Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6791
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6791, 776 aa
1>>>pF1KE6791 776 - 776 aa - 776 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7129+/-0.000439; mu= 18.6010+/- 0.027
mean_var=118.7584+/-22.299, 0's: 0 Z-trim(114.0): 227 B-trim: 97 in 2/53
Lambda= 0.117691
statistics sampled from 23381 (23641) to 23381 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16
Scan time: 7.670
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003805 (OMIM: 603712) disintegrin and metallopr ( 776) 5547 954.1 0
XP_005268208 (OMIM: 603712) PREDICTED: disintegrin ( 776) 5547 954.1 0
NP_003804 (OMIM: 603713) disintegrin and metallopr ( 722) 3201 555.7 2.4e-157
XP_011529861 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 2782 484.7 6.9e-136
XP_011529863 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 2782 484.7 6.9e-136
NP_055084 (OMIM: 604778) disintegrin and metallopr ( 820) 2782 484.7 6.9e-136
NP_001124175 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 2782 484.7 6.9e-136
NP_001265054 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 2782 484.7 6.9e-136
XP_011529859 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 2782 484.7 6.9e-136
XP_011529862 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 2782 484.7 6.9e-136
XP_011529858 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 2782 484.7 6.9e-136
NP_001265055 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 2782 484.7 6.9e-136
NP_001124177 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 2782 484.7 6.9e-136
NP_001124176 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 2782 484.7 6.9e-136
NP_001265056 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 2782 484.7 6.9e-136
NP_003807 (OMIM: 602713,612775) disintegrin and me ( 819) 1840 324.7 9.7e-88
XP_016869431 (OMIM: 602713,612775) PREDICTED: disi ( 821) 1823 321.8 7.2e-87
XP_011542984 (OMIM: 602713,612775) PREDICTED: disi ( 801) 1821 321.5 8.9e-87
NP_068566 (OMIM: 604779) disintegrin and metallopr ( 790) 1568 278.5 7.5e-74
XP_011527669 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 812) 1272 228.3 1e-58
NP_001269376 (OMIM: 607114) disintegrin and metall ( 812) 1266 227.2 2.1e-58
NP_079496 (OMIM: 607114) disintegrin and metallopr ( 813) 1266 227.2 2.1e-58
XP_006723702 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 825) 1225 220.3 2.6e-56
XP_011527668 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 825) 1225 220.3 2.6e-56
XP_005260900 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 826) 1225 220.3 2.6e-56
XP_011542671 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 673) 1210 217.7 1.3e-55
XP_006716337 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 728) 1210 217.7 1.4e-55
XP_011542670 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 728) 1210 217.7 1.4e-55
XP_016868464 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 732) 1210 217.7 1.4e-55
XP_005273437 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 736) 1210 217.7 1.4e-55
XP_016868463 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 741) 1210 217.7 1.4e-55
XP_011542669 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 746) 1210 217.7 1.4e-55
NP_001291280 (OMIM: 606188) disintegrin and metall ( 754) 1210 217.7 1.5e-55
XP_006716336 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 767) 1210 217.7 1.5e-55
NP_055080 (OMIM: 606188) disintegrin and metallopr ( 775) 1210 217.7 1.5e-55
XP_006723703 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 823) 1210 217.7 1.5e-55
XP_016868465 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 715) 1197 215.5 6.5e-55
NP_003808 (OMIM: 607310) disintegrin and metallopr ( 754) 1163 209.7 3.7e-53
XP_016869432 (OMIM: 607310) PREDICTED: disintegrin ( 755) 1163 209.7 3.7e-53
NP_001455 (OMIM: 601533) disintegrin and metallopr ( 735) 1077 195.1 9e-49
XP_005273439 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 621) 1075 194.7 1e-48
NP_150377 (OMIM: 603640) disintegrin and metallopr ( 918) 1068 193.7 3e-48
XP_005266060 (OMIM: 603640) PREDICTED: disintegrin ( 955) 1068 193.7 3.1e-48
NP_694882 (OMIM: 607114) disintegrin and metallopr ( 787) 1064 192.9 4.3e-48
NP_001275902 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 906) 1029 187.1 2.9e-46
XP_011527670 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 800) 1023 186.0 5.5e-46
NP_003465 (OMIM: 602714) disintegrin and metallopr ( 909) 1011 184.0 2.4e-45
NP_001275904 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 735) 997 181.5 1.1e-44
NP_001275903 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 737) 997 181.5 1.1e-44
XP_011542672 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 542) 991 180.4 1.8e-44
>>NP_003805 (OMIM: 603712) disintegrin and metalloprotei (776 aa)
initn: 5547 init1: 5547 opt: 5547 Z-score: 5098.1 bits: 954.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5547; 100.0% identity (100.0% similar) in 776 aa overlap (1-776:1-776)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVQLHQDTDPQIPKGQPCTLNSSEGGARPAVPHTLFSSALDRWLHNDSFIMAVGEPLVHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MVQLHQDTDPQIPKGQPCTLNSSEGGARPAVPHTLFSSALDRWLHNDSFIMAVGEPLVHI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RVTLLLLWFGMFLSISGHSQARPSQYFTSPEVVIPLKVISRGRGAKAPGWLSYSLRFGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RVTLLLLWFGMFLSISGHSQARPSQYFTSPEVVIPLKVISRGRGAKAPGWLSYSLRFGGQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 RYIVHMRVNKLLFAAHLPVFTYTEQHALLQDQPFIQDDCYYHGYVEGVPESLVALSTCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RYIVHMRVNKLLFAAHLPVFTYTEQHALLQDQPFIQDDCYYHGYVEGVPESLVALSTCSG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GFLGMLQINDLVYEIKPISVSATFEHLVYKIDSDDTQFPPMRCGLTEEKIAHQMELQLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GFLGMLQINDLVYEIKPISVSATFEHLVYKIDSDDTQFPPMRCGLTEEKIAHQMELQLSY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NFTLKQSSFVGWWTHQRFVELVVVVDNIRYLFSQSNATTVQHEVFNVVNIVDSFYHPLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NFTLKQSSFVGWWTHQRFVELVVVVDNIRYLFSQSNATTVQHEVFNVVNIVDSFYHPLEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 DVILTGIDIWTASNPLPTSGDLDNVLEDFSIWKNYNLNNRLQHDVAHLFIKDTQGMKLGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DVILTGIDIWTASNPLPTSGDLDNVLEDFSIWKNYNLNNRLQHDVAHLFIKDTQGMKLGV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 AYVKGICQNPFNTGVDVFEDNRLVVFAITLGHELGHNLGMQHDTQWCVCELQWCIMHAYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AYVKGICQNPFNTGVDVFEDNRLVVFAITLGHELGHNLGMQHDTQWCVCELQWCIMHAYR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 KVTTKFSNCSYAQYWDSTISSGLCIQPPPYPGNIFRLKYCGNLVVEEGEECDCGTIRQCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KVTTKFSNCSYAQYWDSTISSGLCIQPPPYPGNIFRLKYCGNLVVEEGEECDCGTIRQCA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 KDPCCLLNCTLHPGAACAFGICCKDCKFLPSGTLCRQQVGECDLPEWCNGTSHQCPDDVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KDPCCLLNCTLHPGAACAFGICCKDCKFLPSGTLCRQQVGECDLPEWCNGTSHQCPDDVY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 VQDGISCNVNAFCYEKTCNNHDIQCKEIFGQDARSASQSCYQEINTQGNRFGHCGIVGTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VQDGISCNVNAFCYEKTCNNHDIQCKEIFGQDARSASQSCYQEINTQGNRFGHCGIVGTT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 YVKCWTPDIMCGRVQCENVGVIPNLIEHSTVQQFHLNDTTCWGTDYHLGMAIPDIGEVKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YVKCWTPDIMCGRVQCENVGVIPNLIEHSTVQQFHLNDTTCWGTDYHLGMAIPDIGEVKD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 GTVCGPEKICIRKKCASMVHLSQACQPKTCNMRGICNNKQHCHCNHEWAPPYCKDKGYGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GTVCGPEKICIRKKCASMVHLSQACQPKTCNMRGICNNKQHCHCNHEWAPPYCKDKGYGG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KE6 SADSGPPPKNNMEGLNVMGKLRYLSLLCLLPLVAFLLFCLHVLFKKRTKSKEDEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SADSGPPPKNNMEGLNVMGKLRYLSLLCLLPLVAFLLFCLHVLFKKRTKSKEDEEG
730 740 750 760 770
>>XP_005268208 (OMIM: 603712) PREDICTED: disintegrin and (776 aa)
initn: 5547 init1: 5547 opt: 5547 Z-score: 5098.1 bits: 954.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5547; 100.0% identity (100.0% similar) in 776 aa overlap (1-776:1-776)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVQLHQDTDPQIPKGQPCTLNSSEGGARPAVPHTLFSSALDRWLHNDSFIMAVGEPLVHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MVQLHQDTDPQIPKGQPCTLNSSEGGARPAVPHTLFSSALDRWLHNDSFIMAVGEPLVHI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RVTLLLLWFGMFLSISGHSQARPSQYFTSPEVVIPLKVISRGRGAKAPGWLSYSLRFGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RVTLLLLWFGMFLSISGHSQARPSQYFTSPEVVIPLKVISRGRGAKAPGWLSYSLRFGGQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 RYIVHMRVNKLLFAAHLPVFTYTEQHALLQDQPFIQDDCYYHGYVEGVPESLVALSTCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RYIVHMRVNKLLFAAHLPVFTYTEQHALLQDQPFIQDDCYYHGYVEGVPESLVALSTCSG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GFLGMLQINDLVYEIKPISVSATFEHLVYKIDSDDTQFPPMRCGLTEEKIAHQMELQLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GFLGMLQINDLVYEIKPISVSATFEHLVYKIDSDDTQFPPMRCGLTEEKIAHQMELQLSY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NFTLKQSSFVGWWTHQRFVELVVVVDNIRYLFSQSNATTVQHEVFNVVNIVDSFYHPLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NFTLKQSSFVGWWTHQRFVELVVVVDNIRYLFSQSNATTVQHEVFNVVNIVDSFYHPLEV
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310 320 330 340 350 360
pF1KE6 DVILTGIDIWTASNPLPTSGDLDNVLEDFSIWKNYNLNNRLQHDVAHLFIKDTQGMKLGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DVILTGIDIWTASNPLPTSGDLDNVLEDFSIWKNYNLNNRLQHDVAHLFIKDTQGMKLGV
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pF1KE6 AYVKGICQNPFNTGVDVFEDNRLVVFAITLGHELGHNLGMQHDTQWCVCELQWCIMHAYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AYVKGICQNPFNTGVDVFEDNRLVVFAITLGHELGHNLGMQHDTQWCVCELQWCIMHAYR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 KVTTKFSNCSYAQYWDSTISSGLCIQPPPYPGNIFRLKYCGNLVVEEGEECDCGTIRQCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KVTTKFSNCSYAQYWDSTISSGLCIQPPPYPGNIFRLKYCGNLVVEEGEECDCGTIRQCA
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490 500 510 520 530 540
pF1KE6 KDPCCLLNCTLHPGAACAFGICCKDCKFLPSGTLCRQQVGECDLPEWCNGTSHQCPDDVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KDPCCLLNCTLHPGAACAFGICCKDCKFLPSGTLCRQQVGECDLPEWCNGTSHQCPDDVY
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pF1KE6 VQDGISCNVNAFCYEKTCNNHDIQCKEIFGQDARSASQSCYQEINTQGNRFGHCGIVGTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VQDGISCNVNAFCYEKTCNNHDIQCKEIFGQDARSASQSCYQEINTQGNRFGHCGIVGTT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 YVKCWTPDIMCGRVQCENVGVIPNLIEHSTVQQFHLNDTTCWGTDYHLGMAIPDIGEVKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YVKCWTPDIMCGRVQCENVGVIPNLIEHSTVQQFHLNDTTCWGTDYHLGMAIPDIGEVKD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 GTVCGPEKICIRKKCASMVHLSQACQPKTCNMRGICNNKQHCHCNHEWAPPYCKDKGYGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GTVCGPEKICIRKKCASMVHLSQACQPKTCNMRGICNNKQHCHCNHEWAPPYCKDKGYGG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KE6 SADSGPPPKNNMEGLNVMGKLRYLSLLCLLPLVAFLLFCLHVLFKKRTKSKEDEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SADSGPPPKNNMEGLNVMGKLRYLSLLCLLPLVAFLLFCLHVLFKKRTKSKEDEEG
730 740 750 760 770
>>NP_003804 (OMIM: 603713) disintegrin and metalloprotei (722 aa)
initn: 1982 init1: 1982 opt: 3201 Z-score: 2945.8 bits: 555.7 E(85289): 2.4e-157
Smith-Waterman score: 3201; 62.1% identity (83.3% similar) in 712 aa overlap (51-759:1-710)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 NSSEGGARPAVPHTLFSSALDRWLHNDSFIMAVGEPLVHIRVTLLLLWFGMFLSISGHSQ
::: ::.:::::::::.:.::::::. :
NP_003 MAVDGTLVYIRVTLLLLWLGVFLSISGYCQ
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 ARPSQYFTSPEVVIPLKVISRGRGAKAPGWLSYSLRFGGQRYIVHMRVNKLLFAAHLPVF
: :::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::...:::::.::: . :::::
NP_003 AGPSQHFTSPEVVIPLKVISRGRSAKAPGWLSYSLRFGGQKHVVHMRVKKLLVSRHLPVF
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 TYTEQHALLQDQPFIQDDCYYHGYVEGVPESLVALSTCSGGFLGMLQINDLVYEIKPISV
:::...:::.:: :: ::::::::::..:::::..:.: ::: :.:.:. :.:::.::
NP_003 TYTDDRALLEDQLFIPDDCYYHGYVEAAPESLVVFSACFGGFRGVLKISGLTYEIEPIRH
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250
pF1KE6 SATFEHLVYKIDSDDTQFPPMRCGLTEEKIA-HQMELQLSYNFTLKQSSFVGWWTHQRFV
:::::::::::.:..:::: :::::::...: .:.:.. . : .:. .: :::: :.
NP_003 SATFEHLVYKINSNETQFPAMRCGLTEKEVARQQLEFEEAENSALEPKSAGDWWTHAWFL
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 ELVVVVDNIRYLFSQSNATTVQHEVFNVVNIVDSFYHPLEVDVILTGIDIWTASNPLPTS
::::::.. ...:::: . ::..:: :::::::.:. : . .:: ::.::. .: .: .
NP_003 ELVVVVNHDFFIYSQSNISKVQEDVFLVVNIVDSMYKQLGTYIILIGIEIWNQGNVFPMT
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 GDLDNVLEDFSIWKNYNLNNRLQHDVAHLFIKDTQGMKLGVAYVKGICQNPFNTGVDVFE
. ...::.::: ::. .:. .::::.::.:::.. ::.::: :::. :.. ::: :.
NP_003 S-IEQVLNDFSQWKQISLS-QLQHDAAHMFIKNSLISILGLAYVAGICRPPIDCGVDNFQ
280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 DNRLVVFAITLGHELGHNLGMQHDTQWCVCELQWCIMHAYRKVTTKFSNCSYAQYWDSTI
. .:: :..:::::.:::::: ..: : . :::...: . ::.:::::.. .:.
NP_003 GDTWSLFANTVAHELGHTLGMQHDEEFCFCGERGCIMNTFRVPAEKFTNCSYADFMKTTL
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
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NP_055 CILLLIVLFILLCCLYRLCKKSKPIKKQQDVQTPSAKEEEKIQRRPHELPPQSQPWVMPS
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>>NP_001124175 (OMIM: 604778) disintegrin and metallopro (820 aa)
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NP_001 MKMLLLLHCLGVFLSCSGHIQDEHPQYHSP
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NP_001 PDVVIPVRITGTTRGMTPPGWLSYILPFGGQKHIIHIKVKKLLFSKHLPVFTYTDQGAIL
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776 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 16:22:43 2016 done: Tue Nov 8 16:22:44 2016
Total Scan time: 7.670 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]