Result of FASTA (omim) for
pFN21AE9289
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9289, 304 aa
1>>>pF1KE9289 304 - 304 aa - 304 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0053+/-0.000531; mu= 17.1596+/- 0.033
mean_var=81.2968+/-20.693, 0's: 0 Z-trim(106.0): 272 B-trim: 900 in 1/46
Lambda= 0.142245
statistics sampled from 13776 (14131) to 13776 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.488), E-opt: 0.2 (0.166), width: 16
Scan time: 4.420
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 975 210.6 3.2e-54
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 947 204.9 1.7e-52
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 934 202.2 1.1e-51
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 921 199.5 6.9e-51
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 921 199.5 6.9e-51
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 902 195.6 1e-49
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 881 191.3 2e-48
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 870 189.1 9.7e-48
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 832 181.3 2.2e-45
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 826 180.1 5.2e-45
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 826 180.1 5.2e-45
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 826 180.1 5.2e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 823 179.4 7.9e-45
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 812 177.2 3.7e-44
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 794 173.5 4.8e-43
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 792 173.1 6.7e-43
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 771 168.8 1.3e-41
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 768 168.1 1.9e-41
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 768 168.1 2e-41
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 747 163.8 3.8e-40
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 499 113.0 8.2e-25
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 421 96.9 5.4e-20
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 189 49.4 1.2e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 188 49.1 1.3e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 180 47.5 4.2e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 176 46.7 7.5e-05
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 175 46.5 8.9e-05
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 173 46.2 0.00015
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 169 45.3 0.00023
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 169 45.3 0.00023
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 169 45.4 0.00025
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 168 45.1 0.00027
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 167 44.8 0.00027
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 167 44.8 0.00027
XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 169 45.4 0.00028
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 168 45.1 0.00028
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 168 45.1 0.00028
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 168 45.1 0.00028
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 166 44.7 0.00038
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 164 44.2 0.00041
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 164 44.2 0.00043
XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349) 163 44.0 0.0005
NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349) 163 44.0 0.0005
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 158 43.1 0.0012
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 158 43.1 0.0012
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 150 40.9 0.0015
NP_001289607 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 ( 123) 147 40.3 0.0023
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 153 42.0 0.0023
NP_003599 (OMIM: 604620) psychosine receptor [Homo ( 337) 152 41.8 0.0023
NP_001139737 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 151 41.6 0.0029
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 975; 49.1% identity (80.1% similar) in 287 aa overlap (14-300:1-287)
10 20 30 40 50 60
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70 80 90 100 110 120
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NP_003 LIRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISL
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NP_003 MHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNP
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pF1KE9 QSIA
NP_003 LIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
290 300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 947; 51.1% identity (76.1% similar) in 284 aa overlap (18-300:7-289)
10 20 30 40 50 60
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pF1KE9 LIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLIF
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NP_006 KIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLN
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300
pF1KE9 PQSIA
:
NP_006 PLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
290 300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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pF1KE9 MVFLSSVETDQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQLRLFLLFLGIYVVTVVGNLSMIT
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pF1KE9 LIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLIF
....: ::::::.:::.:::.::: : .::::.: . : . ::. :.::.:: ..:
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pF1KE9 AIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWLTVGVYILGILGSTIHTGFMLRLF
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pF1KE9 LCKTNVINHYFCDLFPLLGLSCSSTYINELLVLVLSAFNILTPALTILASYIFIIASILR
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pF1KE9 IRSTEGRSKAFSTCSSHILAVAVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQGKVSSVFYTIVVPMLNP
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XP_011 VPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNP
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pF1KE9 QSIA
XP_011 FIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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pF1KE9 MVFLSSVETDQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQLRLFLLFLGIYVVTVVGNLSMIT
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIIL
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pF1KE9 LIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLIF
....: ::::::.:::.:::.::: : .::::.: . : . ::. :.::.:: ..:
NP_036 SVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMF
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pF1KE9 AIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWLTVGVYILGILGSTIHTGFMLRLF
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NP_036 VDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLS
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pF1KE9 LCKTNVINHYFCDLFPLLGLSCSSTYINELLVLVLSAFNILTPALTILASYIFIIASILR
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NP_036 FCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLK
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pF1KE9 IRSTEGRSKAFSTCSSHILAVAVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQGKVSSVFYTIVVPMLNP
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NP_036 VPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNP
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pF1KE9 QSIA
NP_036 FIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 921 init1: 921 opt: 921 Z-score: 1034.6 bits: 199.5 E(85289): 6.9e-51
Smith-Waterman score: 921; 46.7% identity (78.0% similar) in 287 aa overlap (14-300:1-287)
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pF1KE9 MVFLSSVETDQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQLRLFLLFLGIYVVTVVGNLSMIT
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIIL
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pF1KE9 LIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLIF
....: ::::::.:::.:::.::: : .::::.: . : . ::. :.::.:: ..:
XP_011 SVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMF
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pF1KE9 AIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWLTVGVYILGILGSTIHTGFMLRLF
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XP_011 VDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLS
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pF1KE9 LCKTNVINHYFCDLFPLLGLSCSSTYINELLVLVLSAFNILTPALTILASYIFIIASILR
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XP_011 FCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLK
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pF1KE9 IRSTEGRSKAFSTCSSHILAVAVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQGKVSSVFYTIVVPMLNP
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XP_011 VPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNP
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pF1KE9 QSIA
XP_011 FIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 902 init1: 902 opt: 902 Z-score: 1013.5 bits: 195.6 E(85289): 1e-49
Smith-Waterman score: 902; 45.8% identity (77.8% similar) in 284 aa overlap (17-300:5-288)
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pF1KE9 MVFLSSVETDQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQLRLFLLFLGIYVVTVVGNLSMIT
:: . .: ::: :.:. :.. :: .:: ::..... :::.:.
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIV
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pF1KE9 LIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLIF
:: ..::::::::.:::.:::::.:. . .:::: :.. :.. :.. :. : ..: .
NP_001 LIRMDSHLHTPMYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTM
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130 140 150 160 170 180
pF1KE9 AIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWLTVGVYILGILGSTIHTGFMLRLF
...: .... :::::.:::.::::. ::: : :...:.:. :. .: .. : .:.:
NP_001 GLSESCLMTAMAYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLH
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LCKTNVINHYFCDLFPLLGLSCSSTYINELLVLVLSAFNILTPALTILASYIFIIASILR
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NP_001 FCGSNVIRHFFCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 IRSTEGRSKAFSTCSSHILAVAVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQGKVSSVFYTIVVPMLNP
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NP_001 ITSAKGRSKAFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNP
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 QSIA
NP_001 LIYSLRNKEIKDALKRLQKRKCC
290 300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 881 init1: 881 opt: 881 Z-score: 990.2 bits: 191.3 E(85289): 2e-48
Smith-Waterman score: 881; 45.9% identity (76.0% similar) in 283 aa overlap (18-300:8-290)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVFLSSVETDQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQLRLFLLFLGIYVVTVVGNLSMIT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIII
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70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLIF
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NP_001 LSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLAL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 AIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWLTVGVYILGILGSTIHTGFMLRLF
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NP_001 GTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LCKTNVINHYFCDLFPLLGLSCSSTYINELLVLVLSAFNILTPALTILASYIFIIASILR
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NP_001 LCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILR
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250 260 270 280 290 300
pF1KE9 IRSTEGRSKAFSTCSSHILAVAVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQGKVSSVFYTIVVPMLNP
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NP_001 MQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNP
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 QSIA
NP_001 LIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 870 init1: 791 opt: 870 Z-score: 978.1 bits: 189.1 E(85289): 9.7e-48
Smith-Waterman score: 870; 46.0% identity (77.0% similar) in 287 aa overlap (14-300:1-285)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVFLSSVETDQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQLRLFLLFLGIYVVTVVGNLSMIT
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLIS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLIF
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NP_003 LVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 AIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWLTVGVYILGILGSTIHTGFMLRLF
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NP_003 GCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLP
110 120 130 140 150 160
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pF1KE9 LCKTNVINHYFCDLFPLLGLSCSSTYINELLVLVLSAFNILTPALTILASYIFIIASILR
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NP_003 YRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVK
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NP_003 MKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNP
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 QSIA
NP_003 LIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
290 300
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 832 init1: 832 opt: 832 Z-score: 935.9 bits: 181.3 E(85289): 2.2e-45
Smith-Waterman score: 832; 44.9% identity (73.5% similar) in 283 aa overlap (18-300:2-284)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVFLSSVETDQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQLRLFLLFLGIYVVTVVGNLSMIT
::: :::::. ::...:::: .::.:: .:.:. .::. .:
NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIII
10 20 30 40
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pF1KE9 LIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLIF
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NP_001 AKIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 AIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWLTVGVYILGILGSTIHTGFMLRLF
:: .... ::::::::: :: :..::..: : : :. ... .: .::....::
NP_001 LGAEMVLFTTMAYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LCKTNVINHYFCDLFPLLGLSCSSTYINELLVLVLSAFNILTPALTILASYIFIIASILR
.: :.:.:.::.. :::.:::: . :::..: : . . . :: :::..:::
NP_001 FCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILR
170 180 190 200 210 220
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pF1KE9 IRSTEGRSKAFSTCSSHILAVAVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQGKVSSVFYTIVVPMLNP
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NP_001 IRTVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNP
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 QSIA
NP_001 MVYSFQNREMQAGIRKVFAFLKH
290 300
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 826 init1: 826 opt: 826 Z-score: 929.1 bits: 180.1 E(85289): 5.2e-45
Smith-Waterman score: 826; 43.9% identity (75.3% similar) in 287 aa overlap (14-300:1-287)
10 20 30 40 50 60
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVL
10 20 30 40
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pF1KE9 LIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLIF
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NP_036 LIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLAL
50 60 70 80 90 100
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pF1KE9 AIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWLTVGVYILGILGSTIHTGFMLRLF
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NP_036 GGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLP
110 120 130 140 150 160
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pF1KE9 LCKTNVINHYFCDLFPLLGLSCSSTYINELLVLVLSAFNILTPALTILASYIFIIASILR
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NP_036 MCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILK
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pF1KE9 IRSTEGRSKAFSTCSSHILAVAVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQGKVSSVFYTIVVPMLNP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]