Result of FASTA (omim) for
pFN21AE9253
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9253, 3114 aa
1>>>pF1KE9253 3114 - 3114 aa - 3114 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.7612+/-0.000875; mu= -16.3355+/- 0.054
mean_var=711.7102+/-151.198, 0's: 0 Z-trim(115.0): 712 B-trim: 1338 in 1/52
Lambda= 0.048075
statistics sampled from 24381 (25121) to 24381 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 21.970
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_057427 (OMIM: 243605,600236,616369) centromere (3114) 19598 1378.0 0
XP_016855575 (OMIM: 243605,600236,616369) PREDICTE (3114) 19598 1378.0 0
XP_011507384 (OMIM: 243605,600236,616369) PREDICTE (3055) 16780 1182.5 0
NP_001243417 (OMIM: 602500) golgin subfamily B mem (3184) 969 85.9 1.2e-14
XP_016861683 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3189) 969 85.9 1.2e-14
XP_006713653 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3223) 969 85.9 1.2e-14
XP_005247430 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3228) 969 85.9 1.2e-14
XP_016861680 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3228) 969 85.9 1.2e-14
XP_006713654 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3189) 954 84.9 2.4e-14
NP_004478 (OMIM: 602500) golgin subfamily B member (3259) 948 84.5 3.2e-14
XP_016861678 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3264) 948 84.5 3.2e-14
XP_006713650 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3264) 948 84.5 3.2e-14
XP_006713651 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3264) 948 84.5 3.2e-14
XP_011511001 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3269) 948 84.5 3.2e-14
NP_001243415 (OMIM: 602500) golgin subfamily B mem (3269) 948 84.5 3.2e-14
XP_005247428 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3269) 948 84.5 3.2e-14
XP_016861679 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3263) 937 83.7 5.5e-14
XP_006713652 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3263) 937 83.7 5.5e-14
NP_001243416 (OMIM: 602500) golgin subfamily B mem (3225) 935 83.6 6e-14
XP_016861681 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3225) 935 83.6 6e-14
XP_005247429 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3230) 935 83.6 6e-14
XP_016861682 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3224) 929 83.2 8e-14
XP_016861684 (OMIM: 602500) PREDICTED: golgin subf (3016) 923 82.7 1e-13
XP_011529848 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2633) 697 67.0 4.8e-09
XP_016883108 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (1976) 599 60.1 4.4e-07
NP_001305148 (OMIM: 609689) centrosome-associated (1810) 595 59.7 5e-07
XP_016867138 (OMIM: 604001,611820) PREDICTED: A-ki (3931) 592 59.9 1e-06
NP_671714 (OMIM: 604001,611820) A-kinase anchor pr (3899) 585 59.4 1.4e-06
XP_016867135 (OMIM: 604001,611820) PREDICTED: A-ki (3939) 572 58.5 2.6e-06
XP_016867132 (OMIM: 604001,611820) PREDICTED: A-ki (3955) 572 58.5 2.6e-06
XP_016867143 (OMIM: 604001,611820) PREDICTED: A-ki (3876) 566 58.1 3.4e-06
XP_016861677 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2195) 549 56.6 5.2e-06
XP_005265132 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2214) 540 56.0 8.1e-06
XP_006713173 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2250) 538 55.9 9e-06
XP_005265129 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2269) 536 55.7 1e-05
XP_016861676 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2236) 533 55.5 1.1e-05
NP_002069 (OMIM: 602509) golgin subfamily A member (2230) 530 55.3 1.3e-05
NP_001166184 (OMIM: 602509) golgin subfamily A mem (2243) 530 55.3 1.3e-05
XP_005265131 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2245) 530 55.3 1.3e-05
XP_016861674 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2251) 530 55.3 1.3e-05
XP_016861675 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2251) 530 55.3 1.3e-05
XP_005265130 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2252) 530 55.3 1.3e-05
XP_016861673 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2276) 530 55.3 1.3e-05
XP_005265128 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2278) 530 55.3 1.3e-05
XP_005265127 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2283) 530 55.3 1.3e-05
XP_005265126 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2285) 530 55.3 1.3e-05
XP_016867137 (OMIM: 604001,611820) PREDICTED: A-ki (3936) 532 55.7 1.8e-05
XP_016867142 (OMIM: 604001,611820) PREDICTED: A-ki (3892) 527 55.3 2.3e-05
XP_016863148 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2551) 510 54.0 3.8e-05
XP_011529850 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2604) 510 54.0 3.8e-05
>>NP_057427 (OMIM: 243605,600236,616369) centromere prot (3114 aa)
initn: 19598 init1: 19598 opt: 19598 Z-score: 7367.3 bits: 1378.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 19598; 100.0% identity (100.0% similar) in 3114 aa overlap (1-3114:1-3114)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MSWALEEWKEGLPTRALQKIQELEGQLDKLKKEKQQRQFQLDSLEAALQKQKQKVENEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MSWALEEWKEGLPTRALQKIQELEGQLDKLKKEKQQRQFQLDSLEAALQKQKQKVENEKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 EGTNLKRENQRLMEICESLEKTKQKISHELQVKESQVNFQEGQLNSGKKQIEKLEQELKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 EGTNLKRENQRLMEICESLEKTKQKISHELQVKESQVNFQEGQLNSGKKQIEKLEQELKR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CKSELERSQQAAQSADVSLNPCNTPQKIFTTPLTPSQYYSGSKYEDLKEKYNKEVEERKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 CKSELERSQQAAQSADVSLNPCNTPQKIFTTPLTPSQYYSGSKYEDLKEKYNKEVEERKR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LEAEVKALQAKKASQTLPQATMNHRDIARHQASSSVFSWQQEKTPSHLSSNSQRTPIRRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LEAEVKALQAKKASQTLPQATMNHRDIARHQASSSVFSWQQEKTPSHLSSNSQRTPIRRD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 FSASYFSGEQEVTPSRSTLQIGKRDANSSFFDNSSSPHLLDQLKAQNQELRNKINELELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 FSASYFSGEQEVTPSRSTLQIGKRDANSSFFDNSSSPHLLDQLKAQNQELRNKINELELR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 LQGHEKEMKGQVNKFQELQLQLEKAKVELIEKEKVLNKCRDELVRTTAQYDQASTKYTAL
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NP_057 LQGHEKEMKGQVNKFQELQLQLEKAKVELIEKEKVLNKCRDELVRTTAQYDQASTKYTAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 EQKLKKLTEDLSCQRQNAESARCSLEQKIKEKEKEFQEELSRQQRSFQTLDQECIQMKAR
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NP_057 EQKLKKLTEDLSCQRQNAESARCSLEQKIKEKEKEFQEELSRQQRSFQTLDQECIQMKAR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 LTQELQQAKNMHNVLQAELDKLTSVKQQLENNLEEFKQKLCRAEQAFQASQIKENELRRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LTQELQQAKNMHNVLQAELDKLTSVKQQLENNLEEFKQKLCRAEQAFQASQIKENELRRS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 MEEMKKENNLLKSHSEQKAREVCHLEAELKNIKQCLNQSQNFAEEMKAKNTSQETMLRDL
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NP_057 MEEMKKENNLLKSHSEQKAREVCHLEAELKNIKQCLNQSQNFAEEMKAKNTSQETMLRDL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 QEKINQQENSLTLEKLKLAVADLEKQRDCSQDLLKKREHHIEQLNDKLSKTEKESKALLS
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NP_057 QEKINQQENSLTLEKLKLAVADLEKQRDCSQDLLKKREHHIEQLNDKLSKTEKESKALLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 ALELKKKEYEELKEEKTLFSCWKSENEKLLTQMESEKENLQSKINHLETCLKTQQIKSHE
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NP_057 ALELKKKEYEELKEEKTLFSCWKSENEKLLTQMESEKENLQSKINHLETCLKTQQIKSHE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 YNERVRTLEMDRENLSVEIRNLHNVLDSKSVEVETQKLAYMELQQKAEFSDQKHQKEIEN
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NP_057 YNERVRTLEMDRENLSVEIRNLHNVLDSKSVEVETQKLAYMELQQKAEFSDQKHQKEIEN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 MCLKTSQLTGQVEDLEHKLQLLSNEIMDKDRCYQDLHAEYESLRDLLKSKDASLVTNEDH
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NP_057 MCLKTSQLTGQVEDLEHKLQLLSNEIMDKDRCYQDLHAEYESLRDLLKSKDASLVTNEDH
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 QRSLLAFDQQPAMHHSFANIIGEQGSMPSERSECRLEADQSPKNSAILQNRVDSLEFSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 QRSLLAFDQQPAMHHSFANIIGEQGSMPSERSECRLEADQSPKNSAILQNRVDSLEFSLE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 SQKQMNSDLQKQCEELVQIKGEIEENLMKAEQMHQSFVAETSQRISKLQEDTSAHQNVVA
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NP_057 SQKQMNSDLQKQCEELVQIKGEIEENLMKAEQMHQSFVAETSQRISKLQEDTSAHQNVVA
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pF1KE9 ETLSALENKEKELQLLNDKVETEQAEIQELKKSNHLLEDSLKELQLLSETLSLEKKEMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ETLSALENKEKELQLLNDKVETEQAEIQELKKSNHLLEDSLKELQLLSETLSLEKKEMSS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 IISLNKREIEELTQENGTLKEINASLNQEKMNLIQKSESFANYIDEREKSISELSDQYKQ
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NP_057 IISLNKREIEELTQENGTLKEINASLNQEKMNLIQKSESFANYIDEREKSISELSDQYKQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 EKLILLQRCEETGNAYEDLSQKYKAAQEKNSKLECLLNECTSLCENRKNELEQLKEAFAK
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NP_057 EKLILLQRCEETGNAYEDLSQKYKAAQEKNSKLECLLNECTSLCENRKNELEQLKEAFAK
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1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 EHQEFLTKLAFAEERNQNLMLELETVQQALRSEMTDNQNNSKSEAGGLKQEIMTLKEEQN
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NP_057 EHQEFLTKLAFAEERNQNLMLELETVQQALRSEMTDNQNNSKSEAGGLKQEIMTLKEEQN
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1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 KMQKEVNDLLQENEQLMKVMKTKHECQNLESEPIRNSVKERESERNQCNFKPQMDLEVKE
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NP_057 KMQKEVNDLLQENEQLMKVMKTKHECQNLESEPIRNSVKERESERNQCNFKPQMDLEVKE
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 ISLDSYNAQLVQLEAMLRNKELKLQESEKEKECLQHELQTIRGDLETSNLQDMQSQEISG
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NP_057 ISLDSYNAQLVQLEAMLRNKELKLQESEKEKECLQHELQTIRGDLETSNLQDMQSQEISG
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1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE9 LKDCEIDAEEKYISGPHELSTSQNDNAHLQCSLQTTMNKLNELEKICEILQAEKYELVTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LKDCEIDAEEKYISGPHELSTSQNDNAHLQCSLQTTMNKLNELEKICEILQAEKYELVTE
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1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE9 LNDSRSECITATRKMAEEVGKLLNEVKILNDDSGLLHGELVEDIPGGEFGEQPNEQHPVS
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NP_057 LNDSRSECITATRKMAEEVGKLLNEVKILNDDSGLLHGELVEDIPGGEFGEQPNEQHPVS
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1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE9 LAPLDESNSYEHLTLSDKEVQMHFAELQEKFLSLQSEHKILHDQHCQMSSKMSELQTYVD
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NP_057 LAPLDESNSYEHLTLSDKEVQMHFAELQEKFLSLQSEHKILHDQHCQMSSKMSELQTYVD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE9 SLKAENLVLSTNLRNFQGDLVKEMQLGLEEGLVPSLSSSCVPDSSSLSSLGDSSFYRALL
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NP_057 SLKAENLVLSTNLRNFQGDLVKEMQLGLEEGLVPSLSSSCVPDSSSLSSLGDSSFYRALL
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1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE9 EQTGDMSLLSNLEGTVSANQCSVDEVFCSSLQEENLTRKETPSAPAKGVEELESLCEVYR
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NP_057 EQTGDMSLLSNLEGAVSANQCSVDEVFCSSLQEENLTRKETPSAPAKGVEELESLCEVYR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE9 QSLEKLEEKMESQGIMKNKEIQELEQLLSSERQELDCLRKQYLSENEQWQQKLTSVTLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 QSLEKLEEKMESQGIMKNKEIQELEQLLSSERQELDCLRKQYLSENEQWQQKLTSVTLEM
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE9 ESKLAAEKKQTEQLSLELEVARLQLQGLDLSSRSLLGIDTEDAIQGRNESCDISKEHTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ESKLAAEKKQTEQLSLELEVARLQLQGLDLSSRSLLGIDTEDAIQGRNESCDISKEHTSE
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE9 TTERTPKHDVHQICDKDAQQDLNLDIEKITETGAVKPTGECSGEQSPDTNYEPPGEDKTQ
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NP_057 TTERTPKHDVHQICDKDAQQDLNLDIEKITETGAVKPTGECSGEQSPDTNYEPPGEDKTQ
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE9 GSSECISELSFSGPNALVPMDFLGNQEDIHNLQLRVKETSNENLRLLHVIEDRDRKVESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GSSECISELSFSGPNALVPMDFLGNQEDIHNLQLRVKETSNENLRLLHVIEDRDRKVESL
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE9 LNEMKELDSKLHLQEVQLMTKIEACIELEKIVGELKKENSDLSEKLEYFSCDHQELLQRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LNEMKELDSKLHLQEVQLMTKIEACIELEKIVGELKKENSDLSEKLEYFSCDHQELLQRV
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE9 ETSEGLNSDLEMHADKSSREDIGDNVAKVNDSWKERFLDVENELSRIRSEKASIEHEALY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ETSEGLNSDLEMHADKSSREDIGDNVAKVNDSWKERFLDVENELSRIRSEKASIEHEALY
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE9 LEADLEVVQTEKLCLEKDNENKQKVIVCLEEELSVVTSERNQLRGELDTMSKKTTALDQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LEADLEVVQTEKLCLEKDNENKQKVIVCLEEELSVVTSERNQLRGELDTMSKKTTALDQL
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE9 SEKMKEKTQELESHQSECLHCIQVAEAEVKEKTELLQTLSSDVSELLKDKTHLQEKLQSL
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NP_057 SEKMKEKTQELESHQSECLHCIQVAEAEVKEKTELLQTLSSDVSELLKDKTHLQEKLQSL
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XP_016 LAPLDESNSYEHLTLSDKEVQMHFAELQEKFLSLQSEHKILHDQHCQMSSKMSELQTYVD
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XP_016 GSSECISELSFSGPNALVPMDFLGNQEDIHNLQLRVKETSNENLRLLHVIEDRDRKVESL
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XP_016 SEKMKEKTQELESHQSECLHCIQVAEAEVKEKTELLQTLSSDVSELLKDKTHLQEKLQSL
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XP_016 GEFALRLSSTQEEVHQLRRGIEKLRVRIEADEKKQLHIAEKLKERERENDSLKDKVENLE
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XP_016 RELQMSEENQELVILDAENSKAEVETLKTQIEEMARSLKVFELDLVTLRSEKENLTKQIQ
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pF1KE9 EKQGQLSELDKLLSSFKSLLEEKEQAEIQIKEESKTAVEMLQNQLKELNEAVAALCGDQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 EQTGDMSLLSNLEGAVSANQCSVDEVFCSSLQEENLTRKETPSAPAKGVEELESLCEVYR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE9 ESKLAAEKKQTEQLSLELEVARLQLQGLDLSSRSLLGIDTEDAIQGRNESCDISKEHTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ESKLAAEKKQTEQLSLELEVARLQLQGLDLSSRSLLGIDTEDAIQGRNESCDISKEHTSE
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XP_011 TTERTPKHDVHQICDKDAQQDLNLDIEKITETGAVKPTGECSGEQSPDTNYEPPGEDKTQ
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XP_011 GSSECISELSFSGPNALVPMDFLGNQEDIHNLQLRVKETSNENLRLLHVIEDRDRKVESL
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XP_011 ETSEGLNSDLEMHADKSSREDIGDNVAKVNDSWKERFLDVENELSRIRSEKASIEHEALY
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pF1KE9 LEADLEVVQTEKLCLEKDNENKQKVIVCLEEELSVVTSERNQLRGELDTMSKKTTALDQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 SEKMKEKTQELESHQSECLHCIQVAEAEVKEKTELLQTLSSDVSELLKDKTHLQEKLQSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKDSQALSLTKCELENQIAQLNKEKELLVKESESLQARLSESDYEKLNVSKALEAALVEK
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pF1KE9 GEFALRLSSTQEEVHQLRRGIEKLRVRIEADEKKQLHIAEKLKERERENDSLKDKVENLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GEFALRLSSTQEEVHQLRRGIEKLRVRIEADEKKQLHIAEKLKERERENDSLKDKVENLE
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XP_011 IMKATEQSLDPPIEEEHQLRNSIEKLRARLEADEKKQLCVLQQLKESEHHADLLKGRVEN
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XP_011 LERELEIARTNQEHAALEAENSKGEVETLKAKIEGMTQSLRGLELDVVTIRSEKENLTNE
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