQRHDRESYNNSGSSSRKKGQHGSEHSKSRSSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 PGKPQAVSSLNSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKSPRDPDANWDSPSRVPFSSGQHSTQSFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PGKPQAVSSLNSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKSPRDPDANWDSPSRVPFSSGQHSTQSFPP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 SLMSKSNSMLQKPTAYVRPMDGQESMEPKLSSEHYSSQSHGNSMTELKPSSKAHLTKLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SLMSKSNSMLQKPTAYVRPMDGQESMEPKLSSEHYSSQSHGNSMTELKPSSKAHLTKLKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 PSQPLDASASGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PSQPLDASASGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 EQKRYNPSKTSNGHQSKSMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EQKRYNPSKTSNGHQSKSMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNSEG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 ADNSRDDSSSHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ADNSRDDSSSHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLNK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 VNPHKVSPASSVDSNIPSSQGYKKEGREQGTGNSYTDTSGPKETSSATPGRDSKTIQKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VNPHKVSPASSVDSNIPSSQGYKKEGREQGTGNSYTDTSGPKETSSATPGRDSKTIQKGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 ESGRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEEPRGGLKIESETPVDLASSMPSSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ESGRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEEPRGGLKIESETPVDLASSMPSSR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 HKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSREIIETDTSSSDSDESESLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSREIIETDTSSSDSDESESLP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 PSSQTPKYPESNRTPVKPSSVEEEDSFFRQRMFSPMEEKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PSSQTPKYPESNRTPVKPSSVEEEDSFFRQRMFSPMEEKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 NLLTRIPGKPYKETEPPKGEKKNVPEKHTREAQKQASEKVSNKGKRKHKNEDDNRASESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NLLTRIPGKPYKETEPPKGEKKNVPEKHTREAQKQASEKVSNKGKRKHKNEDDNRASESK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 KPKTEDKNSAGHKPSSNRESSKQSAAKEKDLLPSPAGPVPSKDPKTEHGSRKRTISQSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KPKTEDKNSAGHKPSSNRESSKQSAAKEKDLLPSPAGPVPSKDPKTEHGSRKRTISQSSS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 LKSSSNSNKETSGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSKEVKEKAPSSSSNCPPSAPTLDSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LKSSSNSNKETSGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSKEVKEKAPSSSSNCPPSAPTLDSSK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 PRRTKLVFDDRNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIECGNALEKNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PRRTKLVFDDRNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIECGNALEKNA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 QESKSPFPMYSETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRCESLLYLRLFKLKKEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QESKSPFPMYSETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRCESLLYLRLFKLKKEN
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 ALKYSKTLTEHLKNSYNNSQAPSPGLGSKAVGMPSPVSPKLSPGNSGNYSSGASSASASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ALKYSKTLTEHLKNSYNNSQAPSPGLGSKAVGMPSPVSPKLSPGNSGNYSSGASSASASG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 SSVTIPQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELDKVMGPLIFNASI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSVTIPQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELDKVMGPLIFNASI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160
pF1KE9 MTDLVRYTRQGLHWLRQDAKLIS
:::::::::::::::::::::::
CCDS41 MTDLVRYTRQGLHWLRQDAKLIS
1150 1160
>>CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218 aa)
initn: 1393 init1: 451 opt: 1581 Z-score: 813.1 bits: 162.5 E(32554): 5.7e-39
Smith-Waterman score: 2437; 39.7% identity (68.0% similar) in 1222 aa overlap (12-1160:25-1216)
10 20 30 40
pF1KE9 MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDK
.:.:::::: .: ..::: . :::.:::: :.: :.
CCDS54 MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYK-TAKGDE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 LSSRIQSMLGNYDEMKDFIGDRS-IPKLVA----IPKPTVPPSADEKSN-PNFFEQRHGG
::::::.:::::.:.:.:.. .: .: : . :: : :. :. :. . : .
CCDS54 LSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPS--SSFHTS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE9 SHQSSKWTPV-GP------APSTSQSQKRSSGLQSGHSSQRTSAGSSSGTNSSGQRHDRE
:..: ::. :: . . ...: :. . : : : : . .:. .::
CCDS54 VHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLH------AKSCGPPDSQHLTQDRL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190
pF1KE9 SYNNSGSSSRKKGQH--GSEHSKSRS-SSPGK--------PQAVSSLNSSHS--------
. .. ::: .:::.. ..: : . :.: . :. : :. ::
CCDS54 GQEGFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRT
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240
pF1KE9 ----RSHGNDHHSKEHQRSKSPRDPDA---NWDSPSRVPFSSGQHSTQSFPP-SLMSKSN
. ::....:: . .:::.: . . ..:. . .: .:.::: :: :::
CCDS54 QGSSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSV
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 SMLQKPTAYVRPMDGQE---SMEPKLSS--EHYSSQSHGNSMTELKPSSKAHLTKLKIPS
.: :::::::::::::. : :.:. : : .:. . :.:: .::.:::::.::
CCDS54 AMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEK--TDLKVPAKAKLTKLKMPS
300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 QPLDASASGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTGEQ
: .. . :..: ::.:::::::::::::::::::: .::::::::::.::. . : .:
CCDS54 QSVEQTYSNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQ
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410
pF1KE9 KRYNPS-KT-SNGHQ-SKSMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNS-
:.:. : :: ::..: ..:::.:::.::.:::::.:: :.. :.:.. :: .:
CCDS54 KQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQT-----PEKPPSSSAPPSAPQSL
410 420 430 440 450 460
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 -EGADNSRDDSS-SHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDN
: . .....:. :.: :.:.:.::::::::::::: ::: .. .:::::: ::::::::
CCDS54 PEPVASAHSSSAESESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDN
470 480 490 500 510 520
480 490 500 510 520 530
pF1KE9 WLNKVNPHKVSPASSVDSNIPSSQGYKKEGREQGTGNSYTDTSGPK-ETSSATPGRDSKT
::.::. . : . ... : . .: . ...:.. ..... : ..:: .: ..
CCDS54 WLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEA
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KE9 IQKGSESGRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEE-PRGGLKIESET---PVD
. :. :. ::::::.. ::.::: ::::: ::.:. : .:. : : :
CCDS54 PHPGK---RSCQKSPAQQEPP-QRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYG
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640
pF1KE9 LASSMPSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSREIIET--DTS
.. ... :. ::: . ..: : . :..::::.::. . .:. : :.
CCDS54 SRDQTSKDKPKVKTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNV
650 660 670 680 690 700
650 660 670 680 690 700
pF1KE9 SSDSDESESLPPSSQTPKYPES---NRTP-VKPSSVEEEDSFFRQRMFSPMEEKELLSPL
. . : .: : ... :.: .:: . . : .::: ..:. :... .:::::
CCDS54 EDRTPEHFALVPLTESQGPPHSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSR-KDRLPLPLRDTKLLSPL
710 720 730 740 750
710 720 730 740 750 760
pF1KE9 SEPDDRYPLIVKIDLNLLTRIPGKPYKETEPPKGEKKNVPEKHTREAQKQASEKVSNKGK
. :.::: :.::.::: : : .. :.: :. : . . ..:..:.. :.:
CCDS54 RDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDS-SSKLA
760 770 780 790 800 810
770 780 790 800 810
pF1KE9 RKHKNEDDNRASESKKPKTED--KNSAGHKPSSNRESSK------QSAAKEKDLLPSPAG
.:.:.: . : ..:: . : :.... . ::..:::: .: ...:..:: :
CCDS54 KKRKGEAE-RDCDNKKIRLEKEIKSQSSSSSSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPP--
820 830 840 850 860 870
820 830 840 850 860 870
pF1KE9 PVPSKDPKTEHGSRKRTISQSSSLKSSSNSNKETSGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSKE
:: :.. : . . ::. .... .. .. .. :....:: ::...::: : ::.:
CCDS54 PVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSE
880 890 900 910 920 930
880 890 900 910 920 930
pF1KE9 VKEKAPSSSSNCP-PSAPTLDSSKPRRTKLVFDDRNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRF
: .. .... : :: :. .::: . .. :: .. :: ...::::.:..:. ..::
CCDS54 HKGSSGDTANPFPVPSLPN-GNSKPGKPQVKFDKQQ--ADLHMREAKKMKQKAELMTDRV
940 950 960 970 980 990
940 950 960 970 980 990
pF1KE9 EKAVYYLDAVVSFIECGNALEKNAQESKSPFPMYSETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADK
:: ::.::.:::::: : :...: ::: . .:::::::::. :.::.. : . .:
CCDS54 GKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEK
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE9 RLTVLCLRCESLLYLRLFKLKKENALKYSKTLTEHLKNSYNNSQAPSPGLGSKAVGMPSP
..:::.::.:.: . .:. ::. :.:::.::..:...: . .::::: . ....: :::
CCDS54 IFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSPCI-ARSTGTPSP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE9 VSPKLSPGNSGNYSSGASSASASGSSVTI--PQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAE
.:: ::..: . .:.:.:...:: ..:: : :..:..::: .::. : : ..:.:::
CCDS54 LSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE9 QLSKEQKEFFAELDKVMGPLIFNASIMTDLVRYTRQGLHWLRQDAKLIS
:....:::::.:. . : .:.: ..:::.:::::.. :.. .:
CCDS54 ALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSS-LVDLVHYTRQGFQQLQELTKTP
1180 1190 1200 1210
>>CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210 aa)
initn: 1547 init1: 605 opt: 1579 Z-score: 812.1 bits: 162.3 E(32554): 6.5e-39
Smith-Waterman score: 2435; 39.8% identity (67.9% similar) in 1222 aa overlap (12-1160:18-1208)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQS
.:.:::::: .: ..::: . :::.:::: :.: :.::::::.
CCDS36 MAAQSSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYK-TAKGDELSSRIQN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE9 MLGNYDEMKDFIGDRS-IPKLVA----IPKPTVPPSADEKSN-PNFFEQRHGGSHQSSKW
:::::.:.:.:.. .: .: : . :: : :. :. :. . : . :..:
CCDS36 MLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPS--SSFHTSVHHQSIH
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 TPV-GP------APSTSQSQKRSSGLQSGHSSQRTSAGSSSGTNSSGQRHDRESYNNSGS
::. :: . . ...: :. . : : : : . .:. .:: . .. ::
CCDS36 TPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLH------AKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGS
120 130 140 150 160 170
170 180 190
pF1KE9 SSRKKGQH--GSEHSKSRS-SSPGK--------PQAVSSLNSSHS------------RSH
: .:::.. ..: : . :.: . :. : :. :: . :
CCDS36 SHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVH
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 GNDHHSKEHQRSKSPRDPDA---NWDSPSRVPFSSGQHSTQSFPP-SLMSKSNSMLQKPT
:....:: . .:::.: . . ..:. . .: .:.::: :: ::: .: ::::
CCDS36 GSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPT
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300
pF1KE9 AYVRPMDGQE---SMEPKLSS--EHYSSQSHGNSMTELKPSSKAHLTKLKIPSQPLDASA
:::::::::. : :.:. : : .:. . :.:: .::.:::::.::: .. .
CCDS36 AYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEK--TDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTY
300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 SGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTGEQKRYNPS-
:..: ::.:::::::::::::::::::: .::::::::::.::. . : .::.:. :
CCDS36 SNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSS
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 KT-SNGHQ-SKSMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNS--EGADNS
:: ::..: ..:::.:::.::.:::::.:: :.. :.:.. :: .: : . ..
CCDS36 KTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQT-----PEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASA
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 RDDSS-SHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLNKVNP
...:. :.: :.:.:.::::::::::::: ::: .. .:::::: ::::::::::.::.
CCDS36 HSSSAESESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQ
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 HKVSPASSVDSNIPSSQGYKKEGREQGTGNSYTDTSGPK-ETSSATPGRDSKTIQKGSES
. : . ... : . .: . ...:.. ..... : ..:: .: .. . :.
CCDS36 PAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGK--
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590
pF1KE9 GRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEE-PRGGLKIESET---PVDLASSMPS
:. ::::::.. ::.::: ::::: ::.:. : .:. : : : .. .
CCDS36 -RSCQKSPAQQEPP-QRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTSK
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KE9 SRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSREIIET--DTSSSDSDES
.. :. ::: . ..: : . :..::::.::. . .:. : :. . . :
CCDS36 DKPKVKTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVEDRTPEH
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700 710
pF1KE9 ESLPPSSQTPKYPES---NRTP-VKPSSVEEEDSFFRQRMFSPMEEKELLSPLSEPDDRY
.: : ... :.: .:: . . : .::: ..:. :... .::::: .
CCDS36 FALVPLTESQGPPHSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSR-KDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQ
710 720 730 740 750
720 730 740 750 760 770
pF1KE9 PLIVKIDLNLLTRIPGKPYKETEPPKGEKKNVPEKHTREAQKQASEKVSNKGKRKHKNED
:.::: :.::.::: : : .. :.: :. : . . ..:..:.. :.: .:.:.:
CCDS36 SLMVKITLDLLSRIPQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDS-SSKLAKKRKGEA
760 770 780 790 800 810
780 790 800 810 820
pF1KE9 DNRASESKKPKTED--KNSAGHKPSSNRESSK------QSAAKEKDLLPSPAGPVPSKDP
. : ..:: . : :.... . ::..:::: .: ...:..:: : :: :..
CCDS36 E-RDCDNKKIRLEKEIKSQSSSSSSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPP--PVSSSSQ
820 830 840 850 860 870
830 840 850 860 870 880
pF1KE9 KTEHGSRKRTISQSSSLKSSSNSNKETSGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSKEVKEKAPS
: . . ::. .... .. .. .. :....:: ::...::: : ::.: : .. .
CCDS36 KPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGD
880 890 900 910 920 930
890 900 910 920 930 940
pF1KE9 SSSNCP-PSAPTLDSSKPRRTKLVFDDRNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYL
... : :: :. .::: . .. :: .. :: ...::::.:..:. ..:: :: ::
CCDS36 TANPFPVPSLPN-GNSKPGKPQVKFDKQQ--ADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYL
940 950 960 970 980 990
950 960 970 980 990 1000
pF1KE9 DAVVSFIECGNALEKNAQESKSPFPMYSETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCL
.::.:::::: : :...: ::: . .:::::::::. :.::.. : . .: ..:::.
CCDS36 EAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCM
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE9 RCESLLYLRLFKLKKENALKYSKTLTEHLKNSYNNSQAPSPGLGSKAVGMPSPVSPKLSP
::.:.: . .:. ::. :.:::.::..:...: . .::::: ..: .: :::.:: ::
CCDS36 RCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIAS--TGTPSPLSPMPSP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE9 GNSGNYSSGASSASASGSSVTI--PQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQK
..: . .:.:.:...:: ..:: : :..:..::: .::. : : ..:.::: :....:
CCDS36 ASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNK
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1130 1140 1150 1160
pF1KE9 EFFAELDKVMGPLIFNASIMTDLVRYTRQGLHWLRQDAKLIS
::::.:. . : .:.: ..:::.:::::.. :.. .:
CCDS36 EFFARLSTNVCTLALNSS-LVDLVHYTRQGFQQLQELTKTP
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CCDS42 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYK-T
10 20 30 40 50
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: : .:.: : :. .:. . :. : :.
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. .:. : ...:... : :: :. .: .... :.:. . ... .
CCDS42 MGWQKAGHPPSDGQQRATQQG------SL-----RTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQ
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230 240 250 260 270
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CCDS42 TQERPPAMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSS
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CCDS42 SETSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--W
260 270 280 290 300 310
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:::.::..: :.::.:::::.:.:: . : .. :. . : . .:: .. :::.::::
CCDS42 LPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSMLEDDLK
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390 400 410 420 430
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:::.:. . .: ..: :. : : . : .:.:...: .. ::: : ::::
CCDS42 LSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESS
380 390 400 410 420 430
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pF1KE9 SGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLNKVNPHKVSPASSVDSNIP
::::::.:::::.::...: . .::: :: .::::::.::::::::: . .:.
CCDS42 SGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPILIQNESHGS
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500 510 520 530 540 550
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:. : . .: : :. :. : :: .:. .. . . ...: .::::
CCDS42 ESNQYYNPVKEDVQDCGK-VPDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSP
500 510 520 530 540 550
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pF1KE9 ---------------------AQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEEPRGGLKIESETP
:.. . ::..::: ...:...: . . . : .
CCDS42 PAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAA
560 570 580 590 600 610
590 600 610 620 630 640
pF1KE9 VD-LASSM--PSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSREIIET
.: :..:. : :. :. . . .:: .:: : ::.. .. :. ::.:.:::
CCDS42 ADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSV--TCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIET
620 630 640 650 660
650 660 670
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..::: ::: :.: : :. : : .: :.::
CCDS42 ESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINA
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680 690 700 710 720
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:.. : :..:. . :. ..::::::.. :. : :::::.::.::: .
CCDS42 RTTSDIAKELEEQFYT---LVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQE
730 740 750 760 770 780
730 740 750 760 770 780
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: . : .....: .:: .. .::. :.:::.: :::: : : :: . : :
CCDS42 PGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTP---AEKALPKSKRKRKCDNEDDYR--EIKKSQGEKD
790 800 810 820 830 840
790 800 810 820 830
pF1KE9 KNSAGHKPSSNRESSKQ------SAA----KEKDLLPSPAGPVPSKDPKTEHGSRKRTIS
..: .:: :... :.: :.. .: :: .:. . ..: .. ..
CCDS42 SSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKMLRSPISPL---SDASKHKYTSEDLT
850 860 870 880 890
840 850 860 870 880 890
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.:: . ..:: ...:::. .. :. . : ...... .:. : .: . : .:
CCDS42 SSS--RPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSP
900 910 920 930 940 950
900 910 920 930 940 950
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.. . .: :::::: :::...::::..::.:::. ..: ::. : .:..::::::
CCDS42 GSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECG
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960 970 980 990 1000 1010
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::.:.. .:::::. ::::::.::.:.:.::.. .:.:: ::.:..:: :: .::: :.
CCDS42 NAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRM
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE9 FKLKKENALKYSKTLTEHLKNSYNNSQAPSP-GLGSKAVGMPSPVSPKLSPGNSGNYSSG
:.::...:.::::.: ...::: . .::::: : ..:..: :::.::. ::..: . ...
CCDS42 FRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGS
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE9 ASSASASGSS--VTIPQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELDKV
:.::: . : :.:::.::::::..:..:...:.. . :..:..:.::..::: .:: .
CCDS42 LSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLL
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1140 1150 1160
pF1KE9 MGPLIFNASIMTDLVRYTRQGLHWLRQDAKLIS
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CCDS42 MGPVTLHSS-MEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
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10 20 30 40
pF1KE9 MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVT
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CCDS33 RNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYK-T
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50 60 70 80 90 100
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CCDS33 NKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKIDEHFV------
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110 120 130 140 150 160
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: : .:.: : :. .:. . :. : :.
CCDS33 ------------ADSRAQNQPSSI----------CSTTTSTPAAVPVQQSKR------GT
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170 180 190 200 210 220
pF1KE9 SSRKKGQHGSEHSKSRSSSPGKPQAVSSLNSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKSPRDPDANWD
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CCDS33 MGWQKAGHPPSDGQQRATQQG------SL-----RTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQ
180 190 200 210
230 240 250 260 270
pF1KE9 SPSRVP-----FSSGQHSTQSFPPSLMSKSNSMLQKPTAYVRPMDGQESME---PKLSSE
. : : ::. : .:.::::: :: . . :::::::::::::.. :::.:
CCDS33 TQERPPAMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSS
220 230 240 250 260 270
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pF1KE9 HYSS----QSHGNSMTELKPS-SKAHLTKLKIPSQPLDASASGDV-SCVDEILKEMTHSW
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CCDS33 SETSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--W
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 PPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTGEQKRYN--PSKTSNGHQSKSMLKDDLK
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CCDS33 LPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSMLEDDLK
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CCDS33 LSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESS
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:. : . .: : :. :. : :: .:. .. . . ...: .::::
CCDS33 ESNQYYNPVKEDVQDCGK-VPDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSP
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pF1KE9 ---------------------AQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEEPRGGLKIESETP
:.. . ::..::: ...:...: . . . : .
CCDS33 PAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAA
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pF1KE9 VD-LASSM--PSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSREIIET
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CCDS33 ADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSV--TCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIET
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650 660 670
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CCDS33 ESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINA
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680 690 700 710 720
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CCDS33 RTTSDIAKELEEQFYT---LVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQE
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CCDS33 PGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTP---AEKALPKSKRKRKCDNEDDYR--EIKKSQGEKD
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.:: . ..:: ...:::. .. :. . : ...... .:. : .: . : .:
CCDS33 SSS--RPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSP
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CCDS33 GSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECG
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CCDS33 NAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRM
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CCDS33 FRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGS
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE9 ASSASASGSS--VTIPQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELDKV
:.::: . : :.:::.::::::..:..:...:.. . :..:..:.::..::: .:: .
CCDS33 LSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLL
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1140 1150 1160
pF1KE9 MGPLIFNASIMTDLVRYTRQGLHWLRQDAKLIS
:::. ...: : ::.:..:::::::..:.:
CCDS33 MGPVTLHSS-MEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
1230 1240 1250
>>CCDS78510.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276 aa)
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50 60 70 80 90 100
pF1KE9 EDKLSSRIQSMLGNYDEMKDFIGDRSIPKLVAIPKPTVPPSADEKSNPNFF-EQRHG--G
:.::: .:: . ..:..:.:: ::..
CCDS78 DALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIP
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KE9 SHQSSKWTPVGPAPSTSQSQKRSSGLQSGHSSQ----RTSAGSSS--GTNSSGQRHDRES
::.. : .: : : :. ..:...:. : : . :. ....::: . ..
CCDS78 PHQDNT-HPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQT
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 YNNSGSSSRKKG--QHGSEHSKSRSSSPGKPQAVSSLNSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKSP
... :... . . .:. . ..: :. ..:. : :.: :: .:.::
CCDS78 LTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNP---SAKEDSNPNSSGEDAF-KEIFQSNSP
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE9 RDPDANWDSP-------SRVPFSSGQHSTQSFPPSLMSKSNSMLQKPTAYVRPMDGQES-
.. . ..: : . ::: :.:.:::.:. :.. :::::::::::::..
CCDS78 EESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGL-SVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQA
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KE9 --MEPKLSSEHYSSQSHGN----SMTELKPS---SKAHLTKLKIPSQPLDASASGDVSCV
. : :. .: :: .. . ::: ::..: :. : : ..: .: :::
CCDS78 PDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTI-LQTSEVSLPSDPSCV
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE9 DEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTGEQKRYNPS-KTSNGHQ
.:::.: : : : :: .:. ..:.
CCDS78 EEILRESQHLTP-----------------------------GFTLQKWNDPTTRASTKSV
360 370 380
380 390 400 410 420
pF1KE9 S-KSMLKDDLKLSSSED--------------SDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNSEG
: ::::.:::::::.:: .. : .:. ::..: : . .
CCDS78 SFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNP-VNPPLATPQPPP
390 400 410 420 430 440
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 ADNSRDDSSSHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLNK
: .. :.: : ::::: :::..:::..:::.:: . :.:::::: :::::::.::::
CCDS78 AVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNK
450 460 470 480 490 500
490 500 510 520 530
pF1KE9 VNPHKVS--------PASSVDSNIPSSQGYKKEGREQGTGNSYTDTSGPKETSSATPGRD
:. .. : : ... : : .. . . . :. . ::: . :.
CCDS78 VTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVK--TNASQVPAEPKERPLLSLIRE
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570 580
pF1KE9 S---KTIQKGSESGRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEEPRGGLK--IESE
. . :: :. ..: . :....:: :.:::::::.:: .. . : : :
CCDS78 KARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQR-TIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSS
570 580 590 600 610 620
590 600 610 620 630 640
pF1KE9 TPVDLAS----SMPSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSREI
:: . : . : .:.::. ..:: .:: . . . :::::.. .: ::::.
CCDS78 TPKEKESVELHDPPRGRNKAT---AHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREF
630 640 650 660 670
650 660 670 680
pF1KE9 IETDTSSSDS--DESESL-----PP----SSQTPKYPE------SNRTPVKPSSVEEEDS
::::.:.::: :. :.: :: ...: : : . : .. :. ... :
CCDS78 IETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASLTLSTLMSSSGSNNNLS
680 690 700 710 720 730
690 700 710 720 730 740
pF1KE9 FFRQR-MFSPME--EKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDLNLLTRIPGKPYKETEPPKGEKKN
. .. :::. . :.:::: . .. : :::::.::.:.::. .. : : ..:.
CCDS78 ISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAPAKPDHKE
740 750 760 770 780 790
750 760 770 780 790
pF1KE9 VPEKHTREAQKQASEKVSNKGKRKHKNEDDNRASESKKPKTEDKNSA-----------GH
. : :.. : :: . ::::::: . . :: . :. .. :
CCDS78 TATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPH
800 810 820 830 840 850
800 810 820 830 840
pF1KE9 KPSSNRESSKQSAA---KEKDLLPSPAGPVPSKDPKTEHGS-------RKRTISQSSSLK
:: ..::.... : ::. :.: : .:.: :. .. : . ..:......
CCDS78 KPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQIT
860 870 880 890 900 910
850 860 870 880
pF1KE9 SSS------------------NSNKETSGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSKEVKEKAPS
:.. .. :..:... . ..:. : :. . : : .
CCDS78 STKPKRTEGKFCATFKGISEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATA
920 930 940 950 960 970
890 900 910
pF1KE9 SSSNCPPSA---------------------------PTLDSSKP--RRTKLVFDDRNYSA
.... .. : :.::. :: ::.::: ..:
CCDS78 TATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNA
980 990 1000 1010 1020 1030
920 930 940 950 960 970
pF1KE9 DHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIECGNALEKNAQESKSPFPMYSETVD
:.:.::::::::.:::: ..: ::: : ::..:: :::::.:.. :.:::. ::::::.
CCDS78 DYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVE
1040 1050 1060 1070 1080 1090
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE9 LIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRCESLLYLRLFKLKKENALKYSKTLTEHLK-N
:..:.:.:::. .: :. .::.:.::: :: ::::::.:::::..:.:::..: :..: :
CCDS78 LLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQN
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE9 SYNNSQAPSPGLGSKAVGMPSPVS-PKLSPGNS-GNYSSGASSASASGSSVTIPQKIHQM
. . .: ::: . :.. . ::::: ..:: :. :: ..: :::::.::.:
CCDS78 ASKVAQIPSPWV-SNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGP---------VTIPQRIHHM
1160 1170 1180 1190 1200
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE9 AASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELDKVMGPLIFNASIMTDLVRYTRQGL
:::.:..::: : . : ::.:..:..:.::::..:: .:::: ..: ::.::::.::::
CCDS78 AASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSS-MTNLVRYVRQGL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1160
pF1KE9 HWLRQDAKLIS
::: ::.:.
CCDS78 CWLRIDAHLL
1270
>>CCDS55521.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (952 aa)
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300 310 320 330 340 350
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CCDS55 MKFKRRHQAFPSFFKMKVSLPSDPSCVEEILRESQH
10 20 30
360 370 380 390
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. : :: .:. ..:. : ::::.:::::::.:: .. :
CCDS55 LTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAV
40 50 60 70 80 90
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 DKTMPRSTPGSNSEPSHHNSEGADNSRDDSSSHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQ
.:. ::..: : . . : .. :.: : ::::: :::..:::..:::.:: .
CCDS55 EKAKPRNNP-VNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPR
100 110 120 130 140 150
460 470 480 490 500 510
pF1KE9 SASPEPEPPPTNKWQLDNWLNKVNPHKVS--------PASSVDSNIPSSQGYKKEGREQG
:.:::::: :::::::.:::::. .. : : ... : : .. . . .
CCDS55 VATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVK-
160 170 180 190 200 210
520 530 540 550 560
pF1KE9 TGNSYTDTSGPKETSSATPGRDS---KTIQKGSESGRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKKQP
:. : . . ::: . :.. . :: :. ..: . :....:: :.:::::
CCDS55 TNASQVPAE-PKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQR-TIGKKQP
220 230 240 250 260 270
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 KKAEKAAAEEPRGGLK--IESETPVDLAS----SMPSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSP
::.:: .. . : : : :: . : . : .:.::. ..:: .:: . .
CCDS55 KKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKAT---AHKPAPRKEPRPNI
280 290 300 310 320
630 640 650 660 670
pF1KE9 RPTAEKKKYKSTSKSSQKSREIIETDTSSSDS--DESESL-----PP----SSQTPKYPE
. :::::.. .: ::::.::::.:.::: :. :.: :: ...: : :
CCDS55 PLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKE
330 340 350 360 370 380
680 690 700 710 720
pF1KE9 ------SNRTPVKPSSVEEEDSFFRQR-MFSPME--EKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDLN
. : .. :. ... :. .. :::. . :.:::: . .. : :::::.
CCDS55 ICGASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLD
390 400 410 420 430 440
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 LLTRIPGKPYKETEPPKGEKKNVPEKHTREAQKQASEKVSNKGKRKHKNEDDNRASESKK
::.:.::. .. : : ..:.. : :.. : :: . ::::::: . . ::
CCDS55 LLSRVPGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKK
450 460 470 480 490 500
790 800 810 820
pF1KE9 PKTEDKNSA-----------GHKPSSNRESSKQSAA---KEKDLLPSPAGPVPSKDPKTE
. :. .. ::: ..::.... : ::. :.: : .:.: :. .
CCDS55 QRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRR
510 520 530 540 550 560
830 840 850 860
pF1KE9 HGS-------RKRTISQSSSLKSSSNSNKETS------GSSKNSSSTSKQKK--------
. : . ..:...... :.. . : . : : : ..: :. .
CCDS55 NVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTN
570 580 590 600 610 620
870 880 890 900
pF1KE9 ----------TEGKTSSSSKEVKEKAPSSSSNCPPSAPT-------LDSSK---------
: :.. . . : ..... :. : .:::.
CCDS55 TAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAAL
630 640 650 660 670 680
910 920 930 940 950
pF1KE9 P---------RRTKLVFDDRNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIE
: :: ::.::: ..::.:.::::::::.:::: ..: ::: : ::..:: :
CCDS55 PLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTE
690 700 710 720 730 740
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE9 CGNALEKNAQESKSPFPMYSETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRCESLLYL
::::.:.. :.:::. ::::::.:..:.:.:::. .: :. .::.:.::: :: :::::
CCDS55 CGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYL
750 760 770 780 790 800
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE9 RLFKLKKENALKYSKTLTEHLK-NSYNNSQAPSPGLGSKAVGMPSPVS-PKLSPGNS-GN
:.:::::..:.:::..: :..: :. . .: ::: . :.. . ::::: ..:: :. ::
CCDS55 RMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWV-SNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGN
810 820 830 840 850 860
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE9 YSSGASSASASGSSVTIPQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELD
..: :::::.::.::::.:..::: : . : ::.:..:..:.::::..::
CCDS55 CNNGP---------VTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLD
870 880 890 900 910
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pF1KE9 KVMGPLIFNASIMTDLVRYTRQGLHWLRQDAKLIS
.:::: ..: ::.::::.:::: ::: ::.:.
CCDS55 TLMGPLTQHSS-MTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL
920 930 940 950
>>CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276 aa)
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50 60 70 80 90 100
pF1KE9 KEDKLSSRIQSMLGNYDEMKDFIGDRSIPKLVAIPKPTVPPSADEKSNPNFF-EQRHG--
::.::: .:: . ..:..:.:: ::..
CCDS76 GDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRII
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pF1KE9 GSHQSSKWTPVGPAPSTSQSQKRSSGLQSGHSSQ----RTSAGSSS--GTNSSGQRHDRE
::.. : .: : : :. ..:...:. : : . :. ....::: . .
CCDS76 PPHQDNT-HPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQ
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 SYNNSGSSSRKKG--QHGSEHSKSRSSSPGKPQAVSSLNSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKS
. ... :... . . .:. . ..: :. ..:. : :.: :: .:.:
CCDS76 TLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNP---SAKEDSNPNSSGEDAF-KEIFQSNS
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE9 PRDPDANWDSP-------SRVPFSSGQHSTQSFPPSLMSKSNSMLQKPTAYVRPMDGQES
:.. . ..: : . ::: :.:.:::.:. :.. :::::::::::::..
CCDS76 PEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGL-SVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQ
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KE9 ---MEPKLSSEHYSSQSHGN----SMTELKPS---SKAHLTKLKIPSQPLDASASGDVSC
. : :. .: :: .. . ::: ::..: :. : : ..: .: ::
CCDS76 APDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTI-LQTSEVSLPSDPSC
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE9 VDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTGEQKRYNPSKTSNGHQ
:.:::.: : : : :: .:. .
CCDS76 VEEILRESQHLTP-----------------------------GFTLQKWNDPTTRA----
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pF1KE9 SKSMLKDDLKLSSSED--------------SDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNSEGA
: .::.:::::::.:: .. : .:. ::..: : . . :
CCDS76 STKMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNP-VNPPLATPQPPPA
390 400 410 420 430 440
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CCDS76 VQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKV
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. .. : : ... : : .. . . . :. . ::: . :..
CCDS76 TSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVKT--NASQVPAEPKERPLLSLIREK
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570 580
pF1KE9 ---KTIQKGSESGRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEEPRGGLK--IESET
. :: :. ..: . :....:: :.:::::::.:: .. . : : : :
CCDS76 ARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQR-TIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSST
570 580 590 600 610
590 600 610 620 630 640
pF1KE9 PVDLAS----SMPSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSREII
: . : . : .:.::. ..:: .:: . . . :::::.. .: ::::.:
CCDS76 PKEKESVELHDPPRGRNKAT---AHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFI
620 630 640 650 660 670
650 660 670 680
pF1KE9 ETDTSSSDS--DESESL-----PP----SSQTPKYPE------SNRTPVKPSSVEEEDSF
:::.:.::: :. :.: :: ...: : : . : .. :. ... :.
CCDS76 ETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASLTLSTLMSSSGSNNNLSI
680 690 700 710 720 730
690 700 710 720 730 740
pF1KE9 FRQR-MFSPME--EKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDLNLLTRIPGKPYKETEPPKGEKKNV
.. :::. . :.:::: . .. : :::::.::.:.::. .. : : ..:..
CCDS76 SNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAPAKPDHKET
740 750 760 770 780 790
750 760 770 780 790
pF1KE9 PEKHTREAQKQASEKVSNKGKRKHKNEDDNRASESKKPKTEDKNSA-----------GHK
: :.. : :: . ::::::: . . :: . :. .. ::
CCDS76 ATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHK
800 810 820 830 840 850
800 810 820 830 840
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: ..::.... : ::. :.: : .:.: :. .. : . ..:...... :
CCDS76 PPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITS
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850 860 870 880
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