Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6716
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6716, 755 aa
1>>>pF1KE6716 755 - 755 aa - 755 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3369+/-0.000921; mu= 15.3649+/- 0.055
mean_var=81.9142+/-16.636, 0's: 0 Z-trim(106.8): 33 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.141708
statistics sampled from 9187 (9204) to 9187 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 2.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3322.1 SENP5 gene_id:205564|Hs108|chr3 ( 755) 5178 1068.6 0
CCDS77876.1 SENP5 gene_id:205564|Hs108|chr3 ( 709) 4299 888.9 0
CCDS73958.1 SENP3 gene_id:26168|Hs108|chr17 ( 574) 1040 222.6 1.4e-57
CCDS44868.2 SENP1 gene_id:29843|Hs108|chr12 ( 644) 541 120.6 7.7e-27
CCDS33902.1 SENP2 gene_id:59343|Hs108|chr3 ( 589) 488 109.8 1.3e-23
>>CCDS3322.1 SENP5 gene_id:205564|Hs108|chr3 (755 aa)
initn: 5178 init1: 5178 opt: 5178 Z-score: 5717.6 bits: 1068.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5178; 99.9% identity (99.9% similar) in 755 aa overlap (1-755:1-755)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKKQRKILWRKGIHLAFSEKWNTGFGGFKKFYFHQHLCILKAKLGRPVTWNRQLRHFQGR
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CCDS33 MKKQRKILWRKGIHLAFSEKWNTGFGGFKKFYFHQHLCILKAKLGRPVTWNRQLRHFQGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KKALQIQKTWIKDEPLCAKTKFNVATQNVSTLSSKVKRKDAKHFISSSKTLLRLQAEKLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SSAKNSDHEYCREKNLLKAVTDFPSNSALGQANGHRPRTDPQPSDFPMKFNGESQSPGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SSAKNSDHEYCREKNLLKAVTDFPSNSALGQANGHRPRTDPQPSDFPMKFNGESQSPGES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GTIVVTLNNHKRKGFCYGCCQGPEHHRNGGPLIPKKFQLNQHRRIKLSPLMMYEKLSMIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GTIVVTLNNHKRKGFCYGCCQGPEHHRNGGPLIPKKFQLNQHRRIKLSPLMMYEKLSMIR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FRYRILRSQHFRTKSKVCKLRKAQRSWVQKVTGDHQETRRENGEGGSCSPFPSPEPKDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FRYRILRSQHFRTKSKVCKLRKAQRSWVQKVTGDHQETRRENGEGGSCSPFPSPEPKDPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CRHQPYFPDMDSSAVVKGTNSHVPDCHTKGSSFLGKELSLDEAFPDQQNGSATNAWDQSS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 CSSPKWECTELIHDIPLPEHRSNTMFISETEREIMTLGQENQTSSVSDDRVKLSVSGADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CSSPKWECTELIHDIPLPEHRSNTMFISETEREIMTLGQENQTSSVSDDRVKLSVSGADT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SVSSVDGPVSQKAVQNENSYQMEEDGSLKQSILSSELLDHPYCKSPLEAPLVCSGLKLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SVSSVDGPVSQKAVQNENSYQMEEDGSLKQSILSSELLDHPYCKSPLEAPLVCSGLKLEN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 QVGGGKNSQKASPVDDEQLSVCLSGFLDEVMKKYGSLVPLSEKEVLGRLKDVFNEDFSNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QVGGGKNSQKASPVDDEQLSVCLSGFLDEVMKKYGSLVPLSEKEVLGRLKDVFNEDFSNR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 KPFINREITNYRARHQKCNFRIFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KPFINREITNYRARHQKCNFRIFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 DKVHFFNSFFHRQLVTKGYNGVKRWTKKVDLFKKSLLLIPIHLEVHWSLITVTLSNRIIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DKVHFFNSFFHRQLVTKGYNGVKRWTKKVDLFKKSLLLIPIHLEVHWSLITVTLSNRIIS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 FYDSQGIHFKFCVENIRKYLLTEAREKNRPEFLQGWQTAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FYDSQGIHFKFCVENIRKYLLTEAREKNRPEFLQGWQTAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQY
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE6 CKCLALEQPFQFSQEDMPRVRKRIYKELCECRLMD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CKCLALEQPFQFSQEDMPRVRKRIYKELCECRLMD
730 740 750
>>CCDS77876.1 SENP5 gene_id:205564|Hs108|chr3 (709 aa)
initn: 4299 init1: 4299 opt: 4299 Z-score: 4746.9 bits: 888.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4773; 93.8% identity (93.8% similar) in 755 aa overlap (1-755:1-709)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKKQRKILWRKGIHLAFSEKWNTGFGGFKKFYFHQHLCILKAKLGRPVTWNRQLRHFQGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MKKQRKILWRKGIHLAFSEKWNTGFGGFKKFYFHQHLCILKAKLGRPVTWNRQLRHFQGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 KKALQIQKTWIKDEHLCAKTKFNVATQNVSTLSSKVKRKDAKHFISSSKTLLRLQAEKLL
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KKALQIQKTWIKDEPLCAKTKFNVATQNVSTLSSKVKRKDAKHFISSSKTLLRLQAEKLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SSAKNSDHEYCREKNLLKAVTDFPSNSALGQANGHRPRTDPQPSDFPMKFNGESQSPGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SSAKNSDHEYCREKNLLKAVTDFPSNSALGQANGHRPRTDPQPSDFPMKFNGESQSPGES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GTIVVTLNNHKRKGFCYGCCQGPEHHRNGGPLIPKKFQLNQHRRIKLSPLMMYEKLSMIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GTIVVTLNNHKRKGFCYGCCQGPEHHRNGGPLIPKKFQLNQHRRIKLSPLMMYEKLSMIR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FRYRILRSQHFRTKSKVCKLRKAQRSWVQKVTGDHQETRRENGEGGSCSPFPSPEPKDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FRYRILRSQHFRTKSKVCKLRKAQRSWVQKVTGDHQETRRENGEGGSCSPFPSPEPKDPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CRHQPYFPDMDSSAVVKGTNSHVPDCHTKGSSFLGKELSLDEAFPDQQNGSATNAWDQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 CRHQPYFPDMDSSAVVKGTNSHVPDCHTKGSSFLGKELSLDEAFPDQQNGSATNAWDQSS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 CSSPKWECTELIHDIPLPEHRSNTMFISETEREIMTLGQENQTSSVSDDRVKLSVSGADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 CSSPKWECTELIHDIPLPEHRSNTMFISETEREIMTLGQENQTSSVSDDRVKLSVSGADT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SVSSVDGPVSQKAVQNENSYQMEEDGSLKQSILSSELLDHPYCKSPLEAPLVCSGLKLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SVSSVDGPVSQKAVQNENSYQMEEDGSLKQSILSSELLDHPYCKSPLEAPLVCSGLKLEN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 QVGGGKNSQKASPVDDEQLSVCLSGFLDEVMKKYGSLVPLSEKEVLGRLKDVFNEDFSNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QVGGGKNSQKASPVDDEQLSVCLSGFLDEVMKKYGSLVPLSEKEVLGRLKDVFNEDFSNR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 KPFINREITNYRARHQKCNFRIFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KPFINREITNYRARHQKCNFRIFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 DKVHFFNSFFHRQLVTKGYNGVKRWTKKVDLFKKSLLLIPIHLEVHWSLITVTLSNRIIS
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DKVHFFNSFFHRQLVTKGYNGVKRWTKK--------------------------------
610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 FYDSQGIHFKFCVENIRKYLLTEAREKNRPEFLQGWQTAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 --------------NIRKYLLTEAREKNRPEFLQGWQTAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQY
630 640 650 660 670
730 740 750
pF1KE6 CKCLALEQPFQFSQEDMPRVRKRIYKELCECRLMD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 CKCLALEQPFQFSQEDMPRVRKRIYKELCECRLMD
680 690 700
>>CCDS73958.1 SENP3 gene_id:26168|Hs108|chr17 (574 aa)
initn: 1041 init1: 887 opt: 1040 Z-score: 1147.5 bits: 222.6 E(32554): 1.4e-57
Smith-Waterman score: 1040; 53.5% identity (79.2% similar) in 284 aa overlap (475-753:291-572)
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 DGSLKQSILSSELLDHPYCKSPLEAPLVCSGLKLENQVGGGKNSQKASPVDDEQLSVCLS
:. : . : : .:. ::. .:... :..
CCDS73 LAPPDASILISNVCSIGDHVAQELFQGSDLGMAEEAERPGEKAGQH-SPLREEHVT-CVQ
270 280 290 300 310
510 520 530 540 550
pF1KE6 GFLDEVMKKYGSLVPLSEKEVLGRLKDVFNEDFS--NRKPFINREITNYRARHQKC---N
..::: .. ::::.::: ::. .:.:.:...:: .:: .. . : .:. . .
CCDS73 SILDEFLQTYGSLIPLSTDEVVEKLEDIFQQEFSTPSRKGLVLQLIQSYQRMPGNAMVRG
320 330 340 350 360 370
560 570 580 590 600 610
pF1KE6 FRIFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVPDKVHFFNSFFHRQLVTKGY
::. :..:.: ::::.:: :::::::::.::::.:.::.::.:::::::::. .: ::::
CCDS73 FRVAYKRHVLTMDDLGTLYGQNWLNDQVMNMYGDLVMDTVPEKVHFFNSFFYDKLRTKGY
380 390 400 410 420 430
620 630 640 650 660 670
pF1KE6 NGVKRWTKKVDLFKKSLLLIPIHLEVHWSLITVTLSNRIISFYDSQGIHFKFCVENIRKY
.:::::::.::.:.: :::::::::::::::.: . : :...::: . : ..: ::
CCDS73 DGVKRWTKNVDIFNKELLLIPIHLEVHWSLISVDVRRRTITYFDSQRTLNRRCPKHIAKY
440 450 460 470 480 490
680 690 700 710 720 730
pF1KE6 LLTEAREKNRPEFLQGWQTAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQYCKCLALEQPFQFSQEDMPR
: .:: .:.: .: :::. . .:.::::::.::::::: ::: :::.:.:.:::.
CCDS73 LQAEAVKKDRLDFHQGWKGYFKMNVARQNNDSDCGAFVLQYCKHLALSQPFSFTQQDMPK
500 510 520 530 540 550
740 750
pF1KE6 VRKRIYKELCECRLMD
.:..::::::.:.:
CCDS73 LRRQIYKELCHCKLTV
560 570
>>CCDS44868.2 SENP1 gene_id:29843|Hs108|chr12 (644 aa)
initn: 431 init1: 279 opt: 541 Z-score: 595.3 bits: 120.6 E(32554): 7.7e-27
Smith-Waterman score: 542; 29.8% identity (57.2% similar) in 463 aa overlap (306-754:214-644)
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 QETRRENGEGGSCSPFPSPEPKDPSCRHQPYFPDMDSSAVVKGTNSHVPDCHTKGSSFLG
.:: : . .. :. . .:.: .
CCDS44 ETVQEEEREIYRQLLQMVTGKQFTIAKPTTHFPLHLSRCLSSSKNTLKDSLFKNGNSCAS
190 200 210 220 230 240
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 KELSLDEAFPDQQNGSATNAWDQSSCSSPKWECTELIHDIPLPEHRSNTMFISETEREIM
. .. : . ..:::. .: . : . . :. . . :.:. . .. .
CCDS44 QIIGSDTS----SSGSASILTNQEQLSHSVYSLSSYTPDVAFGSKDSGTLHHPHHHHSVP
250 260 270 280 290
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 ----TLGQENQTSSVSDDRVKLSVSGADTSVSSVDGPVSQKAVQNENSYQMEEDGSLKQS
.:. : : ::. . :.:. ..: . : :. : : ..: :. .:
CCDS44 HQPDNLAASNTQSEGSDSVILLKVKDSQTPT-----P-SSTFFQAE--LWIKELTSVYDS
300 310 320 330 340 350
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 ILSSELLDHPYCKSPLEAPLVCSGLKLENQVGGGKNSQKASPVDDEQLSVCLSGFLDEVM
. : : . .. : .:.:.:: . ... : : :: : : .
CCDS44 -RARERLRQIEEQKAL-------ALQLQNQ----RLQEREHSVHD---SVELH--LRVPL
360 370 380 390
520 530 540 550 560
pF1KE6 KKYGSLVPLSEKEVLG-RLKDVFNEDFSNRKPFINREITN-YRARHQKCNFRIFYNKHML
.: .. ..: . : .: : .: : . ...:: : .: .: . . . .
CCDS44 EKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDE-FPEITEEMEKEIKNVFRNGNQDEVLSEAF-RLTI
400 410 420 430 440 450
570 580 590 600 610 620
pF1KE6 DMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVPDK----VHFFNSFFHRQLVTKGYNGVKRW
:. ::. :::::..::.: ...:. .: :: ::.:: .: : ::..::::
CCDS44 TRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLKTAGYQAVKRW
460 470 480 490 500 510
630 640 650 660 670 680
pF1KE6 TKKVDLFKKSLLLIPIHLEVHWSLITVTLSNRIISFYDSQG-IHFKFCVENIRKYLLTEA
:::::.:. ..::.:::: ::: : .: . .. :..:::.: :. . : . . .:: :.
CCDS44 TKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEAC-RILLQYLKQES
520 530 540 550 560 570
690 700 710 720 730 740
pF1KE6 REKNRPEF-LQGWQ--TAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQYCKCLALEQPFQFSQEDMPRVR
.:.: :: .::: . .. :::: : ::::.:. .: :.. ..:..:.:. :: :
CCDS44 IDKKRKEFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINFTQQHMPYFR
580 590 600 610 620 630
750
pF1KE6 KRIYKELCECRLMD
::. :. . .:.
CCDS44 KRMVWEILHRKLL
640
>>CCDS33902.1 SENP2 gene_id:59343|Hs108|chr3 (589 aa)
initn: 443 init1: 250 opt: 488 Z-score: 537.4 bits: 109.8 E(32554): 1.3e-23
Smith-Waterman score: 488; 30.6% identity (63.9% similar) in 291 aa overlap (475-754:304-589)
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 DGSLKQSILSSELLDHPYCKSPLEAPLVCSGLKLENQVGGGKNSQKASPVDDEQLSVCL-
:...::. .. . . : .:..:. :
CCDS33 RLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTETMVGIRFENE---SRRGYQLEPDLSEEVSARLR
280 290 300 310 320 330
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 --SGFLDEVMKKYGSLVPLSEKEVLGRLKDVFNEDFSNRKPFINREITNYRARHQKCNFR
:: . .... :.. .::. :. .: ..:. . ...::.: .. . ..
CCDS33 LGSGS-NGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDEIL
340 350 360 370 380
570 580 590 600 610
pF1KE6 IFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVPDK----VHFFNSFFHRQLVTK
: . :. :: . .::::.:::.: .:... . .: :..::. .: .
CCDS33 SSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLKSG
390 400 410 420 430 440
620 630 640 650 660 670
pF1KE6 GYNGVKRWTKKVDLFKKSLLLIPIHLEVHWSLITVTLSNRIISFYDSQGIH-FKFCVENI
::..:::::: :.::.. ..:.::: .:::::... : .. ... ::.: . ..: : .
CCDS33 GYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRIC-EIL
450 460 470 480 490 500
680 690 700 710 720 730
pF1KE6 RKYLLTEAREKNRPEF-LQGWQTAVTK--CIPQQKNDSDCGVFVLQYCKCLALEQPFQFS
.:: :.. : .. : : : :::: : ::::.:. .: .. ..:. :.
CCDS33 LQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFT
510 520 530 540 550 560
740 750
pF1KE6 QEDMPRVRKRIYKELCECRLMD
:..:: ::.. :. . .:.
CCDS33 QHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
570 580
755 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 15:39:35 2016 done: Tue Nov 8 15:39:35 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]