Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9393
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9393, 1251 aa
1>>>pF1KE9393 1251 - 1251 aa - 1251 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2717+/- 0.001; mu= -3.7589+/- 0.061
mean_var=282.1997+/-57.126, 0's: 0 Z-trim(113.7): 47 B-trim: 39 in 1/52
Lambda= 0.076348
statistics sampled from 14306 (14346) to 14306 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.737), E-opt: 0.2 (0.441), width: 16
Scan time: 4.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251) 8322 930.8 0
CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226) 8034 899.1 0
CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218) 1317 159.2 5.9e-38
CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210) 1312 158.7 8.5e-38
CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163) 1142 139.9 3.6e-32
CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 1005 124.9 1.4e-27
CCDS55521.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX ( 952) 771 99.0 6e-20
CCDS78510.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 771 99.1 7.8e-20
CCDS14684.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1311) 771 99.1 7.9e-20
>>CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251 aa)
initn: 8322 init1: 8322 opt: 8322 Z-score: 4964.7 bits: 930.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8322; 99.9% identity (100.0% similar) in 1251 aa overlap (1-1251:1-1251)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDSFDLALLQEWDLESLWGEDILNQRNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MDSFDLALLQEWDLESLWGEDILNQRNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 NQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTMGWQKAGHPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTMGWQKAGHPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 SDGQQRATQQGSLRTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SDGQQRATQQGSLRTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 FPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 RAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 SQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 AVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 PEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS33 PEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 PSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 PAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 SHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 VAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 PLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 KSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 LRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 NNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 EKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 EDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 TPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYW
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE9 EMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226 aa)
initn: 8132 init1: 8033 opt: 8034 Z-score: 4793.4 bits: 899.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8089; 97.9% identity (98.0% similar) in 1251 aa overlap (1-1251:1-1226)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDSFDLALLQEWDLESLWGEDILNQRNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERR
::::::::::::::::: : :::::::::::::::::
CCDS42 MDSFDLALLQEWDLESL-----------------------C--VYEPDRNALRRKERERR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 NQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTMGWQKAGHPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTMGWQKAGHPP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 SDGQQRATQQGSLRTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SDGQQRATQQGSLRTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 FPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 RAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKD
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 SQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 AVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSS
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 PEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS42 PEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQ
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 PSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENA
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 PAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRA
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 SHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQT
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 VAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLS
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 PLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALP
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 KSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKM
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 LRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAH
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 NNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMV
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 EKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATP
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 EDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 TPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYW
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE9 EMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
1180 1190 1200 1210 1220
>>CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218 aa)
initn: 1524 init1: 449 opt: 1317 Z-score: 794.9 bits: 159.2 E(32554): 5.9e-38
Smith-Waterman score: 1947; 34.9% identity (60.3% similar) in 1293 aa overlap (43-1245:13-1212)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 DLESLWGEDILNQRNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFN
:.:. ::: :: .:.::::::..:. .:
CCDS54 MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFP
10 20 30 40
80 90 100 110 120
pF1KE9 SSYSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHL------VGVPK-PGV
. ::.::::: ::::::.:::: ::::.:.:.::. .:. .: .: :: : .
CCDS54 EKIPLFGEPYKTAKGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLI
50 60 70 80 90 100
130 140 150
pF1KE9 P--------------------QTP------VNKIDEHF-VADSRAQNQPSSICSTTTSTP
: .:: :..:... .:. :.. .:: . . . . :
CCDS54 PDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPS-LHAKSCGPP
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 AAVPVQQSKRGTMGW----QKAGHPPSDGQQRATQQGSL-RTLLGDGVGRQQPRAKQVCN
. . :.. : :. .: : .::.. :. : . :. .. .: . .
CCDS54 DSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSP-VPPLSP
170 180 190 200 210 220
220 230 240
pF1KE9 VEVGLQTQERPPAMAAKHSSS----GHC-----------------------------VQN
.. . :: : . . :.:: :.: :.
CCDS54 IHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQT
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290
pF1KE9 FPP-SLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPE-
::: :: :: .::::::::::::::::::.:::.:: : .:: : .
CCDS54 FPPPSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE------DYRQQTFEKTDL
290 300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 PARAKAKLSKFSIPKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFP
. :::::.:...:.:. :.. :.:.. :::::..::: : :::.::..:. .::.:::
CCDS54 KVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEVH-CVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFP
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 FPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTAL
::.:::: ::: .: :. :. .. .:. ..:: ::::::.::..:. . .:. ..
CCDS54 FPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPP-
400 410 420 430 440 450
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 RALSDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSK
:.:: :. :.: .:. :::. : :.:::.:: ::::.:::::.:: ..
CCDS54 ---SSSA---PPSAPQSLPEPVASAHSSSA-ESESTSDSDSS--SDSESESSSSDSEENE
460 470 480 490 500
480 490 500 510 520 530
pF1KE9 PPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCG
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. . : .: .: :. :....::: ..:: :: :.
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: .::.. : : :...: : .. ..:: :. .. . .::. :. . .
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:.. : ::. .: . .: ... . : . :: . :. ..:. .
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.:. ..:::::.:. .:: ::: : :::::: : :: : : .. ::.
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:.:. . . : .::: . : : . :: . ::. .:. ..:.:. : .
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. .. . : ... : : :.:..:. : .. : : : :.. ::::.:.
CCDS54 SKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQ-KPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSN
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. ::.. . :.....::. . . : ::. . .. :: ..:
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::.. : ::. : .: ..: .:.::.:: ..: ::: :.: :.:::..: .:..:
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::.:::::: ..:::::::.:: ::::::::::.: ..... . .. .: : :..:
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....:.::. .: ..: ::.:. :...:.::: :. . ..:.::. ::.:..::..
CCDS54 TSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQGFQ
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CCDS54 QLQELTKTP
1210
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250 260 270 280 290
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::.:::: ::: .: :. :. .. .:. ..:: ::::::.::..:. . .:. ..
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CCDS36 DLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVD
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CCDS36 LIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESS
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CCDS36 SKVAQAPSPCIAS---TGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNM
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CCDS36 TSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQGFQ
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pF1KE9 WLRNSAHLS
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CCDS36 QLQELTKTP
1210
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CCDS41 FAEPYKVTSKEDKLSSRIQSMLGNYDEMKDFIGDRSIPK-LVAIPKPTVPPSADEKSNPN
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pF1KE9 FV------------------ADSRAQNQPSSI----------CSTTTSTPAAVPVQQSKR
: : : .:.: : :. .:. . :. :
CCDS41 FFEQRHGGSHQSSKWTPVGPAPSTSQSQKRSSGLQSGHSSQRTSAGSSSGTNSSGQRHDR
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170 180 190 200 210
pF1KE9 ------GTMGWQKAGHPPSDGQQRATQQG------SL-----RTLLGDGVGRQQPRAKQV
:. . .:. : ...:... : :: :. .: .... :.:.
CCDS41 ESYNNSGSSSRKKGQHGSEHSKSRSSSPGKPQAVSSLNSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKSP
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pF1KE9 CNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPD
. ... .. : : ::. : .:.::::: :: . . :::::::::::::..
CCDS41 RDPDANWDSPSRVP-----FSSGQHSTQSFPPSLMSKSNSMLQKPTAYVRPMDGQESM--
220 230 240 250 260
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:::.: .: . .: .. .:. .::.:.:..::.: . : ::.. :::.::
CCDS41 -EPKLSSEHYSS----QSHGNSMTELKPS-SKAHLTKLKIPSQPLDASASGDV-SCVDEI
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CCDS41 LKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTGEQKRYN--PSKTSNGHQSK
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:::.:::::::.:. . .: ..: :. : : . : .:.:...: . .::
CCDS41 SMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGS------NSEPSHHNSEGADNSRD--DSS
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: : ::::::::::.:::::.::...: . .::: :: .::::::.:::::::::
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. .:. :. : . .: : :. :. : :: :. . .: .:. :
CCDS41 SSVDSNIPSSQGYKKEGRE--QGTGNSYTDTSGP----KET-SSATPGRDSKTIQKGSES
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.:::: :.. . ::..::: ...:...: . .
CCDS41 GRGRQKSP---------------------AQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEEPRGG
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. : . .: :..:. : :. :. . . .:: .:: : ::.. .. :.
CCDS41 LKIESETPVD-LASSM--PSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQ
590 600 610 620 630
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::.:.:::..::: ::: :.: : : .:: :.
CCDS41 KSREIIETDTSSS----DSD---ESESLPPS-SQT-----------------------PK
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: .. . :.. : :..:. . :. ..::::::.. :. : :::::.::.:
CCDS41 YPESNRTPVKPSSV--EEEDSFFRQRMFSPMEEKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDLNLLTR
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: : .: . : .....: .:: .. .::. :.:::.: :::: : :
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:: . : :..: .:: :... :.: :.. .: :: .:. . ..:
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.. ...:: . ..:: ...:::. .. :. . : ...... .:. : .:
CCDS41 GSRKRTISQSSSLKSSSNSNKETSGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSKEVKEKAP--SSS
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CCDS41 SNCPPSAPTLDSSKP-RRTKLVFDDRNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDA
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..::::::::.:.. .:::::. ::::::.::.:.:.::.. .:.:: ::.:..:: ::
CCDS41 VVSFIECGNALEKNAQESKSPFPMYSETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRC
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pF1KE9 LALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPA
.::: :.:.::...:.::::.: ...::: . .::::: : ..:..: :::.::. ::.
CCDS41 ESLLYLRLFKLKKENALKYSKTLTEHLKNSYNNSQAPSP-GLGSKAVGMPSPVSPKLSPG
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE9 SSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENRE
.: . ... :.::: . : :.:::.::::::..:..:...:.. . :..:..:.::..:
CCDS41 NSGNYSSGASSASASGSS--VTIPQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKE
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1220 1230 1240 1250
pF1KE9 FFNDLDLLMGPVTLHSS-MEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
:: .:: .:::. ...: : ::.:..:::::::..:.:
CCDS41 FFAELDKVMGPLIFNASIMTDLVRYTRQGLHWLRQDAKLIS
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:: ::.::...: ::::::.::.: :.:.
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..::.:::: ::::: :.::.:::::::::::..::..:::.::::.:: .:::.:
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:: . : ... . : .: :.: : ....... :.. .: ::
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..: . : ....:: : .:. ..: ::. : . .
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220 230 240 250
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.:. .: :. : : ::: ::::::.: : :. ::::::
CCDS76 DAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTA
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
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::::::::::::: :: :: : : .: :. . .:: : .:.:: ::.: . .:
CCDS76 YVRPMDGQDQAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSE
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
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: .. ::::::.:: :: .. : . : .:
CCDS76 VSLPSDP-SCVEEILRE---------------------------SQHLTPGFTLQKWND-
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: . ..:.::::::::::::.. : . : : .:.. . :..
CCDS76 -PTT----RASTKMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPP
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. . . . ..::.:.:::.::::: :::.::::...::... :. ..:: :: :.:::
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::::::::: . .: : :::. :. . :. . .. :: .. : :. .:.
CCDS76 QLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETP-METISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERP
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pF1KE9 IKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRS
. : .:. ::: ..: : .:..:.: .. .:. .:.
CCDS76 LLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVS----------------------QRT
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::: ...:.... : . .:. ... :: . : .. . ::: :
CCDS76 IGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPR
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.. ::.. :: ..:::::.:::::.::.:.:..: ::: :.
CCDS76 PNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTD------QEE-TLQIKVLPPCII
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pF1KE9 SSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLSPLKDS
:.:: . :: :.: . . : .. ...... :: .. .: ..:.::::.:
CCDS76 SGGNTAKSKEIC--GASLTLSTLMS-SSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDH
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pF1KE9 DEIRSLWVKIDLTLLSRIPEH--LPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALPKSK
.....::::::: ::::.: : : : . : :.. . : .:. : .:: ::.:
CCDS76 ENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAP---AKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGK
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::.: . . : :. : . : : . . : :. . : :.::.
CCDS76 RKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKL
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pF1KE9 LRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNG---NSLFTSASSSKKPKAD--------SQLQ
. :.::: . .. ....... : : : .:. .: ::: . ..
CCDS76 FPPPLSPLPEDPPRR---RNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGIS
880 890 900 910 920 930
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pF1KE9 PHGGDLTKAAHNNSENIP------------------------------------------
. :: : : . . ..
CCDS76 VNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITST
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. .:. . :. : :.. . .: ::.::: ..:::.:::::..::::::.
CCDS76 ITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADAL
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1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE9 VEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNAT
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CCDS76 FEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLAS
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1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE9 PEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFK-NSSKAAQAPSPWGASGKS
::.::.::::::.::: :::.::.:::.:::..:..::: :.::.:: :::: ..::.
CCDS76 DGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKN
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1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE9 TGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYD
::::.: : .: ....:. .:. : :.::::::.:::.::.::...:..:.
CCDS76 --TPSPVSLN--NVSPINAMGNCNNG----P---VTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYE
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.:.:::.:..::.:::.::: ::::.: :::: .::.: .::: ::: .:::
CCDS76 HWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL
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CCDS55 QHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQ
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CCDS55 AVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAP
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. ..:: :: :.:::::::::::: . .: : :::. :. . :. . .. ::
CCDS55 RVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETP-METISLPPPIIQPMEVQMKV
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.. : :. .:. . : .:. ::: ..: : .:..:.: .. .:.
CCDS55 KTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVS----------
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.:. ::: ...:.... : . .:. ... :: . :
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.. . ::: : .. ::.. :: ..:::::.:::::.::.:.:..: :
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:: :. :.:: . :: :.: . . : .. ...... :: ..
CCDS55 EE-TLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEIC--GASLTLSTLMS-SSGSNNNLSISNEEPTFSP
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.: ..:.::::.: .....::::::: ::::.: : : : . : :.. . :
CCDS55 IPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAP---AKPDHKETATKPKR
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.:. : .:: ::.:::.: . . : :. : . : : . . :
CCDS55 QTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRE
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pF1KE9 NSVAIPIN--KNEKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNG---NSLFTSASSSKKP
:. . : :.::.. :.::: . .. ....... : : : .:. .: ::
CCDS55 NNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRR---RNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKP
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pF1KE9 KAD--------SQLQPHGGDLTKAAHNNSENIP---------------------------
: . .. . :: : : . . ..
CCDS55 KRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATA
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pF1KE9 --------------------LHKSRPQTKPWS--PG-SNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADY
. .:. . :. : :.. . .: ::.::: ..:::
CCDS55 TTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADY
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.:::::..::::::. ::::::.:::.::::: :::::::. :.:.:::::::::::::.
CCDS55 YMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELL
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:::::::. ..: :. ::.::.::::::.::: :::.::.:::.:::..:..::: :.:
CCDS55 RYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNAS
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CCDS55 KVAQIPSPWVSNGKN--TPSPVSLNN--VSPINAMGNCNNG----P---VTIPQRIHHMA
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pF1KE9 ANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHW
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CCDS55 ASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCW
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:: .:::
CCDS55 LRIDAHLL
950
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CCDS78 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSG
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pF1KE9 YSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKID
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CCDS78 FDLFGEPYKTNKGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNE
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CCDS78 PSFFPEQKNRIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLA
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pF1KE9 QQRATQQGSLRTLLGDG-----------------VGR---QQPRAKQVCNVEVG------
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CCDS78 SQASGQPNKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFK
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.:. .: :. : : ::: ::::::.: : :. ::::::::::
CCDS78 EIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRP
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::::::::: :: :: : : .: :. . .:: : .:.:: ::.: . .: :
CCDS78 MDGQDQAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLP
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pF1KE9 GETNSCVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPES
.. ::::::.:: :: .. : . : .: ..
CCDS78 SDP-SCVEEILRE---------------------------SQHLTPGFTLQKWNDPTTRA
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pF1KE9 PDNGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTS-----VPSS
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CCDS78 STKSVSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATP
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pF1KE9 KGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPASSNKWQLDK
. . ..::.:.:::.::::: :::.::::...::... :. ..:: :: :.:::::::
CCDS78 QPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDK
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::::: . .: : :::. :. . :. . .. :: .. : :. .:. . :
CCDS78 WLNKVTSQNKSFICGQNETP-METISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSL
500 510 520 530 540 550
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pF1KE9 CKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKK
.:. ::: ..: : .:..:.: .. .:. .:. :::
CCDS78 IREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVS----------------------QRTIGKK
560 570 580 590
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pF1KE9 PTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSVT
...:.... : . .:. ... :: . : .. . ::: : ..
CCDS78 QPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIP
600 610 620 630 640 650
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pF1KE9 C--EKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGN
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.::: . .. ....... : : : .:. .: ::: ..... .: ::
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: : . . .. .
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]