Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6747
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6747, 856 aa
1>>>pF1KE6747 856 - 856 aa - 856 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8079+/-0.000935; mu= 18.9544+/- 0.057
mean_var=77.8073+/-15.674, 0's: 0 Z-trim(106.2): 27 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.145400
statistics sampled from 8841 (8853) to 8841 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16
Scan time: 2.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9254.1 ATP6V0A2 gene_id:23545|Hs108|chr12 ( 856) 5694 1204.4 0
CCDS5849.1 ATP6V0A4 gene_id:50617|Hs108|chr7 ( 840) 2248 481.5 2.6e-135
CCDS45683.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 838) 1830 393.9 6.4e-109
CCDS11426.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 831) 1825 392.8 1.3e-108
CCDS45684.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 837) 1288 280.2 1.1e-74
CCDS53670.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 ( 614) 1217 265.2 2.5e-70
CCDS8177.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 ( 830) 1217 265.3 3.2e-70
>>CCDS9254.1 ATP6V0A2 gene_id:23545|Hs108|chr12 (856 aa)
initn: 5694 init1: 5694 opt: 5694 Z-score: 6449.4 bits: 1204.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5694; 100.0% identity (100.0% similar) in 856 aa overlap (1-856:1-856)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE
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CCDS92 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQRLGAKLGFVSGLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQRLGAKLGFVSGLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 NQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 ICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRVI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 QVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 QVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNII
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 PTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 PTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGFV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 MFLFALLLVLNENHPRLNQSQEIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVNLFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MFLFALLLVLNENHPRLNQSQEIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVNLFG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 SGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGIDPIWNLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGIDPIWNLA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 TNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLCIFGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 TNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLCIFGY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 LIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSGLYTGQEYVQRVLLVVTALSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSGLYTGQEYVQRVLLVVTALSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 PVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEVSLLGSQDIEEGNHQVEDGCRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 PVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEVSLLGSQDIEEGNHQVEDGCRE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 MACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLWAMLMRVGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLWAMLMRVGLR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE6 VDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYVGAGTKFVPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 VDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYVGAGTKFVPF
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE6 SFSLLSSKFNNDDSVA
::::::::::::::::
CCDS92 SFSLLSSKFNNDDSVA
850
>>CCDS5849.1 ATP6V0A4 gene_id:50617|Hs108|chr7 (840 aa)
initn: 2906 init1: 1005 opt: 2248 Z-score: 2542.8 bits: 481.5 E(32554): 2.6e-135
Smith-Waterman score: 2892; 52.5% identity (78.7% similar) in 851 aa overlap (1-842:1-830)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE
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CCDS58 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK
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CCDS58 LERILRFLEDEM-QNEIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQ-RLGAKLGFVSGL
..::: : ..:. :. : . .... ..: . ....::. . . . .::::..:.
CCDS58 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLA---DDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 INQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVK
::. .. .::..:::.:.: . ....:.: :::: : : :. .:.: . :::. .:.:
CCDS58 INRERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRV
:::: .. ::: :. : ::::. :..:.:..:: ::. .::.. ...: .:: . .: .
CCDS58 KICDGFRATVYPCPEPAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 IQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNI
:.:.::::.::.::::..:::..:.:::.: : :: ..::::.: . ::... .:.
CCDS58 IKVQKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 IPTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGF
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CCDS58 VQSKTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 VMFLFALLLVLNENHPRLNQS--QEIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVN
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CCDS58 VMLLAALWMILNERR-LLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLN
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 LFGSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRG-PYPLGIDPI
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CCDS58 IFGSSWSVQPMFRNG----------TWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPI
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 WNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLC
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CCDS58 WNLASNKLTFLNSYKMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILC
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE6 IFGYLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSG--LYTGQEYVQRVLLV
.::::.:::..:: :....:. ::::::.::::::: : .:. :: :. :: ..:
CCDS58 LFGYLVFMIIFKWCCFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVV
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE6 VTALSVPVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEV-SLLGSQDIEEGNHQ
.. .::: ..: :: :.: . .: . ..: :..:. :.. . .: . . :..
CCDS58 MALISVPWMLLIKP-FILRASHRKSQLQASR-----IQEDATENIEGDSSSPSSRSGQRT
650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE6 VED--GCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLW
: : . ::::::.... :.::.::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS58 SADTHGALDDHGEEFNFGDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLW
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KE6 AMLMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYV
.:.: ::.. :.. .. ..:.:::::. ::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS58 TMVMNSGLQTRGWGGIVGVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYV
760 770 780 790 800 810
840 850
pF1KE6 GAGTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA
: : :: ::::
CCDS58 GDGYKFSPFSFKHILDGTAEE
820 830 840
>>CCDS45683.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (838 aa)
initn: 2884 init1: 1049 opt: 1830 Z-score: 2069.0 bits: 393.9 E(32554): 6.4e-109
Smith-Waterman score: 2989; 54.3% identity (79.1% similar) in 851 aa overlap (1-842:1-828)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE
:: ::::: : :::::::: .:: :.: ::: : ::::::: .:. ::::::.::.::::
CCDS45 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK
..: : .. .:: .:.::. . .: .: ....... ...:.: ::.:.. :.: :..
CCDS45 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSL--ESDSLLDYSCMQR-LGAKLGFVS
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CCDS45 NFLELTELKFILRKTQQFFDE-AELHHQQMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GLINQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHK
:.::. .. .::.::::::.: ... ::... :::: ::. .. ::.: : :.:. ..
CCDS45 GVINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 VKKICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYS
:::::. .. .:: :.: .::.:. :.::::.:: ::..:::. ..:: ::...
CCDS45 VKKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 RVIQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFM
:.:.::::::: ::.:..:::.:::::::::: .::.... ::..:...::.:.::..
CCDS45 WFIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSIL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 NIIPTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGH
: . :..:::: .::::: ::::::::::.:.:::.::: .::::::::::::::::::
CCDS45 NRMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGH
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 GFVMFLFALLLVLNENHPRLNQSQEIMRMF---FNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSK
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CCDS45 GILMTLFAVWMVLRESRI-LSQKNE-NEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 SVNLFGSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGID
:.:.:::.:.: :.. . :.. ..: : .:::.:..:::: ::::.:::
CCDS45 SLNIFGSSWSVRPMFTYN-----------WTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGID
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 PIWNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFM
::::.:::.:::::::::::::::::::: ::: :..:::..:.: .:::. :::..::
CCDS45 PIWNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFM
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE6 LCIFGYLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLF--PASKTSGLYTGQEYVQRVL
.::::...::::: ...:.::. :::.::.::::::: : : : ::.::. .: :
CCDS45 TSLFGYLVILIFYKWTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFL
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE6 LVVTALSVPVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFG-VNRSGYTLIRKDSEEEVSLLGSQDIEEGN
.::. : :: ..: ::: : . :. .: .: .: . .::.. .. : . ..
CCDS45 VVVALLCVPWMLLFKPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEII--QHDQLST
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KE6 HQVEDGCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLW
:. ::. .::.::. .. :.::.::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS45 HS-EDA------DEFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLW
710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KE6 AMLMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYV
.:....:: : . : :.:. .. ::.::. ::::::::::::::.::::::::::::
CCDS45 TMVIHIGLSVKSLAGGLVLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYS
760 770 780 790 800 810
840 850
pF1KE6 GAGTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA
:.: ::.::::
CCDS45 GTGFKFLPFSFEHIREGKFEE
820 830
>>CCDS11426.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (831 aa)
initn: 2884 init1: 1049 opt: 1825 Z-score: 2063.4 bits: 392.8 E(32554): 1.3e-108
Smith-Waterman score: 2984; 54.3% identity (78.9% similar) in 849 aa overlap (1-842:1-821)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE
:: ::::: : :::::::: .:: :.: ::: : ::::::: .:. ::::::.::.::::
CCDS11 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK
..: : .. .:: .:.::. . .: .: ....... ...:.: ::.:.. :.: :..
CCDS11 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQR-LGAKLGFVSGL
:.::: : .:: :. : . .. : : ::.:::. : : : .::::.:.
CCDS11 NFLELTELKFILRKTQQFFDEMAD--PDLLE----ESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAGV
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 INQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVK
::. .. .::.::::::.: ... ::... :::: ::. .. ::.: : :.:. ..::
CCDS11 INRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRV
:::. .. .:: :.: .::.:. :.::::.:: ::..:::. ..:: ::...
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:.:.::::::: ::.:..:::.:::::::::: .::.... ::..:...::.:.::..:
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. :..:::: .::::: ::::::::::.:.:::.::: .:::::::::::::::::::.
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:.:::.:.: :.. . :.. ..: : .:::.:..:::: ::::.:::::
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::.:::.:::::::::::::::::::: ::: :..:::..:.: .:::. :::..::
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.::::...::::: ...:.::. :::.::.::::::: : : : ::.::. .: :.:
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:. : :: ..: ::: : . :. .: .: .: . .::.. .. : . ..:.
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::. .::.::. .. :.::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
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....:: : . : :.:. .. ::.::. ::::::::::::::.:::::::::::: :.
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840 850
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CCDS11 GFKFLPFSFEHIREGKFEE
820 830
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CCDS45 GFKFLPFSFEHIREGKFEE
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..:.:..: :::.:. :::.::::::::::.:::::::::::: :.: :. ::.:.
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CCDS53 D
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. :. :.:..:::.:.:. :.:. ::.. :: : ::: :..::::.::::::.:..:
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: ::.::::.:. . : : . :. . :.: :: .:: .: ::: .. . . .
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: .. ::: ::::.:: .::.:::::::: :.::::: .::::::::::::::: :::..
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CCDS81 PSGWSVAAMANQSG----------WSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSL
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CCDS81 YLVFLVIYKWLCVWAARAASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALA
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CCDS81 MVPILLLGTPLHLLHRHRRR----LRRRP---ADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEK
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CCDS81 TGYKLSPFTFAATDD
820 830
856 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]