Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6759
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6759, 543 aa
1>>>pF1KE6759 543 - 543 aa - 543 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1281+/-0.000368; mu= 19.3162+/- 0.023
mean_var=64.4219+/-13.470, 0's: 0 Z-trim(113.0): 178 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.159793
statistics sampled from 22023 (22207) to 22023 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 7.690
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000095 (OMIM: 231300,600975,601771,604229) cyto ( 543) 3652 851.0 0
NP_000490 (OMIM: 108330) cytochrome P450 1A1 isofo ( 512) 1277 303.4 1.1e-81
NP_001306146 (OMIM: 108330) cytochrome P450 1A1 is ( 512) 1277 303.4 1.1e-81
NP_000752 (OMIM: 124060) cytochrome P450 1A2 [Homo ( 516) 1224 291.2 5.2e-78
NP_001306145 (OMIM: 108330) cytochrome P450 1A1 is ( 483) 917 220.4 1e-56
XP_005262774 (OMIM: 610670,615030) PREDICTED: cyto ( 562) 831 200.6 1e-50
NP_000093 (OMIM: 202110,609300) steroid 17-alpha-h ( 508) 772 187.0 1.2e-46
NP_898898 (OMIM: 610670,615030) cytochrome P450 2U ( 544) 737 178.9 3.4e-44
XP_016877442 (OMIM: 108330) PREDICTED: cytochrome ( 484) 698 169.9 1.6e-41
NP_000097 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 2D ( 497) 688 167.6 8e-41
XP_011528270 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 491) 681 166.0 2.4e-40
XP_011528268 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 502) 681 166.0 2.5e-40
NP_000763 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 isof ( 490) 675 164.6 6.3e-40
NP_000762 (OMIM: 122700,601130) cytochrome P450 2C ( 490) 653 159.6 2.1e-38
XP_016871247 (OMIM: 122700,601130) PREDICTED: cyto ( 490) 653 159.6 2.1e-38
NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C ( 490) 653 159.6 2.1e-38
NP_000766 (OMIM: 601258) cytochrome P450 2J2 [Homo ( 502) 653 159.6 2.2e-38
NP_001185783 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 388) 640 156.5 1.4e-37
NP_001185782 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 640 156.5 1.5e-37
NP_001185784 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 640 156.5 1.5e-37
NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofo ( 490) 640 156.6 1.7e-37
NP_001020332 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 ( 446) 631 154.5 6.6e-37
XP_011528272 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 451) 624 152.9 2e-36
NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B ( 491) 602 147.8 7.3e-35
NP_085125 (OMIM: 611529) cytochrome P450 2S1 precu ( 504) 588 144.6 7e-34
XP_016872683 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 574 141.3 5.3e-33
XP_016872681 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 574 141.3 5.3e-33
XP_016872682 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 574 141.3 5.3e-33
XP_016872684 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 574 141.3 5.3e-33
XP_016872680 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 574 141.3 5.3e-33
XP_011518197 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 574 141.3 5.3e-33
XP_011518200 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 574 141.3 5.3e-33
XP_016872679 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 446) 574 141.3 5.9e-33
XP_005252846 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 447) 574 141.3 5.9e-33
XP_005252845 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 453) 574 141.3 6e-33
NP_078790 (OMIM: 600081,608713) vitamin D 25-hydro ( 501) 574 141.4 6.5e-33
NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Hom ( 494) 573 141.1 7.6e-33
NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precu ( 493) 570 140.4 1.2e-32
NP_000765 (OMIM: 124070) cytochrome P450 2F1 precu ( 491) 564 139.0 3.2e-32
XP_016881874 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 566) 564 139.1 3.6e-32
NP_060251 (OMIM: 615967) cytochrome P450 2W1 precu ( 490) 536 132.6 2.8e-30
NP_001122397 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 i ( 431) 535 132.3 2.9e-30
XP_011513743 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 475) 535 132.3 3.2e-30
NP_000753 (OMIM: 122700,122720,188890,211980) cyto ( 494) 534 132.1 3.9e-30
NP_085079 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 443) 525 130.0 1.5e-29
NP_000755 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 494) 525 130.1 1.6e-29
XP_011524851 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 294) 519 128.5 2.8e-29
XP_011513742 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 564) 520 128.9 4e-29
XP_006723113 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 457) 518 128.4 4.7e-29
XP_011524856 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 434) 471 117.6 8.2e-26
>>NP_000095 (OMIM: 231300,600975,601771,604229) cytochro (543 aa)
initn: 3652 init1: 3652 opt: 3652 Z-score: 4546.2 bits: 851.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3652; 99.8% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGTSLSPNDPWPLNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLRSAPPGPFAWPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MGTSLSPNDPWPLNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLRSAPPGPFAWPLI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GNAAAVGQAAHLSFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GNAAAVGQAAHLSFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ASFRVVSGGRSMAFGHYSEHWKVQRRAAHSMMRNFFTRQPRSRQVLEGHVLSEARELVAL
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LVRGSADGAFLDPRPLTVVAVANVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVGAGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LVRGSADGAFLDPRPLTVVAVANVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVGAGSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VDVMPWLQYFPNPVRTVFREFEQLNRNFSNFILDKFLRHCESLRPGAAPRDMMDAFILSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VDVMPWLQYFPNPVRTVFREFEQLNRNFSNFILDKFLRHCESLRPGAAPRDMMDAFILSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EKKAAGDSHGGGARLDLENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRVQAEL
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370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DQVVGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPKDTVV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 FVNQWSVNHDPVKWPNPENFDPARFLDKDGLINKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEELSKMQL
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FVNQWSVNHDPLKWPNPENFDPARFLDKDGLINKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEELSKMQL
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pF1KE6 FLFISILAHQCDFRANPNEPAKMNFSYGLTIKPKSFKVNVTLRESMELLDSAVQNLQAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FLFISILAHQCDFRANPNEPAKMNFSYGLTIKPKSFKVNVTLRESMELLDSAVQNLQAKE
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 TCQ
:::
NP_000 TCQ
>>NP_000490 (OMIM: 108330) cytochrome P450 1A1 isoform 1 (512 aa)
initn: 1175 init1: 626 opt: 1277 Z-score: 1587.6 bits: 303.4 E(85289): 1.1e-81
Smith-Waterman score: 1277; 40.1% identity (70.8% similar) in 504 aa overlap (13-512:2-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGTSLSPNDPWPLNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLRSAPPGPFAWPLI
: :.:.. : .:: .. : : : . . . ::::..::::
NP_000 MLFPISMSATEFLLASVIFCLVFWVIRASRPQVPKGLKNPPGPWGWPLI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GNAAAVGQAAHLSFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAF
:. ..:. ::...:....::::.:::.:: :.:::.: .:.::::.::. : :: .
NP_000 GHMLTLGKNPHLALSRMSQQYGDVLQIRIGSTPVVVLSGLDTIRQALVRQGDDFKGRPDL
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130 140 150 160 170
pF1KE6 ASFRVVSGGRSMAFGHYSEH-WKVQRRAAHSMMRNF-FTRQPRSRQ--VLEGHVLSEARE
.: ..:.:.::.:. : : ..:: :.. ...: .. .: : :: :: .::.
NP_000 YTFTLISNGQSMSFSPDSGPVWAARRRLAQNGLKSFSIASDPASSTSCYLEEHVSKEAEV
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pF1KE6 LVALLVRGSADGAFLDPRPLTVVAVANVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVG
:.. : . : . ..: .::.:.::. :.::: ::.:. :. :.. :..::..::
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pF1KE6 AGSLVDVMPWLQYFPNPVRTVFREFEQLNRNFSNFILDKFLRHCESLRPGAAPRDMMDAF
.:. .: .: :.:.::: ..:.. ::..: .:. .: .... : ::. :..
NP_000 SGNPADFIPILRYLPNPSLNAFKD---LNEKFYSFMQKMVKEHYKTFEKGHI-RDITDSL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ILSAEKKAAGDSHGGGARLDLENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRV
: ..: .. ....:. :.. . :.:::. ::..::..: :. .. : :: ..
NP_000 IEHCQEKQLDEN--ANVQLSDEKIINIVLDLFGAGFDTVTTAISWSLMYLVMNPRVQRKI
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pF1KE6 QAELDQVVGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPK
: ::: :.::.: : ..:. .:::. ::. :..: ::::: ::::.:: .::. :..:::
NP_000 QEELDTVIGRSRRPRLSDRSHLPYMEAFILETFRHSSFVPFTIPHSTTRDTSLKGFYIPK
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pF1KE6 DTVVFVNQWSVNHDPVKWPNPENFDPARFLDKDGLINKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEELS
::::::..::: : :: .: : ::: :: :.: :. .:.::..:::.:::: ..
NP_000 GRCVFVNQWQINHDQKLWVNPSEFLPERFLTPDGAIDKVLSEKVIIFGMGKRKCIGETIA
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pF1KE6 KMQLFLFISILAHQCDFRANPNEPAKMNFSYGLTIKPKSFKVNVTLRESMELLDSAVQNL
. ..:::..:: .. .: . . . :. ::::.:
NP_000 RWEVFLFLAILLQRVEFSVPLGVKVDMTPIYGLTMKHACCEHFQMQLRS
470 480 490 500 510
540
pF1KE6 QAKETCQ
>>NP_001306146 (OMIM: 108330) cytochrome P450 1A1 isofor (512 aa)
initn: 1175 init1: 626 opt: 1277 Z-score: 1587.6 bits: 303.4 E(85289): 1.1e-81
Smith-Waterman score: 1277; 40.1% identity (70.8% similar) in 504 aa overlap (13-512:2-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGTSLSPNDPWPLNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLRSAPPGPFAWPLI
: :.:.. : .:: .. : : : . . . ::::..::::
NP_001 MLFPISMSATEFLLASVIFCLVFWVIRASRPQVPKGLKNPPGPWGWPLI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GNAAAVGQAAHLSFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAF
:. ..:. ::...:....::::.:::.:: :.:::.: .:.::::.::. : :: .
NP_001 GHMLTLGKNPHLALSRMSQQYGDVLQIRIGSTPVVVLSGLDTIRQALVRQGDDFKGRPDL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE6 ASFRVVSGGRSMAFGHYSEH-WKVQRRAAHSMMRNF-FTRQPRSRQ--VLEGHVLSEARE
.: ..:.:.::.:. : : ..:: :.. ...: .. .: : :: :: .::.
NP_001 YTFTLISNGQSMSFSPDSGPVWAARRRLAQNGLKSFSIASDPASSTSCYLEEHVSKEAEV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LVALLVRGSADGAFLDPRPLTVVAVANVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVG
:.. : . : . ..: .::.:.::. :.::: ::.:. :. :.. :..::..::
NP_001 LISTLQELMAGPGHFNPYRYVVVSVTNVICAICFGRRYDHNHQELLSLVNLNNNFGEVVG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 AGSLVDVMPWLQYFPNPVRTVFREFEQLNRNFSNFILDKFLRHCESLRPGAAPRDMMDAF
.:. .: .: :.:.::: ..:.. ::..: .:. .: .... : ::. :..
NP_001 SGNPADFIPILRYLPNPSLNAFKD---LNEKFYSFMQKMVKEHYKTFEKGHI-RDITDSL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ILSAEKKAAGDSHGGGARLDLENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRV
: ..: .. ....:. :.. . :.:::. ::..::..: :. .. : :: ..
NP_001 IEHCQEKQLDEN--ANVQLSDEKIINIVLDLFGAGFDTVTTAISWSLMYLVMNPRVQRKI
290 300 310 320 330 340
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pF1KE6 QAELDQVVGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPK
: ::: :.::.: : ..:. .:::. ::. :..: ::::: ::::.:: .::. :..:::
NP_001 QEELDTVIGRSRRPRLSDRSHLPYMEAFILETFRHSSFVPFTIPHSTTRDTSLKGFYIPK
350 360 370 380 390 400
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pF1KE6 DTVVFVNQWSVNHDPVKWPNPENFDPARFLDKDGLINKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEELS
::::::..::: : :: .: : ::: :: :.: :. .:.::..:::.:::: ..
NP_001 GRCVFVNQWQINHDQKLWVNPSEFLPERFLTPDGAIDKVLSEKVIIFGMGKRKCIGETIA
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 KMQLFLFISILAHQCDFRANPNEPAKMNFSYGLTIKPKSFKVNVTLRESMELLDSAVQNL
. ..:::..:: .. .: . . . :. ::::.:
NP_001 RWEVFLFLAILLQRVEFSVPLGVKVDMTPIYGLTMKHACCEHFQMQLRS
470 480 490 500 510
540
pF1KE6 QAKETCQ
>>NP_000752 (OMIM: 124060) cytochrome P450 1A2 [Homo sap (516 aa)
initn: 1168 init1: 497 opt: 1224 Z-score: 1521.5 bits: 291.2 E(85289): 5.2e-78
Smith-Waterman score: 1224; 38.4% identity (70.5% similar) in 518 aa overlap (15-526:8-515)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGTSLSPNDPWPLNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLRSAPPGPFAWPLI
:.: : ::: ... : . :: : . ..:: :..:::.
NP_000 MALSQSVPFSA--TELLLASAIFCLVFWVLKGLRPRVPKGLKSPPEPWGWPLL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GNAAAVGQAAHLSFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAF
:.. ..:. ::...:...:::::.:::.:: :..::. .:.::::.::. : :: .
NP_000 GHVLTLGKNPHLALSRMSQRYGDVLQIRIGSTPVLVLSRLDTIRQALVRQGDDFKGRPDL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE6 ASFRVVSGGRSMAFGHYSEH-WKVQRRAAHSMMRNF-FTRQPRSRQ--VLEGHVLSEARE
. ... :.:..:. : : ..:: :.. . .: .. .: : . :: :: .::.
NP_000 YTSTLITDGQSLTFSTDSGPVWAARRRLAQNALNTFSIASDPASSSSCYLEEHVSKEAKA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LVALLVRGSADGAFLDPRPLTVVAVANVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVG
:.. : . : . .:: .::.::::..:.::: .. ... :. :.....:: .:..
NP_000 LISRLQELMAGPGHFDPYNQVVVSVANVIGAMCFGQHFPESSDEMLSLVKNTHEFVETAS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 AGSLVDVMPWLQYFPNPVRTVFREFEQLNRNFSNFILDKFLRHCESLRPGAAPRDMMDAF
.:. .: .: :.:.:::. ...:. .:. : :. .: ... ... ::. :.
NP_000 SGNPLDFFPILRYLPNPA---LQRFKAFNQRFLWFLQKTVQEHYQDFDKNSV-RDITGAL
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ILSAEKKAAGDSHGGGARLDLENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRV
. ..: ...: . :.. ..:::::. ::..::..: :. .. :..: ..
NP_000 FKHSKK----GPRASGNLIPQEKIVNLVNDIFGAGFDTVTTAISWSLMYLVTKPEIQRKI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 QAELDQVVGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPK
: ::: :.::.: : ..:.:.:::. ::. :..: :::.: ::::.:: .:.. :..:::
NP_000 QKELDTVIGRERRPRLSDRPQLPYLEAFILETFRHSSFLPFTIPHSTTRDTTLNGFYIPK
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pF1KE6 DTVVFVNQWSVNHDPVKWPNPENFDPARFLDKDGL-INKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEEL
::::::.::::: : .: .: : ::: :: ::: :. ..:.:..:::::::: :
NP_000 KCCVFVNQWQVNHDPELWEDPSEFRPERFLTADGTAINKPLSEKMMLFGMGKRRCIGEVL
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pF1KE6 SKMQLFLFISILAHQCDFRANPNEPAKMNFSYGLTIK-PKSFKVNVTLRESMELLDSAVQ
.: ..:::..:: .: .: . :. . .. ::::.: . .:.. :: :.
NP_000 AKWEIFLFLAILLQQLEFSVPPGVKVDLTPIYGLTMKHARCEHVQARLRFSIN
470 480 490 500 510
540
pF1KE6 NLQAKETCQ
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Smith-Waterman score: 1085; 36.7% identity (66.1% similar) in 504 aa overlap (13-512:2-470)
10 20 30 40 50 60
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: :.:.. : .:: .. : : : . . . ::::..::::
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10 20 30 40
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:. ..:. ::...:....::::.:::.:: :.:::.: .:.::::.::. : :: .
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.: ..:.:.::.:. : : ..:: :.. ...: .. .: : :: :: .::.
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110 120 130 140 150 160
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pF1KE6 LVALLVRGSADGAFLDPRPLTVVAVANVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVG
:.. : . : . ..: .::.:.::. :.::: ::.:. :. :.. :..::..::
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.:. .: .: :.:.::: ..:.. ::..: .:. .: .... : ::. :..
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pF1KE6 ILSAEKKAAGDSHGGGARLDLENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRV
: ..: .. ....:. :.. . :.:::. ::..::..: :. .. : :: ..
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: ::: :.::.: : ..:. .:::. ::. :..: ::::: ::::
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: :: .: : ::: :: :.: :. .:.::..:::.:::: ..
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pF1KE6 KMQLFLFISILAHQCDFRANPNEPAKMNFSYGLTIKPKSFKVNVTLRESMELLDSAVQNL
. ..:::..:: .. .: . . . :. ::::.:
NP_001 RWEVFLFLAILLQRVEFSVPLGVKVDMTPIYGLTMKHACCEHFQMQLRS
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540
pF1KE6 QAKETCQ
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Smith-Waterman score: 955; 32.4% identity (62.0% similar) in 574 aa overlap (8-523:13-562)
10 20 30 40
pF1KE6 MGTSLSPNDPWP-------LNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLR
. ::: :. : .. . ::: :... .: :: ::. :
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. :::: :::.:: ::.. .. .. .:.::: ::..
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90 100 110 120 130
pF1KE6 FQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAFASFRVVS---GGR-----------
:.. .: .:::. .....:::::. .:.::: . .:. : :
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...:.::. :. ::. .:: .:.: .. :: ... : . . : . . .
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: : :.... ::.:.. ..::: :... . ::...:. . : . .: ::
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250 260 270 280 290
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.. ::: :.: .: :.:..:.......: : :... : ::: :.:..: ..:
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300 310 320 330 340 350
pF1KE6 AEKKAAGDSHGGGARLDLENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRVQAE
:.. ..:. . .: : . : :.: :. :: ...: : :: .. :::: .:. :
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pF1KE6 LDQVVGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPKDTV
...:.: .: : . :. ..::. : ..:..:.. ::..::: :. :: . :: ::: :.
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420 430 440 450 460 470
pF1KE6 VFVNQWSVNHDPVKWPNPENFDPARFLDKDGLINKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEELSKMQ
.. : :::..::. : .::.: : :::: .: . : : . :..::: :.::.:.::.
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pF1KE6 LFLFISILAHQCDFRANPNEPAK--MNFSYGLTIKPKSFKVNVTLRESMELLDSAVQNLQ
:::.. : .. : : :.. : .. .:::. :. :..... :
XP_005 LFLMFVSLMQSFAF-ALPEDSKKPLLTGRFGLTLAPHPFNITISRR
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540
pF1KE6 AKETCQ
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Smith-Waterman score: 772; 28.2% identity (63.6% similar) in 500 aa overlap (42-525:19-498)
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pF1KE6 PLNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLRSAPPGPFAWPLIGNAAAVGQAAH
.:: . : . .. ::.:. . . .:
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pF1KE6 L--SFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAFASFRVVSGG
. .: .: ..:: ....:.:. :... .. ...:...:. :. :: .:.. ..:..
NP_000 MHNNFFKLQKKYGPIYSVRMGTKTTVIVGHHQLAKEVLIKKGKDFSGRPQMATLDIASNN
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pF1KE6 RS-MAFGHYSEHWKVQRRAAHSMMRNFFTRQPRSRQVLEGHVLSEARELVALLVRGSADG
:. .::. . ::...:: : . . : . : :: . .: : .:. . .:
NP_000 RKGIAFADSGAHWQLHRRLAMATFALF----KDGDQKLEKIICQEISTLCDMLA--THNG
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.: . :::.::.: .::. :.. :::. . ..:: . ... ::::..:::.
NP_000 QSIDISFPVFVAVTNVISLICFNTSYKNGDPELNVIQNYNEGIIDNLSKDSLVDLVPWLK
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::: . .. .. .. : ::... :..: . .:.:... . : .:.
NP_000 IFPNKTLEKLKSHVKIRNDLLNKILENY---KEKFRSDSIT-NMLDTLM---QAKMNSDN
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pF1KE6 HGGGARLDLE-----NVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRVQAELDQV
..: : : .. .:: :::::. .: .....: : .. . :.:. .. :.::
NP_000 GNAGPDQDSELLSDNHILTTIGDIFGAGVETTTSVVKWTLAFLLHNPQVKKKLYEEIDQN
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pF1KE6 VGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPKDTVVFVN
:: .: : ..:. : . : . :..:. .:. ::: .....:. . . : : :..:
NP_000 VGFSRTPTISDRNRLLLLEATIREVLRLRPVAPMLIPHKANVDSSIGEFAVDKGTEVIIN
340 350 360 370 380 390
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pF1KE6 QWSVNHDPVKWPNPENFDPARFLDKDG--LINKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEELSKMQLF
:...:. .: .:..: : :::. : ::. ... . :..: : :::: :....::
NP_000 LWALHHNEKEWHQPDQFMPERFLNPAGTQLISPSVS--YLPFGAGPRSCIGEILARQELF
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pF1KE6 LFISILAHQCDFRANPNEPAKMNFSYGLTIKPK------SFKVNVTLRESMELLDSAVQN
:... : .. :... :.. ... :. :: ::::.. .:..
NP_000 LIMAWLLQRFDLEV-PDD-GQLPSLEGI---PKVVFLIDSFKVKIKVRQAWREAQAEGST
460 470 480 490 500
540
pF1KE6 LQAKETCQ
>>NP_898898 (OMIM: 610670,615030) cytochrome P450 2U1 [H (544 aa)
initn: 894 init1: 390 opt: 737 Z-score: 914.4 bits: 178.9 E(85289): 3.4e-44
Smith-Waterman score: 1002; 33.2% identity (63.7% similar) in 564 aa overlap (2-523:5-544)
10 20 30 40
pF1KE6 MGTSLSPND--PWP-------LNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLR
: : : . ::: :. : .. . ::: :... .: ::.:: :
NP_898 MSSPGPSQPPAEDPPWPARLLRAPLGLLRLDPSGGALLLCGLVAL-LGWSWLRRRRA--R
10 20 30 40 50
50 60 70 80
pF1KE6 SAPPGPFAWPLIGN---------------------AAAVGQAA---HLSFARLARRYGDV
. :::: :::.:: ::.. .. .. .:.::: ::..
NP_898 GIPPGPTPWPLVGNFGHVLLPPFLRRRSWLSSRTRAAGIDPSVIGPQVLLAHLARVYGSI
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 FQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAFASFRVVSGGRSMAFGHYSEHWKVQ
:.. .: .:::. .....:::::. .:.::: . .:. ....:.::. :. :
NP_898 FSFFIGHYLVVVLSDFHSVREALVQQAEVFSDRPRVPLISIVTKEKGVVFAHYGPVWRQQ
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 RRAAHSMMRNFFTRQPRSRQVLEGHVLSEARELVALLVRGSADGAFLDPRPLTVV--AVA
:. .:: .:.: .. :: ... : . . : . . . : : :.... ::.
NP_898 RKFSHSTLRHF----GLGKLSLEPKIIEEFKYVKAEMQKHGED-PFC---PFSIISNAVS
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pF1KE6 NVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVGAGS---LVDVMPWLQYFP-NPVRTVF
:.. ..::: :... . ::...:. . : . .: ::.. ::: :.: .: :
NP_898 NIICSLCFGQRFDYTNSEFKKMLGFMSR-GLEICLNSQVLLVNICPWLYYLPFGP----F
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pF1KE6 REFEQLNRNFSNFILDKFLR-HCESLRPGAAPRDMMDAFILSAEKKAAGDSHGGGARLDL
.:..:.......: : :... : ::: :.:..: ..: :.. ..:... .:
NP_898 KELRQIEKDITSF-LKKIIKDHQESL-DRENPQDFIDMYLLHMEEERKNNSNSS---FDE
290 300 310 320 330
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pF1KE6 ENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRVQAELDQVVGRDRLPCMGDQPN
: . : :.: :. :: ...: : :: .. :::: .:. :...:.: .: : . :. .
NP_898 EYLFYIIGDLFIAGTDTTTNSLLWCLLYMSLNPDVQEKVHEEIERVIGANRAPSLTDKAQ
340 350 360 370 380 390
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pF1KE6 LPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPKDTVVFVNQWSVNHDPVKWPNP
.::. : ..:..:.. ::..::: :. :: . :: ::: :... : :::..::. : .:
NP_898 MPYTEATIMEVQRLTVVVPLAIPHMTSENTVLQGYTIPKGTLILPNLWSVHRDPAIWEKP
400 410 420 430 440 450
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pF1KE6 ENFDPARFLDKDGLINKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEELSKMQLFLFISILAHQCDFRANP
:.: : :::: .: . : : . :..::: :.::.:.::.:::.. : .. : : :
NP_898 EDFYPNRFLDDQGQLIKKET--FIPFGIGKRVCMGEQLAKMELFLMFVSLMQSFAF-ALP
460 470 480 490 500 510
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pF1KE6 NEPAK--MNFSYGLTIKPKSFKVNVTLRESMELLDSAVQNLQAKETCQ
.. : .. .:::. :. :..... :
NP_898 EDSKKPLLTGRFGLTLAPHPFNITISRR
520 530 540
>>XP_016877442 (OMIM: 108330) PREDICTED: cytochrome P450 (484 aa)
initn: 1070 init1: 626 opt: 698 Z-score: 866.6 bits: 169.9 E(85289): 1.6e-41
Smith-Waterman score: 1129; 38.3% identity (66.7% similar) in 504 aa overlap (13-512:2-471)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGTSLSPNDPWPLNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLRSAPPGPFAWPLI
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XP_016 MLFPISMSATEFLLASVIFCLVFWVIRASRPQVPKGLKNPPGPWGWPLI
10 20 30 40
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pF1KE6 GNAAAVGQAAHLSFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAF
:. ..:. ::...:....::::.:::.:: :.:::.: .:.::::.::. : :: .
XP_016 GHMLTLGKNPHLALSRMSQQYGDVLQIRIGSTPVVVLSGLDTIRQALVRQGDDFKGRPDL
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pF1KE6 ASFRVVSGGRSMAFGHYSEH-WKVQRRAAHSMMRNF-FTRQPRSRQ--VLEGHVLSEARE
.: ..:.:.::.:. : : ..:: :.. ...: .. .: : :: :: .::.
XP_016 YTFTLISNGQSMSFSPDSGPVWAARRRLAQNGLKSFSIASDPASSTSCYLEEHVSKEAEV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LVALLVRGSADGAFLDPRPLTVVAVANVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVG
:.. : . : . ..: .::.:.::. :.::: ::.:. .::::
XP_016 LISTLQELMAGPGHFNPYRYVVVSVTNVICAICFGRRYDHNH---QELLS----------
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 AGSLVDVMPWLQYFPNPVRTVFREFEQLNRNFSNFILDKFLRHCESLRPGAAPRDMMDAF
::.. :..::..: .:. .: .... : ::. :..
XP_016 ---LVNL---------------NAFKDLNEKFYSFMQKMVKEHYKTFEKGHI-RDITDSL
220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ILSAEKKAAGDSHGGGARLDLENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRV
: ..: .. ....:. :.. . :.:::. ::..::..: :. .. : :: ..
XP_016 IEHCQEKQLDEN--ANVQLSDEKIINIVLDLFGAGFDTVTTAISWSLMYLVMNPRVQRKI
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 QAELDQVVGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPK
: ::: :.::.: : ..:. .:::. ::. :..: ::::: ::::.:: .::. :..:::
XP_016 QEELDTVIGRSRRPRLSDRSHLPYMEAFILETFRHSSFVPFTIPHSTTRDTSLKGFYIPK
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:: : : . : .: ::.::::...:. :.::::: :...::: .: ::::
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.... : ::.. ...:. :. ::: . : .::. ... :: : ::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]