Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6762
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6762, 756 aa
1>>>pF1KE6762 756 - 756 aa - 756 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6410+/-0.00102; mu= 6.2669+/- 0.062
mean_var=202.0564+/-40.424, 0's: 0 Z-trim(111.5): 49 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.090227
statistics sampled from 12374 (12423) to 12374 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.382), width: 16
Scan time: 3.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 ( 756) 5225 693.2 3.9e-199
CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 ( 734) 2628 355.2 2.2e-97
CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7 (1158) 1784 245.4 3.7e-64
CCDS3810.1 CPE gene_id:1363|Hs108|chr4 ( 476) 1335 186.7 7.3e-47
CCDS43212.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 515) 1261 177.1 6.2e-44
CCDS3404.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 641) 1261 177.2 7.3e-44
CCDS33953.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 652) 1261 177.2 7.4e-44
CCDS7486.1 CPN1 gene_id:1369|Hs108|chr10 ( 458) 774 113.7 6.8e-25
CCDS11257.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1380) 676 101.3 1.1e-20
CCDS56025.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1133) 618 93.7 1.8e-18
CCDS8987.1 CPM gene_id:1368|Hs108|chr12 ( 443) 536 82.7 1.4e-15
>>CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 (756 aa)
initn: 5225 init1: 5225 opt: 5225 Z-score: 3688.6 bits: 693.2 E(32554): 3.9e-199
Smith-Waterman score: 5225; 99.9% identity (100.0% similar) in 756 aa overlap (1-756:1-756)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSRPGTATPALALVLLAVTLAGVGAQGAALEDPDYYGQEIWSREPYYARPEPELETFSPP
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CCDS76 MSRPGTATPALALVLLAVTLAGVGAQGAALEDPDYYGQEIWSREPYYARPEPELETFSPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LPAGPGEEWERRPQEPRPPKRATKPKKAPKREKSAPEPPPPGKHSNKKVMRTKSSEKAAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LPAGPGEEWERRPQEPRPPKRATKPKKAPKREKSAPEPPPPGKHSNKKVMRTKSSEKAAN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DDHSVRVAREDVRESCPPLGLETLKITDFQLHASTVKRYGLGAHRGRLNIQAGINENDFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DDHSVRVAREDVRESCPPLGLETLKITDFQLHASTVKRYGLGAHRGRLNIQAGINENDFY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DGAWCAGRNDLQQWIEVDARRLTRFTGVITQGRNSLWLSDWVTSYKVMVSNDSHTWVTVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DGAWCAGRNDLQQWIEVDARRLTRFTGVITQGRNSLWLSDWVTSYKVMVSNDSHTWVTVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NGSGDMIFEGNSEKEIPVLNELPVPMVARYIRINPQSWFDNGSICMRMEILGCPLPDPNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NGSGDMIFEGNSEKEIPVLNELPVPMVARYIRINPQSWFDNGSICMRMEILGCPLPDPNN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 YYHRRNEMTTTDDLDFKHHNYKEMRQLMKVVNEMCPNITRIYNIGKSHQGLKLYAVEISD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YYHRRNEMTTTDDLDFKHHNYKEMRQLMKVVNEMCPNITRIYNIGKSHQGLKLYAVEISD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 HPGEHEVGEPEFHYIAGAHGNEVLGRELLLLLVQFVCQEYLARNARIVHLVEETRIHVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HPGEHEVGEPEFHYIAGAHGNEVLGRELLLLLVQFVCQEYLARNARIVHLVEETRIHVLP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SLNPDGYEKAYEGGSELGGWSLGRWTHDGIDINNNFPDLNTLLWEAEDRQNVPRKVPNHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SLNPDGYEKAYEGGSELGGWSLGRWTHDGIDINNNFPDLNTLLWEAEDRQNVPRKVPNHY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 IAIPEWFLSENATVAAETRAVIAWMEKIPFVLGGNLQGGELVVAYPYDLVRSPWKTQEHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IAIPEWFLSENATVAAETRAVIAWMEKIPFVLGGNLQGGELVVAYPYDLVRSPWKTQEHT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 PTPDDHVFRWLAYSYASTHRLMTDARRRVCHTEDFQKEEGTVNGASWHTVAGSLNDFSYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PTPDDHVFRWLAYSYASTHRLMTDARRRVCHTEDFQKEEGTVNGASWHTVAGSLNDFSYL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 HTNCFELSIYVGCDKYPHESQLPEEWENNRESLIVFMEQVHRGIKGLVRDSHGKGIPNAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HTNCFELSIYVGCDKYPHESQLPEEWENNRESLIVFMEQVHRGIKGLVRDSHGKGIPNAI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 ISVEGINHDIRTANDGDYWRLLNPGEYVVTAKAEGFTASTKNCMVGYDMGATRCDFTLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ISVEGINHDIRTANDGDYWRLLNPGEYVVTAKAEGFTASTKNCMVGYDMGATRCDFTLSK
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE6 TNMARIREIMEKFGKQPVSLPARRLKLRGRKRRQRG
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS76 TNMARIREIMEKFGKQPVSLPARRLKLRGQKRRQRG
730 740 750
>>CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 (734 aa)
initn: 2143 init1: 1822 opt: 2628 Z-score: 1861.8 bits: 355.2 E(32554): 2.2e-97
Smith-Waterman score: 2628; 54.4% identity (78.6% similar) in 695 aa overlap (62-751:48-733)
40 50 60 70 80
pF1KE6 DPDYYGQEIWSREPYYARPEPELETFSPPLPAGPGEEWERRPQEPRPPKRATKPKKA--P
:: : : .: . :. : ::.
CCDS13 ALGAPRNSVLGLAQPGTTKVPGSTPALHSSPAQPPAETANGTSEQHVRIRVIKKKKVIMK
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 KREKSAPEPPPPGKHSNKKVMRTKSSEKAANDDHSVRVAREDVRESCPPLGLETLKITDF
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CCDS13 KRKKLTLTRPTPLVTAGPLVTPTP----AGTLDPA-----EKQETGCPPLGLESLRVSDS
80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 QLHASTVKRYGLGAHRGRLNIQAGINENDFYDGAWCAGRNDLQQWIEVDARRLTRFTGVI
.:.::. . .::: ::::::::.:....:.::::::: ..: . :..::: . :::.:::
CCDS13 RLEASSSQSFGLGPHRGRLNIQSGLEDGDLYDGAWCAEEQDADPWFQVDAGHPTRFSGVI
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 TQGRNSLWLSDWVTSYKVMVSNDSHTWVTVKNGSG--DMIFEGNSEKEIPVLNELPVPMV
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CCDS13 TQGRNSVWRYDWVTSYKVQFSNDSRTWWGSRNHSSGMDAVFPANSDPETPVLNLLPEPQV
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 ARYIRINPQSWFDNGSICMRMEILGCPLPDPNNYYHRRNEMTTTDDLDFKHHNYKEMRQL
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CCDS13 ARFIRLLPQTWLQGGAPCLRAEILACPVSDPNDLFLEAPASGSSDPLDFQHHNYKAMRKL
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 MKVVNEMCPNITRIYNIGKSHQGLKLYAVEISDHPGEHEVGEPEFHYIAGAHGNEVLGRE
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CCDS13 MKQVQEQCPNITRIYSIGKSYQGLKLYVMEMSDKPGEHELGEPEVRYVAGMHGNEALGRE
310 320 330 340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 LLLLLVQFVCQEYLARNARIVHLVEETRIHVLPSLNPDGYEKAYEGGSELGGWSLGRWTH
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CCDS13 LLLLLMQFLCHEFLRGNPRVTRLLSEMRIHLLPSMNPDGYEIAYHRGSELVGWAEGRWNN
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 DGIDINNNFPDLNTLLWEAEDRQNVPRKVPNHYIAIPEWFLSENATVAAETRAVIAWMEK
..::.:.:: :::: ::::.: .::. ::::.. .: .. ::::: :::::: ::..
CCDS13 QSIDLNHNFADLNTPLWEAQDDGKVPHIVPNHHLPLPTYYTLPNATVAPETRAVIKWMKR
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 IPFVLGGNLQGGELVVAYPYDLVRSPWKTQEHTPTPDDHVFRWLAYSYASTHRLMTDARR
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CCDS13 IPFVLSANLHGGELVVSYPFDMTRTPWAARELTPTPDDAVFRWLSTVYAGSNLAMQDTSR
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KE6 RVCHTEDFQKEEGTVNGASWHTVAGSLNDFSYLHTNCFELSIYVGCDKYPHESQLPEEWE
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CCDS13 RPCHSQDFSVHGNIINGADWHTVPGSMNDFSYLHTNCFEVTVELSCDKFPHENELPQEWE
550 560 570 580 590 600
630 640 650 660 670 680
pF1KE6 NNRESLIVFMEQVHRGIKGLVRDSHGK-GIPNAIISVEGINHDIRTANDGDYWRLLNPGE
::...:....:::. :: :.:::. . :: .:.:.:.:::::. :: :::::::.::.
CCDS13 NNKDALLTYLEQVRMGIAGVVRDKDTELGIADAVIAVDGINHDVTTAWGGDYWRLLTPGD
610 620 630 640 650 660
690 700 710 720 730 740
pF1KE6 YVVTAKAEGFTASTKNCMVGYDMGATRCDFTLSKTNMARIREIMEKFGKQPVSLPARRLK
:.:::.:::. . :.:: : .. : :.:.:.:: :.::.. .: : .: : .
CCDS13 YMVTASAEGYHSVTRNCRVTFEEGPFPCNFVLTKTPKQRLRELLAAGAKVPPDLRRRLER
670 680 690 700 710 720
750
pF1KE6 LRGRKRRQRG
:::.:
CCDS13 LRGQKD
730
>>CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7 (1158 aa)
initn: 1750 init1: 1091 opt: 1784 Z-score: 1265.3 bits: 245.4 E(32554): 3.7e-64
Smith-Waterman score: 2644; 52.4% identity (73.9% similar) in 762 aa overlap (38-755:267-1021)
10 20 30 40 50
pF1KE6 TPALALVLLAVTLAGVGAQGAALEDPDYYGQEIWSREPYYARP--------EPELETFSP
...: . : : :: .. . :
CCDS54 DQIEREDYEDFEYIRRQKQPRPPPSRRRRPERVWPEPPEEKAPAPAPEERIEPPVKPLLP
240 250 260 270 280 290
60 70 80 90 100
pF1KE6 PLPAGPGE----------EWERRPQEPRPP--KRATKPKKA----PKREKSAPEPPPPGK
::: :. .. : :. : .: : .: ::.: :.:. :
CCDS54 PLPPDYGDGYVIPNYDDMDYYFGPPPPQKPDAERQTDEEKEELKKPKKEDSSPKEETD-K
300 310 320 330 340 350
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 HSNKKVMRTKSSEKAANDDHSVRVAREDVRESCPPLGLETLKITDFQLHASTVKRYGLGA
. .: : .:. . .. . : :. :::.:.:. .: : :..::.. :.::::
CCDS54 WAVEKGKDHKEPRKGEELEEEW-TPTEKVK--CPPIGMESHRIEDNQIRASSMLRHGLGA
360 370 380 390 400 410
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 HRGRLNIQAGINENDFYDGAWCAGRNDLQQWIEVDARRLTRFTGVITQGRNSLWLSDWVT
.:::::.:.: .:.:.::::::: . ::::::.:: :::::::::::.: .:.::
CCDS54 QRGRLNMQTGATEDDYYDGAWCAEDDARTQWIEVDTRRTTRFTGVITQGRDSSIHDDFVT
420 430 440 450 460 470
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 SYKVMVSNDSHTWVTVKNGSGDMIFEGNSEKEIPVLNELPVPMVARYIRINPQSWFDNGS
.. : ::::.::: :: .: :.:: .:. :::.::: :.:::.::: : .: :::
CCDS54 TFFVGFSNDSQTWVMYTNGYEEMTFHGNVDKDTPVLSELPEPVVARFIRIYPLTW--NGS
480 490 500 510 520 530
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 ICMRMEILGCPLPDPNNYYHRRNEMTTTDDLDFKHHNYKEMRQLMKVVNEMCPNITRIYN
.:::.:.::: . : :. .::...::::::.::.::.:::::::::: ::.::: :.
CCDS54 LCMRLEVLGCSVA-PVYSYYAQNEVVATDDLDFRHHSYKDMRQLMKVVNEECPTITRTYS
540 550 560 570 580
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 IGKSHQGLKLYAVEISDHPGEHEVGEPEFHYIAGAHGNEVLGRELLLLLVQFVCQEYLAR
.::: .:::.::.::::.:::::.:::::.: :: ::::::::::::::.:..:.::
CCDS54 LGKSSRGLKIYAMEISDNPGEHELGEPEFRYTAGIHGNEVLGRELLLLLMQYLCREYRDG
590 600 610 620 630 640
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 NARIVHLVEETRIHVLPSLNPDGYEKAYEGGSELGGWSLGRWTHDGIDINNNFPDLNTLL
: :. ::..::::..::::::::: : . :::.:.:.:: ::..:.:: ..:::::..:
CCDS54 NPRVRSLVQDTRIHLVPSLNPDGYEVAAQMGSEFGNWALGLWTEEGFDIFEDFPDLNSVL
650 660 670 680 690 700
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 WEAEDRQNVPRKVPNHYIAIPEWFLSENATVAAETRAVIAWMEKIPFVLGGNLQGGELVV
: ::.:. :: .:::. . ::: .:: .:::..:.::.:::::: :::::.::.::: .:
CCDS54 WGAEERKWVPYRVPNNNLPIPERYLSPDATVSTEVRAIIAWMEKNPFVLGANLNGGERLV
710 720 730 740 750 760
530 540 550 560
pF1KE6 AYPYDLVRSPWKTQ------------------EHTPTPDDHVFRWLAYSYASTHRLMTDA
.::::..:.: . : : ::: .::::: :.::.: .:.
CCDS54 SYPYDMARTPTQEQLLAAAMAAARGEDEDEVSEAQETPDHAIFRWLAISFASAHLTLTEP
770 780 790 800 810 820
570 580 590 600 610 620
pF1KE6 RRRVCHTEDFQKEEGTVNGASWHTVAGSLNDFSYLHTNCFELSIYVGCDKYPHESQLPEE
: :...:. : ::::.:. .:..::::::::::.:::.:.::::.::::.::.:
CCDS54 YRGGCQAQDYTGGMGIVNGAKWNPRTGTINDFSYLHTNCLELSFYLGCDKFPHESELPRE
830 840 850 860 870 880
630 640 650 660 670 680
pF1KE6 WENNRESLIVFMEQVHRGIKGLVRDSHGKGIPNAIISVEGINHDIRTANDGDYWRLLNPG
::::.:.:..:::::::::::.: : .: : :: ::: :::: ..::. :::::.::::
CCDS54 WENNKEALLTFMEQVHRGIKGVVTDEQGIPIANATISVSGINHGVKTASGGDYWRILNPG
890 900 910 920 930 940
690 700 710 720 730 740
pF1KE6 EYVVTAKAEGFTASTKNCMVGYDMGATRCDFTLSKTNMARIREIMEKFGKQPVSL--PAR
:: :::.:::.: :.:.: : ::.:::.:.: :...: :::::: :..:. :.:
CCDS54 EYRVTAHAEGYTPSAKTCNVDYDIGATQCNFILARSNWKRIREIMAMNGNRPIPHIDPSR
950 960 970 980 990 1000
750
pF1KE6 RLKLRGRKRRQRG
. . :. .::
CCDS54 PMTPQQRRLQQRRLQHRLRLRAQMRLRRLNATTTLGPHTVPPTLPPAPATTLSTTIEPWG
1010 1020 1030 1040 1050 1060
>>CCDS3810.1 CPE gene_id:1363|Hs108|chr4 (476 aa)
initn: 1222 init1: 526 opt: 1335 Z-score: 954.8 bits: 186.7 E(32554): 7.3e-47
Smith-Waterman score: 1335; 45.1% identity (74.7% similar) in 439 aa overlap (298-731:33-465)
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 ARYIRINPQSWFDNGSICMRMEILGCPLPDPNNYYHRRNEMTTTDDLDFKHHNYKEMRQL
: ..:: .. : ..:..: : :.:.
CCDS38 GRGGSALLALCGALAACGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREA
10 20 30 40 50 60
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 MKVVNEMCPNITRIYNIGKSHQGLKLYAVEISDHPGEHEVGEPEFHYIAGAHGNEVLGRE
. : .: :.:::..:.: .: .: ..:.::.:: :: :::::.::.. ::::..:::
CCDS38 LVSVWLQCTAISRIYTVGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRE
70 80 90 100 110 120
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 LLLLLVQFVCQEYLARNARIVHLVEETRIHVLPSLNPDGYEKAYEGGSELGGWSLGRWTH
::..:.:..:.:: : ::.:.. ::::..:::::::.::: .:: : .:: .
CCDS38 LLIFLAQYLCNEYQKGNETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNA
130 140 150 160 170 180
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 DGIDINNNFPDLNTLLWEAEDRQNVPRKVPNHYIAIPEWFLSENATVAAETRAVIAWMEK
.:::.: :::::. ... ...... : :: . . ....:. .: ::.::: :.
CCDS38 QGIDLNRNFPDLDRIVY-VNEKEGGPN---NHLLKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMD
190 200 210 220 230
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 IPFVLGGNLQGGELVVAYPYDLVRSPWKTQEHTPTPDDHVFRWLAYSYASTHRLMTDARR
:::::..::.::.::. :::: .:: ...:.. .::: .:. :: .:.: . :.: :
CCDS38 IPFVLSANLHGGDLVANYPYDETRSG-SAHEYSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNR
240 250 260 270 280 290
570 580 590 600 610 620
pF1KE6 RVCHTEDFQKE--EGTVNGASWHTVAGSLNDFSYLHTNCFELSIYVGCDKYPHESQLPEE
:. .: .. .::.::..:..: :...::.:: .::::... ..:.:.: : :
CCDS38 PPCRKNDDDSSFVDGTTNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTY
300 310 320 330 340 350
630 640 650 660 670 680
pF1KE6 WENNRESLIVFMEQVHRGIKGLVRDSHGKGIPNAIISVEGINHDIRTANDGDYWRLLNPG
::.:..::: ..::.:::.::.::: .:. : :: ::::::.::. .:.:::::::: ::
CCDS38 WEDNKNSLISYLEQIHRGVKGFVRDLQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPG
360 370 380 390 400 410
690 700 710 720 730 740
pF1KE6 EYVVTAKAEGFTASTKNCMVGYDMGATRCDFTL---SKTNMARIREIMEKFGKQPVSLPA
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CCDS33 HRGIKGVVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKVI
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CCDS33 KKVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRAR
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: .:::::.... ...::.::::::::... ..:::.: : .: .:: .:::.:: :.:
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: . :: : .: :... ... .:. .. : . : : : .. ::
CCDS74 ETVTVTVG-PAEPTLVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQR
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:
CCDS74 GPA
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CCDS11 GVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPVTK
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: : . :: . .::: ...
CCDS11 NVTVKSE-GAIQVNFTLVRSSTDSNNESKKGKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAEN
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>--
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CCDS11 LGSSARAAHIKKAEATTTTTSAGAEAAEGQFDRYYHEEELESALREAAAAGLPGLARLFS
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::.: .: :...... : : :.:. . ... ::.:..
CCDS11 IGRSVEGRPLWVLRLTAGLGSLIPEGDAGPDAAGPDAAGPLLPGRPQVKLVGNMHGDETV
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CCDS11 SRQVLIYLARELAAGYRRGDPRLVRLLNTTDVYLLPSLNPDGFERAREGDCGFGDGGPSG
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:: . : :.: .::: ..: : : .:: :.:
CCDS11 ASGRDNSRGRDLNRSFPDQFSTGEPPALD------EVP-------------------EVR
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CCDS11 ALIEWIRRNKFVLSGNLHGGSVVASYPFDDSPEHKATGIYSKTSDDEVFKYLAKAYASNH
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CCDS11 PIMKTGEPHCPGDEDETFKDGITNGAHWYDVEGGMQDYNYVWANCFEITLELSCCKYPPA
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CCDS11 SQLRQEWENNRESLITLIEKVHIGVKGFVKDSITGSGLENATISVAGINHNITTGRFGDF
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CCDS11 YRLLVPGTYNLTVVLTGYMPLTVTNVVVKEGPATEVDFSLRPTVTSVIPDTTEAVSTAST
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:..:
CCDS11 VAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSLGKSVESRELY
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>>CCDS56025.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1133 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]