FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6739, 1218 aa
1>>>pF1KE6739 1218 - 1218 aa - 1218 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3042+/-0.00161; mu= 20.2623+/- 0.096
mean_var=272.1129+/-51.319, 0's: 0 Z-trim(107.2): 259 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.077750
statistics sampled from 9181 (9451) to 9181 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 3.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218) 9177 1045.2 0
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CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1200) 2867 337.4 1.3e-91
CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6 ( 723) 1771 214.1 1e-54
CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15 ( 685) 1714 207.7 8.4e-53
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555) 1509 185.6 1.3e-45
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471) 1393 172.6 1.1e-41
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321) 1198 150.7 4e-35
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003) 1076 136.9 5e-31
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 951 122.7 7.2e-27
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 940 121.4 1.7e-26
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 940 121.4 1.7e-26
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 940 121.4 1.7e-26
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 925 119.7 5.4e-26
CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3144) 898 117.2 6.3e-25
CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3165) 898 117.3 6.3e-25
CCDS53454.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1294) 859 112.2 8.5e-24
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 844 110.7 3e-23
CCDS4897.1 DLK2 gene_id:65989|Hs108|chr6 ( 383) 818 106.7 1.1e-22
CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15 (1044) 814 107.0 2.5e-22
CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 ( 870) 794 104.6 1.1e-21
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571) 802 106.6 1.2e-21
CCDS1390.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1406) 794 105.0 1.4e-21
CCDS33390.1 DNER gene_id:92737|Hs108|chr2 ( 737) 762 100.9 1.2e-20
CCDS58053.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1382) 760 101.2 1.9e-20
CCDS6852.2 CRB2 gene_id:286204|Hs108|chr9 (1285) 758 100.9 2.2e-20
CCDS9963.1 DLK1 gene_id:8788|Hs108|chr14 ( 383) 739 97.9 5.3e-20
CCDS74370.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1557) 714 96.1 7.3e-19
CCDS74368.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1587) 714 96.1 7.4e-19
CCDS74369.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1624) 714 96.1 7.5e-19
CCDS81852.1 DLK1 gene_id:8788|Hs108|chr14 ( 310) 696 92.9 1.3e-18
CCDS12537.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19 ( 587) 687 92.3 3.7e-18
CCDS12538.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19 ( 618) 687 92.4 3.8e-18
CCDS30892.1 PEAR1 gene_id:375033|Hs108|chr1 (1037) 608 83.9 2.3e-15
CCDS72880.1 NOTCH2NL gene_id:388677|Hs108|chr1 ( 236) 572 78.8 1.8e-14
CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2 (1413) 569 79.8 5.5e-14
CCDS32232.1 FBN1 gene_id:2200|Hs108|chr15 (2871) 568 80.2 8.4e-14
CCDS9831.1 LTBP2 gene_id:4053|Hs108|chr14 (1821) 555 78.4 1.8e-13
CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5 (2912) 553 78.5 2.7e-13
CCDS12196.1 FBN3 gene_id:84467|Hs108|chr19 (2809) 543 77.3 5.8e-13
CCDS44555.1 NELL1 gene_id:4745|Hs108|chr11 ( 763) 519 73.7 2e-12
CCDS6811.1 TNC gene_id:3371|Hs108|chr9 (2201) 517 74.2 3.9e-12
CCDS75461.1 DLK2 gene_id:65989|Hs108|chr6 ( 377) 499 70.9 6.6e-12
CCDS4967.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 ( 594) 487 69.9 2.1e-11
CCDS47446.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 ( 619) 487 69.9 2.2e-11
CCDS54344.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1353) 489 70.7 2.7e-11
CCDS3732.3 FAT4 gene_id:79633|Hs108|chr4 (4981) 495 72.4 3.2e-11
>>CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218 aa)
initn: 9177 init1: 9177 opt: 9177 Z-score: 5583.4 bits: 1045.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9177; 100.0% identity (100.0% similar) in 1218 aa overlap (1-1218:1-1218)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCCGGARN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCCGGARN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PGDRKCTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLKASRGNDRNRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PGDRKCTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLKASRGNDRNRI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VLPFSFAWPRSYTLLVEAWDSSNDTVQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQNTGVAHFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VLPFSFAWPRSYTLLVEAWDSSNDTVQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQNTGVAHFE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 YQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECNRAICRQGCSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECNRAICRQGCSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLCETNWGGQLCDKDLNYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLCETNWGGQLCDKDLNYC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLGFEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLGFEC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 ECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 CVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQCQNDASCRDLVNGYRCICPPGYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQCQNDASCRDLVNGYRCICPPGYA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 GDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 YNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 PHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 GAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTC
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pF1KE6 YDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICA
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pF1KE6 QNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEIN
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pF1KE6 GYRCVCPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQCLNGRIACSKVWCGPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GYRCVCPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQCLNGRIACSKVWCGPR
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pF1KE6 PCLLHKGHSECPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PCLLHKGHSECPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCAN
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pF1KE6 ITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEPSPSANNEIHVAISAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEPSPSANNEIHVAISAED
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KE6 IRDDGNPIKEITDKIIDLVSKRDGNSSLIAAVAEVRVQRRPLKNRTDFLVPLLSSVLTVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IRDDGNPIKEITDKIIDLVSKRDGNSSLIAAVAEVRVQRRPLKNRTDFLVPLLSSVLTVA
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pF1KE6 WICCLVTAFYWCLRKRRKPGSHTHSASEDNTTNNVREQLNQIKNPIEKHGANTVPIKDYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WICCLVTAFYWCLRKRRKPGSHTHSASEDNTTNNVREQLNQIKNPIEKHGANTVPIKDYE
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pF1KE6 NKNSKMSKIRTHNSEVEEDDMDKHQQKARFAKQPAYTLVDREEKPPNGTPTKHPNWTNKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NKNSKMSKIRTHNSEVEEDDMDKHQQKARFAKQPAYTLVDREEKPPNGTPTKHPNWTNKQ
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1210
pF1KE6 DNRDLESAQSLNRMEYIV
::::::::::::::::::
CCDS13 DNRDLESAQSLNRMEYIV
1210
>>CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1238 aa)
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Smith-Waterman score: 5135; 53.4% identity (74.4% similar) in 1252 aa overlap (5-1216:2-1234)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCCGG-AR
:..::. : :: :: :: ... : :::.. ...:::::: .: :: : .:
CCDS99 MRAQGRGRLPRRLL--LLLALWVQAARPMGYFELQLSALRNVNGELLSGACCDGDGR
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pF1KE6 NPGDRKCTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLK-ASRGNDRN
. : .:::::: .:::::::..:: ::::.: :.:::.:::.: : :. ..::
CCDS99 TTRAGGCGHDECDTYVRVCLKEYQAKVTPTGPCSYGHGATPVLGGNSFYLPPAGAAGDRA
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pF1KE6 R-------------IVLPFSFAWPRSYTLLVEAWDSSNDTVQPDSI-IEKASHSGMINPS
: .:.::.::::::.::.::::: .:::. . . ::..::.:::::
CCDS99 RARARAGGDQDPGLVVIPFQFAWPRSFTLIVEAWDWDNDTTPNEELLIERVSHAGMINPE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 RQWQTLKQNTGVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGW
.:..:. . :::.: :::: ::. ::. ::::::::.::::::.::: :::.::.::
CCDS99 DRWKSLHFSGHVAHLELQIRVRCDENYYSATCNKFCRPRNDFFGHYTCDQYGNKACMDGW
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 MGPECNRAICRQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLC
:: ::..:.:.:::. ::.: .::.:::.::::: .::.:.:.:::::: : ::::: :
CCDS99 MGKECKEAVCKQGCNLLHGGCTVPGECRCSYGWQGRFCDECVPYPGCVHGSCVEPWQCNC
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 ETNWGGQLCDKDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDP
:::::: ::::::::::.:.:: ::::: :. ::.:.:.::.:::: ::: ::::: :.:
CCDS99 ETNWGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 CHNRGSCKETSLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQW
: : :::.:. ::::.: ::.::::. .::.:. : :. :::: : :.::.:.:: ::
CCDS99 CANGGSCHEVPSGFECHCPSGWSGPTCALDIDECASNPCAAGGTCVDQVDGFECICPEQW
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 TGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQCQNDASC
.: ::::::::::.:::.:: ::::::..:::::.::: : :: ::.::: ::::. ..:
CCDS99 VGATCQLDANECEGKPCLNAFSCKNLIGGYYCDCIPGWKGINCHINVNDCRGQCQHGGTC
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 RDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQL
.::::::.:.:: :..: ::: . :::::.:: .:: :.. . :.: :: :::: ::..
CCDS99 KDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCEV
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE6 DIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMAS
:.: :::.::.:::.::: .::.: ::.:. ::::: .. : :.:::.: .:
CCDS99 DVDLCEPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNCSVPREPCPGGACRVIDGC----GS
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE6 NDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTC
. : .:.::::::.: :: ::.:.: :..:::::::::::.:: ..::::::::
CCDS99 DAGPGMPGTAASGVCGPHGRCVSQPGGNFSCICDSGFTGTYCHENIDDCLGQPCRNGGTC
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE6 IDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHS
:: :....:.: .:::: :.:: ::: .:::. : : :::::::: : .:::::::::
CCDS99 IDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYCACDDGWKGKTCHS
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE6 RDSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGE
:. ::: ::.::::::: ::.:.: :: ::.:.:: .:.::::::::: :::::: .:
CCDS99 REFQCDAYTCSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAKNSSCLPNPCVNGGTCVGSGA
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE6 SFTCVCKEGWEGPICAQNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININEC
::.:.:..:::: :..:::::.: ::::.: :::: ::.:::::::::::::::::.::
CCDS99 SFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDEC
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KE6 QSSPCAFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQEVSG--RPCITMGSVIPDGAKWDDDCNT
::::::.::::::::::::: ::::..: .:::: : : : . :. .: :..: .:::.
CCDS99 QSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWSRGTPFPHGSSWVEDCNS
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CCDS43 AGKCINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICMPGYEGV
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CCDS12 ECSIGANPCEHLGRCVNTQGSFLCQCGRGYTGPRCETDVNECLSGPCRNQATCLDRIGQF
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pF1KE6 --VAMAS---NDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCE
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CCDS12 TCICMAGFTGTYCEVDIDECQSSPCVNGGVCKDRVNG-FSCTCPSGFSGSTCQLDVDECA
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pF1KE6 SNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCK
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CCDS12 STPCRNGAKCVDQPDGYECRCAEGFEGTLCDRNVDDCSPDPCHHG-RCVDGIASFSCACA
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pF1KE6 NGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCH
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CCDS12 PGYTGTRCESQVDECRSQPCRHGGKCLDLVDKYLCRCPSGTTGVNCEVNIDD-CASNPC-
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CCDS12 TFGVCRDGINRYDCVCQPGFTGPLCNVEINECASSPCGEGGSCVDGENGFRCLCPPGSLP
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CCDS12 PLCLPPSHPCAHEPCSHGI-CYDAPGGFRCVCEPGWSGPRCSQSLARDACESQPCRAGGT
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:: . :. ..:: : . : : :: : :. : :: .:. . : .
CCDS12 CSSDGMGFH--CTCPPGVQGR-QCELLSPCTPNPCE-HGGRCESAPGQ--LPVCSCPQGW
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: : : ::
CCDS12 QGPRCQQDVDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGGYTGPSCDQDINDCDPNPCLNGG
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>--
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CCDS12 DINDCDPNPCLNGGSCQDGVGSFSCSCLPGFAGPRCARDVDECLSNPC-GPGTCTDHVAS
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CCDS12 PGWSGRLCD-----IRSLPCRE------AAAQI----GVRL--EQLCQAGGQCVDEDSSH
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CCDS12 Y-CVCPEGRTGSHCEQEVDPCLAQPCQHGGTCRGYMGGYMCECLPGYNGDNCEDDVDECA
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. : .:: ..: : : . :.:: : :: :. :. : :. : .
CCDS12 LSPCESQPCQHGGQCRPSPGPGGGLTFTCHCAQPFWGPRCERVARSCRELQCPVGVPCQQ
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: ::.:::: :: .:. : : : ::. . .: . ::.:
CCDS12 TPRGPRCACPPGLSGPSCRSFPGSP--------P-GAS-NASCAAAPCLHGGSCRPAPLA
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CCDS12 PFFRCACAQGWTGPR-CEAPAAAPEVSEEPRCPRA-ACQAKRGDQRCDRECNSPG-CGWD
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CCDS12 GGDCSLSVGDPWRQCEALQCWRLFNNSRCDPACSSPACLYDNFDCHAGGRERTCNPVYEK
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CCDS34 HNTLGSFQCLCPVGQEGPRCELRAGPCPPRGCSNGGTCQLMPEKDSTFHL-C------LC
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230 240 250 260
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270 280 290 300 310 320
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CCDS34 HCRNGGTCQNSAGSFHCVCVSGWGGTSCEENLDDC-IAATCAPGSTCIDR-VGSFSCLCP
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330 340 350 360 370
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CCDS34 PGRTGLLCHL-EDMCLSQPCHGDAQCSTNPLTGSTLCLCQPGYSGPTCHQDLDECLMAQQ
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CCDS34 GPSPCEHGGSCLNTPGSFNCLCPPGYTGSRCEADHNECLSQPCHPGSTCLDLLATFHCLC
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CCDS34 PPGLEGQLCEVETNECASAPCLNHADCHDLLNGFQCICLPGFSGTRCEEDIDECRSSPCA
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CCDS34 NGGQCQDQPGAFHCKCLPGFEGPRCQTEVDECLSDPCPVGASCLDLPGAFFCLCPSGFTG
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CCDS34 QLCEVPLCAPNLCQPKQICKDQKDKANCLCPDGSPGCAPPEDNCTCHHGHCQRSSCVCDV
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CCDS34 GGSCNPSPGGYYCTCPPSHTGPQCQTSTDYCVSAPCFNGGTCVNRPGTFSCLCAMGFQGP
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CCDS34 RCEGKLRPSCADSPCRNRATCQDSPQGPRCLCPTGYTGGSCQTLMDL-CAQKPCPRNSHC
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CCDS34 PGFQGSLCQDHVNPCESRPCQNGATCMAQPSGYLCQCAPGYDGQNCSKELDACQSQPCHN
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CCDS34 HGTCTPKPGGFHCACPPGFVGLRCEGDVDECLDQPCHPTGTAACHSLANAFYCQCLPGHT
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pF1KE6 GQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQD-NCANITFTFNKEMMSP
:: : . : : .:: : :.... .:. : . .. .:..
CCDS34 GQWC-EVEIDPCHSQPCFHGGTCEATAGSPLGFICHCPKGFEGPTCSHRAPSCGFHHCHH
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pF1KE6 GLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEPSPSANNEIHVAISAEDIRDDGNPIKEIT
CCDS34 GGLCLPSPKPGFPPRCACLSGYGGPDCLTPPAPKGCGPPSPCLYNGSCSETTGLGGPGFR
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CCDS43 EP-MADRLLLTTPTHRFQCKGPVDI---NIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCAC
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CCDS43 PYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDN
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: : .: . : .: : : :.. :. :: :. : :. ::..:.: : .:. : :
CCDS43 DCENNATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECV
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:::.: :: : :.:... : .:..: . :: . : :: :::: .:. :. . :
CCDS43 PGYSGKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPC
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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. ::::::: .. :.:: . : : .: :: . . . .: . ...
CCDS43 DQYECQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANIS
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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. ...: .:. ... : . :. ... : .. : .: :..:: . . .
CCDS43 LQVATDKDNGILLYKGD-NDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVE
1190 1200 1210 1220 1230 1240
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. . .. : . : : ..:: .: . :: .. ..:
CCDS43 LVTLNQTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGIN----SPLYLGGIP---TSTGLSALRQG-
1250 1260 1270 1280 1290
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. . . :. :: : . :: . : . :.. :. :: . :..
CCDS43 TDRPLGGFHGCIHEVRINN------ELQDFKALPPQSL-GVSPGCK-----SC--TVCKH
1300 1310 1320 1330 1340
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: :. .: .: :. :: ::.: :.. : : : :.. : :: . : :.:: :..:
CCDS43 GLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEARDPCLGHRCHH-GKCVATGTSYMCKCAEGYGG
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