Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6730
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6730, 809 aa
1>>>pF1KE6730 809 - 809 aa - 809 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5021+/-0.00104; mu= -0.4260+/- 0.063
mean_var=391.2265+/-80.200, 0's: 0 Z-trim(115.7): 56 B-trim: 171 in 1/52
Lambda= 0.064843
statistics sampled from 16258 (16308) to 16258 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.79), E-opt: 0.2 (0.501), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45458.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 809) 5675 545.5 1.3e-154
CCDS10658.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 853) 4525 437.9 3.3e-122
CCDS58447.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 879) 4525 438.0 3.4e-122
CCDS73865.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 923) 4525 438.0 3.5e-122
CCDS10659.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 910) 3941 383.3 9.6e-106
CCDS45638.1 SEZ6 gene_id:124925|Hs108|chr17 ( 993) 2401 239.3 2.4e-62
CCDS45639.1 SEZ6 gene_id:124925|Hs108|chr17 ( 994) 2352 234.7 5.7e-61
CCDS13833.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1024) 2347 234.3 8.1e-61
CCDS54508.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1023) 2343 233.9 1e-60
CCDS54509.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1013) 2128 213.8 1.2e-54
CCDS74837.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1011) 2123 213.3 1.6e-54
CCDS54510.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 ( 948) 1847 187.5 9.2e-47
CCDS54511.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 ( 949) 1660 170.0 1.7e-41
CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8 (3564) 655 76.6 8.4e-13
CCDS380.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3487) 648 75.9 1.3e-12
CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3631) 648 75.9 1.3e-12
>>CCDS45458.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 (809 aa)
initn: 5675 init1: 5675 opt: 5675 Z-score: 2889.2 bits: 545.5 E(32554): 1.3e-154
Smith-Waterman score: 5675; 99.9% identity (99.9% similar) in 809 aa overlap (1-809:1-809)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGTPRAQHPPPPQLLFLILLSCPWIQGLPLKEEEILPEPGSETPTVASEALAELLHGALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGTPRAQHPPPPQLLFLILLSCPWIQGLPLKEEEILPEPGSETPTVASEALAELLHGALL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RRGPEMGYLPGSDPDPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGVRGAGPTAP
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RRGPEMGYLPGSDRDPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGVRGAGPTAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSPAYLLSCGFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSPAYLLSCGFPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RPAHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RPAHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NATLGRIVSPEPGGAVGPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NATLGRIVSPEPGGAVGPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 PVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELSEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELSEP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 AGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARVLA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 QLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 RTASHGDLIRGTVLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RTASHGDLIRGTVLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 HRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCLNP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 GVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKVAYEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKVAYEE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 LLDNRKLEVTQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLDNRKLEVTQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFSGS
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KE6 HSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI
790 800
>>CCDS10658.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 (853 aa)
initn: 5009 init1: 4525 opt: 4525 Z-score: 2307.5 bits: 437.9 E(32554): 3.3e-122
Smith-Waterman score: 4837; 85.1% identity (88.3% similar) in 848 aa overlap (13-809:13-853)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGTPRAQHPPPPQLLFLILLSCPWIQGLPLKEEEILPEPGSETPTVASEALAELLHGALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGTPRAQHPPPPQLLFLILLSCPWIQGLPLKEEEILPEPGSETPTVASEALAELLHGALL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 RRGPEMGYLPGSDPDPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGV-RGAGPT-
::::::::::: : :. : .:. .. .. .: : . .. :.. .: : .
CCDS10 RRGPEMGYLPG----PPLG-PEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSPVLCNNNISEGEGYVE
70 80 90 100 110
120 130 140
pF1KE6 APELLTPP----------------PGTTAPPPPSP------------ASPGPP-LGPEG-
.:.: .: :: . :. : : :.:.
CCDS10 SPDLGSPVSRTLGLLDCTYSIHVYPGYGIEIQVQTLNLSQEEELLVLAGGGSPGLAPRLL
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180
pF1KE6 ------GEEETTTTIITTTTVTTTVTSP-------------AYLLSCGFPPRPAHGDVSV
:: .. . :. . :: :::::::::::::::::::
CCDS10 ANSSMLGEGQVLRS--PTNRLLLHFQSPRVPRGGGFRIHYQAYLLSCGFPPRPAHGDVSV
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIHNATLGRIVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIHNATLGRIVS
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 PEPGGAVGPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLSPVIYDSDMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PEPGGAVGPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLSPVIYDSDMD
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 DVPERGLISDAQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNVTTTDPEYRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DVPERGLISDAQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNVTTTDPEYRP
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDW
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 PQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARVLAQLRGPQPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARVLAQLRGPQPRR
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 RLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGWRTASHGDLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGWRTASHGDLI
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 RGTVLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANGHRTASDAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RGTVLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANGHRTASDAGF
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 PVGSHVQYRCLPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCLNPGVPENGYQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PVGSHVQYRCLPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCLNPGVPENGYQT
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 LYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKVAYEELLDNRKLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKVAYEELLDNRKLEV
720 730 740 750 760 770
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 TQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFSGSHSYSPITVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFSGSHSYSPITVE
780 790 800 810 820 830
790 800
pF1KE6 SDFSNPLYEAGDTREYEVSI
::::::::::::::::::::
CCDS10 SDFSNPLYEAGDTREYEVSI
840 850
>>CCDS58447.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 (879 aa)
initn: 5177 init1: 4525 opt: 4525 Z-score: 2307.3 bits: 438.0 E(32554): 3.4e-122
Smith-Waterman score: 4874; 86.4% identity (86.4% similar) in 841 aa overlap (83-809:39-879)
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 ELLHGALLRRGPEMGYLPGSDPDPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PPPPQLLFLILLSCPWIQGSDRDPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGV
10 20 30 40 50 60
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 RGAGPTAPELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSP--
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RGAGPTAPELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSPVL
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 ------------------------------------------------------------
CCDS58 CNNNISEGEGYVESPDLGSPVSRTLGLLDCTYSIHVYPGYGIEIQVQTLNLSQEEELLVL
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ----------------------------------------------------AYLLSCGF
::::::::
CCDS58 AGGGSPGLAPRLLANSSMLGEGQVLRSPTNRLLLHFQSPRVPRGGGFRIHYQAYLLSCGF
190 200 210 220 230 240
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PPRPAHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PPRPAHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGT
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 IHNATLGRIVSPEPGGAVGPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IHNATLGRIVSPEPGGAVGPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSP
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LSPVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSPVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHG
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 NVTTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NVTTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELS
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 EPAGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EPAGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARV
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 LAQLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LAQLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEW
550 560 570 580 590 600
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 GWRTASHGDLIRGTVLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GWRTASHGDLIRGTVLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIA
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KE6 NGHRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NGHRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCL
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690 700 710
pF1KE6 NPGVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKVAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NPGVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKVAY
730 740 750 760 770 780
720 730 740 750 760 770
pF1KE6 EELLDNRKLEVTQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EELLDNRKLEVTQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFS
790 800 810 820 830 840
780 790 800
pF1KE6 GSHSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSHSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI
850 860 870
>>CCDS73865.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 (923 aa)
initn: 5661 init1: 4525 opt: 4525 Z-score: 2307.1 bits: 438.0 E(32554): 3.5e-122
Smith-Waterman score: 4874; 86.4% identity (86.4% similar) in 841 aa overlap (83-809:83-923)
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 ELLHGALLRRGPEMGYLPGSDPDPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ELLHGALLRRGPEMGYLPGSDRDPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 RGAGPTAPELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSP--
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RGAGPTAPELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSPVL
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 ------------------------------------------------------------
CCDS73 CNNNISEGEGYVESPDLGSPVSRTLGLLDCTYSIHVYPGYGIEIQVQTLNLSQEEELLVL
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 ----------------------------------------------------AYLLSCGF
::::::::
CCDS73 AGGGSPGLAPRLLANSSMLGEGQVLRSPTNRLLLHFQSPRVPRGGGFRIHYQAYLLSCGF
240 250 260 270 280 290
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PPRPAHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PPRPAHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGT
300 310 320 330 340 350
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 IHNATLGRIVSPEPGGAVGPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IHNATLGRIVSPEPGGAVGPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSP
360 370 380 390 400 410
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LSPVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LSPVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NVTTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELS
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EPAGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARV
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480 490 500 510 520 530
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LAQLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEW
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540 550 560 570 580 590
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GWRTASHGDLIRGTVLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIA
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600 610 620 630 640 650
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NGHRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCL
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660 670 680 690 700 710
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NPGVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKVAY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EELLDNRKLEVTQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFS
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780 790 800
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:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GSHSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI
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::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ELLHGALLRRGPEMGYLPGSDRDPTLATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPLTTAVTPNGV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RGAGPTAPELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSPVL
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 ------------------------------------------------------------
CCDS10 CNNNISEGEGYVESPDLGSPVSRTLGLLDCTYSIHVYPGYGIEIQVQTLNLSQEEELLVL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PPRPAHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGT
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240 250 260 270 280 290
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IHNATLGRIVSPEPGGAVGPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSP
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300 310 320 330 340 350
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LSPVIYDSDMDDVPERGLISDAQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NVTTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LAQLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NGHRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCALKYEPCL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NPGVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKV--
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 -----------TQTTDPSRQLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFS
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CCDS10 GSHSYSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVSI
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:::::: :: :::.:::.::.:::::.: :
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:: .::::.: . : :::.:.: :... : :.:.:::.:.::: :::::: : . ::
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::.:..:: ::.:::::::.::: ::.:::..:.: . .: .::: ... .: .::.:.
CCDS45 TCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVEAPPVYDSYEVEYLPIEGLLSS
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pF1KE6 AQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNVTTTDPEYRPGALATFSCLP
.. ..::: ... . ..::.:::.. .:. ::. .:: ... : : :. . ::: :
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pF1KE6 GYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDWPQSYSPGQDC
::.:: . :::::: .:.::.:::::.:.:.::... :::::::.::. :. ::::
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.:::::.:.:::.:....: . ::.::..::: .::::.: ::. . .:..: :.:
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.:::. :: : ::::.:: :::::::::::: ::.. :. .:..:::.::::
CCDS45 IQFQSDPGTSVLGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGWKSPSQPELVHGTVVTYQCY
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pF1KE6 PGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANGHRTASDAGFPVGSHVQYRC
:::...::..: :::::.:: :.::.. .: :::.. ...: :. ::::. ::: :
CCDS45 PGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHSRRLISSPKFPVGATVQYIC
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:. : :...:::..:..:.::::::.::: : . .:: . ..:::: .. :. . ::
CCDS45 DQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHGLSAPENGARSPEKQLHPAG
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680 690 700 710 720 730
pF1KE6 ESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKVA-YEELLDNRKLEVTQTTDPSR
...: : :. : :...: :::::::.:.. ::.:..: . . ..:.:.:... :
CCDS45 ATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASLDGFYNSRSLDVAKAPAASS
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740 750 760 770 780 790
pF1KE6 QLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFSGSHS--YSPITVESDFSNP
:.....: ::.::: ...: .:::.:...::::: . . . :. ::.:: :.::
CCDS45 TLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLPRPRPRPYNRITIESAFDNP
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800
pF1KE6 LYEAGDTREYEVSI
::.:.::::::::
CCDS45 TYETGETREYEVSI
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pF1KE6 GPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSPAYLLSCGFPPRPAHGDVSVTDLHPGGTATF
:::::: :: :::.:::.::.:::::.: :
CCDS45 VIRSPTHQAALRFQSLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFPRRPAYGDVTVTSLHPGGSARF
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210 220 230 240 250 260
pF1KE6 HCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIHNATLGRIVSPEPGGAVGPNL
:: .::::.: . : :::.:.: :... : :.:.:::.:.::: :::::: : . ::
CCDS45 HCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIAACGGVIRNATTGRIVSPGFPGNYSNNL
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pF1KE6 TCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLSPVIYDS-DMDDVPERGLISD
::.:..:: ::.:::::::.::: ::.:::..:.: . .: .::: ... .: .::.:.
CCDS45 TCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVEAPPVYDSYEVEYLPIEGLLSS
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pF1KE6 AQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNVTTTDPEYRPGALATFSCLP
.. ..::: ... . ..::.:::.. .:. ::. .:: ... : : :. . ::: :
CCDS45 GKHFFVELSTDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYGNFSSSTPTYPVGTTVEFSCDP
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pF1KE6 GYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDWPQSYSPGQDC
::.:: . :::::: .:.::.:::::.:.:.::... :::::::.::. :. ::::
CCDS45 GYTLEQGSI--IIECVDPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDSAGVVLSPNWPEPYGRGQDC
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pF1KE6 VWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARVLAQLRGPQPRRRLLSSGPDLT
.:::::.:.:::.:....: . ::.::..::: .::::.: ::. . .:..: :.:
CCDS45 IWGVHVEEDKRIMLDIRVLRIGPGDVLTFYDGDDLTARVLGQYSGPRSHFKLFTSMADVT
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pF1KE6 LQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGWRTASHGDLIRGTVLTYQCE
.:::. :: : ::::.:: :::::::::::: ::.. :. .:..:::.::::
CCDS45 IQFQSDPGTSVLGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGWKSPSQPELVHGTVVTYQCY
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pF1KE6 PGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANGHRTASDAGFPVGSHVQYRC
:::...::..: :::::.:: :.::.. .: :::.. ...: :. ::::. ::: :
CCDS45 PGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHSRRLISSPKFPVGATVQYIC
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pF1KE6 LPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPKWSDRVPKCAL-KYEPCLNPGVPENGYQTLYKHHYQAG
:. : :...:::..:..:.::::::.::: : . .:: . ..:::: .. :. . ::
CCDS45 DQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHGLSAPENGARSPEKQLHPAG
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680 690 700 710 720 730
pF1KE6 ESLRFFCYEGFELIGEVTITCVPGHPSQWTSQPPLCKVA-YEELLDNRKLEVTQTTDPSR
...: : :. : :...: :::::::.:.. ::.:..: . . ..:.:.:... :
CCDS45 ATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASLDGFYNSRSLDVAKAPAASS
860 870 880 890 900 910
740 750 760 770 780 790
pF1KE6 QLEGGNLALAILLPLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFSGSHS--YSPITVESDFSNP
:.....: ::.::: ...: .:::.:...::::: . . . :. ::.:: :.::
CCDS45 TLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLPRPRPRPYNRITIESAFDNP
920 930 940 950 960 970
800
pF1KE6 LYEAGDTREYEVSI
::.:
CCDS45 TYETGSLSFAGDERI
980 990
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pF1KE6 GPPLGPEGGEEETTTTIITTTTVTTTVTSPAYLLSCGFPPRPAHGDVSVTDLHPGGTATF
:..:::.:: :: :::.: ::: ::.: :
CCDS13 QVIRSPTNTISVYFRTFQDDGLGTFQLHYQAFMLSCNFPRRPDSGDVTVMDLHSGGVAHF
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pF1KE6 HCDSGYQLQGEETLICLNGTRPSWNGETPSCMASCGGTIHNATLGRIVSPE-PGGAVGPN
:: ::.::: . : :.:...: :... : : : :::..::::.::..:: : .. : .
CCDS13 HCHLGYELQGAKMLTCINASKPHWSSQEPICSAPCGGAVHNATIGRVLSPSYPENTNGSQ
420 430 440 450 460 470
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pF1KE6 LTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSLDEDNDRLMVRSGGSPLSPVIYDS-DMDDVPERGLIS
. : :.::: ::..:::::::. : .:.::. :.:: . : ..::: . ..:: .::.:
CCDS13 F-CIWTIEAPEGQKLHLHFERLLL-HDKDRMTVHSGQTNKSALLYDSLQTESVPFEGLLS
480 490 500 510 520 530
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pF1KE6 DAQSLYVELLSETPANPLLLSLRFEAFEEDRCFAPFLAHGNVTTTDPEYRPGALATFSCL
..... .:. :. ...::::::. .:. :.. .:: ::.:: : :... :.:
CCDS13 EGNTIRIEFTSDQARAASTFNIRFEAFEKGHCYEPYIQNGNFTTSDPTYNIGTIVEFTCD
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pF1KE6 PGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHWNDTEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDWPQSYSPGQD
::..:: :: :::.. .:.:::::: :.:::::::: :::::::.::. : :.:
CCDS13 PGHSLEQ-GPA-IIECINVRDPYWNDTEPLCRAMCGGELSAVAGVVLSPNWPEPYVEGED
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pF1KE6 CVWGVHVQEEKRILLQVEILNVREGDMLTLFDGDGPSARVLAQLRGPQPRRRLLSSGPDL
:.: .:: :::::.:....::. ..:.::..::: ..:.: : . ..: :: :::
CCDS13 CIWKIHVGEEKRIFLDIQFLNLSNSDILTIYDGDEVMPHILGQYLGNSGPQKLYSSTPDL
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pF1KE6 TLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFKEVPRNDTCPELPPPEWGWRTASHGDLIRGTVLTYQC
:.::.. :. : ::::.... :: :::.: .:: . ::.:.:: .:.::. .::::
CCDS13 TIQFHSDPAGLIFGKGQGFIMNYIEVSRNDSCSDLPEIQNGWKTTSHTELVRGARITYQC
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pF1KE6 EPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAPPACQKIMTCADPGEIANGHRTASDAGFPVGSHVQYR
.:::...::: ::::::::::. :: :.::: :.::::. .. : :: . ::. .::
CCDS13 DPGYDIVGSDTLTCQWDLSWSSDPPFCEKIMYCTDPGEVDHSTRLISDPVLLVGTTIQYT
780 790 800 810 820 830
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CCDS54 IYETGETREYEVSI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]