Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6720
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6720, 753 aa
1>>>pF1KE6720 753 - 753 aa - 753 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2315+/-0.00118; mu= 14.6946+/- 0.071
mean_var=68.7743+/-13.984, 0's: 0 Z-trim(101.3): 78 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.154654
statistics sampled from 6388 (6467) to 6388 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 2.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14428.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 753) 4872 1096.8 0
CCDS65291.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 752) 4853 1092.6 0
CCDS65290.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 712) 3827 863.7 0
CCDS75994.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 713) 3827 863.7 0
CCDS2436.1 ABCB6 gene_id:10058|Hs108|chr2 ( 842) 1585 363.4 8.1e-100
CCDS1580.1 ABCB10 gene_id:23456|Hs108|chr1 ( 738) 801 188.5 3.2e-47
CCDS55090.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 (1257) 765 180.5 1.4e-44
CCDS9241.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 766) 754 178.0 4.8e-44
CCDS5608.1 ABCB1 gene_id:5243|Hs108|chr7 (1280) 743 175.6 4.3e-43
CCDS5913.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 718) 726 171.8 3.4e-42
CCDS64799.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 735) 726 171.8 3.5e-42
CCDS64798.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 630) 725 171.5 3.5e-42
CCDS5607.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1232) 720 170.5 1.5e-41
CCDS5605.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1279) 720 170.5 1.5e-41
CCDS5606.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1286) 720 170.5 1.5e-41
CCDS4758.1 TAP1 gene_id:6890|Hs108|chr6 ( 808) 650 154.8 4.9e-37
CCDS46444.1 ABCB11 gene_id:8647|Hs108|chr2 (1321) 652 155.3 5.8e-37
CCDS64800.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 693) 614 146.8 1.1e-34
CCDS58287.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 681) 613 146.6 1.3e-34
CCDS58288.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 683) 612 146.3 1.5e-34
CCDS78129.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 686) 585 140.3 9.7e-33
CCDS58286.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 703) 576 138.3 4e-32
CCDS43176.1 ABCC5 gene_id:10057|Hs108|chr3 (1437) 580 139.2 4.3e-32
CCDS7484.1 ABCC2 gene_id:1244|Hs108|chr10 (1545) 545 131.4 1e-29
CCDS9474.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 (1325) 544 131.2 1e-29
CCDS42122.1 ABCC1 gene_id:4363|Hs108|chr16 (1531) 536 129.4 4.1e-29
CCDS32681.1 ABCC3 gene_id:8714|Hs108|chr17 (1527) 523 126.5 3.1e-28
CCDS4755.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 653) 517 125.1 3.4e-28
CCDS10732.1 ABCC11 gene_id:85320|Hs108|chr16 (1382) 519 125.6 5.2e-28
CCDS10730.1 ABCC12 gene_id:94160|Hs108|chr16 (1359) 515 124.7 9.5e-28
CCDS4896.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1464) 485 118.0 1.1e-25
CCDS56430.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1492) 485 118.0 1.1e-25
CCDS5371.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 812) 468 114.2 8.3e-25
CCDS8693.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 463 113.1 3.3e-24
CCDS10568.1 ABCC6 gene_id:368|Hs108|chr16 (1503) 461 112.7 4.4e-24
CCDS8694.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 458 112.0 7.2e-24
CCDS5773.1 CFTR gene_id:1080|Hs108|chr7 (1480) 401 99.3 4.7e-20
CCDS55091.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 131) 320 81.1 1.2e-15
CCDS55092.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 126) 317 80.4 1.9e-15
CCDS74138.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17 (1616) 316 80.3 2.6e-14
CCDS74139.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17 (1621) 316 80.3 2.6e-14
CCDS10733.1 ABCC11 gene_id:85320|Hs108|chr16 (1344) 284 73.2 3.1e-12
CCDS13681.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21 ( 663) 278 71.8 3.9e-12
CCDS42938.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21 ( 666) 278 71.8 3.9e-12
CCDS42937.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21 ( 668) 278 71.8 4e-12
CCDS13683.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21 ( 677) 278 71.8 4e-12
CCDS13682.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21 ( 678) 278 71.8 4e-12
CCDS747.1 ABCA4 gene_id:24|Hs108|chr1 (2273) 278 71.9 1.3e-11
CCDS31437.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1581) 274 71.0 1.7e-11
CCDS73264.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1582) 274 71.0 1.7e-11
>>CCDS14428.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX (753 aa)
initn: 4872 init1: 4872 opt: 4872 Z-score: 5869.9 bits: 1096.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4872; 100.0% identity (100.0% similar) in 753 aa overlap (1-753:1-753)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MALLAMHSWRWAAAAAAFEKRRHSAILIRPLVSVSGSGPQWRPHQLGALGTARAYQQIPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MALLAMHSWRWAAAAAAFEKRRHSAILIRPLVSVSGSGPQWRPHQLGALGTARAYQQIPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SLKSITWQRLGKGNSGQFLDAAKALQVWPLIEKRTCWHGHAGGGLHTDPKEGLKDVDTRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLKSITWQRLGKGNSGQFLDAAKALQVWPLIEKRTCWHGHAGGGLHTDPKEGLKDVDTRK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 IIKAMLSYVWPKDRPDLRARVAISLGFLGGAKAMNIVVPFMFKYAVDSLNQMSGNMLNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IIKAMLSYVWPKDRPDLRARVAISLGFLGGAKAMNIVVPFMFKYAVDSLNQMSGNMLNLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DAPNTVATMATAVLIGYGVSRAGAAFFNEVRNAVFGKVAQNSIRRIAKNVFLHLHNLDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DAPNTVATMATAVLIGYGVSRAGAAFFNEVRNAVFGKVAQNSIRRIAKNVFLHLHNLDLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FHLSRQTGALSKAIDRGTRGISFVLSALVFNLLPIMFEVMLVSGVLYYKCGAQFALVTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FHLSRQTGALSKAIDRGTRGISFVLSALVFNLLPIMFEVMLVSGVLYYKCGAQFALVTLG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 TLGTYTAFTVAVTRWRTRFRIEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNERYEAQRYDGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TLGTYTAFTVAVTRWRTRFRIEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNERYEAQRYDGF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LKTYETASLKSTSTLAMLNFGQSAIFSVGLTAIMVLASQGIVAGTLTVGDLVMVNGLLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LKTYETASLKSTSTLAMLNFGQSAIFSVGLTAIMVLASQGIVAGTLTVGDLVMVNGLLFQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 LSLPLNFLGTVYRETRQALIDMNTLFTLLKVDTQIKDKVMASPLQITPQTATVAFDNVHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LSLPLNFLGTVYRETRQALIDMNTLFTLLKVDTQIKDKVMASPLQITPQTATVAFDNVHF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 EYIEGQKVLSGISFEVPAGKKVAIVGGSGSGKSTIVRLLFRFYEPQKGSIYLAGQNIQDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EYIEGQKVLSGISFEVPAGKKVAIVGGSGSGKSTIVRLLFRFYEPQKGSIYLAGQNIQDV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 SLESLRRAVGVVPQDAVLFHNTIYYNLLYGNISASPEEVYAVAKLAGLHDAILRMPHGYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLESLRRAVGVVPQDAVLFHNTIYYNLLYGNISASPEEVYAVAKLAGLHDAILRMPHGYD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 TQVGERGLKLSGGEKQRVAIARAILKDPPVILYDEATSSLDSITEETILGAMKDVVKHRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TQVGERGLKLSGGEKQRVAIARAILKDPPVILYDEATSSLDSITEETILGAMKDVVKHRT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 SIFIAHRLSTVVDADEIIVLDQGKVAERGTHHGLLANPHSIYSEMWHTQSSRVQNHDNPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SIFIAHRLSTVVDADEIIVLDQGKVAERGTHHGLLANPHSIYSEMWHTQSSRVQNHDNPK
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE6 WEAKKENISKEEERKKLQEEIVNSVKGCGNCSC
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WEAKKENISKEEERKKLQEEIVNSVKGCGNCSC
730 740 750
>>CCDS65291.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX (752 aa)
initn: 4490 init1: 4490 opt: 4853 Z-score: 5847.0 bits: 1092.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4853; 99.9% identity (99.9% similar) in 753 aa overlap (1-753:1-752)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MALLAMHSWRWAAAAAAFEKRRHSAILIRPLVSVSGSGPQWRPHQLGALGTARAYQQIPE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS65 MALLAMHSWRWAAAAAAFEKRRHSAILIRPLVSVSGSGPQWRPHQLGALGTARAYQ-IPE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SLKSITWQRLGKGNSGQFLDAAKALQVWPLIEKRTCWHGHAGGGLHTDPKEGLKDVDTRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SLKSITWQRLGKGNSGQFLDAAKALQVWPLIEKRTCWHGHAGGGLHTDPKEGLKDVDTRK
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 IIKAMLSYVWPKDRPDLRARVAISLGFLGGAKAMNIVVPFMFKYAVDSLNQMSGNMLNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 IIKAMLSYVWPKDRPDLRARVAISLGFLGGAKAMNIVVPFMFKYAVDSLNQMSGNMLNLS
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DAPNTVATMATAVLIGYGVSRAGAAFFNEVRNAVFGKVAQNSIRRIAKNVFLHLHNLDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 DAPNTVATMATAVLIGYGVSRAGAAFFNEVRNAVFGKVAQNSIRRIAKNVFLHLHNLDLG
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FHLSRQTGALSKAIDRGTRGISFVLSALVFNLLPIMFEVMLVSGVLYYKCGAQFALVTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 FHLSRQTGALSKAIDRGTRGISFVLSALVFNLLPIMFEVMLVSGVLYYKCGAQFALVTLG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 TLGTYTAFTVAVTRWRTRFRIEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNERYEAQRYDGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TLGTYTAFTVAVTRWRTRFRIEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNERYEAQRYDGF
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LKTYETASLKSTSTLAMLNFGQSAIFSVGLTAIMVLASQGIVAGTLTVGDLVMVNGLLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LKTYETASLKSTSTLAMLNFGQSAIFSVGLTAIMVLASQGIVAGTLTVGDLVMVNGLLFQ
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430 440 450 460 470 480
pF1KE6 LSLPLNFLGTVYRETRQALIDMNTLFTLLKVDTQIKDKVMASPLQITPQTATVAFDNVHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LSLPLNFLGTVYRETRQALIDMNTLFTLLKVDTQIKDKVMASPLQITPQTATVAFDNVHF
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490 500 510 520 530 540
pF1KE6 EYIEGQKVLSGISFEVPAGKKVAIVGGSGSGKSTIVRLLFRFYEPQKGSIYLAGQNIQDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EYIEGQKVLSGISFEVPAGKKVAIVGGSGSGKSTIVRLLFRFYEPQKGSIYLAGQNIQDV
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550 560 570 580 590 600
pF1KE6 SLESLRRAVGVVPQDAVLFHNTIYYNLLYGNISASPEEVYAVAKLAGLHDAILRMPHGYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SLESLRRAVGVVPQDAVLFHNTIYYNLLYGNISASPEEVYAVAKLAGLHDAILRMPHGYD
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 TQVGERGLKLSGGEKQRVAIARAILKDPPVILYDEATSSLDSITEETILGAMKDVVKHRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TQVGERGLKLSGGEKQRVAIARAILKDPPVILYDEATSSLDSITEETILGAMKDVVKHRT
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 SIFIAHRLSTVVDADEIIVLDQGKVAERGTHHGLLANPHSIYSEMWHTQSSRVQNHDNPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SIFIAHRLSTVVDADEIIVLDQGKVAERGTHHGLLANPHSIYSEMWHTQSSRVQNHDNPK
660 670 680 690 700 710
730 740 750
pF1KE6 WEAKKENISKEEERKKLQEEIVNSVKGCGNCSC
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 WEAKKENISKEEERKKLQEEIVNSVKGCGNCSC
720 730 740 750
>>CCDS65290.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX (712 aa)
initn: 4193 init1: 3825 opt: 3827 Z-score: 4610.2 bits: 863.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4501; 94.6% identity (94.6% similar) in 753 aa overlap (1-753:1-712)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MALLAMHSWRWAAAAAAFEKRRHSAILIRPLVSVSGSGPQWRPHQLGALGTARAYQQIPE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS65 MALLAMHSWRWAAAAAAFEKRRHSAILIRPLVSVSGSGPQWRPHQLGALGTARAYQ-IPE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SLKSITWQRLGKGNSGQFLDAAKALQVWPLIEKRTCWHGHAGGGLHTDPKEGLKDVDTRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SLKSITWQRLGKGNSGQFLDAAKALQVWPLIEKRTCWHGHAGGGLHTDPKEG--------
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 IIKAMLSYVWPKDRPDLRARVAISLGFLGGAKAMNIVVPFMFKYAVDSLNQMSGNMLNLS
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 --------------------------------AMNIVVPFMFKYAVDSLNQMSGNMLNLS
120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DAPNTVATMATAVLIGYGVSRAGAAFFNEVRNAVFGKVAQNSIRRIAKNVFLHLHNLDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 DAPNTVATMATAVLIGYGVSRAGAAFFNEVRNAVFGKVAQNSIRRIAKNVFLHLHNLDLG
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FHLSRQTGALSKAIDRGTRGISFVLSALVFNLLPIMFEVMLVSGVLYYKCGAQFALVTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 FHLSRQTGALSKAIDRGTRGISFVLSALVFNLLPIMFEVMLVSGVLYYKCGAQFALVTLG
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 TLGTYTAFTVAVTRWRTRFRIEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNERYEAQRYDGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TLGTYTAFTVAVTRWRTRFRIEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNERYEAQRYDGF
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LKTYETASLKSTSTLAMLNFGQSAIFSVGLTAIMVLASQGIVAGTLTVGDLVMVNGLLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LKTYETASLKSTSTLAMLNFGQSAIFSVGLTAIMVLASQGIVAGTLTVGDLVMVNGLLFQ
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 LSLPLNFLGTVYRETRQALIDMNTLFTLLKVDTQIKDKVMASPLQITPQTATVAFDNVHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LSLPLNFLGTVYRETRQALIDMNTLFTLLKVDTQIKDKVMASPLQITPQTATVAFDNVHF
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 EYIEGQKVLSGISFEVPAGKKVAIVGGSGSGKSTIVRLLFRFYEPQKGSIYLAGQNIQDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EYIEGQKVLSGISFEVPAGKKVAIVGGSGSGKSTIVRLLFRFYEPQKGSIYLAGQNIQDV
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 SLESLRRAVGVVPQDAVLFHNTIYYNLLYGNISASPEEVYAVAKLAGLHDAILRMPHGYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SLESLRRAVGVVPQDAVLFHNTIYYNLLYGNISASPEEVYAVAKLAGLHDAILRMPHGYD
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TQVGERGLKLSGGEKQRVAIARAILKDPPVILYDEATSSLDSITEETILGAMKDVVKHRT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SIFIAHRLSTVVDADEIIVLDQGKVAERGTHHGLLANPHSIYSEMWHTQSSRVQNHDNPK
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730 740 750
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:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 WEAKKENISKEEERKKLQEEIVNSVKGCGNCSC
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CCDS75 MALLAMHSWRWAAAAAAFEKRRHSAILIRPLVSVSGSGPQWRPHQLGALGTARAYQQIPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SLKSITWQRLGKGNSGQFLDAAKALQVWPLIEKRTCWHGHAGGGLHTDPKEG--------
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CCDS75 --------------------------------AMNIVVPFMFKYAVDSLNQMSGNMLNLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS75 FHLSRQTGALSKAIDRGTRGISFVLSALVFNLLPIMFEVMLVSGVLYYKCGAQFALVTLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TLGTYTAFTVAVTRWRTRFRIEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNERYEAQRYDGF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SLESLRRAVGVVPQDAVLFHNTIYYNLLYGNISASPEEVYAVAKLAGLHDAILRMPHGYD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TQVGERGLKLSGGEKQRVAIARAILKDPPVILYDEATSSLDSITEETILGAMKDVVKHRT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WEAKKENISKEEERKKLQEEIVNSVKGCGNCSC
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..: .:.:..::.... :. :.. :: :..: :... :.. . : . .
CCDS24 LMGLERALNVLVPIFYRNIVNLLTE---------KAPWNSLAWTVTSYVFLKFLQGGGTG
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...: ...:. .. .: : . ::. .: :::.:.: .::.:.:: . . :::: ...
CCDS24 STGFVSNLRTFLWIRVQQFTSRRVELLIFSHLHELSLRWHLGRRTGEVLRIADRGTSSVT
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.:: ::::..: . .... :..:.. .: :.:... .. : ..:..::.:::.::
CCDS24 GLLSYLVFNVIPTLADIII--GIIYFSMFFNAWFGLIVFLCMSLYLTLTIVVTEWRTKFR
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330 340 350 360 370 380
pF1KE6 IEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNERYEAQRYDGFLKTYETASLKSTSTLAMLNF
:: .: . :.:::::.:::::.: : ::..:: . :. ::...:..::
CCDS24 RAMNTQENATRARAVDSLLNFETVKYYNAESYEVERYREAIIKYQGLEWKSSASLVLLNQ
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pF1KE6 GQSAIFSVGLTAIMVLASQGIVAGTLTVGDLVMVNGLLFQLSLPLNFLGTVYRETRQALI
:. ....:: : .: . .. : ::: :. . ..:: .:::..:: :: . .:
CCDS24 TQNLVIGLGLLAGSLLCAYFVTEQKLQVGDYVLFGTYIIQLYMPLNWFGTYYRMIQTNFI
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pF1KE6 DMNTLFTLLKVDTQIKDKVMASPLQITPQTATVAFDNVHFEYIEGQKVLSGISFEVPAGK
::...: ::: .:..:: :.::.. : . . :.:::: : .:...:. .:: : :.
CCDS24 DMENMFDLLKEETEVKDLPGAGPLRF--QKGRIEFENVHFSYADGRETLQDVSFTVMPGQ
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.:.:: ::.:::::.:::::::. ..: : . ::.:..:. ::: .::::::.:::.
CCDS24 TLALVGPSGAGKSTILRLLFRFYDISSGCIRIDGQDISQVTQASLRSHIGVVPQDTVLFN
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pF1KE6 NTIYYNLLYGNISASPEEVYAVAKLAGLHDAILRMPHGYDTQVGERGLKLSGGEKQRVAI
.:: :. :: ..:. .:: :.:. ::.::::. .:.:: ::::::::::::::::::::
CCDS24 DTIADNIRYGRVTAGNDEVEAAAQAAGIHDAIMAFPEGYRTQVGERGLKLSGGEKQRVAI
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pF1KE6 ARAILKDPPVILYDEATSSLDSITEETILGAMKDVVKHRTSIFIAHRLSTVVDADEIIVL
::.::: : .:: :::::.::. .:..: ... : .::.: .::::::::.::.:.:.
CCDS24 ARTILKAPGIILLDEATSALDTSNERAIQASLAKVCANRTTIVVAHRLSTVVNADQILVI
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pF1KE6 DQGKVAERGTHHGLLANPHSIYSEMWHTQSSRVQNHDNPKWEAKKENISKEEERKKLQEE
.: ..::: :..::. ..:..::. :... .. .. :
CCDS24 KDGCIVERGRHEALLSRG-GVYADMWQLQQGQEETSEDTKPQTMER
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750
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. .:. ..:. : :.: ..::: ..
CCDS15 AGDEAWRRGPAAPPGDKGRLRPAAAGLPEARKLLGLAYPERR-----RLAAAVGFLTMSS
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.... .::.. .: . ... .. :: . . .::.. ::: : .:
CCDS15 VISMSAPFFLGKIIDVI--YTNPTVDYSDNLTRLCLGLSAVFL------CGAAA-NAIRV
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.. .: . :. ..: . ...: . .:: : :.: . ... ... ::
CCDS15 YLMQTSGQRIVNRLRTSLFSSILRQEVAFFDKTRTGEL---INRLSSDTALLGRSVTENL
240 250 260 270 280 290
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. .: :. ... . ..: .:... . ..: :. .. . . .:
CCDS15 SDGLRAGAQASVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIAVIYGRYLRKLTKVTQDSLAQA
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. : . . : .::. :..: : ..: . :. .. .: ..: .: .. .: .:
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.. :: . :.. :. .:::.: : ... .. :.. : : ..: . :. :
CCDS15 IVLSVLYKGGLLMGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIGGLSSFYSELMKGLGAGGRLWEL
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:. . .. .. :. . . . : : . : :::: : .: .. .:. .:.:. .:.
CCDS15 LEREPKLPFNEGVILN--EKSFQGA-LEFKNVHFAYPARPEVPIFQDFSLSIPSGSVTAL
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:: :::::::.. ::.:.:.: .:.: : :..:.... :: .:.: :. .:: .:
CCDS15 VGPSGSGKSTVLSLLLRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWLRSKIGTVSQEPILFSCSIA
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:. :: :.. ::. ::..:. : .:.:..: :::.:. ::::.:::.:::
CCDS15 ENIAYGADDPSSVTAEEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTVVGEKGVLLSGGQKQRIAIA
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::.::.: ..: :::::.::. .: . :. .. :: . :::::::. .:. . :::
CCDS15 RALLKNPKILLLDEATSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIAHRLSTIKNANMVAVLD
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:::..: : :. ::..:..:: .. . ::
CCDS15 QGKITEYGKHEELLSKPNGIYRKLMNKQSFISA
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CCDS55 GEMSDNLISGCLVQTNTTNYQNCTQSQEKLNEDMTLLTLYYVGIGVA---ALIFGYIQIS
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.. .: . .:: :. : . :.:. : . : : . ::. . ::. . ::.
CCDS55 LWIITAARQTKRIRKQFFHSVLAQDIGWFDSCDIGELNTRMTDDIDKISDGIGDKI-ALL
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:. . : . :. :.. : ...::::.: : ..: .: . . .: .
CCDS55 FQNMST-FSIGLAVGLVK---GWKLTLVTLSTSPLIMASAAACSRMVISLTSKELSAYSK
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:: .: . : . .:: : .. : ::: :: . ..: : . ...: .: :
CCDS55 AGAVAEEVLSSIRTVIAFRAQEKELQRYTQNLKDAKDFGIKRT-IASKVSLGAVYFFMNG
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.. ... :. : :.: .. : .:.. .:.. . . : .. :
CCDS55 TYGLAFWYGTSLILNGEPGYTIGTVLAV---FFSVIHSSYCIGAAVPHFETFAIARGAAF
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CCDS55 HIFQVIDKKPSIDNFSTAGYKPESIEGTVEFKNVSFNYPSRPSIKILKGLNLRIKSGETV
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:.:: .::::::.:.:: :.:.:. : :.. ..:. .... : .::: :. ::: .:
CCDS55 ALVGLNGSGKSTVVQLLQRLYDPDDGFIMVDENDIRALNVRHYRDHIGVVSQEPVLFGTT
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: :. :: ... ::. .:. :. .: :...:. ..: :::.: ..:::.:::.::::
CCDS55 ISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYDFIMEFPNKFNTLVGEKGAQMSGGQKQRIAIAR
480 490 500 510 520 530
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pF1KE6 AILKDPPVILYDEATSSLDSITEETILGAMKDVVKHRTSIFIAHRLSTVVDADEIIVLDQ
:....: ... :::::.::: .. .. .:.. . : ::.: .::::::. .:: :..: .
CCDS55 ALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQAALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTLKD
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pF1KE6 GKVAERGTHHGLLANPHSIYSEMWHTQSSRVQNHDNPKWEAKKENISKEEERK--KLQEE
: .::.:.: :.:. : : :...: : . . :... ::: .: .
CCDS55 GMLAEKGAHAELMAKRGLYY--------SLVMSQDIKKADEQMESMTYSTERKTNSLPLH
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pF1KE6 IVNSVKGCGNCSC
:.:.:
CCDS55 SVKSIKSDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKLNKPEWPFVVLGTLASVLNGTVHPVF
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>--
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CCDS55 TYSTERKTNSLPLHSVKSIKSDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILK-LNKPEWP----
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pF1KE6 DLRARVAISLGFLGGAKAMNIVVPFMFKYAVDSLNQMSGNMLNLSDAPNTVATMATAVLI
. :: : :...: .: .:. .. : :: : . . . : . . ...
CCDS55 ------FVVLGTL--ASVLNGTVHPVFSIIFAKIITMFGN--NDKTTLKHDAEIYSMIFV
700 710 720 730 740
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pF1KE6 GYGVSRAGAAFFNEVRNAVFGKVAQNSIRRIAKNVFLHLHNLDLGFHLSRQ--TGALSKA
:: ...: ... .:.... :. . .: . :... .. ::.:.
CCDS55 ILGVI-CFVSYF--MQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGLTTI
750 760 770 780 790
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pF1KE6 IDRGTRGISFVLSALVFNLLPIMFEVMLVSGVLYYKCGAQFALVTLGTLGTYTAFTVAVT
. :. . .. . ..: : .: .. . : ..... :. . .. . :
CCDS55 LAIDIAQIQGATGSRI-GVLTQNATNMGLSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMIET
800 810 820 830 840 850
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pF1KE6 RWRTRFRIEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNERYEAQRYDGFLKTYETASLKSTS
: : . .. . ::. : ..: : .:. .. :. : :. .:.: . . :...
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pF1KE6 TLAMLNFGQSAIFSVGLTAIMVLASQGIVAGTLTVGDLVMVNGLLFQLSLPLNFLGTVYR
.. . :.. . .: . ... : :: .: . .: . .. .. ..
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: .: ::.::. .: .. : :.: ... : .: : : : :
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:.:. . :: ::.::.:: :::: :.:: :.:.: .:.. . : . ...... :: .
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..:::. :::. .: :. ::. : . : .:. .:. :..:. : .:. :.:::: .:
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.::::.:::.:::::.:. : ..: :::::.::. .:... :. . :: . ..::
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::.. .:: :.:: .::. :.:::. :: : ..:: .. ..::
CCDS55 LSAIQNADLIVVLHNGKIKEQGTHQELLRN-RDIYFKLVNAQSVQ
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CCDS92 ALGETFLPYYTGRAIDGIV-IQKSMDQFSTAVVIVCLLAI-----------GSSFAAGIR
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..:. ... ...: .: :.:. : :. .. .:.:: :.. . .: ..
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. :...: .: : .. . : :.:: : : .::...:: . :: .:.::
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CCDS92 PSGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFARSITDN
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. :: .. : : .:. :. : :... ::.:..::.: .::::.:::::.:::...
CCDS92 ISYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVR
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CCDS92 NPPVLILDEATSALDAESEYLIQQAIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLIVVLDKGRVV
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CCDS92 QQGTHQQLLAQG-GLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA
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.:: .. . : . : :: .: . : .:: :.... : .::. :. . .
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.:.. : : ...: . .. . :. .. ...: ..:... : .:.. .
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.: . . .:. . .. . ..:. :.. . :. : . ... : :::: :
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. :.:.:....: .:. ::.::.:: :::: :.:. :.:.: .: . . ::.:. ...
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. ::. .::: :. ::: .:: :. :: ... .:. ..: :. .: :...:: .::
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CCDS56 VIAHRLSTVRNADVIAGFDDGVIVEKGNHDELM-KEKGIYFKLVTMQTAGNEVELENAAD
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. : : ..:... :..: .. ::.:
CCDS56 ESKSEIDALEMSSNDSRSSLIRKRSTRRSVRGSQAQDRKLSTKEALDESIPPVSFWRIMK
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:..:. :. . . :. . . .. .: . .:. : ... :..:: ...:.
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CCDS56 KVLLDGKEIKRLNVQWLRAHLGIVSQEPILFDCSIAENIAYGDNSRVVSQEEIVRAAKEA
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CCDS56 NIHAFIESLPNKYSTKVGDKGTQLSGGQKQRIAIARALVRQPHILLLDEATSALDTESEK
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CCDS56 VVQEALDKAREGRTCIVIAHRLSTIQNADLIVVFQNGRVKEHGTHQQLLAQ-KGIYFSMV
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CCDS56 SVQAGTKRQ
1280
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CCDS59 MLVHLFRVGIRGGPFPGRLLPPLRFQTFSAVRYSDGYRSSSLLRAVAHLRS
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:.: :: . . :: : : : : : .:. .: ...
CCDS59 QLWAHLPRAPLAPRWSPSAWCWVGGALLGPMVLSKHPHLCLVALCEAEEAPPASSTPHVV
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CCDS59 GSRFNWKLFWQFLHPHLLVLGVAVVLAL--GAALVNVQIPLLLGQLVEVVAKYTRDHVGS
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.... : ..: .:: :::. : :. . .....:.. . . .: :
CCDS59 FMTESQN----LSTHLLILYGVQ--GLLTFGYL--VLLSHVGERMAVDMRRALFSSLLRQ
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CCDS59 DITFFDANKTGQL---VSRLTTDVQEFKSSFKLVISQGLRSCTQVAGCLVSLSMLSTRLT
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: ..: . . :.. . : : ... : .: ..: : .::. : :. :
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CCDS59 ERYGAELEACRCRAEELGRGIALFQ-GLSNIAFNCMVLGTLFIGGSLVAGQQLTGGDLMS
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CCDS59 RGSVTFQNVCFSYPCRPGFEVLKDFTLTLPPGKIVALVGQSGGGKTTVASLLERFYDPTA
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CCDS59 GVVMLDGRDLRTLDPSWLRGQVVGFISQEPVLFGTTIMENIRFGKLEASDEEVYTAAREA
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. :. : .:.::.: ::::: ::::.:::.:::::..:.: :.. :::::.::. .:.
CCDS59 NAHEFITSFPEGYNTVVGERGTTLSGGQKQRLAIARALIKQPTVLILDEATSALDAESER
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.. :. . :: . :::::::: : :.:. .:.: : :::. :: . ..:.:.
CCDS59 VVQEALDRASAGRTVLVIAHRLSTVRGAHCIVVMADGRVWEAGTHEELL-KKGGLYAELI
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pF1KE6 HTQSSRVQNHDNPKWEAKKENISKEEERKKLQEEIVNSVKGCGNCSC
: : : :. :
CCDS59 -----RRQALDAPRTAAPPPKKPEGPRSHQHKS
700 710
753 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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