Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9282
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9282, 1249 aa
1>>>pF1KE9282 1249 - 1249 aa - 1249 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4532+/-0.00107; mu= 16.7367+/- 0.064
mean_var=79.6858+/-16.110, 0's: 0 Z-trim(103.6): 30 B-trim: 144 in 1/49
Lambda= 0.143676
statistics sampled from 7465 (7480) to 7465 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 3.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11631.1 BRIP1 gene_id:83990|Hs108|chr17 (1249) 8292 1729.3 0
CCDS13531.1 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20 (1219) 940 205.4 7.5e-52
CCDS63331.1 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20 (1300) 940 205.4 8e-52
CCDS13530.3 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20 (1243) 853 187.3 2e-46
CCDS74751.1 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20 ( 996) 838 184.2 1.4e-45
CCDS33049.1 ERCC2 gene_id:2068|Hs108|chr19 ( 760) 589 132.6 3.9e-30
CCDS8721.1 DDX11 gene_id:1663|Hs108|chr12 ( 856) 378 88.8 6.3e-17
CCDS41767.1 DDX11 gene_id:1663|Hs108|chr12 ( 906) 378 88.8 6.7e-17
CCDS44856.1 DDX11 gene_id:1663|Hs108|chr12 ( 970) 378 88.8 7.1e-17
CCDS58224.1 DDX11 gene_id:1663|Hs108|chr12 ( 880) 339 80.8 1.8e-14
>>CCDS11631.1 BRIP1 gene_id:83990|Hs108|chr17 (1249 aa)
initn: 8292 init1: 8292 opt: 8292 Z-score: 9280.2 bits: 1729.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8292; 99.9% identity (99.9% similar) in 1249 aa overlap (1-1249:1-1249)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MSSMWSEYTIGGVKIYFPYKAYPSQLAMMNSILRGLNSKQHCLLESPTGSGKSLALLCSA
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CCDS11 MSSMWSEYTIGGVKIYFPYKAYPSQLAMMNSILRGLNSKQHCLLESPTGSGKSLALLCSA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LAWQQSLSGKPADEGVSEKAEVQLSCCCACHSKDFTNNDMNQGTSRHFNYPSTPPSERNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LAWQQSLSGKPADEGVSEKAEVQLSCCCACHSKDFTNNDMNQGTSRHFNYPSTPPSERNG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 TSSTCQDSPEKTTLAAKLSAKKQASIYRDENDDFQVEKKRIRPLETTQQIRKRHCFGTEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TSSTCQDSPEKTTLAAKLSAKKQASIYRDENDDFQVEKKRIRPLETTQQIRKRHCFGTEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 HNLDAKVDSGKTVKLNSPLEKINSFSPQKPPGHCSRCCCSTKQGNSQESSNTIKKDHTGK
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CCDS11 HNLDAKVDSGKTVKLNSPLEKINSFSPQKPPGHCSRCCCSTKQGNSQESSNTIKKDHTGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 SKIPKIYFGTRTHKQIAQITRELRRTAYSGVPMTILSSRDHTCVHPEVVGNFNRNEKCME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SKIPKIYFGTRTHKQIAQITRELRRTAYSGVPMTILSSRDHTCVHPEVVGNFNRNEKCME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 LLDGKNGKSCYFYHGVHKISDQHTLQTFQGMCKAWDIEELVSLGKKLKACPYYTARELIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLDGKNGKSCYFYHGVHKISDQHTLQTFQGMCKAWDIEELVSLGKKLKACPYYTARELIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 DADIIFCPYNYLLDAQIRESMDLNLKEQVVILDEAHNIEDCARESASYSVTEVQLRFARD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DADIIFCPYNYLLDAQIRESMDLNLKEQVVILDEAHNIEDCARESASYSVTEVQLRFARD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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CCDS11 ELDSMVNNNIRKKDHEPLRAVCCSLINWLEANAEYLVERDYESACKIWSGNEMLLTLHKM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 GITTATFPILQGHFSAVLQKEEKISPIYGKEEAREVPVISASTQIMLKGLFMVLDYLFRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GITTATFPILQGHFSAVLQKEEKISPIYGKEEAREVPVISASTQIMLKGLFMVLDYLFRQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 NSRFADDYKIAIQQTYSWTNQIDISDKNGLLVLPKNKKRSRQKTAVHVLNFWCLNPAVAF
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CCDS11 NSRFADDYKIAIQQTYSWTNQIDISDKNGLLVLPKNKKRSRQKTAVHVLNFWCLNPAVAF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 SDINGKVQTIVLTSGTLSPMKSFSSELGVTFTIQLEANHIIKNSQVWVGTIGSGPKGRNL
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CCDS11 SDINGKVQTIVLTSGTLSPMKSFSSELGVTFTIQLEANHIIKNSQVWVGTIGSGPKGRNL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 CATFQNTETFEFQDEVGALLLSVCQTVSQGILCFLPSYKLLEKLKERWLSTGLWHNLELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CATFQNTETFEFQDEVGALLLSVCQTVSQGILCFLPSYKLLEKLKERWLSTGLWHNLELV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 KTVIVEPQGGEKTNFDELLQVYYDAIKYKGEKDGALLVAVCRGKVSEGLDFSDDNARAVI
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CCDS11 KTVIVEPQGGEKTNFDELLQVYYDAIKYKGEKDGALLVAVCRGKVSEGLDFSDDNARAVI
730 740 750 760 770 780
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pF1KE9 TIGIPFPNVKDLQVELKRQYNDHHSKLRGLLPGRQWYEIQAYRALNQALGRCIRHRNDWG
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CCDS11 TIGIPFPNVKDLQVELKRQYNDHHSKLRGLLPGRQWYEIQAYRALNQALGRCIRHRNDWG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 ALILVDDRFRNNPSRYISGLSKWVRQQIQHHSTFESALESLAEFSKKHQKVLNVSIKDRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALILVDDRFRNNPSRYISGLSKWVRQQIQHHSTFESALESLAEFSKKHQKVLNVSIKDRT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 NIQDNESTLEVTSLKYSTPPYLLEAASHLSPENFVEDEAKICVQELQCPKIITKNSPLPS
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CCDS11 NIQDNESTLEVTSLKYSTSPYLLEAASHLSPENFVEDEAKICVQELQCPKIITKNSPLPS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 SIISRKEKNDPVFLEEAGKAEKIVISRSTSPTFNKQTKRVSWSSFNSLGQYFTGKIPKAT
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CCDS11 SIISRKEKNDPVFLEEAGKAEKIVISRSTSPTFNKQTKRVSWSSFNSLGQYFTGKIPKAT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 PELGSSENSASSPPRFKTEKMESKTVLPFTDKCESSNLTVNTSFGSCPQSETIISSLKID
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CCDS11 PELGSSENSASSPPRFKTEKMESKTVLPFTDKCESSNLTVNTSFGSCPQSETIISSLKID
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 ATLTRKNHSEHPLCSEEALDPDIELSLVSEEDKQSTSNRDFETEAEDESIYFTPELYDPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ATLTRKNHSEHPLCSEEALDPDIELSLVSEEDKQSTSNRDFETEAEDESIYFTPELYDPE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 DTDEEKNDLAETDRGNRLANNSDCILAKDLFEIRTIKEVDSAREVKAEDCIDTKLNGILH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DTDEEKNDLAETDRGNRLANNSDCILAKDLFEIRTIKEVDSAREVKAEDCIDTKLNGILH
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240
pF1KE9 IEESKIDDIDGNVKTTWINELELGKTHEIEIKNFKPSPSKNKGMFPGFK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IEESKIDDIDGNVKTTWINELELGKTHEIEIKNFKPSPSKNKGMFPGFK
1210 1220 1230 1240
>>CCDS13531.1 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20 (1219 aa)
initn: 1248 init1: 301 opt: 940 Z-score: 1044.4 bits: 205.4 E(32554): 7.5e-52
Smith-Waterman score: 1156; 31.7% identity (61.7% similar) in 763 aa overlap (241-957:104-831)
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 PGHCSRCCCSTKQGNSQESSNTIKKDHTGKSKIPKIYFGTRTHKQIAQITRELRRTAYSG
. :::: ...:::.:..:. ::: :.:
CCDS13 ERAQGELFPDRALSSWGNAAAAAGDPIACYTDIPKIIYASRTHSQLTQVINELRNTSYRP
80 90 100 110 120 130
280 290 300 310 320
pF1KE9 VPMTILSSRDHTCVHPEVVGNFNRNEKCMELLDGK-NGKSCYFYHGVHKISDQHTLQTFQ
. .:.::.. :.:::: . . :. ..: : ..::.::..:.. : .. : .
CCDS13 -KVCVLGSREQLCIHPEVKKQ-ESNHLQIHLCRKKVASRSCHFYNNVEEKSLEQELAS--
140 150 160 170 180
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 GMCKAWDIEELVSLGKKLKACPYYTARELIQDADIIFCPYNYLLDAQIRESMDLNLKEQV
:::.::. :.: ..:::: .:.: :.::::: ::::::::. :.. ...:: :
CCDS13 ---PILDIEDLVKSGSKHRVCPYYLSRNLKQQADIIFMPYNYLLDAKSRRAHNIDLKGTV
190 200 210 220 230 240
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 VILDEAHNIEDCARESASYSVTEVQLRFARDELDSMVNNNIRKKDH-EPLRAVCCSLINW
::.:::::.: .::::...: .: . : .:...... . .. :: .
CCDS13 VIFDEAHNVEKMCEESASFDLTPHDLASGLDVIDQVLEEQTKAAQQGEPHPEFSAD----
250 260 270 280 290 300
450 460 470 480 490 500
pF1KE9 LEANAEYLVERDYESACKIWSGNEMLLTLHKMGITTATFPILQGHFSAVLQKEEKISPIY
. .. . :. :. .:.: . .: .. .: : :.: . : ..
CCDS13 ---SPSPGLNMELEDIAKL----KMILLRLEGAIDAVELP---GDDSGVTKPGSYIFELF
310 320 330 340 350
510 520 530 540 550 560
pF1KE9 GKEEAREVPVISASTQIMLKGLFMVLDYLFRQNSRFADD---YKIA--IQQTYSWT-NQI
. :. . . .: .: .....: . . :.. :.: :: ..: ..
CCDS13 A-----EAQITFQTKGCILDSLDQIIQHLAGRAGVFTNTAGLQKLADIIQIVFSVDPSEG
360 370 380 390 400
570 580 590 600
pF1KE9 DISDKNGLLVLPKNK---------KRSRQKTAV----------HVLNFWCLNPAVAFSD-
. .. :: .: . : .:. :.. . .::..::..:. .. .
CCDS13 SPGSPAGLGALQSYKVHIHPDAGHRRTAQRSDAWSTTAARKRGKVLSYWCFSPGHSMHEL
410 420 430 440 450 460
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 INGKVQTIVLTSGTLSPMKSFSSELGVTFTIQLEANHIIKNSQVWVGTIGSGPKGRNLCA
. :....::::::.:..::. :. . : . :: ::: . :.:::.. :: : .: .
CCDS13 VRQGVRSLILTSGTLAPVSSFALEMQIPFPVCLENPHIIDKHQIWVGVVPRGPDGAQLSS
470 480 490 500 510 520
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 TFQNTETFEFQDEVGALLLSVCQTVSQGILCFLPSYKLLEKLKERWLSTGLWHNLELVKT
.:. . : . .: : .. ..: :.: :.::: ..:: : : . : ...: .:
CCDS13 AFDRRFSEECLSSLGKALGNIARVVPYGLLIFFPSYPVMEKSLEFWRARDLARKMEALKP
530 540 550 560 570 580
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 VIVEPQGGEKTNFDELLQVYYDAIKYKGEKDGALLVAVCRGKVSEGLDFSDDNARAVITI
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CCDS13 LFVEPRS--KGSFSETISAYYARVAAPG-STGATFLAVCRGKASEGLDFSDTNGRGVIVT
590 600 610 620 630 640
790 800 810 820 830
pF1KE9 GIPFPNVKDLQVELKRQYNDHHSKLRG----LLPGRQWYEIQAYRALNQALGRCIRHRND
:.:.: : .: :: :. :. . : .: :..::. :: ::.:::.:: ::::.:
CCDS13 GLPYPPRMDPRVVLKMQFLDEMKGQGGAGGQFLSGQEWYRQQASRAVNQAIGRVIRHRQD
650 660 670 680 690 700
840 850 860 870 880 890
pF1KE9 WGALILVDDRFRNNPSRYISGLSKWVRQQIQHHSTFESALESLAEFSKKHQKVLNV----
.::..: : :: .: . : .::: ... ...: .....:.: . .... .
CCDS13 YGAVFLCDHRFAFADAR--AQLPSWVRPHVRVYDNFGHVIRDVAQFFRVAERTMPAPAPR
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900 910 920 930 940
pF1KE9 ----SIKDRTNIQDNES------TLEVTSLKYSTPPYLLEAASHLSPENFVEDEAKICVQ
:.. . ... .: : .. :: .: :. : :: . :...::.
CCDS13 ATAPSVRGEDAVSEAKSPGPFFSTRKAKSLDLHVPS--LKQRSSGSPAAG-DPESSLCVE
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950 960 970 980 990 1000
pF1KE9 ELQCPKIITKNSPLPSSIISRKEKNDPVFLEEAGKAEKIVISRSTSPTFNKQTKRVSWSS
: : . ... :
CCDS13 YEQEP-VPARQRPRGLLAALEHSEQRAGSPGEEQAHSCSTLSLLSEKRPAEEPRGGRKKI
820 830 840 850 860 870
>>CCDS63331.1 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20 (1300 aa)
initn: 1248 init1: 301 opt: 940 Z-score: 1043.9 bits: 205.4 E(32554): 8e-52
Smith-Waterman score: 1156; 31.7% identity (61.7% similar) in 763 aa overlap (241-957:104-831)
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 PGHCSRCCCSTKQGNSQESSNTIKKDHTGKSKIPKIYFGTRTHKQIAQITRELRRTAYSG
. :::: ...:::.:..:. ::: :.:
CCDS63 ERAQGELFPDRALSSWGNAAAAAGDPIACYTDIPKIIYASRTHSQLTQVINELRNTSYRP
80 90 100 110 120 130
280 290 300 310 320
pF1KE9 VPMTILSSRDHTCVHPEVVGNFNRNEKCMELLDGK-NGKSCYFYHGVHKISDQHTLQTFQ
. .:.::.. :.:::: . . :. ..: : ..::.::..:.. : .. : .
CCDS63 -KVCVLGSREQLCIHPEVKKQ-ESNHLQIHLCRKKVASRSCHFYNNVEEKSLEQELAS--
140 150 160 170 180
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 GMCKAWDIEELVSLGKKLKACPYYTARELIQDADIIFCPYNYLLDAQIRESMDLNLKEQV
:::.::. :.: ..:::: .:.: :.::::: ::::::::. :.. ...:: :
CCDS63 ---PILDIEDLVKSGSKHRVCPYYLSRNLKQQADIIFMPYNYLLDAKSRRAHNIDLKGTV
190 200 210 220 230 240
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 VILDEAHNIEDCARESASYSVTEVQLRFARDELDSMVNNNIRKKDH-EPLRAVCCSLINW
::.:::::.: .::::...: .: . : .:...... . .. :: .
CCDS63 VIFDEAHNVEKMCEESASFDLTPHDLASGLDVIDQVLEEQTKAAQQGEPHPEFSAD----
250 260 270 280 290 300
450 460 470 480 490 500
pF1KE9 LEANAEYLVERDYESACKIWSGNEMLLTLHKMGITTATFPILQGHFSAVLQKEEKISPIY
. .. . :. :. .:.: . .: .. .: : :.: . : ..
CCDS63 ---SPSPGLNMELEDIAKL----KMILLRLEGAIDAVELP---GDDSGVTKPGSYIFELF
310 320 330 340 350
510 520 530 540 550 560
pF1KE9 GKEEAREVPVISASTQIMLKGLFMVLDYLFRQNSRFADD---YKIA--IQQTYSWT-NQI
. :. . . .: .: .....: . . :.. :.: :: ..: ..
CCDS63 A-----EAQITFQTKGCILDSLDQIIQHLAGRAGVFTNTAGLQKLADIIQIVFSVDPSEG
360 370 380 390 400
570 580 590 600
pF1KE9 DISDKNGLLVLPKNK---------KRSRQKTAV----------HVLNFWCLNPAVAFSD-
. .. :: .: . : .:. :.. . .::..::..:. .. .
CCDS63 SPGSPAGLGALQSYKVHIHPDAGHRRTAQRSDAWSTTAARKRGKVLSYWCFSPGHSMHEL
410 420 430 440 450 460
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 INGKVQTIVLTSGTLSPMKSFSSELGVTFTIQLEANHIIKNSQVWVGTIGSGPKGRNLCA
. :....::::::.:..::. :. . : . :: ::: . :.:::.. :: : .: .
CCDS63 VRQGVRSLILTSGTLAPVSSFALEMQIPFPVCLENPHIIDKHQIWVGVVPRGPDGAQLSS
470 480 490 500 510 520
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pF1KE9 TFQNTETFEFQDEVGALLLSVCQTVSQGILCFLPSYKLLEKLKERWLSTGLWHNLELVKT
.:. . : . .: : .. ..: :.: :.::: ..:: : : . : ...: .:
CCDS63 AFDRRFSEECLSSLGKALGNIARVVPYGLLIFFPSYPVMEKSLEFWRARDLARKMEALKP
530 540 550 560 570 580
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pF1KE9 VIVEPQGGEKTNFDELLQVYYDAIKYKGEKDGALLVAVCRGKVSEGLDFSDDNARAVITI
..:::.. : .:.: ...:: . : . :: ..::::::.:::::::: :.:.::.
CCDS63 LFVEPRS--KGSFSETISAYYARVAAPG-STGATFLAVCRGKASEGLDFSDTNGRGVIVT
590 600 610 620 630 640
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pF1KE9 GIPFPNVKDLQVELKRQYNDHHSKLRG----LLPGRQWYEIQAYRALNQALGRCIRHRND
:.:.: : .: :: :. :. . : .: :..::. :: ::.:::.:: ::::.:
CCDS63 GLPYPPRMDPRVVLKMQFLDEMKGQGGAGGQFLSGQEWYRQQASRAVNQAIGRVIRHRQD
650 660 670 680 690 700
840 850 860 870 880 890
pF1KE9 WGALILVDDRFRNNPSRYISGLSKWVRQQIQHHSTFESALESLAEFSKKHQKVLNV----
.::..: : :: .: . : .::: ... ...: .....:.: . .... .
CCDS63 YGAVFLCDHRFAFADAR--AQLPSWVRPHVRVYDNFGHVIRDVAQFFRVAERTMPAPAPR
710 720 730 740 750 760
900 910 920 930 940
pF1KE9 ----SIKDRTNIQDNES------TLEVTSLKYSTPPYLLEAASHLSPENFVEDEAKICVQ
:.. . ... .: : .. :: .: :. : :: . :...::.
CCDS63 ATAPSVRGEDAVSEAKSPGPFFSTRKAKSLDLHVPS--LKQRSSGSPAAG-DPESSLCVE
770 780 790 800 810
950 960 970 980 990 1000
pF1KE9 ELQCPKIITKNSPLPSSIISRKEKNDPVFLEEAGKAEKIVISRSTSPTFNKQTKRVSWSS
: : . ... :
CCDS63 YEQEP-VPARQRPRGLLAALEHSEQRAGSPGEEQAHSCSTLSLLSEKRPAEEPRGGRKKI
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220 230 240 250 260 270
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. :::: ...:::.:..:. ::: :.: .
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..::.::..:.. : .. : . :::.::. :.: ..:::: .:.: :.:::::
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::::::::. :.. ...:: :::.:::::.: .::::...: .: . : .:...
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... . .. :: . . .. . :. :. .:.: . .: ..
CCDS13 EEQTKAAQQGEPHPEFSAD-------SPSPGLNMELEDIAKL----KMILLRLEGAIDAV
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.: : :.: . : ... :. . . .: .: .....: . . :.
CCDS13 ELP---GDDSGVTKPGSYIFELFA-----EAQITFQTKGCILDSLDQIIQHLAGRAGVFT
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. :.: :: ..: .. . .. :: .: . : .:. :.. .
CCDS13 NTAGLQKLADIIQIVFSVDPSEGSPGSPAGLGALQSYKVHIHPDAGHRRTAQRSDAWSTT
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pF1KE9 ------HVLNFWCLNPAVAFSD-INGKVQTIVLTSGTLSPMKSFSSELGVTFTIQLEANH
.::..::..:. .. . . :....::::::.:..::. :. . : . :: :
CCDS13 AARKRGKVLSYWCFSPGHSMHELVRQGVRSLILTSGTLAPVSSFALEMQIPFPVCLENPH
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:: . :.:::.. :: : .: ..:. . : . .: : .. ..: :.: :.:::
CCDS13 IIDKHQIWVGVVPRGPDGAQLSSAFDRRFSEECLSSLGKALGNIARVVPYGLLIFFPSYP
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pF1KE9 LLEKLKERWLSTGLWHNLELVKTVIVEPQGGEKTNFDELLQVYYDAIKYKGEKDGALLVA
..:: : : . : ...: .: ..:::.. : .:.: ...:: . : . :: ..:
CCDS13 VMEKSLEFWRARDLARKMEALKPLFVEPRS--KGSFSETISAYYARVAAPG-STGATFLA
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pF1KE9 VCRGKVSEGLDFSDDNARAVITIGIPFPNVKDLQVELKRQYNDHHSKLRG----LLPGRQ
:::::.:::::::: :.:.::. :.:.: : .: :: :. :. . : .: :..
CCDS13 VCRGKASEGLDFSDTNGRGVIVTGLPYPPRMDPRVVLKMQFLDEMKGQGGAGGQFLSGQE
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pF1KE9 WYEIQAYRALNQALGRCIRHRNDWGALILVDDRFRNNPSRYISGLSKWVRQQIQHHSTFE
::. :: ::.:::.:: ::::.:.::..: : :: .: . : .::: ... ...:
CCDS13 WYRQQASRAVNQAIGRVIRHRQDYGAVFLCDHRFAFADAR--AQLPSWVRPHVRVYDNFG
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pF1KE9 SALESLAEFSKKHQKVLNV--------SIKDRTNIQDNES------TLEVTSLKYSTPPY
.....:.: . .... . :.. . ... .: : .. :: .:
CCDS13 HVIRDVAQFFRVAERTMPAPAPRATAPSVRGEDAVSEAKSPGPFFSTRKAKSLDLHVPS-
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pF1KE9 LLEAASHLSPENFVEDEAKICVQELQCPKIITKNSPLPSSIISRKEKNDPVFLEEAGKAE
:. : :: . :...::. : : . ... :
CCDS13 -LKQRSSGSPAAG-DPESSLCVEYEQEP-VPARQRPRGLLAALEHSEQRAGSPGEEQAHS
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pF1KE9 KIVISRSTSPTFNKQTKRVSWSSFNSLGQYFTGKIPKATPELGSSENSASSPPRFKTEKM
CCDS13 CSTLSLLSEKRPAEEPRGGRKKIRLVSHPEEPVAGAQTDRAKLFMVAVKQELSQANFATF
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CCDS74 MPYNYLLDAKSRRAHNIDLKGTVVIFDEAHN
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CCDS74 VEKMCEESASFDLTPHDLASGLDVIDQVLEEQTKAAQQGEPHPEFSA------DSPSPGL
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. . :. :. .:.: . .: .. .: : :.: . : ... :.
CCDS74 -NMELEDIAKL----KMILLRLEGAIDAVELP---GDDSGVTKPGSYIFELFA-----EA
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. . .: .: .....: . . :.. :.: :: ..: .. . .. ::
CCDS74 QITFQTKGCILDSLDQIIQHLAGRAGVFTNTAGLQKLADIIQIVFSVDPSEGSPGSPAGL
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.: . : .:. :.. . .::..::..:. .. . . :...
CCDS74 GALQSYKVHIHPDAGHRRTAQRSDAWSTTAARKRGKVLSYWCFSPGHSMHELVRQGVRSL
200 210 220 230 240 250
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CCDS74 ILTSGTLAPVSSFALEMQIPFPVCLENPHIIDKHQIWVGVVPRGPDGAQLSSAFDRRFSE
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: . .: : .. ..: :.: :.::: ..:: : : . : ...: .: ..:::..
CCDS74 ECLSSLGKALGNIARVVPYGLLIFFPSYPVMEKSLEFWRARDLARKMEALKPLFVEPRS-
320 330 340 350 360 370
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: .:.: ...:: . : . :: ..::::::.:::::::: :.:.::. :.:.:
CCDS74 -KGSFSETISAYYARVAAPG-STGATFLAVCRGKASEGLDFSDTNGRGVIVTGLPYPPRM
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: .: :: :. :. . : .: :..::. :: ::.:::.:: ::::.:.::..: :
CCDS74 DPRVVLKMQFLDEMKGQGGAGGQFLSGQEWYRQQASRAVNQAIGRVIRHRQDYGAVFLCD
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:: .: . : .::: ... ...: .....:.: . .... . :..
CCDS74 HRFAFADAR--AQLPSWVRPHVRVYDNFGHVIRDVAQFFRVAERTMPAPAPRATAPSVRG
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. ... .: : .. :: .: :. : :: . :...::. : : .
CCDS74 EDAVSEAKSPGPFFSTRKAKSLDLHVPS--LKQRSSGSPAAG-DPESSLCVEYEQEP-VP
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... :
CCDS74 ARQRPRGLLAALEHSEQRAGSPGEEQAHSCSTLSLLSEKRPAEEPRGGRKKIRLVSHPEE
610 620 630 640 650 660
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CCDS33 GHGVLEMPSGTGKTVSLLALIMAYQRAYPLEVTKLIYCSRTVPEIEKVIEELRKLLNFYE
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CCDS33 KQEGEKLPFLGLALSSRKNLCIHPEVTPLRFGKDVDGKCHSLTASYVRAQYQHDTSLPHC
100 110 120 130 140 150
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CCDS33 RFYEEFDAHGREVPLPA--GI---YNLDDLKALGRRQGWCPYFLARYSILHANVVVYSYH
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:::: .: . .. .: .. ::..::::::.. .: : ..:. : . .:... ..
CCDS33 YLLDPKIADLVSKELARKAVVVFDEAHNIDNVCIDSMSVNLTRRTLDRCQGNLETLQKTV
220 230 240 250 260 270
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.: : :.. :: :.. : ::.: : : . : . .:.: .: ::
CCDS33 LRIKETDEQRLRDEYRRLVEGLREASAAR--ETDAHLANPVLP-DEVLQEAVPGSIRTAE
280 290 300 310 320
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:: . :.. . : : . : :.. : .:.:: . . . :. ::
CCDS33 ------HFLGFLRRLLE----YVKWRLRVQHVVQESPPAFLSGLAQRV-CIQRKPLRFCA
330 340 350 360 370
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. .. .: :. :.: .:. .. . : .:.:
CCDS33 ERLRSLLHTLEITDLADFSPLTLLANFATLVSTYAKGFTIIIEPFDDRTPTIANPILHFS
380 390 400 410 420 430
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:.. ..:.. . . :....:::::::. . . : .:::. : .. ..
CCDS33 CMDASLAIKPVFERFQSVIITSGTLSPLDIYPKILDFHPVTMATFTMTLA--RVCLCPMI
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:: : . . :.. : . . : ::: . .: .::. :. ::. .:.
CCDS33 ----IGRGNDQVAISSKFETREDIAVIRNYGNLLLEMSAVVPDGIVAFFTSYQYMESTVA
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CCDS33 SWYEQGILENIQRNKLLFIETQDGAETSV--ALEKYQEACE-NGR--GAILLSVARGKVS
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::.:: .:::: .:.:. ... .. . .: . ..: .. ..:.:
CCDS33 EGIDFVHHYGRAVIMFGVPYVYTQSRILKARLEYLRDQFQIRE----NDFLTFDAMRHAA
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CCDS33 QCVGRAIRGKTDYGLMVFADKRFARGDKR--GKLPRWIQEHLTDANLNLTVDEGVQVAKY
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CCDS33 FLRQMAQPFHREDQLGLSLLSLEQLESEETLKRIEQIAQQL
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10 20 30 40 50 60
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CCDS87 MANETQKVGAIHFPFPFTPYSIQEDFMAELYRVLEAGKIGIFESPTGTGKSLSLICGA
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CCDS87 WVTQFVQKKEERDLVDRLKAEQARRKQREER--LQQLQHRVQLKYAAKRLRQEE---EER
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.:: .. : . .. . :... : :. .. . .. .. . .:.
CCDS87 ENL-LRL-SREMLETGPEAERLE----QLESGEEELVLAEYESDEEKKVASRVDEDEDDL
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CCDS87 EEEHITKIYYCSRTHSQLAQFVHEVKKSPFGKDVRLVSLGSRQNLCVNEDVKSLGSVQLI
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pF1KE9 NEKCMELLDGKNGK------------------SCYFYHGVHKISDQHTLQTFQGMCKAWD
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CCDS87 NDRCVDMQRSRHEKKKGAEEEKPKRRRQEKQAACPFYN--H---EQMGLLRDEALAEVKD
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CCDS87 MEQLLALGKEARACPYYGSRLAIPAAQLVVLPYQMLLHAATRQAAGIRLQDQVVIIDEAH
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:. : : :. :: :...: ..:. . .. :. :. . :.. . :
CCDS87 NLIDTITGMHSVEVSGSQLCQAHSQLLQYVERYGKRLKAKNLMYLKQIL-YLLEKFVAVL
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.... .. .:.: : :.. . . . : . . .: ..: :
CCDS87 GGNIKQNPNTQSLSQTGTE-LKTINDFLFQSQIDNINLFKVQRYCEKSMISRKLFGFTE-
460 470 480 490 500 510
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CCDS87 TTANQDGRVILSRQGSLS-QST----LKFLLLNPAVHFAQVVKECRAVVIAGGTMQPVSD
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CCDS87 FRQQLLACAGV--EAERVVEFS----------------CGHVIPP------DNI--LPLV
630 640 650 660
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CCDS87 ICSGISNQPLEFT--------FQKR----------ELPQMIFQEPKSAHQV--EQVLLAY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]