Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6668
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6668, 296 aa
1>>>pF1KE6668 296 - 296 aa - 296 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7023+/-0.000793; mu= 13.9404+/- 0.048
mean_var=71.8956+/-14.245, 0's: 0 Z-trim(108.2): 24 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.151260
statistics sampled from 10045 (10069) to 10045 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.687), E-opt: 0.2 (0.309), width: 16
Scan time: 1.830
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2075.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 ( 296) 2060 458.4 3e-129
CCDS2077.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 ( 302) 1319 296.7 1.4e-80
CCDS2076.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 ( 307) 1297 291.9 4.1e-79
CCDS3530.1 SULT1B1 gene_id:27284|Hs108|chr4 ( 296) 1158 261.5 5.4e-70
CCDS33267.1 SULT1C3 gene_id:442038|Hs108|chr2 ( 304) 1157 261.3 6.4e-70
CCDS10636.1 SULT1A2 gene_id:6799|Hs108|chr16 ( 295) 1092 247.1 1.2e-65
CCDS32420.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 ( 295) 1086 245.8 2.9e-65
CCDS32427.1 SULT1A4 gene_id:445329|Hs108|chr16 ( 295) 1083 245.2 4.5e-65
CCDS10674.1 SULT1A3 gene_id:6818|Hs108|chr16 ( 295) 1083 245.2 4.5e-65
CCDS3531.1 SULT1E1 gene_id:6783|Hs108|chr4 ( 294) 1019 231.2 7.2e-61
CCDS10637.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 ( 217) 716 165.0 4.5e-41
CCDS12707.1 SULT2A1 gene_id:6822|Hs108|chr19 ( 285) 712 164.2 1e-40
CCDS12724.1 SULT2B1 gene_id:6820|Hs108|chr19 ( 350) 708 163.4 2.3e-40
CCDS12723.1 SULT2B1 gene_id:6820|Hs108|chr19 ( 365) 708 163.4 2.3e-40
CCDS82492.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 ( 227) 625 145.2 4.4e-35
CCDS33182.1 SULT6B1 gene_id:391365|Hs108|chr2 ( 265) 533 125.1 5.6e-29
CCDS14051.1 SULT4A1 gene_id:25830|Hs108|chr22 ( 284) 499 117.7 1e-26
>>CCDS2075.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 (296 aa)
initn: 2060 init1: 2060 opt: 2060 Z-score: 2433.9 bits: 458.4 E(32554): 3e-129
Smith-Waterman score: 2060; 100.0% identity (100.0% similar) in 296 aa overlap (1-296:1-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MALTSDLGKQIKLKEVEGTLLQPATVDNWSQIQSFEAKPDDLLICTYPKAGTTWIQEIVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 MALTSDLGKQIKLKEVEGTLLQPATVDNWSQIQSFEAKPDDLLICTYPKAGTTWIQEIVD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPPQPSGVEKAKAMPSPRILKTHLSTQLLPPSFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 MIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPPQPSGVEKAKAMPSPRILKTHLSTQLLPPSFW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFETFINGKVVWGSWFDHVKGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 ENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFETFINGKVVWGSWFDHVKGW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 WEMKDRHQILFLFYEDIKRDPKHEIRKVMQFMGKKVDETVLDKIVQETSFEKMKENPMTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 WEMKDRHQILFLFYEDIKRDPKHEIRKVMQFMGKKVDETVLDKIVQETSFEKMKENPMTN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE6 RSTVSKSILDQSISSFMRKGTVGDWKNHFTVAQNERFDEIYRRKMEGTSINFCMEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 RSTVSKSILDQSISSFMRKGTVGDWKNHFTVAQNERFDEIYRRKMEGTSINFCMEL
250 260 270 280 290
>>CCDS2077.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 (302 aa)
initn: 1277 init1: 1251 opt: 1319 Z-score: 1559.9 bits: 296.7 E(32554): 1.4e-80
Smith-Waterman score: 1319; 64.3% identity (84.5% similar) in 291 aa overlap (3-292:9-298)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MALTSDLGKQIKLKEVEGTLLQPA-TVDNWSQIQSFEAKPDDLLICTYPKAGTT
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CCDS20 MALHDMEDFTFDGTKRLSVNYVKG-ILQPTDTCDIWDKIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 WIQEIVDMIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPPQPSGVEKAKAMPSPRILKTHLSTQ
: ::::..:...::::: .:: ..: ::.: : ::.:.:.:::::::::::: .
CCDS20 WTQEIVELIQNEGDVEKSKRAPTHQRFPFLEMKIPSLGSGLEQAHAMPSPRILKTHLPFH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LLPPSFWENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFETFINGKVVWGSW
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CCDS20 LLPPSLLEKNCKIIYVARNPKDNMVSYYHFQRMNKALPAPGTWEEYFETFLAGKVCWGSW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FDHVKGWWEMKDRHQILFLFYEDIKRDPKHEIRKVMQFMGKKVDETVLDKIVQETSFEKM
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CCDS20 HEHVKGWWEAKDKHRILYLFYEDMKKNPKHEIQKLAEFIGKKLDDKVLDKIVHYTSFDVM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KENPMTNRSTVSKSILDQSISSFMRKGTVGDWKNHFTVAQNERFDEIYRRKMEGTSINFC
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CCDS20 KQNPMANYSSIPAEIMDHSISPFMRKGAVGDWKKHFTVAQNERFDEDYKKKMTDTRLTFH
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 MEL
CCDS20 FQF
300
>>CCDS2076.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 (307 aa)
initn: 1918 init1: 1297 opt: 1297 Z-score: 1533.8 bits: 291.9 E(32554): 4.1e-79
Smith-Waterman score: 1897; 91.2% identity (93.2% similar) in 307 aa overlap (1-296:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MALTSDLGKQIKLKEVEGTLLQPATVDNWSQIQSFEAKPDDLLICTYPKAGTTWIQEIVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 MALTSDLGKQIKLKEVEGTLLQPATVDNWSQIQSFEAKPDDLLICTYPKAGTTWIQEIVD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE6 MIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPPQPS--G---VEKA------KAMPSPRILKTH
:::::::::::::::::::::::::::::::: : : .: .. : ..
CCDS20 MIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPPQPSETGFHHVAQAGLKLLSSSNPPASTSQSA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 LSTQLLPPSFWENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFETFINGKVV
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 KITDLLPPSFWENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFETFINGKVV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 WGSWFDHVKGWWEMKDRHQILFLFYEDIKRDPKHEIRKVMQFMGKKVDETVLDKIVQETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 WGSWFDHVKGWWEMKDRHQILFLFYEDIKRDPKHEIRKVMQFMGKKVDETVLDKIVQETS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 FEKMKENPMTNRSTVSKSILDQSISSFMRKGTVGDWKNHFTVAQNERFDEIYRRKMEGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 FEKMKENPMTNRSTVSKSILDQSISSFMRKGTVGDWKNHFTVAQNERFDEIYRRKMEGTS
250 260 270 280 290 300
290
pF1KE6 INFCMEL
:::::::
CCDS20 INFCMEL
>>CCDS3530.1 SULT1B1 gene_id:27284|Hs108|chr4 (296 aa)
initn: 1186 init1: 896 opt: 1158 Z-score: 1370.1 bits: 261.5 E(32554): 5.4e-70
Smith-Waterman score: 1158; 54.4% identity (84.2% similar) in 285 aa overlap (13-296:12-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MALTSDLGKQIKLKEVEGTLLQPATVDNWSQIQSFEAKPDDLLICTYPKAGTTWIQEIVD
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CCDS35 MLSPKDILRKDLKLVHGYPMTCAFASNWEKIEQFHSRPDDIVIATYPKSGTTWVSEIID
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE6 MIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPP-QPSGVEKAKAMPSPRILKTHLSTQLLPPSF
:: ..::.:::.:..: .. :..: . : . ::.:. . :::::.:::: :.::: ::
CCDS35 MILNDGDIEKCKRGFITEKVPMLEMTLPGLRTSGIEQLEKNPSPRIVKTHLPTDLLPKSF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 WENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFETFINGKVVWGSWFDHVKG
::::::..:.:::::: ::::::. ::.. : :::::::.: :..:::..:::: :::.
CCDS35 WENNCKMIYLARNAKDVSVSYYHFDLMNNLQPFPGTWEEYLEKFLTGKVAYGSWFTHVKN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 WWEMKDRHQILFLFYEDIKRDPKHEIRKVMQFMGKKVDETVLDKIVQETSFEKMKENPMT
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CCDS35 WWKKKEEHPILFLYYEDMKENPKEEIKKIIRFLEKNLNDEILDRIIHHTSFEVMKDNPLV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 NRSTVSKSILDQSISSFMRKGTVGDWKNHFTVAQNERFDEIYRRKMEGTSINFCMEL
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CCDS35 NYTHLPTTVMDHSKSPFMRKGTAGDWKNYFTVAQNEKFDAIYETEMSKTALQFRTEI
240 250 260 270 280 290
>>CCDS33267.1 SULT1C3 gene_id:442038|Hs108|chr2 (304 aa)
initn: 1180 init1: 898 opt: 1157 Z-score: 1368.8 bits: 261.3 E(32554): 6.4e-70
Smith-Waterman score: 1157; 55.5% identity (81.3% similar) in 283 aa overlap (15-296:22-304)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MALTSDLGKQIKLKEVEGTLLQPATVDNWSQIQSFEAKPDDLLICTYPKAGTT
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CCDS33 MAKIEKNAPTMEKKPELFNIMEVDGVPTLILSKEWWEKVCNFQAKPDDLILATYPKSGTT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 WIQEIVDMIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPPQPS-GVEKAKAMPSPRILKTHLST
:..::.::: ..::::::.:: :: :.: : . . .: . : ::...:::: .
CCDS33 WMHEILDMILNDGDVEKCKRAQTLDRHAFLELKFPHKEKPDLEFVLEMSSPQLIKTHLPS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 QLLPPSFWENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFETFINGKVVWGS
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CCDS33 HLIPPSIWKENCKIVYVARNPKDCLVSYYHFHRMASFMPDPQNLEEFYEKFMSGKVVGGS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 WFDHVKGWWEMKDRHQILFLFYEDIKRDPKHEIRKVMQFMGKKVDETVLDKIVQETSFEK
::::::::: :: :.::.:::::::.:::.::.:...:. : ..: .:.::. .:::.
CCDS33 WFDHVKGWWAAKDMHRILYLFYEDIKKDPKREIEKILKFLEKDISEEILNKIIYHTSFDV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 MKENPMTNRSTVSKSILDQSISSFMRKGTVGDWKNHFTVAQNERFDEIYRRKMEGTSINF
::.::::: .:. ::.:.::: ::::: :::::.:::::::.::. :..:: :....:
CCDS33 MKQNPMTNYTTLPTSIMDHSISPFMRKGMPGDWKNYFTVAQNEEFDKDYQKKMAGSTLTF
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CMEL
:.
CCDS33 RTEI
>>CCDS10636.1 SULT1A2 gene_id:6799|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 1074 init1: 1074 opt: 1092 Z-score: 1292.3 bits: 247.1 E(32554): 1.2e-65
Smith-Waterman score: 1092; 52.0% identity (78.0% similar) in 296 aa overlap (1-296:1-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MALTSDLGKQIKLKEVEGTLLQPATVDNWSQIQSFEAKPDDLLICTYPKAGTTWIQEIVD
: : .:... :. :.:. : .. . .:::.:.:::::: ::::.::::...:.:
CCDS10 MELIQDISRP-PLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLISTYPKSGTTWVSQILD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPPQPSGVEKAKAMPSPRILKTHLSTQLLPPSFW
:: :.::.:::.:: : : ::.:. : :::.: : :.::.::::: ::: ..
CCDS10 MIYQGGDLEKCHRAPIFMRVPFLEFKVPGIPSGMETLKNTPAPRLLKTHLPLALLPQTLL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFETFINGKVVWGSWFDHVKGW
... : .:::::::: :::::: .: .. : ::::: ..: :. :.: .:::..::. :
CCDS10 DQKVKVVYVARNAKDVAVSYYHFYHMAKVYPHPGTWESFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEW
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 WEMKDRHQILFLFYEDIKRDPKHEIRKVMQFMGKKVDETVLDKIVQETSFEKMKENPMTN
::.. : .:.:::::.:..::.::.:...:.:... : ..: .:..:::..::.:::::
CCDS10 WELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETVDLMVEHTSFKEMKKNPMTN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE6 RSTVSKSILDQSISSFMRKGTVGDWKNHFTVAQNERFDEIYRRKMEGTSINFCMEL
.:: . ..:.::: ::::: .::::. :::::::::: : .:: : :..: ::
CCDS10 YTTVRREFMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAKKMAGCSLSFRSEL
240 250 260 270 280 290
>>CCDS32420.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 1071 init1: 1071 opt: 1086 Z-score: 1285.3 bits: 245.8 E(32554): 2.9e-65
Smith-Waterman score: 1086; 52.0% identity (78.0% similar) in 296 aa overlap (1-296:1-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MALTSDLGKQIKLKEVEGTLLQPATVDNWSQIQSFEAKPDDLLICTYPKAGTTWIQEIVD
: : .: .. :. :.:. : .. . .:::.:.:::::: ::::.::::...:.:
CCDS32 MELIQDTSRP-PLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLISTYPKSGTTWVSQILD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPPQPSGVEKAKAMPSPRILKTHLSTQLLPPSFW
:: :.::.:::.:: : : ::.:. : :::.: : :.::.::::: ::: ..
CCDS32 MIYQGGDLEKCHRAPIFMRVPFLEFKAPGIPSGMETLKDTPAPRLLKTHLPLALLPQTLL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFETFINGKVVWGSWFDHVKGW
... : .:::::::: :::::: .: .. :.::::. ..: :. :.: .:::..::. :
CCDS32 DQKVKVVYVARNAKDVAVSYYHFYHMAKVHPEPGTWDSFLEKFMVGEVSYGSWYQHVQEW
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 WEMKDRHQILFLFYEDIKRDPKHEIRKVMQFMGKKVDETVLDKIVQETSFEKMKENPMTN
::.. : .:.:::::.:..::.::.:...:.:... : ..: .::.:::..::.:::::
CCDS32 WELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETVDFVVQHTSFKEMKKNPMTN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE6 RSTVSKSILDQSISSFMRKGTVGDWKNHFTVAQNERFDEIYRRKMEGTSINFCMEL
.:: . ..:.::: ::::: .::::. :::::::::: : .:: : :..: ::
CCDS32 YTTVPQEFMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
240 250 260 270 280 290
>>CCDS32427.1 SULT1A4 gene_id:445329|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 1068 init1: 1068 opt: 1083 Z-score: 1281.7 bits: 245.2 E(32554): 4.5e-65
Smith-Waterman score: 1083; 51.4% identity (77.7% similar) in 296 aa overlap (1-296:1-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MALTSDLGKQIKLKEVEGTLLQPATVDNWSQIQSFEAKPDDLLICTYPKAGTTWIQEIVD
: : .: .. :. :.:. : .. . .:::.:.:::::: ::::.::::...:.:
CCDS32 MELIQDTSRP-PLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTWVSQILD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPPQPSGVEKAKAMPSPRILKTHLSTQLLPPSFW
:: :.::.:::.:: : : ::.: : .:::.: : : ::..:.:: ::: ..
CCDS32 MIYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPGEPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPLALLPQTLL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFETFINGKVVWGSWFDHVKGW
... : .::::: :: ::::::.::.. :.::::. ..: :. :.: .:::..::. :
CCDS32 DQKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEW
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 WEMKDRHQILFLFYEDIKRDPKHEIRKVMQFMGKKVDETVLDKIVQETSFEKMKENPMTN
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CCDS32 WELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKEMKKNPMTN
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CCDS10 YTTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
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CCDS35 MIYKEGDVEKCKEDVIFNRIPFLECRKENLMNGVKQLDEMNSPRIVKTHLPPELLPASFW
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CCDS35 EKDCKIIYLCRNAKDVAVSFYYFFLMVAGHPNPGSFPEFVEKFMQGQVPYGSWYKHVKSW
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CCDS35 WEKGKSPRVLFLFYEDLKEDIRKEVIKLIHFLERKPSEELVDRIIHHTSFQEMKNNPSTN
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CCDS35 YTTLPDEIMNQKLSPFMRKGITGDWKNHFTVALNEKFDKHYEQQMKESTLKFRTEI
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start: Tue Nov 8 15:16:01 2016 done: Tue Nov 8 15:16:01 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]