Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6756
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6756, 812 aa
1>>>pF1KE6756 812 - 812 aa - 812 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6716+/-0.0014; mu= 18.4208+/- 0.084
mean_var=73.0340+/-14.691, 0's: 0 Z-trim(99.1): 79 B-trim: 16 in 2/48
Lambda= 0.150076
statistics sampled from 5549 (5628) to 5549 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.501), E-opt: 0.2 (0.173), width: 16
Scan time: 3.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5371.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 812) 5161 1127.9 0
CCDS55090.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 (1257) 5161 1128.0 0
CCDS5605.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1279) 2425 535.6 1.9e-151
CCDS5606.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1286) 2401 530.4 7.2e-150
CCDS5608.1 ABCB1 gene_id:5243|Hs108|chr7 (1280) 2372 524.1 5.6e-148
CCDS46444.1 ABCB11 gene_id:8647|Hs108|chr2 (1321) 1904 422.8 1.8e-117
CCDS5607.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1232) 1342 301.1 7.3e-81
CCDS4758.1 TAP1 gene_id:6890|Hs108|chr6 ( 808) 847 193.9 9.3e-49
CCDS55092.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 126) 784 179.8 2.4e-45
CCDS55091.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 131) 784 179.8 2.5e-45
CCDS8693.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 722 166.9 2.3e-40
CCDS8694.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 711 164.6 1.2e-39
CCDS64798.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 630) 658 152.9 1.6e-36
CCDS5913.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 718) 658 152.9 1.8e-36
CCDS64799.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 735) 658 152.9 1.8e-36
CCDS1580.1 ABCB10 gene_id:23456|Hs108|chr1 ( 738) 622 145.1 4e-34
CCDS2436.1 ABCB6 gene_id:10058|Hs108|chr2 ( 842) 568 133.5 1.5e-30
CCDS58286.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 703) 558 131.3 5.7e-30
CCDS9241.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 766) 558 131.3 6.1e-30
CCDS64800.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 693) 512 121.3 5.6e-27
CCDS4896.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1464) 494 117.6 1.6e-25
CCDS56430.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1492) 494 117.6 1.6e-25
CCDS7484.1 ABCC2 gene_id:1244|Hs108|chr10 (1545) 491 116.9 2.6e-25
CCDS43176.1 ABCC5 gene_id:10057|Hs108|chr3 (1437) 473 113.0 3.6e-24
CCDS65290.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 712) 468 111.8 4.2e-24
CCDS75994.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 713) 468 111.8 4.2e-24
CCDS65291.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 752) 468 111.8 4.4e-24
CCDS14428.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 753) 468 111.8 4.4e-24
CCDS10568.1 ABCC6 gene_id:368|Hs108|chr16 (1503) 461 110.4 2.3e-23
CCDS9474.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 (1325) 456 109.3 4.3e-23
CCDS31437.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1581) 437 105.2 8.7e-22
CCDS73264.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1582) 437 105.2 8.7e-22
CCDS78129.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 686) 432 104.0 9.1e-22
CCDS58287.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 681) 397 96.4 1.7e-19
CCDS58288.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 683) 397 96.4 1.7e-19
CCDS42122.1 ABCC1 gene_id:4363|Hs108|chr16 (1531) 370 90.7 2e-17
CCDS5773.1 CFTR gene_id:1080|Hs108|chr7 (1480) 363 89.2 5.5e-17
CCDS10730.1 ABCC12 gene_id:94160|Hs108|chr16 (1359) 358 88.1 1.1e-16
CCDS4755.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 653) 351 86.4 1.7e-16
CCDS10732.1 ABCC11 gene_id:85320|Hs108|chr16 (1382) 330 82.0 7.3e-15
CCDS32681.1 ABCC3 gene_id:8714|Hs108|chr17 (1527) 327 81.4 1.3e-14
CCDS10466.1 ABCA3 gene_id:21|Hs108|chr16 (1704) 315 78.8 8.3e-14
CCDS76643.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 ( 784) 306 76.7 1.7e-13
CCDS45061.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 ( 859) 306 76.7 1.8e-13
CCDS6762.1 ABCA1 gene_id:19|Hs108|chr9 (2261) 310 77.8 2.2e-13
CCDS12055.1 ABCA7 gene_id:10347|Hs108|chr19 (2146) 299 75.4 1.1e-12
CCDS747.1 ABCA4 gene_id:24|Hs108|chr1 (2273) 295 74.6 2.1e-12
CCDS11685.1 ABCA5 gene_id:23461|Hs108|chr17 (1642) 288 73.0 4.6e-12
CCDS43909.1 ABCA2 gene_id:20|Hs108|chr9 (2436) 286 72.6 8.8e-12
CCDS11683.1 ABCA6 gene_id:23460|Hs108|chr17 (1617) 273 69.7 4.3e-11
>>CCDS5371.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 (812 aa)
initn: 5161 init1: 5161 opt: 5161 Z-score: 6036.8 bits: 1127.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5161; 100.0% identity (100.0% similar) in 812 aa overlap (1-812:1-812)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVDENDIRALNVRHYRDHIGVVSQEPVLFGTTISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MVDENDIRALNVRHYRDHIGVVSQEPVLFGTTISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FIMEFPNKFNTLVGEKGAQMSGGQKQRIAIARALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FIMEFPNKFNTLVGEKGAQMSGGQKQRIAIARALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTLKDGMLAEKGAHAELMAKRGLYYSLVMSQDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTLKDGMLAEKGAHAELMAKRGLYYSLVMSQDI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 KKADEQMESMTYSTERKTNSLPLHSVKSIKSDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KKADEQMESMTYSTERKTNSLPLHSVKSIKSDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKLN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KPEWPFVVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAKIITMFGNNDKTTLKHDAEIYSMIFVILGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KPEWPFVVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAKIITMFGNNDKTTLKHDAEIYSMIFVILGVI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGLTTILAIDIAQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGLTTILAIDIAQI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 QGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMIETAAMTGFANK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMIETAAMTGFANK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 DKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQHRNTSKKAQIIGSCYAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQHRNTSKKAQIIGSCYAFS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 HAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGRMTPEGMFIVFTAIAYGAMAIGETLVLAPEYSKAKSGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGRMTPEGMFIVFTAIAYGAMAIGETLVLAPEYSKAKSGA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 AHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPDVFILRGLSLSIERGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPDVFILRGLSLSIERGKT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 VAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVLFDGVDAKELNVQWLRSQIAIVPQEPVLFNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVLFDGVDAKELNVQWLRSQIAIVPQEPVLFNC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 SIAENIAYGDNSRVVPLDEIKEAANAANIHSFIEGLPEKYNTQVGLKGAQLSGGQKQRLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SIAENIAYGDNSRVVPLDEIKEAANAANIHSFIEGLPEKYNTQVGLKGAQLSGGQKQRLA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 IARALLQKPKILLLDEATSALDNDSEKVVQHALDKARTGRTCLVVTHRLSAIQNADLIVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IARALLQKPKILLLDEATSALDNDSEKVVQHALDKARTGRTCLVVTHRLSAIQNADLIVV
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KE6 LHNGKIKEQGTHQELLRNRDIYFKLVNAQSVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LHNGKIKEQGTHQELLRNRDIYFKLVNAQSVQ
790 800 810
>>CCDS55090.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 (1257 aa)
initn: 5161 init1: 5161 opt: 5161 Z-score: 6033.9 bits: 1128.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5161; 100.0% identity (100.0% similar) in 812 aa overlap (1-812:446-1257)
10 20 30
pF1KE6 MVDENDIRALNVRHYRDHIGVVSQEPVLFG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TVALVGLNGSGKSTVVQLLQRLYDPDDGFIMVDENDIRALNVRHYRDHIGVVSQEPVLFG
420 430 440 450 460 470
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 TTISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYDFIMEFPNKFNTLVGEKGAQMSGGQKQRIAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TTISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYDFIMEFPNKFNTLVGEKGAQMSGGQKQRIAI
480 490 500 510 520 530
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 ARALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQAALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ARALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQAALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTL
540 550 560 570 580 590
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 KDGMLAEKGAHAELMAKRGLYYSLVMSQDIKKADEQMESMTYSTERKTNSLPLHSVKSIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KDGMLAEKGAHAELMAKRGLYYSLVMSQDIKKADEQMESMTYSTERKTNSLPLHSVKSIK
600 610 620 630 640 650
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 SDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKLNKPEWPFVVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKLNKPEWPFVVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAK
660 670 680 690 700 710
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 IITMFGNNDKTTLKHDAEIYSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IITMFGNNDKTTLKHDAEIYSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKA
720 730 740 750 760 770
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 MLYQDIAWFDEKENSTGGLTTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MLYQDIAWFDEKENSTGGLTTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGW
780 790 800 810 820 830
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 EMTFLILSIAPVLAVTGMIETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EMTFLILSIAPVLAVTGMIETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKA
840 850 860 870 880 890
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 FEQMYEEMLQTQHRNTSKKAQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGRMTPEGMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FEQMYEEMLQTQHRNTSKKAQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGRMTPEGMF
900 910 920 930 940 950
520 530 540 550 560 570
pF1KE6 IVFTAIAYGAMAIGETLVLAPEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IVFTAIAYGAMAIGETLVLAPEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNL
960 970 980 990 1000 1010
580 590 600 610 620 630
pF1KE6 EFREVSFFYPCRPDVFILRGLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EFREVSFFYPCRPDVFILRGLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
640 650 660 670 680 690
pF1KE6 FDGVDAKELNVQWLRSQIAIVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSRVVPLDEIKEAANAANIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FDGVDAKELNVQWLRSQIAIVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSRVVPLDEIKEAANAANIH
1080 1090 1100 1110 1120 1130
700 710 720 730 740 750
pF1KE6 SFIEGLPEKYNTQVGLKGAQLSGGQKQRLAIARALLQKPKILLLDEATSALDNDSEKVVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SFIEGLPEKYNTQVGLKGAQLSGGQKQRLAIARALLQKPKILLLDEATSALDNDSEKVVQ
1140 1150 1160 1170 1180 1190
760 770 780 790 800 810
pF1KE6 HALDKARTGRTCLVVTHRLSAIQNADLIVVLHNGKIKEQGTHQELLRNRDIYFKLVNAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HALDKARTGRTCLVVTHRLSAIQNADLIVVLHNGKIKEQGTHQELLRNRDIYFKLVNAQS
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE6 VQ
::
CCDS55 VQ
>--
initn: 653 init1: 368 opt: 683 Z-score: 794.0 bits: 158.5 E(32554): 6.6e-38
Smith-Waterman score: 683; 29.3% identity (65.6% similar) in 433 aa overlap (217-627:20-443)
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MESMTYSTERKTNSLPLHSVKSIKSDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKLNKPEWPF
:::. . .. .. . .... . . .
CCDS55 MENSERAEEMQENYQRNGTAEEQPKLRKEAVGSIEIFRFA--DGLDITL
10 20 30 40
250 260 270 280 290
pF1KE6 VVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAKI-------------ITMFGNNDKTT--LKHDAEIYS
..:: :::..::. :.. ...... : . : .. :..: . .
CCDS55 MILGILASLVNGACLPLMPLVLGEMSDNLISGCLVQTNTTNYQNCTQSQEKLNEDMTLLT
50 60 70 80 90 100
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 MIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGLTT
. .: .:: .. ..: .. .. : :.:. :...: :::.::: . : :.:
CCDS55 LYYVGIGVAALIFGYIQISLWIITAARQTKRIRKQFFHSVLAQDIGWFDSCD--IGELNT
110 120 130 140 150 160
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 ILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMIET
.. :: .:. . :..:..: :: ....... .... ::..:.. :: .:.. ... .
CCDS55 RMTDDIDKISDGIGDKIALLFQNMSTFSIGLAVGLVKGWKLTLVTLSTSPLIMASAAACS
170 180 190 200 210 220
420 430 440 450 460
pF1KE6 AAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQH-----RNT
. ....:. . ..:: .: :.: .:::.... .. : : . :. . :.
CCDS55 RMVISLTSKELSAYSKAGAVAEEVLSSIRTVIAFRAQEKELQRYTQNLKDAKDFGIKRTI
230 240 250 260 270 280
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 SKKAQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGR--MTPEGMFIVFTAIAYGAMAIG
..:... :. : : .. .:. .: .:. :: :. .: .. :: .. .... ::
CCDS55 ASKVSL-GAVYFFMNG----TYGLAFWYGTSLILNGEPGYTIGTVLAVFFSVIHSSYCIG
290 300 310 320 330 340
530 540 550 560 570 580
pF1KE6 ETLVLAPEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPD
.. .. :...: :.: ...:::.::. : : ::.. ::..::..::: :: ::.
CCDS55 AAVPHFETFAIARGAAFHIFQVIDKKPSIDNFSTAGYKPESIEGTVEFKNVSFNYPSRPS
350 360 370 380 390 400
590 600 610 620 630 640
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CCDS56 VALVGNSGCGKSTTVQLMQRLYDPTEGMVSVDGQDIRTINVRFLREIIGVVSQEPVLFAT
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CCDS56 TIAENIRYGRENVTMDEIEKAVKEANAYDFIMKLPHKFDTLVGERGAQLSGGQKQRIAIA
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pF1KE6 RALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQAALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTLK
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CCDS56 RALVRNPKILLLDEATSALDTESEAVVQVALDKARKGRTTIVIAHRLSTVRNADVIAGFD
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pF1KE6 DGMLAEKGAHAELMAKRGLYYSLVMSQDI-------KKADE---QMESMTYSTERKTNSL
::...::: : ::: ..:.:..:: : . ::: ..... .:.. . .::
CCDS56 DGVIVEKGNHDELMKEKGIYFKLVTMQTAGNEVELENAADESKSEIDALEMSSNDSRSSL
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pF1KE6 --PLHSVKSIK-SDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKLNKPEWPFVVLGTLASVLNG
. .:.. :. :. . .. . :.: ::. .:.::: :::. :.:.. ...::
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pF1KE6 TVHPVFSIIFAKIITMFGN-NDKTTLKHDAEIYSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGE
..:.:.:::.::: .: .: : .......:..:. ::.: :...:.::. .:.:::
CCDS56 GLQPAFAIIFSKIIGVFTRIDDPETKRQNSNLFSLLFLALGIISFITFFLQGFTFGKAGE
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pF1KE6 ILTMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGLTTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATN
::: :::...:..:: ::..:::. .:.::.::: :: : ::..:: :::..:.::: .:
CCDS56 ILTKRLRYMVFRSMLRQDVSWFDDPKNTTGALTTRLANDAAQVKGAIGSRLAVITQNIAN
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pF1KE6 MGLSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMIETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALE
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CCDS56 LGTGIIISFIYGWQLTLLLLAIVPIIAIAGVVEMKMLSGQALKDKKELEGSGKIATEAIE
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:. :. : ...::.:...::::.:.. .::.:.::: .:::.. ..:: : ::: :
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:: :.: :::. : :: : :: :::. .:.:::: ...:.:.:.:::::::::: :::
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:.:.:::. :.::.:: . :.:::::::....:: :::.::.::::::::::::::::
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.:: .::. ::::.:::.::.::.:.:: ::.:::::::::.::::::...:.:::::::
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:::::..::::::.:::::: ::::.:..::::.:::::::::..::..::.::::.::
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pF1KE6 NRDIYFKLVNAQSVQ
.. :::..:..:.
CCDS56 QKGIYFSMVSVQAGTKRQ
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>--
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:..:. ..: ..:. . : ::......
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: . ..:.::::....:. :.. ..:... .:.: ::
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.:..: :.. . .:. .:. ..: :. :. ..:. :.:.. :.:.:
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:: .. .: :.: :. :...:. . :..::.. :. ... . :..: ::..:..::.
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:.:::.... . . ...:..:. .:: .: :.: :::.... .: . :..
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::...:.. ...:...: ..: ....::.::: :. :.:::. .::::::.: :
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:: : .: ::.::.:... :.:::.::.:::::::.:::.::::::..:.:
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CCDS56 INVRFLREIIGVVSQEPVLFATTIAENIRYGRENVTMDEIEKAVKEANAYDFIMKLPHKF
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. :.:: ....::.:: :::...:.::: :::::::. .:: :.::: :: : .:.::
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....: .:..:.:.:::. . .: :..:.. .: :.:... .: :.::: .::.
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::::::::::::.:::.:.::: ::.:..:: :.:..:::.:::.:.:: :::::: :::
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::... ::::::::::::::..:::.:: :::::: ::::.:..::::.:::::.:.:.
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CCDS56 IYFSMVSVQAGTQNL
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>--
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CCDS56 NTRLTDDISKISEGIGDKVGMFFQAVATFFAGFIVGFIRGWKLTLVIMAISPILGLSAAV
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. ...:..:. .:: .: ::: :::.... .. . :.. :.. .. ::
CCDS56 WAKILSAFSDKELAAYAKAGAVAEEALGAIRTVIAFGGQNKELERYQKHLENAKEIGIKK
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CCDS56 AISANISMGIAFLLIYASYALAFWYGSTLVISKEYTIGNAMTVFFSILIGAFSVGQAAPC
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CCDS56 IDAFANARGAAYVIFDIIDNNPKIDSFSERGHKPDSIKGNLEFNDVHFSYPSRANVKILK
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CCDS56 GLNLKVQSGQTVALVGSSGCGKSTTVQLIQRLYDPDEGTINIDGQDIRNFNVNYLREIIG
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CCDS56 VVSQEPVLFSTTIAENICYGRGNVTMDEIKKAVKEANAYEFIMKLPQKFDTLVGERGAQL
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CCDS47 GSAD--TFTRNLTLMSILTIASAVLEFVG---DGIYNNTMGHVHS-HLQGEVFGAVLRQE
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CCDS47 TEFF--QQNQTGNIMSRVTEDTSTLSDSLSENLSLFLWYLVR-GLCLLGIMLWGSVSLTM
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CCDS47 VTLITLPLLFLLPKKVGKWYQLLEVQVRESLAKSSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEAQK
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CCDS47 VLYQMQFTQAVEVLLSIYPRVQKAVGSSEKIFEYLDRTPRCPPSGLL--TPLHLEGLVQF
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CCDS47 QDVSFAYPNRPDVLVLQGLTFTLRPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLD
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CCDS47 GKPLPQYEHRYLHRQVAAVGQEPQVFGRSLQENIAYGLTQKPT-MEEITAAAVKSGAHSF
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: .. : .:. :..:..:: ...:: :. :..: :.: ::::.:.... :. .:.:
CCDS47 LYESPERYSRSVLLITQHLSLVEQADHILFLEGGAIREGGTHQQLMEKKGCYWAMVQAPA
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CCDS47 DAPE
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::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]