Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6714
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6714, 1184 aa
1>>>pF1KE6714 1184 - 1184 aa - 1184 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4164+/-0.00122; mu= 16.8610+/- 0.073
mean_var=114.1960+/-21.324, 0's: 0 Z-trim(104.5): 99 B-trim: 2 in 1/51
Lambda= 0.120019
statistics sampled from 7823 (7911) to 7823 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 4.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10203.1 CILP gene_id:8483|Hs108|chr15 (1184) 8118 1418.1 0
CCDS12405.1 CILP2 gene_id:148113|Hs108|chr19 (1156) 3576 631.7 3.1e-180
>>CCDS10203.1 CILP gene_id:8483|Hs108|chr15 (1184 aa)
initn: 8118 init1: 8118 opt: 8118 Z-score: 7599.4 bits: 1418.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8118; 99.7% identity (100.0% similar) in 1184 aa overlap (1-1184:1-1184)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVGTKAWVFSFLVLEVTSVLGRQTMLTQSVRRVQPGKKNPSIFAKPADTLESPGEWTTWF
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CCDS10 MVGTKAWVFSFLVLEVTSVLGRQTMLTQSVRRVQPGKKNPSIFAKPADTLESPGEWTTWF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NIDYPGGKGDYERLDAIRFYYGDRVCARPLRLEARTTDWTPAGSTGQVVHGSPREGFWCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NIDYPGGKGDYERLDAIRFYYGDRVCARPLRLEARTTDWTPAGSTGQVVHGSPREGFWCL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 NREQRPGQNCSNYTVRFLCPPGSLRRDTERIWSPWSPWSKCSAACGQTGVQTRTRICLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NREQRPGQNCSNYTVRFLCPPGSLRRDTERIWSPWSPWSKCSAACGQTGVQTRTRICLAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MVSLCSEASEEGQHCMGQDCTACDLTCPMGQVNADCDACMCQDFMLHGAVSLPGGAPASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MVSLCSEASEEGQHCMGQDCTACDLTCPMGQVNADCDACMCQDFMLHGAVSLPGGAPASG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AAIYLLTKTPKLLTQTDSDGRFRIPGLCPDGKSILKITKVKFAPIVLTMPKTSLKAATIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AAIYLLTKTPKLLTQTDSDGRFRIPGLCPDGKSILKITKVKFAPIVLTMPKTSLKAATIK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 AEFVRAETPYMVMNPETKARRAGQSVSLCCKATGKPRPDKYFWYHNDTLLDPSLYKHESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AEFVRAETPYMVMNPETKARRAGQSVSLCCKATGKPRPDKYFWYHNDTLLDPSLYKHESK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LVLRKLQQHQAGEYFCKAQSDAGAVKSKVAQLIVIASDETPCNPVPESYLIRLPHDCFQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LVLRKLQQHQAGEYFCKAQSDAGAVKSKVAQLIVIASDETPCNPVPESYLIRLPHDCFQN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 ATNSFYYDVGRCPVKTCAGQQDNGIRCRDAVQNCCGISKTEEREIQCSGYTLPTKVAKEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ATNSFYYDVGRCPVKTCAGQQDNGIRCRDAVQNCCGISKTEEREIQCSGYTLPTKVAKEC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 SCQRCTETRSIVRGRVSAADNGEPMRFGHVYMGNSRVSMTGYKGTFTLHVPQDTERLVLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SCQRCTETRSIVRGRVSAADNGEPMRFGHVYMGNSRVSMTGYKGTFTLHVPQDTERLVLT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 FVDRLQKFVNTTKVLPFNKKGSAVFHEIKMLRRKEPITLEAMETNIIPLGEVVGEDPMAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FVDRLQKFVNTTKVLPFNKKGSAVFHEIKMLRRKKPITLEAMETNIIPLGEVVGEDPMAE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 LEIPSRSFYRQNGEPYIGKVKASVTFLDPRNISTATAAQTDLNFINDEGDTFPLRTYGMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LEIPSRSFYRQNGEPYIGKVKASVTFLDPRNISTATAAQTDLNFINDEGDTFPLRTYGMF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 SVDFRDEVTSEPLNAGKVKVHLDSTQVKMPEHISTVKLWSLNPDTGLWEEEGDFKFENQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SVDFRDEVTSEPLNAGKVKVHLDSTQVKMPEHISTVKLWSLNPDTGLWEEEGDFKFENQR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 RNKREDRTFLVGNLEIRERRLFNLDVPESRRCFVKVRAYRSERFLPSEQIQGVVISVINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RNKREDRTFLVGNLEIRERRLFNLDVPESRRCFVKVRAYRSERFLPSEQIQGVVISVINL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE6 EPRTGFLSNPRAWGRFDSVITGPNGACVPAFCDDQSPDAYSAYVLASLAGEELQAVESSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EPRTGFLSNPRAWGRFDSVITGPNGACVPAFCDDQSPDAYSAYVLASLAGEELQAVESSP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE6 KFNPNAIGVPQPYLNKLNYRRTDHEDPRVKKTAFQISMAKPRPNSAEESNGPIYAFENLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KFNPNAIGVPQPYLNKLNYRRTDHEDPRVKKTAFQISMAKPRPNSAEESNGPIYAFENLR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE6 ACEEAPPSAAHFRFYQIEGDRYDYNTVPFNEDDPMSWTEDYLAWWPKPMEFRACYIKVKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ACEEAPPSAAHFRFYQIEGDRYDYNTVPFNEDDPMSWTEDYLAWWPKPMEFRACYIKVKI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE6 VGPLEVNVRSRNMGGTHRRTVGKLYGIRDVRSTRDRDQPNVSAACLEFKCSGMLYDQDRV
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CCDS10 VGPLEVNVRSRNMGGTHRQTVGKLYGIRDVRSTRDRDQPNVSAACLEFKCSGMLYDQDRV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE6 DRTLVKVIPQGSCRRASVNPMLHEYLVNHLPLAVNNDTSEYTMLAPLDPLGHNYGIYTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DRTLVKVIPQGSCRRASVNPMLHEYLVNHLPLAVNNDTSEYTMLAPLDPLGHNYGIYTVT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE6 DQDPRTAKEIALGRCFDGTSDGSSRIMKSNVGVALTFNCVERQVGRQSAFQYLQSTPAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DQDPRTAKEIALGRCFDGTSDGSSRIMKSNVGVALTFNCVERQVGRQSAFQYLQSTPAQS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180
pF1KE6 PAAGTVQGRVPSRRQQRASRGGQRQSGVVASLRFPRVAQQPLIN
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS10 PAAGTVQGRVPSRRQQRASRGGQRQGGVVASLRFPRVAQQPLIN
1150 1160 1170 1180
>>CCDS12405.1 CILP2 gene_id:148113|Hs108|chr19 (1156 aa)
initn: 3909 init1: 1937 opt: 3576 Z-score: 3349.3 bits: 631.7 E(32554): 3.1e-180
Smith-Waterman score: 4109; 50.4% identity (75.0% similar) in 1160 aa overlap (24-1179:32-1156)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MVGTKAWVFSFLVLEVTSVLGRQTMLTQSVRRVQPGKKNPSIFAKPADTLESP
: : : : :. .:.. . :
CCDS12 ASLLPLLCLCVVAAHLAGARDATPTEEPMATALGLERRSVYTGQPSPAL-----EDWEEA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 GEWTTWFNIDYPGGKGDYERLDAIRFYYGD-RVCARPLRLEARTTDWTPAGSTGQVVHGS
.:::.:::.:.::: ::.: : ::::::: ::: ::: ::::::::. ...:. :: .
CCDS12 SEWTSWFNVDHPGGDGDFESLAAIRFYYGPARVCPRPLALEARTTDWALPSAVGERVHLN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 PREGFWCLNREQRPGQNCSNYTVRFLCPPGSLRRDTERIWSPWSPWSKCSAACGQTGVQT
: .::::::::: :. :::: ::: :: : :. :.::. ::..:: : .
CCDS12 PTRGFWCLNREQPRGRRCSNYHVRFRCP-------LEASWGAWGPWGPCSGSCGP-GRRL
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RTRICLAEMVSLCSEASEEGQHCMGQDCTACDLTCPMGQVNADCDACMCQDFMLHGAVSL
: : : . . : :.:.:. : .:.: :.: : : .: :.:
CCDS12 RRRHCPSPAGDACPGRPLEAQKCVRPRCPGCSL-----------DTCECPDHILLGSVVT
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 PGGAPASGAAIYLLTKTPKLLTQTDSDGRFRIPGLCPDGKSILKITKVKF-APIVLTMPK
:.: : :: . : . : .. .:. : ::.::.: :... .. : : . .. .
CCDS12 PSGQPLLGARVSLRDQ-PGTVATSDAHGTFRVPGVCADSRANIRAQMDGFSAGEAQAQAN
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 TSLKAATIKAEFVRAETPYMVMNPETKARRAGQSVSLCCKATGKPRPDKYFWYHNDTLLD
:....:: . . : ::.: .::...:.:::.:..::::.: : : :: :.:: ::::
CCDS12 GSISVVTIILD--KLEKPYLVKHPESRVREAGQNVTFCCKASGTPMPKKYSWFHNGTLLD
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 PSLYKHESKLVLRKLQQHQAGEYFCKAQSDAGAVKSKVAQLIVIASDETPCNPVPESYLI
. . ..: :: :. ::: : ::: ..::::.: .:.: :.: . :.: :. :::
CCDS12 RRAHGYGAHLELRGLRPDQAGIYHCKAWNEAGAVRSGTARLTVLAPGQPACDPRPREYLI
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 RLPHDCFQNATNSFYYDVGRCPVKTCAGQQDNGIRCRDAVQNCCGISKTEEREIQCSGYT
.::.:: : ... : ::: :: : . .. :: :: . ::.. . :.:::.: ::.
CCDS12 KLPEDCGQPGSGPAYLDVGLCPDTRCPSLAGSSPRCGDASSRCCSVRRLERREIHCPGYV
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 LPTKVAKECSCQRCTETRSIVRGRVSAADNGEPMRFGHVYMGNSRVSMTGYKGTFTLHVP
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CCDS12 LPVKVVAECGCQKCLPPRGLVRGRVVAADSGEPLRFARILLGQEPIGFTAYQGDFTIEVP
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 QDTERLVLTFVDRLQKFVNTTKVLPFNKKGSAVFHEIKMLRRKEPITLEAMETNIIPLGE
.:.:::.:::: .:.....::::. .:..:.::.: .:.: :. :.. ..: :::::
CCDS12 PSTQRLVVTFVDPSGEFMDAVRVLPFDPRGAGVYHEVKAMRKKAPVILHTSQSNTIPLGE
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE6 VVGEDPMAELEIPSRSFYRQNGEPYIGKVKASVTFLDPRNISTATAAQTDLNFINDEGDT
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CCDS12 LEDEAPLGELVLPSGAFRRADGKPYSGPVEARVTFVDPRDLTSAASAPSDLRFVDSDGEL
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KE6 FPLRTYGMFSVDFRDEVTSEPLNAGKVKVHLDSTQVKMPEHISTVKLWSLNPDTGLWEEE
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CCDS12 APLRTYGMFSVDLRAPGSAEQLQVGPVAVRVAASQIHMPGHVEALKLWSLNPETGLWEEE
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760
pF1KE6 GDFKFENQR--RNKREDRTFLVGNLEIRERRLFNLDVPESRRCFVKVRAYRSERFLPSEQ
. :. :.. : .::.:.:::::.:::::::::::::: :::::::::: ...: ::::
CCDS12 SGFRREGSSGPRVRREERVFLVGNVEIRERRLFNLDVPERRRCFVKVRAYANDKFTPSEQ
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KE6 IQGVVISVINLEPRTGFLSNPRAWGRFDSVITGPNGACVPAFCDDQSPDAYSAYVLASLA
..:::....:::: :: .::::::::::..:::::::.::::: . ::::.: : :.:.
CCDS12 VEGVVVTLVNLEPAPGFSANPRAWGRFDSAVTGPNGACLPAFCDADRPDAYTALVTATLG
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860 870 880
pF1KE6 GEELQAVESSPKFNPNAIGVPQPYLNKLNYRRTDHEDPRVKKTAFQISMAKPRPNSAEES
::::. . : :. : ..:: ::::..:.::::::.:: :...:.:..:::::.. :.
CCDS12 GEELEPAPSLPRPLPATVGVTQPYLDRLGYRRTDHDDPAFKRNGFRINLAKPRPGDPAEA
820 830 840 850 860 870
890 900 910 920 930 940
pF1KE6 NGPIYAFENLRACEEAPPSAAHFRFYQIEGDRYDYNTVPFNEDDPMSWTEDYLAWWPKPM
:::.: ...:: :. :: .:.:::: ..:.:.:.::.::: : : ::: : :::::.:.
CCDS12 NGPVYPWRSLRECQGAPVTASHFRFARVEADKYEYNVVPFREGTPASWTGDLLAWWPNPQ
880 890 900 910 920 930
950 960 970 980 990 1000
pF1KE6 EFRACYIKVKIVGPLEVNVRSRNMGGTHRRTVGKLYGIRDVRSTRDRDQPNVSAACLEFK
:::::..:::: :: : :::.: ::.: :: :.:::.::.::.:: ..:..::::.:::
CCDS12 EFRACFLKVKIQGPQEYMVRSHNAGGSHPRTRGQLYGLRDARSVRDPERPGTSAACVEFK
940 950 960 970 980 990
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE6 CSGMLYDQDRVDRTLVKVIPQGSCRRASVNPMLHEYLVNHLPLAVNNDTSEYTMLAPLDP
:::::.:: .:::::: ..:::::::..:: .:..::. : : . .: . ..:::::::
CCDS12 CSGMLFDQRQVDRTLVTIMPQGSCRRVAVNGLLRDYLTRHPPPVPAEDPAAFSMLAPLDP
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE6 LGHNYGIYTVTDQDPRTAKEIALGRCFDGTSDGSSRIMKSNVGVALTFNCVERQVGRQSA
::::::.::::::.:: :::::.::::::.::: :: ::...:.:.::.: : .:: :
CCDS12 LGHNYGVYTVTDQSPRLAKEIAIGRCFDGSSDGFSREMKADAGTAVTFQCREPPAGRPSL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE6 FQYLQSTPAQSPAAGTVQGRVPSRRQQRASRGGQRQSGVVASLRFPRVAQQPLIN
:: : .:: : : .. :....:... : :: . . : :: :
CCDS12 FQRLLESPAT--ALGDIR-----REMSEAAQAQARASGPLRT-RRGRVRQ
1120 1130 1140 1150
1184 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 15:38:07 2016 done: Tue Nov 8 15:38:07 2016
Total Scan time: 4.040 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]