Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6707
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6707, 1243 aa
1>>>pF1KE6707 1243 - 1243 aa - 1243 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4486+/-0.000956; mu= 9.0111+/- 0.058
mean_var=165.2758+/-32.877, 0's: 0 Z-trim(111.0): 18 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.099763
statistics sampled from 12043 (12060) to 12043 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16
Scan time: 5.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44659.1 PITPNM1 gene_id:9600|Hs108|chr11 (1243) 8387 1220.0 0
CCDS31620.1 PITPNM1 gene_id:9600|Hs108|chr11 (1244) 8375 1218.3 0
CCDS73543.1 PITPNM2 gene_id:57605|Hs108|chr12 (1343) 1867 281.6 9.3e-75
CCDS9242.1 PITPNM2 gene_id:57605|Hs108|chr12 (1349) 1799 271.8 8.2e-72
CCDS54080.1 PITPNM3 gene_id:83394|Hs108|chr17 ( 938) 1759 266.0 3.3e-70
CCDS11076.1 PITPNM3 gene_id:83394|Hs108|chr17 ( 974) 1759 266.0 3.4e-70
CCDS45563.1 PITPNA gene_id:5306|Hs108|chr17 ( 270) 805 128.4 2.5e-29
CCDS58588.1 PITPNC1 gene_id:26207|Hs108|chr17 ( 332) 779 124.7 3.9e-28
CCDS58587.1 PITPNC1 gene_id:26207|Hs108|chr17 ( 268) 762 122.2 1.8e-27
CCDS13842.1 PITPNB gene_id:23760|Hs108|chr22 ( 271) 762 122.2 1.8e-27
CCDS63433.1 PITPNB gene_id:23760|Hs108|chr22 ( 272) 762 122.2 1.8e-27
CCDS63432.1 PITPNB gene_id:23760|Hs108|chr22 ( 273) 744 119.6 1.1e-26
>>CCDS44659.1 PITPNM1 gene_id:9600|Hs108|chr11 (1243 aa)
initn: 8387 init1: 8387 opt: 8387 Z-score: 6527.7 bits: 1220.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8387; 100.0% identity (100.0% similar) in 1243 aa overlap (1-1243:1-1243)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLIKEYHILLPMSLDEYQVAQLYMIQKKSREESSGEGSGVEILANRPYTDGPGGSGQYTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MLIKEYHILLPMSLDEYQVAQLYMIQKKSREESSGEGSGVEILANRPYTDGPGGSGQYTH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 KVYHVGSHIPGWFRALLPKAALQVEEESWNAYPYTRTRYTCPFVEKFSIEIETYYLPDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KVYHVGSHIPGWFRALLPKAALQVEEESWNAYPYTRTRYTCPFVEKFSIEIETYYLPDGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 QQPNVFNLSGAERRQRILDTIDIVRDAVAPGEYKAEEDPRLYHSVKTGRGPLSDDWARTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QQPNVFNLSGAERRQRILDTIDIVRDAVAPGEYKAEEDPRLYHSVKTGRGPLSDDWARTA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AQTGPLMCAYKLCKVEFRYWGMQAKIEQFIHDVGLRRVMLRAHRQAWCWQDEWTELSMAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AQTGPLMCAYKLCKVEFRYWGMQAKIEQFIHDVGLRRVMLRAHRQAWCWQDEWTELSMAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 IRALEEETARMLAQRMAKCNTGSEGSEAQPPGKPSTEARSAASNTGTPDGPEAPPGPDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IRALEEETARMLAQRMAKCNTGSEGSEAQPPGKPSTEARSAASNTGTPDGPEAPPGPDAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 PDASFGKQWSSSSRSSYSSQHGGAVSPQSLSEWRMQNIARDSENSSEEEFFDAHEGFSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PDASFGKQWSSSSRSSYSSQHGGAVSPQSLSEWRMQNIARDSENSSEEEFFDAHEGFSDS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 EEVFPKEMTKWNSNDFIDAFASPVEAEGTPEPGAEAAKGIEDGAQAPRDSEGLDGAGELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEVFPKEMTKWNSNDFIDAFASPVEAEGTPEPGAEAAKGIEDGAQAPRDSEGLDGAGELG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 AEACAVHALFLILHSGNILDSGPGDANSKQADVQTLSSAFEAVTRIHFPEALGHVALRLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AEACAVHALFLILHSGNILDSGPGDANSKQADVQTLSSAFEAVTRIHFPEALGHVALRLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 PCPPICAAAYALVSNLSPYSHDGDSLSRSQDHIPLAALPLLATSSSRYQGAVATVIARTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PCPPICAAAYALVSNLSPYSHDGDSLSRSQDHIPLAALPLLATSSSRYQGAVATVIARTN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 QAYSAFLRSPEGAGFCGQVALIGDGVGGILGFDALCHSANAGTGSRGSSRRGSMNNELLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QAYSAFLRSPEGAGFCGQVALIGDGVGGILGFDALCHSANAGTGSRGSSRRGSMNNELLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 PEFGPVRDPLADGVEGLGRGSPEPSALPPQRIPSDMASPEPEGSQNSLQAAPATTSSWEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PEFGPVRDPLADGVEGLGRGSPEPSALPPQRIPSDMASPEPEGSQNSLQAAPATTSSWEP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 RRASTAFCPPAASSEAPDGPSSTARLDFKVSGFFLFGSPLGLVLALRKTVMPALEAQMRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RRASTAFCPPAASSEAPDGPSSTARLDFKVSGFFLFGSPLGLVLALRKTVMPALEAQMRP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 ACEQIYNLFHAADPCASRLEPLLAPKFQAIAPLTVPRYQKFPLGDGSSLLLADTLQTHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ACEQIYNLFHAADPCASRLEPLLAPKFQAIAPLTVPRYQKFPLGDGSSLLLADTLQTHSS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE6 LFLEELEMLVPSTPTSTSGAFWKGSELATDPPAQPAAPSTTSEVVKILERWWGTKRIDYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LFLEELEMLVPSTPTSTSGAFWKGSELATDPPAQPAAPSTTSEVVKILERWWGTKRIDYS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE6 LYCPEALTAFPTVTLPHLFHASYWESADVVAFILRQVIEKERPQLAECEEPSIYSPAFPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LYCPEALTAFPTVTLPHLFHASYWESADVVAFILRQVIEKERPQLAECEEPSIYSPAFPR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE6 EKWQRKRTQVKIRNVTSNHRASDTVVCEGRPQVLSGRFMYGPLDVVTLTGEKVDVYIMTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EKWQRKRTQVKIRNVTSNHRASDTVVCEGRPQVLSGRFMYGPLDVVTLTGEKVDVYIMTQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE6 PLSGKWIHFGTEVTNSSGRLTFPVPPERALGIGVYPVRMVVRGDHTYAECCLTVVARGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PLSGKWIHFGTEVTNSSGRLTFPVPPERALGIGVYPVRMVVRGDHTYAECCLTVVARGTE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE6 AVVFSIDGSFTASVSIMGSDPKVRAGAVDVVRHWQDSGYLIVYVTGRPDMQKHRVVAWLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AVVFSIDGSFTASVSIMGSDPKVRAGAVDVVRHWQDSGYLIVYVTGRPDMQKHRVVAWLS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE6 QHNFPHGVVSFCDGLTHDPLRQKAMFLQSLVQEVELNIVAGYGSPKDVAVYAALGLSPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QHNFPHGVVSFCDGLTHDPLRQKAMFLQSLVQEVELNIVAGYGSPKDVAVYAALGLSPSQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE6 TYIVGRAVRKLQAQCQFLSDGYVAHLGQLEAGSHSHASSGPPRAALGKSSYGVAAPVDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TYIVGRAVRKLQAQCQFLSDGYVAHLGQLEAGSHSHASSGPPRAALGKSSYGVAAPVDFL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240
pF1KE6 RKQSQLLRSRGPSQAEREGPGTPPTTLARGKARSISLKLDSEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RKQSQLLRSRGPSQAEREGPGTPPTTLARGKARSISLKLDSEE
1210 1220 1230 1240
>>CCDS31620.1 PITPNM1 gene_id:9600|Hs108|chr11 (1244 aa)
initn: 4848 init1: 4848 opt: 8375 Z-score: 6518.4 bits: 1218.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8375; 99.9% identity (99.9% similar) in 1244 aa overlap (1-1243:1-1244)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLIKEYHILLPMSLDEYQVAQLYMIQKKSREESSGEGSGVEILANRPYTDGPGGSGQYTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLIKEYHILLPMSLDEYQVAQLYMIQKKSREESSGEGSGVEILANRPYTDGPGGSGQYTH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 KVYHVGSHIPGWFRALLPKAALQVEEESWNAYPYTRTRYTCPFVEKFSIEIETYYLPDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KVYHVGSHIPGWFRALLPKAALQVEEESWNAYPYTRTRYTCPFVEKFSIEIETYYLPDGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 QQPNVFNLSGAERRQRILDTIDIVRDAVAPGEYKAEEDPRLYHSVKTGRGPLSDDWARTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QQPNVFNLSGAERRQRILDTIDIVRDAVAPGEYKAEEDPRLYHSVKTGRGPLSDDWARTA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AQTGPLMCAYKLCKVEFRYWGMQAKIEQFIHDVGLRRVMLRAHRQAWCWQDEWTELSMAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AQTGPLMCAYKLCKVEFRYWGMQAKIEQFIHDVGLRRVMLRAHRQAWCWQDEWTELSMAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 IRALEEETARMLAQRMAKCNTGSEGSEAQPPGKPSTEARSAASNTGTPDGPEAPPGPDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IRALEEETARMLAQRMAKCNTGSEGSEAQPPGKPSTEARSAASNTGTPDGPEAPPGPDAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 PDASFGKQWSSSSRSSYSSQHGGAVSPQSLSEWRMQNIARDSENSSEEEFFDAHEGFSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PDASFGKQWSSSSRSSYSSQHGGAVSPQSLSEWRMQNIARDSENSSEEEFFDAHEGFSDS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 EEVFPKEMTKWNSNDFIDAFASPVEAEGTPEPGAEAAKGIEDGAQAPRDSEGLDGAGELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EEVFPKEMTKWNSNDFIDAFASPVEAEGTPEPGAEAAKGIEDGAQAPRDSEGLDGAGELG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 AEACAVHALFLILHSGNILDSGPGDANSKQADVQTLSSAFEAVTRIHFPEALGHVALRLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AEACAVHALFLILHSGNILDSGPGDANSKQADVQTLSSAFEAVTRIHFPEALGHVALRLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 PCPPICAAAYALVSNLSPYSHDGDSLSRSQDHIPLAALPLLATSSSRYQGAVATVIARTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PCPPICAAAYALVSNLSPYSHDGDSLSRSQDHIPLAALPLLATSSSRYQGAVATVIARTN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 QAYSAFLRSPEGAGFCGQVALIGDGVGGILGFDALCHSANAGTGSRGSSRRGSMNNELLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QAYSAFLRSPEGAGFCGQVALIGDGVGGILGFDALCHSANAGTGSRGSSRRGSMNNELLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 PEFGPVRDPLADGVEGLGRGSPEPSALPPQRIPSDMASPEPEGSQNSLQAAPATTSSWEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PEFGPVRDPLADGVEGLGRGSPEPSALPPQRIPSDMASPEPEGSQNSLQAAPATTSSWEP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE6 RRASTAFCPPAASSEAPDGPSSTARLDFKVSGFFLFGSPLGLVLALRKTVMPALEA-QMR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS31 RRASTAFCPPAASSEAPDGPSSTARLDFKVSGFFLFGSPLGLVLALRKTVMPALEAAQMR
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE6 PACEQIYNLFHAADPCASRLEPLLAPKFQAIAPLTVPRYQKFPLGDGSSLLLADTLQTHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PACEQIYNLFHAADPCASRLEPLLAPKFQAIAPLTVPRYQKFPLGDGSSLLLADTLQTHS
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KE6 SLFLEELEMLVPSTPTSTSGAFWKGSELATDPPAQPAAPSTTSEVVKILERWWGTKRIDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SLFLEELEMLVPSTPTSTSGAFWKGSELATDPPAQPAAPSTTSEVVKILERWWGTKRIDY
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KE6 SLYCPEALTAFPTVTLPHLFHASYWESADVVAFILRQVIEKERPQLAECEEPSIYSPAFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SLYCPEALTAFPTVTLPHLFHASYWESADVVAFILRQVIEKERPQLAECEEPSIYSPAFP
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KE6 REKWQRKRTQVKIRNVTSNHRASDTVVCEGRPQVLSGRFMYGPLDVVTLTGEKVDVYIMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 REKWQRKRTQVKIRNVTSNHRASDTVVCEGRPQVLSGRFMYGPLDVVTLTGEKVDVYIMT
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE6 QPLSGKWIHFGTEVTNSSGRLTFPVPPERALGIGVYPVRMVVRGDHTYAECCLTVVARGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QPLSGKWIHFGTEVTNSSGRLTFPVPPERALGIGVYPVRMVVRGDHTYAECCLTVVARGT
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE6 EAVVFSIDGSFTASVSIMGSDPKVRAGAVDVVRHWQDSGYLIVYVTGRPDMQKHRVVAWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EAVVFSIDGSFTASVSIMGSDPKVRAGAVDVVRHWQDSGYLIVYVTGRPDMQKHRVVAWL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE6 SQHNFPHGVVSFCDGLTHDPLRQKAMFLQSLVQEVELNIVAGYGSPKDVAVYAALGLSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SQHNFPHGVVSFCDGLTHDPLRQKAMFLQSLVQEVELNIVAGYGSPKDVAVYAALGLSPS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE6 QTYIVGRAVRKLQAQCQFLSDGYVAHLGQLEAGSHSHASSGPPRAALGKSSYGVAAPVDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QTYIVGRAVRKLQAQCQFLSDGYVAHLGQLEAGSHSHASSGPPRAALGKSSYGVAAPVDF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE6 LRKQSQLLRSRGPSQAEREGPGTPPTTLARGKARSISLKLDSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRKQSQLLRSRGPSQAEREGPGTPPTTLARGKARSISLKLDSEE
1210 1220 1230 1240
>>CCDS73543.1 PITPNM2 gene_id:57605|Hs108|chr12 (1343 aa)
initn: 3989 init1: 1383 opt: 1867 Z-score: 1455.6 bits: 281.6 E(32554): 9.3e-75
Smith-Waterman score: 4327; 54.0% identity (74.3% similar) in 1294 aa overlap (49-1237:49-1321)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 VAQLYMIQKKSREESSGEGSGVEILANRPYTDGPGGSGQYTHKVYHVGSHIPGWFRALLP
:::::::::::::::::: :::.:::..::
CCDS73 IAQLYMIQKKSRNETYGEGSGVEILENRPYTDGPGGSGQYTHKVYHVGMHIPSWFRSILP
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 KAALQVEEESWNAYPYTRTRYTCPFVEKFSIEIETYYLPDGGQQPNVFNLSGAERRQRIL
::::.: :::::::::::::.::::::::::.:::.: :.:..:.::::: .:. : .
CCDS73 KAALRVVEESWNAYPYTRTRFTCPFVEKFSIDIETFYKTDAGENPDVFNLSPVEKNQLTI
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 DTIDIVRDAVAPGEYKAEEDPRLYHSVKTGRGPLSDDWART-AAQTGPLMCAYKLCKVEF
: ::::.: : .:::.::::.:..:.:: :::::..: . :. :.:::::::::::
CCDS73 DFIDIVKDPVPHNEYKTEEDPKLFQSTKTQRGPLSENWIEEYKKQVFPIMCAYKLCKVEF
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 RYWGMQAKIEQFIHDVGLRRVMLRAHRQAWCWQDEWTELSMADIRALEEETARMLAQRMA
::::::.:::.::::.::::::.::::::::::::: ::: .:: ::.:. ::...::
CCDS73 RYWGMQSKIERFIHDTGLRRVMVRAHRQAWCWQDEWYGLSMENIRELEKEAQLMLSRKMA
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 KCNTGSEGSEAQPPGKPSTEARSAASNTGTPDGPEAPPGPDASPDASFG--KQWSSSSRS
. : .: :: : :: : . .: : :: : . .. : .. : ::::.::.:
CCDS73 QFN--EDGEEATELVKH--EAVSDQT-SGEP--PE-PSSSNGEPLVGRGLKKQWSTSSKS
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 SYSSQHGGAVSPQSLSEWRMQNIARDSENSSEEEFFDAHEGFSDSEEVFPKEMTKWNSND
: ::..:.. : .:.::::::.:::::..::..::::::: .::.::.:::..:::.:::
CCDS73 SRSSKRGASPSRHSISEWRMQSIARDSDESSDDEFFDAHEDLSDTEEMFPKDITKWSSND
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420
pF1KE6 FIDAFASP--------VEAEGTPE----PGAEAAKGIEDGAQAPRDSEGLDGAGELGAEA
..: . :: . .:.:: ..: . ::: .. : :.:
CCDS73 LMDKIESPEPEDTQDGLYRQGAPEFRVASSVEQLNIIEDEVSQP-----------LAAPP
380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 CAVHALFLILHSGNILDSGPGDANSKQADVQTLSSAFEAVTRIHFPEALGHVALRLVPCP
.:.:.:.::.:.:::.: :: .::..:..:....:..: :.:.: :::..:.::::::
CCDS73 SKIHVLLLVLHGGTILDTGAGDPSSKKGDANTIANVFDTVMRVHYPSALGRLAIRLVPCP
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 PICAAAYALVSNLSPYSHDGDSLSRSQDHIPLAALPLLATSSSRYQGAVATVIARTNQAY
:.:. :.:::::::::::: :: ::::::::::::::::: .:: :::::: :.: ::
CCDS73 PVCSDAFALVSNLSPYSHDEGCLSSSQDHIPLAALPLLATSSPQYQEAVATVIQRANLAY
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KE6 SAFLRSPEGAGFCGQVALIGDGVGGILGFDALCHSANAGTGSRGSSRRGSM----NNELL
. :..: :: : ::: :::: :::::.:::::.: . . :..::::::. .:.::
CCDS73 GDFIKSQEGMTFNGQVCLIGDCVGGILAFDALCYSNQPVSESQSSSRRGSVVSMQDNDLL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640
pF1KE6 SPEF--------GPVRDPLADGVEGLGRGSPEPSALPPQR--------IPSDMASPEPEG
:: . : . : . : :: :.: .: :: . .. .:.
CCDS73 SPGILMNAAHCCGGGGGGGGGGGSSGGGGSSGGSSLESSRHLSRSNVDIPRSNGTEDPKR
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690
pF1KE6 SQ------------NSLQAAPATTSSWEPRRASTAFCP-PAASSEAPDGPSSTARLDFKV
. ...: : :: . : : ..:: :: .. .:.::..
CCDS73 QLPRKRSDSSTYELDTIQQHQAFLSSLHASVLRTEPCSRHSSSSTMLDGTGALGRFDFEI
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740
pF1KE6 SGFFLFGSPLGLVLALRKTVMPALEA-QMRPACEQIYNLFHAADPCASRLEPLLAPKFQA
. .:::: ::::::::::::.:::.. :.::::.:.::::: ::: :::::::: .:.:
CCDS73 TDLFLFGCPLGLVLALRKTVIPALDVFQLRPACQQVYNLFHPADPSASRLEPLLERRFHA
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790
pF1KE6 IAPLTVPRYQKFPLGDGSSLLLADTLQTHSSLFLE--------------ELEMLVPS---
. :..:::::..::::: : ::..:.: . : :: : : ::.
CCDS73 LPPFSVPRYQRYPLGDGCSTLLVETVQRNPELVLEGGPLAPLPHGDGFLETSMPVPAPTW
780 790 800 810 820 830
800 810 820
pF1KE6 -------------------------TPTSTSGA-----FWKGSELATDPPAQPAAPS-TT
.:.: . : : ..::.. .. : : :.
CCDS73 QDGPRPGCAESDVLQTHNAAFQEHGAPSSPGTAPASRGFRRASEISIASQVSGMAESYTA
840 850 860 870 880 890
830 840 850 860 870 880
pF1KE6 SEVVKILERWWGTKRIDYSLYCPEALTAFPTVTLPHLFHASYWESADVVAFILRQVIEKE
: ...: .::: :::::.::::.::::::::.::::::::::::.:::.:.::::....
CCDS73 SSIAQIAAKWWGQKRIDYALYCPDALTAFPTVALPHLFHASYWESTDVVSFLLRQVMRHD
900 910 920 930 940 950
890 900 910 920 930
pF1KE6 RPQLAECE--EPSIYSPAFPREKWQRKRTQVKIRNVTSNHRASDTVVCEGRPQVLSGRFM
.. : . : :...:. ::::::::::.::.::::.::: .:... : ::::.::::
CCDS73 NSSILELDGKEVSVFTPSKPREKWQRKRTHVKLRNVTANHRINDALANEDGPQVLTGRFM
960 970 980 990 1000 1010
940 950 960 970 980 990
pF1KE6 YGPLDVVTLTGEKVDVYIMTQPLSGKWIHFGTEVTNSSGRLTFPVPPERALGIGVYPVRM
:::::.::::::::::.::::: ::.:... : :::.:::... .: . ::.::::..:
CCDS73 YGPLDMVTLTGEKVDVHIMTQPPSGEWLYLDTLVTNNSGRVSYTIPESHRLGVGVYPIKM
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE6 VVRGDHTYAECCLTVVARGTEAVVFSIDGSFTASVSIMGSDPKVRAGAVDVVRHWQDSGY
:::::::.:. .::. .::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS73 VVRGDHTFADSYITVLPKGTEFVVFSIDGSFAASVSIMGSDPKVRAGAVDVVRHWQDLGY
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE6 LIVYVTGRPDMQKHRVVAWLSQHNFPHGVVSFCDGLTHDPLRQKAMFLQSLVQEVELNIV
::.::::::::::.::::::.:::::::::::::::.:::::.:: ::. :..:..: .
CCDS73 LIIYVTGRPDMQKQRVVAWLAQHNFPHGVVSFCDGLVHDPLRHKANFLKLLISELHLRVH
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE6 AGYGSPKDVAVYAALGLSPSQTYIVGRAVRKLQAQCQFLSDGYVAHLGQLEAGSHSH-AS
:.::: ::::::.:..::: : ::::: ..::: ::::..:::.:::.::. . ... :
CCDS73 AAYGSTKDVAVYSAISLSPMQIYIVGRPTKKLQQQCQFITDGYAAHLAQLKYSHRARPAR
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE6 SGPPRAALGKSSYGVAAPVDFLRKQSQLLRS-----RGPSQAEREGPGTPPTTLARGKAR
. : :: :.:.:. . ::::....:::. :::. ..: . ::. :
CCDS73 NTATRMALRKGSFGLPGQGDFLRSRNHLLRTISAQPSGPSH-RHERTQSQADGEQRGQ-R
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1240
pF1KE6 SISLKLDSEE
:.:.
CCDS73 SMSVAAGCWGRAMTGRLEPGAAAGPK
1320 1330 1340
>>CCDS9242.1 PITPNM2 gene_id:57605|Hs108|chr12 (1349 aa)
initn: 4282 init1: 1383 opt: 1799 Z-score: 1402.7 bits: 271.8 E(32554): 8.2e-72
Smith-Waterman score: 4291; 53.6% identity (73.7% similar) in 1295 aa overlap (55-1237:55-1327)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 IQKKSREESSGEGSGVEILANRPYTDGPGGSGQYTHKVYHVGSHIPGWFRALLPKAALQV
:::::::::::: :::.:::..::::::.:
CCDS92 IQKKSRNETYGEGSGVEILENRPYTDGPGGSGQYTHKVYHVGMHIPSWFRSILPKAALRV
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 EEESWNAYPYTRTRYTCPFVEKFSIEIETYYLPDGGQQPNVFNLSGAERRQRILDTIDIV
:::::::::::::.::::::::::.:::.: :.:..:.::::: .:. : .: ::::
CCDS92 VEESWNAYPYTRTRFTCPFVEKFSIDIETFYKTDAGENPDVFNLSPVEKNQLTIDFIDIV
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 RDAVAPGEYKAEEDPRLYHSVKTGRGPLSDDWART-AAQTGPLMCAYKLCKVEFRYWGMQ
.: : .:::.::::.:..:.:: :::::..: . :. :.:::::::::::::::::
CCDS92 KDPVPHNEYKTEEDPKLFQSTKTQRGPLSENWIEEYKKQVFPIMCAYKLCKVEFRYWGMQ
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 AKIEQFIHDVGLRRVMLRAHRQAWCWQDEWTELSMADIRALEEETARMLAQRMAKCNTGS
.:::.::::.::::::.::::::::::::: ::: .:: ::.:. ::...::. :
CCDS92 SKIERFIHDTGLRRVMVRAHRQAWCWQDEWYGLSMENIRELEKEAQLMLSRKMAQFN--E
210 220 230 240 250 260
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pF1KE6 EGSEAQPPGKPSTEARSAASNTGTPDGPEAPPGPDASPDASFG--KQWSSSSRSSYSSQH
.: :: : :: : . .: : :: : . .. : .. : ::::.::.:: ::..
CCDS92 DGEEATELVK--HEAVSDQT-SGEP--PE-PSSSNGEPLVGRGLKKQWSTSSKSSRSSKR
270 280 290 300 310
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pF1KE6 GGAVSPQSLSEWRMQNIARDSENSSEEEFFDAHEGFSDSEEVFPKEMTKWNSNDFIDAFA
:.. : .:.::::::.:::::..::..::::::: .::.::.:::..:::.:::..: .
CCDS92 GASPSRHSISEWRMQSIARDSDESSDDEFFDAHEDLSDTEEMFPKDITKWSSNDLMDKIE
320 330 340 350 360 370
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pF1KE6 SP--------VEAEGTPE----PGAEAAKGIEDGAQAPRDSEGLDGAGELGAEACAVHAL
:: . .:.:: ..: . ::: .. : :.: .:.:
CCDS92 SPEPEDTQDGLYRQGAPEFRVASSVEQLNIIEDEVSQP-----------LAAPPSKIHVL
380 390 400 410 420
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pF1KE6 FLILHSGNILDSGPGDANSKQADVQTLSSAFEAVTRIHFPEALGHVALRLVPCPPICAAA
.:.::.:.:::.: :: .::..:..:....:..: :.:.: :::..:.:::::::.:. :
CCDS92 LLVLHGGTILDTGAGDPSSKKGDANTIANVFDTVMRVHYPSALGRLAIRLVPCPPVCSDA
430 440 450 460 470 480
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pF1KE6 YALVSNLSPYSHDGDSLSRSQDHIPLAALPLLATSSSRYQGAVATVIARTNQAYSAFLRS
.:::::::::::: :: ::::::::::::::::: .:: :::::: :.: ::. :..:
CCDS92 FALVSNLSPYSHDEGCLSSSQDHIPLAALPLLATSSPQYQEAVATVIQRANLAYGDFIKS
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pF1KE6 PEGAGFCGQVALIGDGVGGILGFDALCHSANAGTGSRGSSRRGSM----NNELLSPEF--
:: : ::: :::: :::::.:::::.: . . :..::::::. .:.:::: .
CCDS92 QEGMTFNGQVCLIGDCVGGILAFDALCYSNQPVSESQSSSRRGSVVSMQDNDLLSPGILM
550 560 570 580 590 600
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pF1KE6 ------GPVRDPLADGVEGLGRGSPEPSALPPQR--------IPSDMASPEPEGSQ----
: . : . : :: :.: .: :: . .. .:. .
CCDS92 NAAHCCGGGGGGGGGGGSSGGGGSSGGSSLESSRHLSRSNVDIPRSNGTEDPKRQLPRKR
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690
pF1KE6 --------NSLQAAPATTSSWEPRRASTAFCP-PAASSEAPDGPSSTARLDFKVSGFFLF
...: : :: . : : ..:: :: .. .:.::... .:::
CCDS92 SDSSTYELDTIQQHQAFLSSLHASVLRTEPCSRHSSSSTMLDGTGALGRFDFEITDLFLF
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KE6 GSPLGLVLALRKTVMPALEA-QMRPACEQIYNLFHAADPCASRLEPLLAPKFQAIAPLTV
: ::::::::::::.:::.. :.::::.:.::::: ::: :::::::: .:.:. :..:
CCDS92 GCPLGLVLALRKTVIPALDVFQLRPACQQVYNLFHPADPSASRLEPLLERRFHALPPFSV
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800
pF1KE6 PRYQKFPLGDGSSLLLADTLQTHSSLFLEELEMLVPSTPTSTSGAFWKGSEL--------
::::..::::: : ::::.::::.. : :. :.: .. : : ..::.
CCDS92 PRYQRYPLGDGCSTLLADVLQTHNAAFQEHGAPSSPGTAPASRG-FRRASEISIASQVSG
790 800 810 820 830 840
810 820
pF1KE6 -------------ATD---------------------------PPAQPAAPSTTS-----
: : :::. :.:.
CCDS92 MAESYTASSIAQKAPDALSHTPSVRRLSLLALPAPSPTTPGPHPPARKASPGLERAPGLP
850 860 870 880 890 900
830 840 850 860 870 880
pF1KE6 --EVVKILERWWGTKRIDYSLYCPEALTAFPTVTLPHLFHASYWESADVVAFILRQVIEK
.. .. .::: :::::.::::.::::::::.::::::::::::.:::.:.::::...
CCDS92 ELDIGEVAAKWWGQKRIDYALYCPDALTAFPTVALPHLFHASYWESTDVVSFLLRQVMRH
910 920 930 940 950 960
890 900 910 920 930
pF1KE6 ERPQLAECE--EPSIYSPAFPREKWQRKRTQVKIRNVTSNHRASDTVVCEGRPQVLSGRF
. .. : . : :...:. ::::::::::.::.::::.::: .:... : ::::.:::
CCDS92 DNSSILELDGKEVSVFTPSKPREKWQRKRTHVKLRNVTANHRINDALANEDGPQVLTGRF
970 980 990 1000 1010 1020
940 950 960 970 980 990
pF1KE6 MYGPLDVVTLTGEKVDVYIMTQPLSGKWIHFGTEVTNSSGRLTFPVPPERALGIGVYPVR
::::::.::::::::::.::::: ::.:... : :::.:::... .: . ::.::::..
CCDS92 MYGPLDMVTLTGEKVDVHIMTQPPSGEWLYLDTLVTNNSGRVSYTIPESHRLGVGVYPIK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE6 MVVRGDHTYAECCLTVVARGTEAVVFSIDGSFTASVSIMGSDPKVRAGAVDVVRHWQDSG
::::::::.:. .::. .::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::: :
CCDS92 MVVRGDHTFADSYITVLPKGTEFVVFSIDGSFAASVSIMGSDPKVRAGAVDVVRHWQDLG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE6 YLIVYVTGRPDMQKHRVVAWLSQHNFPHGVVSFCDGLTHDPLRQKAMFLQSLVQEVELNI
:::.::::::::::.::::::.:::::::::::::::.:::::.:: ::. :..:..: .
CCDS92 YLIIYVTGRPDMQKQRVVAWLAQHNFPHGVVSFCDGLVHDPLRHKANFLKLLISELHLRV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE6 VAGYGSPKDVAVYAALGLSPSQTYIVGRAVRKLQAQCQFLSDGYVAHLGQLEAGSHSH-A
:.::: ::::::.:..::: : ::::: ..::: ::::..:::.:::.::. . ... :
CCDS92 HAAYGSTKDVAVYSAISLSPMQIYIVGRPTKKLQQQCQFITDGYAAHLAQLKYSHRARPA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE6 SSGPPRAALGKSSYGVAAPVDFLRKQSQLLRS-----RGPSQAEREGPGTPPTTLARGKA
. : :: :.:.:. . ::::....:::. :::. ..: . ::.
CCDS92 RNTATRMALRKGSFGLPGQGDFLRSRNHLLRTISAQPSGPSH-RHERTQSQADGEQRGQ-
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1240
pF1KE6 RSISLKLDSEE
::.:.
CCDS92 RSMSVAAGCWGRAMTGRLEPGAAAGPK
1330 1340
>>CCDS54080.1 PITPNM3 gene_id:83394|Hs108|chr17 (938 aa)
initn: 2994 init1: 1421 opt: 1759 Z-score: 1374.0 bits: 266.0 E(32554): 3.3e-70
Smith-Waterman score: 2982; 51.7% identity (74.0% similar) in 922 aa overlap (323-1224:8-905)
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 APPGPDASPDASFGKQWSSSSRSSYSSQHGGAVSPQSLSEWRMQNIARDSENSSEEEFFD
:. : . . :...:. :: .::..::::
CCDS54 MAKAGRAGGPPPGGGAPWHLRNVLSDSVESSDDEFFD
10 20 30
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 AH-EGFSDSEEVFPKEMTKWNSNDFIDAFASPVEAEGTPEPGAEAAKGIEDGAQAPRDSE
:. :: . . .: . . . .. . : :. :: .:::
CCDS54 ARGEGTAPCTSSILQEKQR-------ELYRVSLRRQRFPAQGS-----IE----IHEDSE
40 50 60 70 80
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 GLDGAGELGAEACAVHALFLILHSGNILDSGPGDANSKQADVQTLSSAFEAVTRIHFPEA
.: . ..: .:.:.:.::.:::::.: :: . : ::..:.::..: ::: ::: :
CCDS54 --EGCPQ---RSCKTHVLLLVLHGGNILDTGAGDPSCKAADIHTFSSVLEKVTRAHFPAA
90 100 110 120 130
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 LGHVALRLVPCPPICAAAYALVSNLSPYSHDGDSLSRSQDHIPLAALPLLATSSSRYQGA
:::. ...:::: ::. :..:::.:.::::: :: ::::.::::::::: :: .:: :
CCDS54 LGHILIKFVPCPAICSEAFSLVSHLNPYSHDEGCLSSSQDHVPLAALPLLAISSPQYQDA
140 150 160 170 180 190
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 VATVIARTNQAYSAFLRSPEGAGFCGQVALIGDGVGGILGFDALCHSAN-AGTGSRGSSR
::::: :.::.: ::.: .: :: ::: :::: :::.:.:::.:.::. .: . .:::
CCDS54 VATVIERANQVYREFLKSSDGIGFSGQVCLIGDCVGGLLAFDAICYSAGPSGDSPASSSR
200 210 220 230 240 250
600 610 620 630 640
pF1KE6 RGSMNNELLSPEFGPVRDPLADGVEGLGRGSPE-PSALPPQRIPSDMASPEPEGSQNSLQ
.::... .: ::.. . :.... . :.: .. . . ..: . .
CCDS54 KGSISSTQDTPVAVEEDCSLASS-KRLSKSNIDISSGLEDEEPKRPLPRKQSDSSTYDCE
260 270 280 290 300 310
650 660 670 680 690 700
pF1KE6 AAP---ATTSSWEPRRASTAFCPPAASSEAPDGPS-STARLDFKVSGFFLFGSPLGLVLA
: : :: . . :::.. :. : : .:.:: :: :::::::::::::
CCDS54 AITQHHAFLSSIHSSVLKDESETPAAGG--PQLPEVSLGRFDFDVSDFFLFGSPLGLVLA
320 330 340 350 360 370
710 720 730 740 750 760
pF1KE6 LRKTVMPALEA-QMRPACEQIYNLFHAADPCASRLEPLLAPKFQAIAPLTVPRYQKFPLG
.:.::.:.:.. :.:::: :.:..:: ::: :::::::: :::. . :..:::::.::::
CCDS54 MRRTVLPGLDGFQVRPACSQVYSFFHCADPSASRLEPLLEPKFHLVPPVSVPRYQRFPLG
380 390 400 410 420 430
770 780 790 800 810
pF1KE6 DGSSLLLADTLQTHSSLFLEELE------MLVPSTPTSTSGAFWKGSELATDPPAQPAAP
::.::::::.:.::: :::: . .:..: ..: : ... . ..
CCDS54 DGQSLLLADALHTHSPLFLEGSSRDSPPLLDAPASPPQASRFQRPGRRMSEGSSHSESSE
440 450 460 470 480 490
820 830 840 850 860 870
pF1KE6 STTSEV----VKILERWWGTKRIDYSLYCPEALTAFPTVTLPHLFHASYWESADVVAFIL
:. : . .: .:::.:::::.::::..:::::::.::::::::::::.:::::::
CCDS54 SSDSMAPVGASRITAKWWGSKRIDYALYCPDVLTAFPTVALPHLFHASYWESTDVVAFIL
500 510 520 530 540 550
880 890 900 910 920 930
pF1KE6 RQVIEKERPQLAECE--EPSIYSPAFPREKWQRKRTQVKIRNVTSNHRASDTVVCEGRPQ
:::.. : .. : .:. ::: ::::: :::::::.::::.::::.:... : ::
CCDS54 RQVMRYESVNIKESARLDPAALSPANPREKWLRKRTQVKLRNVTANHRANDVIAAEDGPQ
560 570 580 590 600 610
940 950 960 970 980 990
pF1KE6 VLSGRFMYGPLDVVTLTGEKVDVYIMTQPLSGKWIHFGTEVTNSSGRLTFPVPPERALGI
:: :::::::::.:.:::::::. .:..: ::.:.:. ::.::::::.:. :: : ::.
CCDS54 VLVGRFMYGPLDMVALTGEKVDILVMAEPSSGRWVHLDTEITNSSGRITYNVPRPRRLGV
620 630 640 650 660 670
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE6 GVYPVRMVVRGDHTYAECCLTVVARGTEAVVFSIDGSFTASVSIMGSDPKVRAGAVDVVR
:::::.::::::.: : :::. :: : :::::::::.::::::::::::: :::::::
CCDS54 GVYPVKMVVRGDQTCAMSYLTVLPRGMECVVFSIDGSFAASVSIMGSDPKVRPGAVDVVR
680 690 700 710 720 730
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE6 HWQDSGYLIVYVTGRPDMQKHRVVAWLSQHNFPHGVVSFCDGLTHDPLRQKAMFLQSLVQ
:::: ::.:.:.::::::::.:::.::::::::.:.. : :::.::::::::.::..:.:
CCDS54 HWQDLGYMILYITGRPDMQKQRVVSWLSQHNFPQGMIFFSDGLVHDPLRQKAIFLRNLMQ
740 750 760 770 780 790
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE6 EVELNIVAGYGSPKDVAVYAALGLSPSQTYIVGRAVRKLQAQCQFLSDGYVAHLGQLEAG
: ..: :.::: ::..::..::: :: .:::: ..: :.::::::.::.:::. :::.
CCDS54 ECFIKISAAYGSTKDISVYSVLGLPASQIFIVGRPTKKYQTQCQFLSEGYAAHLAALEAS
800 810 820 830 840 850
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE6 SHSHASSGPPRAALGKSSYGVAAPVDFLRKQSQLLRSRGPSQAEREGPGTPPTTLARGKA
.:. ... : : :.:.:. : .::::...: :. . .: . . . :
CCDS54 HRSRPKKNNSRMILRKGSFGLHAQPEFLRKRNHLRRTMSVQQPDPPAANPKPERAQSQPE
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1240
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CCDS11 AREEMAEGKNAILIGMSQWNSNDLVEQIETMGKLDEHQGEGTAPCTSSILQEKQRELYRV
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CCDS11 ALPLLAISSPQYQDAVATVIERANQVYREFLKSSDGIGFSGQVCLIGDCVGGLLAFDAIC
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.::. .: . .:::.::... .: ::.. . :.... . :.: ..
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. . ..: . .: : :: . . :::.. :. : : .:.:: :
CCDS11 PLPRKQSDSSTYDCEAITQHHAFLSSIHSSVLKDESETPAAGG--PQLPEVSLGRFDFDV
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: ... . .. :. : . .: .:::.:::::.::::..:::::::.:::::
CCDS11 GRRMSEGSSHSESSESSDSMAPVGASRITAKWWGSKRIDYALYCPDVLTAFPTVALPHLF
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CCDS11 HASYWESTDVVAFILRQVMRYESVNIKESARLDPAALSPANPREKWLRKRTQVKLRNVTA
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CCDS11 NHRANDVIAAEDGPQVLVGRFMYGPLDMVALTGEKVDILVMAEPSSGRWVHLDTEITNSS
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980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE6 GRLTFPVPPERALGIGVYPVRMVVRGDHTYAECCLTVVARGTEAVVFSIDGSFTASVSIM
::.:. :: : ::.:::::.::::::.: : :::. :: : :::::::::.::::::
CCDS11 GRITYNVPRPRRLGVGVYPVKMVVRGDQTCAMSYLTVLPRGMECVVFSIDGSFAASVSIM
700 710 720 730 740 750
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pF1KE6 GSDPKVRAGAVDVVRHWQDSGYLIVYVTGRPDMQKHRVVAWLSQHNFPHGVVSFCDGLTH
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CCDS11 GSDPKVRPGAVDVVRHWQDLGYMILYITGRPDMQKQRVVSWLSQHNFPQGMIFFSDGLVH
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pF1KE6 DPLRQKAMFLQSLVQEVELNIVAGYGSPKDVAVYAALGLSPSQTYIVGRAVRKLQAQCQF
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CCDS11 DPLRQKAIFLRNLMQECFIKISAAYGSTKDISVYSVLGLPASQIFIVGRPTKKYQTQCQF
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pF1KE6 LSDGYVAHLGQLEAGSHSHASSGPPRAALGKSSYGVAAPVDFLRKQSQLLRSRGPSQAER
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CCDS11 LSEGYAAHLAALEASHRSRPKKNNSRMILRKGSFGLHAQPEFLRKRNHLRRTMSVQQPDP
880 890 900 910 920 930
1220 1230 1240
pF1KE6 EGPGTPPTTLARGKARSISLKLDSEE
. . :
CCDS11 PAANPKPERAQSQPESDKDHERPLPALSWARGPPKFESVP
940 950 960 970
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10 20 30 40 50
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CCDS45 HKIYHLQSKVPTFVRMLAPEGALNIHEKAWNAYPYCRTVITNEYMKEDFLIKIETWHKPD
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CCDS45 LGTQENVHKLEPEAWKHVEAVYIDIADRSQVLSKDYKAEEDPAKFKSIKTGRGPLGPNWK
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CCDS45 QELVNQKDCPYMCAYKLVTVKFKWWGLQNKVENFIHK-QERRLFTNFHRQLFCWLDKWVD
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CCDS45 LTMDDIRRMEEETKRQLDEMRQKDPVKGMTADD
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10 20 30 40 50 60
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CCDS58 MLLKEYRICMPLTVDEYKIGQLYMISKHSHEQSD-RGEGVEVVQNEPFEDPHHGNGQFTE
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CCDS58 SNDTIFD-NEAKDVEREVCFIDIACDEIPERYYKESEDPKHFKSEKTGRGQLREGW-RDS
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CCDS58 HQ--PIMCSYKLVTVKFEVWGLQTRVEQFVHKV-VRDILLIGHRQAFAWVDEWYDMTMDE
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CCDS58 VREFERATQEATNKKIGIFPPAI--SISSIPLLPSS-VRSAPSSAPSTPLSTDAPEFLSV
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300 310 320 330 340 350
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CCDS58 SNDTIFD-NEAKDVEREVCFIDIACDEIPERYYKESEDPKHFKSEKTGRGQLREGW-RDS
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CCDS58 VREYEKN---MHEQTNIKVCNQHSSPVDDIESHAQTST
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CCDS13 KELANSPDCPQMCAYKLVTIKFKWWGLQSKVENFIQK-QEKRIFTNFHRQLFCWIDKWID
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1243 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]