Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9294
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9294, 299 aa
1>>>pF1KE9294 299 - 299 aa - 299 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5930+/-0.00121; mu= 13.6515+/- 0.071
mean_var=68.4801+/-15.537, 0's: 0 Z-trim(101.2): 48 B-trim: 17 in 1/46
Lambda= 0.154986
statistics sampled from 6361 (6402) to 6361 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.542), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16
Scan time: 1.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 1717 393.4 1.2e-109
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 1699 389.3 1.9e-108
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 1645 377.3 8.1e-105
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 1600 367.2 8.9e-102
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 1340 309.1 2.7e-84
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 1339 308.8 3.1e-84
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 1305 301.2 6e-82
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 839 197.0 1.4e-50
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 754 178.0 7.8e-45
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 659 156.8 1.9e-38
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 621 148.3 6.9e-36
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 588 140.9 1.1e-33
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 587 140.7 1.3e-33
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 570 136.9 1.8e-32
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 546 131.5 7.8e-31
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 494 119.9 2.4e-27
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 398 98.4 6.8e-21
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 389 96.4 3e-20
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 371 92.4 4.5e-19
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 366 91.3 1e-18
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 355 88.8 5.3e-18
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 330 83.2 2.7e-16
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 309 78.6 7.3e-15
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 308 78.3 7.6e-15
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1717 init1: 1717 opt: 1717 Z-score: 2082.3 bits: 393.4 E(32554): 1.2e-109
Smith-Waterman score: 1717; 85.3% identity (95.7% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
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CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
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CCDS53 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
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CCDS53 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
.::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::: :::::.:::: ::.:: ::
CCDS53 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE9 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
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CCDS53 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
250 260 270 280 290 300
CCDS53 VKGEKPSSS
>>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1699 init1: 1699 opt: 1699 Z-score: 2060.5 bits: 389.3 E(32554): 1.9e-108
Smith-Waterman score: 1699; 86.0% identity (95.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
:::::::::: ::::::::::::::::::::: :: :::::::::::.::::::::::::
CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
::::::::::::::: :::.:::::::::: .::::: ::.::::::::::::::.:::.
CCDS53 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
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CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
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CCDS53 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE9 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
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CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
250 260 270 280 290 300
CCDS53 VKGEKTSSP
>>CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1645 init1: 1645 opt: 1645 Z-score: 1995.3 bits: 377.3 E(32554): 8.1e-105
Smith-Waterman score: 1645; 84.3% identity (94.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
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CCDS53 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
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CCDS53 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
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CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
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CCDS53 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE9 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
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CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
250 260 270 280 290 300
CCDS53 VKGEKPSSP
>>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 (319 aa)
initn: 1600 init1: 1600 opt: 1600 Z-score: 1940.7 bits: 367.2 E(32554): 8.9e-102
Smith-Waterman score: 1600; 81.3% identity (93.3% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
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CCDS53 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
::::.::.: :::::::::.: ::::.::::.:::.: :::::.::::.:::::::::::
CCDS53 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
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CCDS53 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
::::.::.:.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::: ::.:: ::
CCDS53 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE9 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
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CCDS53 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
250 260 270 280 290 300
CCDS53 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
310
>>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1355 init1: 1329 opt: 1340 Z-score: 1626.7 bits: 309.1 E(32554): 2.7e-84
Smith-Waterman score: 1340; 68.7% identity (85.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
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CCDS86 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
:.::.::::::::. .... : ::::.::: : ::::::::::::.::: ::: .
CCDS86 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
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CCDS86 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
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CCDS86 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE9 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
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CCDS86 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
250 260 270 280 290 300
CCDS86 AKGQNQSTP
>>CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 1357 init1: 1328 opt: 1339 Z-score: 1625.7 bits: 308.8 E(32554): 3.1e-84
Smith-Waterman score: 1339; 68.8% identity (87.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
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CCDS86 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
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CCDS86 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
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CCDS86 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
: ...:::..:::::.:.::::::::::::::.:::: :::::::.:::.:::.:: ::
CCDS86 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE9 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
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CCDS86 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
250 260 270 280 290
>>CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 1305 init1: 1305 opt: 1305 Z-score: 1584.6 bits: 301.2 E(32554): 6e-82
Smith-Waterman score: 1305; 66.0% identity (87.5% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
:. :: :: ::::: .::.:: ::::::::: .::. .::: :.::.:::.:::.::::
CCDS86 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
:.:. ::.::.: :.:..:.: .: : ::::.::: : :.::::: ::::::::::: :.
CCDS86 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
::.:.:::.::.:::::.:: :.: :..:.. :::::::::.::::::: :..::. :::
CCDS86 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
::::.:::..:: ::::.::::::::::.::.:::::::::::::.:::: ::..: ::
CCDS86 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE9 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
::. .: :.:.... ..: :...::.... : : :::: :..:::::.:::::::
CCDS86 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
250 260 270 280 290
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
initn: 828 init1: 245 opt: 839 Z-score: 1021.4 bits: 197.0 E(32554): 1.4e-50
Smith-Waterman score: 839; 44.4% identity (73.9% similar) in 306 aa overlap (1-298:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
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