Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9289
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9289, 304 aa
1>>>pF1KE9289 304 - 304 aa - 304 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7317+/-0.00135; mu= 12.8923+/- 0.079
mean_var=133.7774+/-44.550, 0's: 0 Z-trim(100.6): 374 B-trim: 714 in 2/46
Lambda= 0.110888
statistics sampled from 5723 (6179) to 5723 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.514), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 1.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1540 258.8 3.8e-69
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1515 254.9 6.5e-68
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1324 224.3 9.9e-59
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1293 219.3 3e-57
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1272 215.9 3.1e-56
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1230 209.2 3.2e-54
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1204 205.0 5.8e-53
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1173 200.1 1.8e-51
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1165 198.8 4.4e-51
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1127 192.7 2.9e-49
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1030 177.2 1.4e-44
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1005 173.2 2.2e-43
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1004 173.1 2.5e-43
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 999 172.3 4.8e-43
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 998 172.1 4.8e-43
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 979 169.1 4e-42
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 975 168.4 6.2e-42
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 971 167.8 9.9e-42
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 969 167.5 1.2e-41
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 968 167.3 1.3e-41
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 966 167.0 1.7e-41
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 965 166.8 1.9e-41
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 959 165.8 3.6e-41
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 957 165.5 4.5e-41
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 957 165.5 4.6e-41
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 954 165.0 6.3e-41
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 952 164.7 7.9e-41
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 949 164.3 1.1e-40
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 947 163.9 1.4e-40
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 946 163.8 1.5e-40
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 944 163.5 1.9e-40
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 942 163.1 2.4e-40
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 939 162.7 3.4e-40
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 937 162.3 4.2e-40
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 933 161.7 6.5e-40
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 929 161.0 1e-39
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 928 160.9 1.1e-39
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 922 159.9 2.2e-39
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 921 159.8 2.5e-39
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 921 159.8 2.5e-39
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 921 159.8 2.5e-39
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 914 158.6 5.3e-39
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 914 158.7 5.4e-39
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 913 158.5 6e-39
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 912 158.3 6.7e-39
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 912 158.3 6.7e-39
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 905 157.2 1.5e-38
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 903 156.9 1.8e-38
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 902 156.7 2e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 902 156.7 2.1e-38
>>CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1540 init1: 1540 opt: 1540 Z-score: 1354.8 bits: 258.8 E(32554): 3.8e-69
Smith-Waterman score: 1540; 80.8% identity (94.1% similar) in 287 aa overlap (14-300:1-287)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVFLSSVETDQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQLRLFLLFLGIYVVTVVGNLSMIT
::. :.::::::::::::::::::: :::::::::::::::::.: :
CCDS73 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLIF
:: ::::::::::::::.:::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS73 LIWLSSHLHTPMYYFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 AIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWLTVGVYILGILGSTIHTGFMLRLF
:::::::::. :::::.::::::::.::.: . :: : .::::.:.. ...::: :.:.
CCDS73 AIAECHMLAAMAYDRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LCKTNVINHYFCDLFPLLGLSCSSTYINELLVLVLSAFNILTPALTILASYIFIIASILR
.:: ..::::::::.::: ::::: :.:.::.: ..:::::.:.:::: ::::::::::.
CCDS73 FCKFDLINHYFCDLLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILH
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 IRSTEGRSKAFSTCSSHILAVAVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQGKVSSVFYTIVVPMLNP
:::::::::::::::::.:::..::::::::::::::.:::::::::::::::.::::::
CCDS73 IRSTEGRSKAFSTCSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNP
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 QSIA
CCDS73 LIYSLRNKDVHVSLKKMLQRRTLL
290 300 310
>>CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 (346 aa)
initn: 1485 init1: 1485 opt: 1515 Z-score: 1332.7 bits: 254.9 E(32554): 6.5e-68
Smith-Waterman score: 1515; 78.0% identity (91.3% similar) in 300 aa overlap (1-300:24-322)
10 20 30
pF1KE9 MVFLSSVETDQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQ
: ::: .:: :: :.: ::: ::.:::.::.:. :::
CCDS66 MIIYKQGITFLQKENNNTIHLNTMFFLSPAETHQR-MAAENHSFVTKFILVGLTEKSELQ
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 LRLFLLFLGIYVVTVVGNLSMITLIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVN
: :::.:::::::::.:::.:::::::::::::::: :::.:::::.::::.::::::::
CCDS66 LPLFLVFLGIYVVTVLGNLGMITLIGLSSHLHTPMYCFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 FVTEKNIISYPECMTQLYFFLIFAIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWL
:::::::::::::::::::::.::::::::::. ::: ::::::::::..:.: . :: :
CCDS66 FVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAYDGYVAICSPLLYSIIISNKACFSL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 TVGVYILGILGSTIHTGFMLRLFLCKTNVINHYFCDLFPLLGLSCSSTYINELLVLVLSA
. ::..:.. .. : : :.:. .:: .:::::::::. .: ::::::::::::.:..:.
CCDS66 ILVVYVIGLICASAHIGCMFRVQFCKFDVINHYFCDLISILKLSCSSTYINELLILIFSG
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 FNILTPALTILASYIFIIASILRIRSTEGRSKAFSTCSSHILAVAVFFGSAAFMYLQPSS
.:::.:.::::.::::::::::::: ::::::::::::::: ::.:::::::::::::::
CCDS66 INILVPSLTILSSYIFIIASILRIRYTEGRSKAFSTCSSHISAVSVFFGSAAFMYLQPSS
240 250 260 270 280 290
280 290 300
pF1KE9 VSSMDQGKVSSVFYTIVVPMLNPQSIA
:::::::::::::::::::::::
CCDS66 VSSMDQGKVSSVFYTIVVPMLNPLIYSLRNKDVHVALKKTLGKRTFL
300 310 320 330 340
>>CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 (326 aa)
initn: 1312 init1: 830 opt: 1324 Z-score: 1167.8 bits: 224.3 E(32554): 9.9e-59
Smith-Waterman score: 1324; 65.1% identity (87.8% similar) in 304 aa overlap (1-300:1-303)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MVFLSSVET----DQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQLRLFLLFLGIYVVTVVGNL
: ::: .. ::.:.:::::.:::::: ::... .::: :::::::::.::.::::
CCDS31 MGFLSPMHPCRPPTQRRMAAGNHSTVTEFILKGLTKRADLQLPLFLLFLGIYLVTIVGNL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 SMITLIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYF
.::::: :.:.::::::::::.::..:.:.:..::::::::::.::::::: ::.::::
CCDS31 GMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPKMLVNFVSEKNIISYAGCMSQLYF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 FLIFAIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWLTVGVYILGILGSTIHTGFM
::.:.::::.::.: ::::::::: :::::.:::.: :. :.. :: .:..::::.::.:
CCDS31 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 LRLFLCKTNVINHYFCDLFPLLGLSCSSTYINELLVLVLSAFNILTPALTILASYIFIIA
:.: :. ..:.:::::..::. ::::::: :. :. ..:::.. .::.:.:: ::..
CCDS31 LKLPYCE-HLISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 SILRIRSTEGRSKAFSTCSSHILAVAVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQGKVSSVFYTIVVP
::: : .::::::::::::::. ::..:.::.:::::.::..::. : .:.::::: :.:
CCDS31 SILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIP
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE9 MLNPQSIA
::::
CCDS31 MLNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
300 310 320
>>CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1232 init1: 1168 opt: 1293 Z-score: 1141.2 bits: 219.3 E(32554): 3e-57
Smith-Waterman score: 1293; 65.9% identity (90.2% similar) in 287 aa overlap (14-300:1-286)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVFLSSVETDQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQLRLFLLFLGIYVVTVVGNLSMIT
: : :.: :::::::::...::.: ::.::: .:.::.::::..:
CCDS31 MLARNNSLVTEFILAGLTDHPEFQQPLFFLFLVVYIVTMVGNLGLII
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLIF
:.::.::::::::::: .:::::.:.:...:::::.:::..:::::: :::::.:::.:
CCDS31 LFGLNSHLHTPMYYFLFNLSFIDLCYSSVFTPKMLMNFVSKKNIISYVGCMTQLFFFLFF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 AIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWLTVGVYILGILGSTIHTGFMLRLF
.:.::.::. :::::::::.::::.: ::.. : :: ..::.:. :.: ::: ::::
CCDS31 VISECYMLTSMAYDRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGLAGATAHTGCMLRLT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LCKTNVINHYFCDLFPLLGLSCSSTYINELLVLVLSAFNILTPALTILASYIFIIASILR
.:..:.::::.::..::: :::.:::.::..::.. ..::..:. ::: ::.::..:::.
CCDS31 FCSANIINHYLCDILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGINIMVPSCTILISYVFIVTSILH
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 IRSTEGRSKAFSTCSSHILAVAVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQGKVSSVFYTIVVPMLNP
:.::.::::::::::::..:...:::::::::.. :: .::.:::::::::: :::::::
CCDS31 IKSTQGRSKAFSTCSSHVIALSLFFGSAAFMYIKYSS-GSMEQGKVSSVFYTNVVPMLNP
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 QSIA
CCDS31 LIYSLRNKDVKVALRKALIKIQRRNIF
290 300 310
>>CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1204 init1: 1147 opt: 1272 Z-score: 1123.1 bits: 215.9 E(32554): 3.1e-56
Smith-Waterman score: 1272; 65.5% identity (89.5% similar) in 287 aa overlap (14-300:1-286)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVFLSSVETDQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQLRLFLLFLGIYVVTVVGNLSMIT
: : :.: :::::::::...::.. ::.::: ::.::.::::..::
CCDS31 MLARNNSLVTEFILAGLTDHPEFRQPLFFLFLVIYIVTMVGNLGLIT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLIF
:.::.::::::::::: .:::::.:.:...:::::.:::..::::: :::.:.:::.:
CCDS31 LFGLNSHLHTPMYYFLFNLSFIDLCYSSVFTPKMLMNFVSKKNIISNVGCMTRLFFFLFF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 AIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWLTVGVYILGILGSTIHTGFMLRLF
.:.::.::. :::::::::.::::.: ::.. : :: ..::.:. :.: ::: ::::
CCDS31 VISECYMLTSMAYDRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGLAGATAHTGCMLRLT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LCKTNVINHYFCDLFPLLGLSCSSTYINELLVLVLSAFNILTPALTILASYIFIIASILR
.:..:.::::.::..::: :::.:::.::..::.. . :: .:. ::: ::.::..:::.
CCDS31 FCSANIINHYLCDILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGTNITVPSCTILISYVFIVTSILH
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 IRSTEGRSKAFSTCSSHILAVAVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQGKVSSVFYTIVVPMLNP
:.::.::::::::::::..:...:::::::::.. :: .::.:::::::::: :::::::
CCDS31 IKSTQGRSKAFSTCSSHVIALSLFFGSAAFMYIKYSS-GSMEQGKVSSVFYTNVVPMLNP
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 QSIA
CCDS31 LIYSLRNKDVKVALRKALIKIQRRNIF
290 300 310
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 1230 init1: 1230 opt: 1230 Z-score: 1086.9 bits: 209.2 E(32554): 3.2e-54
Smith-Waterman score: 1230; 61.7% identity (88.5% similar) in 287 aa overlap (14-300:1-287)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVFLSSVETDQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQLRLFLLFLGIYVVTVVGNLSMIT
:. :.: ...:.: ::..: :::: :::::::::::::::::.::
CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 VVAEGYLLTAMAYDRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLS
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CCDS31 FCKSHIINHYFCDVLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILH
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CCDS31 IRSSEGRSKAFGTCSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNP
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pF1KE9 QSIA
CCDS84 LIYSLRNKDVKVALKKILNKNAFS
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CCDS31 LIGLNSHLHTPMYFFLFNLSLIDFCFSTTITPKMLMSFVSRKNIISFTGCMTQLFFFCFF
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CCDS31 VVSESFILSAMAYDRYVAICNPLLYTVTMSCQVCLLLLLGAYGMGFAGAMAHTGSIMNLT
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CCDS31 FCADNLVNHFMCDILPLLELSCNSSYMNELVVFIVVAVDVGMPIVTVFISYALILSSILH
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CCDS31 NSSTEGRSKAFSTCSSHIIVVSLFFGSGAFMYLKPLSILPLEQGKVSSLFYTIIVPVLNP
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CCDS31 LIYSLRNKDVKVALRRTLGRKIFS
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CCDS31 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMIS
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CCDS31 IIRLNRQLHTPMYYFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVC
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CCDS31 VISECYMLAAMACDRYVAICSPLLYRVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLS
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CCDS31 FCGSNIIKHYFCDIVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILR
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CCDS31 LIYSLRNNEVRNALMKLLRRKISLSPG
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CCDS31 MTLRNSSSVTEFILVGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVFTVVGNLGLIT
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CCDS31 LIGINPSLHTPMYFFLFNLSFIDLCYSCVFTPKMLNDFVSE-SIISYVGCMTQLFFFCFF
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CCDS31 VNSECYVLVSMAYDRYVAICNPLLYMVTMSPRVCFLLMFGSYVVGFAGAMAHTGSMLRLT
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CCDS31 FCDSNVIDHYLCDVLPLLQLSCTSTHVSELVFFIVVGVITMLSSISIVISYALILSNILC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]