FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6727, 712 aa
1>>>pF1KE6727 712 - 712 aa - 712 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4654+/-0.00102; mu= 19.0015+/- 0.062
mean_var=71.4276+/-14.759, 0's: 0 Z-trim(103.4): 35 B-trim: 37 in 1/46
Lambda= 0.151754
statistics sampled from 7375 (7401) to 7375 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 2.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8683.1 SLCO1C1 gene_id:53919|Hs108|chr12 ( 712) 4756 1051.2 0
CCDS53757.1 SLCO1C1 gene_id:53919|Hs108|chr12 ( 730) 4294 950.0 0
CCDS53759.1 SLCO1C1 gene_id:53919|Hs108|chr12 ( 612) 3515 779.4 0
CCDS53758.1 SLCO1C1 gene_id:53919|Hs108|chr12 ( 663) 3281 728.2 9.4e-210
CCDS8684.1 SLCO1B3 gene_id:28234|Hs108|chr12 ( 702) 2140 478.4 1.6e-134
CCDS8685.1 SLCO1B1 gene_id:10599|Hs108|chr12 ( 691) 2124 474.9 1.7e-133
CCDS44843.1 SLCO1B7 gene_id:338821|Hs108|chr12 ( 640) 1925 431.3 2.1e-120
CCDS8686.1 SLCO1A2 gene_id:6579|Hs108|chr12 ( 670) 1696 381.2 2.7e-105
CCDS10371.1 SLCO3A1 gene_id:28232|Hs108|chr15 ( 710) 1431 323.2 8.4e-88
CCDS45354.1 SLCO3A1 gene_id:28232|Hs108|chr15 ( 692) 1429 322.8 1.1e-87
CCDS44683.1 SLCO2B1 gene_id:11309|Hs108|chr11 ( 687) 940 215.7 1.9e-55
CCDS8235.1 SLCO2B1 gene_id:11309|Hs108|chr11 ( 709) 940 215.7 1.9e-55
CCDS55243.1 SLCO5A1 gene_id:81796|Hs108|chr8 ( 687) 898 206.5 1.1e-52
CCDS6205.1 SLCO5A1 gene_id:81796|Hs108|chr8 ( 848) 898 206.5 1.3e-52
CCDS3084.1 SLCO2A1 gene_id:6578|Hs108|chr3 ( 643) 707 164.7 4e-40
CCDS34205.1 SLCO4C1 gene_id:353189|Hs108|chr5 ( 724) 695 162.1 2.7e-39
CCDS53679.1 SLCO2B1 gene_id:11309|Hs108|chr11 ( 565) 652 152.6 1.5e-36
CCDS75282.1 SLCO6A1 gene_id:133482|Hs108|chr5 ( 657) 555 131.4 4.3e-30
CCDS34206.1 SLCO6A1 gene_id:133482|Hs108|chr5 ( 719) 555 131.4 4.6e-30
CCDS78042.1 SLCO6A1 gene_id:133482|Hs108|chr5 ( 466) 392 95.6 1.8e-19
CCDS55242.1 SLCO5A1 gene_id:81796|Hs108|chr8 ( 793) 329 82.0 3.9e-15
>>CCDS8683.1 SLCO1C1 gene_id:53919|Hs108|chr12 (712 aa)
initn: 4756 init1: 4756 opt: 4756 Z-score: 5624.0 bits: 1051.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4756; 100.0% identity (100.0% similar) in 712 aa overlap (1-712:1-712)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDTSSKENIQLFCKTSVQPVGRPSFKTEYPSSEEKQPCCGELKVFLCALSFVYFAKALAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MDTSSKENIQLFCKTSVQPVGRPSFKTEYPSSEEKQPCCGELKVFLCALSFVYFAKALAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GYLKSTITQIERRFDIPSSLVGVIDGSFEIGNLLVITFVSYFGAKLHRPKIIGAGCVIMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 GYLKSTITQIERRFDIPSSLVGVIDGSFEIGNLLVITFVSYFGAKLHRPKIIGAGCVIMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VGTLLIAMPQFFMEQYKYERYSPSSNSTLSISPCLLESSSQLPVSVMEKSKSKISNECEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 VGTLLIAMPQFFMEQYKYERYSPSSNSTLSISPCLLESSSQLPVSVMEKSKSKISNECEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DTSSSMWIYVFLGNLLRGIGETPIQPLGIAYLDDFASEDNAAFYIGCVQTVAIIGPIFGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 DTSSSMWIYVFLGNLLRGIGETPIQPLGIAYLDDFASEDNAAFYIGCVQTVAIIGPIFGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPKDPQWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPKSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPKDPQWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPKSLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 RSQSREDSNSSSEKSKFIIDDHTDYQTPQGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVYFLYLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 RSQSREDSNSSSEKSKFIIDDHTDYQTPQGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVYFLYLC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQYGQSSSRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMKKFRIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 TSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQYGQSSSRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMKKFRIS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 VCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSDCNSRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 VCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSDCNSRC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 KCSETKWEPMCGENGITYVSACLAGCQTSNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSSGIVGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KCSETKWEPMCGENGITYVSACLAGCQTSNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSSGIVGR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 CQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLSLGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLAIRVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 CQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLSLGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLAIRVLA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 GIPAPVYFGVLIDTSCLKWGFKRCGSRGSCRLYDSNVFRHIYLGLTVILGTVSILLSIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 GIPAPVYFGVLIDTSCLKWGFKRCGSRGSCRLYDSNVFRHIYLGLTVILGTVSILLSIAV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE6 LFILKKNYVSKHRSFITKRERTMVSTRFQKENYTTSDHLLQPNYWPGKETQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LFILKKNYVSKHRSFITKRERTMVSTRFQKENYTTSDHLLQPNYWPGKETQL
670 680 690 700 710
>>CCDS53757.1 SLCO1C1 gene_id:53919|Hs108|chr12 (730 aa)
initn: 4294 init1: 4294 opt: 4294 Z-score: 5077.2 bits: 950.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4294; 99.8% identity (100.0% similar) in 640 aa overlap (1-640:1-640)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDTSSKENIQLFCKTSVQPVGRPSFKTEYPSSEEKQPCCGELKVFLCALSFVYFAKALAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MDTSSKENIQLFCKTSVQPVGRPSFKTEYPSSEEKQPCCGELKVFLCALSFVYFAKALAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GYLKSTITQIERRFDIPSSLVGVIDGSFEIGNLLVITFVSYFGAKLHRPKIIGAGCVIMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GYLKSTITQIERRFDIPSSLVGVIDGSFEIGNLLVITFVSYFGAKLHRPKIIGAGCVIMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VGTLLIAMPQFFMEQYKYERYSPSSNSTLSISPCLLESSSQLPVSVMEKSKSKISNECEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VGTLLIAMPQFFMEQYKYERYSPSSNSTLSISPCLLESSSQLPVSVMEKSKSKISNECEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DTSSSMWIYVFLGNLLRGIGETPIQPLGIAYLDDFASEDNAAFYIGCVQTVAIIGPIFGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DTSSSMWIYVFLGNLLRGIGETPIQPLGIAYLDDFASEDNAAFYIGCVQTVAIIGPIFGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPKDPQWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPKSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPKDPQWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPKSLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 RSQSREDSNSSSEKSKFIIDDHTDYQTPQGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVYFLYLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RSQSREDSNSSSEKSKFIIDDHTDYQTPQGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVYFLYLC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQYGQSSSRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMKKFRIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQYGQSSSRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMKKFRIS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 VCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSDCNSRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSDCNSRC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 KCSETKWEPMCGENGITYVSACLAGCQTSNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSSGIVGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KCSETKWEPMCGENGITYVSACLAGCQTSNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSSGIVGR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 CQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLSLGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLAIRVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLSLGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLAIRVLA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 GIPAPVYFGVLIDTSCLKWGFKRCGSRGSCRLYDSNVFRHIYLGLTVILGTVSILLSIAV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS53 GIPAPVYFGVLIDTSCLKWGFKRCGSRGSCRLYDSNVFRYQIKSIPASHCYSIPDLHNAT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE6 LFILKKNYVSKHRSFITKRERTMVSTRFQKENYTTSDHLLQPNYWPGKETQL
CCDS53 DTNKFSCHFTACKTYISGTNCDTGHSVNSPKHCSTFHFKEKLCFKTQKFYNQERKNNGVY
670 680 690 700 710 720
>>CCDS53759.1 SLCO1C1 gene_id:53919|Hs108|chr12 (612 aa)
initn: 3515 init1: 3515 opt: 3515 Z-score: 4156.6 bits: 779.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3515; 99.8% identity (100.0% similar) in 522 aa overlap (119-640:1-522)
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 EIGNLLVITFVSYFGAKLHRPKIIGAGCVIMGVGTLLIAMPQFFMEQYKYERYSPSSNST
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MGVGTLLIAMPQFFMEQYKYERYSPSSNST
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 LSISPCLLESSSQLPVSVMEKSKSKISNECEVDTSSSMWIYVFLGNLLRGIGETPIQPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LSISPCLLESSSQLPVSVMEKSKSKISNECEVDTSSSMWIYVFLGNLLRGIGETPIQPLG
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 IAYLDDFASEDNAAFYIGCVQTVAIIGPIFGFLLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPKDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IAYLDDFASEDNAAFYIGCVQTVAIIGPIFGFLLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPKDP
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 QWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPKSLPRSQSREDSNSSSEKSKFIIDDHTDYQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPKSLPRSQSREDSNSSSEKSKFIIDDHTDYQTP
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 QGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVYFLYLCTSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQYGQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVYFLYLCTSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQYGQSS
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 SRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMKKFRISVCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMKKFRISVCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCE
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 NSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSDCNSRCKCSETKWEPMCGENGITYVSACLAGCQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSDCNSRCKCSETKWEPMCGENGITYVSACLAGCQT
340 350 360 370 380 390
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 SNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSSGIVGRCQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSSGIVGRCQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLSLG
400 410 420 430 440 450
570 580 590 600 610 620
pF1KE6 GIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLAIRVLAGIPAPVYFGVLIDTSCLKWGFKRCGSRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLAIRVLAGIPAPVYFGVLIDTSCLKWGFKRCGSRG
460 470 480 490 500 510
630 640 650 660 670 680
pF1KE6 SCRLYDSNVFRHIYLGLTVILGTVSILLSIAVLFILKKNYVSKHRSFITKRERTMVSTRF
:::::::::::.
CCDS53 SCRLYDSNVFRYQIKSIPASHCYSIPDLHNATDTNKFSCHFTACKTYISGTNCDTGHSVN
520 530 540 550 560 570
>>CCDS53758.1 SLCO1C1 gene_id:53919|Hs108|chr12 (663 aa)
initn: 3281 init1: 3281 opt: 3281 Z-score: 3879.2 bits: 728.2 E(32554): 9.4e-210
Smith-Waterman score: 4319; 93.1% identity (93.1% similar) in 712 aa overlap (1-712:1-663)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDTSSKENIQLFCKTSVQPVGRPSFKTEYPSSEEKQPCCGELKVFLCALSFVYFAKALAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MDTSSKENIQLFCKTSVQPVGRPSFKTEYPSSEEKQPCCGELKVFLCALSFVYFAKALAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GYLKSTITQIERRFDIPSSLVGVIDGSFEIGNLLVITFVSYFGAKLHRPKIIGAGCVIMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GYLKSTITQIERRFDIPSSLVGVIDGSFEIGNLLVITFVSYFGAKLHRPKIIGAGCVIMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VGTLLIAMPQFFMEQYKYERYSPSSNSTLSISPCLLESSSQLPVSVMEKSKSKISNECEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VGTLLIAMPQFFMEQYKYERYSPSSNSTLSISPCLLESSSQLPVSVMEKSKSKISN----
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DTSSSMWIYVFLGNLLRGIGETPIQPLGIAYLDDFASEDNAAFYIGCVQTVAIIGPIFGF
:::::::::::::::
CCDS53 ---------------------------------------------GCVQTVAIIGPIFGF
180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPKDPQWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPKSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPKDPQWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPKSLP
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 RSQSREDSNSSSEKSKFIIDDHTDYQTPQGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVYFLYLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RSQSREDSNSSSEKSKFIIDDHTDYQTPQGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVYFLYLC
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQYGQSSSRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMKKFRIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQYGQSSSRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMKKFRIS
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 VCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSDCNSRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSDCNSRC
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 KCSETKWEPMCGENGITYVSACLAGCQTSNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSSGIVGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KCSETKWEPMCGENGITYVSACLAGCQTSNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSSGIVGR
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 CQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLSLGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLAIRVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLSLGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLAIRVLA
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 GIPAPVYFGVLIDTSCLKWGFKRCGSRGSCRLYDSNVFRHIYLGLTVILGTVSILLSIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GIPAPVYFGVLIDTSCLKWGFKRCGSRGSCRLYDSNVFRHIYLGLTVILGTVSILLSIAV
560 570 580 590 600 610
670 680 690 700 710
pF1KE6 LFILKKNYVSKHRSFITKRERTMVSTRFQKENYTTSDHLLQPNYWPGKETQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LFILKKNYVSKHRSFITKRERTMVSTRFQKENYTTSDHLLQPNYWPGKETQL
620 630 640 650 660
>>CCDS8684.1 SLCO1B3 gene_id:28234|Hs108|chr12 (702 aa)
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10 20 30 40 50
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10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
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CCDS86 GIIMKISITQIERRFDISSSLAGLIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCLLM
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
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:.:..: ..:.::: :.: . . :: ::: :.: ::.... .: : . .
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110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
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.: ...: ::::::.::.::::::::: ::::.:.::::.: ....:.: ......:::
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: ..: . .: .:..: :: ::.:::::::.:.:::..:.:.::.:: :.: ::...
CCDS86 YVIFLLLTLLQVSSFIGSFTYVFKYMEQQYGQSASHANFLLGIITIPTVATGMFLGGFII
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CCDS86 KKFKLSLVGIAKFSFLTSMISFLFQLLYFPLICESKSVAGLTLTYDGNNSVASHVDVPLS
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:::.:.:.:..:::.::.:::::.: :::::..:. :. .::::.:: ... .. :
CCDS86 YCNSECNCDESQWEPVCGNNGITYLSPCLAGCKSSSGIKKHTVFYNCSCVEVTGLQNRNY
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:. .:.: .:: : . :. ...:.::.: . :: .: .. ..:.::..:.:. ..
CCDS86 SAHLGECPRDNTCTRKFFIYVAIQVINSLFSATGGTTFILLTVKIVQPELKALAMGFQSM
520 530 540 550 560 570
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.::.:.:: ::.:::.::: .:.::. . ::..:.::.:.: : ..::::.. : ..
CCDS86 VIRTLGGILAPIYFGALIDKTCMKWSTNSCGAQGACRIYNSVFFGRVYLGLSIALRFPAL
580 590 600 610 620 630
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pF1KE6 LLSIAVLFILKKNYVSKHRSFITKRERTMVSTRFQKENYTTSDHLLQPNYWPGKETQL
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CCDS86 VLYIVFIFAMKKKFQGKDTKASDNERKVMDEANLEFLNNGEHFVPSAGTDSKTCNLDMQD
640 650 660 670 680 690
>>CCDS8685.1 SLCO1B1 gene_id:10599|Hs108|chr12 (691 aa)
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10 20 30 40 50 60
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:: ..: :. ::.:: :::. ..::.:.
CCDS86 MDQNQHLNKTAEAQPSENKKTRYCNGLKMFLAALSLSFIAKTLGA
10 20 30 40
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CCDS86 IIMKSSIIHIERRFEISSSLVGFIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCFIMG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
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CCDS86 IGGVLTALPHFFMGYYRYSKETNINSSENSTSTLSTCLI---NQI-LSLNRASPEIVGKG
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: ...: ::::::.::.::::::::: :::..:.::::.: ....:.: ....:.::::
CCDS86 CLKESGSYMWIYVFMGNMLRGIGETPIVPLGLSYIDDFAKEGHSSLYLGILNAIAMIGPI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
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CCDS86 IGFTLGSLFSKMYVDIGYVDLSTIRITPTDSRWVGAWWLNFLVSGLFSIISSIPFFFLPQ
230 240 250 260 270 280
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CCDS86 T-PNKPQKERKASLSLHVLETNDEKDQTANLTNQGKN--ITKNVTGFFQSFKSILTNPLY
290 300 310 320 330
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... . .: .: .: :: ::.:::::: ::.::...:.:.:: : :.: :: ..:
CCDS86 VMFVLLTLLQVSSYIGAFTYVFKYVEQQYGQPSSKANILLGVITIPIFASGMFLGGYIIK
340 350 360 370 380 390
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pF1KE6 KFRISVCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSD
::.... : ::. ..:.. ..: : . :::..:::::..:.:..::. :. . .:
CCDS86 KFKLNTVGIAKFSCFTAVMSLSFYLLYFFILCENKSVAGLTMTYDGNNPVTSHRDVPLSY
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CCDS86 CNSDCNCDESQWEPVCGNNGITYISPCLAGCKSSSGNKKPIVFYNCSCLEVTGLQNRNYS
460 470 480 490 500 510
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pF1KE6 GIVGRCQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLSLGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLA
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CCDS86 AHLGECPRDDACTRKFYFFVAIQVLNLFFSALGGTSHVMLIVKIVQPELKSLALGFHSMV
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::.:.:: ::.:::.::::.:.::. . ::.::::: :.:. : ..::::. .: . :..
CCDS86 IRALGGILAPIYFGALIDTTCIKWSTNNCGTRGSCRTYNSTSFSRVYLGLSSMLRVSSLV
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: : ... .::.: : :. : : . . :. . . :.. :. .::.
CCDS86 LYIILIYAMKKKYQEKD---INASENGSVMDEANLESLNKNKHFV-PSAGADSETHC
640 650 660 670 680 690
>>CCDS44843.1 SLCO1B7 gene_id:338821|Hs108|chr12 (640 aa)
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40 50 60 70 80 90
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.: . :::::::.: :::::.:::::::::
CCDS44 MKISTTQIERRFEISSSLVGLIDGSFEIGN
10 20 30
100 110 120 130 140
pF1KE6 LLVITFVSYFGAKLHRPKIIGAGCVIMGVGTLLIAMPQFFMEQYKYERYS---PSSNSTL
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CCDS44 LFVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCFLMGTGSILMALPHFFMGYYRYSKETNIDPSENSTS
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 SISPCLLE---SSSQLPVSVMEKSKSKISNECEVDTSSSMWIYVFLGNLLRGIGETPIQP
.. ::.. : .. : ..:.. : ...: ::::::.::.::::::::: :
CCDS44 NLPNCLINQMLSLNRTPSEIIERG-------CVKESGSHMWIYVFMGNMLRGIGETPIVP
100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 LGIAYLDDFASEDNAAFYIGCVQTVAIIGPIFGFLLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPK
:::.:.::::.: ....:.: :..... : .:.:.:::: ::.:::::.:.:. : ::::
CCDS44 LGISYIDDFAKEGHSSLYLGTVNVMGMTGLVFAFMLGSLFAKMYVDIGYVDLSTIRITPK
150 160 170 180 190 200
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pF1KE6 DPQWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPKSLPRSQSREDSNSSSEKSKFIIDDHTDYQ
: .::::::::.:..::.:.....::..:: . : . ..: . : . : ...
CCDS44 DSRWVGAWWLGFLVSGIVSIISSIPFFFLPLN-PNKPQKERKVSLFLHVLKTNDKRNQIA
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 TPQGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVYFLYLCTSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQYGQ
. .. : . . :. :::... ::.: ... . ....: .. .:: :..:::::
CCDS44 NLTNRRKYITKNVTGFFQSLKSILTNPLYVIFVIFTLLHMSSYIASLTYIIKMVEQQYGW
270 280 290 300 310 320
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pF1KE6 SSSRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMKKFRISVCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALG
:.:..::..:.. .::::.:.:::: ..:::..:. : ::: . :.. : . : :
CCDS44 SASKTNFLLGVLALPAVAIGMFSGGYIIKKFKLSLVGLAKLAFCSATVHLLSQVLYFFLI
330 340 350 360 370 380
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pF1KE6 CENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSDCNSRCKCSETKWEPMCGENGITYVSACLAGC
::...:::::..:.:..:: : . .: :::.:.:.:..:::.::.:::::.: :::::
CCDS44 CESKSVAGLTLTYDGNSPVRSHVDVPLSYCNSECNCDESQWEPVCGNNGITYLSPCLAGC
390 400 410 420 430 440
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pF1KE6 QTSNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSSGIVGRCQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLS
..:. . . :.::::.:: . . .. : :. .:.: .:..: . ..::.:. .. .
CCDS44 KSSSGNKEPIVFYNCSCVEVIGLQNKNYSAHLGECPRDDACTRKSYVYFVIQVLDAFLCA
450 460 470 480 490 500
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pF1KE6 LGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLAIRVLAGIPAPVYFGVLIDTSCLKWGFKRCGS
.: .:..: ..:.::..:.:.... .: :.:: .:.:::.::::.:.::. . ::.
CCDS44 VGLTSYSVLVIRIVQPELKALAIGFHSMIMRSLGGILVPIYFGALIDTTCMKWSTNSCGA
510 520 530 540 550 560
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::.::.:.:. . . ..:: : : ..: . .:...:. .: . . .....: .
CCDS44 RGACRIYNSTYLGRAFFGLKVALIFPVLVLLTVFIFVVRKKSHGKDTKVLENERQVMDEA
570 580 590 600 610 620
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.. : :.:.. :. : :
CCDS44 NLEFLN--DSEHFV-----PSAEEQ
630 640
>>CCDS8686.1 SLCO1A2 gene_id:6579|Hs108|chr12 (670 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 NIQLFCKTSVQPVGRPSFKTEYPSSEEKQPCCGELKVFLCALSFVYFAKALAEGYLKSTI
: ..::.:: :.. .. .:.:. .:..: .
CCDS86 MGETEKRIETHRIRCLSKLKMFLLAITCAFVSKTLSGSYMNSML
10 20 30 40
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pF1KE6 TQIERRFDIPSSLVGVIDGSFEIGNLLVITFVSYFGAKLHRPKIIGAGCVIMGVGTLLIA
:::::.:.::.:::: :.:::::::::.: ::::::.::::: .:: :::.::.: .: .
CCDS86 TQIERQFNIPTSLVGFINGSFEIGNLLLIIFVSYFGTKLHRPIMIGIGCVVMGLGCFLKS
50 60 70 80 90 100
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.:.:.:.::.:: :.. : : .:...: ... ... .:: ...: ::
CCDS86 LPHFLMNQYEYESTVSVSGNLSSNSFLCMENGTQ----ILRPTQDP--SECTKEVKSLMW
110 120 130 140 150
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pF1KE6 IYVFLGNLLRGIGETPIQPLGIAYLDDFASEDNAAFYIGCVQTVAIIGPIFGFLLGSLCA
.::..::..::.::::: ::::.:..:::. .:. .::: :.: :::::..:.::.:.::
CCDS86 VYVLVGNIVRGMGETPILPLGISYIEDFAKFENSPLYIGLVETGAIIGPLIGLLLASFCA
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pF1KE6 KLYVDIGFVNLDHITITPKDPQWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPKSLPRSQSRED
..::: :::: : . ::: : .::::::.:.:: . ...:.:.::..::..::. :
CCDS86 NVYVDTGFVNTDDLIITPTDTRWVGAWWFGFLICAGVNVLTAIPFFFLPNTLPK----EG
220 230 240 250 260 270
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pF1KE6 SNSSSEKSKFIIDDHTDYQTPQGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVYFLYLCTSTVQFN
..... .: ... : : . .. : . ...:::: .:.: ::.:.:.. .:..:::
CCDS86 LETNAD---IIKNENEDKQKEEVKKEK-YGITKDFLPFMKSLSCNPIYMLFILVSVIQFN
280 290 300 310 320 330
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pF1KE6 SLFGMVTYKPKYIEQQYGQSSSRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMKKFRISVCGAAKL
.. .:... :::.::::: ::: : :..:. :.: . .: . ::..::::.:.: ::..
CCDS86 AFVNMISFMPKYLEQQYGISSSDAIFLMGIYNLPPICIGYIIGGLIMKKFKITVKQAAHI
340 350 360 370 380 390
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pF1KE6 YLGSSVFGYLLFLSLFALGCENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSDCNSRCKCSETKW
:.. :::.. : . ::::.:.:...::.: : : .:.::: :.: :
CCDS86 GCWLSLLEYLLYFLSFLMTCENSSVVGINTSYEGIPQDLYVENDIFADCNVDCNCPSKIW
400 410 420 430 440 450
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pF1KE6 EPMCGENGITYVSACLAGCQTSNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSSGIVGRCQKDNGC
.:.::.::..:.:::::::.:: .: :..: ::.:. . :::::...: :.: :
CCDS86 DPVCGNNGLSYLSACLAGCETSIGTGINMVFQNCSCI----QTSGNSSAVLGLCDKGPDC
460 470 480 490 500
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pF1KE6 PQMFLYFLVISVITSYTLSLGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLAIRVLAGIPAPVY
:. :::..:...:. ::..::::..::::.: . ::...:..:. ::.::::::.:
CCDS86 SLMLQYFLILSAMSSFIYSLAAIPGYMVLLRCMKSEEKSLGVGLHTFCTRVFAGIPAPIY
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 FGVLIDTSCLKWGFKRCGSRGSCRLYDSNVFRHIYLGLTVILGTVSILLSIAVLFILKKN
::.:.:..::.:: .:: :.::.:::..::.::::: . : :.. .. .:..:.:
CCDS86 FGALMDSTCLHWGTLKCGESGACRIYDSTTFRYIYLGLPAALRGSSFVPALIILILLRKC
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..
CCDS86 HLPGENASSGTELIETKVKGKENECKDIYQKSTVLKDDELKTKL
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>>CCDS10371.1 SLCO3A1 gene_id:28232|Hs108|chr15 (710 aa)
initn: 1452 init1: 393 opt: 1431 Z-score: 1689.8 bits: 323.2 E(32554): 8.4e-88
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pF1KE6 TSSKENIQLFCKTSVQPVGRPSFKTEYPSSEEKQPCCGELKVFLCALSFVYFAKALAEGY
..: : ...:.:: . ...:.. . .:
CCDS10 MQGKKPGGSSGGGRSGELQGDEAQRNKKKKKKVSCFSNIKIFLVSECALMLAQGTVGAY
10 20 30 40 50
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CCDS10 LVSVLTTLERRFNLQSADVGVIASSFEIGNLALILFVSYFGARGHRPRLIGCGGIVMALG
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.:: :.:.:. .::::: :.. . .. : ..:. : . :
CCDS10 ALLSALPEFLTHQYKYEAGEIRWGAEGRDV-----CAANGSGGD-----EGPDPDLI--C
120 130 140 150 160
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